Tom Gilbert
Professor
- 2020
- Udgivet
Using paleo-archives to safeguard biodiversity under climate change
Fordham, D. A., Jackson, S. T., Brown, S. C., Huntley, B., Dahl-Jensen, Dorthe, Gilbert, M Thomas P, Otto-Bliesner, B., Svensson, Anders, Theodoridis, S., Wilmshurst, J. M., Buettel, J. C., Canteri, Elisabetta, McDowell, M., Orlando, L. A. A., Pilowsky, Julia Aaron, Rahbek, Carsten & Nogues, David Bravo, 28 aug. 2020, I: Science. 369, 6507, s. 1072-1083 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux
da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, , 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss
Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient DNA suggests modern wolves trace their origin to a Late Pleistocene expansion from Beringia
Loog, L., Thalmann, O., Sinding, M. H. S., Schuenemann, V. J., Perri, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Witt, K. E., Samaniego Castruita, J. A., Velasco, M. S., Lundstrøm, I. K. C., Wales, N., Sonet, G., Frantz, L., Schroeder, H., Budd, J., Jimenez, E. L., Fedorov, S., Gasparyan, B., Kandel, A. W. & 16 flere, , 2020, I: Molecular Ecology. 29, 9, s. 1596-1610 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition
Sinding, M. H. S., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, F. G., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Andersen-Ranberg, E. U., Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, E., Skoglund, P. & 15 flere, , 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification
Bohmann, Kristine, Mirarab, S., Bafna, V. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Molecular Ecology. 29, 14, s. 2521-2534Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bone biodeterioration - The effect of marine and terrestrial depositional environments on early diagenesis and bone bacterial community
Eriksen, A. M. H., Nielsen, Tue Kjærgaard, Matthiesen, H., Carøe, C., Hansen, Lars Hestbjerg, Gregory, D. J., Turner-Walker, G., Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: PLoS ONE. 15, 10 October, 24 s., e0240512.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA metabarcoding and spatial modelling link diet diversification with distribution homogeneity in European bats
Alberdi, Antton, Razgour, O., Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Novella-Fernandez, R., Aihartza, J., Budinski, I., Garin, I., Ibanez, C., Izagirre, E., Rebelo, H., Russo, D., Vlaschenko, A., Zhelyazkova, V., Zrncic, V. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Nature Communications. 11, 8 s., 1154.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA-Based Arthropod Diversity Assessment in Amazonian Iron Mine Lands Show Ecological Succession Towards Undisturbed Reference Sites
Lynggaard, Christina Islas, Yu, D. W., Oliveira, G., Caldeira, C. F., Ramos, S. J., Ellegaard, M. R., Gilbert, M Thomas P, Gastauer, M. & Bohmann, Kristine, 2020, I: Frontiers in Ecology and Evolution. 8, 15 s., 590976.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Darwin's Fancy Revised: An Updated Understanding of the Genomic Constitution of Pigeon Breeds
Antunes Pacheco, George, van Grouw, H., Shapiro, M. D., Gilbert, M Thomas P & Vieira, Filipe Garrett, 2020, I: Genome Biology and Evolution. 12, 3, s. 136-150 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics
Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, , 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet
Gelabert, P., Sandoval-Velasco, M., Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, A., Stiller, J., de-Dios, T., Fang, Q., Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, B., Olsen, R-A., Navarro, A., Deng, Y. & 6 flere, , 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GC bias affects genomic and metagenomic reconstructions, underrepresenting GC-poor organisms
Browne, Patrick Denis, Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Aggerholm, A., Gilbert, M Thomas P, Puetz, Lara Christine, Rasmussen, M., Zervas, A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: GigaScience. 9, 2, 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomes of Pleistocene Siberian Wolves Uncover Multiple Extinct Wolf Lineages
Ramos-Madrigal, J., Sinding, M-H. S., Carøe, C., Mak, S. S. T., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Fedorov, S., Kandyba, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Feuerborn, T. R., Pitulko, V. V., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Larson, G., Frantz, L. A. F., Willerslev, E., Meldgaard, M. & 7 flere, , 2020, I: Current biology : CB. 31, s. 198-206Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic Adaptations and Evolutionary History of the Extinct Scimitar-Toothed Cat, Homotherium latidens
Barnett, R., Westbury, M. V., Sandoval-Velasco, M., Vieira, F. G., Jeon, S., Zazula, G., Martin, M. D., Ho, S. Y. W., Mather, N., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Zepeda-Mendoza, M. L., Antunes, A., Baez, A. C., De Cahsan, B., Larson, G., O’Brien, S. J., Eizirik, E., Johnson, W. E. & 11 flere, , 2020, I: Current Biology. 30, s. 5018-5025Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic and proteomic evidence for Mycobacterium leprae in human medieval dental calculus from Trondheim, Norway
Vagene, A. J., Fotaki, Anna Katerina, Denham, S. D., Orbegozo, M., Mackie, Meaghan, Olsen, Jesper Velgaard, Cappellini, Enrico, Christophersen, A. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: American Journal of Physical Anthropology. 171, s. 291 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning
- Udgivet
Hi-C chromosome conformation capture sequencing of avian genomes using the BGISEQ-500 platform
Sandoval-Velasco, Marcela, Rodríguez, Juan Antonio, Estrada, C. P., Zhang, G., Aiden, E. L., Marti-Renom, M. A., Gilbert, M Thomas P & Smith, O., 2020, I: GigaScience. 9, 8, 7 s., giaa087.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Historical isolation facilitates species radiation by sexual selection: Insights from Chorthippus grasshoppers
Nolen, Z. J., Yildirim, B., Irisarri, I., Liu, Shanlin, Groot Crego, C., Amby, Daniel Buchvaldt, Mayer, F., Gilbert, M Thomas P & Pereira, R. J., 2020, I: Molecular Ecology. 29, 24, s. 4985-5002Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Holo-Omics: Integrated Host-Microbiota Multi-omics for Basic and Applied Biological Research
Jessen, Lasse Nyholm, Koziol, Adam Leslie, Marcos, S., Botnen, A. B., Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Gopalakrishnan, Shyam, Limborg, Morten Tønsberg, Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2020, I: iScience. 23, 8, s. 1-16 101414.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular identification and phylogenetic analysis of a Callosciurus notatus complete mitogenome from Peninsular Malaysia
Jahari, P. N. S., Mohd Azman, S., Munian, K., Ahmad Ruzman, N. H., Shamsir, M. S., Richter, S. R., Gilbert, M Thomas P & Mohd Salleh, F., 2020, I: Mitochondrial DNA Part B: Resources. 5, 3, s. 3022-3024 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multi-omic detection of Mycobacterium leprae in archaeological human dental calculus
Fotaki, Anna Katerina, Denham, S. D., Mackie, Meaghan, Iraeta Orbegozo, Miren, Mylopotamitaki, Dorothea, Gopalakrishnan, Shyam, Sicheritz-Pontén, Thomas, Olsen, Jesper Velgaard, Cappellini, Enrico, KU, thw266, Christophersen, A., Gilbert, M Thomas P & Vågene, Åshild Joanne, 2020, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 375, 1812, 10 s., 20190584.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Near-Random Distribution of Chromosome-Derived Circular DNA in the Condensed Genome of Pigeons and the Larger, More Repeat-Rich Human Genome
Møller, H. D., Ramos Madrigal, Jazmin, Prada Luengo, Inigo, Gilbert, M Thomas P & Regenberg, Birgitte, 2020, I: Genome Biology and Evolution. 12, 2, s. 3762-3777 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogeny of Neotropical Seirinae (Collembola, Entomobryidae) based on mitochondrial genomes
Godeiro, N. N., Antunes Pacheco, George, Liu, Shanlin, Gioia Cipola, N., Berbel-Filho, W. M., Zhang, F., Gilbert, M Thomas P & Bellini, B. C., 2020, I: Zoologica Scripta. 49, 3, s. 329-339Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmodium vivax Malaria Viewed through the Lens of an Eradicated European Strain
van Dorp, L., Gelabert, P., Rieux, A., de Manuel, M., de-Dios, T., Gopalakrishnan, Shyam, Caroe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Fregel, R., Olalde, I., Escosa, R., Aranda, C., Huijben, S., Mueller, I., Marques-Bonet, T., Balloux, F., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 37, 3, s. 773-785 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomics of the Viking world: [incl. correction]
Margaryan, A., Lawson, D. J., Sikora, M., Racimo, F., Rasmussen, S., Moltke, I., Cassidy, L. M., Jørsboe, E., Ingason, A., Pedersen, M. W., Korneliussen, T., Wilhelmson, H., Buś, M. M., de Barros Damgaard, P., Martiniano, R., Renaud, G., Bhérer, C., Moreno-Mayar, J. V., Fotakis, A. K., Allen, M. & 30 flere, , 2020, I: Nature. 585, 7825, s. 390-396 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pre-extinction Demographic Stability and Genomic Signatures of Adaptation in the Woolly Rhinoceros
Lord, E., Dussex, N., Kierczak, M., Díez-del-Molino, D., Ryder, O. A., Stanton, D. W. G., Gilbert, M. T. P., Sánchez-Barreiro, F., Zhang, G., Sinding, M. H. S., Lorenzen, E. D., Willerslev, E., Protopopov, A., Shidlovskiy, F., Fedorov, S., Bocherens, H., Nathan, S. K. S. S., Goossens, B., van der Plicht, J., Chan, Y. L. & 10 flere, , 2020, I: Current Biology. 30, 19, s. 3871-3879, e1-e7 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid loss of endogenous DNA in pig bone buried in five different environments
Eriksen, A. M. H., Matthiesen, H., Kontopoulos, I., Gregory, D., Snoeck, C., KU, thw266, Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Archaeometry. 62, 4, s. 827-846 20 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Recent mitochondrial lineage extinction in the critically endangered Javan rhinoceros
Margaryan, Ashot, Sinding, Mikkel Holger Strander, Liu, Shanlin, Vieira, Filipe Garrett, Chan, Y. L., Nathan, S. K. S. S., Moodley, Y., Bruford, M. W. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Zoological Journal of the Linnean Society. 190, 1, s. 372-383 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Releasing the microbes from old bones: the effect of different DNA extraction protocols on microbial community profiling
Eriksen, A. M. H., Puetz, Lara Christine, Rocha, C., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: STAR: Science & Technology of Archaeological Research. 6, 1, s. 1-15 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The evolutionary history of extinct and living lions
de Manuel, M., Barnett, R., Sandoval-Velasco, M., Yamaguchi, N., Vieira, F. G., Mendoza, M. L. Z., Liu, S., Martin, M. D., Sinding, M-H. S., Mak, S. S. T., Caroe, C., Liu, S., Guo, C., Zheng, J., Zazula, G., Baryshnikov, G., Eizirik, E., Koepfli, K-P., Johnson, W. E., Antunes, A. & 9 flere, , 2020, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 20, s. 10927-10934 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The first complete mitochondrial genome data of Hippocampus kuda originating from Malaysia
Jahari, P. N. S., Malik, N. F. A., Shamsir, M. S., Gilbert, M Thomas P & Salleh, F. M., 2020, I: Data in Brief. 31, 8 s., 105721.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The secrets of Sobek - A crocodile mummy mitogenome from ancient Egypt
Hekkala, E. R., Aardema, M. L., Narechania, A., Amato, G., Ikram, S., Shirley, M. H., Vliet, K. A., Cunningham, S. W., Gilbert, M Thomas P & Smith, O., 2020, I: Journal of Archaeological Science: Reports. 33, s. 1-10 10 s., 102483.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tracking the history of grapevine cultivation in Georgia by combining geometric morphometrics and ancient DNA
Bouby, L., Wales, N., Jalabadze, M., Rusishvili, N., Bonhomme, V., Ramos Madrigal, Jazmin, Evin, A., Ivorra, S., Lacombe, T., Pagnoux, C., Boaretto, E., Gilbert, M Thomas P, Bacilieri, R., Lordkipanidze, D. & Maghradze, D., 2020, I: Vegetation History and Archaeobotany. 30, s. 63-76 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Using in silico predicted ancestral genomes to improve the efficiency of paleogenome reconstruction
Vieira, Filipe Garrett, Castruita, J. A. S. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Ecology and Evolution. 10, 23, s. 12700-12709Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 12980
Flest downloads
-
6192
downloads
Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5650
downloads
Deep sequencing of RNA from ancient maize kernels
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5255
downloads
True single-molecule DNA sequencing of a pleistocene horse bone
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet