Bent Petersen
Seniorforsker
Section for Hologenomics
Øster Farimagsgade 5
1353 København K
- Udgivet
Within-host microevolution of Pseudomonas aeruginosa in Italian cystic fibrosis patients
Marvig, R. L., Dolce, D., Sommer, L. M., Petersen, Bent, Ciofu, Oana, Campana, S., Molin, S., Taccetti, G. & Johansen, Helle Krogh, 19 okt. 2015, I: B M C Microbiology. 15, 13 s., 218.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds
Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Using expected sequence features to improve basecalling accuracy of amplicon pyrosequencing data
Rask, T. S., Petersen, Bent, Chen, D. S., Day, K. P. & Pedersen, A. G., 22 apr. 2016, I: BMC Bioinformatics. 17, s. 176Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Uncovering the genomic basis of an extraordinary plant invasion
Bieker, V. C., Battlay, P., Petersen, B., Sun, X., Wilson, J., Brealey, J. C., Bretagnolle, F., Nurkowski, K., Lee, C., Barreiro, F. S., Owens, G. L., Lee, J. Y., Kellner, F. L., van Boheeman, L., Gopalakrishnan, S., Gaudeul, M., Mueller-Schaerer, H., Lommen, S., Karrer, G., Chauvel, B. & 8 flere, , 2022, I: Science Advances. 8, 34, 18 s., eabo5115.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tracking the origins of Yakutian horses and the genetic basis for their fast adaptation to subarctic environments
Sanz, P. L., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Schubert, M., Jónsson, H., Albrechtsen, A., Fumagalli, M., Yang, M. A., Gamba, C., Seguin-Orlando, A., Mortensen, C. D., Petersen, B., Hoover, C. A., Lorente-Galdos, B., Nedoluzhko, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Neuditschko, M., Jagannathan, V., Theves, C. & 20 flere, , 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112, 50, s. E6889-E6897 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics
Gopalakrishnan, Shyam, Samaniego Castruita, J. A., Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Räikkönen, J., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Larson, G., Orlando, L. A. A., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes, Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2017, I: BMC Genomics. 18, 11 s., 495.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The tuatara genome reveals ancient features of amniote evolution
Gemmell, N. J., Rutherford, K., Prost, S., Tollis, M., Winter, D., Macey, J. R., Adelson, D. L., Suh, A., Bertozzi, T., Grau, J. H., Organ, C., Gardner, P. P., Muffato, M., Patricio, M., Billis, K., Martin, F. J., Flicek, P., Petersen, B., Kang, L., Michalak, P. & 31 flere, , 2020, I: Nature. 584, s. 403–409, +19 26 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The population genomic legacy of the second plague pandemic
Gopalakrishnan, S., Ebenesersdóttir, S. S., Lundstrøm, I. K. C., Turner-Walker, G., Moore, K. H. S., Luisi, P., Margaryan, A., Martin, M. D., Ellegaard, M. R., Magnússon, Ó., Sigurðsson, Á., Snorradóttir, S., Magnúsdóttir, D. N., Laffoon, J. E., van Dorp, L., Liu, X., Moltke, I., Ávila-Arcos, M. C., Schraiber, J. G., Rasmussen, S. & 40 flere, , 2022, I: Current Biology. 32, 21, s. 4743-4751.e6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
The genomic basis of the plant island syndrome in Darwin’s giant daisies
Cerca, J., Petersen, B., Lazaro-Guevara, J. M., Rivera-Colón, A., Birkeland, S., Vizueta, J., Li, S., Li, Q., Loureiro, J., Kosawang, C., Díaz, P. J., Rivas-Torres, G., Fernández-Mazuecos, M., Vargas, P., McCauley, R. A., Petersen, G., Santos-Bay, L., Wales, N., Catchen, J. M., Machado, D. & 9 flere, , 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3729.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The formation of the Indo-Pacific montane avifauna
Reeve, A. H., Kennedy, J. D., Pujolar, J. M., Petersen, Bent, Blom, M. P. K., Alström, P., Haryoko, T., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Nylander, J. A. A. & Jønsson, Knud Andreas, 2023, I: Nature Communications. 14, 15 s., 8215.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The first draft reference genome of the American mink (Neovison vison)
Cai, Z., Petersen, Bent, Sahana, G., Madsen, L. B., Larsen, K., Thomsen, Bo Victor, Bendixen, C., Lund, M. S., Guldbrandtsen, B. & Panitz, F., 2017, I: Scientific Reports. 7, 1, 10 s., 14564 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Whole Genome Sequence and mRNA Transcriptome of the Tropical Cyclopoid Copepod Apocyclops royi
Jorgensen, T. S., Nielsen, B. L. H., Petersen, Bent, Browne, Patrick Denis, Hansen, B. W. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2019, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 9, 5, s. 1295-1302Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Genome and mRNA Transcriptome of the Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartia tonsa Dana Improve the Understanding of Copepod Genome Size Evolution
Jørgensen, T. S., Petersen, Bent, Petersen, H. C. B., Browne, Patrick Denis, Prost, S., Stillman, J. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Hansen, B. W., 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 5, s. 1440-1450Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Tetragnatha kauaiensis Genome Sheds Light on the Origins of Genomic Novelty in Spiders
Cerca, J., Armstrong, E. E., Vizueta Moraga, Joel, Fernández, R., Dimitrov, D., Petersen, Bent, Prost, S., Rozas, J., Petrov, D. & Gillespie, R. G., 2021, I: Genome Biology and Evolution. 13, 12, 17 s., evab262.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural Conservation Despite Huge Sequence Diversity Allows EPCR Binding by the PfEMP1 Family Implicated in Severe Childhood Malaria
Lau, C. K. Y., Turner, Louise, Jespersen, Jakob Schmidt, Lowe, E. D., Petersen, Bent, Wang, Christian William, Petersen, J. E. V., Lusingu, J., Theander, Thor Grundtvig, Lavstsen, Thomas & Higgins, M. K., 14 jan. 2015, I: Cell Host & Microbe. 17, 1, s. 118-29 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Speciation with gene flow in equids despite extensive chromosomal plasticity
Jónsson, H., Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Ginolhac, A., Petersen, L., Fumagalli, M., Albrechtsen, A., Petersen, B., Korneliussen, T. S., Mouatt, J. T. V., Lear, T., Myka, J. L., Lundquist, J., Miller, D. C., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Stagegaard, J., Strauss, G., Bertelsen, M. F. & 6 flere, , 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. 18655–18660 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SinEx DB 2.0 update 2020: database for eukaryotic single-exon coding sequences
Jorquera, R., Gonzalez, C., Clausen, P. T. L. C., Petersen, Bent & Holmes, D. S., 2021, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2021, 5 s., baab002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference
Sørensen, L. M., Jensen, J. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Villesen, P., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R., Ye, W., Rao, J., Guo, X. & 39 flere, , 2017, I: Nature. 548, 7665, s. 87-91 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse
Orlando, L. A. A., Ginolhac, A., Zhang, G., Froese, D., Albrechtsen, A., Stiller, M., Schubert, M., Cappellini, E., Petersen, B., Moltke, I., Johnson, P. L. F., Fumagalli, M., Mouatt, J. T. V., Raghavan, M., Korneliussen, T. S., Malaspinas, A. S., Vogt, J., Szklarczyk, D. M., Kelstrup, C., Vinther, J. & 36 flere, , 4 jul. 2013, I: Nature. 499, 7456, s. 74-78 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning
Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prehistoric genomes reveal the genetic foundation and cost of horse domestication
Schubert, M., Jónsson, H., Chang, D., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Ginolhac, A., Albrechtsen, A., Dupanloup, I., Foucal, A., Petersen, B., Fumagalli, M., Raghavan, M., Seguin-Orlando, A., Korneliussen, T. S., Velazquez, A. M. V., Stenderup, J., Hoover, C. A., Rubin, C-J., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A. & 15 flere, , 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. E5661–E5669 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomics of the island thrush elucidates one of earth’s great archipelagic radiations
Hart Reeve, A., Gower, Graham, Pujolar, J. M., Smith, B. T., Petersen, Bent, Olsson, U., Haryoko, T., Koane, B., Maiah, G., Blom, M. P. K., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Racimo, Fernando & Jønsson, Knud Andreas, 2022, bioRxiv, 46 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Population genomics of the island thrush elucidates one of earth's great archipelagic radiations
Hart Reeve, A., Gower, Graham, Pujolar, J. M., Smith, B. T., Petersen, Bent, Olsson, U., Haryoko, T., Koane, B., Maiah, G., Blom, M. P. K., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Racimo, Fernando & Jønsson, Knud Andreas, 2023, I: Evolution Letters. 7, 1, s. 24-36 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomics of grey wolves and wolf-like canids in North America
Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishan, S., Vieira, Filipe Garrett, Samaniego Castruita, J. A., Raundrup, K., Heide-Jørgensen, M. P., Meldgaard, Morten, Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Mikkelsen, J. B., Marquard-Petersen, U., Dietz, R., Sonne, C., Dalén, L., Bachmann, L., Wiig, Ø., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: PLOS Genetics. 14, 11, 23 s., e1007745.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 203154234
Flest downloads
-
477
downloads
Comparative performance of the BGISEQ-500 vs Illumina HiSeq2500 sequencing platforms for palaeogenomic sequencing
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
394
downloads
Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
287
downloads
The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet