thw266 KU
Professor, Adjungeret professor
- Udgivet
31º South: The physiology of adaptation to arid conditions in a passerine bird
Ribeiro, Â. M., Puetz, Lara Christine, Pattinson, N. B., Dalén, L., Deng, Y., KU, thw266, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smit, B. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Molecular Ecology. 28, 16, s. 3709-3721 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
863 genomes reveal the origin and domestication of chicken
Wang, M. S., Thakur, M., Peng, M-S., Jiang, Y., Frantz, L. A. F., Li, M., Zhang, J-J., Wang, S., Peters, J., Otecko, N. O., Suwannapoom, C., Guo, X., Zheng, Z-Q., Esmailizadeh, A., Hirimuthugoda, N. Y., Ashari, H., Suladari, S., Zein, M. S. A., Kusza, S., Sohrabi, S. & 37 flere, , 2020, I: Cell Research. 30, 8, s. 693-701 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Callithrix jacchus (the common marmoset)
Yang, Chentao & KU, thw266, 2021, I: Trends in Genetics. 37, 10, s. 948-949 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
A Young Drosophila Duplicate Gene Plays Essential Roles in Spermatogenesis by Regulating Several Y-Linked Male Fertility Genes
Ding, Y., Zhao, L., Yang, S., Jiang, Y., Chen, Y., Zhao, R., Zhang, Y., KU, thw266, Dong, Y., Yu, H., Zhou, Q. & Wang, W., 2010, I: PLOS Genetics. 6, 12, 12 s., e1001255.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A complete, telomere-to-telomere human genome sequence presents new opportunities for evolutionary genomics
Mao, Y. & KU, thw266, 2022, I: Nature Methods. 19, 6, s. 635-638 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A draft genome assembly of spotted hyena, Crocuta crocuta
Yang, C., Li, F., Xiong, Z., Koepfli, K., Ryder, O., Perelman, P., Li, Q. & KU, thw266, 2020, I: Scientific Data. 7, 10 s., 126.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux
da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, , 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A flock of Genomes
KU, thw266, Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1308-1309 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A genomic comparison of two termites with different social complexity
Korb, J., Poulsen, Michael, Hu, H., Li, C., Boomsma, Jacobus J., KU, thw266 & Liebig, J., 2015, I: Frontiers in Genetics. 6, 12 s., 9.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A global catalog of whole-genome diversity from 233 primate species
Kuderna, L. F. K., Gao, H., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., Rousselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S. & 55 flere, , 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, s. 906-913 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A haplotype-resolved genome assembly of the Nile rat facilitates exploration of the genetic basis of diabetes
Toh, H., Yang, C., Formenti, G., Raja, K., Yan, L., Tracey, A., Chow, W., Howe, K., Bergeron, L. A., Zhang, G., Haase, B., Mountcastle, J., Fedrigo, O., Fogg, J., Kirilenko, B., Munegowda, C., Hiller, M., Jain, A., Kihara, D., Rhie, A. & 9 flere, , 2022, I: BMC Biology. 20, 21 s., 245.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A near-chromosome-scale genome assembly of the gemsbok (Oryx gazella): an iconic antelope of the Kalahari Desert
Farré, M., Li, Q., Zhou, Y., Damas, J., Chemnick, L. G., Kim, J., Ryder, O. A., Ma, J., KU, thw266, Larkin, D. M. & Lewin, H. A., 2019, I: GigaScience. 8, 2, s. 1-8 giy162.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A new duck genome reveals conserved and convergently evolved chromosome architectures of birds and mammals
Li, J., Zhang, J., Liu, J., Zhou, Y., Cai, C., Xu, L., Dai, X., Feng, S., Guo, C., Rao, J., Wei, K., Jarvis, E. D., Jiang, Y., Zhou, Z., KU, thw266 & Zhou, Q., 2021, I: GigaScience. 10, 1, 15 s., giaa142.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A new emu genome illuminates the evolution of genome configuration and nuclear architecture of avian chromosomes
Liu, J., Wang, Z., Li, J., Xu, L., Liu, J., Feng, S., Guo, C., Chen, S., Ren, Z., Rao, J., Wei, K., Chen, Y., Jarvis, E. D., KU, thw266 & Zhou, Q., 2021, I: Genome Research. 31, 3, s. 497-511 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A novel method for using RNA-seq data to identify imprinted genes in social Hymenoptera with multiply mated queens
Howe, Jack, Schiøtt, M., Li, Q., Wang, Z., KU, thw266 & Boomsma, Jacobus J., 2020, I: Journal of Evolutionary Biology. 33, 12, s. 1770-1782 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A region of suppressed recombination misleads neoavian phylogenomics
Mirarab, S., Rivas-González, I., Feng, S., Stiller, Josefin, Fang, Q., Mai, U., Hickey, G., Chen, G., Brajuka, N., Fedrigo, O., Formenti, G., Wolf, J. B. W., Howe, K., Antunes, A., Schierup, M. H., Paten, B., Jarvis, E. D., KU, thw266 & Braun, E. L., 1 apr. 2024, I: Proceedings of the National Academy of Sciences. 121, 15, 10 s., e2319506121.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A single-cell transcriptomic atlas tracking the neural basis of division of labour in an ant superorganism
Li, Q., Wang, M., Zhang, P., Liu, Y., Guo, Q., Zhu, Y., Wen, T., Dai, X., Zhang, X., Nagel, M., Dethlefsen, B. H., Xie, N., Zhao, J., Jiang, W., Han, L., Wu, L., Zhong, W., Wang, Z., Wei, X., Dai, W. & 9 flere, , 2022, I: Nature Ecology & Evolution. 6, 8, s. 1191-1204Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A soft selective sweep during rapid evolution of gentle behaviour in an Africanized honeybee
Avalos, A., Pan, H., Li, C., Acevedo-Gonzalez, J. P., Rendon, G., Fields, C. J., Brown, P. J., Giray, T., Robinson, G. E., Hudson, M. E. & KU, thw266, 16 nov. 2017, I: Nature Communications. 8, 9 s., 1550.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptation and Cryptic Pseudogenization in Penguin Toll-Like Receptors
Fiddaman, S. R., Vinkler, M., Spiro, S. G., Levy, H., Emerling, C. A., Boyd, A. C., Dimopoulos, E. A., Vianna, J. A., Cole, T. L., Pan, H., Fang, M., KU, thw266, Hart, T., Frantz, L. A. F. & Smith, A. L., 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 1, 17 s., msab354.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptations to a subterranean environment and longevity revealed by the analysis of mole rat genomes
Fang, X., Seim, I., Huang, Z., Gerashchenko, M. V., Xiong, Z., Turanov, A. A., Zhu, Y., Lobanov, A. V., Fan, D., Yim, S. H., Yao, X., Ma, S., Yang, L., Lee, S-G., Kim, E. B., Bronson, R. T., Sumbera, R., Buffenstein, R., Zhou, X., Krogh, A. & 4 flere, , 2014, I: Cell Reports. 8, 5, s. 1354-1364 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Adaptive diversity of innate immune receptor family short pentraxins in Murinae
Li, Y., Robins, J. H., Ye, J., Huang, Z., Wen, Q. & KU, thw266, 2012, I: F E B S Letters. 586, 6, s. 798-803 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Advances in genome editing technology and its promising application in evolutionary and ecological studies
Chen, L., Tang, L., Xiang, H., Jin, L., Li, Q., Dong, Y., Wang, W. & KU, thw266, 2014, I: GigaScience. 3, 24, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
African lungfish genome sheds light on the vertebrate water-to-land transition
Wang, K., Wang, J., Zhu, C., Yang, L., Ren, Y., Ruan, J., Fan, G., Hu, J., Xu, W., Bi, X., Zhu, Y., Song, Y., Chen, H., Ma, T., Zhao, R., Jiang, H., Zhang, B., Feng, C., Yuan, Y., Gan, X. & 16 flere, , 2021, I: Cell. 184, 5, s. 1362-1376.e18 33 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An Indo-Pacific Humpback Dolphin Genome Reveals Insights into Chromosome Evolution and the Demography of a Vulnerable Species
Zhang, P., Zhao, Y., Li, C., Lin, M., Dong, L., Zhang, R., Liu, M., Li, K., Zhang, H., Liu, X., Zhang, Y., Yuan, Y., Liu, H., Seim, I., Sun, S., Du, X., Chang, Y., Li, F., Liu, S., Lee, S. M. Y. & 13 flere, , 2020, I: iScience. 23, 10, 52 s., 101640.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancestral developmental potentials in early bony fish contributed to vertebrate water-to-land transition
Bi, X. & KU, thw266, 2021, I: Zoological research. 42, 2, s. 135-137 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient and Modern Genomes Reveal Microsatellites Maintain a Dynamic Equilibrium Through Deep Time
McComish, B. J., Charleston, M. A., Parks, M., Baroni, C., Salvatore, M. C., Li, R., KU, thw266, Millar, C. D., Holland, B. R. & Lambert, D. M., 2024, I: Genome Biology and Evolution. 16, 3, 11 s., evae017.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient and modern genomes unravel the evolutionary history of the rhinoceros family
Liu, S., Westbury, M. V., Dussex, N., Mitchell, K. J., Sinding, M. H. S., Heintzman, P. D., Duchêne, D. A., Kapp, J. D., von Seth, J., Heiniger, H., Sánchez-Barreiro, F., Margaryan, A., André-Olsen, R., De Cahsan, B., Meng, G., Yang, C., Chen, L., van der Valk, T., Moodley, Y., Rookmaaker, K. & 19 flere, , 2021, I: Cell. 184, 19, s. 4874-4885.e16Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient population genomics and the study of evolution
Parks, M., Subramanian, S., Baroni, C., Salvatore, M. C., KU, thw266, Millar, C. D. & Lambert, D. M., 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient proteins resolve controversy over the identity of Genyornis eggshell
Demarchi, B., Stiller, Josefin, Grealy, A., Mackie, Meaghan, Deng, Y., Gilbert, M Thomas P, Clarke, J., Legendre, L. J., Boano, R., Sicheritz-Pontén, Thomas, Magee, J., KU, thw266, Bunce, M., Collins, Matthew James & Miller, G., 2022, I: PNAS. 119, 43, 9 s., e2109326119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Avian Binocularity and Adaptation to Nocturnal Environments: Genomic Insights from a Highly Derived Visual Phenotype
Borges, R., Fonseca, J., Gomes, C., Johnson, W. E., O'Brien, S. J., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D. & Antunes, A., 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 8, s. 2244-2255Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Avianbase: a community resource for bird genomics
Eöry, L., Gilbert, M Thomas P, Li, C., Li, B., Archibald, A., Aken, B. L., KU, thw266, Jarvis, E., Flicek, P. & Burt, D. W., 2015, I: Genome Biology (Online Edition). 16, 4 s., 21.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bird sequencing project takes off
KU, thw266, Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature. 522, 7554, s. 34 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bone-associated gene evolution and the origin of flight in birds
Machado, J. P., Johnson, W. E., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J. & Antunes, A., 2016, I: BMC Genomics. 17, 15 s., 371.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Canalized gene expression during development mediates caste differentiation in ants
Qiu, Bitao, Dai, X., Li, P., Larsen, Rasmus Stenbak, Li, Ruyan, Price, A. L., Ding, G., Texada, Michael James, Zhang, X., Zuo, D., Gao, Q., Jiang, W., Wen, T., Pontieri, L., Guo, C., Rewitz, Kim, Li, Q., Liu, W., Boomsma, Jacobus J. & KU, thw266, 2022, I: Nature Ecology and Evolution. 6, 11, s. 1753-1765Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Caste-specific RNA editomes in the leaf-cutting ant Acromyrmex echinatior
Li, Q., Wang, Z., Lian, J., Schiøtt, M., Jin, L., Zhang, P., Zhang, Y., Nygaard, S., Peng, Z., Zhou, Y., Deng, Y., Zhang, W., Boomsma, Jacobus J. & KU, thw266, 2014, I: Nature Communications. 5, 11 s., 4943.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Chromatin accessibility and transcriptome landscapes of Monomorium pharaonis brain
Wang, M., Liu, Y., Wen, T., Liu, W., Gao, Q., Zhao, J., Xiong, Z., Wang, Z., Jiang, W., Yu, Y., Wu, L., Yuan, Y., Wei, X., Xu, J., Cheng, M., Zhang, P., Li, P., Hou, Y., Yang, H., Zhang, G. & 3 flere, , 2020, I: Scientific Data. 7, 10 s., 217.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Analysis of Bat Genomes Provides Insight into the Evolution of Flight and Immunity
Zhang, G., Cowled, C., Shi, Z., Huang, Z., Bishop-Lilly, K. A., Fang, X., Wynne, J. W., Xiong, Z., Baker, M. L., Zhao, W., Tachedjian, M., Zhu, Y., Zhou, P., Jiang, X., Ng, J., Yang, L., Wu, L., Xiao, J., Feng, Y., Chen, Y. & 8 flere, , 2013, I: Science (New York, N.Y.). 339, 6118Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Phylogenomics, a Stepping Stone for Bird Biodiversity Studies
Stiller, Josefin & KU, thw266, 2019, I: Diversity. 11, 7, 19 s., 115.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genomic data of the Avian Phylogenomics Project
KU, thw266, Li, B., Li, C., Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., Wang, J. & Avian Genome Consortium, A. G. C., 2014, I: GigaScience. 3, 8 s., 26.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Comparative genomics of parasitic silkworm microsporidia reveal an association between genome expansion and host adaptation
Pan, G., Xu, J., Li, T., Xia, Q., Liu, S-L., Zhang, G., Li, S., Li, C., Liu, H., Yang, L., Liu, T., Zhang, X., Wu, Z., Fan, W., Dang, X., Xiang, H., Tao, M., Li, Y., Hu, J., Li, Z. & 13 flere, , 2013, I: BMC Genomics. 14, 14 s., 186.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation
Zhang, G., Li, C., Li, Q., Li, B., Larkin, D. M., Lee, C., Storz, J. F., Antunes, A., Greenwold, M. J., Meredith, R. W., Ödeen, A., Cui, J., Zhou, Q., Xu, L., Pan, H., Wang, Z., Jin, L., Zhang, P., Hu, H., Yang, W. & 85 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1311-1320 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genomics reveals the hybrid origin of a macaque group
Zhang, B. L., Chen, W., Wang, Z., Pang, W., Luo, M. T., Wang, S., Shao, Y., He, W. Q., Deng, Y., Zhou, L., Chen, J., Yang, M. M., Wu, Y., Wang, L., Fernández-Bellon, H., Molloy, S., Meunier, H., Wanert, F., Kuderna, L., Marques-Bonet, T. & 10 flere, , 2023, I: Science Advances. 9, 22, 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Comparative methylomics between domesticated and wild silkworms implies possible epigenetic influences on silkworm domestication
Xiang, H., Li, X., Dai, F., Xu, X., Tan, A., Chen, L., KU, thw266, Ding, Y., Li, Q., Lian, J., Willden, A., Guo, Q., Xia, Q., Wang, J. & Wang, W., 2013, I: BMC Genomics. 14, 11 s., 646.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative performance of the BGISEQ-500 vs Illumina HiSeq2500 sequencing platforms for palaeogenomic sequencing
Mak, Sarah Siu Tze, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Geng, C., Liu, Shanlin, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Zhang, W., Fu, S., Vieira, Filipe Garrett, Germonpré, M., Bocherens, H., Fedorov, S., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Marques-Bonet, T., KU, thw266, Jiang, H. & Gilbert, M Thomas P, aug. 2017, I: GigaScience. 6, 8, s. 1–13 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative phylogeography study reveals introgression and incomplete lineage sorting during rapid diversification of Rhodiola
You, J., Lougheed, S. C., Zhao, Y., KU, thw266, Liu, W., Lu, F., Wang, Y., Zhang, W., Yang, J., Qiong, L. & Song, Z., 2022, I: Annals of Botany. 129, 2, s. 185-200 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative study on pattern recognition receptors in non-teleost ray-finned fishes and their evolutionary significance in primitive vertebrates
He, Y., Pan, H., KU, thw266 & He, S., 2019, I: Science China Life Sciences. 62, 4, s. 566-578Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complementary symbiont contributions to plant decomposition in a fungus-farming termite
Thomas-Poulsen, M., Hu, H., Li, C., Chen, Z., Xu, L., Otani, S., Nygaard, S., Nobre, T., Klaubauf, S., Schindler, P. M., Hauser, F., Pan, H., Yang, Z., Sonnenberg, A. S. M., de Beer, Z. W., Zhang, Y., Wingfield, M. J., Grimmelikhuijzen, C., de Vries, R. P., Korb, J. & 4 flere, , 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 40, 6 s., 14500-14505.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complex evolutionary trajectories of sex chromosomes across bird taxa
Zhou, Q., Zhang, J., Bachtrog, D., An, N., Huang, Q., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2014, I: Science. 346, 6215, 8 s., 1246338.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes
Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, A-A., Rivas-González, I., Duchêne, D. A., Fang, Q., Deng, Y., Kozlov, A., Stamatakis, A., Claramunt, S., Nguyen, J. M. T., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Haag, J., Houde, P., Cracraft, J., Balaban, M., Mai, U., Chen, G., Gao, R. & 32 flere, , 1 apr. 2024, I: Nature.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conservation genomics of the endangered Seychelles Magpie-Robin (Copsychus sechellarum): a unique insight into the history of a precious endemic bird
Cavill, Emily Louisa, Gopalakrishnan, Shyam, Puetz, Lara Christine, Ribeiro, Â. M., Mak, Sarah Siu Tze, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Antunes Pacheco, George, Dunlop, B., Accouche, W., Shah, N., Zora, A., Calabrese, L., Genner, M., Jones, G., Guo, C., KU, thw266 & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Ibis. 164, 2, s. 396-410 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Constrained vertebrate evolution by pleiotropic genes
Hu, H., Uesaka, M., Guo, S., Shimai, K., Lu, T., Li, F., Fujimoto, S., Ishikawa, M., Liu, S., Sasagawa, Y., KU, thw266, Kuratani, S., Yu, J., Kusakabe, T. G., Khaitovich, P. & Irie, N., nov. 2017, I: Nature Ecology and Evolution. 1, 11, s. 1722-1730 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Construction of Red Fox Chromosomal Fragments from the Short-Read Genome Assembly
Rando, H. M., Farre, M., Robson, M. P., Won, N. B., Johnson, J. L., Buch, R., Bastounes, E. R., Xiang, X., Feng, S., Liu, S., Xiong, Z., Kim, J., KU, thw266, Trut, L. N., Larkin, D. M. & Kukekova, A. V., 2018, I: Genes. 9, 6, 21 s., 308.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Convergent transcriptional specializations in the brains of humans and song-learning birds
Pfenning, A. R., Hara, E., Whitney, O., Rivas, M. V., Wang, R., Roulhac, P. L., Howard, J. T., Wirthlin, M., Lovell, P. V., Ganapathy, G., Mouncastle, J., Moseley, M. A., Thompson, J. W., Soderblom, E. J., Iriki, A., Kato, M., Gilbert, M. T. P., Zhang, G., Bakken, T., Bongaarts, A. & 5 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Cross-comparison of the genome sequences from human, chimpanzee, Neanderthal and a Denisovan hominin identifies novel potentially compensated mutations
KU, thw266, Pei, Z., Ball, E. V., Mort, M., Kehrer-Sawatzki, H. & Cooper, D. N., 2011, I: Human Genomics (Online). 5, 5, s. 453-484 32 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Deep parallel sequencing reveals conserved and novel miRNAs in gill and hepatopancreas of giant freshwater prawn
Tan, T. T., Chen, M., Harikrishna, J. A., Khairuddin, N., Shamsudin, M. I. M., KU, thw266 & Bhassu, S., 2013, I: Fish and Shellfish Immunology. 35, 4, s. 1061-1069 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics
Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, , 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detoxification Genes Differ Between Cactus-, Fruit-, and Flower-Feeding Drosophila
Rane, R. V., Clarke, D. F., Pearce, S. L., KU, thw266, Hoffmann, A. A. & Oakeshott, J. G., 2019, I: The Journal of Heredity. 110, 1, s. 80-91 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Developmental plasticity shapes social traits and selection in a facultatively eusocial bee
Kapheim, K. M., Jones, B. M., Pan, H., Li, C., Harpur, B. A., Kent, C. F., Zayed, A., Ioannidis, P., Waterhouse, R. M., Kingwell, C., Stolle, E., Avalos, A., KU, thw266, McMillan, W. O. & Wcislo, W. T., 2020, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 24, s. 13615-13625 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dissecting aneuploidy phenotypes by constructing Sc2.0 chromosome VII and SCRaMbLEing synthetic disomic yeast
Shen, Y., Gao, F., Wang, Y., Wang, Y., Zheng, J., Gong, J., Zhang, J., Luo, Z., Schindler, D., Deng, Y., Ding, W., Lin, T., Swidah, R., Zhao, H., Jiang, S., Zeng, C., Chen, S., Chen, T., Wang, Y., Luo, Y. & 11 flere, , 2023, I: Cell Genomics. 3, 11, 19 s., 100364.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diverse coral reef invertebrates exhibit patterns of phylosymbiosis
O'Brien, P. A., Tan, S., Yang, C., Frade, P. R., Andreakis, N., Smith, H. A., Miller, D. J., Webster, N. S., KU, thw266 & Bourne, D. G., 2020, I: ISME Journal. 14, 9, s. 2211-2222 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft Genome Assembly and Population Genetics of an Agricultural Pollinator, the Solitary Alkali Bee (Halictidae: Nomia melanderi)
Kapheim, K. M., Pan, H., Li, C., Blatti, C., Harpur, B. A., Ioannidis, P., Jones, B. M., Kent, C. F., Ruzzante, L., Sloofman, L., Stolle, E., Waterhouse, R. M., Zayed, A., KU, thw266 & Wcislo, W. T., 2019, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 9, 3, s. 625-634Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome assemblies of four manakins
Li, X., Gao, R., Chen, G., Price, A. L., Øksnebjerg, Daniel Bilyeli, Hosner, Peter Andrew, Zhou, Y., KU, thw266 & Feng, S., 2022, I: Scientific Data. 9, 11 s., 564.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome of the Marco Polo Sheep (Ovis ammon polii)
Yang, Y., Wang, Y., Zhao, Y., Zhang, X., Li, R., Chen, L., KU, thw266, Jiang, Y., Qiu, Q., Wang, W., Wei, H. & Wang, K., dec. 2017, I: GigaScience. 6, 12, 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome of the leopard gecko, Eublepharis macularius
Xiong, Z., Li, F., Li, Q., Zhou, L., Gamble, T., Zheng, J., Kui, L., Li, C., Li, S., Yang, H. & KU, thw266, 2016, I: GigaScience. 5, 6 s., 47.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome of the milu (Elaphurus davidianus)
Zhang, C., Chen, L., Zhou, Y., Wang, K., Chemnick, L. G., Ryder, O. A., Wang, W., KU, thw266 & Qiu, Q., 2017, I: GigaScience. 7, 2, s. 1-6 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic evolution of the alpha (α) and beta (β) keratins has accompanied integument diversification and the adaptation of birds into novel lifestyles
Greenwold, M. J., Bao, W., Jarvis, E. D., Hu, H., Li, C., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Sawyer, R. H., 2014, I: B M C Evolutionary Biology. 14, 16 s., 249.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic evolution of transposable elements, demographic history, and gene content of paleognathous birds
Wang, Z., Chen, G., KU, thw266 & Zhou, Q., 2021, I: Zoological Research. 42, 1, s. 51-61 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic evolutionary history and gene content of sex chromosomes across diverse songbirds
Xu, L., Auer, G., Peona, V., Suh, A., Deng, Y., Feng, S., KU, thw266, Blom, M. P. K., Christidis, L., Prost, S., Irestedt, M. & Zhou, Q., 2019, I: Nature Ecology and Evolution. 3, 5, s. 834-844 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
ETV2 induces endothelial, but not hematopoietic, lineage specification in birds
Weng, W., Deng, Y., Deviatiiarov, R., Hamidi, S., Kajikawa, E., Gusev, O., Kiyonari, H., KU, thw266 & Sheng, G., 2024, I: Life Science Alliance. 7, 6, 12 s., e202402694.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Earth BioGenome Project: sequencing life for the future of life
Lewin, H. A., Robinson, G. E., Kress, W. J., Baker, W. J., Coddington, J., Crandall, K. A., Durbin, R., Edwards, S. V., Forest, F., Gilbert, M. T. P., Goldstein, M. M., Grigoriev, I. V., Hackett, K. J., Haussler, D., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Patrinos, A., Richards, S., Castilla-Rubio, J. C., van Sluys, M-A. & 4 flere, , 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 17, s. 4325-4333 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Eighty million years of rapid evolution of the primate Y chromosome
Zhou, Y., Zhan, X., Jin, J., Zhou, L., Bergman, J., Li, X., Rousselle, M. M. C., Belles, M. R., Zhao, L., Fang, M., Chen, J., Fang, Q., Kuderna, L., Marques-Bonet, T., Kitayama, H., Hayakawa, T., Yao, Y. G., Yang, H., Cooper, D. N., Qi, X. & 3 flere, , 2023, I: Nature Ecology and Evolution. 7, 20 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Epigenetic modification and inheritance in sexual reversal of fish
Shao, C., Li, Q., Chen, S., Zhang, P., Lian, J., Hu, Q., Sun, B., Jin, L., Liu, S., Wang, Z., Zhao, H., Jin, Z., Liang, Z., Li, Y., Zheng, Q., Zhang, Y., Wang, J. & KU, thw266, 2014, I: Genome Research. 24, 4, s. 604-615 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evidence for a single loss of mineralized teeth in the common avian ancestor
Meredith, R. W., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D. & Springer, M. S., 2014, I: Science. 346, 6215, 6 s., 1254390.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolution of gene regulation in ruminants differs between evolutionary breakpoint regions and homologous synteny blocks
Farre, M., Kim, J., Proskuryakova, A. A., Zhang, Y., Kulemzina, A. I., Li, Q., Zhou, Y., Xiong, Y., Johnson, J. L., Perelman, P. L., Johnson, W. E., Warren, W. C., Kukekova, A. V., KU, thw266, O'Brien, S. J., Ryder, O. A., Graphodatsky, A. S., Ma, J., Lewin, H. A. & Larkin, D. M., 2019, I: Genome Research. 29, 4, s. 576-589Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolution of the germline mutation rate across vertebrates
Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Zheng, J., Li, P., Bertelsen, Mads Frost, Quintard, B., Hoffman, J. I., Li, Z., Leger, J. S., Shao, C., Stiller, Josefin, Gilbert, M Thomas P, Schierup, M. H. & KU, thw266, 2023, I: Nature. 615, s. 285-291Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet
Gelabert, P., Sandoval-Velasco, M., Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, A., Stiller, J., de-Dios, T., Fang, Q., Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, B., Olsen, R-A., Navarro, A., Deng, Y. & 6 flere, , 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary and biomedical insights from a marmoset diploid genome assembly
Yang, C., Zhou, Y., Marcus, S., Formenti, G., Bergeron, L. A., Song, Z., Bi, X., Bergman, J., Rousselle, M. M. C., Zhou, C., Zhou, L., Deng, Y., Fang, M., Xie, D., Zhu, Y., Tan, S., Mountcastle, J., Haase, B., Balacco, J., Wood, J. & 13 flere, , 2021, I: Nature. 594, s. 227-233Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary genomics and adaptive evolution of the hedgehog gene family (Shh, Ihh and Dhh) in vertebrates
Pereira, J., Johnson, W. E., O'Brien, S. J., Jarvis, E. D., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Vasconcelos, V. & Antunes, A., 2014, I: PloS one. 9, 12, 35 s., e74132.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary history of the extinct Sardinian dhole
Ciucani, M. M., Jensen, J. K., Sinding, M. S., Smith, O., Lucenti, S. B., Rosengren, E., Rook, L., Tuveri, C., Arca, M., Cappellini, Enrico, Galaverni, M., Randi, E., Guo, C., KU, thw266, Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Gilbert, M Thomas P & Gopalakrishnan, Shyam, 2021, I: Current Biology. 31, 24, s. 5571-5579.e6 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary trajectories of snake genes and genomes revealed by comparative analyses of five-pacer viper
Yin, W., Wang, Z., Li, Q., Lian, J., Zhou, Y., Lu, B., Jin, L., Qiu, P., Zhang, P., Zhu, W., Wen, B., Huang, Y., Lin, Z., Qiu, Bitao, Su, X., Yang, H., KU, thw266, Yan, G. & Zhou, Q., 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 13107.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
False gene and chromosome losses in genome assemblies caused by GC content variation and repeats
Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Yoo, D. A., Won, S., Phillippy, A. M., Fedrigo, O., KU, thw266, Howe, K., Wood, J., Durbin, R., Formenti, G., Brown, S., Cantin, L., Mello, C. V., Cho, S., Rhie, A., Kim, H. & Jarvis, E. D., 2022, I: Genome Biology. 23, 29 s., 204.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Functional Diversity and Evolution of Bitter Taste Receptors in Egg-Laying Mammals
Itoigawa, A., Hayakawa, T., Zhou, Y., Manning, A. D., KU, thw266, Grutzner, F. & Imai, H., 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 6, 9 s., msac107.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Functional genomics analysis reveals the evolutionary adaptation and demographic history of pygmy lorises
Li, M. L., Wang, S., Xu, P., Tian, H. Y., Bai, M., Zhang, Y. P., Shao, Y., Xiong, Z. J., Qi, X. G., Cooper, D. N., KU, thw266, Zhu, H. H. & Wu, D. D., 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 40, 10 s., e2123030119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Functional roles of Aves class-specific cis-regulatory elements on macroevolution of bird-specific features
Seki, R., Li, C., Fang, Q., Hayashi, S., Egawa, S., Hu, J., Xu, L., Pan, H., Kondo, M., Sato, T., Matsubara, H., Kamiyama, N., Kitajima, K., Saito, D., Liu, Y., Gilbert, T., Zhou, Q., Xu, X-Z., Shiroishi, T., Irie, N. & 2 flere, , 6 feb. 2017, I: Nature Communications. 8, 14 s., 14229.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gene loss, adaptive evolution and the co-evolution of plumage coloration genes with opsins in birds
Borges, R., Khan, I., Johnson, W. E., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J. & Antunes, A., 2015, I: B M C Genomics. 16, 13 s., 751 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic basis of ruminant headgear and rapid antler regeneration
Wang, Y., Zhang, C., Wang, N., Li, Z., Heller, R., Liu, R., Zhao, Y., Han, J., Pan, X., Zheng, Z., Dai, X., Chen, C., Dou, M., Peng, S., Chen, X., Liu, J., Li, M., Wang, K., Liu, C., Lin, Z. & 18 flere, , 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1153-+ eaav6335.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic load and adaptive potential of a recovered avian species that narrowly avoided extinction
Femerling Romero, Maria Georgette, Oosterhout, C. V., Feng, S., Bristol, R. M., KU, thw266, Groombridge, J., Gilbert, M Thomas P & Morales Villegas, Hernan Eduardo, 2022, bioRxiv, 23 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Genome and single-cell RNA-sequencing of the earthworm Eisenia andrei identifies cellular mechanisms underlying regeneration
Shao, Y., Wang, X., Zhang, J., Li, M. L., Wu, S., Ma, X., Wang, X., Zhao, H., Li, Y., Zhu, H. H., Irwin, D. M., Wang, D., KU, thw266, Ruan, J. & Wu, D., 2020, I: Nature Communications. 11, 15 s., 2656.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genome of Drosophila suzukii, the Spotted Wing Drosophila
Chiu, J. C., Jiang, X., Zhao, L., Hamm, C. A., Cridland, J. M., Saelao, P., Hamby, K. A., Lee, E. K., Kwok, R. S., KU, thw266, Zalom, F. G., Walton, V. M. & Begun, D. J., 2013, I: G3: Genes, Genomes, Genetics. 3, 12, s. 2257-2271 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequence of a diabetes-prone rodent reveals a mutation hotspot around the ParaHox gene cluster
Hargreaves, A. D., Zhou, L., Christensen, J., Marlétaz, F., Liu, S., Li, F., Jansen, P. G., Spiga, E., Hansen, M. T., Pedersen, S. V. H., Biswas, S., Serikawa, K., Fox, B. A., Taylor, W. R., Mulley, J. F., KU, thw266, Heller, R. S. & Holland, P. W. H., 18 jul. 2017, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114, 29, s. 7677-7682 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequencing and comparison of two nonhuman primate animal models, the cynomolgus and Chinese rhesus macaques
Yan, G., Zhang, G., Fang, X., Zhang, Y., Li, C., Ling, F., Cooper, D. N., Li, Q., Li, Y., van Gool, A. J., Du, H., Chen, J., Chen, R., Zhang, P., Huang, Z., Thompson, J. R., Meng, Y., Bai, Y., Wang, J., Zhuo, M. & 26 flere, , 2011, I: Nature Biotechnology. 29, 11, s. 1019-1023 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequencing reveals insights into physiology and longevity of the naked mole rat
Kim, E. B., Fang, X., Fushan, A. A., Huang, Z., Lobanov, A. V., Han, L., Marino, S. M., Sun, X., Turanov, A. A., Yang, P., Yim, S. H., Zhao, X., Kasaikina, M. V., Stoletzki, N., Peng, C., Polak, P., Xiong, Z., Kiezun, A., Zhu, Y., Chen, Y. & 16 flere, , 2011, I: Nature Photographer. 479, 7372, s. 223-7 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome-wide and caste-specific DNA methylomes of the ants Camponotus floridanus and Harpegnathos saltator
Bonasio, R., Li, Q., Lian, J., Mutti, N. S., Jin, L., Zhao, H., Zhang, P., Wen, P., Xiang, H., Ding, Y., Jin, Z., Shen, S. S., Wang, Z., Wang, W., Wang, J., Berger, S. L., Liebig, J., KU, thw266 & Reinberg, D., 2012, I: Current Biology. 22, 19, s. 1755-1764 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic Adaptations and Evolutionary History of the Extinct Scimitar-Toothed Cat, Homotherium latidens
Barnett, R., Westbury, M. V., Sandoval-Velasco, M., Vieira, F. G., Jeon, S., Zazula, G., Martin, M. D., Ho, S. Y. W., Mather, N., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Zepeda-Mendoza, M. L., Antunes, A., Baez, A. C., De Cahsan, B., Larson, G., O’Brien, S. J., Eizirik, E., Johnson, W. E. & 11 flere, , 2020, I: Current Biology. 30, s. 5018-5025Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic Takeover by Transposable Elements in the Strawberry Poison Frog
Rogers, R. L., Zhou, L., Chu, C., Márquez, R., Corl, A., Linderoth, T., Freeborn, L., MacManes, M. D., Xiong, Z., Zheng, J., Guo, C., Xun, X., Kronforst, M. R., Summers, K., Wu, Y., Yang, H., Richards-Zawacki, C. L., KU, thw266 & Nielsen, R., 2018, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 35, 12, s. 2913-2927Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic and transcriptomic investigations of the evolutionary transition from oviparity to viviparity
Gao, W., Sun, Y-B., Zhou, W-W., Xiong, Z-J., Chen, L., Li, H., Fu, T-T., Xu, K., Xu, W., Ma, L., Chen, Y-J., Xiang, X-Y., Zhou, L., Zeng, T., Zhang, S., Jin, J-Q., Chen, H-M., Zhang, G., Hillis, D. M., Ji, X. & 2 flere, , 2019, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116, 9, s. 3646-3655Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic changes associated with adaptation to arid environments in cactophilic Drosophila species
Rane, R. V., Pearce, S. L., Li, F., Coppin, C., Schiffer, M., Shirriffs, J., Sgro, C. M., Griffin, P. C., KU, thw266, Lee, S. F., Hoffmann, A. A. & Oakeshott, J. G., 2019, I: BMC Genomics. 20, s. 1-22 52.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic insights into the secondary aquatic transition of penguins
Cole, T. L., Zhou, C., Fang, M., Pan, H., Ksepka, D. T., Fiddaman, S. R., Emerling, C. A., Thomas, D. B., Bi, X., Fang, Q., Ellegaard, M. R., Feng, S., Smith, A. L., Heath, T. A., Tennyson, A. J. D., Borboroglu, P. G., Wood, J. R., Hadden, P. W., Grosser, S., Bost, C. A. & 20 flere, , 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3912.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic legacy of the African cheetah, Acinonyx jubatus
Dobrynin, P., Liu, S., Tamazian, G., Xiong, Z., Yurchenko, A. A., Krasheninnikova, K., Kliver, S., Schmidt-Kuentzel, A., Koepfli, K-P., Johnson, W., Kuderna, L. F. K., Garcia-Perez, R., de Manuel, M., Godinez, R., Komissarov, A., Makunin, A., Brukhin, V., Qiu, W., Zhou, L., Li, F. & 15 flere, , 2015, I: Genome Biology (Online Edition). 16, 19 s., 277.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic regions influencing aggressive behavior in honey bees are defined by colony allele frequencies
Avalos, A., Fang, M., Pan, H., Lluch, A. R., Lipka, A. E., Zhao, S. D., Giray, T., Robinson, G. E., KU, thw266 & Hudson, M. E., 2020, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 29, s. 17135-17141 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic signatures of evolutionary transitions from solitary to group living
Kapheim, K. M., Pan, H., Li, C., Salzberg, S. L., Puiu, D., Magoc, T., Robertson, H. M., Hudson, M. E., Venkat, A., Fischman, B. J., Hernandez, A., Yandell, M., Ence, D., Holt, C., Yocum, G. D., Kemp, W. P., Bosch, J., Waterhouse, R. M., Zdobnov, E. M., Stolle, E. & 32 flere, , 2015, I: Science (New York, N.Y.). 348, 6239, s. 1139-1143 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic signatures of near-extinction and rebirth of the crested ibis and other endangered bird species
Li, S., Li, B., Cheng, C., Xiong, Z., Liu, Q., Lai, J., Carey, H. V., Zhang, Q., Zheng, H., Wei, S., Zhang, H., Chang, L., Liu, S., Zhang, S., Yu, B., Zeng, X., Hou, Y., Nie, W., Guo, Y., Chen, T. & 13 flere, , 2014, I: Genome Biology (Online Edition). 15, 16 s., 557.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gut Microbiota Linked with Reduced Fear of Humans in Red Junglefowl Has Implications for Early Domestication
Puetz, Lara Christine, Delmont, T. O., Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Guo, C., KU, thw266, Katajamaa, R., Jensen, P. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Advanced Genetics. 2, 4, 12 s., 2100018.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hairs distinguish castes and sexes: identifying the early ontogenetic building blocks of a fungus-farming superorganism (Hymenoptera: Formicidae)
Adams, R. M. M., Larsen, Rasmus Stenbak, Stylianidi, N., Cheung, D., Qiu, Bitao, Murray, S. K., KU, thw266 & Boomsma, Jacobus J., 2021, I: Myrmecological News. 31, s. 201-216 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Harvesting the fruits of the first stage of the Primate Genome Project
Guo, Y. T., Shao, Y., Bi, X., Zhang, B. L., Wu, H., Zhou, Y., Li, M. L., Yu, L., KU, thw266, Wu, D. D. & Qi, X. G., 2023, I: Zoological research. 44, 4, s. 725-728 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
High Rate of Chimeric Gene Origination by Retroposition in Plant Genomes
Wang, W., Zheng, H., Fan, C., Li, J., Shi, J., Cai, Z., KU, thw266, Liu, D., Zhang, J., Vang, S., Lu, Z., Wong, G. K., Long, M. & Wang, J., 2006, I: Plant Cell. 18, 8, s. 1791-1802 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High-coverage genomes to elucidate the evolution of penguins
Pan, H., Cole, T. L., Bi, X., Fang, M., Zhou, C., Yang, Z., Ksepka, D. T., Hart, T., Bouzat, J. L., Argilla, L. S., Bertelsen, M. F., Boersma, P. D., Bost, C. A., Cherel, Y., Dann, P., Fiddaman, S. R., Howard, P., Labuschagne, K., Mattern, T., Miller, G. & 26 flere, , 2019, I: GigaScience. 8, 9, s. 1-17Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
High-coverage sequencing and annotated assemblies of the budgerigar genome
Ganapathy, G., Howard, J. T., Ward, J. M., Li, J., Li, B., Li, Y., Xiong, Y., Zhang, Y., Zhou, S., Schwartz, D. C., Schatz, M., Aboukhalil, R., Fedrigo, O., Bukovnik, L., Wang, T., Wray, G., Rasolonjatovo, I., Winer, R., Knight, J. R., Koren, S. & 4 flere, , 8 jul. 2014, I: GigaScience. 3, 1, 11.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High-coverage sequencing and annotated assembly of the genome of the Australian dragon lizard Pogona vitticeps
Georges, A., Li, Q., Lian, J., O'Meally, D., Deakin, J., Wang, Z., Zhang, P., Fujita, M., Patel, H. R., Holleley, C. E., Zhou, Y., Zhang, X., Matsubara, K., Waters, P., Graves, J. A. M., Sarre, S. D. & KU, thw266, 2015, I: GigaScience. 4, 10 s., 45.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High-quality chromosome-level genome assembly and full-length transcriptome analysis of the pharaoh ant Monomorium pharaonis
Gao, Q., Xiong, Z., Larsen, Rasmus Stenbak, Zhou, L., Zhao, J., Ding, G., Zhao, R., Liu, C., Ran, H. & KU, thw266, 2020, I: GigaScience. 9, 12, 14 s., giaa143.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Historic Sampling of a Vanishing Beast: Population Structure and Diversity in the Black Rhinoceros
Sánchez-Barreiro, F., Westbury, Binia De Cahsan, Westbury, Michael Vincent, Sun, Xin, Margaryan, Ashot, Fontsere, Claudia, Bruford, M. W., Russo, I. M., Kalthoff, D. C., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Dalén, L., KU, thw266, Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Moodley, Y., 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 9, 19 s., msad180.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Historical population declines prompted significant genomic erosion in the northern and southern white rhinoceros (Ceratotherium simum)
Sánchez-Barreiro, F., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Westbury, Michael Vincent, de Manuel, M., Margaryan, Ashot, Ciucani, M. M., Vieira, Filipe Garrett, Patramanis, Ioannis, Kalthoff, D. C., Timmons, Z., Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Ryder, O. A., KU, thw266, Marques-Bonet, T., Moodley, Y. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6355-6369 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hologenomic adaptations underlying the evolution of sanguivory in the common vampire bat
Zepeda Mendoza, M. L., Xiong, Z., Escalera-Zamudio, M., Runge, A. K. W., Thézé, J., Streicker, D., Frank, H. K., Loza-Rubio, E., Liu, S., Ryder, O. A., Castruita, J. A. S., Katzourakis, A., Pacheco, G. A., Taboada, B., Löber, U., Pybus, O. G., Li, Y., Rojas-Anaya, E., Bohmann, K., Carmona Baez, A. & 9 flere, , 2018, I: Nature Ecology & Evolution. 2, 4, s. 659-668 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
How genomics can help biodiversity conservation
The European Reference Genome Atlas Consortium, T. E. R. G. A. C., 2023, I: Trends in Genetics. 39, 7, 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Identification and characterization of insect-specific proteins by genome data analysis
KU, thw266, Wang, H., Shi, J., Wang, X., Zheng, H., Wong, G. K., Clark, T., Wang, W., Wang, J. & Kang, L., 2007, I: B M C Genomics. 8, 11 s., 93.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification and evolution of avian endogenous foamy viruses
Chen, Y., Wei, X., KU, thw266, Holmes, E. C. & Cui, J., 2019, I: Virus Evolution. 5, 2, 6 s., vez049.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of constrained sequence elements across 239 primate genomes
Kuderna, L. F. K., Ulirsch, J. C., Rashid, S., Ameen, M., Sundaram, L., Hickey, G., Cox, A. J., Gao, H., Kumar, A., Aguet, F., Christmas, M. J., Clawson, H., Haeussler, M., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J. & 72 flere, , 2024, I: Nature. 625, s. 735–742 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Improving the ostrich genome assembly using optical mapping data
Zhang, J., Li, C., Zhou, Q. & KU, thw266, 2015, I: GigaScience. 4, 3 s., 24.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
In-Depth Tanscriptomic Analysis on Giant Freshwater Prawns
Mohd-Shamsudin, M. I., Kang, Y., Lili, Z., Tan, T. T., Kwong, Q. B., Liu, H., KU, thw266, Othman, R. Y. & Bhassu, S., 2013, I: PLoS ONE. 8, 5, 14 s., e60839.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Incomplete lineage sorting and phenotypic evolution in marsupials
Feng, S., Bai, M., Rivas-González, I., Li, C., Liu, S., Tong, Y., Yang, H., Chen, G., Xie, D., Sears, K. E., Franco, L. M., Gaitan-Espitia, J. D., Nespolo, R. F., Johnson, W. E., Yang, H., Brandies, P. A., Hogg, C. J., Belov, K., Renfree, M. B., Helgen, K. M. & 3 flere, , 2022, I: Cell. 185, 10, s. 1646-1660.e18Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Initiation of the Primate Genome Project
Wu, D., Qi, X., Yu, L., Li, M., Liu, Z., Yoder, A. D., Roos, C., Hayakawa, T., Rogers, J., Marques-Bonet, T., Su, B., Yao, Y., Zhang, Y. & KU, thw266, 2022, I: Zoological research. 43, 2, s. 147-149 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Labour classified by cervical dilatation & fetal membrane rupture demonstrates differential impact on RNA-seq data for human myometrium tissues
Lai, P. F., Lei, K., Zhan, X., Sooranna, G., Li, J. K. H., Georgiou, E. X., Das, A., Singh, N., Li, Q., Stanfield, Z., KU, thw266, Tribe, R. M., Mesiano, S. & Johnson, M. R., 2021, I: PLoS ONE. 16, 11, 22 s., e0260119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Large-scale genomic analysis reveals the genetic cost of chicken domestication
Wang, M-S., Zhang, J-J., Guo, X., Li, M., Meyer, R., Ashari, H., Zheng, Z-Q., Wang, S., Peng, M-S., Jiang, Y., Thakur, M., Suwannapoom, C., Esmailizadeh, A., Hirimuthugoda, N. Y., Zein, M. S. A., Kusza, S., Kharrati-Koopaee, H., Zeng, L., Wang, Y-M., Yin, T-T. & 23 flere, , 2021, I: BMC Biology. 19, 16 s., 118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits
Chen, L., Qin, Q., Jiang, Y., Wang, K., Lin, Z., Li, Z., Bibi, F., Yang, Y., Wang, J., Nie, W., Su, W., Liu, G., Li, Q., Fu, W., Pan, X., Liu, C., Yang, J., Zhang, C., Yin, Y., Wang, Y. & 32 flere, , 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1152-Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lineage-specific accelerated sequences underlying primate evolution
Bi, X., Zhou, L., Zhang, J., Feng, S., Hu, M., Cooper, D. N., Lin, J., Li, J., Wu, D. & KU, thw266, 2023, I: Science Advances. 9, 22, 12 s., eadc9507.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Low frequency of paleoviral infiltration across the avian phylogeny
Cui, J., Zhao, W., Huang, Z., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P, Walker, P. J., Holmes, E. C. & KU, thw266, 2014, I: Genome Biology (Online Edition). 15, 12, 13 s., 539.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mitogenomes Uncover Extinct Penguin Taxa and Reveal Island Formation as a Key Driver of Speciation
Cole, T. L., Ksepka, D. T., Mitchell, K. J., Tennyson, A. J. D., Thomas, D. B., Pan, H., KU, thw266, Rawlence, N. J., Wood, J. R., Bover, P., Bouzat, J. L., Cooper, A., Fiddaman, S. R., Hart, T., Miller, G., Ryan, P. G., Shepherd, L. D., Wilmshurst, J. M. & Waters, J. M., 2019, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 36, 4, s. 784-797 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modern Siberian dog ancestry was shaped by several thousand years of Eurasian-wide trade and human dispersal
Feuerborn, T. R., Carmagnini, A., Losey, R. J., Nomokonova, T., Askeyev, A., Askeyev, I., Askeyev, O., Antipina, E. E., Appelt, M., Bachura, O. P., Beglane, F., Bradley, D. G., Daly, K. G., Gopalakrishnan, S., Gregersen, K. M., Guo, C., Gusev, A. V., Jones, C., Kosintsev, P. A., Kuzmin, Y. V. & 17 flere, , 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 39, e2100338118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modes of genetic adaptations underlying functional innovations in the rumen
Pan, X., Cai, Y., Li, Z., Chen, X., Heller, R., Wang, N., Wang, Y., Zhao, C., Wang, Y., Xu, H., Li, S., Li, M., Li, C., Hu, S., Li, H., Wang, K., Chen, L., Wei, B., Zheng, Z., Fu, W. & 20 flere, , 2021, I: Science China Life Sciences. 64, 1, s. 1-21 21 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular traces of alternative social organization in a termite genome
Terrapon, N., Li, C., Robertson, H. M., Ji, L., Meng, X., Booth, W., Chen, Z., Childers, C. P., Glastad, K. M., Gokhale, K., Gowin, J., Gronenberg, W., Hermansen, R. A., Hu, H., Hunt, B. G., Huylmans, A. K., Khalil, S. M. S., Mitchell, R. D., Munoz-Torres, M. C., Mustard, J. A. & 23 flere, , 2014, I: Nature Communications. 5, 12 s., 3636.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mudskipper genomes provide insights into the terrestrial adaptation of amphibious fishes
You, X., Bian, C., Zan, Q., Xu, X., Liu, X., Chen, J., Wang, J., Qiu, Y., Li, W., Zhang, X., Sun, Y., Chen, S., Hong, W., Li, Y., Cheng, S., Fan, G., Shi, C., Liang, J., Tom Tang, Y., Yang, C. & 24 flere, , 2014, I: Nature Communications. 5, 5594, 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multi-omic detection of Mycobacterium leprae in archaeological human dental calculus
Fotaki, Anna Katerina, Denham, S. D., Mackie, Meaghan, Iraeta Orbegozo, Miren, Mylopotamitaki, Dorothea, Gopalakrishnan, Shyam, Sicheritz-Pontén, Thomas, Olsen, Jesper Velgaard, Cappellini, Enrico, KU, thw266, Christophersen, A., Gilbert, M Thomas P & Vågene, Åshild Joanne, 2020, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 375, 1812, 10 s., 20190584.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multiple origins of a frameshift insertion in a mitochondrial gene in birds and turtles
Andreu-Sánchez, S., Chen, W., Stiller, Josefin & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 1, 11 s., giaa161.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Neuroprotectants attenuate hypobaric hypoxia-induced brain injuries in cynomolgus monkeys
Zhang, P., Chen, J-S., Li, Q-Y., Sheng, L-X., Gao, Y-X., Lu, B-Z., Zhu, W-B., Zhan, X-Y., Li, Y., Yuan, Z-B., Xu, G., Qiu, B-T., Yan, M., Guo, C-X., Wang, Y-Q., Huang, Y-J., Zhang, J-X., Liu, F-Y., Tang, Z-W., Lin, S-Z. & 7 flere, , 13 dec. 2019, I: Zoological research. 41, 1, s. 3-19 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Olfactory receptor subgenomes linked with broad ecological adaptations in sauropsida
Khan, I., Yang, Z., Maldonado, E., Li, C., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J., Johnson, W. E. & Antunes, A., 2015, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 32, 11, s. 2832-2843 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On the origin and evolution of RNA editing in metazoans
Zhang, P., Zhu, Y., Guo, Q., Li, J., Zhan, X., Yu, H., Xie, N., Tan, H., Lundholm, Nina, Garcia-Cuetos, L., Martin, M. D., Subirats, M. A., Su, Y., Ruiz-Trillo, I., Martindale, M. Q., Yu, J., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Li, Q., 2023, I: Cell Reports. 42, 2, 22 s., 112112.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
On the origin of new genes in Drosophila
Zhou, Q., KU, thw266, Zhang, Y., Xu, S., Zhao, R., Zhan, Z., Li, X., Ding, Y., Yang, S. & Wang, W., 2008, I: Genome Research. 18, 9, s. 1446-1455 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Origin and Deep Evolution of Human Endogenous Retroviruses in Pan-Primates
Li, Y., KU, thw266 & Cui, J., 2022, I: Viruses. 14, 7, 14 s., 1370.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Orthologous microsatellites, transposable elements, and DNA deletions correlate with generation time and body mass in neoavian birds
Ji, Y., Feng, S., Wu, L., Fang, Q., Brüniche-Olsen, Anna, DeWoody, J. A., Cheng, Y., Zhang, D., Hao, Y., Song, G., Qu, Y., Suh, A., KU, thw266, Hackett, S. J. & Lei, F., 2022, I: Science Advances. 8, 35, 11 s., eabo0099.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Outbred genome sequencing and CRISPR/Cas9 gene editing in butterflies
Li, X., Fan, D., Zhang, W., Liu, G., Zhang, L., Zhao, L., Fang, X., Chen, L., Dong, Y., Chen, Y., Ding, Y., Zhao, R., Feng, M., Zhu, Y., Feng, Y., Jiang, X., Zhu, D., Xiang, H., Feng, X., Li, S. & 4 flere, , 2015, I: Nature Communications. 6, 10 s., 8212.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Parallel evolution of fish bi-modal breathing and expansion of olfactory receptor (OR) genes: toward a universal ORs nomenclature
Silva, L., Mendes, T., Ramos, L., KU, thw266 & Antunes, A., 2023, I: Journal of Genetics and Genomics. 50, 8, 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pervasive incomplete lineage sorting illuminates speciation and selection in primates
Rivas-González, I., Rousselle, M., Li, F., Zhou, L., Dutheil, J. Y., Munch, K., Shao, Y., Wu, D., Schierup, M. H. & KU, thw266, 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomic analyses data of the avian phylogenomics project
Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Alfaro Nuñez, L. A., Narula, N., Liu, L., Burt, D., Ellegren, H., Edwards, S. V., Stamatakis, A. & 7 flere, , 2015, I: GigaScience. 4, 9 s., 4.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomic analyses of the genus Drosophila reveals genomic signals of climate adaptation
Li, F., Rane, R. V., Luria, V., Xiong, Z., Chen, J., Li, Z., Catullo, R. A., Griffin, P. C., Schiffer, M., Pearce, S., Lee, S. F., McElroy, K., Stocker, A., Shirriffs, J., Cockerell, F., Coppin, C., Sgrò, C. M., Karger, A., Cain, J. W., Weber, J. A. & 5 flere, , 2022, I: Molecular Ecology Resources. 22, 4, s. 1559-1581 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomic analyses provide insights into primate evolution
Shao, Y., Zhou, L., Li, F., Zhao, L., Zhang, B. L., Shao, F., Chen, J. W., Chen, C. Y., Bi, X., Zhuang, X. L., Zhu, H. L., Hu, J., Sun, Z., Li, X., Wang, D., Rivas-González, I., Wang, S., Wang, Y. M., Chen, W., Li, G. & 23 flere, , 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, s. 913-924 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogeny and sex chromosome evolution of palaeognathae
Wang, Z., Zhang, J., Xu, X., Witt, C., Deng, Y., Chen, G., Meng, G., Feng, S., Xu, L., Szekely, T., KU, thw266 & Zhou, Q., 2022, I: Journal of Genetics and Genomics. 49, 2, s. 109-119 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Platypus and echidna genomes reveal mammalian biology and evolution
Zhou, Y., Shearwin-Whyatt, L., Li, J., Song, Z., Hayakawa, T., Stevens, D., Fenelon, J. C., Peel, E., Cheng, Y., Pajpach, F., Bradley, N., Suzuki, H., Nikaido, M., Damas, J., Daish, T., Perry, T., Zhu, Z., Geng, Y., Rhie, A., Sims, Y. & 22 flere, , 2021, I: Nature. 592, 7856, s. 756-762Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomics reveal recent speciation and rapid evolutionary adaptation in polar bears
Liu, S., Lorenzen, E., Fumagalli, M., Li, B., Harris, K., Xiong, Z., Zhou, L., Korneliussen, T. S., Somel, M., Babbitt, C., Wray, G., Li, J., He, W., Wang, Z., Fu, W., Xiang, X., Morgan, C. C., Doherty, A., O'Connell, M. J., McInerney, J. O. & 9 flere, , 2014, I: Cell. 157, 4, s. 785-794 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pre-extinction Demographic Stability and Genomic Signatures of Adaptation in the Woolly Rhinoceros
Lord, E., Dussex, N., Kierczak, M., Díez-del-Molino, D., Ryder, O. A., Stanton, D. W. G., Gilbert, M. T. P., Sánchez-Barreiro, F., Zhang, G., Sinding, M. H. S., Lorenzen, E. D., Willerslev, E., Protopopov, A., Shidlovskiy, F., Fedorov, S., Bocherens, H., Nathan, S. K. S. S., Goossens, B., van der Plicht, J., Chan, Y. L. & 10 flere, , 2020, I: Current Biology. 30, 19, s. 3871-3879, e1-e7 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Probing the genomic limits of de-extinction in the Christmas Island rat
Lin, J., Duchene, David, Carøe, C., Smith, O., Ciucani, M. M., Niemann, Jonas, Richmond, D., Greenwood, A. D., MacPhee, R., KU, thw266, Gopalakrishnan, Shyam & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 7, s. 1650-1656.e3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Progressive Cactus is a multiple-genome aligner for the thousand-genome era
Armstrong, J., Hickey, G., Diekhans, M., Fiddes, I. T., Novak, A. M., Deran, A., Fang, Q., Xie, D., Feng, S., Stiller, J., Genereux, D., Johnson, J., Marinescu, V. D., Alföldi, J., Harris, R. S., Lindblad-Toh, K., Haussler, D., Karlsson, E., Jarvis, E. D., Zhang, G. & 1 flere, , 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 246-251Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RES-Scanner: a software package for genome-wide identification of RNA-editing sites
Wang, Z., Lian, J., Li, Q., Zhang, P., Zhou, Y., Zhan, X. & KU, thw266, 2016, I: GigaScience. 5, 9 s., 37.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid loss of endogenous DNA in pig bone buried in five different environments
Eriksen, A. M. H., Matthiesen, H., Kontopoulos, I., Gregory, D., Snoeck, C., KU, thw266, Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Archaeometry. 62, 4, s. 827-846 20 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reciprocal genomic evolution in the ant-fungus agricultural symbiosis
Nygaard, S., Hu, H., Li, C., Schiøtt, M., Chen, Z., Yang, Z., Xie, Q., Ma, C., Deng, Y., Dikow, R. B., Rabeling, C., Nash, David Richard, Wcislo, W. T., Brady, S. G., Schultz, T. R., KU, thw266 & Boomsma, Jacobus J., 2016, I: Nature Communications. 7, 9 s., 12233.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviours
Kukekova, A. V., Johnson, J. L., Xiang, X., Feng, S., Liu, S., Rando, H. M., Kharlamova, A. V., Herbeck, Y., Serdyukova, N. A., Xiong, Z., Beklemischeva, V., Koepfli, K-P., Gulevich, R. G., Vladimirova, A. V., Hekman, J. P., Perelman, P. L., Graphodatsky, A. S., O'Brien, S. J., Wang, X., Clark, A. G. & 3 flere, , 2018, I: Nature Ecology & Evolution. 2, 9, s. 1479-1491Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reference genome of wild goat (capra aegagrus) and sequencing of goat breeds provide insight into genic basis of goat domestication
Dong, Y., Zhang, X., Xie, M., Arefnezhad, B., Wang, Z., Wang, W., Feng, S., Huang, G., Guan, R., Shen, W., Bunch, R., McCulloch, R., Li, Q., Li, B., KU, thw266, Xu, X., Kijas, J. W., Salekdeh, G. H., Wang, W. & Jiang, Y., 2015, I: B M C Genomics. 16, 11 s., 431.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Reference-assisted chromosome assembly
Kim, J., Larkin, D. M., Cai, Q., Asan, Zhang, Y., Ge, R., Auvil, L., Capitanu, B., KU, thw266, Lewin, H. A. & Ma, J., 2013, I: PNAS. 110, 5, s. 1785-1790 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Relaxed selection underlies genome erosion in socially parasitic ant species
Schrader, Lukas, Pan, H., Bollazzi, M., Schiøtt, M., Larabee, F. J., Bi, X., Deng, Y., KU, thw266, Boomsma, Jacobus J. & Rabeling, C., 2021, I: Nature Communications. 12, 13 s., 2918.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Response of an Afro-Palearctic bird migrant to glaciation cycles
Thorup, Kasper, Pedersen, L., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Naimi, B., Nogues, David Bravo, Krapp, M., Manica, A., Willemoes, M., Sjöberg, Sissel, Feng, S., Chen, G., Rey de la Iglesia, Alba, Campos, P. F., Beyer, R., Araújo, M. B., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Tøttrup, Anders P. & Rahbek, Carsten, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 52, 8 s., e2023836118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Response to Comment on “Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds”
Cracraft, J., Houde, P., Ho, S. Y. W., Mindell, D. P., Fjeldså, Jon, Lindow, Bent Erik Kramer, Edwards, S. V., Rahbek, Carsten, Mirarab, S., Warnow, T., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Braun, E. L. & Jarvis, E. D., 2015, I: Science. 349, 6255, s. 1460b 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Sensory Rewiring in an Echolocator: Genome-Wide Modification of Retinogenic and Auditory Genes in the Bat Myotis davidii
Hudson, N. J., Baker, M. L., Hart, N. S., Wynne, J. W., Gu, Q., Huang, Z., KU, thw266, Ingham, A. B., Wang, L. & Reverter, A., 2014, I: G3: Genes, Genomes, Genetics. 4, 10, s. 1825-1835 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sequencing, de novo assembling, and annotating the genome of the endangered Chinese crocodile lizard Shinisaurus crocodilurus
Gao, J., Li, Q., Wang, Z., Zhou, Y., Martelli, P., Li, F., Xiong, Z., Wang, J., Yang, H. & KU, thw266, jul. 2017, I: GigaScience. 6, 7, s. 1-6 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Species-specific traits mediate avian demographic responses under past climate change
Germain, Ryan Ross, Feng, S., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Nogues, David Bravo, 2022, bioRxiv, 24 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Species-specific traits mediate avian demographic responses under past climate change
Germain, Ryan Ross, Feng, S., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Nogues, David Bravo, 2023, I: Nature Ecology and Evolution. 7, 6, s. 862-872 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Standards recommendations for the Earth BioGenome Project
Lawniczak, M. K. N., Durbin, R., Flicek, P., Lindblad-Toh, K., Wei, X., Archibald, J. M., Baker, W. J., Belov, K., Blaxter, M. L., Bonet, T. M., Childers, A. K., Coddington, J. A., Crandall, K. A., Crawford, A. J., Davey, R. P., Palma, F. D., Fang, Q., Haerty, W., Hall, N., Hoff, K. J. & 25 flere, , 2022, I: PNAS. 119, 4, 8 s., e2115639118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Studying mutation rate evolution in primates - a need for systematic comparison of computational pipelines
Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Schierup, M. H. & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 10, 4 s., giab072.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Temporal dynamics of avian populations during pleistocene revealed by whole-genome sequences
Nadachowska-Brzyska, K., Li, C., Smeds, L., KU, thw266 & Ellegren, H., 2015, I: Current Biology. 25, 10, s. 1375-1380 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Temporal genomic evolution of bird sex chromosomes
Wang, Z., Zhang, J., Yang, W., An, N., Zhang, P., KU, thw266 & Zhou, Q., 2014, I: B M C Evolutionary Biology. 14, 12 s., 250.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Testing cophylogeny between coral reef invertebrates and their bacterial and archaeal symbionts
O'Brien, P. A., Andreakis, N., Tan, S., Miller, D. J., Webster, N. S., KU, thw266 & Bourne, D. G., 2021, I: Molecular Ecology. 30, 15, s. 3768-3782 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Earth BioGenome Project 2020: Starting the clock
Lewin, H. A., Richards, S., Aiden, E. L., Allende, M. L., Archibald, J. M., Bálint, M., Barker, K. B., Baumgartner, B., Belov, K., Bertorelle, G., Blaxter, M. L., Cai, J., Caperello, N. D., Carlson, K., Castilla-Rubio, J. C., Chaw, S. M., Chen, L., Childers, A. K., Coddington, J. A., Conde, D. A. & 65 flere, , 2022, I: PNAS. 119, 4, 7 s., e2115635118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Genome 10K Project: a way forward
Koepfli, K-P., Paten, B., O'Brien, S. J., Antunes, A., Belov, K., Bustamante, C., Castoe, T. A., Clawson, H., Crawford, A. J., Diekhans, M., Distel, D., Durbin, R., Earl, D., Fujita, M. K., Gamble, T., Georges, A., Gemmell, N., Gilbert, M. T. P., Graves, J. M., Green, R. E. & 25 flere, , 2015, I: Annual Review of Animal Biosciences. 3, s. 57-111 55 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
The Genome of Dendrobium officinale Illuminates the Biology of the Important Traditional Chinese Orchid Herb
Yan, L., Wang, X., Liu, H., Tian, Y., Lian, J., Yang, R., Hao, S., Wang, X., Yang, S., Li, Q., Qi, S., Kui, L., Okpekum, M., Ma, X., Zhang, J., Ding, Z., KU, thw266, Wang, W., Dong, Y. & Sheng, J., 2015, I: Molecular Plant. 8, 6, s. 922-934 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Genomic Footprints of the Fall and Recovery of the Crested Ibis
Feng, S., Fang, Q., Barnett, R., Li, C., Han, S., Kuhlwilm, M., Zhou, L., Pan, H., Deng, Y., Chen, G., Gamauf, A., Woog, F., Prys-Jones, R., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2019, I: Current Biology. 29, 2, s. 340-349, e1-e7Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Global Ant Genomics Alliance (GAGA)
Boomsma, Jacobus J., Brady, S. G., Dunn, Rob, Gadau, J., Heinze, J., Keller, L., Moreau, C. S., Sanders, N., Schrader, Lukas, Schultz, T. R., Sundström, L., Ward, P. S., Wcislo, W. T. & KU, thw266, okt. 2017, I: Myrmecological News. 25, s. 61-66 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Mutationathon highlights the importance of reaching standardization in estimates of pedigree-based germline mutation rates
Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Turner, T. N., Versoza, C. J., Wang, R. J., Price, A. L., Armstrong, E., Riera, M., Carlson, J., Chen, Hwei-Yen, Hahn, M. W., Harris, K., Kleppe, A. S., López-Nandam, E. H., Moorjani, P., Pfeifer, S. P., Tiley, G. P., Yoder, A. D., KU, thw266 & Schierup, M. H., 2022, I: eLife. 11, 28 s., e73577.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Vertebrate TLR Supergene Family Evolved Dynamically by Gene Gain/Loss and Positive Selection Revealing a Host-Pathogen Arms Race in Birds
Khan, I., Maldonado, E., Silva, L., Almeida, D., Johnson, W. E., O'Brien, S. J., KU, thw266, Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Antunes, A., 2019, I: Diversity. 11, 8, 25 s., 131.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The bird's-eye view on chromosome evolution
KU, thw266, 2018, I: Genome Biology. 19, s. 1-3 201.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The draft genome of a socially polymorphic halictid bee, Lasioglossum albipes: [plus] Erratum
Kocher, S. D., Li, C., Yang, W., Tan, H., Yi, S. V., Yang, X., Hoekstra, H. E., KU, thw266, Pierce, N. E. & Yu, D. W., 2013, I: Genome Biology. 14, 12, 14 s., R142 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The draft genomes of soft-shell turtle and green sea turtle yield insights into the development and evolution of the turtle-specific body plan
Wang, Z., Pascual-Anaya, J., Zadissa, A., Li, W., Niimura, Y., Huang, Z., Li, C., White, S., Xiong, Z., Fang, D., Wang, B., Ming, Y., Chen, Y., Zheng, Y., Kuraku, S., Pignatelli, M., Herrero, J., Beal, K., Nozawa, M., Li, Q. & 14 flere, , 2013, I: Nature Genetics. 45, 6, s. 701-706 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The enormous repetitive Antarctic krill genome reveals environmental adaptations and population insights
Shao, C., Sun, S., Liu, K., Wang, J., Li, S., Liu, Q., Deagle, B. E., Seim, I., Biscontin, A., Wang, Q., Liu, X., Kawaguchi, S., Liu, Y., Jarman, S., Wang, Y., Wang, H. Y., Huang, G., Hu, J., Feng, B., De Pittà, C. & 29 flere, , 2023, I: Cell. 186, 6, s. 1279-1294.e19 36 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The era of reference genomes in conservation genomics
Formenti, G., Theissinger, K., Fernandes, C., Bista, I., Bombarely, A., Bleidorn, C., Ciofi, C., Crottini, A., Godoy, J. A., Höglund, J., Malukiewicz, J., Mouton, A., Oomen, R. A., Paez, S., Palsbøll, P. J., Pampoulie, C., Ruiz-López, M. J., Svardal, H., Theofanopoulou, C., de Vries, J. & 8 flere, , 2022, I: Trends in Ecology and Evolution. 37, 3, s. 197-202 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The evolution of ancestral and species-specific adaptations in snowfinches at the Qinghai–Tibet Plateau
Qu, Y., Chen, C., Chen, X., Hao, Y., She, H., Wang, M., Ericson, P. G. P., Lin, H., Cai, T., Song, G., Jia, C., Chen, C., Zhang, H., Li, J., Liang, L., Wu, T., Zhao, J., Gao, Q., Zhang, G., Zhai, W. & 3 flere, , 2021, I: PNAS. 118, 13, 10 s., e2012398118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The evolutionary history of extinct and living lions
de Manuel, M., Barnett, R., Sandoval-Velasco, M., Yamaguchi, N., Vieira, F. G., Mendoza, M. L. Z., Liu, S., Martin, M. D., Sinding, M-H. S., Mak, S. S. T., Caroe, C., Liu, S., Guo, C., Zheng, J., Zazula, G., Baryshnikov, G., Eizirik, E., Koepfli, K-P., Johnson, W. E., Antunes, A. & 9 flere, , 2020, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 20, s. 10927-10934 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The first AsiaEvo conference, connecting Asian evolutionary biologists to the world
KU, thw266, 2018, I: National Science Review. 5, 5, s. 614-616Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The gene expression network regulating queen brain remodeling after insemination and its parallel use in ants with reproductive workers
Nagel, M., Qiu, Bitao, Brandenborg, L. E., Larsen, Rasmus Stenbak, Ning, D., Boomsma, Jacobus J. & KU, thw266, 2020, I: Science Advances. 6, 38, 17 s., eaaz5772.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The genome and transcriptome of Japanese flounder provide insights into flatfish asymmetry
Shao, C., Bao, B., Xie, Z., Chen, X., Li, B., Jia, X., Yao, Q., Ortí, G., Li, W., Li, X., Hamre, K., Xu, J., Wang, L., Chen, F., Tian, Y., Schreiber, A. M., Wang, N., Wei, F., Zhang, J., Dong, Z. & 16 flere, , 1 jan. 2017, I: Nature Genetics. 49, 1, s. 119-124 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genome of the clonal raider ant Cerapachys biroi
Oxley, P. R., Ji, L., Fetter-Pruneda, I., McKenzie, S. K., Li, C., Hu, H., KU, thw266 & Kronauer, D. J. C., 2014, I: Current Biology. 24, 4, s. 451-458 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The genome of the golden apple snail Pomacea canaliculata provides insight into stress tolerance and invasive adaptation
Liu, C., Zhang, Y., Ren, Y., Wang, H., Li, S., Jiang, F., Yin, L., Qiao, X., KU, thw266, Qian, W., Liu, B. & Fan, W., 2018, I: GigaScience. 7, 9, 13 s., giy101.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genome of the largest bony fish, ocean sunfish (Mola mola), provides insights into its fast growth rate
Pan, H., Yu, H., Ravi, V., Li, C., Lee, A. P., Lian, M. M., Tay, B., Brenner, S., Wang, J., Yang, H., KU, thw266 & Venkatesh, B., 2016, I: GigaScience. 5, 12 s., 36.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The genomic consequences of adaptive divergence and reproductive isolation between species of manakins
Parchman, T. L., Gompert, Z., Braun, M. J., Brumfield, R. T., McDonald, D. B., Uy, J. A. C., KU, thw266, Jarvis, E. D., Schlinger, B. A. & Buerkle, C. A., 2013, I: Molecular Ecology. 22, 12, s. 3304-3317 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The germline mutational process in rhesus macaque and its implications for phylogenetic dating
Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Bakker, J., Zheng, J., Li, P., Antunes Pacheco, George, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kamilari, M., Gilbert, M Thomas P, Schierup, M. H. & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 5, 14 s., giab029.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The i5K Initiative: Advancing Arthropod Genomics for Knowledge, Human Health, Agriculture, and the Environment
Evans, J. D., Brown, S. J., Hackett, K. J., Robinson, G., Richards, S., Lawson, D., Elsik, C., Coddington, J., Edwards, O., Emrich, S., Gabaldon, T., Goldsmith, M., Hanes, G., Misof, B., Muñoz-Torres, M., Niehuis, O., Papanicolaou, A., Pfrender, M., Poelchau, M., Purcell-Miramontes, M. & 7 flere, , 2013, I: Journal of Heredity. 104, 5, s. 595-600 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The landscape of tolerated genetic variation in humans and primates
Gao, H., Hamp, T., Ede, J., Schraiber, J. G., McRae, J., Singer-Berk, M., Yang, Y., Dietrich, A. S. D., Fiziev, P. P., Kuderna, L. F. K., Sundaram, L., Wu, Y., Adhikari, A., Field, Y., Chen, C., Batzoglou, S., Aguet, F., Lemire, G., Reimers, R., Balick, D. & 77 flere, , 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The locust genome provides insight into swarm formation and long-distance flight
Wang, X., Fang, X., Yang, P., Jiang, X., Jiang, F., Zhao, D., Li, B., Cui, F., Wei, J., Ma, C., Wang, Y., He, J., Luo, Y., Wang, Z., Guo, X., Guo, W., Wang, X., Zhang, Y., Yang, M., Hao, S. & 25 flere, , 2014, I: Nature Communications. 5, 9 s., 2957.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The origin of domestication genes in goats
Zheng, Z., Wang, X., Li, M., Li, Y., Yang, Z., Wang, X., Pan, X., Gong, M., Zhang, Y., Guo, Y., Wang, Y., Liu, J., Cai, Y., Chen, Q., Okpeku, M., Colli, L., Cai, D., Wang, K., Huang, S., Sonstegard, T. S. & 16 flere, , 2020, I: Science Advances. 6, 21, eaaz5216.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The yak genome and adaptation to life at high altitude
Qiu, Q., Zhang, G., Ma, T., Qian, W., Wang, J., Ye, Z., Cao, C., Hu, Q., Kim, J., Larkin, D. M., Auvil, L., Capitanu, B., Ma, J., Lewin, H. A., Qian, X., Lang, Y., Zhou, R., Wang, L., Wang, K., Xia, J. & 29 flere, , 2012, I: Nature Genetics. 44, 8, s. 946-951 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Three crocodilian genomes reveal ancestral patterns of evolution among archosaurs
Green, R. E., Braun, E. L., Armstrong, J., Earl, D., Nguyen, N., Hickey, G., Vandewege, M. W., John, J. A. S., Capella-Gutierrez, S., Castoe, T. A., Kern, C., Fujita, M. K., Opazo, J. C., Jurka, J., Kojima, K. K., Caballero, J., Hubley, R. M., Smit, A. F., Platt, R. N., Lavoie, C. A. & 35 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species
Rhie, A., McCarthy, S. A., Fedrigo, O., Damas, J., Formenti, G., Koren, S., Uliano-Silva, M., Chow, W., Fungtammasan, A., Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Chaisson, M., Gedman, G. L., Cantin, L. J., Thibaud-Nissen, F., Haggerty, L., Bista, I., Smith, M., Haase, B. & 107 flere, , 2021, I: Nature. 592, 7856, s. 737-746 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Towards reconstructing the ancestral brain gene-network regulating caste differentiation in ants
Qiu, Bitao, Larsen, Rasmus Stenbak, Chang, N., Wang, J., Boomsma, Jacobus J. & KU, thw266, 2018, I: Nature Ecology & Evolution. 2, 11, s. 1782-1791Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tracing the genetic footprints of vertebrate landing in non-teleost ray-finned fishes
Bi, X., Wang, K., Yang, L., Pan, H., Jiang, H., Wei, Q., Fang, M., Yu, H., Zhu, C., Cai, Y., He, Y., Gan, X., Zeng, H., Yu, D., Zhu, Y., Jiang, H., Qiu, Q., Yang, H., Zhang, Y. E., Wang, W. & 3 flere, , 2021, I: Cell. 184, 5, s. 1377-1391, e1-e14Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptome innovations in primates revealed by single-molecule long-read sequencing
Ferrández-Peral, L., Zhan, X., Alvarez-Estape, M., Chiva, C., Esteller-Cucala, P., García-Pérez, R., Julià, E., Lizano, E., Fornas, Ò., Sabidó, E., Li, Q., Marquès-Bonet, T., Juan, D. & KU, thw266, 2022, I: Genome Research. 32, 8, s. 1448-1462 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Triangulation of the human, chimpanzee, and Neanderthal genome sequences identifies potentially compensated mutations
KU, thw266, Pei, Z., Krawczak, M., Ball, E. V., Mort, M., Kehrer-Sawatzki, H. & Cooper, D. N., 2010, I: Human Mutation. 31, 12, s. 1286-93 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Two Antarctic penguin genomes reveal insights into their evolutionary history and molecular changes related to the Antarctic environment
Li, C., Zhang, Y., Li, J., Kong, L., Hu, H., Pan, H., Xu, L., Deng, Y., Li, Q., Jin, L., Yu, H., Chen, Y., Liu, B., Yang, L., Liu, S., Zhang, Y., Lang, Y., Xia, J., He, W., Shi, Q. & 21 flere, , 2014, I: GigaScience. 3, 27, 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Unparalleled details of soft tissues in a Cretaceous ant
Zhuang, Y., Xu, W., KU, thw266, Mai, H., Li, X., He, H., Ran, H. & Liu, Y., 2022, I: BMC Ecology and Evolution. 22, 1, 10 s., 146.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Validation of Potential Reference Genes for Real-Time qPCR Analysis in Pharaoh Ant, Monomorium pharaonis (Hymenoptera: Formicidae)
Ding, G., Gao, Q., Chen, J., Zhao, J., KU, thw266 & Liu, W., 2022, I: Frontiers in Physiology. 13, 9 s., 852357.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variation in predicted COVID-19 risk among lemurs and lorises
Melin, A. D., Orkin, J. D., Janiak, M. C., Valenzuela, A., Kuderna, L., Marrone, F., Ramangason, H., Horvath, J. E., Roos, C., Kitchener, A. C., Khor, C. C., Lim, W. K., Lee, J. G. H., Tan, P., Umapathy, G., Raveendran, M., Alan Harris, R., Gut, I., Gut, M., Lizano, E. & 19 flere, , 2021, I: American Journal of Primatology. 83, 6, 12 s., e23255.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole genome identification, phylogeny and evolution of the cytochrome P450 family 2 (CYP2) sub-families in birds
Almeida, D., Maldonado, E., Khan, I., Silva, L., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Jarvis, E. D., O'Brien, S. J., Johnson, W. E. & Antunes, A., 2016, I: Genome Biology and Evolution. 8, 4, s. 1115-1131 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds
Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Whole-genome sequence of Schistosoma haematobium
Young, N. D., Jex, A. R., Li, B., Liu, S., Yang, L., Xiong, Z., Li, Y., Cantacessi, C., Hall, R. S., Xu, X., Chen, F., Wu, X., Zerlotini, A., Oliveira, G., Hofmann, A., Zhang, G., Fang, X., Kang, Y., Campbell, B. E., Loukas, A. & 8 flere, , 2012, I: Nature Genetics. 44, 2, s. 221-225 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole-genome sequence of the Tibetan frog Nanorana parkeri and the comparative evolution of tetrapod genomes
Sun, Y-B., Xiong, Z-J., Xiang, X-Y., Liu, S-P., Zhou, W-W., Tu, X-L., Zhong, L., Wang, L., Wu, D-D., Zhang, B-L., Zhu, C-L., Yang, M-M., Chen, H-M., Li, F., Zhou, L., Feng, S-H., Huang, C., Zhang, G., Irwin, D., Hillis, D. M. & 5 flere, , 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112, 11, s. E1257-E1262 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Why sequence all eukaryotes?
Blaxter, M., Archibald, J. M., Childers, A. K., Coddington, J. A., Crandall, K. A., Di Palma, F., Durbin, R., Edwards, S. V., Graves, J. A. M., Hackett, K. J., Hall, N., Jarvis, E. D., Johnson, R. N., Karlsson, E. K., Kress, W. J., Kuraku, S., Lawniczak, M. K. N., Lindblad-Toh, K., Lopez, J. V., Moran, N. A. & 7 flere, , 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 4, 9 s., e2115636118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 40294134
Flest downloads
-
3206
downloads
Molecular traces of alternative social organization in a termite genome
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3123
downloads
Caste-specific RNA editomes in the leaf-cutting ant Acromyrmex echinatior
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2707
downloads
Two Antarctic penguin genomes reveal insights into their evolutionary history and molecular changes related to the Antarctic environment
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet