Ashot Margaryan

Population genomics of post-glacial western Eurasia

Allentoft, M. E., Sikora, M., Refoyo-Martínez, A., Irving-Pease, E. K., Fischer, A., Barrie, W., Ingason, A., Stenderup, J., Sjögren, K-G., Pearson, A., da Mota, B. S., Paulsson, B. S., Halgren, A., Macleod, R., Jørkov, M. L. S., Demeter, F., Sørensen, L., Nielsen, P. O., Henriksen, R. A., Vimala, T. & 144 flere, McColl, Hugh, Margaryan, Ashot, Ilardo, M., Vaughn, Andrew Howland, Mortensen, M. F., Nielsen, A. B., Hede, M. U., Johannsen, N. N., Rasmussen, P., Vinner, Lasse, Renaud, Gabriel, Stern, A., Jensen, Theis Zetner Trolle, Scorrano, Gabriele, Schroeder, Hannes, Lysdahl, P., Ramsøe, Abigail Daisy, Skorobogatov, A., Schork, A. J., Rosengren, A., Ruter, Anthony Henry, Outram, A., Timoshenko, A. A., Buzhilova, A., Coppa, A., Zubova, A., Silva, A. M., Hansen, Anders Johannes, Gromov, A., Logvin, A., Gotfredsen, Anne Birgitte, Nielsen, B. H., González-Rabanal, B., Lalueza-Fox, C., McKenzie, C. J., Gaunitz, Charleen, Blasco, C., Liesau, C., Martinez-Labarga, C., Pozdnyakov, D. V., Cuenca-Solana, D., Lordkipanidze, D. O., En’shin, D., Salazar-García, D. C., Price, T. D., Borić, D., Kostyleva, E., Veselovskaya, E. V., Usmanova, E. R., Cappellini, Enrico, Petersen, Erik Brinch, Kannegaard, E., Radina, F., Yediay, Fulya Eylem, Duday, H., Gutiérrez-Zugasti, I., Merts, I., Potekhina, I., Shevnina, I., Altinkaya, Isin, Guilaine, J., Hansen, J., Tortosa, J. E. A., Zilhão, J., Vega, J., Pedersen, K. B., Tunia, K., Zhao, Lei, Mylnikova, L. N., Larsson, L., Metz, L., Yepiskoposyan, L., Pedersen, L., Sarti, L., Orlando, L., Slimak, L., Klassen, L., Blank, M., González-Morales, M., Silvestrini, M., Vretemark, M., Nesterova, M. S., Rykun, M., Rolfo, M. F., Szmyt, M., Przybyła, M., Calattini, M., Sablin, M., Dobisíková, M., Meldgaard, Morten, Johansen, M., Berezina, N., Card, N., Saveliev, N. A., Poshekhonova, O., Rickards, O., Lozovskaya, O. V., Gábor, O., Uldum, O. C., Aurino, P., Kosintsev, P., Courtaud, P., Ríos, P., Mortensen, P., Lotz, P., Persson, P., Bangsgaard, Pernille, de Barros Damgaard, P., Vang Petersen, P., Martinez, P. P., Włodarczak, P., Smolyaninov, R. V., Maring, R., Menduiña, R., Badalyan, R., Iversen, Rune, Turin, R., Vasilyev, S., Wåhlin, S., Borutskaya, S., Skochina, S., Sørensen, S. A., Andersen, S. H., Jørgensen, T., Serikov, Y. B., Molodin, V. I., Smrcka, V., Merts, V., Appadurai, V., Moiseyev, V., Magnusson, Y., Kjær, Kurt H., Lynnerup, Niels, Lawson, D. J., Sudmant, P. H., Rasmussen, Simon, Korneliussen, Thorfinn Sand, Durbin, R., Nielsen, Rasmus, Delaneau, O., Werge, Thomas, Racimo, Fernando, Kristiansen, Kristian & Willerslev, Eske, 2024, I: Nature. 625, 7994, s. 301-311

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Historic Sampling of a Vanishing Beast: Population Structure and Diversity in the Black Rhinoceros

Sánchez-Barreiro, F., Westbury, Binia De Cahsan, Westbury, Michael Vincent, Sun, Xin, Margaryan, Ashot, Fontsere, Claudia, Bruford, M. W., Russo, I. M., Kalthoff, D. C., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Dalén, L., KU, thw266, Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Moodley, Y., 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 9, 19 s., msad180.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Complete mitochondrial genomes from museum specimens clarify millipede evolution in the Eastern Arc Mountains

Nielsen, M., Margaryan, Ashot, Nielsen, Tejs Lind, Enghoff, Henrik & Allentoft, Morten Erik, 2022, I: Zoological Journal of the Linnean Society. 196, 2, s. 924-939 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genomic ancestry, diet and microbiomes of Upper Palaeolithic hunter-gatherers from San Teodoro cave (Sicily, Italy)

Scorrano, Gabriele, Nielsen, Sofie Holtsmark, Vetro, D. L., Sawafuji, R., Mackie, Meaghan, Margaryan, Ashot, Fotaki, Anna Katerina, Martínez-Labarga, C., Fabbri, P. F., Allentoft, Morten Erik, Carra, M., Martini, F., Rickards, O., Olsen, Jesper Velgaard, Pedersen, Mikkel Winther, Cappellini, Enrico & Sikora, Martin, 2022, I: Communications Biology. 5

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The population genomic legacy of the second plague pandemic

Gopalakrishnan, S., Ebenesersdóttir, S. S., Lundstrøm, I. K. C., Turner-Walker, G., Moore, K. H. S., Luisi, P., Margaryan, A., Martin, M. D., Ellegaard, M. R., Magnússon, Ó., Sigurðsson, Á., Snorradóttir, S., Magnúsdóttir, D. N., Laffoon, J. E., van Dorp, L., Liu, X., Moltke, I., Ávila-Arcos, M. C., Schraiber, J. G., Rasmussen, S. & 40 flere, Juan, D., Gelabert, P., de-Dios, T., Fotaki, Anna Katerina, Iraeta Orbegozo, Miren, Vågene, Åshild Joanne, Denham, S. D., Christophersen, A., Stenøien, H. K., Vieira, Filipe Garrett, Liu, Shanlin, Günther, T., Kivisild, T., Moseng, O. G., Skar, B., Cheung, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Wales, N., Schroeder, Hannes, Campos, P. F., Guðmundsdóttir, V. B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Halgunset, J., Gilbert, E., Cavalleri, G. L., Hovig, E., Kockum, I., Olsson, T., Alfredsson, L., Hansen, Thomas Folkmann, Werge, Thomas, Willerslev, Eske, Balloux, F., Marques-Bonet, T., Lalueza-Fox, C., Nielsen, Rasmus, Stefánsson, K., Helgason, A. & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 21, s. 4743-4751.e6

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genome-scale sequencing and analysis of human, wolf, and bison DNA from 25,000-year-old sediment

Gelabert, P., Sawyer, S., Bergström, A., Margaryan, Ashot, Collin, T. C., Meshveliani, T., Belfer-Cohen, A., Lordkipanidze, D., Jakeli, N., Matskevich, Z., Bar-Oz, G., Fernandes, D. M., Cheronet, O., Özdoğan, K. T., Oberreiter, V., Feeney, R. N. M., Stahlschmidt, M. C., Skoglund, P. & Pinhasi, R., 23 aug. 2021, I: Current Biology. 31, 16, s. 3564-3574.e9 20 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ancient and modern genomes unravel the evolutionary history of the rhinoceros family

Liu, S., Westbury, M. V., Dussex, N., Mitchell, K. J., Sinding, M. H. S., Heintzman, P. D., Duchêne, D. A., Kapp, J. D., von Seth, J., Heiniger, H., Sánchez-Barreiro, F., Margaryan, A., André-Olsen, R., De Cahsan, B., Meng, G., Yang, C., Chen, L., van der Valk, T., Moodley, Y., Rookmaaker, K. & 19 flere, Bruford, M. W., Ryder, O., Steiner, C., Sonsbeek, L. G. R. B., Vartanyan, S., Guo, C., Cooper, A., Kosintsev, P., Kirillova, I., Lister, A. M., Marques-Bonet, T., Gopalakrishnan, Shyam, Dunn, Rob, Lorenzen, Eline, Shapiro, B., KU, thw266, Antoine, P. O., Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Cell. 184, 19, s. 4874-4885.e16

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genomic Steppe ancestry in skeletons from the Neolithic Single Grave Culture in Denmark

Egfjord, A. F., Margaryan, Ashot, Fischer, A., Sjögren, K., Price, T. D., Johannsen, N. N., Nielsen, P. O., Sørensen, L., Willerslev, Eske, Iversen, Rune, Sikora, Martin, Kristiansen, K. & Allentoft, Morten Erik, 2021, I: P L o S One. 16, 1, s. 1-21

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Historical population declines prompted significant genomic erosion in the northern and southern white rhinoceros (Ceratotherium simum)

Sánchez-Barreiro, F., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Westbury, Michael Vincent, de Manuel, M., Margaryan, Ashot, Ciucani, M. M., Vieira, Filipe Garrett, Patramanis, Ioannis, Kalthoff, D. C., Timmons, Z., Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Ryder, O. A., KU, thw266, Marques-Bonet, T., Moodley, Y. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6355-6369 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mitochondrial genomes of Danish vertebrate species generated for the national DNA reference database, DNAmark

Margaryan, Ashot, Noer, Christina, Richter, S. R., Restrup, M. E., Bülow‐hansen, J. L., Leerhøi, Frederik, Arfaoui, Emilia Marie Rolander, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Gilbert, M Thomas P & Bohmann, Kristine, 2021, I: Environmental DNA. 3, 2, s. 472-480

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Origin and diffusion of human Y chromosome haplogroup J1-M267

Sahakyan, H., Margaryan, A., Saag, L., Karmin, M., Flores, R., Haber, M., Kushniarevich, A., Khachatryan, Z., Bahmanimehr, A., Parik, J., Karafet, T., Yunusbayev, B., Reisberg, T., Solnik, A., Metspalu, E., Hovhannisyan, A., Khusnutdinova, E. K., Behar, D. M., Metspalu, M., Yepiskoposyan, L. & 2 flere, Rootsi, S. & Villems, R., 2021, I: Scientific Reports. 11, 14 s., 6659.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Uncovering the genomic and metagenomic research potential in old ethanol-preserved snakes

Zacho, Claus Møller, Bager, Martina Aabenhus, Margaryan, Ashot, Gravlund, P., Galatius, A., Rasmussen, A. R. & Allentoft, Morten Erik, 2021, I: PLoS ONE. 16, 8, 24 s., e0256353.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Screening archaeological bone for palaeogenetic and palaeoproteomic studies

Kontopoulos, I., Penkman, K., Mullin, V. E., Winkelbach, L., Unterländer, M., Scheu, A., Kreutzer, S., Hansen, H. B., Margaryan, Ashot, Teasdale, M. D., Gehlen, B., Street, M., Lynnerup, Niels, Liritzis, I., Sampson, A., Papageorgopoulou, C., Allentoft, Morten Erik, Burger, J., Bradley, D. G. & Collins, Matthew James, jun. 2020, I: PLoS ONE. 15, 6, 17 s., e0235146.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics

Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, Sinding, Mikkel Holger Strander, Puetz, Lara Christine, Cavill, Emily Louisa, Ribeiro, Â. M., Eckhart, L., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Brumfield, R. T., Christidis, L., Bertelsen, Mads Frost, Sicheritz-Pontén, Thomas, Tietze, D. T., Robertson, B. C., Song, G., Borgia, G., Claramunt, S., Lovette, I. J., Cowen, S. J., Njoroge, P., Dumbacher, J. P., Ryder, O. A., Fuchs, J., Bunce, M., Burt, D. W., Cracraft, J., Meng, G., Hackett, S. J., Ryan, P. G., Jønsson, Knud Andreas, Jamieson, I. G., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Braun, E. L., Houde, P., Mirarab, S., Suh, A., Hansson, B., Ponnikas, S., Sigeman, H., Stervander, M., Frandsen, P. B., van der Zwan, H., van der Sluis, R., Visser, C., Balakrishnan, C. N., Clark, A. G., Fitzpatrick, J. W., Bowman, R., Chen, N., Cloutier, A., Sackton, T. B., Edwards, S. V., Foote, D. J., Shakya, S. B., Sheldon, F. H., Vignal, A., Soares, A. E. R., Shapiro, B., González-Solís, J., Ferrer-Obiol, J., Rozas, J., Riutort, M., Tigano, A., Friesen, V., Dalén, L., Urrutia, A. O., Székely, T., Liu, Y., Campana, M. G., Corvelo, A., Fleischer, R. C., Rutherford, K. M., Gemmell, N. J., Dussex, N., Mouritsen, H., Thiele, N., Delmore, K., Liedvogel, M., Franke, A., Hoeppner, M. P., Krone, O., Fudickar, A. M., Milá, B., Ketterson, E. D., Fidler, A. E., Friis, G., Parody-Merino, Á. M., Battley, P. F., Cox, M. P., Lima, N. C. B., Prosdocimi, F., Parchman, T. L., Schlinger, B. A., Loiselle, B. A., Blake, J. G., Lim, H. C., Day, L. B., Fuxjager, M. J., Baldwin, M. W., Braun, M. J., Wirthlin, M., Dikow, R. B., Ryder, T. B., Camenisch, G., Keller, L. F., Dacosta, J. M., Hauber, M. E., Louder, M. I. M., Witt, C. C., McGuire, J. A., Mudge, J., Megna, L. C., Carling, M. D., Wang, B., Taylor, S. A., Del-Rio, G., Aleixo, A., Vasconcelos, A. T. R., Mello, C. V., Weir, J. T., Haussler, D., Li, Q., Yang, H., Wang, J., Lei, F., Rahbek, Carsten, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R., Jarvis, E. D., Paten, B. & KU, thw266, 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Diverse variola virus (smallpox) strains were widespread in northern Europe in the Viking Age

Mühlemann, B., Vinner, L., Margaryan, A., Wilhelmson, H., de la Fuente Castro, C., Allentoft, M. E., de Barros Damgaard, P., Hansen, A. J., Holtsmark Nielsen, S., Strand, L. M., Bill, J., Buzhilova, A., Pushkina, T., Falys, C., Khartanovich, V., Moiseyev, V., Jørkov, M. L. S., Østergaard Sørensen, P., Magnusson, Y., Gustin, I. & 9 flere, Schroeder, Hannes, Sutter, G., Smith, G. L., Drosten, C., Fouchier, R. A. M., Smith, D. J., Willerslev, Eske, Jones, T. C. & Sikora, Martin, 2020, I: Science (New York, N.Y.). 369, 6502, s. 1-12

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet

Gelabert, P., Sandoval-Velasco, M., Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, A., Stiller, J., de-Dios, T., Fang, Q., Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, B., Olsen, R-A., Navarro, A., Deng, Y. & 6 flere, Dalén, L., Marquès-Bonet, T., KU, thw266, Antunes, A., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Population genomics of the Viking world: [incl. correction]

Margaryan, A., Lawson, D. J., Sikora, M., Racimo, F., Rasmussen, S., Moltke, I., Cassidy, L. M., Jørsboe, E., Ingason, A., Pedersen, M. W., Korneliussen, T., Wilhelmson, H., Buś, M. M., de Barros Damgaard, P., Martiniano, R., Renaud, G., Bhérer, C., Moreno-Mayar, J. V., Fotakis, A. K., Allen, M. & 30 flere, Allmäe, R., Molak, M., Cappellini, Enrico, Scorrano, Gabriele, McColl, Hugh, Buzhilova, A., Fox, A., Albrechtsen, Anders, Schütz, B., Skar, B., Arcini, C., Lundstrøm, I., Cheng, J., Stenderup, Jesper Tandberg, Iversen, K. H., Arge, S. V., Ellingvåg, S., Orlando, L., Pentz, P., Jessen, M. D., Pedersen, A., Jørkov, M L S, Lynnerup, Niels, Gilbert, M Thomas P, Allentoft, Morten Erik, Sindbæk, S. M., Kristiansen, K., Nielsen, Rasmus, Werge, Thomas & Willerslev, Eske, 2020, I: Nature. 585, 7825, s. 390-396 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Recent mitochondrial lineage extinction in the critically endangered Javan rhinoceros

Margaryan, Ashot, Sinding, Mikkel Holger Strander, Liu, Shanlin, Vieira, Filipe Garrett, Chan, Y. L., Nathan, S. K. S. S., Moodley, Y., Bruford, M. W. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Zoological Journal of the Linnean Society. 190, 1, s. 372-383 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ancient DNA shows high faunal diversity in the Lesser Caucasus during the Late Pleistocene

Antonosyan, M., Seersholm, Frederik Valeur, Grealy, A. C., Barham, M., Werndly, D., Margaryan, Ashot, Cieślik, A., Stafford, T. W., Allentoft, Morten Erik, Bunce, M. & Yepiskoposyan, L., 2019, I: Quaternary Science Reviews. 219, s. 102-111 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Approaching sheep herds origins and the emergence of the wool economy in continental Europe during the Bronze Age

Sabatini, S., Bergerbrant, S., Brandt, Luise Ørsted, Margaryan, Ashot & Allentoft, Morten Erik, 2019, I: Archaeological and Anthropological Sciences. 11, 9, s. 4909-4925 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The population history of northeastern Siberia since the Pleistocene

Sikora, M., Pitulko, V. V., Sousa, V. C., Allentoft, M. E., Vinner, L., Rasmussen, S., Margaryan, A., Damgaard, P. D. B., de la Fuente Castro, C., Renaud, G., Yang, M. A., Fu, Q., Dupanloup, I., Giampoudakis, K., Nogues, D. B., Rahbek, C., Kroonen, G., Peyrot, M., McColl, H., Vasilyev, S. V. & 27 flere, Veselovskaya, E., Gerasimova, M., Pavlova, E. Y., Chasnyk, V. G., Nikolskiy, P. A., Gromov, A. V., Khartanovich, V. I., Moiseyev, V., Grebenyuk, P. S., Fedorchenko, A. Y., Lebedintsev, A. I., Slobodin, S. B., Malyarchuk, B. A., Martiniano, R., Meldgaard, Morten, Arppe, L., Palo, J. U., Sundell, T., Mannermaa, K., Putkonen, M., Alexandersen, V., Primeau, C., Baimukhanov, N., Malhi, R. S., Sjögren, K. G., Nielsen, Rasmus & Willerslev, Eske, 2019, I: Nature. 570, s. 182–188

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt