Tom Gilbert

Tom Gilbert

Professor

Medlem af:


    1. 2015
    2. Udgivet

      Olfactory receptor subgenomes linked with broad ecological adaptations in sauropsida

      Khan, I., Yang, Z., Maldonado, E., Li, C., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J., Johnson, W. E. & Antunes, A., 2015, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 32, 11, s. 2832-2843 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      The Genome 10K Project: a way forward

      Koepfli, K-P., Paten, B., O'Brien, S. J., Antunes, A., Belov, K., Bustamante, C., Castoe, T. A., Clawson, H., Crawford, A. J., Diekhans, M., Distel, D., Durbin, R., Earl, D., Fujita, M. K., Gamble, T., Georges, A., Gemmell, N., Gilbert, M. T. P., Graves, J. M., Green, R. E. & 25 flere, Hickey, G., Jarvis, E. D., Johnson, W., Komissarov, A., Korf, I., Kuhn, R., Larkin, D. M., Lewin, H., Lopez, J. V., Ma, J., Marques-Bonet, T., Miller, W., Murphy, R., Pevzner, P., Shapiro, B., Steiner, C., Tamazian, G., Venkatesh, B., Wang, J., Wayne, R., Wiley, E., Yang, H., KU, thw266, Haussler, D. & Ryder, O., 2015, I: Annual Review of Animal Biosciences. 3, s. 57-111 55 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Ancient mitochondrial DNA from the northern fringe of the Neolithic farming expansion in Europe sheds light on the dispersion process

      Malmström, H., Linderholm, A., Skoglund, P., Storå, J., Sjödin, P., Gilbert, M Thomas P, Holmlund, G., Willerslev, Eske, Jakobsson, M., Lidén, K. & Götherström, A., 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 10 s., 20130373.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Geographic and temporal dynamics of a global radiation and diversification in the killer whale

      Morin, P. A., Parsons, K. M., Archer, F. I., Avila Arcos, M. D. C., Barrett-Lennard, L. G., Dalla Rosa, L., Duchêne, S., Durban, J. W., Ellis, G. M., Ferguson, S. H., Ford, J. K., Ford, M. J., Garilao, C., Gilbert, M. T. P., Kaschner, K., Matkin, C. O., Petersen, S. D., Robertson, K. M., Visser, I. N., Wade, P. R. & 2 flere, Ho, S. Y. W. & Foote, A. D., 2015, I: Molecular Ecology. 24, 15, s. 3964-3979 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      A common genetic origin for early farmers from Mediterranean Cardial and Central European LBK cultures

      Olalde, I., Schroeder, Hannes, Sandoval-Velasco, Marcela, Vinner, Lasse, Lobón, I., Ramirez, O., Civit, S., Borja, P. G., Salazar-García, D. C., Talamo, S., Fullola, J. M., Oms, F. X., Pedro, M., Martínez, P., Sanz, M., Daura, J., Zilhão, J., Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2015, I: Molecular Biology and Evolution. 32, 12, s. 3132-3142 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Reconstructing ancient genomes and epigenomes

      Orlando, L. A. A., Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2015, I: Nature Reviews. Genetics. 16, 7, s. 395-408 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      Ancient and modern environmental DNA

      Pedersen, Mikkel Winther, Overballe-Petersen, S., Ermini, L., Der Sarkissian, C., Haile, James Seymour, Hellström, A. M., Spens, J., Thomsen, P. F., Bohmann, Kristine, Cappellini, Enrico, Schnell, I. B., Wales, N., Carøe, C., Campos, P., Schmidt, A. M. Z., Gilbert, M Thomas P, Hansen, Anders Johannes, Orlando, L. A. A. & Willerslev, Eske, 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 11 s., 20130383.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      A refined model of the genomic basis for phenotypic variation in vertebrate hemostasis

      Ribeiro, Â. M., Zepeda Mendoza, M. L., Bertelsen, Mads Frost, Kristensen, Annemarie T., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2015, I: B M C Evolutionary Biology. 15, 8 s., 124.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      The origin and evolution of maize in the Southwestern United States: [+ erratum]

      Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smith, B. D., Wales, N., Cappellini, Enrico, Skoglund, P., Fumagalli, M., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Hufnagel, D. E., Korneliussen, Thorfinn Sand, Vieira, Filipe Garrett, Jakobsson, M., Arriaza, B., Willerslev, Eske, Nielsen, Rasmus, Hufford, M. B., Albrechtsen, Anders, Ross-Ibarra, J. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature Plants. 1, 5 s., 14003.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      Odintifier - A computational method for identifying insertions of organellar origin from modern and ancient high-throughput sequencing data based on haplotype phasing

      Samaniego Castruita, J. A., Zepeda Mendoza, M. L., Barnett, R., Wales, N. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: BMC Bioinformatics. 16, 13 s., 232.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Tag jumps illuminated - reducing sequence-to-sample misidentifications in metabarcoding studies

      Schnell, I. B., Bohmann, Kristine & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Molecular Ecology Resources. 15, 6, s. 1289-1303 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      iDNA from terrestrial haematophagous leeches as a wildlife surveying and monitoring tool - prospects, pitfalls and avenues to be developed

      Schnell, I. B., Sollmann, R., Calvignac-Spencer, S., Siddall, M. E., Yu, D. W., Wilting, A. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Frontiers in Zoology. 12, 14 s., 24.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      Genome-wide ancestry of 17th-century enslaved Africans from the Caribbean

      Schroeder, Hannes, Avila Arcos, M. D. C., Malaspinas, A. S., Poznik, G. D., Sandoval-Velasco, Marcela, Carpenter, M. L., Moreno Mayar, J. Víctor, Sikora, Martin, Johnson, P. L. F., Allentoft, Morten Erik, Samaniego Castruita, J. A., Haviser, J. B., Dee, M. W., Stafford, T. W., Salas, A., Orlando, L. A. A., Willerslev, Eske, Bustamente, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 112, 12, s. 3669–3673 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Ancient DNA unravels the truth behind the controversial GUS Greenlandic Norse fur samples: the bison was a horse, and the muskox and bears were goats

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Arneborg, J., Nyegaard, G. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Journal of Archaeological Science. 53, s. 297-303 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      Penile density and globally used chemicals in Canadian and Greenland polar bears

      Sonne, C., Dyck, M., Rigét, F. F., Jensen, J. B., Hyldstrup, L., Letcher, R. J., Gustavson, K., Gilbert, M Thomas P & Dietz, R., 2015, I: Environmental Research. 137, s. 287-291 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      New insights on single-stranded versus double-stranded DNA library preparation for ancient DNA

      Wales, N., Carøe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Gamba, C., Barnett, R., Samaniego Castruita, J. A., Ramos Madrigal, Jazmin, Orlando, L. A. A. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: BioTechniques. 59, 6, s. 368-371 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      Direct evidence of milk consumption from ancient human dental calculus

      Warinner, C., Hendy, J., Speller, C., Cappellini, E., Fischer, R., Trachsel, C., Arneborg, J., Lynnerup, N., Craig, O., Swallow, D. M., Fotakis, A. K., Christensen, R. J., Olsen, J. V., Liebert, A., Montalva, N., Fiddyment, S., Mackie, M., Canci, A., Bouwman, A., Ruhli, F. & 2 flere, Gilbert, M Thomas P & Collins, M. J., 2015, I: American Journal of Physical Anthropology. 156, Suppl. 60, s. 319 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      Environmental genes and genomes: understanding the differences and challenges in the approaches and software for their analyses

      Zepeda Mendoza, M. L., Sicheritz-Pontén, T. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Briefings in Bioinformatics. 16, 5, s. 745-758 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      Bird sequencing project takes off

      KU, thw266, Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature. 522, 7554, s. 34 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

    21. 2016
    22. Udgivet

      Do vertebrate gut metagenomes confer rapid ecological adaptation?

      Alberdi, Antton, Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Bohmann, Kristine, Zepeda Mendoza, M. L. & Gilbert, M Thomas P, sep. 2016, I: Trends in Ecology & Evolution. 31, 9, s. 689-699 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Udgivet

      Further evidence of Chelonid herpesvirus 5 (ChHV5) latency: high levels of ChHV5 DNA detected in clinically healthy marine turtles

      Alfaro Nuñez, L. A., Bojesen, Anders Miki, Bertelsen, Mads Frost, Wales, N., Balazs, G. H. & Gilbert, M Thomas P, 27 jul. 2016, I: PeerJ. 4, 16 s., e2274.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. Udgivet

      Whole genome identification, phylogeny and evolution of the cytochrome P450 family 2 (CYP2) sub-families in birds

      Almeida, D., Maldonado, E., Khan, I., Silva, L., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J., Johnson, W. E. & Antunes, A., 2016, I: Genome Biology and Evolution. 8, 4, s. 1115-1131 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      Redefining the taxonomy of the all-black and pied boubous (Laniarius spp.) in coastal Kenya and Somalia

      Finch, B. W., Hunter, N. D., Winkelmann, I. E. H., Manzano Vargas, K., Njoroge, P., Fjeldså, Jon & Gilbert, M Thomas P, jun. 2016, I: Bulletin of the British Ornithologists' Club. 136, 2, s. 74-85 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      Genome-culture coevolution promotes rapid divergence of killer whale ecotypes

      Foote, A. D., Vijay, N., Avila Arcos, M. D. C., Baird, R. W., Durban, J. W., Fumagalli, M., Gibbs, R. A., Hanson, M. B., Korneliussen, Thorfinn Sand, Martin, M. D., Robertson, K. M., Sousa, V. C., Vieira, Filipe Garrett, Vinař, T., Wade, P., Worley, K. C., Excoffier, L., Morin, P. A., Gilbert, M Thomas P & Wolf, J. B. W., maj 2016, I: Nature Communications. 7, 12 s., 11693.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    27. Udgivet

      Mitochondrial DNA from the eradicated European Plasmodium vivax and P. falciparum from 70-year-old slides from the Ebro Delta in Spain

      Gelabert, P., Sandoval-Velasco, Marcela, Olalde, I., Fregel, R., Rieux, A., Escosa, R., Aranda, C., Paaijmans, K., Mueller, I., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2016, I: National Academy of Sciences. Proceedings. 113, 41, s. 11495-11500 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    28. Udgivet

      The Draft Genome of Extinct European Aurochs and its Implications for De-Extinction

      Gilbert, M Thomas P & Sinding, Mikkel Holger Strander, 2016, I: Open Quaternary. 2, 9 s., 7.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    29. Udgivet

      Bone-associated gene evolution and the origin of flight in birds

      Machado, J. P., Johnson, W. E., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J. & Antunes, A., 2016, I: BMC Genomics. 17, 15 s., 371.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    30. Udgivet

      Genomic characterization of a South American Phytophthora hybrid mandates reassessment of the geographic origins of Phytophthora infestans

      Martin, M. D., Vieira, Filipe Garrett, Ho, S. Y. W., Wales, N., Schubert, Mikkel, Seguin-Orlando, A., Ristaino, J. B. & Gilbert, M Thomas P, 2016, I: Molecular Biology and Evolution. 33, 2, s. 478-491 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    31. Udgivet

      The population genomic basis of geographic differentiation in North American common ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.)

      Martin, M. D., Olsen, Morten Tange, Samaniego Castruita, J. A., Zimmer, E. A. & Gilbert, M Thomas P, jun. 2016, I: Ecology and Evolution. 6, 11, s. 3760-3771 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    32. Udgivet

      Genome sequence of a 5,310-year-old maize cob provides insights into the early stages of maize domestication

      Ramos Madrigal, Jazmin, Smith, B. D., Moreno Mayar, J. Víctor, Gopalakrishnan, Shyam, Ross-Ibarra, J., Gilbert, M Thomas P & Wales, N., 2016, I: Current Biology. 26, 23, s. 3195-3201 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    33. Udgivet

      The potential and pitfalls of de-extinction

      Richmond, D. J., Sinding, Mikkel Holger Strander & Gilbert, M Thomas P, okt. 2016, I: Zoologica Scripta. 45, S1, s. 22-36 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    34. Udgivet

      Genomic population structure of freshwater-resident and anadromous ide (Leuciscus idus) in north-western Europe

      Skovrind, Mikkel, Olsen, Morten Tange, Vieira, Filipe Garrett, Antunes Pacheco, George, Carl, Henrik, Gilbert, M Thomas P & Møller, Peter Rask, 2016, I: Ecology and Evolution. 6, 4, s. 1064-1074 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    35. Udgivet

      Complete mitochondrial genomes of living and extinct pigeons revise the timing of the columbiform radiation

      Soares, A. E. R., Novak, B. J., Haile, James Seymour, Heupink, T. H., Fjeldså, Jon, Gilbert, M Thomas P, Poinar, H., Church, G. M. & Shapiro, B., 2016, I: BMC Evolutionary Biology. 16, 9 s., 230.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    36. Udgivet

      The limits and potential of paleogenomic techniques for reconstructing grapevine domestication

      Wales, N., Ramos Madrigal, J., Cappellini, E., Baez, A. C., Samaniego Castruita, J. A., Romero-Navarro, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Peñaloza, F., Moreno Mayar, J. V., Gasparyan, B., Zardaryan, D., Bagoyan, T., Smith, A., Pinhasi, R., Bosi, G., Fiorentino, G., Grasso, A. M., Celant, A., Bar-Oz, G. & 7 flere, Tepper, Y., Hall, A., Scalabrin, S., Miculan, M., Morgante, M., Di Gaspero, G. & Gilbert, M Thomas P, aug. 2016, I: Journal of Archaeological Science. 72, s. 57-70 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    37. Udgivet

      DAMe: a toolkit for the initial processing of datasets with PCR replicates of double-tagged amplicons for DNA metabarcoding analyses

      Zepeda Mendoza, M. L., Bohmann, Kristine, Baez, A. C. & Gilbert, M Thomas P, 2016, I: BMC Research Notes. 9, 13 s., 255.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    38. 2017
    39. Udgivet

      Connecting Earth observation to high-throughput biodiversity data

      Bush, A., Sollmann, R., Wilting, A., Bohmann, K., Cole, B., Balzter, H., Martius, C., Zlinszky, A., Calvignac-Spencer, S., Cobbold, C. A., Dawson, T. P., Emerson, B. C., Ferrier, S., Gilbert, T., Herold, M., Jones, L., Leendertz, F. H., Matthews, L., Millington, J. D. A., Olson, J. R. & 11 flere, Ovaskainen, O., Raffaelli, D., Reeve, R., Rödel, M., Rodgers, T. W., Snape, S., Visseren-Hamakers, I., Vogler, A. P., White, P. C. L., Wooster, M. J. & Yu, D. W., 22 jun. 2017, I: Nature Ecology and Evolution. 1, 7, 0176.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    40. Udgivet

      Draft genome of the fungus-growing termite pathogenic fungus Ophiocordyceps bispora (Ophiocordycipitaceae, Hypocreales, Ascomycota)

      Conlon, B. H., Mitchell, J., de Beer, Z. W., Carøe, C., Gilbert, M Thomas P, Eilenberg, Jørgen, Poulsen, Michael & de Fine Licht, Henrik Hjarvard, 2017, I: Data in Brief. 11, s. 537-542 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    41. Udgivet

      Genome-wide ancestry and demographic history of African-descendant Maroon communities from French Guiana and Suriname

      Fortes-Lima, C., Gessain, A., Ruiz-Linares, A., Bortolini, M., Migot-Nabias, F., Bellis, G., Moreno Mayar, J. Víctor, Restrepo, B. N., Rojas, W., Avendaño-Tamayo, E., Bedoya, G., Orlando, L. A. A., Salas, A., Helgason, A., Gilbert, M Thomas P, Sikora, Martin, Schroeder, Hannes & Dugoujon, J., 2 nov. 2017, I: American Journal of Human Genetics. 101, 5, s. 725-736 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    42. Udgivet

      The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics

      Gopalakrishnan, Shyam, Samaniego Castruita, J. A., Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Räikkönen, J., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Larson, G., Orlando, L. A. A., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes, Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2017, I: BMC Genomics. 18, 11 s., 495.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    43. Udgivet

      Eggshell palaeogenomics: palaeognath evolutionary history revealed through ancient nuclear and mitochondrial DNA from Madagascan elephant bird (Aepyornis sp.) eggshell

      Grealy, A., Phillips, M., Miller, G., Gilbert, M Thomas P, Rouillard, J., Lambert, D., Bunce, M. & Haile, J., apr. 2017, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 109, s. 151-163 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    44. Udgivet

      Leeches as a source of mammalian viral DNA and RNA - a study in medicinal leeches

      Kampmann, Marie-Louise, Schnell, I. B., Jensen, R. H., Axtner, J., Sander, Adam F. , Hansen, Anders Johannes, Bertelsen, Mads Frost, Greenwood, A. D., Gilbert, M Thomas P & Wilting, A., 2017, I: European Journal of Wildlife Research. 63, 6 s., 36.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    45. Udgivet

      Comparative performance of the BGISEQ-500 vs Illumina HiSeq2500 sequencing platforms for palaeogenomic sequencing

      Mak, Sarah Siu Tze, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Geng, C., Liu, Shanlin, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Zhang, W., Fu, S., Vieira, Filipe Garrett, Germonpré, M., Bocherens, H., Fedorov, S., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Marques-Bonet, T., KU, thw266, Jiang, H. & Gilbert, M Thomas P, aug. 2017, I: GigaScience. 6, 8, s. 1–13 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    46. Udgivet

      An expanded mammal mitogenome dataset from Southeast Asia

      Mohd Salleh, F. B., Ramos Madrigal, Jazmin, Peñaloza, F., Liu, Shanlin, Sinding, Mikkel Holger Strander, Patel, R. P., Martins, R., Lenz, D., Fickel, J., Roos, C., Shamsir, M. S., Azman, M. S., Lim, B. K., Rossiter, S. J., Wilting, A. & Gilbert, M Thomas P, aug. 2017, I: GigaScience. 6, 8, s. 1–8 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    47. Udgivet

      Natural selection shaped the rise and fall of passenger pigeon genomic diversity

      Murray, G. G. R., Soares, A. E. R., Novak, B. J., Schaefer, N. K., Cahill, J. A., Baker, A. J., Demboski, J. R., Doll, A., Rodrigues da Fonseca, R. A., Fulton, T. L., Gilbert, T., Heintzman, P. D., Letts, B., McIntosh, G., O'Connell, B. L., Peck, M., Pipes, M-L., Rice, E. S., Santos, K. M., Sohrweide, A. G. & 4 flere, Vohr, S. H., Corbett-Detig, R. B., Green, R. E. & Shapiro, B., 17 nov. 2017, I: Science. 358, 6365, s. 951-954 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    48. Udgivet

      Evolutionary history of Saber-toothed cats based on ancient mitogenomics

      Paijmans, J. L. A., Barnett, R., Gilbert, M Thomas P, Zepeda Mendoza, M. L., Reumer, J. W. F., de Vos, J., Zazula, G., Nagel, D., Baryshnikov, G. F., Leonard, J. A., Rohland, N., Westbury, Michael Vincent, Barlow, A. & Hofreiter, M., 6 nov. 2017, I: Current Biology. 27, 21, s. 3330-3336 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    49. Udgivet

      Characterizing restriction enzyme-associated loci in historic ragweed (Ambrosia artemisiifolia) voucher specimens using custom-designed RNA probes

      Sanchez Barreiro, F., Vieira, Filipe Garrett, Martin, M. D., Haile, James Seymour, Gilbert, M Thomas P & Wales, N., 2017, I: Molecular Ecology Resources. 17, 2, s. 209-220 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    50. Udgivet

      Relative performance of two DNA extraction and library preparation methods on archaeological human teeth samples

      Sandoval-Velasco, Marcela, Lundstrom, I. K. C., Wales, N., Ávila-Arcos, M. C., Schroeder, Hannes & Gilbert, M Thomas P, 2017, I: Science and Technology of Archaeological Research. 3, 1, s. 80-88 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    51. Udgivet

      Functional roles of Aves class-specific cis-regulatory elements on macroevolution of bird-specific features

      Seki, R., Li, C., Fang, Q., Hayashi, S., Egawa, S., Hu, J., Xu, L., Pan, H., Kondo, M., Sato, T., Matsubara, H., Kamiyama, N., Kitajima, K., Saito, D., Liu, Y., Gilbert, T., Zhou, Q., Xu, X-Z., Shiroishi, T., Irie, N. & 2 flere, Tamura, K. & KU, thw266, 6 feb. 2017, I: Nature Communications. 8, 14 s., 14229.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    52. Udgivet

      Molecular clocks indicate turnover and diversification of modern coleoid cephalopods during the Mesozoic Marine Revolution

      Tanner, A. R., Fuchs, D., Winkelmann, I. E. H., Gilbert, M Thomas P, Pankey, M. S., Oliveira Ribeiro, Â. M., Kocot, K. M., Halanych, K. M., Oakley, T. H., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Pisani, D. & Vinther, J., 15 mar. 2017, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 284, 1850, 7 s., 20162818.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    53. Udgivet

      An ‛aukward’ tale: a genetic approach to discover the whereabouts of the last Great Auks

      Thomas, J. E., Carvalho, G. R., Haile, James Seymour, Martin, M. D., Samaniego Castruita, J. A., Niemann, Jonas, Sinding, Mikkel Holger Strander, Sandoval-Velasco, Marcela, Rawlence, N. J., Fuller, E., Fjeldså, Jon, Hofreiter, M., Stewart, J. R., Gilbert, M Thomas P & Knapp, M., 15 jun. 2017, I: Genes. 8, 6, 12 s., 164.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    54. 2018
    55. Udgivet

      Agriculture shapes the trophic niche of a bat preying on multiple pest arthropods across Europe: Evidence from DNA metabarcoding

      Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Budinski, I., Georgiakakis, P., Gopalakrishnan, Shyam, Ibanez, C., Mata, V., Rebelo, H., Russo, D., Szodoray-Paradi, F., Zhelyazkova, V., Zrncic, V., Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2018, I: Molecular Ecology. 27, 3, s. 815-825 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    56. Udgivet

      Scrutinizing key steps for reliable metabarcoding of environmental samples

      Alberdi, Antton, Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Gilbert, M Thomas P & Bohmann, Kristine, 2018, I: Methods in Ecology and Evolution. 9, 1, s. 134-147 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    57. Udgivet

      No longer locally extinct? Tracing the origins of a lion (Panthera leo) living in Gabon

      Barnett, R., Sinding, M. S., Vieira, Filipe Garrett, Mendoza, M. L. Z., Bonnet, M., Araldi, A., Kienast, I., Zambarda, A., Yamaguchi, N., Henschel, P. & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Conservation Genetics. 19, 3, s. 611-618 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    58. Udgivet

      Using DNA metabarcoding for simultaneous inference of common vampire bat diet and population structure

      Bohmann, Kristine, Gopalakrishnan, Shyam, Nielsen, M., Santos-Bay, Luisa, Jones, G., Streicker, D. G. & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Molecular Ecology Resources. 18, 5, s. 1050-1063 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    59. Udgivet

      Ancient DNA analysis of Scandinavian medieval drinking horns and the horn of the last aurochs bull

      Bro-Jørgensen, M. H., Carøe, C., Vieira, Filipe Garrett, Nestor, S., Hallström, A., Gregersen, K. M., Etting, V., Gilbert, M Thomas P & Sinding, Mikkel Holger Strander, 1 nov. 2018, I: Journal of Archaeological Science. 99, s. 47-54 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    60. Udgivet

      Single-tube library preparation for degraded DNA

      Carøe, C., Gopalakrishnan, Shyam, Vinner, Lasse, Mak, Sarah Siu Tze, Sinding, Mikkel Holger Strander, Samaniego, J. A., Wales, N., Sicheritz-Ponten, T. & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Methods in Ecology and Evolution. 9, 2, s. 410-419 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    61. Udgivet

      Quantifying Temporal Genomic Erosion in Endangered Species

      Diez-del-Molino, D., Sanchez Barreiro, F., Barnes, I., Gilbert, M Thomas P & Dalen, L., 2018, I: Trends in Ecology & Evolution. 33, 3, s. 176-185 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    62. Udgivet

      Ancient genomes from Iceland reveal the making of a human population

      Ebenesersdóttir, S. S., Sandoval Velasco, M., Gunnarsdóttir, E. D., Jagadeesan, A., Guðmundsdóttir, V. B., Thordardóttir, E. L., Einarsdóttir, M. S., Moore, K. H. S., Sigurðsson, Á., Magnusdóttir, D. N., Jonsson, H., Snorradóttir, S., Hovig, E., Møller, P., Kockum, I., Olsson, T., Alfredsson, L., Hansen, T. F., Werge, T., Cavalleri, G. L. & 10 flere, Gilbert, E., Lalueza-Fox, C., Walser, J. ,. I., Kristjánsdóttir, S., Gopalakrishnan, Shyam, Árnadóttir, L., Magnússon, Ó. Þ., Gilbert, M Thomas P, Stefánsson, K. & Helgason, A., 2018, I: Science. 360, 6392, s. 1028-1032 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    63. Udgivet

      Mind the gut: genomic insights to population divergence and gut microbial composition of two marine keystone species

      Fietz, K., Hintze, C. O. R., Skovrind, Mikkel, Nielsen, Tue Kjærgaard, Limborg, Morten Tønsberg, Krag, M. A., Palsboll, P. J., Hansen, L. H., Møller, Peter Rask & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Microbiome. 6, 16 s., 82.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    64. Udgivet

      Improved Genome Assembly and Annotation for the Rock Pigeon (Columba livia)

      Holt, C., Campbell, M., Keays, D. A., Edelman, N., Kapusta, A., Maclary, E., Domyan, E. T., Suh, A., Warren, W. C., Yandell, M., Gilbert, M Thomas P & Shapiro, M. D., 2018, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 8, 5, s. 1391-1398 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    65. Udgivet
    66. Udgivet

      Multiproxy evidence highlights a complex evolutionary legacy of maize in South America

      Kistler, L., Maezumi, S. Y., Gregorio De Souza, J., Przelomska, N. A. S., Malaquias Costa, F., Smith, O., Loiselle, H., Ramos Madrigal, Jazmin, Wales, N., Ribeiro, E. R., Morrison, R. R., Grimaldo, C., Prous, A. P., Arriaza, B., Gilbert, M Thomas P, De Oliveira Freitas, F. & Allaby, R. G., 14 dec. 2018, I: Science. 362, 6420, s. 1309-1313

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    67. Udgivet

      Testosterone in ancient hair from an extinct species

      Koren, L., Matas, D., Pečnerová, P., Dalén, L., Tikhonov, A., Gilbert, M Thomas P, Wynne-edwards, K. E. & Geffen, E., 1 nov. 2018, I: Special Papers in Palaeontology. 61, 6, s. 797-802

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    68. Udgivet

      The evolutionary history of dogs in the Americas

      Leathlobhair, M. N., Perri, A. R., Irving-Pease, E. K., Witt, K. E., Linderholm, A., Haile, J., Lebrasseur, O., Ameen, C., Blick, J., Boyko, A. R., Brace, S., Cortes, Y. N., Crockford, S. J., Devault, A., Dimopoulos, E. A., Eldridge, M., Enk, J., Gopalakrishnan, S., Gori, K., Grimes, V. & 30 flere, Guiry, E., Hansen, Anders Johannes, Hulme-Beaman, A., Johnson, J., Kitchen, A., Kasparov, A. K., Kwon, Y., Nikolskiy, P. A., Lope, C. P., Manin, A., Martin, T., Meyer, M., Myers, K. N., Omura, M., Rouillard, J., Pavlova, E. Y., Sciulli, P., Sinding, M. S., Strakova, A., Ivanova, V. V., Widga, C., Willerslev, Eske, Pitulko, V. V., Barnes, I., Gilbert, M Thomas P, Dobney, K. M., Malhi, R. S., Murchison, E. P., Larson, G. & Frantz, L. A. F., 2018, I: Science. 361, 6397, s. 81-85 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    69. Udgivet

      Earth BioGenome Project: sequencing life for the future of life

      Lewin, H. A., Robinson, G. E., Kress, W. J., Baker, W. J., Coddington, J., Crandall, K. A., Durbin, R., Edwards, S. V., Forest, F., Gilbert, M. T. P., Goldstein, M. M., Grigoriev, I. V., Hackett, K. J., Haussler, D., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Patrinos, A., Richards, S., Castilla-Rubio, J. C., van Sluys, M-A. & 4 flere, Soltis, P. S., Xu, X., Yang, H. & KU, thw266, 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 17, s. 4325-4333 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    70. Udgivet

      Applied Hologenomics: Feasibility and Potential in Aquaculture

      Limborg, Morten Tønsberg, Alberdi, Antton, Kodama, M., Roggenbuck, M., Kristiansen, Karsten & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Trends in Biotechnology. 36, 3, s. 252-264 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    71. Udgivet

      Whole-Genome Sequencing of African Dogs Provides Insights into Adaptations against Tropical Parasites

      Liu, Y., Wang, L., Xu, T., Guo, X., Li, Y., Yin, T., Yang, H., Hu, Y., Adeola, A. C., Sanke, O. J., Otecko, N. O., Wang, M., Ma, Y., Charles, O. S., Sinding, M. S., Gopalakrishnan, S., Alfredo Samaniego, J., Hansen, A. J., Fernandes, C., Gaubert, P. & 10 flere, Budd, J., Dawuda, P. M., Knispel Rueness, E., Jiang, L., Zhai, W., Gilbert, M Thomas P, Peng, M., Qi, X., Wang, G. & Zhang, Y., 1 feb. 2018, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 35, 2, s. 287-298

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    72. Udgivet

      Assembly-free and alignment-free sample identification using genome skims

      Sarmashghi, S., Bohmann, Kristine, Gilbert, M Thomas P, Bafna, V. & Mirarab, S., 1 jan. 2018, I: Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics). 10812, s. 276-277 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

    73. Udgivet

      Debugging diversity – a pan-continental exploration of the potential of terrestrial blood-feeding leeches as a vertebrate monitoring tool

      Schnell, I. B., Bohmann, K., Schultze, S. E., Richter, S. R., Murray, D. C., Sinding, M. H. S., Bass, D., Cadle, J. E., Campbell, M. J., Dolch, R., Edwards, D. P., Gray, T. N. E., Hansen, T., Hoa, A. N. Q., Noer, C. L., Heise-Pavlov, S., Sander Pedersen, A. F., Ramamonjisoa, J. C., Siddall, M. E., Tilker, A. & 7 flere, Traeholt, C., Wilkinson, N., Woodcock, P., Yu, D. W., Bertelsen, Mads Frost, Bunce, M. & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Molecular Ecology Resources. 18, 6, s. 1282-1298 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    74. Udgivet

      Population genomics of grey wolves and wolf-like canids in North America

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishan, S., Vieira, Filipe Garrett, Samaniego Castruita, J. A., Raundrup, K., Heide-Jørgensen, M. P., Meldgaard, Morten, Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Mikkelsen, J. B., Marquard-Petersen, U., Dietz, R., Sonne, C., Dalén, L., Bachmann, L., Wiig, Ø., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: PLOS Genetics. 14, 11, 23 s., e1007745.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    75. Udgivet

      Greenland sled dogs at risk of extinction

      Sonne, C., Langebæk, Rikke, Dietz, R., Andersen-Ranberg, E., Houser, G., Hansen, Anders Johannes, Sinding, Mikkel Holger Strander, Olsen, Morten Tange, Egevang, C., Gilbert, M Thomas P & Meldgaard, Morten, 2018, I: Science. 360, 6393, s. 1080-1080

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    76. Udgivet

      Bat biology, genomes, and the Bat1K project: to generate chromosome-level genomes for all living bat species

      Teeling, E. C., Vernes, S. C., Dávalos, L. M., Ray, D. A., Gilbert, M Thomas P & Myers, E., 2018, I: Annual Review of Animal Biosciences. 6, s. 23-46 24 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    77. Udgivet

      Hologenomic adaptations underlying the evolution of sanguivory in the common vampire bat

      Zepeda Mendoza, M. L., Xiong, Z., Escalera-Zamudio, M., Runge, A. K. W., Thézé, J., Streicker, D., Frank, H. K., Loza-Rubio, E., Liu, S., Ryder, O. A., Castruita, J. A. S., Katzourakis, A., Pacheco, G. A., Taboada, B., Löber, U., Pybus, O. G., Li, Y., Rojas-Anaya, E., Bohmann, K., Carmona Baez, A. & 9 flere, Arias, C. F., Liu, S., Greenwood, A. D., Bertelsen, Mads Frost, White, N. E., Bunce, M., KU, thw266, Sicheritz-Ponten, T. & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Nature Ecology & Evolution. 2, 4, s. 659-668 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    78. Udgivet

      Protective role of the vulture facial skin and gut microbiomes aid adaptation to scavenging

      Zepeda Mendoza, M. L., Roggenbuck, M., Manzano Vargas, K., Hansen, L. H., Brunak, Søren, Gilbert, M Thomas P & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2018, I: Acta Veterinaria Scandinavica. 60, 1, s. 1-19 19 s., 61.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    79. Udgivet

      Pan-genome Analysis of Ancient and Modern Salmonella enterica Demonstrates Genomic Stability of the Invasive Para C Lineage for Millennia

      Zhou, Z., Lundstrøm, I. K. C., Tran-Dien, A., Duchêne, S., Alikhan, N., Sergeant, M. J., Langridge, G., Fotaki, Anna Katerina, Nair, S., Stenøien, H. K., Hamre, S. S., Casjens, S., Christophersen, A., Quince, C., Thomson, N. R., Weill, F., Ho, S. Y. W., Gilbert, M Thomas P & Achtman, M., 6 aug. 2018, I: Current Biology. 28, 15, s. 2420-2429 20 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    80. 2019
    81. Udgivet

      A guide to the application of Hill numbers to DNA-based diversity analyses

      Alberdi, Antton & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Molecular Ecology Resources. 19, 4, s. 804-817 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    82. Udgivet

      Promises and pitfalls of using high-throughput sequencing for diet analysis

      Alberdi, Antton, Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Bohmann, Kristine, Gopalakrishnan, Shyam, Lynggaard, Christina Islas, Nielsen, M. & Gilbert, M Thomas P, mar. 2019, I: Molecular Ecology Resources. 19, 2, s. 327-348

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    83. Udgivet

      Parallel adaptation of rabbit populations to myxoma virus

      Alves, J. M., Carneiro, M., Cheng, J. Y., Matos, A. L. D., Rahman, M. M., Loog, L., Campos, P. F., Wales, N., Eriksson, A., Manica, A., Strive, T., Graham, S. C., Afonso, S., Bell, D. J., Belmont, L., Day, J. P., Fuller, S. J., Marchandeau, S., Palmer, W. J., Queney, G. & 8 flere, Surridge, A. K., Vieira, Filipe Garrett, McFadden, G., Nielsen, Rasmus, Gilbert, M Thomas P, Esteves, P. J., Ferrand, N. & Jiggins, F. M., 2019, I: Science. 363, 6433

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    84. Udgivet

      Specialized sledge dogs accompanied Inuit dispersal across the North American Arctic

      Ameen, C., Feuerborn, T. R., Brown, S. K., Linderholm, A., Hulme-Beaman, A., Lebrasseur, O., Sinding, M-H. S., Lounsberry, Z. T., Lin, A. T., Appelt, M., Bachmann, L., Betts, M., Britton, K., Darwent, J., Dietz, R., Fredholm, M., Gopalakrishnan, S., Goriunova, O. I., Grønnow, B., Haile, J. & 39 flere, Hallsson, J. H., Harrison, R., Heide-Jørgensen, M. P., Knecht, R., Losey, R. J., Masson-MacLean, E., McGovern, T. H., McManus-Fry, E., Meldgaard, Morten, Midtdal, Å., Moss, M. L., Nikitin, I. G., Nomokonova, T., Pálsdóttir, A. H., Perri, A., Popov, A. N., Rankin, L., Reuther, J. D., Sablin, M., Schmidt, A. L., Shirar, S., Smiarowski, K., Sonne, C., Stiner, M. C., Vasyukov, M., West, C. F., Ween, G. B., Wennerberg, S. E., Wiig, Ø., Woollett, J., Dalén, L., Hansen, Anders Johannes, Gilbert, M Thomas P, Sacks, B. N., Frantz, L., Larson, G., Dobney, K., Darwent, C. M. & Evin, A., 2019, I: Proceedings. Biological sciences. 286, 1916, s. 20191929

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    85. Udgivet

      Avian Binocularity and Adaptation to Nocturnal Environments: Genomic Insights from a Highly Derived Visual Phenotype

      Borges, R., Fonseca, J., Gomes, C., Johnson, W. E., O'Brien, S. J., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D. & Antunes, A., 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 8, s. 2244-2255

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    86. Udgivet

      DNA extraction from keratin and chitin

      Campos, P. F. & Gilbert, M Thomas P, 1 jan. 2019, Methods in Molecular Biology. Humana Press, s. 57-63 7 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1963).

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

    87. Udgivet

      Early Pleistocene enamel proteome from Dmanisi resolves Stephanorhinus phylogeny

      Cappellini, E., Welker, F., Pandolfi, L., Ramos-Madrigal, J., Samodova, D., Rüther, P. L., Fotakis, A. K., Lyon, D., Moreno-Mayar, J. V., Bukhsianidze, M., Rakownikow Jersie-Christensen, R., Mackie, M., Ginolhac, A., Ferring, R., Tappen, M., Palkopoulou, E., Dickinson, M. R., Stafford, T. W., Chan, Y. L., Götherström, A. & 23 flere, Nathan, S. K. S. S., Heintzman, P. D., Kapp, J. D., Kirillova, I., Moodley, Y., Agusti, J., Kahlke, R. D., Kiladze, G., Martínez-Navarro, B., Liu, Shanlin, Sandoval-Velasco, Marcela, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kelstrup, C. D., Allentoft, Morten Erik, Orlando, L., Penkman, K., Shapiro, B., Rook, L., Dalén, L., Gilbert, M Thomas P, Olsen, Jesper Velgaard, Lordkipanidze, D. & Willerslev, Eske, 2019, I: Nature. 574, 7776, s. 103-107

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    88. Udgivet

      Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits

      Chen, L., Qin, Q., Jiang, Y., Wang, K., Lin, Z., Li, Z., Bibi, F., Yang, Y., Wang, J., Nie, W., Su, W., Liu, G., Li, Q., Fu, W., Pan, X., Liu, C., Yang, J., Zhang, C., Yin, Y., Wang, Y. & 32 flere, Zhao, Y., Zhang, C., Wang, Z., Qin, Y., Liu, W., Wang, B., Ren, Y., Zhang, R., Zeng, Y., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Wei, B., Li, R., Wan, W., Zhao, R., Zhu, W., Wang, Y., Duan, S., Gao, Y., Zhang, Y. E., Chen, C., Hvilsom, C., Epps, C. W., Chemnick, L. G., Doug, Y., Mirarab, S., Siegismund, Hans Redlef, Ryder, O. A., Gilbert, M Thomas P, Lewin, H. A., KU, thw266, Heller, Rasmus & Wang, W., 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1152-

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    89. Udgivet

      Using metabarcoding to compare the suitability of two blood-feeding leech species for sampling mammalian diversity in North Borneo

      Drinkwater, R., Schnell, I. B., Bohmann, Kristine, Bernard, H., Veron, G., Clare, E., Gilbert, M Thomas P & Rossiter, S. J., 2019, I: Molecular Ecology Resources. 19, 1, s. 105-117

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    90. Udgivet

      The Genomic Footprints of the Fall and Recovery of the Crested Ibis

      Feng, S., Fang, Q., Barnett, R., Li, C., Han, S., Kuhlwilm, M., Zhou, L., Pan, H., Deng, Y., Chen, G., Gamauf, A., Woog, F., Prys-Jones, R., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2019, I: Current Biology. 29, 2, s. 340-349, e1-e7

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    91. Udgivet

      Killer whale genomes reveal a complex history of recurrent admixture and vicariance

      Foote, A. D., Martin, M. D., Louis, M., Pacheco, G., Robertson, K. M., Sinding, M-H. S., Amaral, A. R., Baird, R. W., Baker, C. S., Ballance, L., Barlow, J., Brownlow, A., Collins, T., Constantine, R., Dabin, W., Dalla Rosa, L., Davison, N. J., Durban, J. W., Esteban, R., Ferguson, S. H. & 15 flere, Gerrodette, T., Guinet, C., Hanson, M. B., Hoggard, W., Matthews, C. J. D., Samarra, F. I. P., de Stephanis, R., Tavares, S. B., Tixier, P., Totterdell, J. A., Wade, P., Excoffier, L., Gilbert, M Thomas P, Wolf, J. B. W. & Morin, P. A., 2019, I: Molecular Ecology. 28, 14, s. 3427-3444 18 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    92. Udgivet

      Ancient pigs reveal a near-complete genomic turnover following their introduction to Europe

      Frantz, L. A. F., Haile, J., Lin, A. T., Scheu, A., Geoerg, C., Benecke, N., Alexander, M., Linderholm, A., Mullin, V. E., Daly, K. G., Battista, V. M., Price, M., Gron, K. J., Alexandri, P., Arbogast, R-M., Arbuckle, B., Balasescu, A., Barnett, R., Bartosiewicz, L., Baryshnikov, G. & 80 flere, Bonsall, C., Boric, D., Boroneant, A., Bulatovic, J., Cakirlar, C., Carretero, J., Chapman, J., Church, M., Crooijmans, R., De Cupere, B., Detry, C., Dimitrijevic, V., Dumitrascu, V., du Plessis, L., Edwards, C. J., Erek, C. M., Erim-Ozdogan, A., Ervynck, A., Fulgione, D., Gligor, M., Gotherstrom, A., Gourichon, L., Groenen, M. A. M., Helmer, D., Hongo, H., Horwitz, L. K., Irving-Pease, E. K., Lebrasseur, O., Lesur, J., Malone, C., Manaseryan, N., Marciniak, A., Martlew, H., Mashkour, M., Matthews, R., Matuzeviciute, G. M., Maziar, S., Meijaard, E., McGovern, T., Megens, H., Miller, R., Mohaseb, A. F., Orschiedt, J., Orton, D., Papathanasiou, A., Pearson, M. P., Pinhasi, R., Radmanovic, D., Ricaut, F., Richards, M., Sabin, R., Sarti, L., Schier, W., Sheikhi, S., Stephan, E., Stewart, J. R., Stoddart, S., Tagliacozzo, A., Tasic, N., Trantalidou, K., Tresset, A., Valdiosera, C., van den Hurk, Y., Van Poucke, S., Vigne, J., Yanevich, A., Zeeb-Lanz, A., Triantafyllidis, A., Gilbert, M Thomas P, Schibler, J., Rowley-Conwy, P., Zeder, M., Peters, J., Cucchi, T., Bradley, D. G., Dobney, K., Burger, J., Evin, A., Girdland-Flink, L. & Larson, G., 2019, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116, 35, s. 17231-17238

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    93. Udgivet

      A comparison of storage methods for gut microbiome studies in teleosts: insights from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

      Hildonen, M., Kodama, M., Puetz, Lara Christine, Gilbert, M Thomas P & Limborg, Morten Tønsberg, 2019, I: Journal of Microbiological Methods. 160, s. 42-48

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    94. Udgivet

      Host-derived population genomics data provides insights into bacterial and diatom composition of the killer whale skin

      Hooper, R., Brealey, J. C., van der Valk, T., Alberdi, Antton, Durban, J. W., Fearnbach, H., Robertson, K. M., Baird, R. W., Bradley Hanson, M., Wade, P., Gilbert, M Thomas P, Morin, P. A., Wolf, J. B. W., Foote, A. D. & Guschanski, K., 2019, I: Molecular Ecology. 28, 2, s. 484-502 19 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    95. Udgivet

      A 5700 year-old human genome and oral microbiome from chewed birch pitch

      Jensen, T. Z. T., Niemann, J., Iversen, K. H., Fotakis, A. K., Gopalakrishnan, S., Vågene, Å. J., Pedersen, M. W., Sinding, M-H. S., Ellegaard, M. R., Allentoft, M. E., Lanigan, L. T., Taurozzi, A. J., Nielsen, S. H., Dee, M. W., Mortensen, M. N., Christensen, M. C., Sørensen, S. A., Collins, M. J., Gilbert, M. T. P., Sikora, M. & 2 flere, Rasmussen, Simon & Schroeder, Hannes, 2019, I: Nature Communications. 10, 10 s., 5520.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    96. Udgivet

      Resolving a clinical tuberculosis outbreak using palaeogenomic genome reconstruction methodologies

      Jones, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Harris, L. G., Morgan, S., Temple, M., Ruddy, M. C., Williams, R., Perry, M. D., Hitchings, M., Wilkinson, T. S., Humphrey, T., Gilbert, M Thomas P & Davies, A. P., dec. 2019, I: Tuberculosis. 119, 5 s., 101865.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    97. Udgivet

      The Vertebrate TLR Supergene Family Evolved Dynamically by Gene Gain/Loss and Positive Selection Revealing a Host-Pathogen Arms Race in Birds

      Khan, I., Maldonado, E., Silva, L., Almeida, D., Johnson, W. E., O'Brien, S. J., KU, thw266, Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Antunes, A., 2019, I: Diversity. 11, 8, 25 s., 131.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    98. Udgivet

      Diabetic cats have decreased gut microbial diversity and a lack of butyrate producing bacteria

      Kieler, Ida Nordang, Osto, M., Hugentobler, L., Puetz, Lara Christine, Gilbert, M Thomas P, Hansen, Torben, Pedersen, Oluf Borbye, Reusch, C. E., Zini, E., Lutz, T. A. & Bjørnvad, Charlotte Reinhard, 2019, I: Scientific Reports. 9, s. 1-13 13 s., 4822.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    99. Udgivet

      Mitogenomic evidence of close relationships between New Zealand's extinct giant raptors and small-sized Australian sister-taxa

      Knapp, M., Thomas, J. E., Haile, James Seymour, Prost, S., Ho, S. Y. W., Dussex, N., Cameron-Christie, S., Kardailsky, O., Barnett, R., Bunce, M., Gilbert, M Thomas P & Scofield, R. P., 2019, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 134, s. 122-128

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    100. Udgivet

      Biological adaptations in the Arctic cervid, the reindeer (Rangifer tarandus)

      Lin, Z., Chen, L., Chen, X., Zhong, Y., Yang, Y., Xia, W., Liu, C., Zhu, W., Wang, H., Yan, B., Yang, Y., Liu, X., Kvie, K. S., Røed, K. H., Wang, K., Xiao, W., Wei, H., Li, G., Heller, R., Gilbert, M. T. P. & 3 flere, Qiu, Q., Wang, W. & Li, Z., 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1154-+ 7 s., eaav6312.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    101. Udgivet

      Progress for research of grape and wine culture in Georgia, the South Caucasus

      Maghradze, D., Aslanishvili, A., Mdinaradze, I., Tkemaladze, D., Mekhuzla, L., Lordkipanidze, D., Jalabadze, M., Kvavadze, E., Rusishvili, N., Mcgovern, P., This, P., Bacilieri, R., Failla, O., Cola, G., Mariani, L., Toffolatti, S. L., Lorenzis, G. D., Bianco, P. A., Quaglino, F., Wales, N. & 11 flere, Gilbert, M Thomas P, Bouby, L., Kazeli, T., Ujmajuridze, L., Mamasakhlisashili, L., Batiuk, S., Graham, A., Boaretto, E., Cheishvili, A., Davitashvili, A. L. & Aurand, J. (red.), 2019. 10 s.

      Publikation: KonferencebidragPaperForskningfagfællebedømt

    102. Udgivet

      A simplified DNA extraction protocol for unsorted bulk arthropod samples that maintains exoskeletal integrity

      Nielsen, M., Gilbert, M Thomas P, Pape, Thomas & Bohmann, Kristine, 2019, I: Environmental DNA. 1, 2, s. 144-154

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    103. Udgivet

      The discovery of Neotropical Lepidosira (Collembola, Entomobryidae) and its systematic position

      Nunes, R. C., Godeiro, N. N., Antunes Pacheco, George, Liu, Shanlin, Gilbert, M Thomas P, Alvarez-Valin, F., Zhang, F. & Bellini, B. C., 2019, I: Zoologica Scripta. 48, 6, s. 783-800

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    104. Udgivet

      Postglacial Colonization of Northern Coastal Habitat by Bottlenose Dolphins: a Marine Leading-Edge Expansion?

      Nykänen, M., Kaschner, K., Dabin, W., Brownlow, A., Davison, N. J., Deaville, R., Garilao, C., Kesner-Reyes, K., Gilbert, M Thomas P, Penrose, R., Islas-Villanueva, V., Wales, N., Ingram, S. N., Rogan, E., Louis, Marie Georgette Yolande J & Foote, A. D., 2019, I: The Journal of Heredity. 110, 6, s. 662-674

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    105. Udgivet

      High-coverage genomes to elucidate the evolution of penguins

      Pan, H., Cole, T. L., Bi, X., Fang, M., Zhou, C., Yang, Z., Ksepka, D. T., Hart, T., Bouzat, J. L., Argilla, L. S., Bertelsen, M. F., Boersma, P. D., Bost, C. A., Cherel, Y., Dann, P., Fiddaman, S. R., Howard, P., Labuschagne, K., Mattern, T., Miller, G. & 26 flere, Parker, P., Phillips, R. A., Quillfeldt, P., Ryan, P. G., Taylor, H., Thompson, D. R., Young, M. J., Ellegaard, M. R., Gilbert, M Thomas P, Sinding, Mikkel Holger Strander, Antunes Pacheco, George, Shepherd, L. D., Tennyson, A. J. D., Grosser, S., Kay, E., Nupen, L. J., Ellenberg, U., Houston, D. M., Reeve, A. H., Johnson, K., Masello, J. F., Stracke, T., McKinlay, B., Borboroglu, P. G., Zhang, D. X. & KU, thw266, 2019, I: GigaScience. 8, 9, s. 1-17

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    ID: 12980