Bent Petersen
Seniorforsker
Section for Hologenomics
Øster Farimagsgade 5
1353 København K
- Udgivet
"Out of the Can": A Draft Genome Assembly, Liver Transcriptome, and Nutrigenomics of the European Sardine, Sardina pilchardus
Machado, A. M., Tørresen, O. K., Kabeya, N., Couto, A., Petersen, Bent, Felicio, M., Campos, P. F., Fonseca, E., Bandarra, N., Lopes-Marques, M., Ferraz, R., Ruivo, R., Fonseca, M. M., Jentoft, S., Monroig, Ó., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Castro, L. F. C., 2018, I: Genes. 9, 10, s. 1-13 485.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmodium falciparum var genes expressed in children with severe malaria encode CIDRα1 domains
Jespersen, Jakob Schmidt, Wang, Christian William, Mkumbaye, S. I., Minja, D. T., Petersen, Bent, Turner, Louise, Petersen, J. E., Lusingu, J. P., Theander, Thor Grundtvig & Lavstsen, Thomas, 2016, I: EMBO Molecular Medicine. 8, 8, s. 839-850 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux
da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, , 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A generic method for assignment of reliability scores applied to solvent accessibility predictions
Petersen, Bent, Petersen, T. N., Andersen, P., Nielsen, M. & Lundegaard, C., 2009, I: BMC Structural Biology. 9, 10 s., 51.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Accurate genotyping across variant classes and lengths using variant graphs
Sibbesen, Jonas Andreas, Maretty, L., Krogh, Anders, Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Guo, X., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Wang, J. & Brunak, Søren, 2018, I: Nature Genetics. 50, s. 1054-1059 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms
Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, Patrick Denis, Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Analysis of 62 hybrid assembled human Y chromosomes exposes rapid structural changes and high rates of gene conversion
Skov, L., Schierup, M. H., Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Sørensen, L. M., Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Belling, K. G., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Rasmussen, Simon, Kristiansen, Karsten & Brunak, Søren, 2017, I: PLOS Genetics. 13, 8, s. e1006834Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Antibodies to intercellular adhesion molecule 1-binding Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1-DBLβ are biomarkers of protective immunity to malaria in a cohort of young children from Papua New Guinea
Tessema, S. K., Utama, D., Chesnokov, O., Hodder, A. N., Lin, C. S., Harrison, G. L. A., Jespersen, Jakob Schmidt, Petersen, Bent, Tavul, L., Siba, P., Kwiatkowski, D., Lavstsen, Thomas, Hansen, D. S., Oleinikov, A. V., Mueller, I. & Barry, A. E., 1 aug. 2018, I: Infection and Immunity. 86, 8, s. 1-14 14 s., e00485-17.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition
Sinding, M. H. S., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, F. G., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Andersen-Ranberg, E. U., Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, E., Skoglund, P. & 15 flere, , 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Assembly and analysis of 100 full MHC haplotypes from the Danish population
Jensen, J. M., Villesen, P., Friborg, R. M., Mailund, T., Besenbacher, S., Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R. & 39 flere, , sep. 2017, I: Genome Research. 27, 9, s. 1597-1607 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Benchmarking the HLA typing performance of Polysolver and Optitype in 50 Danish parental trios
Matey-Hernandez, M. L., Danish Pan Genome Consortium, D. P. G. C., Brunak, Søren, Izarzugaza, J. M. G., Sørensen, L. M., Petersen, Bent, Sibbesen, Jonas Andreas, Liu, S., Belling, K. G., Have, C. T., Bork-Jensen, J., Sun, J., Hansen, Torben, Krogh, Anders, Sørensen, Thorkild I.A., Pedersen, Oluf Borbye, Wang, J., Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff & Kristiansen, Karsten, 2018, I: BMC Bioinformatics. 19, s. 1-12 239.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative analyses identify genomic features potentially involved in the evolution of birds-of-paradise
Prost, S., Armstrong, E. E., Nylander, J., Thomas, G. W. C., Suh, A., Petersen, Bent, Dalen, L., Benz, B. W., Blom, M. P. K., Palkopoulou, E., Ericson, P. G. P. & Irestedt, M., 2019, I: GigaScience. 8, 5, 12 s., giz003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative performance of the BGISEQ-500 vs Illumina HiSeq2500 sequencing platforms for palaeogenomic sequencing
Mak, Sarah Siu Tze, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Geng, C., Liu, Shanlin, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kuderna, L. F. K., Zhang, W., Fu, S., Vieira, Filipe Garrett, Germonpré, M., Bocherens, H., Fedorov, S., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, T., Marques-Bonet, T., KU, thw266, Jiang, H. & Gilbert, M Thomas P, aug. 2017, I: GigaScience. 6, 8, s. 1–13 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete Genome Sequence of Salmonella enterica Bacteriophage PRF-SP1
Mutusamy, P., Jothi, S. J., Lee, S. Y., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Clokie, M. R. J., Loke, S., Millard, A., Parimannan, Sivachandran & Rajandas, Heera, 2021, I: Microbiology resource announcements. 10, 47, 3 s., e00965-21.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete genome sequence of plant growth-promoting Bacillus stratosphericus AIMST-CREST02 isolated from bulk soil of a paddy field
Sivaprakasam, S., Khan, N. A. M. A., Fan, T. Y., Kumarasan, Y., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Hata, E. M., Vadamalai, G., Parimannan, Sivachandran & Rajandas, Heera, 2024, I: Microbiology resource announcements. 13, 4, 3 s., e0113723.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Complete mitochondrial genome of the Oriental Hornet, Vespa orientalis F. (Hymenoptera: Vespidae)
Haddad, N. J., Al-Nakeeb, K. A. A., Petersen, Bent, Dalén, L., Blom, N. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2017, I: Mitochondrial DNA Part B: Resources. 2, 1, s. 139-140 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes
Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, A-A., Rivas-González, I., Duchêne, D. A., Fang, Q., Deng, Y., Kozlov, A., Stamatakis, A., Claramunt, S., Nguyen, J. M. T., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Haag, J., Houde, P., Cracraft, J., Balaban, M., Mai, U., Chen, G., Gao, R. & 32 flere, , 1 apr. 2024, I: Nature.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Connecting moss lipid droplets to patchoulol biosynthesis
Peramuna, A., Bae, H., Quiñonero López, C., Fromberg, A., Petersen, Bent & Simonsen, H. T., 2020, I: PLoS ONE. 15, 12, 19 s., e0243620.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics
Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, , 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diversity, prevalence, and longitudinal occurrence of type II toxin-antitoxin systems of Pseudomonas aeruginosa infecting cystic fibrosis lungs
Andersen, Sandra Breum, Ghoul, M., Griffin, A. S., Petersen, Bent, Johansen, Helle Krogh & Molin, S., 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 12 s., 1180.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet
Gelabert, P., Sandoval-Velasco, M., Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, A., Stiller, J., de-Dios, T., Fang, Q., Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, B., Olsen, R-A., Navarro, A., Deng, Y. & 6 flere, , 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary genomics and conservation of the endangered Przewalski's horse
Der Sarkissian, C., Ermini, L., Schubert, M., Yang, M. A., Sanz, P. L., Fumagalli, M., Jónsson, H., Bar-Gal, G. K., Albrechtsen, A., Garrett Vieira, F. J., Petersen, B., Ginolhac, A., Seguin-Orlando, A., Magnussen, K., Fages, A. A., Gamba, C., Lorente-Galdos, B., Polani, S., Steiner, C., Neuditschko, M. & 17 flere, , 2015, I: Current Biology. 25, 19, s. 2577-2583 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
From Trees to Clouds: PhageClouds for Fast Comparison of ∼640,000 Phage Genomic Sequences and Host-Centric Visualization Using Genomic Network Graphs
Rangel Piñeros, Guillermo Andres, Millard, A., Michniewski, S., Scanlan, D., Sirén, K., Reyes, A., Petersen, Bent, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 2, 4, s. 194-203Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Gene expression plasticity across hosts of an invasive scale insect species
Christodoulides, N., Van Dam, A. R., Peterson, D. A., Frandsen, R. J. N., Mortensen, U. H., Petersen, Bent, Rasmussen, Simon, Normark, B. B. & Hardy, N. B., 2017, I: PLoS ONE. 12, 5Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genome analyses show strong selection on coloration, morphological and behavioral phenotypes in birds-of-paradise
Prost, S., Armstrong, E. E., Nylander, J., Thomas, G. W. C., Suh, A., Petersen, Bent, Dalen, L., Benz, B. W., Blom, M. P. K., Palkopoulou, E., Ericson, P. G. P. & Irestedt, M., 16 maj 2018, (Accepteret/In press) I: bioRxiv.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 203154234
Flest downloads
-
471
downloads
Comparative performance of the BGISEQ-500 vs Illumina HiSeq2500 sequencing platforms for palaeogenomic sequencing
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
392
downloads
Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
285
downloads
The wolf reference genome sequence (Canis lupus lupus) and its implications for Canis spp. population genomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet