Tom Gilbert

Tom Gilbert

Professor

Medlem af:


    1. Udgivet

      Comparative Performance of Two Whole Genome Capture Methodologies on Ancient DNA Illumina Libraries

      Ávila-Arcos, M. C., Sandoval-Velasco, Marcela, Schroeder, Hannes, Carpenter, M. L., Malaspinas, A., Wales, N., Peñaloza, F., Bustamante, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2014, 6 udg., bioRxiv, 37 s.

      Publikation: Working paperPreprintForskning

    2. Udgivet

      Genomic insights into the conservation status of the world's last remaining Sumatran rhinoceros populations

      von Seth, J., Dussex, N., Diez-del-Molino, D., van der Valk, T., Kutschera, V. E., Kierczak, M., Steiner, C. C., Liu, S., Gilbert, M. T. P., Sinding, M-H. S., Prost, S., Guschanski, K., Nathan, S. K. S. S., Brace, S., Chan, Y. L., Wheat, C. W., Skoglund, P., Ryder, O. A., Goossens, B., Gotherstrom, A. & 1 flere, Dalen, L., 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 11 s., 2393.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      Plasmodium vivax Malaria Viewed through the Lens of an Eradicated European Strain

      van Dorp, L., Gelabert, P., Rieux, A., de Manuel, M., de-Dios, T., Gopalakrishnan, Shyam, Caroe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Fregel, R., Olalde, I., Escosa, R., Aranda, C., Huijben, S., Mueller, I., Marques-Bonet, T., Balloux, F., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 37, 3, s. 773-785 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Bone marrow and bone as a source for postmortem RNA

      van Doorn, N. L., Wilson, A. S., Willerslev, Eske & Gilbert, M Thomas P, 2011, I: Journal of Forensic Sciences. 56, 3, s. 720-725 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Genetic affinities of an eradicated European Plasmodium falciparum strain

      de-Dios, T., van Dorp, L., Gelabert, P., Carøe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Fregel, R., Escosa, R., Aranda, C., Huijben, S., Balloux, F., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2019, I: Microbial Genomics. 5, 9, 7 s., 289.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      The evolutionary history of extinct and living lions

      de Manuel, M., Barnett, R., Sandoval-Velasco, M., Yamaguchi, N., Vieira, F. G., Mendoza, M. L. Z., Liu, S., Martin, M. D., Sinding, M-H. S., Mak, S. S. T., Caroe, C., Liu, S., Guo, C., Zheng, J., Zazula, G., Baryshnikov, G., Eizirik, E., Koepfli, K-P., Johnson, W. E., Antunes, A. & 9 flere, Sicheritz-Pontén, Thomas, Gopalakrishnan, Shyam, Larson, G., Yang, H., O'Brien, S. J., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Marques-Bonet, T. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 20, s. 10927-10934 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Phylogenomics of the world's otters

      de Ferran, V., Figueiró, H. V., Trindade, F. D. J., Smith, O., Sinding, Mikkel Holger Strander, Trinca, C. S., Lazzari, G. Z., Veron, G., Vianna, J. A., Barbanera, F., Kliver, S., Serdyukova, N., Bulyonkova, T., Ryder, O. A., Gilbert, M Thomas P, Koepfli, K. & Eizirik, E., 2022, I: Current Biology. 32, 16, s. 3650-3658.e4 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux

      da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, Osório, H., Winkelmann, I., Simakov, O., Rasmussen, Simon, Rahman, M. Z., Pisani, D., Vinther, J., Jarvis, E., KU, thw266, Strugnell, J. M., Castro, L. F. C., Fedrigo, O., Patricio, M., Li, Q., Rocha, S., Antunes, A., Wu, Y., Ma, B., Sanges, R., Vinar, T., Blagoev, B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Nielsen, Rasmus & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      DNA metabarcoding - need for robust experimental designs to draw sound ecological conclusions

      Zinger, L., Bonin, A., Alsos, I. G., Bálint, M., Bik, H., Boyer, F., Chariton, A. A., Creer, S., Coissac, E., Deagle, B. E., De Barba, M., Dickie, I. A., Dumbrell, A. J., Ficetola, G. F., Fierer, N., Fumagalli, L., Gilbert, M. T. P., Jarman, S., Jumpponen, A., Kauserud, H. & 7 flere, Orlando, L., Pansu, J., Pawlowski, J., Tedersoo, L., Thomsen, P. F., Willerslev, Eske & Taberlet, P., 2019, I: Molecular Ecology. 28, 8, s. 1857-1862 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Pan-genome Analysis of Ancient and Modern Salmonella enterica Demonstrates Genomic Stability of the Invasive Para C Lineage for Millennia

      Zhou, Z., Lundstrøm, I. K. C., Tran-Dien, A., Duchêne, S., Alikhan, N., Sergeant, M. J., Langridge, G., Fotaki, Anna Katerina, Nair, S., Stenøien, H. K., Hamre, S. S., Casjens, S., Christophersen, A., Quince, C., Thomson, N. R., Weill, F., Ho, S. Y. W., Gilbert, M Thomas P & Achtman, M., 6 aug. 2018, I: Current Biology. 28, 15, s. 2420-2429 20 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      Complex evolutionary trajectories of sex chromosomes across bird taxa

      Zhou, Q., Zhang, J., Bachtrog, D., An, N., Huang, Q., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2014, I: Science. 346, 6215, 8 s., 1246338.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      On the origin and evolution of RNA editing in metazoans

      Zhang, P., Zhu, Y., Guo, Q., Li, J., Zhan, X., Yu, H., Xie, N., Tan, H., Lundholm, Nina, Garcia-Cuetos, L., Martin, M. D., Subirats, M. A., Su, Y., Ruiz-Trillo, I., Martindale, M. Q., Yu, J., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Li, Q., 2023, I: Cell Reports. 42, 2, 22 s., 112112.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      Bird sequencing project takes off

      KU, thw266, Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature. 522, 7554, s. 34 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      A flock of Genomes

      KU, thw266, Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1308-1309 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation

      Zhang, G., Li, C., Li, Q., Li, B., Larkin, D. M., Lee, C., Storz, J. F., Antunes, A., Greenwold, M. J., Meredith, R. W., Ödeen, A., Cui, J., Zhou, Q., Xu, L., Pan, H., Wang, Z., Jin, L., Zhang, P., Hu, H., Yang, W. & 85 flere, Hu, J., Xiao, J., Yang, Z., Liu, Y., Xie, Q., Yu, H., Lian, J., Wen, P., Zhang, F., Li, H., Zeng, Y., Xiong, Z., Liu, S., Zhou, L., Huang, Z., An, N., Wang, J., Zheng, Q., Xiong, Y., Wang, G., Wang, B., Wang, J., Fan, Y., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Alfaro Nuñez, L. A., Schubert, Mikkel, Orlando, L. A. A., Mourier, T., Howard, J. T., Ganapathy, G., Pfenning, A., Whitney, O., Rivas, M. V., Hara, E., Smith, J., Farré, M., Narayan, J., Slavov, G., Romanov, M. N., Borges, R., MacHado, J. P., Khan, I., Springer, M. S., Gatesy, J., Hoffmann, F. G., Opazo, J. C., Håstad, O., Sawyer, R. H., Kim, H., Kim, K. W., Kim, H. J., Cho, S., Li, N., Huang, Y., Bruford, M. W., Zhan, X., Dixon, A., Bertelsen, Mads Frost, Derryberry, E., Warren, W., Wilson, R. K., Li, S., Ray, D. A., Green, R. E., O'Brien, S. J., Griffin, D., Johnson, W. E., Haussler, D., Ryder, O. A., Willerslev, Eske, Graves, G. R., Alström, P., Fjeldså, Jon, Mindell, D. P., Edwards, S. V., Braun, E. L., Rahbek, Carsten, Burt, D. W., Houde, P., Zhang, Y., Yang, H., Wang, J., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Wang, J., 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1311-1320 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      Comparative genomic data of the Avian Phylogenomics Project

      KU, thw266, Li, B., Li, C., Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., Wang, J. & Avian Genome Consortium, A. G. C., 2014, I: GigaScience. 3, 8 s., 26.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      Environmental genes and genomes: understanding the differences and challenges in the approaches and software for their analyses

      Zepeda Mendoza, M. L., Sicheritz-Pontén, T. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Briefings in Bioinformatics. 16, 5, s. 745-758 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      DAMe: a toolkit for the initial processing of datasets with PCR replicates of double-tagged amplicons for DNA metabarcoding analyses

      Zepeda Mendoza, M. L., Bohmann, Kristine, Baez, A. C. & Gilbert, M Thomas P, 2016, I: BMC Research Notes. 9, 13 s., 255.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      Hologenomic adaptations underlying the evolution of sanguivory in the common vampire bat

      Zepeda Mendoza, M. L., Xiong, Z., Escalera-Zamudio, M., Runge, A. K. W., Thézé, J., Streicker, D., Frank, H. K., Loza-Rubio, E., Liu, S., Ryder, O. A., Castruita, J. A. S., Katzourakis, A., Pacheco, G. A., Taboada, B., Löber, U., Pybus, O. G., Li, Y., Rojas-Anaya, E., Bohmann, K., Carmona Baez, A. & 9 flere, Arias, C. F., Liu, S., Greenwood, A. D., Bertelsen, Mads Frost, White, N. E., Bunce, M., KU, thw266, Sicheritz-Ponten, T. & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Nature Ecology & Evolution. 2, 4, s. 659-668 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      Protective role of the vulture facial skin and gut microbiomes aid adaptation to scavenging

      Zepeda Mendoza, M. L., Roggenbuck, M., Manzano Vargas, K., Hansen, L. H., Brunak, Søren, Gilbert, M Thomas P & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2018, I: Acta Veterinaria Scandinavica. 60, 1, s. 1-19 19 s., 61.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    21. Udgivet

      DNA from soil mirrors plant taxonomic and growth form diversity

      Yoccoz, N. G., Bråthen, K. A., Gielly, L., Haile, J. S., Edwards, M. E., Goslar, T., von Stedingk, H., Brysting, A. K., Coissac, E., Pompanon, F., Sønstebo, J. H., Miquel, C., Valentini, A., de Bello, F., Chave, J., Thuiller, W., Wincker, P., Cruaud, C., Gavory, F., Rasmussen, M. & 5 flere, Gilbert, M Thomas P, Orlando, L. A. A., Brochmann, C., Willerslev, Eske & Taberlet, P., 1 aug. 2012, I: Molecular Ecology. 21, 15, s. 3647-3655 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    22. Udgivet

      Historical mammal extinction on Christmas Island (Indian Ocean) correlates with introduced infectious disease

      Wyatt, K. B., Campos, P. F., Gilbert, M Thomas P, Kolokotronis, S., Hynes, W. H., DeSalle, R., Daszak, P., MacPhee, R. D. E. & Greenwood, A. D., 2008, I: PLoS ONE. 3, 11, s. e3602

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Udgivet

      Direct evidence of extensive diversity of HIV-1 in Kinshasa by 1960

      Worobey, M., Gemmel, M., Teuwen, D. E., Haselkorn, T., Kunstman, K., Bunce, M., Muyembe, J., Kabongo, J. M., Kalengayi, R. M., Van Marck, E., Gilbert, M Thomas P & Wolinsky, S. M., 2008, I: Nature. 455, 7213, s. 661-4 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. Udgivet

      Reply to Pape et al.: the phylogeography of HIV-1 group M subtype B.

      Worobey, M., Pitchenik, A. E., Gilbert, M Thomas P, Wlasiuk, G. & Rambaut, A., 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 105, 12, s. E16

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      Mitochondrial genome diversity and population structure of the giant squid Architeuthis: genetics sheds new light on one of the most enigmatic marine species

      Winkelmann, I. E. H., Campos, P., Strugnell, J., Cherel, Y., Smith, P. J., Kubodera, T., Allcock, L., Kampmann, Marie-Louise, Schroeder, Hannes, Guerra, A., Norman, M., Finn, J., Ingrao, D., Clarke, M. & Gilbert, M Thomas P, 22 maj 2013, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 280, 1759, 9 s., 20130273.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      Stable isotope and DNA evidence for ritual sequences in Inca child sacrifice.

      Wilson, A. S., Taylor, T., Ceruti, M. C., Chavez, J. A., Reinhard, J., Grimes, V., Meier-Augenstein, W., Cartmell, L., Stern, B., Richards, M. P., Worobey, M., Barnes, I. & Gilbert, M Thomas P, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 42, s. 16456-61 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    27. Udgivet

      Ancient biomolecules from deep ice cores reveal a forested southern Greenland.

      Willerslev, E., Cappellini, E., Boomsma, W. K., Nielsen, R., Hebsgaard, M. B., Brand, T. B., Hofreiter, M., Bunce, M., Poinar, H. N., Dahl-Jensen, D., Johnsen, S. J., Steffensen, J. P., Bennike, O., Schwenninger, J-L., Nathan, R., Armitage, S., de Hoog, C-J., Alfimov, V., Christl, M., Beer, J. & 10 flere, Muscheler, R., Barker, J., Sharp, M., Penkman, K. E. H., Haile, J., Taberlet, P., Gilbert, M Thomas P, Casoli, A., Campani, E. & Collins, M. J., 2007, I: Science. 317, 5834, s. 111-114 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    28. Udgivet

      Analysis of complete mitochondrial genomes from extinct and extant rhinoceroses reveals lack of phylogenetic resolution

      Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P, Binladen, J., Ho, S. Y. W., Campos, P. F., Ratan, A., Tomsho, L. P., da Fonseca, R. R., Sher, A., Kuznetsova, T. V., Nowak-Kemp, M., Roth, T. L., Miller, W. & Schuster, S. C., 2009, I: BMC Evolutionary Biology. 9, s. 95

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    29. Udgivet

      Fifty thousand years of Arctic vegetation and megafaunal diet

      Willerslev, E., Davison, J., Moora, M., Zobel, M., Coissac, E., Edwards, M. E., Lorenzen, E., Vestergård, M., Gussarova, G., Haile, J. S., Craine, J., Gielly, L., Boessenkool, S., Epp, L. S., Pearman, P. B., Cheddadi, R., Murray, D., Bråthen, K. A., Yoccoz, N., Binney, H. & 30 flere, Cruaud, C., Wincker, P., Goslar, T., Alsos, I. G., Bellemain, E., Brysting, A. K., Elven, R., Sønstebø, J. H., Murton, J., Sher, A., Rasmussen, M., Rønn, Regin, Mourier, T., Cooper, A., Austin, J., Möller, P., Froese, D., Zazula, G., Pompanon, F., Rioux, D., Niderkorn, V., Tikhonov, A., Savvinov, G., Roberts, R. G., MacPhee, R. D. E., Gilbert, M Thomas P, Kjær, Kurt H., Orlando, L. A. A., Brochmann, C. & Taberlet, P., 2014, I: Nature. 506, 7486, s. 47-51 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    30. Udgivet

      Diverse plant and animal genetic records from Holocene and Pleistocene sediments

      Willerslev, Eske, Hansen, Anders Johannes, Binladen, J., Brand, T. B., Gilbert, M Thomas P, Shapiro, B., Bunce, M., Wiuf, C., Gilichinsky, D. A. & Cooper, A., 2003, I: Science. 300, 5620, s. 791-5

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    31. Udgivet

      Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss

      Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    32. Udgivet

      The evolutionary history of cockatoos (Aves: Psittaciformes: Cacatuidae)

      White, N. E., Phillips, M. J., Gilbert, M Thomas P, Alfaro Nuñez, L. A., Willerslev, Eske, Mawson, P. R., Spencer, P. B. S. & Bunce, M., jun. 2011, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 59, 3, s. 615-622 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    33. Udgivet

      A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives: [version 1; peer review: 2 approved]

      Westbury, Michael Vincent, Barnett, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Gower, Graham, Vieira, Filipe Garrett, de Manuel, M., Hansen, Anders Johannes, Yamaguchi, N., Werdelin, L., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lorenzen, Eline, 2021, I: Open Research Europe. 1, 15 s., 25.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    34. Udgivet

      A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives: [version 2; peer review: 2 approved]

      Westbury, Michael Vincent, Barnett, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Gower, Graham, Vieira, Filipe Garrett, de Manuel, M., Hansen, Anders Johannes, Yamaguchi, N., Werdelin, L., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lorenzen, Eline, 2021, I: Open Research Europe. 1, 16 s., 25.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    35. Udgivet

      The late Pleistocene distribution of vicunas (Vicugna vicugna) and the "extinction" of the gracile Llama ("Lama gracilis"): New molecular data

      Weinstock, J., Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2009, I: Quaternary Science Reviews. 28, s. 1369-1373

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    36. Udgivet

      Pre-Clovis mastodon hunting 13,800 years ago at the Manis site, Washington

      Waters, M. R., Stafford jr., T., McDonald, H. G., Gustafson, C., Rasmussen, M., Cappellini, Enrico, Olsen, Jesper Velgaard, Szklarczyk, D. M., Jensen, Lars Juhl, Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2011, I: Science. 334, 6054, s. 351-353 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    37. Udgivet

      Pathogens and host immunity in the ancient human oral cavity

      Warinner, C., Rodrigues, J. F. M., Vyas, R., Trachsel, C., Shved, N., Grossmann, J., Radini, A., Hancock, Y., Tito, R. Y., Fiddyment, S., Speller, C., Hendy, J., Charlton, S., Luder, H. U., Salazar-García, D. C., Eppler, E., Seiler, R., Hansen, L. H., Samaniego Castruita, J. A., Barkow-Oesterreicher, S. & 12 flere, Teoh, K. Y., Kelstrup, C., Olsen, Jesper Velgaard, Nanni, P., Kawai, T., Willerslev, Eske, von Mering, C., Lewis, C. M., Collins, M. J., Gilbert, M Thomas P, Rühli, F. & Cappellini, Enrico, 2014, I: Nature Genetics. 46, s. 336-344 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    38. Udgivet

      Direct evidence of milk consumption from ancient human dental calculus

      Warinner, C., Hendy, J., Speller, C., Cappellini, E., Fischer, R., Trachsel, C., Arneborg, J., Lynnerup, N., Craig, O., Swallow, D. M., Fotakis, A. K., Christensen, R. J., Olsen, J. V., Liebert, A., Montalva, N., Fiddyment, S., Mackie, M., Canci, A., Bouwman, A., Ruhli, F. & 2 flere, Gilbert, M Thomas P & Collins, M. J., 2015, I: American Journal of Physical Anthropology. 156, Suppl. 60, s. 319 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

    39. Udgivet

      Direct evidence of milk consumption from ancient human dental calculus

      Warinner, C., Hendy, J., Speller, C., Cappellini, E., Fischer, R., Trachsel, C., Arneborg, J., Lynnerup, N., Craig, O. E., Swallow, D. M., Fotakis, A. K., Jersie-Christensen, R. R., Olsen, J. V., Liebert, A., Montalva, N., Fiddyment, S., Charlton, S., Mackie, M. E., Canci, A., Bouwman, A. & 3 flere, Rühli, F., Gilbert, M Thomas P & Collins, M. J., 2014, I: Scientific Reports. 4, 6 s., 7104.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    40. Udgivet

      Evaluating the Y chromosomal timescale in human demographic and lineage dating

      Wang, C., Gilbert, M Thomas P, Jin, L. & Li, H., 2014, I: Investigative Genetics. 5, 7 s., 12.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    41. Udgivet

      Ancient DNA reveals the timing and persistence of organellar genetic bottlenecks over 3,000 years of sunflower domestication and improvement

      Wales, N., Akman, M., Watson, R. H. B., Sánchez Barreiro, F., Smith, B. D., Gremillion, K. J., Gilbert, M Thomas P & Blackman, B. K., 1 jan. 2019, I: Evolutionary Applications. 12, 1, s. 38-53

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    42. Udgivet

      New insights on single-stranded versus double-stranded DNA library preparation for ancient DNA

      Wales, N., Carøe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Gamba, C., Barnett, R., Samaniego Castruita, J. A., Ramos Madrigal, Jazmin, Orlando, L. A. A. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: BioTechniques. 59, 6, s. 368-371 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    43. Udgivet

      The limits and potential of paleogenomic techniques for reconstructing grapevine domestication

      Wales, N., Ramos Madrigal, J., Cappellini, E., Baez, A. C., Samaniego Castruita, J. A., Romero-Navarro, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Peñaloza, F., Moreno Mayar, J. V., Gasparyan, B., Zardaryan, D., Bagoyan, T., Smith, A., Pinhasi, R., Bosi, G., Fiorentino, G., Grasso, A. M., Celant, A., Bar-Oz, G. & 7 flere, Tepper, Y., Hall, A., Scalabrin, S., Miculan, M., Morgante, M., Di Gaspero, G. & Gilbert, M Thomas P, aug. 2016, I: Journal of Archaeological Science. 72, s. 57-70 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    44. Udgivet

      Optimization of DNA recovery and amplification from non-carbonized archaeobotanical remains

      Wales, N., Andersen, K., Cappellini, Enrico, Avila Arcos, M. D. C. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: PLOS ONE. 9, 1, 14 s., e86827.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    45. Udgivet

      Choosing the best plant for the job: a cost-effective assay to prescreen ancient plant remains destined for shotgun sequencing

      Wales, N., Romero-Navarro, J. A., Cappellini, Enrico & Gilbert, M Thomas P, 20 sep. 2012, I: PLoS ONE. 7, 9, 8 s., e45644.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    46. Udgivet

      The survival of PCR-amplifiable DNA in cow leather15

      Vuissoz, A., Worobey, M., Odegaard, N., Bunce, M., Machado, C. A., Lynnerup, Niels, Peacock, E. E. & Gilbert, M Thomas P, 2007, I: Journal of Archaeological Science. 34, 5, s. 823-829 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    47. Udgivet

      Statistical analysis of post mortem DNA damage-derived miscoding lesions in Neandertal mitochondrial DNA

      Vives, S., Gilbert, M Thomas P, Arenas, C., Gigli, E., Lao, O. & Lalueza-Fox, C., 2008, I: BMC Research Notes. 1, s. 40

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    48. Udgivet

      Using in silico predicted ancestral genomes to improve the efficiency of paleogenome reconstruction

      Vieira, Filipe Garrett, Castruita, J. A. S. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Ecology and Evolution. 10, 23, s. 12700-12709

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    49. Udgivet

      The Founding Feathers: The true ancestry of the domestic Barbary Dove

      Van Grouw, H., Hernández-Alonso, G., Cavill, Emily Louisa & Gilbert, M Thomas P, 2023, I: Bulletin of the British Ornithologists' Club. 143, 2, s. 153-171 19 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    50. Udgivet

      Genomic and proteomic evidence for Mycobacterium leprae in human medieval dental calculus from Trondheim, Norway

      Vagene, A. J., Fotaki, Anna Katerina, Denham, S. D., Orbegozo, M., Mackie, Meaghan, Olsen, Jesper Velgaard, Cappellini, Enrico, Christophersen, A. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: American Journal of Physical Anthropology. 171, s. 291 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

    51. Udgivet

      Hybridization capture using short PCR products enriches small genomes by Capturing Flanking Sequences (CapFlank)

      Tsangaras, K., Wales, N., Sicheritz-Pontén, T., Rasmussen, Simon, Michaux, J., Ishida, Y., Morand, S., Kampmann, Marie-Louise, Gilbert, M Thomas P & Greenwood, A. D., 2014, I: PLoS ONE. 9, 10, 10 s., e109101.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    52. Udgivet

      Novel strategies to improve chicken performance and welfare by unveiling host-microbiota interactions through hologenomics

      Tous, N., Marcos, S., Goodarzi Boroojeni, F., Pérez de Rozas, A., Zentek, J., Estonba, A., Sandvang, D., Gilbert, M Thomas P, Esteve-Garcia, E., Finn, R., Alberdi, Antton & Tarradas, J., 2022, I: Frontiers in Physiology. 13, 14 s., 884925.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    53. Udgivet

      Non-destructive sampling of ancient insect DNA

      Thomsen, P. F., Elias, S., Gilbert, M Thomas P, Haile, James Seymour, Munch, K., Kuzmina, S., Froese, D. G., Sher, A., Holdaway, R. N. & Willerslev, Eske, 2009, I: PLoS ONE. 4, 4, s. e5048

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    54. Udgivet

      Monitoring endangered freshwater biodiversity using environmental DNA

      Thomsen, P. F., Kielgast, J., Iversen, Lars Lønsmann, Wiuf, C. H., Rasmussen, M., Gilbert, M Thomas P, Orlando, L. A. A. & Willerslev, Eske, 2012, I: Molecular Ecology. 21, 11, s. 2565-2573 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    55. Udgivet

      An ‛aukward’ tale: a genetic approach to discover the whereabouts of the last Great Auks

      Thomas, J. E., Carvalho, G. R., Haile, James Seymour, Martin, M. D., Samaniego Castruita, J. A., Niemann, Jonas, Sinding, Mikkel Holger Strander, Sandoval-Velasco, Marcela, Rawlence, N. J., Fuller, E., Fjeldså, Jon, Hofreiter, M., Stewart, J. R., Gilbert, M Thomas P & Knapp, M., 15 jun. 2017, I: Genes. 8, 6, 12 s., 164.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    56. Udgivet

      Demographic reconstruction from ancient DNA supports rapid extinction of the great auk

      Thomas, J. E., Carvalho, G. R., Haile, J., Rawlence, N. J., Martin, M. D., Ho, S. Y. W., Sigfusson, A. P., Josefsson, V. A., Frederiksen, M., Linnebjerg, J. F., Castruita, J. A. S., Niemann, J., Sinding, M-H. S., Sandoval-Velasco, M., Soares, A. E. R., Lacy, R., Barilaro, C., Best, J., Brandis, D., Cavallo, C. & 17 flere, Elorza, M., Garrett, K. L., Groot, M., Johansson, F., Lifjeld, J. T., Nilson, G., Serjeanston, D., Sweet, P., Fuller, E., Hufthammer, A. K., Meldgaard, Morten, Fjeldså, Jon, Shapiro, B., Hofreiter, M., Stewart, J. R., Gilbert, M Thomas P & Knapp, M., 2019, I: eLife. 8, 35 s., e47509.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    57. Udgivet

      Bat biology, genomes, and the Bat1K project: to generate chromosome-level genomes for all living bat species

      Teeling, E. C., Vernes, S. C., Dávalos, L. M., Ray, D. A., Gilbert, M Thomas P & Myers, E., 2018, I: Annual Review of Animal Biosciences. 6, s. 23-46 24 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    58. Udgivet

      Molecular clocks indicate turnover and diversification of modern coleoid cephalopods during the Mesozoic Marine Revolution

      Tanner, A. R., Fuchs, D., Winkelmann, I. E. H., Gilbert, M Thomas P, Pankey, M. S., Oliveira Ribeiro, Â. M., Kocot, K. M., Halanych, K. M., Oakley, T. H., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Pisani, D. & Vinther, J., 15 mar. 2017, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 284, 1850, 7 s., 20162818.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    59. Udgivet

      Genome sequence of Campylobacter jejuni strain 327, a strain isolated from a turkey slaughterhouse

      Takamiya, M., Özen, A. I., Rasmussen, M., Alter, T., Gilbert, M Thomas P, Ussery, D. & Knoechel, Susanne, 2011, I: Standards in Genomic Sciences. 4, 2, s. 113-122 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    60. Udgivet

      Genome sequences of two stress-tolerant Campylobacter jejuni poultry strains, 305 and DFVF1099

      Takamiya, M., Özen, A. I., Rasmussen, M., Alter, T., Gilbert, M Thomas P, Ussery, D. & Knoechel, Susanne, 2011, I: Journal of Bacteriology. 193, 19, s. 5546-5547 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    61. Udgivet

      Genomic affinities of two 7,000-year-old Iberian hunter-gatherers

      Sánchez-Quinto, F., Schroeder, Hannes, Ramirez, O., Avila Arcos, M. D. C., Pybus, M., Olalde, I., Velazquez, A. M. V., Marcos, M., Encinas, J., Bertranpetit, J., Orlando, L. A. A., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2012, I: Current Biology. 22, 16, s. 1494-1499 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    62. Udgivet

      Historic Sampling of a Vanishing Beast: Population Structure and Diversity in the Black Rhinoceros

      Sánchez-Barreiro, F., Westbury, Binia De Cahsan, Westbury, Michael Vincent, Sun, Xin, Margaryan, Ashot, Fontsere, Claudia, Bruford, M. W., Russo, I. M., Kalthoff, D. C., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Dalén, L., KU, thw266, Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Moodley, Y., 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 9, 19 s., msad180.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    63. Udgivet

      Historical population declines prompted significant genomic erosion in the northern and southern white rhinoceros (Ceratotherium simum)

      Sánchez-Barreiro, F., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Westbury, Michael Vincent, de Manuel, M., Margaryan, Ashot, Ciucani, M. M., Vieira, Filipe Garrett, Patramanis, Ioannis, Kalthoff, D. C., Timmons, Z., Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Ryder, O. A., KU, thw266, Marques-Bonet, T., Moodley, Y. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6355-6369 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    64. Udgivet

      Genomic evidence refutes the hypothesis that the Bornean banteng is a distinct species

      Sun, Xin, Ciucani, M. M., Rasmussen, Jacob Agerbo, Gilbert, M Thomas P & Sinding, Mikkel Holger Strander, 2022, I: BMC Ecology and Evolution. 22, 4 s., 110.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    65. Udgivet

      Ancient DNA reveals genetic admixture in China during tiger evolution

      Sun, X., Liu, Y. C., Tiunov, M. P., Gimranov, D. O., Zhuang, Y., Han, Y., Driscoll, C. A., Pang, Y., Li, C., Pan, Y., Velasco, M. S., Gopalakrishnan, S., Yang, R. Z., Li, B. G., Jin, K., Xu, X., Uphyrkina, O., Huang, Y., Wu, X. H., Gilbert, M. T. P. & 3 flere, O’Brien, S. J., Yamaguchi, N. & Luo, S., 2023, I: Nature Ecology and Evolution. 7, 11, s. 1914-1929 29 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    66. Udgivet

      Transcriptomes of the desiccation-tolerant resurrection plant Craterostigma plantagineum

      Suarez Rodriguez, M. C., Edsgärd, D., Hussain, S. S., Alquezar Planas, D. E., Rasmussen, M., Gilbert, M Thomas P, Nielsen, B. H., Bartels, D. & Mundy, J., jul. 2010, I: The Plant Journal. 63, 2, s. 212-228 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    67. Udgivet

      Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes

      Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, A-A., Rivas-González, I., Duchêne, D. A., Fang, Q., Deng, Y., Kozlov, A., Stamatakis, A., Claramunt, S., Nguyen, J. M. T., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Haag, J., Houde, P., Cracraft, J., Balaban, M., Mai, U., Chen, G., Gao, R. & 32 flere, Zhou, C., Xie, Y., Huang, Z., Cao, Z., Yan, Z., Ogilvie, H. A., Nakhleh, L., Lindow, Bent Erik Kramer, Morel, B., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, da Fonseca, R. R., Petersen, Bent, Tobias, J. A., Székely, T., Kennedy, J. D., Reeve, A. H., Liker, A., Stervander, M., Antunes, A., Tietze, D. T., Bertelsen, Mads, Lei, F., Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Schierup, M. H., Warnow, T., Braun, E. L., Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., Mirarab, S. & KU, thw266, 1 apr. 2024, I: Nature.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    68. Udgivet

      Hvad er hologenomik?

      Spile, M. B., Gilbert, M Thomas P & Noer, Christina, 2023, I: Kaskelot. 245, s. 12-18

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

    69. Udgivet

      Greenland sled dogs at risk of extinction

      Sonne, C., Langebæk, Rikke, Dietz, R., Andersen-Ranberg, E., Houser, G., Hansen, Anders Johannes, Sinding, Mikkel Holger Strander, Olsen, Morten Tange, Egevang, C., Gilbert, M Thomas P & Meldgaard, Morten, 2018, I: Science. 360, 6393, s. 1080-1080

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    70. Udgivet

      Penile density and globally used chemicals in Canadian and Greenland polar bears

      Sonne, C., Dyck, M., Rigét, F. F., Jensen, J. B., Hyldstrup, L., Letcher, R. J., Gustavson, K., Gilbert, M Thomas P & Dietz, R., 2015, I: Environmental Research. 137, s. 287-291 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    71. Udgivet

      Complete mitochondrial genomes of living and extinct pigeons revise the timing of the columbiform radiation

      Soares, A. E. R., Novak, B. J., Haile, James Seymour, Heupink, T. H., Fjeldså, Jon, Gilbert, M Thomas P, Poinar, H., Church, G. M. & Shapiro, B., 2016, I: BMC Evolutionary Biology. 16, 9 s., 230.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    72. Udgivet

      Ancient RNA from Late Pleistocene permafrost and historical canids shows tissue-specific transcriptome survival

      Smith, O., Dunshea, G., Sinding, M. S., Fedorov, S., Germonpre, M., Bocherens, H. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: PLOS Biology. 17, 7, s. 1-28 e3000166.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    73. Udgivet

      Genomic population structure of freshwater-resident and anadromous ide (Leuciscus idus) in north-western Europe

      Skovrind, Mikkel, Olsen, Morten Tange, Vieira, Filipe Garrett, Antunes Pacheco, George, Carl, Henrik, Gilbert, M Thomas P & Møller, Peter Rask, 2016, I: Ecology and Evolution. 6, 4, s. 1064-1074 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    74. Udgivet

      Uncovering neutral and adaptive genomic differentiation among European perch with brackish water and freshwater origin in the western Baltic Sea region

      Skovrind, Mikkel, Antunes Pacheco, George, Christensen, E. A. F., Gopalakrishnan, Shyam, Fietz, K., Holm-Hansen, T. H., Vieira, Filipe Garrett, Krag, M. A., Carl, Henrik, Gilbert, M Thomas P, Olsen, Morten Tange & Møller, Peter Rask, 2023, I: Fisheries Research. 268, 11 s., 106846.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    75. Udgivet

      Origins and genetic legacy of Neolithic farmers and hunter-gatherers in Europe

      Skoglund, P., Malmström, H., Raghavan, M., Storå, J., Hall, P., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P, Götherström, A. & Jakobsson, M., 2012, I: Science. 336, 6080, s. 466-469 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    76. Udgivet

      Multi-omics and potential applications in wine production

      Sirén, K., Mak, Sarah Siu Tze, Fischer, U., Hansen, Lars Hestbjerg & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Current Opinion in Biotechnology. 56, s. 172-178

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    77. Udgivet

      Taxonomic and Functional Characterization of the Microbial Community During Spontaneous in vitro Fermentation of Riesling Must

      Sirén, K., Mak, Sarah Siu Tze, Melkonian, C., Carøe, C., Swiegers, J. H., Molenaar, D., Fischer, U. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 17 s., 697.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    78. Udgivet

      Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning

      Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    79. Udgivet

      Population genomics of grey wolves and wolf-like canids in North America

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishan, S., Vieira, Filipe Garrett, Samaniego Castruita, J. A., Raundrup, K., Heide-Jørgensen, M. P., Meldgaard, Morten, Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Mikkelsen, J. B., Marquard-Petersen, U., Dietz, R., Sonne, C., Dalén, L., Bachmann, L., Wiig, Ø., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: PLOS Genetics. 14, 11, 23 s., e1007745.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    80. Udgivet

      Kouprey (Bos sauveli) genomes unveil polytomic origin of wild Asian Bos

      Sinding, M. S., Ciucani, M. M., Ramos Madrigal, Jazmin, Carmagnini, A., Rasmussen, Jacob Agerbo, Feng, S., Chen, G., Vieira, Filipe Garrett, Mattiangeli, V., Ganjoo, R. K., Larson, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Frantz, L., Gilbert, M Thomas P & Bradley, D. G., 2021, I: iScience. 24, 11, 18 s., 103226.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    81. Udgivet

      Ancient DNA unravels the truth behind the controversial GUS Greenlandic Norse fur samples: the bison was a horse, and the muskox and bears were goats

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Arneborg, J., Nyegaard, G. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Journal of Archaeological Science. 53, s. 297-303 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    82. Udgivet

      Minimally destructive DNA extraction from archaeological artefacts made from whale baleen

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Gilbert, M Thomas P, Grønnow, B., Gulløv, H. C., Toft, P. A. & Foote, A. D., 1 dec. 2012, I: Journal of Archaeological Science. 39, 12, s. 3750-3753 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    83. Udgivet

      Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition

      Sinding, M. H. S., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, F. G., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Andersen-Ranberg, E. U., Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, E., Skoglund, P. & 15 flere, Fredholm, Merete, Wennerberg, S. E., Heide-Jørgensen, M. P., Dietz, R., Sonne, C., Meldgaard, Morten, Dalén, L., Larson, G., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Bachmann, L., Wiig, Ø., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    84. Udgivet

      The genome sequence of the grey wolf, Canis lupus Linnaeus 1758

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishnan, Shyam, Raundrup, K., Dalén, L., Threlfall, J., Gilbert, M Thomas P, Darwin Tree of Life Barcoding collective, D. T. O. L. B. C., Wellcome Sanger Institute Tree of Life programme, W. S. I. T. O. L. P., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: DNA Pipelines collective, W. S. I. S. O. D. P. C. & Tree of Life Core Informatics collective, Darwin Tree of Life Consortium, T. O. L. C. I. C. D. T. O. L. C., 2021, I: Wellcome Open Research. 6, 12 s., 310.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    85. Udgivet

      Genomic diversity and evolution of the head crest in the rock pigeon

      Shapiro, M. D., Kronenberg, Z., Li, C., Domyan, E. T., Pan, H., Campbell, M., Tan, H., Huff, C. D., Hu, H., Vickrey, A. I., Nielsen, S. C. A., Stringham, S. A., Hu, H., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P, Yandell, M., Zhang, G. & Wang, J., 1 mar. 2013, I: Science. 339, 6123, s. 1063-1067 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    86. Udgivet

      No proof that typhoid caused the Plague of Athens (a reply to Papagrigorakis et al.)

      Shapiro, B., Rambaut, A. & Gilbert, M Thomas P, 2006, I: International Journal of Infectious Diseases. 10, 4, s. 334-335

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    87. Udgivet

      Rise and fall of the Beringian steppe bison

      Shapiro, B., Drummond, A. J., Rambaut, A., Wilson, M. C., Matheus, P. E., Sher, A. V., Pybus, O. G., Gilbert, M. T. P., Barnes, I., Binladen, J., Willerslev, E., Hansen, A. J., Baryshnikov, G. F., Burns, J. A., Davydov, S., Driver, J. C., Froese, D. G., Harington, C. R., Keddie, G., Kosintsev, P. & 7 flere, Kunz, M. L., Martin, L. D., Stephenson, R. O., Storer, J., Tedford, R., Zimov, S. & Cooper, A., 2004, I: Science. 306, 5701, s. 1561-5

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    88. Udgivet

      Functional roles of Aves class-specific cis-regulatory elements on macroevolution of bird-specific features

      Seki, R., Li, C., Fang, Q., Hayashi, S., Egawa, S., Hu, J., Xu, L., Pan, H., Kondo, M., Sato, T., Matsubara, H., Kamiyama, N., Kitajima, K., Saito, D., Liu, Y., Gilbert, T., Zhou, Q., Xu, X-Z., Shiroishi, T., Irie, N. & 2 flere, Tamura, K. & KU, thw266, 6 feb. 2017, I: Nature Communications. 8, 14 s., 14229.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    89. Udgivet

      Prehistoric genomes reveal the genetic foundation and cost of horse domestication

      Schubert, M., Jónsson, H., Chang, D., Der Sarkissian, C., Ermini, L., Ginolhac, A., Albrechtsen, A., Dupanloup, I., Foucal, A., Petersen, B., Fumagalli, M., Raghavan, M., Seguin-Orlando, A., Korneliussen, T. S., Velazquez, A. M. V., Stenderup, J., Hoover, C. A., Rubin, C-J., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A. & 15 flere, Al-Rasheid, K. A. S., MacHugh, D. E., Kalbfleisch, T., MacLeod, J. N., Rubin, E. M., Sicheritz-Ponten, T., Andersson, L., Hofreiter, M., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P, Nielsen, R., Excoffier, L., Willerslev, Eske, Shapiro, B. & Orlando, L. A. A., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 52, s. E5661–E5669 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    90. Udgivet

      Genome-wide ancestry of 17th-century enslaved Africans from the Caribbean

      Schroeder, Hannes, Avila Arcos, M. D. C., Malaspinas, A. S., Poznik, G. D., Sandoval-Velasco, Marcela, Carpenter, M. L., Moreno Mayar, J. Víctor, Sikora, Martin, Johnson, P. L. F., Allentoft, Morten Erik, Samaniego Castruita, J. A., Haviser, J. B., Dee, M. W., Stafford, T. W., Salas, A., Orlando, L. A. A., Willerslev, Eske, Bustamente, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 112, 12, s. 3669–3673 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    91. Udgivet

      Debugging diversity – a pan-continental exploration of the potential of terrestrial blood-feeding leeches as a vertebrate monitoring tool

      Schnell, I. B., Bohmann, K., Schultze, S. E., Richter, S. R., Murray, D. C., Sinding, M. H. S., Bass, D., Cadle, J. E., Campbell, M. J., Dolch, R., Edwards, D. P., Gray, T. N. E., Hansen, T., Hoa, A. N. Q., Noer, C. L., Heise-Pavlov, S., Sander Pedersen, A. F., Ramamonjisoa, J. C., Siddall, M. E., Tilker, A. & 7 flere, Traeholt, C., Wilkinson, N., Woodcock, P., Yu, D. W., Bertelsen, Mads Frost, Bunce, M. & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Molecular Ecology Resources. 18, 6, s. 1282-1298 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    92. Udgivet

      Characterisation of insect and plant origins using DNA extracted from small volumes of bee honey

      Schnell, I. B., Fraser, M., Willerslev, Eske & Gilbert, M Thomas P, 2010, I: Arthropod - Plant Interactions. 4, 2, s. 107-116 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    93. Udgivet

      Screening mammal biodiversity using DNA from leeches

      Schnell, I. B., Thomsen, P. F., Wilkinson, N., Rasmussen, M., Jensen, L. R. D., Willerslev, Eske, Bertelsen, Mads Frost & Gilbert, M Thomas P, 2012, I: Current Biology. 22, 8, s. R262-R263 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    94. Udgivet

      iDNA from terrestrial haematophagous leeches as a wildlife surveying and monitoring tool - prospects, pitfalls and avenues to be developed

      Schnell, I. B., Sollmann, R., Calvignac-Spencer, S., Siddall, M. E., Yu, D. W., Wilting, A. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Frontiers in Zoology. 12, 14 s., 24.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    95. Udgivet

      Tag jumps illuminated - reducing sequence-to-sample misidentifications in metabarcoding studies

      Schnell, I. B., Bohmann, Kristine & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Molecular Ecology Resources. 15, 6, s. 1289-1303 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    96. Udgivet

      Identification of animal species in skin clothing from museum collections

      Schmidt, A. L., Gilbert, M Thomas P, Cappellini, Enrico & Olsen, Jesper Velgaard, 2011. 8 s.

      Publikation: KonferencebidragPaperForskningfagfællebedømt

    97. Udgivet

      Skmer: assembly-free and alignment-free sample identification using genome skims

      Sarmashghi, S., Bohmann, Kristine, Gilbert, M Thomas P, Bafna, V. & Mirarab, S., 2019, I: Genome Biology. 20, 20 s., 34.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    98. Udgivet

      Assembly-free and alignment-free sample identification using genome skims

      Sarmashghi, S., Bohmann, Kristine, Gilbert, M Thomas P, Bafna, V. & Mirarab, S., 1 jan. 2018, I: Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics). 10812, s. 276-277 2 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

    99. Udgivet

      The genetic origins of Saint Helena’s liberated Africans

      Sandoval-Velasco, Marcela, Jagadeesan, A., Ávila-Arcos, M. C., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Moreno Mayar, J. Víctor, Renaud, Gabriel, Cruz-Dávalos, D. I., Johannesdóttir, E., Watson, J., Robson-Brown, K., Pearson, A., Helgason, A., Gilbert, M Thomas P & Schroeder, Hannes, 2019, bioRxiv, 16 s.

      Publikation: Working paperPreprintForskning

    100. Udgivet

      Hi-C chromosome conformation capture sequencing of avian genomes using the BGISEQ-500 platform

      Sandoval-Velasco, Marcela, Rodríguez, Juan Antonio, Estrada, C. P., Zhang, G., Aiden, E. L., Marti-Renom, M. A., Gilbert, M Thomas P & Smith, O., 2020, I: GigaScience. 9, 8, 7 s., giaa087.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    Forrige 1 2 3 4 5 Næste

    ID: 12980