Bent Petersen
Seniorforsker
Section for Hologenomics
Øster Farimagsgade 5
1353 København K
- Udgivet
An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms
Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, Patrick Denis, Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diversity, prevalence, and longitudinal occurrence of type II toxin-antitoxin systems of Pseudomonas aeruginosa infecting cystic fibrosis lungs
Andersen, Sandra Breum, Ghoul, M., Griffin, A. S., Petersen, Bent, Johansen, Helle Krogh & Molin, S., 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 12 s., 1180.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Large haploblocks underlie rapid adaptation in the invasive weed Ambrosia artemisiifolia
Battlay, P., Wilson, J., Bieker, V. C., Lee, C., Prapas, D., Petersen, Bent, Craig, S., van Boheemen, L., Scalone, R., de Silva, N. P., Sharma, A., Konstantinović, B., Nurkowski, K. A., Rieseberg, L. H., Connallon, T., Martin, M. D. & Hodgins, K. A., 2023, I: Nature Communications. 14, 15 s., 1717.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Uncovering the genomic basis of an extraordinary plant invasion
Bieker, V. C., Battlay, P., Petersen, B., Sun, X., Wilson, J., Brealey, J. C., Bretagnolle, F., Nurkowski, K., Lee, C., Barreiro, F. S., Owens, G. L., Lee, J. Y., Kellner, F. L., van Boheeman, L., Gopalakrishnan, S., Gaudeul, M., Mueller-Schaerer, H., Lommen, S., Karrer, G., Chauvel, B. & 8 flere, , 2022, I: Science Advances. 8, 34, 18 s., eabo5115.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The first draft reference genome of the American mink (Neovison vison)
Cai, Z., Petersen, Bent, Sahana, G., Madsen, L. B., Larsen, K., Thomsen, Bo Victor, Bendixen, C., Lund, M. S., Guldbrandtsen, B. & Panitz, F., 2017, I: Scientific Reports. 7, 1, 10 s., 14564 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genomic basis of the plant island syndrome in Darwin’s giant daisies
Cerca, J., Petersen, B., Lazaro-Guevara, J. M., Rivera-Colón, A., Birkeland, S., Vizueta, J., Li, S., Li, Q., Loureiro, J., Kosawang, C., Díaz, P. J., Rivas-Torres, G., Fernández-Mazuecos, M., Vargas, P., McCauley, R. A., Petersen, G., Santos-Bay, L., Wales, N., Catchen, J. M., Machado, D. & 9 flere, , 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3729.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Tetragnatha kauaiensis Genome Sheds Light on the Origins of Genomic Novelty in Spiders
Cerca, J., Armstrong, E. E., Vizueta Moraga, Joel, Fernández, R., Dimitrov, D., Petersen, Bent, Prost, S., Rozas, J., Petrov, D. & Gillespie, R. G., 2021, I: Genome Biology and Evolution. 13, 12, 17 s., evab262.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Gene expression plasticity across hosts of an invasive scale insect species
Christodoulides, N., Van Dam, A. R., Peterson, D. A., Frandsen, R. J. N., Mortensen, U. H., Petersen, Bent, Rasmussen, Simon, Normark, B. B. & Hardy, N. B., 2017, I: PLoS ONE. 12, 5Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary genomics and conservation of the endangered Przewalski's horse
Der Sarkissian, C., Ermini, L., Schubert, M., Yang, M. A., Sanz, P. L., Fumagalli, M., Jónsson, H., Bar-Gal, G. K., Albrechtsen, A., Garrett Vieira, F. J., Petersen, B., Ginolhac, A., Seguin-Orlando, A., Magnussen, K., Fages, A. A., Gamba, C., Lorente-Galdos, B., Polani, S., Steiner, C., Neuditschko, M. & 17 flere, , 2015, I: Current Biology. 25, 19, s. 2577-2583 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics
Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, , 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet
Gelabert, P., Sandoval-Velasco, M., Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, A., Stiller, J., de-Dios, T., Fang, Q., Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, B., Olsen, R-A., Navarro, A., Deng, Y. & 6 flere, , 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The tuatara genome reveals ancient features of amniote evolution
Gemmell, N. J., Rutherford, K., Prost, S., Tollis, M., Winter, D., Macey, J. R., Adelson, D. L., Suh, A., Bertozzi, T., Grau, J. H., Organ, C., Gardner, P. P., Muffato, M., Patricio, M., Billis, K., Martin, F. J., Flicek, P., Petersen, B., Kang, L., Michalak, P. & 31 flere, , 2020, I: Nature. 584, s. 403–409, +19 26 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The population genomic legacy of the second plague pandemic
Gopalakrishnan, S., Ebenesersdóttir, S. S., Lundstrøm, I. K. C., Turner-Walker, G., Moore, K. H. S., Luisi, P., Margaryan, A., Martin, M. D., Ellegaard, M. R., Magnússon, Ó., Sigurðsson, Á., Snorradóttir, S., Magnúsdóttir, D. N., Laffoon, J. E., van Dorp, L., Liu, X., Moltke, I., Ávila-Arcos, M. C., Schraiber, J. G., Rasmussen, S. & 40 flere, , 2022, I: Current Biology. 32, 21, s. 4743-4751.e6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics
Gopalakrishnan, Shyam, Samaniego Castruita, J. A., Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Räikkönen, J., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Larson, G., Orlando, L. A. A., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes, Dalén, L. & Gilbert, M Thomas P, 2017, I: BMC Genomics. 18, 11 s., 495.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interspecific Gene Flow Shaped the Evolution of the Genus Canis
Gopalakrishnan, S., Sinding, M. H. S., Ramos-Madrigal, J., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Vieira, F. G., Carøe, C., Montero, M. D. M., Kuderna, L., Serres, A., González-Basallote, V. M., Liu, Y. H., Wang, G. D., Marques-Bonet, T., Mirarab, S., Fernandes, C., Gaubert, P., Koepfli, K. P., Budd, J., Rueness, E. K. & 7 flere, , 2018, I: Current Biology. 28, 21, s. 3441-3449Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Complete mitochondrial genome of the Oriental Hornet, Vespa orientalis F. (Hymenoptera: Vespidae)
Haddad, N. J., Al-Nakeeb, K. A. A., Petersen, Bent, Dalén, L., Blom, N. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2017, I: Mitochondrial DNA Part B: Resources. 2, 1, s. 139-140 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomics of the island thrush elucidates one of earth's great archipelagic radiations
Hart Reeve, A., Gower, Graham, Pujolar, J. M., Smith, B. T., Petersen, Bent, Olsson, U., Haryoko, T., Koane, B., Maiah, G., Blom, M. P. K., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Racimo, Fernando & Jønsson, Knud Andreas, 2023, I: Evolution Letters. 7, 1, s. 24-36 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomics of the island thrush elucidates one of earth’s great archipelagic radiations
Hart Reeve, A., Gower, Graham, Pujolar, J. M., Smith, B. T., Petersen, Bent, Olsson, U., Haryoko, T., Koane, B., Maiah, G., Blom, M. P. K., Ericson, P. G. P., Irestedt, M., Racimo, Fernando & Jønsson, Knud Andreas, 2022, bioRxiv, 46 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
Global monitoring of antimicrobial resistance based on metagenomics analyses of urban sewage
Hendriksen, R. S., Munk, P., Njage, P., van Bunnik, B., McNally, L., Lukjancenko, O., Röder, T., Nieuwenhuijse, D., Pedersen, S. K., Kjeldgaard, J., Kaas, R. S., Clausen, P. T. L. C., Vogt, J. K., Leekitcharoenphon, P., van de Schans, M. G. M., Zuidema, T., de Roda Husman, A. M., Rasmussen, S., Petersen, B., Bego, A. & 108 flere, , 2019, I: Nature Communications. 10, 1, 12 s., 1124.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
NetSurfP-3.0: accurate and fast prediction of protein structural features by protein language models and deep learning
Høie, M. H., Kiehl, E. N., Petersen, Bent, Nielsen, M., Winther, Ole, Nielsen, H., Hallgren, J. & Marcatili, P., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W510-W515 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds
Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Assembly and analysis of 100 full MHC haplotypes from the Danish population
Jensen, J. M., Villesen, P., Friborg, R. M., Mailund, T., Besenbacher, S., Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R. & 39 flere, , sep. 2017, I: Genome Research. 27, 9, s. 1597-1607 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmodium falciparum var genes expressed in children with severe malaria encode CIDRα1 domains
Jespersen, Jakob Schmidt, Wang, Christian William, Mkumbaye, S. I., Minja, D. T., Petersen, Bent, Turner, Louise, Petersen, J. E., Lusingu, J. P., Theander, Thor Grundtvig & Lavstsen, Thomas, 2016, I: EMBO Molecular Medicine. 8, 8, s. 839-850 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Whole Genome Sequence and mRNA Transcriptome of the Tropical Cyclopoid Copepod Apocyclops royi
Jorgensen, T. S., Nielsen, B. L. H., Petersen, Bent, Browne, Patrick Denis, Hansen, B. W. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2019, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 9, 5, s. 1295-1302Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SinEx DB 2.0 update 2020: database for eukaryotic single-exon coding sequences
Jorquera, R., Gonzalez, C., Clausen, P. T. L. C., Petersen, Bent & Holmes, D. S., 2021, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2021, 5 s., baab002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 203154234
Flest downloads
-
471
downloads
Comparative performance of the BGISEQ-500 vs Illumina HiSeq2500 sequencing platforms for palaeogenomic sequencing
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
391
downloads
Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
285
downloads
The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet