Tom Gilbert

Tom Gilbert

Professor

Medlem af:

    ORCID: 0000-0002-5805-7195

    Udgivelsesår:
    Alle
    301 - 400 ud af 443Pr. side: 100
    Sortering: Udgivelsesår
    1. 2019
    2. Udgivet

      Contrasting dates of rainforest fragmentation in Africa inferred from trees with different dispersal abilities

      Pineiro, R., Hardy, O. J., Tovar, C., Gopalakrishnan, Shyam, Vieira, Filipe Garrett & Gilbert, M Thomas P, 2019, 19 s. (bioRxiv).

      Publikation: Working paper › Preprint

    3. Udgivet

      Palaeogenomic insights into the origins of French grapevine diversity

      Ramos Madrigal, Jazmin, Runge, Anne Kathrine Wiborg, Bouby, L., Lacombe, T., Samaniego Castruita, J. A., Adam-Blondon, A., Figueiral, I., Hallavant, C., Schaal, C., Töpfer, R., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., This, P., Bacilieri, R., Gilbert, M Thomas P & Wales, N., 2019, I: Nature Plants. 5, 6, s. 595-603 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    4. Udgivet

      MobiSeq: De novo SNP discovery in model and non-model species through sequencing the flanking region of transposable elements

      Rey de la Iglesia, Alba, Gopalakrishan, S., Carøe, C., Alquezar-Planas, D. E., Nielsen, A. A., Röder, T., Pedersen, Lene Bruhn, Næsborg-Nielsen, C., Sinding, Mikkel Holger Strander, Rath, Martin Fredensborg, Li, Z., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Bunce, M., Mourier, T. & Hansen, Anders Johannes, 2019, I: Molecular Ecology Resources. 19, 2, s. 512-525 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    5. Udgivet

      31° South: Dietary niche of an arid‐zone endemic passerine

      Ribeiro, Â. M., Smit, B. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Environmental Engineering. 1, 2, s. 109-118

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      31º South: The physiology of adaptation to arid conditions in a passerine bird

      Ribeiro, Â. M., Puetz, Lara Christine, Pattinson, N. B., Dalén, L., Deng, Y., KU, thw266, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smit, B. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Molecular Ecology. 28, 16, s. 3709-3721 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    7. Udgivet

      The genetic origins of Saint Helena’s liberated Africans

      Sandoval-Velasco, Marcela, Jagadeesan, A., Ávila-Arcos, M. C., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Moreno Mayar, J. Víctor, Renaud, Gabriel, Cruz-Dávalos, D. I., Johannesdóttir, E., Watson, J., Robson-Brown, K., Pearson, A., Helgason, A., Gilbert, M Thomas P & Schroeder, Hannes, 2019, bioRxiv, 16 s.

      Publikation: Working paper › Preprint

    8. Udgivet

      Skmer: assembly-free and alignment-free sample identification using genome skims

      Sarmashghi, S., Bohmann, Kristine, Gilbert, M Thomas P, Bafna, V. & Mirarab, S., 2019, I: Genome Biology. 20, 20 s., 34.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. Udgivet

      Multi-omics and potential applications in wine production

      Sirén, K., Mak, Sarah Siu Tze, Fischer, U., Hansen, Lars Hestbjerg & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Current Opinion in Biotechnology. 56, s. 172-178

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    10. Udgivet

      Taxonomic and Functional Characterization of the Microbial Community During Spontaneous in vitro Fermentation of Riesling Must

      Sirén, K., Mak, Sarah Siu Tze, Melkonian, C., Carøe, C., Swiegers, J. H., Molenaar, D., Fischer, U. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 17 s., 697.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    11. Udgivet

      Ancient RNA from Late Pleistocene permafrost and historical canids shows tissue-specific transcriptome survival

      Smith, O., Dunshea, G., Sinding, M. S., Fedorov, S., Germonpre, M., Bocherens, H. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: PLOS Biology. 17, 7, s. 1-28 e3000166.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    12. Udgivet

      Demographic reconstruction from ancient DNA supports rapid extinction of the great auk

      Thomas, J. E., Carvalho, G. R., Haile, J., Rawlence, N. J., Martin, M. D., Ho, S. Y. W., Sigfusson, A. P., Josefsson, V. A., Frederiksen, M., Linnebjerg, J. F., Castruita, J. A. S., Niemann, J., Sinding, M-H. S., Sandoval-Velasco, M., Soares, A. E. R., Lacy, R., Barilaro, C., Best, J., Brandis, D., Cavallo, C. & 17 flere, Elorza, M., Garrett, K. L., Groot, M., Johansson, F., Lifjeld, J. T., Nilson, G., Serjeanston, D., Sweet, P., Fuller, E., Hufthammer, A. K., Meldgaard, Morten, Fjeldså, Jon, Shapiro, B., Hofreiter, M., Stewart, J. R., Gilbert, M Thomas P & Knapp, M., 2019, I: eLife. 8, 35 s., e47509.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    13. Udgivet

      Ancient DNA reveals the timing and persistence of organellar genetic bottlenecks over 3,000 years of sunflower domestication and improvement

      Wales, N., Akman, M., Watson, R. H. B., Sánchez Barreiro, F., Smith, B. D., Gremillion, K. J., Gilbert, M Thomas P & Blackman, B. K., 1 jan. 2019, I: Evolutionary Applications. 12, 1, s. 38-53

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Udgivet

      DNA metabarcoding - need for robust experimental designs to draw sound ecological conclusions

      Zinger, L., Bonin, A., Alsos, I. G., Bálint, M., Bik, H., Boyer, F., Chariton, A. A., Creer, S., Coissac, E., Deagle, B. E., De Barba, M., Dickie, I. A., Dumbrell, A. J., Ficetola, G. F., Fierer, N., Fumagalli, L., Gilbert, M. T. P., Jarman, S., Jumpponen, A., Kauserud, H. & 7 flere, Orlando, L., Pansu, J., Pawlowski, J., Tedersoo, L., Thomsen, P. F., Willerslev, Eske & Taberlet, P., 2019, I: Molecular Ecology. 28, 8, s. 1857-1862 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt

    15. Udgivet

      Genetic affinities of an eradicated European Plasmodium falciparum strain

      de-Dios, T., van Dorp, L., Gelabert, P., Carøe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Fregel, R., Escosa, R., Aranda, C., Huijben, S., Balloux, F., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2019, I: Microbial Genomics. 5, 9, 7 s., 289.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    16. 2020
    17. Udgivet

      DNA metabarcoding and spatial modelling link diet diversification with distribution homogeneity in European bats

      Alberdi, Antton, Razgour, O., Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Novella-Fernandez, R., Aihartza, J., Budinski, I., Garin, I., Ibanez, C., Izagirre, E., Rebelo, H., Russo, D., Vlaschenko, A., Zhelyazkova, V., Zrncic, V. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Nature Communications. 11, 8 s., 1154.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    18. Udgivet

      Genomic Adaptations and Evolutionary History of the Extinct Scimitar-Toothed Cat, Homotherium latidens

      Barnett, R., Westbury, M. V., Sandoval-Velasco, M., Vieira, F. G., Jeon, S., Zazula, G., Martin, M. D., Ho, S. Y. W., Mather, N., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Zepeda-Mendoza, M. L., Antunes, A., Baez, A. C., De Cahsan, B., Larson, G., O’Brien, S. J., Eizirik, E., Johnson, W. E. & 11 flere, Koepfli, K., Wilting, A., Fickel, J., Dalén, L., Lorenzen, Eline, Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Bhak, J., Yamaguchi, N. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Current Biology. 30, s. 5018-5025

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. Udgivet

      Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification

      Bohmann, Kristine, Mirarab, S., Bafna, V. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Molecular Ecology. 29, 14, s. 2521-2534

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    20. Udgivet

      Tracking the history of grapevine cultivation in Georgia by combining geometric morphometrics and ancient DNA

      Bouby, L., Wales, N., Jalabadze, M., Rusishvili, N., Bonhomme, V., Ramos Madrigal, Jazmin, Evin, A., Ivorra, S., Lacombe, T., Pagnoux, C., Boaretto, E., Gilbert, M Thomas P, Bacilieri, R., Lordkipanidze, D. & Maghradze, D., 2020, I: Vegetation History and Archaeobotany. 30, s. 63-76 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    21. Udgivet

      GC bias affects genomic and metagenomic reconstructions, underrepresenting GC-poor organisms

      Browne, Patrick Denis, Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Aggerholm, A., Gilbert, M Thomas P, Puetz, Lara Christine, Rasmussen, M., Zervas, A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: GigaScience. 9, 2, 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    22. Udgivet

      Rapid loss of endogenous DNA in pig bone buried in five different environments

      Eriksen, A. M. H., Matthiesen, H., Kontopoulos, I., Gregory, D., Snoeck, C., KU, thw266, Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Archaeometry. 62, 4, s. 827-846 20 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    23. Udgivet

      Bone biodeterioration - The effect of marine and terrestrial depositional environments on early diagenesis and bone bacterial community

      Eriksen, A. M. H., Nielsen, Tue Kjærgaard, Matthiesen, H., Carøe, C., Hansen, Lars Hestbjerg, Gregory, D. J., Turner-Walker, G., Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: PLoS ONE. 15, 10 October, 24 s., e0240512.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    24. Udgivet

      Releasing the microbes from old bones: the effect of different DNA extraction protocols on microbial community profiling

      Eriksen, A. M. H., Puetz, Lara Christine, Rocha, C., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: STAR: Science & Technology of Archaeological Research. 6, 1, s. 1-15 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    25. Udgivet

      Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics

      Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, Sinding, Mikkel Holger Strander, Puetz, Lara Christine, Cavill, Emily Louisa, Ribeiro, Â. M., Eckhart, L., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Brumfield, R. T., Christidis, L., Bertelsen, Mads Frost, Sicheritz-Pontén, Thomas, Tietze, D. T., Robertson, B. C., Song, G., Borgia, G., Claramunt, S., Lovette, I. J., Cowen, S. J., Njoroge, P., Dumbacher, J. P., Ryder, O. A., Fuchs, J., Bunce, M., Burt, D. W., Cracraft, J., Meng, G., Hackett, S. J., Ryan, P. G., Jønsson, Knud Andreas, Jamieson, I. G., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Braun, E. L., Houde, P., Mirarab, S., Suh, A., Hansson, B., Ponnikas, S., Sigeman, H., Stervander, M., Frandsen, P. B., van der Zwan, H., van der Sluis, R., Visser, C., Balakrishnan, C. N., Clark, A. G., Fitzpatrick, J. W., Bowman, R., Chen, N., Cloutier, A., Sackton, T. B., Edwards, S. V., Foote, D. J., Shakya, S. B., Sheldon, F. H., Vignal, A., Soares, A. E. R., Shapiro, B., González-Solís, J., Ferrer-Obiol, J., Rozas, J., Riutort, M., Tigano, A., Friesen, V., Dalén, L., Urrutia, A. O., Székely, T., Liu, Y., Campana, M. G., Corvelo, A., Fleischer, R. C., Rutherford, K. M., Gemmell, N. J., Dussex, N., Mouritsen, H., Thiele, N., Delmore, K., Liedvogel, M., Franke, A., Hoeppner, M. P., Krone, O., Fudickar, A. M., Milá, B., Ketterson, E. D., Fidler, A. E., Friis, G., Parody-Merino, Á. M., Battley, P. F., Cox, M. P., Lima, N. C. B., Prosdocimi, F., Parchman, T. L., Schlinger, B. A., Loiselle, B. A., Blake, J. G., Lim, H. C., Day, L. B., Fuxjager, M. J., Baldwin, M. W., Braun, M. J., Wirthlin, M., Dikow, R. B., Ryder, T. B., Camenisch, G., Keller, L. F., Dacosta, J. M., Hauber, M. E., Louder, M. I. M., Witt, C. C., McGuire, J. A., Mudge, J., Megna, L. C., Carling, M. D., Wang, B., Taylor, S. A., Del-Rio, G., Aleixo, A., Vasconcelos, A. T. R., Mello, C. V., Weir, J. T., Haussler, D., Li, Q., Yang, H., Wang, J., Lei, F., Rahbek, Carsten, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R., Jarvis, E. D., Paten, B. & KU, thw266, 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    26. Udgivet

      Using paleo-archives to safeguard biodiversity under climate change

      Fordham, D. A., Jackson, S. T., Brown, S. C., Huntley, B., Dahl-Jensen, Dorthe, Gilbert, M Thomas P, Otto-Bliesner, B., Svensson, Anders, Theodoridis, S., Wilmshurst, J. M., Buettel, J. C., Canteri, Elisabetta, McDowell, M., Orlando, L. A. A., Pilowsky, Julia Aaron, Rahbek, Carsten & Nogues, David Bravo, 28 aug. 2020, I: Science. 369, 6507, s. 1072-1083 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    27. Udgivet

      Multi-omic detection of Mycobacterium leprae in archaeological human dental calculus

      Fotaki, Anna Katerina, Denham, S. D., Mackie, Meaghan, Iraeta Orbegozo, Miren, Mylopotamitaki, Dorothea, Gopalakrishnan, Shyam, Sicheritz-Pontén, Thomas, Olsen, Jesper Velgaard, Cappellini, Enrico, KU, thw266, Christophersen, A., Gilbert, M Thomas P & Vågene, Åshild Joanne, 2020, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 375, 1812, 10 s., 20190584.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    28. Udgivet

      Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet

      Gelabert, P., Sandoval-Velasco, M., Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, A., Stiller, J., de-Dios, T., Fang, Q., Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, B., Olsen, R-A., Navarro, A., Deng, Y. & 6 flere, Dalén, L., Marquès-Bonet, T., KU, thw266, Antunes, A., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    29. Udgivet

      Phylogeny of Neotropical Seirinae (Collembola, Entomobryidae) based on mitochondrial genomes

      Godeiro, N. N., Antunes Pacheco, George, Liu, Shanlin, Gioia Cipola, N., Berbel-Filho, W. M., Zhang, F., Gilbert, M Thomas P & Bellini, B. C., 2020, I: Zoologica Scripta. 49, 3, s. 329-339

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    30. Udgivet

      The secrets of Sobek - A crocodile mummy mitogenome from ancient Egypt

      Hekkala, E. R., Aardema, M. L., Narechania, A., Amato, G., Ikram, S., Shirley, M. H., Vliet, K. A., Cunningham, S. W., Gilbert, M Thomas P & Smith, O., 2020, I: Journal of Archaeological Science: Reports. 33, s. 1-10 10 s., 102483.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    31. Udgivet

      Molecular identification and phylogenetic analysis of a Callosciurus notatus complete mitogenome from Peninsular Malaysia

      Jahari, P. N. S., Mohd Azman, S., Munian, K., Ahmad Ruzman, N. H., Shamsir, M. S., Richter, S. R., Gilbert, M Thomas P & Mohd Salleh, F., 2020, I: Mitochondrial DNA Part B: Resources. 5, 3, s. 3022-3024 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    32. Udgivet

      The first complete mitochondrial genome data of Hippocampus kuda originating from Malaysia

      Jahari, P. N. S., Malik, N. F. A., Shamsir, M. S., Gilbert, M Thomas P & Salleh, F. M., 2020, I: Data in Brief. 31, 8 s., 105721.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    33. Udgivet

      Ancient DNA suggests modern wolves trace their origin to a Late Pleistocene expansion from Beringia

      Loog, L., Thalmann, O., Sinding, M. H. S., Schuenemann, V. J., Perri, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Witt, K. E., Samaniego Castruita, J. A., Velasco, M. S., Lundstrøm, I. K. C., Wales, N., Sonet, G., Frantz, L., Schroeder, H., Budd, J., Jimenez, E. L., Fedorov, S., Gasparyan, B., Kandel, A. W. & 16 flere, Lázničková-Galetová, M., Napierala, H., Uerpmann, H. P., Nikolskiy, P. A., Pavlova, E. Y., Pitulko, V. V., Herzig, K., Malhi, R. S., Willerslev, Eske, Hansen, Anders Johannes, Dobney, K., Gilbert, M Thomas P, Krause, J., Larson, G., Eriksson, A. & Manica, A., 2020, I: Molecular Ecology. 29, 9, s. 1596-1610 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    34. Udgivet

      Pre-extinction Demographic Stability and Genomic Signatures of Adaptation in the Woolly Rhinoceros

      Lord, E., Dussex, N., Kierczak, M., Díez-del-Molino, D., Ryder, O. A., Stanton, D. W. G., Gilbert, M. T. P., Sánchez-Barreiro, F., Zhang, G., Sinding, M. H. S., Lorenzen, E. D., Willerslev, E., Protopopov, A., Shidlovskiy, F., Fedorov, S., Bocherens, H., Nathan, S. K. S. S., Goossens, B., van der Plicht, J., Chan, Y. L. & 10 flere, Prost, S., Potapova, O., Kirillova, I., Lister, A. M., Heintzman, P. D., Kapp, J. D., Shapiro, B., Vartanyan, S., Götherström, A. & Dalén, L., 2020, I: Current Biology. 30, 19, s. 3871-3879, e1-e7 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    35. Udgivet

      DNA-Based Arthropod Diversity Assessment in Amazonian Iron Mine Lands Show Ecological Succession Towards Undisturbed Reference Sites

      Lynggaard, Christina Islas, Yu, D. W., Oliveira, G., Caldeira, C. F., Ramos, S. J., Ellegaard, M. R., Gilbert, M Thomas P, Gastauer, M. & Bohmann, Kristine, 2020, I: Frontiers in Ecology and Evolution. 8, 15 s., 590976.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    36. Udgivet

      Population genomics of the Viking world: [incl. correction]

      Margaryan, A., Lawson, D. J., Sikora, M., Racimo, F., Rasmussen, S., Moltke, I., Cassidy, L. M., Jørsboe, E., Ingason, A., Pedersen, M. W., Korneliussen, T., Wilhelmson, H., Buś, M. M., de Barros Damgaard, P., Martiniano, R., Renaud, G., Bhérer, C., Moreno-Mayar, J. V., Fotakis, A. K., Allen, M. & 30 flere, Allmäe, R., Molak, M., Cappellini, Enrico, Scorrano, Gabriele, McColl, Hugh, Buzhilova, A., Fox, A., Albrechtsen, Anders, Schütz, B., Skar, B., Arcini, C., Lundstrøm, I., Cheng, J., Stenderup, Jesper Tandberg, Iversen, K. H., Arge, S. V., Ellingvåg, S., Orlando, L., Pentz, P., Jessen, M. D., Pedersen, A., Jørkov, M L S, Lynnerup, Niels, Gilbert, M Thomas P, Allentoft, Morten Erik, Sindbæk, S. M., Kristiansen, K., Nielsen, Rasmus, Werge, Thomas & Willerslev, Eske, 2020, I: Nature. 585, 7825, s. 390-396 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    37. Udgivet

      Recent mitochondrial lineage extinction in the critically endangered Javan rhinoceros

      Margaryan, Ashot, Sinding, Mikkel Holger Strander, Liu, Shanlin, Vieira, Filipe Garrett, Chan, Y. L., Nathan, S. K. S. S., Moodley, Y., Bruford, M. W. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Zoological Journal of the Linnean Society. 190, 1, s. 372-383 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    38. Udgivet

      Near-Random Distribution of Chromosome-Derived Circular DNA in the Condensed Genome of Pigeons and the Larger, More Repeat-Rich Human Genome

      Møller, H. D., Ramos Madrigal, Jazmin, Prada Luengo, Inigo, Gilbert, M Thomas P & Regenberg, Birgitte, 2020, I: Genome Biology and Evolution. 12, 2, s. 3762-3777 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    39. Udgivet

      Historical isolation facilitates species radiation by sexual selection: Insights from Chorthippus grasshoppers

      Nolen, Z. J., Yildirim, B., Irisarri, I., Liu, Shanlin, Groot Crego, C., Amby, Daniel Buchvaldt, Mayer, F., Gilbert, M Thomas P & Pereira, R. J., 2020, I: Molecular Ecology. 29, 24, s. 4985-5002

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    40. Udgivet

      Holo-Omics: Integrated Host-Microbiota Multi-omics for Basic and Applied Biological Research

      Jessen, Lasse Nyholm, Koziol, Adam Leslie, Marcos, S., Botnen, A. B., Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Gopalakrishnan, Shyam, Limborg, Morten Tønsberg, Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2020, I: iScience. 23, 8, s. 1-16 101414.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    41. Udgivet

      Darwin's Fancy Revised: An Updated Understanding of the Genomic Constitution of Pigeon Breeds

      Antunes Pacheco, George, van Grouw, H., Shapiro, M. D., Gilbert, M Thomas P & Vieira, Filipe Garrett, 2020, I: Genome Biology and Evolution. 12, 3, s. 136-150 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    42. Udgivet

      Genomes of Pleistocene Siberian Wolves Uncover Multiple Extinct Wolf Lineages

      Ramos-Madrigal, J., Sinding, M-H. S., Carøe, C., Mak, S. S. T., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Fedorov, S., Kandyba, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Feuerborn, T. R., Pitulko, V. V., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Larson, G., Frantz, L. A. F., Willerslev, E., Meldgaard, M. & 7 flere, Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Bachmann, L., Wiig, Ø., Hansen, Anders Johannes, Gilbert, M Thomas P & Gopalakrishnan, Shyam, 2020, I: Current biology : CB. 31, s. 198-206

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    43. Udgivet

      Hi-C chromosome conformation capture sequencing of avian genomes using the BGISEQ-500 platform

      Sandoval-Velasco, Marcela, Rodríguez, Juan Antonio, Estrada, C. P., Zhang, G., Aiden, E. L., Marti-Renom, M. A., Gilbert, M Thomas P & Smith, O., 2020, I: GigaScience. 9, 8, 7 s., giaa087.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    44. Udgivet

      Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition

      Sinding, M. H. S., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, F. G., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Andersen-Ranberg, E. U., Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, E., Skoglund, P. & 15 flere, Fredholm, Merete, Wennerberg, S. E., Heide-Jørgensen, M. P., Dietz, R., Sonne, C., Meldgaard, Morten, Dalén, L., Larson, G., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Bachmann, L., Wiig, Ø., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    45. Udgivet

      Genomic and proteomic evidence for Mycobacterium leprae in human medieval dental calculus from Trondheim, Norway

      Vagene, A. J., Fotaki, Anna Katerina, Denham, S. D., Orbegozo, M., Mackie, Meaghan, Olsen, Jesper Velgaard, Cappellini, Enrico, Christophersen, A. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: American Journal of Physical Anthropology. 171, s. 291 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

    46. Udgivet

      Using in silico predicted ancestral genomes to improve the efficiency of paleogenome reconstruction

      Vieira, Filipe Garrett, Castruita, J. A. S. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Ecology and Evolution. 10, 23, s. 12700-12709

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    47. Udgivet

      Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss

      Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    48. Udgivet

      A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux

      da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, Osório, H., Winkelmann, I., Simakov, O., Rasmussen, Simon, Rahman, M. Z., Pisani, D., Vinther, J., Jarvis, E., KU, thw266, Strugnell, J. M., Castro, L. F. C., Fedrigo, O., Patricio, M., Li, Q., Rocha, S., Antunes, A., Wu, Y., Ma, B., Sanges, R., Vinar, T., Blagoev, B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Nielsen, Rasmus & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    49. Udgivet

      The evolutionary history of extinct and living lions

      de Manuel, M., Barnett, R., Sandoval-Velasco, M., Yamaguchi, N., Vieira, F. G., Mendoza, M. L. Z., Liu, S., Martin, M. D., Sinding, M-H. S., Mak, S. S. T., Caroe, C., Liu, S., Guo, C., Zheng, J., Zazula, G., Baryshnikov, G., Eizirik, E., Koepfli, K-P., Johnson, W. E., Antunes, A. & 9 flere, Sicheritz-Pontén, Thomas, Gopalakrishnan, Shyam, Larson, G., Yang, H., O'Brien, S. J., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Marques-Bonet, T. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 20, s. 10927-10934 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    50. Udgivet

      Plasmodium vivax Malaria Viewed through the Lens of an Eradicated European Strain

      van Dorp, L., Gelabert, P., Rieux, A., de Manuel, M., de-Dios, T., Gopalakrishnan, Shyam, Caroe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Fregel, R., Olalde, I., Escosa, R., Aranda, C., Huijben, S., Mueller, I., Marques-Bonet, T., Balloux, F., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 37, 3, s. 773-785 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    51. 2021
    52. Udgivet

      The role of the gut microbiota in the dietary niche expansion of fishing bats

      Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Jessen, Lasse Nyholm, Morris, E., Chaverri, G., Montalvo, L. G. H., Flores-Martinez, J. J., Lin, A., Razgour, O., Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 14 s., 76.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    53. Udgivet

      Non-invasive surveys of mammalian viruses using environmental DNA

      Alfano, N., Dayaram, A., Axtner, J., Tsangaras, K., Kampmann, Marie-Louise, Mohamed, A., Wong, S. T., Gilbert, M Thomas P, Wilting, A. & Greenwood, A. D., 2021, I: Methods in Ecology and Evolution. 12, 10, s. 1941-1952

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    54. Udgivet

      Molecular parallelisms between pigmentation in the avian iris and the integument of ectothermic vertebrates

      Andrade, P., Gazda, M. A., Araújo, P. M., Afonso, S., Rasmussen, Jacob Agerbo, Marques, C. I., Lopes, R. J., Gilbert, M Thomas P & Carneiro, M., 2021, I: PLOS Genetics. 17, 2, 16 s., 1009404.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    55. Udgivet

      Feasibility of applying shotgun metagenomic analyses to grapevine leaf, rhizosphere and soil microbiome characterisation

      Azevedo-Silva, D., Rasmussen, Jacob Agerbo, Carneiro, M., Gilbert, M Thomas P & Azevedo, H., 2021, I: Australian Journal of Grape and Wine Research. 27, 4, s. 519-526 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    56. Udgivet

      The germline mutational process in rhesus macaque and its implications for phylogenetic dating

      Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Bakker, J., Zheng, J., Li, P., Antunes Pacheco, George, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kamilari, M., Gilbert, M Thomas P, Schierup, M. H. & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 5, 14 s., giab029.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    57. Udgivet

      Reconsidering domestication from a process archaeology perspective

      Bogaard, A., Allaby, R., Arbuckle, B. S., Bendrey, R., Crowley, S., Cucchi, T., Denham, T., Frantz, L., Fuller, D., Gilbert, M Thomas P, Karlsson, E., Manin, A., Marshall, F., Mueller, N., Peters, J., Stépanoff, C., Weide, A. & Larson, G., 2021, I: World Archaeology. 53, 1, s. 56-77 22 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    58. Udgivet

      Salmon gut microbiota correlates with disease infection status: potential for monitoring health in farmed animals

      Bozzi, D., Rasmussen, Jacob Agerbo, Carøe, C., Sveier, H., Nordøy, K., Gilbert, M Thomas P & Limborg, Morten Tønsberg, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 1, 17 s., 30.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    59. Udgivet

      Evolutionary history of the extinct Sardinian dhole

      Ciucani, M. M., Jensen, J. K., Sinding, M. S., Smith, O., Lucenti, S. B., Rosengren, E., Rook, L., Tuveri, C., Arca, M., Cappellini, Enrico, Galaverni, M., Randi, E., Guo, C., KU, thw266, Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Gilbert, M Thomas P & Gopalakrishnan, Shyam, 2021, I: Current Biology. 31, 24, s. 5571-5579.e6 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    60. Udgivet

      Leech blood-meal invertebrate-derived DNA reveals differences in Bornean mammal diversity across habitats

      Drinkwater, R., Jucker, T., Potter, J. H. T., Swinfield, T., Coomes, D. A., Slade, E. M., Gilbert, M Thomas P, Lewis, O. T., Bernard, H., Struebig, M. J., Clare, E. L. & Rossiter, S. J., 2021, I: Molecular Ecology. 30, 13, s. 3299-3312 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    61. Udgivet

      Modern Siberian dog ancestry was shaped by several thousand years of Eurasian-wide trade and human dispersal

      Feuerborn, T. R., Carmagnini, A., Losey, R. J., Nomokonova, T., Askeyev, A., Askeyev, I., Askeyev, O., Antipina, E. E., Appelt, M., Bachura, O. P., Beglane, F., Bradley, D. G., Daly, K. G., Gopalakrishnan, S., Gregersen, K. M., Guo, C., Gusev, A. V., Jones, C., Kosintsev, P. A., Kuzmin, Y. V. & 17 flere, Mattiangeli, V., Perri, A. R., Plekhanov, A. V., Ramos Madrigal, Jazmin, Schmidt, A. L., Shaymuratova, D., Smith, O., Yavorskaya, L. V., KU, thw266, Willerslev, Eske, Meldgaard, Morten, Gilbert, M Thomas P, Larson, G., Dalén, L., Hansen, Anders Johannes, Sinding, Mikkel Holger Strander & Frantz, L., 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 39, e2100338118.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    62. Udgivet

      The genetic impact of an Ebola outbreak on a wild gorilla population

      Fontsere, C., Frandsen, P., Hernandez-Rodriguez, J., Niemann, Jonas, Scharff-Olsen, Camilla Hjorth, Vallet, D., Le Gouar, P., Ménard, N., Navarro, A., Siegismund, Hans Redlef, Hvilsom, C., Gilbert, M Thomas P, Kuhlwilm, M., Hughes, D. & Marques-Bonet, T., 2021, I: BMC Genomics. 22, 12 s., 735.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    63. Udgivet

      Runs of homozygosity in killer whale genomes provide a global record of demographic histories

      Foote, A. D., Hooper, R., Alexander, A., Baird, R. W., Baker, C. S., Ballance, L., Barlow, J., Brownlow, A., Collins, T., Constantine, R., Dalla Rosa, L., Davison, N. J., Durban, J. W., Esteban, R., Excoffier, L., Martin, S. L. F., Forney, K. A., Gerrodette, T., Gilbert, M. T. P., Guinet, C. & 14 flere, Hanson, M. B., Li, S., Martin, M. D., Robertson, K. M., Samarra, F. I. P., de Stephanis, R., Tavares, S. B., Tixier, P., Totterdell, J. A., Wade, P., Wolf, J. B. W., Fan, G., Zhang, Y. & Morin, P. A., 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6162-6177 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    64. Udgivet

      Ancient microRNA profiles of 14,300-yr-old canid samples confirm taxonomic origin and provide glimpses into tissue-specific gene regulation from the Pleistocene

      Fromm, B., Tarbier, M., Smith, O., Marmol-Sanchez, E., Dalen, L., Gilbert, M Thomas P & Friedlander, M. R., 2021, I: RNA. 27, 3, s. 324-334 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    65. Udgivet

      Ancient and modern stickleback genomes reveal the demographic constraints on adaptation

      Kirch, M., Romundset, A., Gilbert, M Thomas P, Jones, F. C. & Foote, A. D., 2021, I: Current Biology. 31, 9, s. 2027-2036.e8 18 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    66. Udgivet

      A towering genome: Experimentally validated adaptations to high blood pressure and extreme stature in the giraffe

      Liu, C., Gao, J., Cui, X., Li, Z., Chen, L., Yuan, Y., Zhang, Y., Mei, L., Zhao, L., Cai, D., Hu, M., Zhou, B., Li, Z., Qin, T., Si, H., Li, G., Lin, Z., Xu, Y., Zhu, C., Yin, Y. & 9 flere, Zhang, C., Xu, W., Li, Q., Wang, K., Gilbert, M Thomas P, Heller, Rasmus, Wang, W., Huang, J. & Qiu, Q., 2021, I: Science Advances. 7, 12, 13 s., eabe9459.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    67. Udgivet

      Ancient and modern genomes unravel the evolutionary history of the rhinoceros family

      Liu, S., Westbury, M. V., Dussex, N., Mitchell, K. J., Sinding, M. H. S., Heintzman, P. D., Duchêne, D. A., Kapp, J. D., von Seth, J., Heiniger, H., Sánchez-Barreiro, F., Margaryan, A., André-Olsen, R., De Cahsan, B., Meng, G., Yang, C., Chen, L., van der Valk, T., Moodley, Y., Rookmaaker, K. & 19 flere, Bruford, M. W., Ryder, O., Steiner, C., Sonsbeek, L. G. R. B., Vartanyan, S., Guo, C., Cooper, A., Kosintsev, P., Kirillova, I., Lister, A. M., Marques-Bonet, T., Gopalakrishnan, Shyam, Dunn, Rob, Lorenzen, Eline, Shapiro, B., KU, thw266, Antoine, P. O., Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Cell. 184, 19, s. 4874-4885.e16

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    68. Udgivet

      Mitochondrial genomes of Danish vertebrate species generated for the national DNA reference database, DNAmark

      Margaryan, Ashot, Noer, Christina, Richter, S. R., Restrup, M. E., Bülow‐hansen, J. L., Leerhøi, Frederik, Arfaoui, Emilia Marie Rolander, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Gilbert, M Thomas P & Bohmann, Kristine, 2021, I: Environmental DNA. 3, 2, s. 472-480

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    69. Udgivet

      The pangenome of the fungal pathogen Neonectria neomacrospora

      Nielsen, Knud Nor, Sirén, K., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Gilbert, M Thomas P, Korneliussen, Thorfinn Sand & Hansen, Ole Kim, 12 mar. 2021, 30 s. (bioRxiv).

      Publikation: Working paper › Preprint

    70. Udgivet

      Extended survival of Pleistocene Siberian wolves into the early 20th century on the island of Honshu

      Niemann, Jonas, Gopalakrishnan, Shyam, Yamaguchi, N., Ramos Madrigal, Jazmin, Wales, N., Gilbert, M Thomas P & Sinding, M. S., 2021, I: iScience. 24, 25 s., 101904.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    71. Udgivet

      Identification of African swine fever virus transcription within peripheral blood mononuclear cells of acutely infected pigs

      Olesen, A. S., Kodama, M., Lohse, L., Accensi, F., Rasmussen, T. B., Lazov, C. M., Limborg, Morten Tønsberg, Gilbert, M Thomas P, Bøtner, A. & Belsham, Graham John, 2021, I: Viruses. 13, 11, 2333.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    72. Udgivet

      Fine-tuning biodiversity assessments: A framework to pair eDNA metabarcoding and morphological approaches

      Pereira, Catia Lucio, Gilbert, M Thomas P, Araújo, M. B. & Matias, M. G., 2021, I: Methods in Ecology and Evolution. 12, 12, s. 2397-2409 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    73. Udgivet

      Dire wolves were the last of an ancient New World canid lineage

      Perri, A. R., Mitchell, K. J., Mouton, A., Alvarez-Carretero, S., Hulme-Beaman, A., Haile, J., Jamieson, A., Meachen, J., Lin, A. T., Schubert, B. W., Ameen, C., Antipina, E. E., Bover, P., Brace, S., Carmagnini, A., Carøe, C., Samaniego Castruita, J. A., Chatters, J. C., Dobney, K., dos Reis, M. & 29 flere, Evin, A., Gaubert, P., Gopalakrishnan, Shyam, Gower, Graham, Heiniger, H., Helgen, K. M., Kapp, J., Kosintsev, P. A., Linderholm, A., Ozga, A. T., Presslee, S., Salis, A. T., Saremi, N. F., Shew, C., Skerry, K., Taranenko, D. E., Thompson, M., Sablin, M. V., Kuzmin, Y. V., Collins, Matthew James, Sinding, M. S., Gilbert, M Thomas P, Stone, A. C., Shapiro, B., Van Valkenburgh, B., Wayne, R. K., Larson, G., Cooper, A. & Frantz, L. A. F., 2021, I: Nature. 591, s. 87-91

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    74. Udgivet

      Contrasting genetic signal of recolonization after rainforest fragmentation in African trees with different dispersal abilities

      Piñeiro, R., Hardy, O. J., Tovar, C., Gopalakrishnan, Shyam, Vieira, Filipe Garrett & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 27, 9 s., e2013979118.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    75. Udgivet

      An integrated morphological-molecular approach reveals new insights on the systematics of the octocoral Telestula humilis (Thomson, 1927) (Octocorallia: Alcyonacea : Clavulariidae)

      Poliseno, A., Altuna, A., Puetz, Lara Christine, Mak, Sarah Siu Tze, Rios, P., Petroni, E., McFadden, C. S., Sørensen, Martin Vinther & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Invertebrate Systematics. 35, 3, s. 261-281 21 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    76. Udgivet

      Gut Microbiota Linked with Reduced Fear of Humans in Red Junglefowl Has Implications for Early Domestication

      Puetz, Lara Christine, Delmont, T. O., Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Guo, C., KU, thw266, Katajamaa, R., Jensen, P. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Advanced Genetics. 2, 4, 12 s., 2100018.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    77. Udgivet

      Genome-resolved metagenomics suggests a mutualistic relationship between Mycoplasma and salmonid hosts

      Rasmussen, Jacob Agerbo, Villumsen, Kasper Rømer, Duchene, David, Puetz, Lara Christine, Delmont, T. O., Sveier, H., Jørgensen, Louise von Gersdorff, Præbel, K., Martin, M. D., Bojesen, Anders Miki, Gilbert, M Thomas P, Kristiansen, Karsten & Limborg, Morten Tønsberg, 2021, I: Communications Biology. 4, 10 s., 579.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    78. Udgivet

      eDNA‐based biomonitoring at an experimental German vineyard to characterize how management regimes shape ecosystem diversity

      Rasmussen, Jacob Agerbo, Nielsen, M., Mak, Sarah Siu Tze, Döring, J., Klincke, F., Gopalakrishnan, Shyam, Dunn, Rob, Kauer, R. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Environmental DNA. 3, 1, s. 70-82 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    79. Udgivet

      Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species

      Rhie, A., McCarthy, S. A., Fedrigo, O., Damas, J., Formenti, G., Koren, S., Uliano-Silva, M., Chow, W., Fungtammasan, A., Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Chaisson, M., Gedman, G. L., Cantin, L. J., Thibaud-Nissen, F., Haggerty, L., Bista, I., Smith, M., Haase, B. & 107 flere, Mountcastle, J., Winkler, S., Paez, S., Howard, J., Vernes, S. C., Lama, T. M., Grutzner, F., Warren, W. C., Balakrishnan, C. N., Burt, D., George, J. M., Biegler, M. T., Iorns, D., Digby, A., Eason, D., Robertson, B., Edwards, T., Wilkinson, M., Turner, G., Meyer, A., Kautt, A. F., Franchini, P., Detrich, H. W., Svardal, H., Wagner, M., Naylor, G. J. P., Pippel, M., Malinsky, M., Mooney, M., Simbirsky, M., Hannigan, B. T., Pesout, T., Houck, M., Misuraca, A., Kingan, S. B., Hall, R., Kronenberg, Z., Sović, I., Dunn, C., Ning, Z., Hastie, A., Lee, J., Selvaraj, S., Green, R. E., Putnam, N. H., Gut, I., Ghurye, J., Garrison, E., Sims, Y., Collins, J., Pelan, S., Torrance, J., Tracey, A., Wood, J., Dagnew, R. E., Guan, D., London, S. E., Clayton, D. F., Mello, C. V., Friedrich, S. R., Lovell, P. V., Osipova, E., Al-Ajli, F. O., Secomandi, S., Kim, H., Theofanopoulou, C., Hiller, M., Zhou, Y., Harris, R. S., Makova, K. D., Medvedev, P., Hoffman, J., Masterson, P., Clark, K., Martin, F., Howe, K., Flicek, P., Walenz, B. P., Kwak, W., Clawson, H., Diekhans, M., Nassar, L., Paten, B., Kraus, R. H. S., Crawford, A. J., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Venkatesh, B., Murphy, R. W., Koepfli, K., Shapiro, B., Johnson, W. E., Di Palma, F., Marques-Bonet, T., Teeling, E. C., Warnow, T., Graves, J. M., Ryder, O. A., Haussler, D., O’Brien, S. J., Korlach, J., Lewin, H. A., Howe, K., Myers, E. W., Durbin, R., Phillippy, A. M. & Jarvis, E. D., 2021, I: Nature. 592, 7856, s. 737-746 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    80. Udgivet

      The genome sequence of the grey wolf, Canis lupus Linnaeus 1758

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishnan, Shyam, Raundrup, K., Dalén, L., Threlfall, J., Gilbert, M Thomas P, Darwin Tree of Life Barcoding collective, D. T. O. L. B. C., Wellcome Sanger Institute Tree of Life programme, W. S. I. T. O. L. P., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: DNA Pipelines collective, W. S. I. S. O. D. P. C. & Tree of Life Core Informatics collective, Darwin Tree of Life Consortium, T. O. L. C. I. C. D. T. O. L. C., 2021, I: Wellcome Open Research. 6, 12 s., 310.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    81. Udgivet

      Kouprey (Bos sauveli) genomes unveil polytomic origin of wild Asian Bos

      Sinding, M. S., Ciucani, M. M., Ramos Madrigal, Jazmin, Carmagnini, A., Rasmussen, Jacob Agerbo, Feng, S., Chen, G., Vieira, Filipe Garrett, Mattiangeli, V., Ganjoo, R. K., Larson, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Frantz, L., Gilbert, M Thomas P & Bradley, D. G., 2021, I: iScience. 24, 11, 18 s., 103226.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    82. Udgivet

      Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning

      Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    83. Udgivet

      Historical population declines prompted significant genomic erosion in the northern and southern white rhinoceros (Ceratotherium simum)

      Sánchez-Barreiro, F., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Westbury, Michael Vincent, de Manuel, M., Margaryan, Ashot, Ciucani, M. M., Vieira, Filipe Garrett, Patramanis, Ioannis, Kalthoff, D. C., Timmons, Z., Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Ryder, O. A., KU, thw266, Marques-Bonet, T., Moodley, Y. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6355-6369 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    84. Udgivet

      A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives: [version 1; peer review: 2 approved]

      Westbury, Michael Vincent, Barnett, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Gower, Graham, Vieira, Filipe Garrett, de Manuel, M., Hansen, Anders Johannes, Yamaguchi, N., Werdelin, L., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lorenzen, Eline, 2021, I: Open Research Europe. 1, 15 s., 25.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    85. Udgivet

      A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives: [version 2; peer review: 2 approved]

      Westbury, Michael Vincent, Barnett, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Gower, Graham, Vieira, Filipe Garrett, de Manuel, M., Hansen, Anders Johannes, Yamaguchi, N., Werdelin, L., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lorenzen, Eline, 2021, I: Open Research Europe. 1, 16 s., 25.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    86. Udgivet

      Genomic insights into the conservation status of the world's last remaining Sumatran rhinoceros populations

      von Seth, J., Dussex, N., Diez-del-Molino, D., van der Valk, T., Kutschera, V. E., Kierczak, M., Steiner, C. C., Liu, S., Gilbert, M. T. P., Sinding, M-H. S., Prost, S., Guschanski, K., Nathan, S. K. S. S., Brace, S., Chan, Y. L., Wheat, C. W., Skoglund, P., Ryder, O. A., Goossens, B., Gotherstrom, A. & 1 flere, Dalen, L., 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 11 s., 2393.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    87. 2022
    88. Udgivet

      Disentangling host–microbiota complexity through hologenomics

      Alberdi, Antton, Andersen, Sandra Breum, Limborg, Morten Tønsberg, Dunn, Rob & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Nature Reviews Genetics. 23, 5, s. 281-297 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    89. Udgivet

      Grey wolf genomic history reveals a dual ancestry of dogs

      Bergström, A., Stanton, D. W. G., Taron, U. H., Frantz, L., Sinding, M. H. S., Ersmark, E., Pfrengle, S., Cassatt-Johnstone, M., Lebrasseur, O., Girdland-Flink, L., Fernandes, D. M., Ollivier, M., Speidel, L., Gopalakrishnan, S., Westbury, M. V., Ramos-Madrigal, J., Feuerborn, T. R., Reiter, E., Gretzinger, J., Münzel, S. C. & 61 flere, Swali, P., Conard, N. J., Carøe, C., Haile, James Seymour, Linderholm, A., Androsov, S., Barnes, I., Baumann, C., Benecke, N., Bocherens, H., Brace, S., Carden, R. F., Drucker, D. G., Fedorov, S., Gasparik, M., Germonpré, M., Grigoriev, S., Groves, P., Hertwig, S. T., Ivanova, V. V., Janssens, L., Jennings, R. P., Kasparov, A. K., Kirillova, I. V., Kurmaniyazov, I., Kuzmin, Y. V., Kosintsev, P. A., Lázničková-Galetová, M., Leduc, C., Nikolskiy, P., Nussbaumer, M., O’Drisceoil, C., Orlando, L., Outram, A., Pavlova, E. Y., Perri, A. R., Pilot, M., Pitulko, V. V., Plotnikov, V. V., Protopopov, A. V., Rehazek, A., Sablin, M., Seguin-Orlando, A., Storå, J., Verjux, C., Zaibert, V. F., Zazula, G., Crombé, P., Hansen, Anders Johannes, Willerslev, Eske, Leonard, J. A., Götherström, A., Pinhasi, R., Schuenemann, V. J., Hofreiter, M., Gilbert, M Thomas P, Shapiro, B., Larson, G., Krause, J., Dalén, L. & Skoglund, P., 2022, I: Nature. 607, 7918, s. 313-320

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    90. Udgivet

      Uncovering the genomic basis of an extraordinary plant invasion

      Bieker, V. C., Battlay, P., Petersen, B., Sun, X., Wilson, J., Brealey, J. C., Bretagnolle, F., Nurkowski, K., Lee, C., Barreiro, F. S., Owens, G. L., Lee, J. Y., Kellner, F. L., van Boheeman, L., Gopalakrishnan, S., Gaudeul, M., Mueller-Schaerer, H., Lommen, S., Karrer, G., Chauvel, B. & 8 flere, Sun, Y., Kostantinovic, B., Dalén, L., Poczai, P., Rieseberg, L. H., Gilbert, M Thomas P, Hodgins, K. A. & Martin, M. D., 2022, I: Science Advances. 8, 34, 18 s., eabo5115.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    91. Udgivet

      Conservation genomics of the endangered Seychelles Magpie-Robin (Copsychus sechellarum): a unique insight into the history of a precious endemic bird

      Cavill, Emily Louisa, Gopalakrishnan, Shyam, Puetz, Lara Christine, Ribeiro, Â. M., Mak, Sarah Siu Tze, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Antunes Pacheco, George, Dunlop, B., Accouche, W., Shah, N., Zora, A., Calabrese, L., Genner, M., Jones, G., Guo, C., KU, thw266 & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Ibis. 164, 2, s. 396-410 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    92. Udgivet

      To bee, or not to bee? One leg is the question

      Cavill, Emily Louisa, Liu, S., Zhou, X. & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Molecular Ecology Resources. 22, 5, s. 1868-1874 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    93. Udgivet

      The genomic basis of the plant island syndrome in Darwin’s giant daisies

      Cerca, J., Petersen, B., Lazaro-Guevara, J. M., Rivera-Colón, A., Birkeland, S., Vizueta, J., Li, S., Li, Q., Loureiro, J., Kosawang, C., Díaz, P. J., Rivas-Torres, G., Fernández-Mazuecos, M., Vargas, P., McCauley, R. A., Petersen, G., Santos-Bay, L., Wales, N., Catchen, J. M., Machado, D. & 9 flere, Nowak, M. D., Suh, A., Sinha, N. R., Nielsen, Lene Rostgaard, Seberg, Ole, Gilbert, M Thomas P, Leebens-Mack, J. H., Rieseberg, L. H. & Martin, M. D., 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3729.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    94. Udgivet

      Genomic insights into the secondary aquatic transition of penguins

      Cole, T. L., Zhou, C., Fang, M., Pan, H., Ksepka, D. T., Fiddaman, S. R., Emerling, C. A., Thomas, D. B., Bi, X., Fang, Q., Ellegaard, M. R., Feng, S., Smith, A. L., Heath, T. A., Tennyson, A. J. D., Borboroglu, P. G., Wood, J. R., Hadden, P. W., Grosser, S., Bost, C. A. & 20 flere, Cherel, Y., Mattern, T., Hart, T., Sinding, Mikkel Holger Strander, Shepherd, L. D., Phillips, R. A., Quillfeldt, P., Masello, J. F., Bouzat, J. L., Ryan, P. G., Thompson, D. R., Ellenberg, U., Dann, P., Miller, G., Dee Boersma, P., Zhao, R., Gilbert, M Thomas P, Yang, H., Zhang, D. & KU, thw266, 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3912.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    95. Udgivet

      Ancient proteins resolve controversy over the identity of Genyornis eggshell

      Demarchi, B., Stiller, Josefin, Grealy, A., Mackie, Meaghan, Deng, Y., Gilbert, M Thomas P, Clarke, J., Legendre, L. J., Boano, R., Sicheritz-Pontén, Thomas, Magee, J., KU, thw266, Bunce, M., Collins, Matthew James & Miller, G., 2022, I: PNAS. 119, 43, 9 s., e2109326119.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    96. Udgivet

      Genome-wide re-sequencing reveals the adaptive potential of European ash (Fraxinus excelsior)

      Doonan, J., Budde, K. B., Lobo, A., Kosawang, C., Verbylaite, R., Pliura, A., Ulaszewski, B., Thomas, K., Konrad, H., Jørgensen, H. J. L., Seegmüller, S., Liziniewicz, M., Cleary, M., Nemesio-Gorriz, M., Fussi, B., Kirisits, T., Gilbert, M. T. P., Martin, M., Heuertz, M., Kjær, E. D. & 1 flere, Nielsen, L. R., 2022, 7th IUFRO International Workshop on the Genetics of Tree-Parasite Interactions in Forestry: Book of abstracts: GTPI 2022. IUFRO, s. 49 1 s.

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning

    97. Udgivet

      Genetic load and adaptive potential of a recovered avian species that narrowly avoided extinction

      Femerling Romero, Maria Georgette, Oosterhout, C. V., Feng, S., Bristol, R. M., KU, thw266, Groombridge, J., Gilbert, M Thomas P & Morales Villegas, Hernan Eduardo, 2022, bioRxiv, 23 s.

      Publikation: Working paper › Preprint

    98. Udgivet

      The Australian dingo is an early offshoot of modern breed dogs

      Field, M. A., Yadav, S., Dudchenko, O., Esvaran, M., Rosen, B. D., Skvortsova, K., Edwards, R. J., Keilwagen, J., Cochran, B. J., Manandhar, B., Bustamante, S., Rasmussen, J. A., Melvin, R. G., Chernoff, B., Omer, A., Colaric, Z., Chan, E. K. F., Minoche, A. E., Smith, T. P. L., Gilbert, M. T. P. & 5 flere, Bogdanovic, O., Zammit, R. A., Thomas, T., Aiden, E. L. & Ballard, J. W. O., 2022, I: Science Advances. 8, 16, 14 s., eabm5944.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    99. Udgivet

      The era of reference genomes in conservation genomics

      Formenti, G., Theissinger, K., Fernandes, C., Bista, I., Bombarely, A., Bleidorn, C., Ciofi, C., Crottini, A., Godoy, J. A., Höglund, J., Malukiewicz, J., Mouton, A., Oomen, R. A., Paez, S., Palsbøll, P. J., Pampoulie, C., Ruiz-López, M. J., Svardal, H., Theofanopoulou, C., de Vries, J. & 8 flere, Waldvogel, A. M., KU, thw266, Mazzoni, C. J., Jarvis, E., Bálint, M., Gilbert, M Thomas P, tsr259, tsr259 & European Reference Genome Atlas (ERGA) Consortium, E. R. G. A. (. C., 2022, I: Trends in Ecology and Evolution. 37, 3, s. 197-202 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    100. Udgivet

      Species-specific traits mediate avian demographic responses under past climate change

      Germain, Ryan Ross, Feng, S., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Nogues, David Bravo, 2022, bioRxiv, 24 s.

      Publikation: Working paper › Preprint

    101. Udgivet

      The population genomic legacy of the second plague pandemic

      Gopalakrishnan, S., Ebenesersdóttir, S. S., Lundstrøm, I. K. C., Turner-Walker, G., Moore, K. H. S., Luisi, P., Margaryan, A., Martin, M. D., Ellegaard, M. R., Magnússon, Ó., Sigurðsson, Á., Snorradóttir, S., Magnúsdóttir, D. N., Laffoon, J. E., van Dorp, L., Liu, X., Moltke, I., Ávila-Arcos, M. C., Schraiber, J. G., Rasmussen, S. & 40 flere, Juan, D., Gelabert, P., de-Dios, T., Fotaki, Anna Katerina, Iraeta Orbegozo, Miren, Vågene, Åshild Joanne, Denham, S. D., Christophersen, A., Stenøien, H. K., Vieira, Filipe Garrett, Liu, Shanlin, Günther, T., Kivisild, T., Moseng, O. G., Skar, B., Cheung, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Wales, N., Schroeder, Hannes, Campos, P. F., Guðmundsdóttir, V. B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Halgunset, J., Gilbert, E., Cavalleri, G. L., Hovig, E., Kockum, I., Olsson, T., Alfredsson, L., Hansen, Thomas Folkmann, Werge, Thomas, Willerslev, Eske, Balloux, F., Marques-Bonet, T., Lalueza-Fox, C., Nielsen, Rasmus, Stefánsson, K., Helgason, A. & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 21, s. 4743-4751.e6

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    102. Udgivet

      Travel Tales of a Worldwide Weed: Genomic Signatures of Plantago major L. Reveal Distinct Genotypic Groups With Links to Colonial Trade Routes

      Iwanycki Ahlstrand, N., Gopalakrishnan, S., Vieira, F. G., Bieker, V. C., Meudt, H. M., Dunbar-Co, S., Rothfels, C. J., Martinez-Swatson, K. A., Maldonado, C., Hassemer, G., Shipunov, A., Bowers, M. D., Gardner, E., Xu, M., Ghorbani, A., Amano, M., Grace, O. M., Pringle, J. S., Bishop, M., Manzanilla, V. & 18 flere, Cotrim, H., Blaney, S., Zubov, D., Choi, H., Yesil, Y., Bennett, B., Vimolmangkang, S., El-Seedi, H. R., Staub, P. O., Li, Z., Boldbaatar, D., Hislop, M., Caddy, L. J., Muasya, A. M., Saslis-Lagoudakis, C. H., Gilbert, M Thomas P, Zerega, N. J. C. & Rønsted, Nina, 2022, I: Frontiers in Plant Science. 13, 16 s., 838166.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    103. Udgivet

      Ancient and historical DNA in conservation policy

      Jensen, E. L., Díez-del-Molino, D., Gilbert, M Thomas P, Bertola, Laura, Borges, F., Cubric-Curik, V., de Navascués, M., Frandsen, P., Heuertz, M., Hvilsom, C., Jiménez-Mena, B., Miettinen, A., Moest, M., Chrzanová Pecnerová, Patrícia, Barnes, I. & Vernesi, C., 2022, I: Trends in Ecology and Evolution. 37, 5, s. 420-429 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    104. Udgivet

      Enriching captivity conditions with natural elements does not prevent the loss of wild-like gut microbiota but shapes its compositional variation in two small mammals

      Koziol, Adam Leslie, Larrañaga, Iñaki Odriozola, Jessen, Lasse Nyholm, Leonard, Aoife Mary, San Jose, C., Pauperio, J., Ferreira, C., Hansen, Anders Johannes, Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2022, I: MicrobiologyOpen. 11, 5, 19 s., e1318.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    Forrige 1 2 3 4 5 Næste

    ID: 12980