Søren Buus

Immunogenicity and reactogenicity following MMR vaccination in 5–7-month-old infants: a double-blind placebo-controlled randomized clinical trial in 6540 Danish infants

Vittrup, Dorthe Maria, Jensen, A., Sørensen, J. K., Zimakoff, A. C., Malon, M., Charabi, S., Johansen, M. R., Simões, E. A. F., Kirkby, N. S., Buus, Søren, Svensson, Jannet & Stensballe, Lone Graff, 2024, I: EClinicalMedicine. 68, 12 s., 102421.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genome-wide epitope mapping across multiple host species reveals significant diversity in antibody responses to Coxiella burnetii vaccination and infection

Bach, Emil, Fitzgerald, S. F., Williams-MacDonald, S. E., Mitchell, M., Golde, W. T., Longbottom, D., Nisbet, A. J., Dinkla, A., Sullivan, E., Pinapati, R. S., Tan, J. C., Joosten, L. A. B., Roest, H. J., Østerbye, Thomas, Koets, A. P., Buus, Søren & McNeilly, T. N., 2023, I: Frontiers in Immunology. 14, 20 s., 1257722.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Thiopurine 6TG treatment increases tumor immunogenicity and response to immune checkpoint blockade

Nazerai, L., Willis, S. C., Yankilevich, P., Di Leo, L., Bosisio, F. M., Frias, A., Bertolotto, C., Nersting, J., Thastrup, M., Buus, Søren, Thomsen, Allan Randrup, Nielsen, M., Rohrberg, K. S., Schmiegelow, Kjeld & de Zio, Daniela, 2023, I: OncoImmunology. 12, 1, 16 s., 2158610.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

High levels of antibodies 6 months after COVID-19 vaccination in children with severe chronic diseases: A prospective longitudinal case series

Nygaard, Ulrikka, Kirkby, N. S., Dungu, K. H. S., Nielsen, Kim G., Masmas, T., Juul, K., Born, P., Buus, Søren & Stensballe, Lone Graff, 2023, I: Acta Paediatrica. 112, 4, s. 802-804 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Efficacy of Phase I and Phase II Coxiella burnetii Bacterin Vaccines in a Pregnant Ewe Challenge Model

Williams-Macdonald, S. E., Mitchell, M., Frew, D., Palarea-Albaladejo, J., Ewing, D., Golde, W. T., Longbottom, D., Nisbet, A. J., Livingstone, M., Hamilton, C. M., Fitzgerald, S. F., Buus, Søren, Bach, Emil, Dinkla, A., Roest, H., Koets, A. P. & McNeilly, T. N., 2023, I: Vaccines. 11, 3, 19 s., 511.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Immunopeptidomic Analysis of BoLA-I and BoLA-DR Presented Peptides from Theileria parva Infected Cells

Connelley, T., Nicastri, A., Sheldrake, T., Vrettou, C., Fisch, A., Reynisson, B., Buus, Søren, Hill, A., Morrison, I., Nielsen, M. & Ternette, N., 2022, I: Vaccines. 10, 11, 1907.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HIV specific CD8⁺ T_RM-like cells in tonsils express exhaustive signatures in the absence of natural HIV control

Fardoos, R., Nyquist, S. K., Asowata, O. E., Kazer, S. W., Singh, A., Ngoepe, A., Giandhari, J., Mthabela, N., Ramjit, D., Singh, S., Karim, F., Buus, S., Anderson, F., Porterfield, J. Z., Sibiya, A. L., Bipath, R., Moodley, K., Kuhn, W., Berger, B., Nguyen, S. & 6 flere, de Oliveira, T., Ndung’u, T., Goulder, P., Shalek, A. K., Leslie, A. & Kløverpris, Henrik Nyhus, 2022, I: Frontiers in Immunology. 13, 912038.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Defective Proinsulin Handling Modulates the MHC I Bound Peptidome and Activates the Inflammasome in β-Cells

Khilji, Muhammad Saad, Faridi, P., Pinheiro-Machado, E., Hoefner, C., Dahlby, T., Aranha, R., Buus, Søren, Nielsen, M., Klusek, J., Mandrup-Poulsen, Thomas, Pandey, K., Purcell, A. W. & Marzec, Michal Tomasz, 2022, I: Biomedicines. 10, 4, 814.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Minimal Information about MHC Multimers (MIAMM)

Vita, R., Mody, A., Overton, J. A., Buus, Søren, Haley, S. T., Sette, A., Mallajosyula, V., Davis, M. M., Long, D. L., Willis, R. A., Peters, B. & Altman, J. D., 2022, I: Journal of Immunology. 208, 3, s. 531-537 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Focused B cell response to recurring gluten motif with implications for epitope spreading in celiac disease

Zhou, C., Østerbye, Thomas, Bach, Emil, Dahal-Koirala, S., Høydahl, L. S., Steinsbø, Ø., Jahnsen, J., Lundin, K. E. A., Buus, Søren, Sollid, L. M. & Iversen, R., 2022, I: Cell Reports. 41, 4, 111541.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Integral use of immunopeptidomics and immunoinformatics for the characterization of antigen presentation and rational identification of BoLA-DR-presented peptides and epitopes

Fisch, A., Reynisson, B., Benedictus, L., Nicastri, A., Vasoya, D., Morrison, I., Buus, Søren, Ferreira, B. R., De Miranda Santos, I. K. F., Ternette, N., Connelley, T. & Nielsen, M., 2021, I: Journal of Immunology. 206, 10, s. 2489-2497 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Capsid-like particles decorated with the SARS-CoV-2 receptor-binding domain elicit strong virus neutralization activity

Fougeroux, C., Goksøyr, L., Idorn, M., Soroka, V., Myeni, S. K., Dagil, R., Janitzek, C. M., Søgaard, M., Aves, K-L., Horsted, E. W., Erdogan, S. M., Gustavsson, T., Dorosz, J., Clemmensen, S., Fredsgaard, L., Thrane, S., Vidal-Calvo, E. E., Khalifé, P., Hulen, T. M., Choudhary, S. & 27 flere, Theisen, Michael, Singh, S. K., Garcia-Senosiain, A., Van Oosten, L., Pijlman, G., Hierzberger, B., Domeyer, T., Nalewajek, B. W., Strøbæk, A., Skrzypczak, M., Andersson, L. F., Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn, Christensen, Jan Pravsgaard, Dalebout, T. J., Iversen, Kasper, Harritshøj, L. H., Mordmüller, B., Ullum, H., Reinert, L. S., de Jongh, W. A., Kikkert, M., Paludan, S. R., Theander, Thor Grundtvig, Nielsen, Morten Agertoug, Salanti, Ali & Sander, Adam F. , 2021, I: Nature Communications. 12, 1, s. 324

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Normal T and B Cell Responses Against SARS-CoV-2 in a Family With a Non-Functional Vitamin D Receptor: A Case Report

Kongsbak-Wismann, Martin, Al-Jaberi, F. A. H., Schmidt, J. D., Ghanizada, M., Hansen, Cecilie Bo, Lopez, D. V., Woetmann, Anders , Ødum, Niels, Bonefeld, Charlotte Menne, Buus, Anette Stryhn, Garred, Peter, Buus, Søren & Geisler, Carsten, 2021, I: Frontiers in Immunology. 12, 758154.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Efficient control of zika virus infection induced by a non-replicating adenovector encoding zika virus ns1/ns2 antigens fused to the mhc class ii-associated invariant chain

Nazerai, L., Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn, Thomsen, Allan Randrup & Christensen, Jan Pravsgaard, 2021, I: Viruses. 13, 11, 2215.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Peptides derived from insulin granule proteins are targeted by cd8⁺ t cells across mhc class i restrictions in humans and nod mice

Azoury, M. E., Tarayrah, M., Afonso, G., Pais, A., Colli, M. L., Maillard, C., Lavaud, C., Alexandre-Heymann, L., Gonzalez-Duque, S., Verdier, Y., Vinh, J., Pinto, S., Buus, Søren, Dubois-Laforgue, D., Larger, E., Beressi, J. P., Bruno, G., Eizirik, D. L., You, S. & Mallone, R., 2020, I: Diabetes. 69, 12, s. 2678-2690 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

T cell responses induced by attenuated flavivirus vaccination are specific and show limited cross-reactivity with other flavivirus species

Grifoni, A., Voic, H., Dhanda, S. K., Kidd, C. K., Brien, J. D., Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn, Durbin, A. P., Whitehead, S., Diehl, S. A., De Silva, A. D., Balmaseda, A., Harris, E., Weiskopf, D. & Sette, A., 2020, I: Journal of Virology. 94, 10, e00089-20.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Effector CD8 T Cell-Dependent Zika Virus Control in the CNS: A Matter of Time and Numbers

Nazerai, L., Schøller, A. S., Bassi, Maria Rosaria, Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn, Christensen, Jan Pravsgaard & Thomsen, Allan Randrup, 2020, I: Frontiers in Immunology. 11, 16 s., 1977.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Immunoinformatics: Predicting Peptide-MHC Binding

Nielsen, M., Andreatta, M., Peters, B. & Buus, Søren, 2020, I: Annual Review of Biomedical Data Science. 3, s. 191-215 25 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA class ii specificity assessed by high-density peptide microarray interactions

Østerbye, Thomas, Nielsen, M., Dudek, N. L., Ramarathinam, S. H., Purcell, A. W., Schafer-Nielsen, C. & Buus, Søren, 2020, I: Journal of Immunology. 205, 1, s. 290-299 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A Systematic, Unbiased Mapping of CD8⁺ and CD4⁺ T Cell Epitopes in Yellow Fever Vaccinees

Buus, Anette Stryhn, Kongsgaard, M., Rasmussen, M., Harndahl, M. N., Østerbye, Thomas, Bassi, Maria Rosaria, Thybo, S., Gabriel, M., Hansen, Morten Bagge, Nielsen, M., Christensen, Jan Pravsgaard, Thomsen, Allan Randrup & Buus, Søren, 31 aug. 2020, I: Frontiers in Immunology. 11, 25 s., 1836.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Measles-mumps-rubella vaccine at 6 months of age, immunology, and childhood morbidity in a high-income setting: study protocol for a randomized controlled trial

Vittrup, Dorthe Maria, Laursen, A. C. L., Malon, M., Soerensen, J. K., Hjort, J., Buus, Søren, Svensson, Jannet & Stensballe, Lone Graff, 2020, I: Trials. 21, 1, 1015.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Unbiased Characterization of Peptide-HLA Class II Interactions Based on Large-Scale Peptide Microarrays; Assessment of the Impact on HLA Class II Ligand and Epitope Prediction

Wendorff, M., Garcia Alvarez, H. M., Østerbye, Thomas, ElAbd, H., Rosati, E., Degenhardt, F., Buus, Søren, Franke, A. & Nielsen, M., 2020, I: Frontiers in Immunology. 11, 8 s., 1705.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NNAlign-MA; MHC peptidome deconvolution for accurate MHC binding motif characterization and improved t-cell epitope predictions

Alvarez, B., Reynisson, B., Barra, C., Buus, Søren, Ternette, N., Connelley, T., Andreatta, M. & Nielsen, M., 2019, I: Molecular and Cellular Proteomics. 18, 12, s. 2459-2477 19 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Efficient Induction of T Cells against Conserved HIV-1 Regions by Mosaic Vaccines Delivered as Self-Amplifying mRNA

Moyo, N., Vogel, A. B., Buus, Søren, Erbar, S., Wee, E. G., Sahin, U. & Hanke, T., 2019, I: Molecular Therapy - Methods & Clinical Development. 12, s. 32-46 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Differential immunodominance hierarchy of CD8⁺ T-cell responses in HLA-B*27: 05- and -B*27:02-mediated control of HIV-1 infection

Adland, E., Hill, M., Lavandier, N., Csala, A., Edwards, A., Chen, F., Radkowski, M., Kowalska, J. D., Paraskevis, D., Hatzakis, A., Valenzuela-Ponce, H., Pfafferott, K., Williams, I., Pellegrino, P., Borrow, P., Mori, M., Rockstroh, J., Prado, J. G., Mothe, B., Dalmau, J. & 20 flere, Martinez-Picado, J., Tudor-Williams, G., Frater, J., Buus, Anette Stryhn, Buus, Søren, Teran, G. R., Mallal, S., John, M., Buchbinder, S., Kirk, G., Martin, J., Michael, N., Fellay, J., Deeks, S., Walker, B., Avila-Rios, S., Cole, D., Brander, C., Carrington, M. & Goulder, P., feb. 2018, I: Journal of Virology. 92, 4, 14 s., e01685-17.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Major TCR Repertoire Perturbation by Immunodominant HLA-B*44:03-Restricted CMV-Specific T Cells

Attaf, M., Malik, A., Severinsen, M. C., Roider, J., Ogongo, P., Buus, Søren, Ndung'u, T., Leslie, A., Kløverpris, Henrik Nyhus, Matthews, P. C., Sewell, A. K. & Goulder, P., 2018, I: Frontiers in Immunology. 9, 2539.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Footprints of antigen processing boost MHC class II natural ligand predictions

Barra, C., Alvarez, B., Paul, S., Sette, A., Peters, B., Andreatta, M., Buus, Søren & Nielsen, M., 2018, I: Genome Medicine. 10, 15 s., 84.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Personalized adoptive immunotherapy for patients with EBVassociated tumors and complications: Evaluation of novel naturally processed and presented EBV-derived T-cell epitopes

Bieling, M., Tischer, S., Kalinke, U., Blasczyk, R., Buus, Søren, Maecker-Kolhoff, B. & Eiz-Vesper, B., jan. 2018, I: OncoTarget. 9, 4, s. 4737-4757 21 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Islet-reactive CD8(+) T cell frequencies in the pancreas, but not in blood, distinguish type 1 diabetic patients from healthy donors

Culina, S., Lalanne, A. I., Afonso, G., Cerosaletti, K., Pinto, S., Sebastiani, G., Kuranda, K., Nigi, L., Eugster, A., Osterbye, T., Maugein, A., McLaren, J. E., Ladell, K., Larger, E., Beressi, J-P., Lissina, A., Appay, V., Davidson, H. W., Buus, S., Price, D. A. & 8 flere, Kuhn, M., Bonifacio, E., Battaglia, M., Caillat-Zucman, S., Dotta, F., Scharfmann, R., Kyewski, B. & Mallone, R., 2018, I: Science immunology. 3, 20, eaao4013.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Conventional and Neo-antigenic Peptides Presented by beta Cells Are Targeted by Circulating Naive CD8+T Cells in Type 1 Diabetic and Healthy Donors

Gonzalez-Duque, S., Azoury, M. E., Colli, M. L., Afonso, G., Turatsinze, J-V., Nigi, L., Lalanne, A. I., Sebastiani, G., Carre, A., Pinto, S., Culina, S., Corcos, N., Bugliani, M., Marchetti, P., Armanet, M., Diedisheim, M., Kyewski, B., Steinmetz, L. M., Buus, S., You, S. & 10 flere, Dubois-Laforgue, D., Larger, E., Beressi, J., Bruno, G., Dotta, F., Scharfmann, R., Eizirik, D. L., Verdier, Y., Vinh, J. & Mallone, R., 2018, I: Cell Metabolism. 28, 6, s. 946-960

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Improved methods for predicting peptide binding affinity to MHC class II molecules

Jensen, K. K., Andreatta, M., Marcatili, P., Buus, Søren, Greenbaum, J. A., Yan, Z., Sette, A., Peters, B. & Nielsen, M., 2018, I: Immunology. 154, 3, s. 394-406

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A New In Vivo Model to Study Protective Immunity to Zika Virus Infection in Mice With Intact Type I Interferon Signaling

Nazerai, L., Schøller, A. S., Rasmussen, P. O. S., Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn, Christensen, Jan Pravsgaard & Thomsen, Allan Randrup, 2018, I: Frontiers in Immunology. 9, 593.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HIV-1 adaptation to NK cell-mediated immune pressure

Elemans, M., Boelen, L., Rasmussen, M., Buus, Søren & Asquith, B., 2017, I: PLOS Pathogens. 13, 6, 20 s., e1006361.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

ArrayPitope: Automated analysis of amino acid substitutions for peptide microarray-based antibody epitope mapping

Hansen, C. S., Østerbye, Thomas, Marcatili, P., Lund, O., Buus, Søren & Nielsen, M., 2017, I: PLOS ONE. 12, 1, 14 s., e0168453.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Adaptive immune responses to booster vaccination against yellow fever virus are much reduced compared to those after primary vaccination

Kongsgaard, M., Bassi, Maria Rosaria, Rasmussen, M., Skjødt, K., Thybo, S., Gabriel, M., Hansen, Morten Bagge, Christensen, Jan Pravsgaard, Thomsen, Allan Randrup, Buus, Søren & Buus, Anette Stryhn, 2017, I: Scientific Reports. 7, 1, 14 s., 662.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HIV controllers exhibit enhanced frequencies of major histocompatibility complex class II tetramer⁺ Gag-specific CD4⁺ T cells in chronic clade C HIV-1 infection

Laher, F., Ranasinghe, S., Porichis, F., Mewalal, N., Pretorius, K., Ismail, N., Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn, Carrington, M., Walker, B. D., Ndung'u, T. & Ndhlovu, Z. M., apr. 2017, I: Journal of Virology. 91, 7, 17 s., e02477-16.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Post hoc assessment of the immunogenicity of bioengineered factor VIIa demonstrates the use of preclinical tools

Lamberth, K., Reedtz-Runge, S. L., Simon, J., Klementyeva, K., Pandey, G. S., Padkjær, S. B., Pascal, V., León, I. R., Gudme, C. N., Buus, Søren & Sauna, Z. E., 2017, I: Science Translational Medicine. 9, 372, eaag1286.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA-B*14: 02-restricted Env-specific CD8⁺ T-cell activity has highly potent antiviral efficacy associated with immune control of HIV infection

Leitman, E. M., Willberg, C. B., Tsai, M. H., Chen, H., Buus, S., Chen, F., Riddell, L., Haas, D., Fellay, J., Goedert, J. J., Piechocka-Trocha, A., Walker, B. D., Martin, J., Deeks, S., Wolinsky, S. M., Martinson, J., Martin, M., Qi, Y., Sáez-Cirión, A., Yang, O. O. & 3 flere, Matthews, P. C., Carrington, M. & Goulder, P. J. R., nov. 2017, I: Journal of Virology. 91, 22, 19 s., e00544-17.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Saporin-conjugated tetramers identify efficacious anti-HIV CD8+ T-cell specificities

Leitman, E. M., Palmer, C. D., Buus, Søren, Chen, F., Riddell, L., Sims, S., Klenerman, P., Sáez-Cirión, A., Walker, B. D., Hess, P. R., Altfeld, M., Matthews, P. C. & Goulder, P. J. R., okt. 2017, I: PLOS ONE. 12, 10, 13 s., e0184496.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Immunodominant cytomegalovirus-specific CD8+ T-cell responses in sub-Saharan African populations

Malik, A., Adland, E., Laker, L., Kløverpris, Henrik Nyhus, Fardoos, R., Roider, J., Severinsen, M. C., Chen, F., Riddell, L., Edwards, A., Buus, Søren, Jooste, P., Matthews, P. C. & Goulder, P. J. R., 2017, I: PLOS ONE. 12, 12, 15 s., e0189612.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Zika virus infection: a new in vivo model to define protective immunity

Nazerai, L., Scholler, A. S., Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn, Christensen, Jan Pravsgaard & Thomsen, Allan Randrup, okt. 2017, I: Scandinavian Journal of Immunology. 86, 4, s. 287-288 A-31425.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

Low antigen dose formulated in CAF09 adjuvant Favours a cytotoxic T-cell response following intraperitoneal immunization in Göttingen minipigs

Overgaard, N. H., Frøsig, T. M., Jakobsen, J. T., Buus, Søren, Andersen, Mads Hald & Jungersen, G., okt. 2017, I: Vaccine. 35, 42, s. 5629-5636 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Shared peptide binding of HLA Class I and II alleles associate with cutaneous nevirapine hypersensitivity and identify novel risk alleles

Pavlos, R., McKinnon, E. J., Ostrov, D. A., Peters, B., Buus, S., Koelle, D., Chopra, A., Schutte, R., Rive, C., Redwood, A., Restrepo, S., Bracey, A., Kaever, T., Myers, P., Speers, E., Malaker, S. A., Shabanowitz, J., Jing, Y., Gaudieri, S., Hunt, D. F. & 4 flere, Carrington, M., Haas, D. W., Mallal, S. & Phillips, E. J., 2017, I: Scientific Reports. 7, 12 s., 8653.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

In-situ immunohistochemical detection of ZnT8(186-194) reactive CD8(+) T cells in the pancreas of nPOD type 1 diabetic donors

Sebastiani, G., Nigi, L., Culina, S., Afonso, G., Ventriglia, G., Buus, Søren, Dotta, F. & Mallone, R., 2017, I: Diabetologia. 60, S1, s. S200-S201

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

Prediction and in vitro verification of potential CTL epitopes conserved among PRRSV-2 strains

Welner, S., Nielsen, M., Rasmussen, M., Buus, Søren, Jungersen, G. & Larsen, L. E., okt. 2017, I: Immunogenetics. 69, 10, s. 689-702 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Structural elements recognized by abacavir-induced T cells

Yerly, D., Pompeu, Y. A., Schutte, R. J., Eriksson, K. K., Buus, Anette Stryhn, Bracey, A. W., Buus, Søren & Ostrov, D. A., 2017, I: International Journal of Molecular Sciences. 18, 7, 10 s., 1464.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Vaccination with Replication Deficient Adenovectors Encoding YF-17D Antigens Induces Long-Lasting Protection from Severe Yellow Fever Virus Infection in Mice

Bassi, Maria Rosaria, Larsen, M. A. B., Kongsgaard, M., Rasmussen, M., Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn, Thomsen, Allan Randrup & Christensen, Jan Pravsgaard, feb. 2016, I: PLoS Neglected Tropical Diseases . 10, 2, 17 s., e0004464.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Extensive CD4 and CD8 T Cell cross-reactivity between alphaherpesviruses

Jing, L., Laing, K. J., Dong, L., Russell, R. M., Barlow, R. S., Haas, J. G., Ramchandani, M. S., Johnston, C., Buus, Søren, Redwood, A. J., White, K. D., Mallal, S. A., Phillips, E. J., Posavad, C. M., Wald, A. & Koelle, D. M., 2016, I: Journal of Immunology. 196, 5, s. 2205-2218 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A combined prediction strategy increases identification of peptides bound with high affinity and stability to porcine MHC class I molecules SLA-1*04:01, SLA-2*04:01, and SLA-3*04:01

Pedersen, L. E., Rasmussen, M., Harndahl, M., Nielsen, M., Buus, Søren & Jungersen, G., feb. 2016, I: Immunogenetics. 68, 2, s. 157-165

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Immunogenicity of HLA Class I and II Double Restricted Influenza A-Derived Peptides

Pedersen, S. R., Christensen, Jan Pravsgaard, Buus, Søren, Rasmussen, M., Korsholm, K. S., Nielsen, M. & Claesson, Mogens Helweg, 2016, I: P L o S One. 11, 1, 16 s., e0145629.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pan-specific prediction of peptide-MHC Class I complex stability, a correlate of T cell immunogenicity

Rasmussen, M., Fenoy, E., Harndahl, M., Kristensen, A. B., Nielsen, I. K., Nielsen, M. M. & Buus, Søren, 15 aug. 2016, I: Journal of Immunology. 197, 4, s. 1517-1524 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

CD8⁺ T Cells Complement Antibodies in Protecting against Yellow Fever Virus

Bassi, Maria Rosaria, Kongsgaard, M., Steffensen, Maria Abildgaard, Fenger, C., Rasmussen, M., Skjødt, K., Finsen, B., Buus, Anette Stryhn, Buus, Søren, Christensen, Jan Pravsgaard & Thomsen, Allan Randrup, 1 feb. 2015, I: Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 194, 3, s. 1141-53 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Disease progression despite protective HLA expression in an HIV-infected transmission pair

Brener, J., Gall, A., Batorsky, R., Riddell, L., Buus, Søren, Leitman, E., Kellam, P., Allen, T., Goulder, P. & Matthews, P. C., 30 jun. 2015, I: Retrovirology. 12, s. 1-13 13 s., 55.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Materno-Fetal Transfer of Preproinsulin Through the Neonatal Fc Receptor Prevents Autoimmune Diabetes

Culina, S., Gupta, N., Boisgard, R., Afonso, G., Gagnerault, M., Dimitrov, J., Østerbye, Thomas, Justesen, S., Luce, S., Attias, M., Kyewski, B., Buus, Søren, Wong, F. S., Lacroix-Desmazes, S. & Mallone, R., okt. 2015, I: Diabetes. 64, 10, s. 3532-3542 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A molecular switch in immunodominant HIV-1-specific CD8 T-cell epitopes shapes differential HLA-restricted escape

Kløverpris, Henrik Nyhus, Cole, D. K., Fuller, A., Carlson, J., Beck, K., Schauenburg, A. J., Rizkallah, P. J., Buus, Søren, Sewell, A. K. & Goulder, P., 20 feb. 2015, I: Retrovirology. 12, s. 1-11 11 s., 20.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

CD8⁺ TCR Bias and Immunodominance in HIV-1 Infection

Kløverpris, Henrik Nyhus, McGregor, R., McLaren, J. E., Ladell, K., Harndahl, M., Buus, Anette Stryhn, Carlson, J. M., Koofhethile, C., Gerritsen, B., Kesmir, C., Chen, F., Riddell, L., Luzzi, G., Leslie, A., Walker, B. D., Ndung'u, T., Buus, Søren, Price, D. A. & Goulder, P. J., 1 jun. 2015, I: Journal of Immunology. 194, 11, s. 5329-5345 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Magnitude and Kinetics of CD8⁺ T Cell Activation during Hyperacute HIV Infection Impact Viral Set Point

Ndhlovu, Z. M., Kamya, P., Mewalal, N., Kloverpris, H. N., Nkosi, T., Pretorius, K., Laher, F., Ogunshola, F., Chopera, D., Shekhar, K., Ghebremichael, M., Ismail, N., Moodley, A., Malik, A., Leslie, A., Goulder, P. J. R., Buus, S., Chakraborty, A., Dong, K., Ndung'u, T. & 1 flere, Walker, B. D., 15 sep. 2015, I: Immunity. 43, 3, s. 591-604 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Establishing the pig as a large animal model for vaccine development against human cancer

Overgaard, N. H., Frøsig, T. M., Welner, S., Rasmussen, M., Ilsøe, M., Sørensen, M. R., Andersen, Mads Hald, Buus, Søren & Jungersen, G., 2015, I: Frontiers in Genetics. 6, 12 s., 286.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A modern approach for epitope prediction: identification of foot-and-mouth disease virus peptides binding bovine leukocyte antigen (BoLA) class I molecules

Pandya, M., Rasmussen, M., Hansen, A. M., Nielsen, M., Buus, Søren, Golde, W. & Barlow, J., nov. 2015, I: Immunogenetics. 67, 11, s. 691-703 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA class I is most tightly linked to levels of tapasin compared with other antigen-processing proteins in glioblastoma

Thuring, C., Follin, E., Geironson, L., Freyhult, E., Junghans, V., Harndahl, M., Buus, Søren & Paulsson, K. M., 15 sep. 2015, I: B J C. 113, 6, s. 952-962 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification and HLA-tetramer-validation of human CD4+ and CD8+ T cell responses against HCMV proteins IE1 and IE2

Braendstrup, P., Mortensen, B. K., Justesen, S., Østerbye, Thomas, Rasmussen, M., Hansen, A. M., Christiansen, C. B., Hansen, Morten Bagge, Nielsen, M., Vindeløv, L., Buus, Søren & Buus, Anette Stryhn, 2014, I: PLOS ONE. 9, 4, s. 1-16 17 s., e94892.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Soluble human leukocyte antigen-G in seminal plasma is associated with HLA-G genotype: possible implications for fertility success

Dahl, M., Perin, T. L., Djurisic, S., Rasmussen, M., Ohlsson, J., Buus, Søren, Lindhard, A. & Hviid, Thomas Vauvert F., jul. 2014, I: American Journal of Reproductive Immunology (Print). 72, 1, s. 89-105 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Characterization of binding specificities of bovine leucocyte class I molecules: impacts for rational epitope discovery

Hansen, A. M., Rasmussen, M., Svitek, N., Harndahl, M., Golde, W. T., Barlow, J., Nene, V., Buus, Søren & Nielsen, M., 4 sep. 2014, I: Immunogenetics. 66, 12, s. 705-718 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NetMHCstab - predicting stability of peptide-MHC-I complexes; impacts for cytotoxic T lymphocyte epitope discovery

Jørgensen, K. W., Rasmussen, M., Buus, Søren & Nielsen, M., jan. 2014, I: Immunology. 141, 1, s. 18-26 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dataset size and composition impact the reliability of performance benchmarks for peptide-MHC binding predictions

Kim, Y., Sidney, J., Buus, Søren, Sette, A., Nielsen, M. & Peters, B., 2014, I: B M C Bioinformatics. 15, s. 241 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HIV subtype influences HLA-B*07:02-associated HIV disease outcome

Kløverpris, Henrik Nyhus, Adland, E., Koyanagi, M., Buus, Anette Stryhn, Harndahl, M., Matthews, P. C., Shapiro, R., Walker, B. D., Ndung'u, T., Brander, C., Takiguchi, M., Buus, Søren & Goulder, P., maj 2014, I: AIDS Research and Human Retroviruses. 30, 5, s. 468-75 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Programmed death-1 expression on HIV-1-specific CD8+ T cells is shaped by epitope specificity, T-cell receptor clonotype usage and antigen load

Kløverpris, Henrik Nyhus, McGregor, R., McLaren, J. E., Ladell, K., Buus, Anette Stryhn, Koofhethile, C., Brener, J., Chen, F., Riddell, L., Graziano, L., Klenerman, P., Leslie, A., Buus, Søren, Price, D. A. & Goulder, P., 10 sep. 2014, I: AIDS (London, England). 28, 14, s. 2007-21 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Evaluation of a competitive enzyme-linked immunosorbent assay for measurements of soluble HLA-G protein

Rasmussen, M., Dahl, M., Buus, Søren, Djurisic, S., Ohlsson, J. & Hviid, Thomas Vauvert F., aug. 2014, I: HLA. 84, 2, s. 206-15 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Uncovering the Peptide-Binding Specificities of HLA-C: A General Strategy To Determine the Specificity of Any MHC Class I Molecule

Rasmussen, M., Harndahl, M., Stryhn, A., Boucherma, R., Nielsen, L. L., Lemonnier, F. A., Nielsen, M. & Buus, Søren, 13 okt. 2014, I: Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 193, s. 4790-4802 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Use of "one-pot, mix-and-read" peptide-MHC class I tetramers and predictive algorithms to improve detection of cytotoxic T lymphocyte responses in cattle

Svitek, N., Hansen, A. M., Steinaa, L., Saya, R., Awino, E., Nielsen, M., Buus, Søren & Nene, V., 2014, I: Veterinary Research. 45, s. 1-16 16 s., 50.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA-A*01:03, HLA-A*24:02, HLA-B*08:01, HLA-B*27:05, HLA-B*35:01, HLA-B*44:02, and HLA-C*07:01 Monochain Transgenic/H-2 Class I Null Mice: Novel Versatile Preclinical Models of Human T Cell Responses

Boucherma, R., Kridane-Miledi, H., Bouziat, R., Rasmussen, M., Gatard, T., Langa-Vives, F., Lemercier, B., Lim, A., Bérard, M., Benmohamed, L., Buus, Søren, Rooke, R. & Lemonnier, F. A., 17 jun. 2013, I: Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 191, 2, s. 583-593 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tapasin facilitation of natural HLA-A and -B allomorphs is strongly influenced by peptide length, depends on stability, and separates closely related allomorphs

Geironson, L., Thuring, C., Harndahl, M., Rasmussen, M., Buus, Søren, Røder, G. & Paulsson, K. M., 1 okt. 2013, I: Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 191, 7, s. 3939-47 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Discovering naturally processed antigenic determinants that confer protective T cell immunity

Gilchuk, P., Spencer, C. T., Conant, S. B., Hill, T., Gray, J. J., Niu, X., Zheng, M., Erickson, J. J., Boyd, K. L., McAfee, K. J., Oseroff, C., Hadrup, S. R., Bennink, J. R., Hildebrand, W., Edwards, K. M., Crowe, J. E., Williams, J. V., Buus, S., Sette, A., Schumacher, T. N. M. & 2 flere, Link, A. J. & Joyce, S., 1 maj 2013, I: The Journal of Clinical Investigation. 123, 5, s. 1976-87 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Chaperone-assisted thermostability engineering of a soluble T cell receptor using phage display

Gunnarsen, K. S., Kristinsson, S. G., Justesen, S., Frigstad, T., Buus, Søren, Bogen, B., Sandlie, I. & Løset, G. Å., 2013, I: Scientific Reports. 3, s. 1162 10 s., 1162.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NetMHCIIpan-3.0, a common pan-specific MHC class II prediction method including all three human MHC class II isotypes, HLA-DR, HLA-DP and HLA-DQ

Karosiene, E., Rasmussen, M., Blicher, T., Lund, O., Buus, Søren & Nielsen, M., okt. 2013, I: Immunogenetics. 65, 10, s. 711-24 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA-specific intracellular epitope processing shapes an immunodominance pattern for HLA-B*57 that is distinct from HLA-B*58:01

Kløverpris, Henrik Nyhus, Stryhn, A., Harndahl, M., Payne, R., Towers, G. J., Chen, F., Riddell, L., Walker, B. D., Ndung'u, T., Leslie, A., Buus, Søren & Goulder, P., 2013, I: Journal of Virology.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA-A*68:02-restricted Gag-specific cytotoxic T lymphocyte responses can drive selection pressure on HIV but are subdominant and ineffective

Kløverpris, Henrik Nyhus, Buus, Anette Stryhn, Harndahl, M., Carlson, J. M., Leslie, A. J., Chen, F., Riddell, L., Mulenga, J., Walker, B. D., Ndung'u, T., Buus, Søren & Goulder, P., 17 jul. 2013, I: AIDS (London, England). 27, 11, s. 1717-23 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Comparison of Vaccine-Induced Effector CD8 T Cell Responses Directed against Self- and Non-Self-Tumor Antigens: Implications for Cancer Immunotherapy

Pedersen, S. R., Sørensen, M. R., Buus, Søren, Christensen, Jan Pravsgaard & Thomsen, Allan Randrup, 1 okt. 2013, I: Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). 191, 7, s. 3955-67 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Carbon anhydrase IX specific immune responses in patients with metastatic renal cell carcinoma potentially cured by interleukin-2 based immunotherapy

Rasmussen, S., Donskov, F., Pedersen, J. W., Wandall, Hans H., Buus, Søren, Harndahl, M., Braendstrup, P., Claesson, Mogens Helweg & Pedersen, Anders Elm, aug. 2013, I: Immunopharmacology and Immunotoxicology. 35, 4, s. 487-96 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Peptide pool immunization and CD8+ T cell reactivity

Rasmussen, S. B., Harndahl, M. N., Buus, Anette Stryhn, Buus, Søren & Claesson, Mogens Helweg, mar. 2013, I: Immunology Letters. 151, 1-2, s. 48-53 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

MHCcluster, a method for functional clustering of MHC molecules

Thomsen, M., Lundegaard, C., Buus, Søren, Lund, O. & Nielsen, M., sep. 2013, I: Immunogenetics. 65, 9, s. 655-65 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

High-resolution mapping of linear antibody epitopes using ultrahigh-density peptide microarrays

Buus, Søren, Rockberg, J., Forsström, B., Nilsson, P., Uhlen, M. & Schafer-Nielsen, C., dec. 2012, I: Molecular and Cellular Proteomics. 11, 12, s. 1790-1800 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Further progress on defining highly conserved immunogenic epitopes for a global HIV vaccine: HLA-A3-restricted GAIA vaccine epitopes

De Groot, A. S., Levitz, L., Ardito, M. T., Skowron, G., Mayer, K. H., Buus, Søren, Boyle, C. M. & Martin, W. D., jul. 2012, I: Human vaccines & immunotherapeutics. 8, 7, s. 987-1000 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Peptide-MHC class I stability is a better predictor than peptide affinity of CTL immunogenicity

Harndahl, M., Rasmussen, M., Roder, G., Dalgaard Pedersen, I., Sørensen, M., Nielsen, M. & Buus, Søren, jun. 2012, I: Central-European Journal of Immunology. 42, 6, s. 1405-1416 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of conserved subdominant HIV Type 1 CD8(+) T Cell epitopes restricted within common HLA Supertypes for therapeutic HIV Type 1 vaccines

Karlsson, I., Kløverpris, Henrik Nyhus, Jensen, K. J., Buus, Anette Stryhn, Buus, Søren, Karlsson, A., Vinner, L., Goulder, P. & Fomsgaard, A., nov. 2012, I: AIDS Research and Human Retroviruses. 28, 11, s. 1434-1443 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HIV control through a single nucleotide on the HLA-B locus

Kløverpris, Henrik Nyhus, Harndahl, M., Leslie, A. J., Carlson, J. M., Ismail, N., van der Stok, M., Huang, K. G., Chen, F., Riddell, L., Steyn, D., Goedhals, D., van Vuuren, C., Frater, J., Walker, B. D., Carrington, M., Ndung'u, T., Buus, Søren & Goulder, P., nov. 2012, I: Journal of Virology. 86, 21, s. 11493-11500 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA-B*57 Micropolymorphism shapes HLA allele-specific epitope immunogenicity, selection pressure, and HIV immune control

Kløverpris, Henrik Nyhus, Buus, Anette Stryhn, van der Stok, M., Harndahl, M., Payne, R. P., Matthews, P. C., Chen, F., Riddell, L., Walker, B. D., Ndung'u, T., Buus, Søren & Goulder, P., 2012, I: Journal of Virology. 86, 2, s. 919-29 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Conservation of HIV-1 T cell epitopes across time and clades: validation of immunogenic HLA-A2 epitopes selected for the GAIA HIV vaccine

Levitz, L., Koita, O. A., Sangare, K., Ardito, M. T., Boyle, C. M., Rozehnal, J., Tounkara, K., Dao, S. M., Koné, Y., Koty, Z., Buus, Søren, Moise, L., Martin, W. D. & De Groot, A. S., 14 dec. 2012, I: The Vaccine Quarterly. 30, 52, s. 7547-7560 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Humoral and cellular CMV responses in healthy donors; identification of a frequent population of CMV-specific, CD4+ T cells in seronegative donors

Mårtensson, Nina Løth, Assing, K., Madsen, H. O., Vindeløv, L., Buus, Søren & Buus, Anette Stryhn, 7 feb. 2012, I: PloS one. 7, 2, 1 s., e31420.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Cancer associated aberrant protein o-glycosylation can modify antigen processing and immune response

Madsen, C. B., Petersen, C., Lavrsen, K., Harndahl, M., Buus, Søren, Clausen, Henrik, Pedersen, Anders Elm & Wandall, Hans H., 2012, I: P L o S One. 7, 11, s. e50139

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Differential clade-specific HLA-B*3501 association with HIV-1 disease outcome is linked to immunogenicity of a single Gag epitope

Matthews, P. C., Koyanagi, M., Kløverpris, H. N., Harndahl, M., Buus, A. S., Akahoshi, T., Gatanaga, H., Oka, S., Juarez Molina, C., Valenzuela Ponce, H., Avila Rios, S., Cole, D., Carlson, J., Payne, R. P., Ogwu, A., Bere, A., Ndung'u, T., Gounder, K., Chen, F., Riddell, L. & 11 flere, Luzzi, G., Shapiro, R., Brander, C., Walker, B., Sewell, A. K., Reyes Teran, G., Heckerman, D., Hunter, E., Buus, Søren, Takiguchi, M. & Goulder, P. J. R., dec. 2012, I: Journal of Virology. 86, 23, s. 12643-12654 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of a novel UTY-encoded minor histocompatibility antigen

Mortensen, B. K., Rasmussen, A. H., Larsen, M. E., Larsen, M. V., Lund, O., Brændstrup, P., Harndahl, M. N., Rasmussen, M., Buus, Søren, Buus, Anette Stryhn & Vindeløv, L., 2012, I: Scandinavian Journal of Immunology. 76, 2, s. 141-150 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Designing bovine T cell vaccines via reverse immunology

Nene, V., Svitek, N., Toye, P., Golde, W. T., Barlow, J., Harndahl, M., Buus, Søren & Nielsen, M., jun. 2012, I: Ticks and Tick-borne Diseases. 3, 3, s. 188-192 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Drug hypersensitivity caused by alteration of the MHC-presented self-peptide repertoire

Ostrov, D. A., Grant, B. J., Pompeu, Y. A., Sidney, J., Harndahl, M., Southwood, S., Oseroff, C., Lu, S., Jakoncic, J., de Oliveira, C. A. F., Yang, L., Mei, H., Shi, L., Shabanowitz, J., English, A. M., Wriston, A., Lucas, A., Phillips, E., Mallal, S., Grey, H. M. & 4 flere, Sette, A., Hunt, D. F., Buus, Søren & Peters, B., 19 jun. 2012, I: Proceedings of the National Academy of the United States of America. 109, 25, s. 9959-9964 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Strategies to work with HLA data in human populations for histocompatibility, clinical transplantation, epidemiology and population genetics: HLA-NET methodological recommendations

Sanchez-Mazas, A., Vidan-Jeras, B., Nunes, J. M., Fischer, G., Little, A-M., Bekmane, U., Buhler, S., Buus, S., Claas, F. H. J., Dormoy, A., Dubois, V., Eglite, E., Eliaou, J. F., Gonzalez-Galarza, F., Grubic, Z., Ivanova, M., Lie, B., Ligeiro, D., Lokki, M. L., da Silva, B. M. & 14 flere, Martorell, J., Mendonça, D., Middleton, D., Voniatis, D. P., Papasteriades, C., Poli, F., Riccio, M. E., Vlachou, M. S., Sulcebe, G., Tonks, S., Nevessignsky, M. T., Vangenot, C., van Walraven, A. & Tiercy, J., dec. 2012, I: International Journal of Immunogenetics (Print Edition). 39, 6, s. 459-476 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA-B7-restricted islet epitopes are differentially recognized in type 1 diabetic children and adults and form weak peptide-HLA complexes

Scotto, M., Afonso, G., Østerbye, Thomas, Larger, E., Luce, S., Raverdy, C., Novelli, G., Bruno, G., Gonfroy-Leymarie, C., Launay, O., Lemonnier, F. A., Buus, Søren, Carel, J., Boitard, C. & Mallone, R., okt. 2012, I: Diabetes. 61, 10, s. 2546-2555 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NNAlign: a web-based prediction method allowing non-expert end-user discovery of sequence motifs in quantitative peptide data

Andreatta, M., Schafer-Nielsen, C., Lund, O., Buus, Søren & Nielsen, M., 2011, I: P L o S One. 6, 11, s. e26781

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

T cells recognizing a peptide contaminant undetectable by mass spectrometry

Brezar, V., Culina, S., Østerbye, Thomas, Guillonneau, F., Chiappetta, G., Verdier, Y., Vinh, J., Wong, F. S., Buus, Søren & Mallone, R., 2011, I: P L o S One. 6, 12, s. e28866

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLArestrictor--a tool for patient-specific predictions of HLA restriction elements and optimal epitopes within peptides

Erup Larsen, M., Kloverpris, H., Buus, Anette Stryhn, Koofhethile, C. K., Sims, S., Ndung'u, T., Goulder, P., Buus, Søren & Nielsen, M., 2011, I: Immunogenetics. 63, 1, s. 43-55 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Real-time, high-throughput measurements of peptide-MHC-I dissociation using a scintillation proximity assay

Harndahl, M., Rasmussen, M., Røder, G. A. & Buus, Søren, 30 nov. 2011, I: Journal of Immunological Methods.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Human leukocyte antigen (HLA) class I restricted epitope discovery in yellow fewer and dengue viruses: importance of HLA binding strength

Lund, O., Nascimento, E. J. M., Maciel, M., Nielsen, M., Larsen, M. V., Lundegaard, C., Harndahl, M., Lamberth, K., Buus, Søren, Salmon, J., August, T. J. & Marques, E. T. A., 2011, I: P L o S One. 6, 10, s. e26494

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA-A*7401-mediated control of HIV viremia is independent of its linkage disequilibrium with HLA-B*5703

Matthews, P. C., Adland, E., Listgarten, J., Leslie, A., Mkhwanazi, N., Carlson, J. M., Harndahl, M., Buus, A. S., Payne, R. P., Ogwu, A., Huang, K-H. G., Frater, J., Paioni, P., Kloverpris, H., Jooste, P., Goedhals, D., van Vuuren, C., Steyn, D., Riddell, L., Chen, F. & 8 flere, Luzzi, G., Balachandran, T., Ndung'u, T., Buus, Søren, Carrington, M., Shapiro, R., Heckerman, D. & Goulder, P. J. R., 2011, I: Journal of Immunology. 186, 10, s. 5675-86 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Induction of foot-and-mouth disease virus-specific cytotoxic T cell killing by vaccination

Patch, J. R., Pedersen, L. E., Toka, F. N., Moraes, M., Grubman, M. J., Nielsen, M., Jungersen, G., Buus, Søren & Golde, W. T., 2011, I: Clinical and Vaccine Immunology (Online). 18, 2, s. 280-8 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Wildtype p53-specific Antibody and T-Cell Responses in Cancer Patients

Pedersen, Anders Elm, Stryhn, A., Justesen, S., Harndahl, M., Rasmussen, S., Donskov, F., Claesson, Mogens Helweg, Pedersen, J. W., Wandall, Hans H., Svane, Inge Marie & Buus, Søren, 2011, I: Journal of Immunotherapy. 34, 9, s. 629-40 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Porcine major histocompatibility complex (MHC) class I molecules and analysis of their peptide-binding specificities

Pedersen, L. E., Harndahl, M., Rasmussen, M., Lamberth, K., Golde, W. T., Lund, O., Nielsen, M. & Buus, Søren, 2011, I: Immunogenetics. 63, 12, s. 821-834

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tapasin discriminates peptide-human leukocyte antigen-A*02:01 complexes formed with natural ligands

Røder, G. A., Geironson, L., Rasmussen, M., Harndahl, M., Buus, Søren & Paulsson, K., 2011, I: The Journal of Biological Chemistry. 286, 23, s. 20547-57

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genome-based in silico identification of new Mycobacterium tuberculosis antigens activating polyfunctional CD8+ T cells in human tuberculosis

Tang, S. T., van Meijgaarden, K. E., Caccamo, N., Guggino, G., Klein, M. R., van Weeren, P., Kazi, F., Buus, Anette Stryhn, Zaigler, A., Sahin, U., Buus, Søren, Dieli, F., Lund, O. & Ottenhoff, T. H. M., 2011, I: Journal of Immunology. 186, 2, s. 1068-80 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of MHC class II restricted T-cell-mediated reactivity against MHC class I binding Mycobacterium tuberculosis peptides

Wang, M., Tang, S. T., Buus, Anette Stryhn, Justesen, S., Larsen, M. V., Dziegiel, Morten Hanefeld, Lewinsohn, D. M., Buus, Søren, Lund, O. & Claesson, Mogens Helweg, apr. 2011, I: Immunology. 132, 4, s. 482-491 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Structural properties of MHC class II ligands, implications for the prediction of MHC class II epitopes

Jørgensen, K. W., Buus, Søren & Nielsen, M., 1 jan. 2010, I: P L o S One. 5, 12, s. e15877

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Degree of predicted minor histocompatibility antigen mismatch correlates with poorer clinical outcomes in nonmyeloablative allogeneic hematopoietic cell transplantation

Larsen, M. E., Kornblit, B., Larsen, M. V., Masmas, T. N., Nielsen, M., Thiim, M., Garred, P., Stryhn, A., Lund, O., Buus, S., Vindelov, L., Vindeløv, L., Larsen, M. E., Kornblit, B., Larsen, M. V., Masmas, T. N., Nielsen, M., Thiim, M., Garred, P., Stryhn, A. & 3 flere, Lund, O., Buus, S. & Vindeløv, L., 1 okt. 2010, I: Biology of Blood and Marrow Transplantation. 16, 10, s. 1370-81 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of CD8+ T cell epitopes in the West Nile virus polyprotein by reverse-immunology using NetCTL

Larsen, M. V., Lelic, A., Parsons, R., Nielsen, M., Hoof, I., Lamberth, K., Loeb, M. B., Buus, Søren, Bramson, J. & Lund, O., 1 jan. 2010, I: P L o S One. 5, 9, s. e12697

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Major histocompatibility complex class I binding predictions as a tool in epitope discovery

Lundegaard, C., Lund, O., Buus, Søren & Nielsen, M., 2010, I: Immunology. 130, 3, s. 309-18 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

MHC class II epitope predictive algorithms

Nielsen, M., Lund, O., Buus, Søren & Lundegaard, C., 2010, I: Immunology. 130, 3, s. 319-28 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NetMHCIIpan-2.0 - Improved pan-specific HLA-DR predictions using a novel concurrent alignment and weight optimization training procedure

Nielsen, M., Justesen, S., Lund, O., Lundegaard, C. & Buus, Søren, 1 jan. 2010, I: Immunome Research. 6, s. 9

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Efficacious early antiviral activity of HIV Gag- and Pol-specific HLA-B*2705-restricted CD8⁺ T cells

Payne, R. P., Kløverpris, Henrik Nyhus, Sacha, J. B., Brumme, Z., Brumme, C., Buus, Søren, Sims, S., Hickling, S., Riddell, L., Chen, F., Luzzi, G., Edwards, A., Phillips, R., Prado, J. G. & Goulder, P. J. R., 2010, I: Journal of Virology. 84, 20, s. 10543-10557

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA class I binding 9mer peptides from influenza A virus induce CD4 T cell responses

Wang, M., Larsen, M. V., Nielsen, M., Harndahl, M., Justesen, S., Dziegiel, Morten Hanefeld, Buus, Søren, Tang, S. T., Lund, O., Claesson, Mogens Helweg, Wang, M., Larsen, M. V., Nielsen, M., Harndahl, M. N., Justesen, S., Dziegiel, Morten Hanefeld, Buus, S., Tang, S. T., Lund, O. & Claesson, M. H., 1 jan. 2010, I: PLoS ONE. 5, 5, s. e10533

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Oxidative stress can alter the antigenicity of immunodominant peptides

Weiskopf, D., Schwanninger, A., Weinberger, B., Almanzar, G., Parson, W., Buus, Søren, Lindner, H. & Grubeck-Loebenstein, B., 2010, I: Journal of Leukocyte Biology. 87, 1, s. 165-72 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Peptide Binding to HLA Class I Molecules: Homogenous, High-Throughput Screening, and Affinity Assays

Harndahl, M., Justesen, S., Lamberth, K., Røder, G., Nielsen, M. & Buus, Søren, 2009, I: Journal of Biomolecular Screening.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Functional recombinant MHC class II molecules and high-throughput peptide-binding assays

Justesen, S., Harndahl, M., Lamberth, K., Nielsen, L. B. & Buus, Søren, 2009, I: Immunome Research. 5, 2

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Recombinant chymosin used for exact and complete removal of a prochymosin derived fusion tag releasing intact native target protein

Justesen, S., Lamberth, K., Nielsen, L. B., Schafer-Nielsen, C. & Buus, Søren, 2009, I: Protein Science. 18, 5, s. 1023-32 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Immune hierarchy among HIV-1 CD8+ T cell epitopes delivered by dendritic cells depends on MHC-I binding irrespective of mode of loading and immunization in HLA-A*0201 mice

Kloverpris, H. N., Karlsson, I., Thorn, M., Buus, Søren & Fomsgaard, A., 2009, I: Acta Pathologica Microbiologica et Immunologica Scandinavica. 117, 11, s. 849-55 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

In silico-accelerated identification of conserved and immunogenic variola/vaccinia T-cell epitopes

Moise, L., McMurry, J. A., Buus, Søren, Frey, S., Martin, W. D. & De Groot, A. S., 2009, I: Vaccine. 27, 46, s. 6471-9 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Elimination of immunodominant epitopes from multispecific DNA-based vaccines allows induction of CD8 T cells that have a striking antiviral potential

Riedl, P., Wieland, A., Lamberth, K., Buus, Søren, Lemonnier, F., Reifenberg, K., Reimann, J. & Schirmbeck, R., 2009, I: Journal of Immunology. 183, 1, s. 370-80 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The outermost N-terminal region of tapasin facilitates folding of major histocompatibility complex class I

Røder, G. A., Geironson, L., Darabi, A., Harndahl, M., Schafer-Nielsen, C., Skjødt, K., Buus, Søren & Paulsson, K., 2009, I: European Journal of Immunology. 39, 10, s. 2682-94 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Peptide specific expansion of CD8(+) T cells by recombinant plate bound MHC/peptide complexes

Schmidt, E. G. W., Buus, Søren, Thorn, M., Buus, Anette Stryhn, Leisner, C. & Claesson, Mogens Helweg, 2009, I: Journal of Immunological Methods. 340, 1, s. 25-32 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dendritic cells engineered to express defined allo-HLA peptide complexes induce antigen-specific cytotoxic T cells efficiently killing tumour cells

Stronen, E., Abrahamsen, I. W., Gaudernack, G., Wälchli, S., Munthe, E., Buus, Søren, Johansen, F., Lund-Johansen, F. & Olweus, J., 2009, I: Scandinavian Journal of Immunology. 69, 4, s. 319-28 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Antigen processing influences HIV-specific cytotoxic T lymphocyte immunodominance

Tenzer, S., Wee, E., Burgevin, A., Stewart-Jones, G., Friis, L., Lamberth, K., Chang, C., Harndahl, M., Weimershaus, M., Gerstoft, J., Akkad, N., Klenerman, P., Fugger, L., Jones, E. Y., McMichael, A. J., Buus, Søren, Schild, H., van Endert, P. & Iversen, A. K. N., 2009, I: Nature Immunology. 10, 6, s. 636-46 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

High-affinity human leucocyte antigen class I binding variola-derived peptides induce CD4+ T cell responses more than 30 years post-vaccinia virus vaccination

Wang, M., Tang, S. T., Lund, O., Dziegiel, Morten Hanefeld, Buus, Søren & Claesson, Mogens Helweg, 2009, I: Clinical and Experimental Immunology. 155, 3, s. 441-6 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Modified human beta 2-microglobulin (desLys(58)) displays decreased affinity for the heavy chain of MHC class I and induces nitric oxide production and apoptosis

Wang, M., Harhaji, L., Lamberth, K., Harndahl, M., Buus, Søren, Heegaard, N. H. H., Claesson, Mogens Helweg & Nissen, Mogens Holst, 2009, I: Scandinavian Journal of Immunology. 69, 3, s. 203-12 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ligand binding and antigenic properties of a human neonatal Fc receptor with mutation of two unpaired cysteine residues

Andersen, J. T., Justesen, S., Fleckenstein, B., Michaelsen, T. E., Berntzen, G., Kenanova, V. E., Daba, M. B., Lauvrak, V., Buus, Søren & Sandlie, I., 2008, I: FEBS Journal. 275, 16, s. 4097-110 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A strategy for bacterial production of a soluble functional human neonatal Fc receptor

Andersen, J. T., Justesen, S., Berntzen, G., Michaelsen, T. E., Lauvrak, V., Fleckenstein, B., Buus, Søren & Sandlie, I., 2008, I: Journal of Immunological Methods. 331, 1-2, s. 39-49 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HLA-A*0201-restricted CD8+ cytotoxic T lymphocyte epitopes identified from herpes simplex virus glycoprotein D

Chentoufi, A. A., Zhang, X., Lamberth, K., Dasgupta, G., Bettahi, I., Nguyen, A., Wu, M., Zhu, X., Mohebbi, A., Buus, Søren, Wechsler, S. L., Nesburn, A. B. & BenMohamed, L., 2008, I: Journal of Immunology. 180, 1, s. 426-37 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of immunogenic HLA-B7 "Achilles' heel" epitopes within highly conserved regions of HIV

De Groot, A. S., Rivera, D. S., McMurry, J. A., Buus, Søren & Martin, W., 2008, I: Vaccine. 26, 24, s. 3059-71 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of differentially expressed proteins in spontaneous thymic lymphomas from knockout mice with deletion of p53

Honoré, B., Buus, Søren & Claesson, Mogens Helweg, 2008, I: Proteome Science. 6, s. 18

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NetMHCpan: MHC class I binding prediction beyond HLA-A and -B

Hoof, I., Peters, B., Buus, Søren & Nielsen, M., 2008, I: HLA. 72, 3, s. 251-251

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NetMHCpan, a method for MHC class I binding prediction beyond humans

Hoof, I., Peters, B., Sidney, J., Pedersen, L. E., Sette, A., Lund, O., Buus, Søren & Nielsen, M., 2008, I: Immunogenetics.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Prospective study of 18FDG-PET in the detection and management of patients with lymph node metastases to the neck from an unknown primary tumor. Results from the DAHANCA-13 study

Johansen, J., Buus, Søren, Loft, A., Keiding, S., Overgaard, M., Hansen, H. S., Grau, C., Bundgaard, T., Kirkegaard, J. & Overgaard, J., 2008, I: Head & Neck Pathology. 30, 4, s. 471-478 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

One-pot, mix-and-read peptide-MHC tetramers

Leisner, C. V. V., Mårtensson, Nina Løth, Lamberth, K., Justesen, S., Wiborg, Christina Sylvester-Hvid, Schmidt, E. G., Claesson, Mogens Helweg, Buus, Søren & Buus, Anette Stryhn, 2008, I: PLoS ONE. 3, 2, s. e1678

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NetMHC-3.0: accurate web accessible predictions of human, mouse and monkey MHC class I affinities for peptides of length 8-11

Lundegaard, C., Lamberth, K., Harndahl, M., Buus, Søren, Lund, O. & Nielsen, M., 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, Web Server issue, s. W509-12

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Quantitative predictions of peptide binding to any HLA-DR molecule of known sequence: NetMHCIIpan

Nielsen, M., Lundegaard, C., Blicher, T., Peters, B., Sette, A., Justesen, S., Buus, Søren & Lund, O., 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e1000107

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Structure of a SARS coronavirus-derived peptide bound to the human major histocompatibility complex class I molecule HLA-B*1501

Røder, G., Kristensen, O., Kastrup, Jette Sandholm Jensen, Buus, Søren & Gajhede, Michael, 2008, I: Acta Crystallographica. Section F : Structural Biology and Crystallization Communications. 64, Pt 6, s. 459-62 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

MHC-I-restricted epitopes conserved among variola and other related orthopoxviruses are recognized by T cells 30 years after vaccination

Tang, S. T., Wang, M., Lamberth, K., Harndahl, M., Dziegiel, Morten Hanefeld, Claesson, Mogens Helweg, Buus, Søren & Lund, O., 2008, I: Archives of Virology. 153, 10, s. 1833-44 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Antigen processing shapes HIV-specific CTL-response hierarchies

Tenzer, S., Wee, E., Burgevin, A., Stewart-Jones, G., Friis, L., Lamberth, K., Chang, C., Harndahl, M., Gerstoft, J., Fugger, L., Jones, E., McMichael, A. J., Buus, Søren, Schild, H., Endert, P. V. & Iversen, A. K., 2008, I: Wiener Klinische Wochenschrift. 120, Suppl. 1, s. 146-146

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Addition of TAT protein transduction domain and GrpE to human p53 provides soluble fusion proteins that can be transduced into dendritic cells and elicit p53-specific T-cell responses in HLA-A*0201 transgenic mice.

Justesen, S., Buus, Søren, Claesson, Mogens Helweg & Pedersen, Anders Elm, 2007, I: Immunology. 122, 3, s. 326-34 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Large-scale validation of methods for cytotoxic T-lymphocyte epitope prediction

Larsen, M. V., Lundegaard, C., Lamberth, K., Buus, Søren, Lund, O. & Nielsen, M., 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, s. 424

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Diversity of Francisella tularensis Schu4 antigens recognized by T lymphocytes after natural infections in humans: identification of candidate epitopes for inclusion in a rationally designed tularemia vaccine

McMurry, J. A., Gregory, S. H., Moise, L., Rivera, D., Buus, Søren & De Groot, A. S., 2007, I: Vaccine. 25, 16, s. 3179-91 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NetMHCpan, a method for quantitative predictions of peptide binding to any HLA-A and -B locus protein of known sequence

Nielsen, M., Lundegaard, C., Blicher, T., Lamberth, K., Harndahl, M., Justesen, S., Røder, G., Peters, B., Sette, A., Lund, O. & Buus, Søren, 2007, I: PLoS ONE. 2, 8, s. e796

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of a new hTERT-derived HLA-A*0201 restricted, naturally processed CTL epitope

Thorn, M., Wang, M., Kløverpris, H., Schmidt, E. G. W., Fomsgaard, A., Wenandy, L., Berntsen, A., Brunak, S., Buus, Søren & Claesson, Mogens Helweg, 2007, I: Cancer Immunology, Immunotherapy. 56, 11, s. 1755-63 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Structure of HLA-A*1101 in complex with a hepatitis B peptide homologue

Blicher, T., Kastrup, Jette Sandholm Jensen, Pedersen, L. Ø., Buus, Søren & Gajhede, Michael, 2006, I: Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications. 62, Pt 12, s. 1179-84 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Conflicting selective forces affect T cell receptor contacts in an immunodominant human immunodeficiency virus epitope

Iversen, A. K. N., Stewart-Jones, G., Learn, G. H., Christie, N., Sylvester-Hviid, C., Armitage, A. E., Kaul, R., Beattie, T., Lee, J. K., Li, Y., Chotiyarnwong, P., Dong, T., Xu, X., Luscher, M. A., MacDonald, K., Ullum, H., Klarlund-Pedersen, B., Skinhøj, P., Fugger, L., Buus, S. & 4 flere, Mullins, J. I., Jones, E. Y., van der Merwe, P. A. & McMichael, A. J., 2006, I: Nature Immunology. 7, 2, s. 179-89 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The effect of a therapeutic dendritic cell-based cancer vaccination depends on the blockage of CTLA-4 signaling.

Met, Özcan, Wang, M., Pedersen, Anders Elm, Nissen, Mogens Holst, Buus, Søren & Claesson, Mogens Helweg, 2006, I: Cancer Letters. 231, 2, s. 247-56 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A community resource benchmarking predictions of peptide binding to MHC-I molecules

Peters, B., Bui, H., Frankild, S., Nielson, M., Lundegaard, C., Kostem, E., Basch, D., Lamberth, K., Harndahl, M., Fleri, W., Wilson, S. S., Sidney, J., Lund, O., Buus, Søren & Sette, A., 2006, I: PLoS Computational Biology. 2, 6, s. e65

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Crystal structures of two peptide-HLA-B*1501 complexes; structural characterization of the HLA-B62 supertype

Røder, G., Blicher, T., Justesen, S., Johannesen, B., Kristensen, O., Kastrup, Jette Sandholm Jensen, Buus, Søren & Gajhede, Michael, 2006, I: Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography. 62, Pt 11, s. 1300-10 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Characterization of monocyte-derived dendritic cells maturated with IFN-alpha.

Svane, I. M., Nikolajsen, K., Walter, M. R., Buus, Søren, Gad, M., Claesson, Mogens Helweg & Pedersen, Anders Elm, 2006, I: Scandinavian Journal of Immunology. 63, 3, s. 217-22 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

CTL epitopes for influenza A including the H5N1 bird flu; genome-, pathogen-, and HLA-wide screening.

Wang, M., Lamberth, K., Harndahl, M., Røder, G., Buus, Anette Stryhn, Larsen, M. V., Nielsen, M., Lundegaard, C., Tang, S. T., Dziegiel, M. H., Rosenkvist, J., Pedersen, Anders Elm, Buus, Søren, Claesson, Mogens Helweg & Lund, O., 2006, I: Vaccine. 25, 15, s. 2823-31 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of MHC class I H-2 Kb/Db-restricted immunogenic peptides derived from retinal proteins.

Wang, M., Bai, F., Pries, M., Buus, Søren, Prause, J. U. & Nissen, Mogens Holst, 2006, I: Investigative Ophthalmology & Visual Science. 47, 9, s. 3939-45 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of an HLA-A*0201 restricted Bcl2-derived epitope expressed on tumors.

Wang, M., Johansen, B., Nissen, Mogens Holst, Thorn, M., Kløverpris, H., Fomsgaard, A., Buus, Søren & Claesson, Mogens Helweg, 2006, I: Cancer Letters. 251, 1, s. 86-95 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

High-resolution structure of HLA-A*1101 in complex with SARS nucleocapsid peptide

Blicher, T., Kastrup, Jette Sandholm Jensen, Buus, Søren & Gajhede, Michael, 2005, I: Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography. 61, Pt 8, s. 1031-40 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A novel system for continuous protein refolding and on-line capture by expanded bed adsorption.

Ferré, H., Ruffet, E., Nielsen, L. B., Nissen, Mogens Holst, Hobley, T. J., Thomas, O. R. T. & Buus, Søren, 2005, I: Protein Science. 14, 8, s. 2141-53 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

An integrative approach to CTL epitope prediction: a combined algorithm integrating MHC class I binding, TAP transport efficiency, and proteasomal cleavage predictions

Larsen, M. V., Lundegaard, C., Lamberth, K., Buus, Søren, Brunak, S., Lund, O. & Nielsen, M., 2005, I: European Journal of Immunology. 35, 8, s. 2295-303 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Phenotypic and functional characterization of clinical grade dendritic cells generated from patients with advanced breast cancer for therapeutic vaccination.

Pedersen, Anders Elm, Thorn, M., Gad, M., Walter, M. R., Johnsen, H. E., Gaarsdal, E., Nikolajsen, K., Buus, Søren, Claesson, Mogens Helweg & Svane, I. M., 2005, I: Scandinavian Journal of Immunology. 61, 2, s. 147-56 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Treatment of transplanted CT26 tumour with dendritic cell vaccine in combination with blockade of vascular endothelial growth factor receptor 2 and CTLA-4.

Pedersen, Anders Elm, Buus, Søren & Claesson, Mogens Helweg, 2005, I: Cancer Letters. 235, 2, s. 229-38 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The design and implementation of the immune epitope database and analysis resource

Peters, B., Sidney, J., Bourne, P., Bui, H., Buus, Søren, Doh, G., Fleri, W., Kronenberg, M., Kubo, R., Lund, O., Nemazee, D., Ponomarenko, J. V., Sathiamurthy, M., Schoenberger, S. P., Stewart, S., Surko, P., Way, S., Wilson, S. & Sette, A., 2005, I: Immunogenetics. 57, 5, s. 326-36 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The immune epitope database and analysis resource: from vision to blueprint

Peters, B., Sidney, J., Bourne, P., Bui, H., Buus, Søren, Doh, G., Fleri, W., Kronenberg, M., Kubo, R., Lund, O., Nemazee, D., Ponomarenko, J. V., Sathiamurthy, M., Schoenberger, S., Stewart, S., Surko, P., Way, S., Wilson, S. & Sette, A., 2005, I: PLoS - Biology. 3, 3, s. e91

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt