Thorfinn Sand Korneliussen
Lektor
Section for Geogenetics
Øster Voldgade 5-7
1350 København K
- 2024
- Udgivet
100 ancient genomes show repeated population turnovers in Neolithic Denmark
Allentoft, M. E., Sikora, M., Fischer, A., Sjögren, K-G., Ingason, A., Macleod, R., Rosengren, A., Schulz Paulsson, B., Jørkov, M. L. S., Novosolov, M., Stenderup, J., Price, T. D., Mortensen, M. F., Nielsen, A. B., Hede, M. U., Sørensen, L., Nielsen, P. O., Rasmussen, P., Jensen, T. Z. T., Refoyo-Martínez, A. & 48 flere, , 2024, I: Nature. 625, 7994, s. 329-337 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Elevated genetic risk for multiple sclerosis emerged in steppe pastoralist populations
Barrie, W., Yang, Y., Irving-Pease, E. K., Attfield, K. E., Scorrano, G., Jensen, L. T., Armen, A. P., Dimopoulos, E. A., Stern, A., Refoyo-Martinez, A., Pearson, A., Ramsøe, A., Gaunitz, C., Demeter, F., Jørkov, M. L. S., Møller, S. B., Springborg, B., Klassen, L., Hyldgård, I. M., Wickmann, N. & 11 flere, , 2024, I: Nature. 625, 7994, s. 321-328Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomics of post-glacial western Eurasia
Allentoft, M. E., Sikora, M., Refoyo-Martínez, A., Irving-Pease, E. K., Fischer, A., Barrie, W., Ingason, A., Stenderup, J., Sjögren, K-G., Pearson, A., da Mota, B. S., Paulsson, B. S., Halgren, A., Macleod, R., Jørkov, M. L. S., Demeter, F., Sørensen, L., Nielsen, P. O., Henriksen, R. A., Vimala, T. & 144 flere, , 2024, I: Nature. 625, 7994, s. 301-311Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
NGSNGS: next-generation simulator for next-generation sequencing data
Henriksen, Rasmus Henrik Amund, Zhao, Lei & Korneliussen, Thorfinn Sand, 2023, I: Bioinformatics. 39, 1, 2 s., btad041.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The transcriptional and regulatory identity of erythropoietin producing cells
Kragesteen, B. K., Giladi, A., David, E., Halevi, S., Geirsdóttir, L., Lempke, O. M., Li, B., Bapst, A. M., Xie, K., Katzenelenbogen, Y., Dahl, S. L., Sheban, F., Gurevich-Shapiro, A., Zada, M., Phan, T. S., Avellino, R., Wang, S-Y., Barboy, O., Shlomi-Loubaton, S., Winning, S. & 15 flere, , 2023, I: Nature Medicine. 29, 5, s. 1191-1200Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
ngsLCA — A toolkit for fast and flexible lowest common ancestor inference and taxonomic profiling of metagenomic data
Wang, Yucheng, Korneliussen, Thorfinn Sand, Holman, Luke Earl, Manica, A. & Pedersen, Mikkel Winther, 2022, I: Methods in Ecology and Evolution. 13, 12, s. 2699-2708 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A 2-million-year-old ecosystem in Greenland uncovered by environmental DNA
Kjær, K. H., Pedersen, M. W., De Sanctis, B., De Cahsan, B., Korneliussen, T. S., Michelsen, C. S., Sand, K. K., Jelavić, S., Ruter, A. H., Schmidt, A. M. A., Kjeldsen, K. K., Tesakov, A. S., Snowball, I., Gosse, J. C., Alsos, I. G., Wang, Y., Dockter, C., Rasmussen, M., Jørgensen, M. E., Skadhauge, B. & 19 flere, , 2022, I: Nature. 612, 7939, s. 283-291 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DistAngsd: Fast and Accurate Inference of Genetic Distances for Next-Generation Sequencing Data
Zhao, Lei, Nielsen, Rasmus & Korneliussen, Thorfinn Sand, 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 6, 14 s., msac119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Estimation of site frequency spectra from low-coverage sequencing data using stochastic EM reduces overfitting, runtime, and memory usage
Rasmussen, Malthe Sebro, Garcia Erill, Genís, Korneliussen, Thorfinn Sand, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2022, I: Genetics. 222, 4, 15 s., iyac148.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast and accurate estimation of multidimensional site frequency spectra from low-coverage high-throughput sequencing data
Mas-Sandoval, A., Pope, N. S., Nielsen, Knud Nor, Altinkaya, Isin, Fumagalli, M. & Korneliussen, Thorfinn Sand, 2022, I: GigaScience. 11, 9 s., giac032.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic risk for Multiple Sclerosis originated in Pastoralist Steppe populations
Barrie, W., Yang, Y., Attfield, K. E., Irving-Pease, E., Scorrano, G., Jensen, L. T., Armen, A. P., Dimopoulos, E. A., Stern, A., Refoyo-Martínez, A., Ramsøe, A., Gaunitz, C., Demeter, F., Jørkov, M. L. S., Møller, S. B., Springborg, B., Klassen, L., Hyldgård, I. M., Wickmann, N., Vinner, L. & 9 flere, , 2022, bioRxiv, 55 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
LocalNgsRelate: a software tool for inferring IBD sharing along the genome between pairs of individuals from low-depth NGS data
Severson, A. L., Korneliussen, Thorfinn Sand & Moltke, Ida, 2022, I: Bioinformatics. 38, 4, s. 1159-1161 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling the spatiotemporal spread of beneficial alleles using ancient genomes
Muktupavela, Rasa Audange, Petr, Martin, Ségurel, L., Korneliussen, Thorfinn Sand, Novembre, J. & Racimo, Fernando, 2022, I: eLife. 11, 33 s., e73767.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population Genomics of Stone Age Eurasia
Allentoft, M. E., Sikora, M., Refoyo-Martínez, A., Irving-Pease, E. K., Fischer, A., Barrie, W., Ingason, A., Stenderup, J., Sjögren, K-G., Pearson, A., Mota, B., Paulsson, B. S., Halgren, A., Macleod, R., Schjellerup Jørkov, M. L., Demeter, F., Novosolov, M., Sørensen, L., Nielsen, P-O., Henriksen, R. H. A. & 143 flere, , 2022, s. 1-71, (bioRxiv).Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Reply to: When did mammoths go extinct?
Wang, Y., Prohaska, A., Dong, H., Alberti, A., Alsos, I. G., Beilman, D. W., Bjørk, A. A., Cao, J., Cherezova, A. A., Coissac, E., De Sanctis, B., Denoeud, F., Dockter, C., Durbin, R., Edwards, M. E., Edwards, N. R., Esdale, J., Fedorov, G. B., Fernandez-Guerra, A., Froese, D. G. & 32 flere, , 2022, I: Nature. 612, 7938, s. E4-E6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Selection Landscape and Genetic Legacy of Ancient Eurasians
Irving-Pease, E., Refoyo Martínez, A., Ingason, A., Pearson, A., Fischer, A., Barrie, W., Sjögren, K-G., Halgren, A. S., Macleod, R., Demeter, F., Henriksen, R. H. A., Vimala, T., McColl, H., Vaughn, A., Stern, A. J., Speidel, L., Scorrano, G., Ramsøe, A., Schork, A. J., Rosengren, A. & 12 flere, , 2022, bioRxiv, 26 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
The formation of avian montane diversity across barriers and along elevational gradients
Pujolar, J. M., Blom, M. P. K., Hart Reeve, A., Kennedy, J. D., Marki, P. Z., Korneliussen, Thorfinn Sand, Freeman, B. G., Sam, K., Linck, E., Haryoko, T., Iova, B., Koane, B., Maiah, G., Paul, L., Irestedt, M. & Jønsson, Knud Andreas, 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 268.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
- Udgivet
A reference-free approach to analyse RADseq data using standard next generation sequencing toolkits
Heller, Rasmus, Nursyifa, Casia, Garcia Erill, Genís, Salmona, J., Chikhi, L., Meisner, Jonas, Korneliussen, Thorfinn Sand & Albrechtsen, Anders, 2021, I: Molecular Ecology Resources. 21, 4, s. 1085-1097 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extensive Genome-Wide Phylogenetic Discordance Is Due to Incomplete Lineage Sorting and Not Ongoing Introgression in a Rapidly Radiated Bryophyte Genus
Meleshko, O., Martin, M. D., Korneliussen, Thorfinn Sand, Schröck, C., Lamkowski, P., Schmutz, J., Healey, A., Piatkowski, B. T., Shaw, A. J., Weston, D. J., Flatberg, K. I., Szövényi, P., Hassel, K. & Stenøien, H. K., 2021, I: Molecular Biology and Evolution. 38, 7, s. 2750-2766 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identifying a living great-grandson of the Lakota Sioux leader Tatanka Iyotake (Sitting Bull)
Moltke, Ida, Korneliussen, Thorfinn Sand, Seguin-Orlando, A., Moreno Mayar, J. Víctor, LaPointe, E., Billeck, W. & Willerslev, Eske, 2021, I: Science Advances. 7, 44, 7 s., eabh2013.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Late Quaternary dynamics of Arctic biota from ancient environmental genomics: [+ Correction]
Wang, Y., Pedersen, M. W., Alsos, I. G., De Sanctis, B., Racimo, F., Prohaska, A., Coissac, E., Owens, H. L., Merkel, M. K. F., Fernandez-Guerra, A., Rouillard, A., Lammers, Y., Alberti, A., Denoeud, F., Money, D., Ruter, A. H., McColl, H., Larsen, N. K., Cherezova, A. A., Edwards, M. E. & 30 flere, , 2021, I: Nature. 600, 7887, s. 86–92 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
A likelihood method for estimating present-day human contamination in ancient male samples using low-depth X-chromosome data
Moreno-Mayar, J. V., Korneliussen, Thorfinn Sand, Dalal, J., Renaud, Gabriel, Albrechtsen, Anders, Nielsen, Rasmus & Malaspinas, A., 2020, I: Bioinformatics. 36, 3, s. 828-841 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient Jomon genome sequence analysis sheds light on migration patterns of early East Asian populations
Gakuhari, T., Nakagome, S., Rasmussen, S., Allentoft, M. E., Sato, T., Korneliussen, T., Chuinneagain, B. N., Matsumae, H., Koganebuchi, K., Schmidt, R., Mizushima, S., Kondo, O., Shigehara, N., Yoneda, M., Kimura, R., Ishida, H., Masuyama, T., Yamada, Y., Tajima, A., Shibata, H. & 8 flere, , 2020, I: Communications Biology . 3, 1, 10 s., 437.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomics of the Viking world: [incl. correction]
Margaryan, A., Lawson, D. J., Sikora, M., Racimo, F., Rasmussen, S., Moltke, I., Cassidy, L. M., Jørsboe, E., Ingason, A., Pedersen, M. W., Korneliussen, T., Wilhelmson, H., Buś, M. M., de Barros Damgaard, P., Martiniano, R., Renaud, G., Bhérer, C., Moreno-Mayar, J. V., Fotakis, A. K., Allen, M. & 30 flere, , 2020, I: Nature. 585, 7825, s. 390-396 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 41892155
Flest downloads
-
5477
downloads
Natural selection affects multiple aspects of genetic variation at putatively peutral sites across the human genome
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3402
downloads
SNP calling, genotype calling, and sample allele frequency estimation from new-generation sequencing data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3166
downloads
Calculation of Tajima's D and other neutrality test statistics from low depth next-generation sequencing data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet