Bent Petersen

Bent Petersen

Seniorforsker

ORCID: 0000-0002-2472-8317

Udgivelsesår:
Alle
1 - 25 ud af 68Pr. side: 25
Sortering: Titel
  1. Udgivet

    Within-host microevolution of Pseudomonas aeruginosa in Italian cystic fibrosis patients

    Marvig, R. L., Dolce, D., Sommer, L. M., Petersen, Bent, Ciofu, Oana, Campana, S., Molin, S., Taccetti, G. & Johansen, Helle Krogh, 19 okt. 2015, I: B M C Microbiology. 15, 13 s., 218.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds

    Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, Boussau, B., Bayzid, M. S., Zavidovych, V., Subramanian, S., Gabaldón, T., Capella-Gutiérrez, S., Huerta-Cepas, J., Rekepalli, B., Terkelsen, K. M., Schierup, M. H., Lindow, Bent Erik Kramer, Warren, W. C., Ray, D., Green, R. E., Bruford, M. W., Zhan, X., Dixon, A., Li, S., Li, N., Huang, Y., Derryberry, E. P., Bertelsen, Mads Frost, Sheldon, F. H., Brumfield, R. T., Mello, C. V., Lovell, P. V., Wirthlin, M., Schneider, M. P. C., Prosdocimi, F., Samaniego Castruita, J. A., Velazquez, A. M. V., Alfaro Nuñez, L. A., Campos, P., Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Pas, A., Bailey, T., Scofield, P., Bunce, M., Lambert, D. M., Zhou, Q., Perelman, P., Driskell, A. C., Shapiro, B., Xiong, Z., Zeng, Y., Liu, S., Li, Z., Liu, B., Wu, K., Xiao, J., Yinqi, X., Zheng, Q., Zhang, Y., Yang, H., Wang, J., Smeds, L., Rheindt, F. E., Braun, M., Fjeldså, Jon, Orlando, L. A. A., Barker, F. K., Jønsson, Knud Andreas, Johnson, W., Koepfli, K. P., O'Brien, S., Haussler, D., Ryder, O. A., Rahbek, Carsten, Willerslev, Eske, Graves, G. R., Glenn, T. C., McCormack, J., Burt, D., Ellegren, H., Alström, P., Edwards, S. V., Stamatakis, A., Mindell, D. P., Cracraft, J., Braun, E. L., Warnow, T., Wang, J., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Using expected sequence features to improve basecalling accuracy of amplicon pyrosequencing data

    Rask, T. S., Petersen, Bent, Chen, D. S., Day, K. P. & Pedersen, A. G., 22 apr. 2016, I: BMC Bioinformatics. 17, s. 176

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    Uncovering the genomic basis of an extraordinary plant invasion

    Bieker, V. C., Battlay, P., Petersen, B., Sun, X., Wilson, J., Brealey, J. C., Bretagnolle, F., Nurkowski, K., Lee, C., Barreiro, F. S., Owens, G. L., Lee, J. Y., Kellner, F. L., van Boheeman, L., Gopalakrishnan, S., Gaudeul, M., Mueller-Schaerer, H., Lommen, S., Karrer, G., Chauvel, B. & 8 flere, Sun, Y., Kostantinovic, B., Dalén, L., Poczai, P., Rieseberg, L. H., Gilbert, M Thomas P, Hodgins, K. A. & Martin, M. D., 2022, I: Science Advances. 8, 34, 18 s., eabo5115.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Tracking the origins of Yakutian horses and the genetic basis for their fast adaptation to subarctic environments

    Sanz, P. L., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Schubert, M., Jónsson, H., Albrechtsen, A., Fumagalli, M., Yang, M. A., Gamba, C., Seguin-Orlando, A., Mortensen, C. D., Petersen, B., Hoover, C. A., Lorente-Galdos, B., Nedoluzhko, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Neuditschko, M., Jagannathan, V., Theves, C. & 20 flere, Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Sicheritz-Pontén, T., Popov, R., Grigoriev, S., Alekseev, A. N., Rubin, E. M., McCue, M., Rieder, S., Leeb, T., Tikhonov, A., Crubézy, E., Slatkin, M., Marques-Bonet, T., Nielsen, R., Willerslev, Eske, Kantanen, J., Prokhortchouk, E. & Orlando, L. A. A., 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112, 50, s. E6889-E6897 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics

    Gopalakrishnan, Shyam, Samaniego Castruita, J. A., Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Räikkönen, J., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Larson, G., Orlando, L. A. A., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes, Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2017, I: BMC Genomics. 18, 11 s., 495.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    The tuatara genome reveals ancient features of amniote evolution

    Gemmell, N. J., Rutherford, K., Prost, S., Tollis, M., Winter, D., Macey, J. R., Adelson, D. L., Suh, A., Bertozzi, T., Grau, J. H., Organ, C., Gardner, P. P., Muffato, M., Patricio, M., Billis, K., Martin, F. J., Flicek, P., Petersen, B., Kang, L., Michalak, P. & 31 flere, Buckley, T. R., Wilson, M., Cheng, Y., Miller, H., Schott, R. K., Jordan, M. D., Newcomb, R. D., Arroyo, J. I., Valenzuela, N., Hore, T. A., Renart, J., Peona, V., Peart, C. R., Warmuth, V. M., Zeng, L., Kortschak, R. D., Raison, J. M., Zapata, V. V., Wu, Z., Santesmasses, D., Mariotti, M., Guigo, R., Rupp, S. M., Twort, V. G., Dussex, N., Taylor, H., Abe, H., Bond, D. M., Paterson, J. M., Mulcahy, D. G. & Ngatiwai Trust Board, N. T. B., 2020, I: Nature. 584, s. 403–409, +19 26 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    The population genomic legacy of the second plague pandemic

    Gopalakrishnan, S., Ebenesersdóttir, S. S., Lundstrøm, I. K. C., Turner-Walker, G., Moore, K. H. S., Luisi, P., Margaryan, A., Martin, M. D., Ellegaard, M. R., Magnússon, Ó., Sigurðsson, Á., Snorradóttir, S., Magnúsdóttir, D. N., Laffoon, J. E., van Dorp, L., Liu, X., Moltke, I., Ávila-Arcos, M. C., Schraiber, J. G., Rasmussen, S. & 40 flere, Juan, D., Gelabert, P., de-Dios, T., Fotaki, Anna Katerina, Iraeta Orbegozo, Miren, Vågene, Åshild Joanne, Denham, S. D., Christophersen, A., Stenøien, H. K., Vieira, Filipe Garrett, Liu, Shanlin, Günther, T., Kivisild, T., Moseng, O. G., Skar, B., Cheung, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Wales, N., Schroeder, Hannes, Campos, P. F., Guðmundsdóttir, V. B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Halgunset, J., Gilbert, E., Cavalleri, G. L., Hovig, E., Kockum, I., Olsson, T., Alfredsson, L., Hansen, Thomas Folkmann, Werge, Thomas, Willerslev, Eske, Balloux, F., Marques-Bonet, T., Lalueza-Fox, C., Nielsen, Rasmus, Stefánsson, K., Helgason, A. & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 21, s. 4743-4751.e6

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    The pangenome of the fungal pathogen Neonectria neomacrospora

    Nielsen, Knud Nor, Sirén, K., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Gilbert, M Thomas P, Korneliussen, Thorfinn Sand & Hansen, Ole Kim, 12 mar. 2021, 30 s. (bioRxiv).

    Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

  10. Udgivet

    The genomic basis of the plant island syndrome in Darwin’s giant daisies

    Cerca, J., Petersen, B., Lazaro-Guevara, J. M., Rivera-Colón, A., Birkeland, S., Vizueta, J., Li, S., Li, Q., Loureiro, J., Kosawang, C., Díaz, P. J., Rivas-Torres, G., Fernández-Mazuecos, M., Vargas, P., McCauley, R. A., Petersen, G., Santos-Bay, L., Wales, N., Catchen, J. M., Machado, D. & 9 flere, Nowak, M. D., Suh, A., Sinha, N. R., Nielsen, Lene Rostgaard, Seberg, Ole, Gilbert, M Thomas P, Leebens-Mack, J. H., Rieseberg, L. H. & Martin, M. D., 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3729.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    The formation of the Indo-Pacific montane avifauna

    Reeve, A. H., Kennedy, J. D., Pujolar, J. M., Petersen, Bent, Blom, M. P. K., Alström, P., Haryoko, T., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Nylander, J. A. A. & Jønsson, Knud Andreas, 2023, I: Nature Communications. 14, 15 s., 8215.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. The first draft reference genome of the American mink (Neovison vison)

    Cai, Z., Petersen, Bent, Sahana, G., Madsen, L. B., Larsen, K., Thomsen, Bo Victor, Bendixen, C., Lund, M. S., Guldbrandtsen, B. & Panitz, F., 2017, I: Scientific Reports. 7, 1, 10 s., 14564 .

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    The Whole Genome Sequence and mRNA Transcriptome of the Tropical Cyclopoid Copepod Apocyclops royi

    Jorgensen, T. S., Nielsen, B. L. H., Petersen, Bent, Browne, Patrick Denis, Hansen, B. W. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2019, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 9, 5, s. 1295-1302

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    The Genome and mRNA Transcriptome of the Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartia tonsa Dana Improve the Understanding of Copepod Genome Size Evolution

    Jørgensen, T. S., Petersen, Bent, Petersen, H. C. B., Browne, Patrick Denis, Prost, S., Stillman, J. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Hansen, B. W., 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 5, s. 1440-1450

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    The Tetragnatha kauaiensis Genome Sheds Light on the Origins of Genomic Novelty in Spiders

    Cerca, J., Armstrong, E. E., Vizueta Moraga, Joel, Fernández, R., Dimitrov, D., Petersen, Bent, Prost, S., Rozas, J., Petrov, D. & Gillespie, R. G., 2021, I: Genome Biology and Evolution. 13, 12, 17 s., evab262.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Structural Conservation Despite Huge Sequence Diversity Allows EPCR Binding by the PfEMP1 Family Implicated in Severe Childhood Malaria

    Lau, C. K. Y., Turner, Louise, Jespersen, Jakob Schmidt, Lowe, E. D., Petersen, Bent, Wang, Christian William, Petersen, J. E. V., Lusingu, J., Theander, Thor Grundtvig, Lavstsen, Thomas & Higgins, M. K., 14 jan. 2015, I: Cell Host & Microbe. 17, 1, s. 118-29 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Speciation with gene flow in equids despite extensive chromosomal plasticity

    Jónsson, H., Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Ginolhac, A., Petersen, L., Fumagalli, M., Albrechtsen, A., Petersen, B., Korneliussen, T. S., Mouatt, J. T. V., Lear, T., Myka, J. L., Lundquist, J., Miller, D. C., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Stagegaard, J., Strauss, G., Bertelsen, M. F. & 6 flere, Sicheritz-Ponten, T., Antczak, D. F., Bailey, E., Nielsen, R., Willerslev, Eske & Orlando, L. A. A., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. 18655–18660 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    SinEx DB 2.0 update 2020: database for eukaryotic single-exon coding sequences

    Jorquera, R., Gonzalez, C., Clausen, P. T. L. C., Petersen, Bent & Holmes, D. S., 2021, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2021, 5 s., baab002.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference

    Sørensen, L. M., Jensen, J. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Villesen, P., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R., Ye, W., Rao, J., Guo, X. & 39 flere, Sun, J., Cao, H., Ye, C., van Beusekom, J., Espeseth, T., Flindt, E., Friborg, R. M., Halager, A. E., Le Hellard, S., Hultman, C. M., Lescai, F., Li, S., Lund, O., Løngren, P., Mailund, T., Matey-Hernandez, M. L., Mors, O., Pedersen, C. N. S., Sicheritz-Pontén, T., Sullivan, P., Syed, A., Westergaard, David, Yadav, R., Li, N., Xu, X., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Bolund, L., Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Gupta, R., Rasmussen, Simon, Besenbacher, S., Børglum, A. D., Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff, Kristiansen, Karsten, Brunak, Søren & Schierup, M. H., 2017, I: Nature. 548, 7665, s. 87-91 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse

    Orlando, L. A. A., Ginolhac, A., Zhang, G., Froese, D., Albrechtsen, A., Stiller, M., Schubert, M., Cappellini, E., Petersen, B., Moltke, I., Johnson, P. L. F., Fumagalli, M., Mouatt, J. T. V., Raghavan, M., Korneliussen, T. S., Malaspinas, A. S., Vogt, J., Szklarczyk, D. M., Kelstrup, C., Vinther, J. & 36 flere, Dolocan, A., Stenderup, Jesper Tandberg, Velazquez, A. M. V., Cahill, J., Rasmussen, M., Wang, X., Min, J., Zazula, G. D., Seguin-Orlando, A., Mortensen, C., Magnussen, K., Thompson, J. F., Weinstock, J., Gregersen, K., Røed, K. H., Eisenmann, V., Rubin, C. J., Miller, D. C., Antczak, D. F., Bertelsen, M. F., Brunak, S., Al-Rasheid, K. A. S., Ryder, O., Andersson, L., Mundy, J., Krogh, Anders, Gilbert, M Thomas P, Kjær, Kurt H., Sicheritz-Pontén, T., Jensen, Lars Juhl, Olsen, Jesper Velgaard, Hofreiter, M., Nielsen, R., Shapiro, B., Wang, J. & Willerslev, Eske, 4 jul. 2013, I: Nature. 499, 7456, s. 74-78 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning

    Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Prehistoric genomes reveal the genetic foundation and cost of horse domestication

    Schubert, M., Jónsson, H., Chang, D., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Ginolhac, A., Albrechtsen, A., Dupanloup, I., Foucal, A., Petersen, B., Fumagalli, M., Raghavan, M., Seguin-Orlando, A., Korneliussen, T. S., Velazquez, A. M. V., Stenderup, J., Hoover, C. A., Rubin, C-J., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A. & 15 flere, Al-Rasheid, K. A. S., MacHugh, D. E., Kalbfleisch, T., MacLeod, J. N., Rubin, E. M., Sicheritz-Ponten, T., Andersson, L., Hofreiter, M., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P, Nielsen, R., Excoffier, L., Willerslev, Eske, Shapiro, B. & Orlando, L. A. A., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. E5661–E5669 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Population genomics of the island thrush elucidates one of earth’s great archipelagic radiations

    Hart Reeve, A., Gower, Graham, Pujolar, J. M., Smith, B. T., Petersen, Bent, Olsson, U., Haryoko, T., Koane, B., Maiah, G., Blom, M. P. K., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Racimo, Fernando & Jønsson, Knud Andreas, 2022, bioRxiv, 46 s.

    Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

  24. Udgivet

    Population genomics of the island thrush elucidates one of earth's great archipelagic radiations

    Hart Reeve, A., Gower, Graham, Pujolar, J. M., Smith, B. T., Petersen, Bent, Olsson, U., Haryoko, T., Koane, B., Maiah, G., Blom, M. P. K., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Racimo, Fernando & Jønsson, Knud Andreas, 2023, I: Evolution Letters. 7, 1, s. 24-36 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Population genomics of grey wolves and wolf-like canids in North America

    Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishan, S., Vieira, Filipe Garrett, Samaniego Castruita, J. A., Raundrup, K., Heide-Jørgensen, M. P., Meldgaard, Morten, Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Mikkelsen, J. B., Marquard-Petersen, U., Dietz, R., Sonne, C., Dalén, L., Bachmann, L., Wiig, Ø., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: PLOS Genetics. 14, 11, 23 s., e1007745.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 203154234