Tim Tolker-Nielsen

Inhibition of Pseudomonas aeruginosa quorum sensing by chemical induction of the MexEF-oprN efflux pump

Kristensen, Rasmus, Andersen, Jens Bo, Rybtke, Morten Levin, Jansen, C. U., Fritz, Blaine Gabriel, Kiilerich, R. O., Uhd, J., Bjarnsholt, Thomas, Qvortrup, K., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Jakobsen, Tim Holm, 2024, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 68, 2

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Role of extracellular matrix components in biofilm formation and adaptation of Pseudomonas ogarae F113 to the rhizosphere environment

Blanco-Romero, E., Garrido-Sanz, D., Durán, D., Rybtke, Morten Levin, Tolker-Nielsen, Tim, Redondo-Nieto, M., Rivilla, R. & Martín, M., 2024, I: Frontiers in Microbiology. 15, 12 s., 1341728.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A genetic switch controls Pseudomonas aeruginosa surface colonization

Manner, C., Dias Teixeira, R., Saha, D., Kaczmarczyk, A., Zemp, R., Wyss, F., Jaeger, T., Laventie, B. J., Boyer, S., Malone, J. G., Qvortrup, K., Andersen, Jens Bo, Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Hiller, S., Drescher, K. & Jenal, U., 2023, I: Nature Microbiology. 8, s. 1520–1533

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Challenges in using transcriptome data to study the c-di-GMP signaling network in Pseudomonas aeruginosa clinical isolates

Gür, M., Erdmann, J., Will, A., Liang, Z., Andersen, Jens Bo, Tolker-Nielsen, Tim & Häussler, S., 2023, I: FEMS Microbes. 4, 10 s., xtad012.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Colistin Enhances Rifampicin's Antimicrobial Action in Colistin-Resistant Pseudomonas aeruginosa Biofilms

Armengol, E., Kragh, K. N., Tolker-Nielsen, Tim, Sierra, J. M., Higazy, Doaa Mohamed Mohamed E, Ciofu, Oana, Viñas, M. & Høiby, Niels, 2023, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 67, 4, e0164122.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Protocol to assess metabolic activity of Pseudomonas aeruginosa by measuring heat flow using isothermal calorimetry

Beilharz, K., Kragh, K. N., Fritz, Blaine Gabriel, Kirkegaard, Julius Bier, Tolker-Nielsen, Tim, Bjarnsholt, Thomas & Lichtenberg, Mads, 2023, I: STAR Protocols. 4, 2, 102269.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Bep gene cluster in Burkholderia cenocepacia H111 codes for a water-insoluble exopolysaccharide essential for biofilm formation

Bellich, B., Terán, L. C., Fazli, M. M., Berti, F., Rizzo, R., Tolker-Nielsen, Tim & Cescutti, P., 2023, I: Carbohydrate Polymers. 301, 120318.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The non-attached biofilm aggregate

Kragh, K. N., Tolker-Nielsen, Tim & Lichtenberg, Mads, 2023, I: Communications Biology . 6, 898.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

The role of individual exopolysaccharides in antibiotic tolerance of Pseudomonas aeruginosa aggregates

Liang, Z., Nilsson, M., Kragh, K. N., Hedal, I., Alcàcer-Almansa, J., Kiilerich, R. O., Andersen, Jens Bo & Tolker-Nielsen, Tim, 2023, I: Frontiers in Microbiology. 14, 1187708.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Cyclic-di-GMP signaling controls metabolic activity in Pseudomonas aeruginosa

Lichtenberg, Mads, Kragh, K. N., Fritz, Blaine Gabriel, Kirkegaard, Julius Bier, Tolker-Nielsen, Tim & Bjarnsholt, Thomas, 2022, I: Cell Reports. 41, 3, s. 111515 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Effects of antibiotic treatment and phagocyte infiltration on development of Pseudomonas aeruginosa biofilm—Insights from the application of a novel PF hydrogel model in vitro and in vivo

Wu, H., Song, L., Yam, J. K. H., Plotkin, M., Wang, H., Rybtke, Morten Levin, Seliktar, D., Kofidis, T., Høiby, Niels, Tolker-Nielsen, Tim, Song, Z. & Givskov, Michael, 2022, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 12, 826450.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Elevated c-di-GMP Levels and Expression of the Type III Secretion System Promote Corneal Infection by Pseudomonas aeruginosa

Yam, J. K. H., Aung, T. T., Chua, S. L., Cheng, Y., Kohli, G. S., Zhou, J., Constancias, F., Liu, Y., Cai, Z., Salido, M. M. S., Drautz-Moses, D. I., Rice, S. A., Schuster, S. C., Boo, Z. Z., Wu, B., Kjelleberg, S., Tolker-Nielsen, T., Lakshminarayanan, R., Beuerman, R. W., Yang, L. & 1 flere, Givskov, Michael, 2022, I: Infection and Immunity. 90, 8

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Solid-phase synthesis and biological evaluation of piperazine-based novel bacterial topoisomerase inhibitors

Flagstad, T., Pedersen, M. T., Jakobsen, Tim Holm, Felding, J., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Qvortrup, K. & Nielsen, Thomas Eiland, 2022, I: Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. 57, 128499.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The BDSF quorum sensing receptor RpfR regulates Bep exopolysaccharide synthesis in Burkholderia cenocepacia via interaction with the transcriptional regulator BerB

Steiner, E., Shilling, R. E., Richter, A. M., Schmid, N., Fazli, M., Kaever, V., Jenal, U., Tolker-Nielsen, Tim & Eberl, L., 2022, I: npj Biofilms and Microbiomes. 8, 93.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Transcription of the Alginate Operon in Pseudomonas aeruginosa Is Regulated by c-di-GMP

Liang, Z., Rybtke, Morten Levin, Kragh, K. N., Johnson, O., Schicketanz, Muriel Leandra, Zhang, Yong, Andersen, Jens Bo & Tolker-Nielsen, Tim, 2022, I: Microbiology Spectrum. 10, 4, 13 s., e00675-22.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Biofilms can act as plasmid reserves in the absence of plasmid specific selection

Røder, Henriette Lyng, Trivedi, Urvish, Russel, J., Kragh, K. N., Herschend, J., Thalsø-Madsen, I., Tolker-Nielsen, Tim, Bjarnsholt, Thomas, Burmølle, Mette & Madsen, Jonas Stenløkke, 2021, I: npj Biofilms and Microbiomes. 7, 6 s., 78.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

Carbon starvation of Pseudomonas aeruginosa biofilms selects for dispersal insensitive mutants

Nair, H. A. S., Subramoni, S., Poh, W. H., Hasnuddin, N. T. B., Tay, M., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Kjelleberg, S., McDougald, D. & Rice, S. A., 2021, I: BMC Microbiology. 21, 10 s., 255.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Disruption of the Pseudomonas aeruginosa Tat system perturbs PQS-dependent quorum sensing and biofilm maturation through lack of the Rieske cytochrome bc₁sub-unit

Soh, E. Y. C., Smith, F., Gimenez, M. R., Yang, L., Vejborg, R. M., Fletcher, M., Halliday, N., Bleves, S., Heeb, S., Cámara, M., Givskov, Michael, Hardie, K. R., Tolker-Nielsen, Tim, Ize, B. & Williams, P., 2021, I: PLOS Pathogens. 17, 8, 25 s., e1009425.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of small molecules that interfere with c-di-GMP signaling and induce dispersal of Pseudomonas aeruginosa biofilms

Andersen, Jens Bo, Hultqvist, Louise Dahl, Jansen, C. U., Jakobsen, Tim Holm, Nilsson, Carl Martin Peter, Rybtke, Morten Levin, Uhd, J., Fritz, Blaine Gabriel, Seifert, R., Berthelsen, J., Nielsen, Thomas Eiland, Qvortrup, K., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2021, I: npj Biofilms and Microbiomes. 7, 13 s., 59.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Immune Responses to Pseudomonas aeruginosa Biofilm Infections

Moser, Claus Ernst, Jensen, Peter Østrup, Thomsen, K., Kolpen, M., Rybtke, Morten Levin, Lauland, A. S., Trøstrup, H. & Tolker-Nielsen, Tim, 2021, I: Frontiers in Immunology. 12, 625597.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Induction of native c-di-GMP phosphodiesterases leads to dispersal of Pseudomonas aeruginosa biofilms

Andersen, Jens Bo, Kragh, K. N., Hultqvist, Louise Dahl, Rybtke, Morten Levin, Nilsson, Carl Martin Peter, Jakobsen, Tim Holm, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2021, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 65, 4, e02431-20.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Nitric-oxide-driven oxygen release in anoxic Pseudomonas aeruginosa

Lichtenberg, Mads, Line, L., Schrameyer, V., Jakobsen, Tim Holm, Rybtke, Morten Levin, Toyofuku, M., Nomura, N., Kolpen, Mette, Tolker-Nielsen, Tim, Kühl, Michael, Bjarnsholt, Thomas & Jensen, Peter Østrup, 2021, I: iScience. 24, 12, 103404.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Redox protein osar (pa0056) regulates dsbm and the oxidative stress response in pseudomonas aeruginosa

Liu, Y., Ma, Y., Ma, Z., Han, X., Qi, H., Andersen, Jens Bo, Xu, H., Tolker-Nielsen, Tim & Qiao, M., 2021, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 65, 3, e01771-20.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

SAR study of 4-arylazo-3,5-diamino-1: H -pyrazoles: identification of small molecules that induce dispersal of Pseudomonas aeruginosa biofilms

Jansen, C. U., Uhd, J., Andersen, Jens Bo, Hultqvist, Louise Dahl, Jakobsen, Tim Holm, Nilsson, Carl Martin Peter, Nielsen, Thomas Eiland, Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim & Qvortrup, K. M., 2021, I: RSC Medicinal Chemistry. 12, 11, s. 1868-1878 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Extracellular Polysaccharide Matrix of Pseudomonas aeruginosa Biofilms Is a Determinant of Polymorphonuclear Leukocyte Responses

Rybtke, Morten Levin, Jensen, Peter Østrup, Nielsen, Claus Henrik & Tolker-Nielsen, Tim, 2021, I: Infection and Immunity. 89, 1

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The biofilm of Burkholderia cenocepacia H111 contains an exopolysaccharide composed of L-rhamnose and L-mannose: Structural characterization and molecular modelling

Bellich, B., Jou, I. A., Buriola, C., Ravenscroft, N., Brady, J. W., Fazli, M., Tolker-Nielsen, Tim, Rizzo, R. & Cescutti, P., 2021, I: Carbohydrate Research. 499, 108231.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Burkholderia cenocepacia h111 produces a water-insoluble exopolysaccharide in biofilm: Structural determination and molecular modelling

Bellich, B., Jou, I. A., Caterino, M., Rizzo, R., Ravenscroft, N., Fazli, M., Tolker-Nielsen, Tim, Brady, J. W. & Cescutti, P., 2020, I: International Journal of Molecular Sciences . 21, 5, 1702.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

High levels of cAMP inhibit Pseudomonas aeruginosa biofilm formation through reduction of the c-di-GMP content

Almblad, H., Rybtke, Morten Levin, Hendiani, S., Andersen, Jens Bo, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, mar. 2019, I: Microbiology. 165, 3, s. 324-333 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

P. aeruginosa flow-cell biofilms are enhanced by repeated phage treatments but can be eradicated by phage-ciprofloxacin combination: —monitoring the phage–P. aeruginosa biofilms interactions

Henriksen, K., Rørbo, N., Rybtke, Morten Levin, Martinet, M. G., Tolker-Nielsen, Tim, Høiby, Niels, Middelboe, Mathias & Ciofu, Oana, 2019, I: Pathogens and Disease. 77, 2, 11 s., ftz011.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Inactivation of the pgmA Gene in Streptococcus mutans Significantly Decreases Biofilm-Associated Antimicrobial Tolerance

Nilsson, Carl Martin Peter, Givskov, Michael, Twetman, Svante & Tolker-Nielsen, Tim, 2019, I: Microorganisms. 7, 9, 12 s., 310.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Increased Intracellular Cyclic di-AMP Levels Sensitize Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus to Osmotic Stress and Reduce Biofilm Formation and Adherence on Intestinal Cells

Teh, W. K., Dramsi, S., Tolker-Nielsen, Tim, Yang, L. & Givskov, Michael, 2019, I: Journal of Bacteriology. 201, 6, s. 1-16 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Key Players and Individualists of Cyclic-di-GMP Signaling in Burkholderia cenocepacia

Richter, A. M., Fazli, M., Schmid, N., Shilling, R., Suppiger, A., Givskov, Michael, Eberl, L. & Tolker-Nielsen, Tim, 2019, I: Frontiers in Microbiology. 9, 15 s., 3286.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Oxidative stress response plays a role in antibiotic tolerance of Streptococcus mutans biofilms

Nilsson, Carl Martin Peter, Jakobsen, Tim Holm, Givskov, Michael, Twetman, Svante & Tolker-Nielsen, Tim, 2019, I: Microbiology. 165, 3, s. 334-342

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Small Molecule Anti-biofilm Agents Developed on the Basis of Mechanistic Understanding of Biofilm Formation

Qvortrup, K., Hultqvist, Louise Dahl, Nilsson, Carl Martin Peter, Jakobsen, Tim Holm, Jansen, C. U., Uhd, J., Andersen, Jens Bo, Nielsen, Thomas Eiland, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2019, I: Frontiers in Chemistry. 7, 27 s., 742.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Sub-lethal antimicrobial photodynamic inactivation affects Pseudomonas aeruginosa PAO1 quorum sensing and cyclic di-GMP regulatory systems

Hendiani, S., Rybtke, Morten Levin, Tolker-Nielsen, Tim & Kashef, N., 2019, I: Photodiagnosis and Photodynamic Therapy. 27, s. 467-473 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tolerance and resistance of pseudomonas aeruginosabiofilms to antimicrobial agents-how P. aeruginosa Can escape antibiotics

Ciofu, Oana & Tolker-Nielsen, Tim, 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, MAY, 15 s., 913.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Two FtsH proteases contribute to fitness and adaptation of pseudomonas aeruginosa Clone C strains

Kamal, S. M., Rybtke, Morten Levin, Nimtz, M., Sperlein, S., Giske, C., Trček, J., Deschamps, J., Briandet, R., Dini, L., Jänsch, L., Tolker-Nielsen, Tim, Lee, C. & Römling, U., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, JULY, 18 s., 1372.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Visualizing biofilm by targeting eDNA with long wavelength probe CDr15

Kwon, H. Y., Kim, J. Y., Liu, X., Lee, J. Y., Yam, J. K. H., Hultqvist, Louise Dahl, Xu, W., Rybtke, Morten Levin, Tolker-Nielsen, Tim, Heo, W., Kim, J. J., Kang, N. Y., Joo, T., Yang, L., Park, S. J., Givskov, Michael & Chang, Y. T., 2019, I: Biomaterials Science. 7, 9, s. 3594-3598 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pseudomonas aeruginosa rhamnolipid induces fibrillation of human α‐synuclein and modulates its effect on biofilm formation

Andersen, K. K., Vad, B. S., Kjaer, L., Tolker-Nielsen, Tim, Christiansen, G. & Otzen, D. E., maj 2018, I: FEBS Letters. 592, 9, s. 1484-1496 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

A transposon mutant library of Bacillus cereus ATCC 10987 reveals novel genes required for biofilm formation and implicates motility as an important factor for pellicle-biofilm formation

Okshevsky, M., Louw, M. G., Lamela, E. O., Nilsson, Carl Martin Peter, Tolker-Nielsen, Tim & Meyer, R. L., 2018, I: MicrobiologyOpen. 7, 2, 17 s., e00552.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

CDy14: A novel biofilm probe targeting exopolysaccharide Psl

Kwon, H. Y., Kim, J. Y., Lee, J. Y., Yam, J. K. H., Hultqvist, Louise Dahl, Xu, W., Rybtke, Morten Levin, Tolker-Nielsen, Tim, Kim, J. J., Kang, N. Y., Yang, L., Park, S. J., Givskov, Michael & Chang, Y. T., 2018, I: Chemical Communications. 54, 84, s. 11865-11868 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Inoculation method could impact the outcome of microbiological experiments

Kragh, K. N., Alhede, M., Rybtke, Morten Levin, Stavnsbjerg, Camilla, Tolker-Nielsen, Tim, Whiteley, M. & Bjarnsholt, Thomas, 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 5, 14 s., e02264-17.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Reduced intracellular c-di-GMP content increases expression of quorum sensing-regulated genes in Pseudomonas aeruginosa

Chua, S. L., Liu, Y., Li, Y., Ting, H. J., Kohli, G. S., Cai, Z., Suwanchaikasem, P., Goh, K. K. K., Ng, S. P., Tolker-Nielsen, Tim, Yang, L. & Givskov, Michael, okt. 2017, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 7, 8 s., 451.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Bacterial Biofilm Control by Perturbation of Bacterial Signaling Processes

Jakobsen, Tim Holm, Tolker-Nielsen, Tim & Givskov, Michael, sep. 2017, I: International Journal of Molecular Sciences. 18, 9, 27 s., 1970.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

High intracellular c-di-GMP levels antagonize quorum sensing and virulence gene expression in Burkholderia cenocepacia H111

Schmid, N., Suppiger, A., Steiner, E., Pessi, G., Kaever, V., Fazli, M., Tolker-Nielsen, Tim, Jenal, U. & Eberl, L., 1 maj 2017, I: Microbiology. 163, 5, s. 754-764 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Importance of the exopolysaccharide matrix in antimicrobial tolerance of Pseudomonas aeruginosa aggregates

Goltermann, Lise & Tolker-Nielsen, Tim, apr. 2017, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 61, 4, 7 s., e02696.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A broad range quorum sensing inhibitor working through sRNA inhibition

Jakobsen, Tim Holm, Warming, A. N., Vejborg, R. M., Moscoso, J. A., Stegger, M., Lorenzen, F., Rybtke, Morten Levin, Andersen, Jens Bo, Petersen, R., Andersen, P. S., Nielsen, Thomas Eiland, Tolker-Nielsen, Tim, Filloux, A., Ingmer, Hanne & Givskov, Michael, 2017, I: Scientific Reports. 7, 1, 12 s., 9857.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Bacterial biofilm in chronic lesions of Hidradenitis Suppurativa

Ring, H. C., Bay, Lene, Nilsson, Carl Martin Peter, Kallenbach, K., Miller, I. M., Saunte, Ditte Marie, Bjarnsholt, Thomas, Tolker-Nielsen, Tim & Jemec, Gregor, 2017, I: British Journal of Dermatology. 176, 4, s. 993–1000

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Regulation of Burkholderia cenocepacia biofilm formation by RpoN and the c-di-GMP effector BerB

Fazli, M., Rybtke, Morten Levin, Steiner, E., Weidel, E., Berthelsen, J., Groizeleau, J. D. D., Bin, W., Zhi, B. Z., Yaming, Z., Kaever, V., Givskov, Michael, Hartmann, R. W., Eberl, L. & Tolker-Nielsen, Tim, 2017, I: MicrobiologyOpen. 6, 4, 13 s., e00480.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Selective proteomic analysis of antibiotic-tolerant cellular subpopulations in pseudomonas aeruginosa biofilms

Babin, B. M., Atangcho, L., van Eldijk, M. B., Sweredoski, M. J., Moradian, A., Hess, S., Tolker-Nielsen, Tim, Newman, D. K. & Tirrell, D. A., 2017, I: mBio. 8, 5, 16 s., e01593-17.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The anti-cancerous drug doxorubicin decreases the c-di-GMP content in Pseudomonas aeruginosa but promotes biofilm formation

Groizeleau, J., Rybtke, Morten Levin, Andersen, Jens Bo, Berthelsen, J., Liu, Y., Yang, L., Nielsen, Thomas Eiland, Kaever, V., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 1 okt. 2016, I: Microbiology. 162, 10, s. 1797-1807 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The dlt genes play a role in antimicrobial tolerance of Streptococcus mutans biofilms

Nilsson, Carl Martin Peter, Rybtke, Morten Levin, Givskov, Michael, Høiby, Niels, Twetman, Svante & Tolker-Nielsen, Tim, sep. 2016, I: International Journal of Antimicrobial Agents. 48, 3, s. 298–304

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pseudomonas aeruginosa Microcolonies in Coronary Thrombi from Patients with ST-Segment Elevation Myocardial Infarction

Hansen, G. M., Midjord-Belstrøm, Daniel, Nilsson, Carl Martin Peter, Helqvist, S., Nielsen, Claus Henrik, Holmstrup, Palle, Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Hansen, Peter Riis, 2016, I: P L o S One. 11, 12, 13 s., e0168771.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Selective labelling and eradication of antibiotic-tolerant bacterial populations in Pseudomonas aeruginosa biofilms

Chua, S. L., Yam, J. K. H., Hao, P., Adav, S. S., Salido, M. M., Liu, Y., Givskov, Michael, Sze, S. K., Tolker-Nielsen, Tim & Yang, L., 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 10750.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pigments influence the tolerance of Pseudomonas aeruginosa PAO1 to photodynamically induced oxidative stress

Orlandi, V. T., Bolognese, F., Chiodaroli, L., Tolker-Nielsen, Tim & Barbieri, P., dec. 2015, I: Microbiology. 161, 12, s. 2298-309 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The LapG protein plays a role in Pseudomonas aeruginosa biofilm formation by controlling the presence of the CdrA adhesin on the cell surface

Rybtke, Morten Levin, Berthelsen, J., Yang, L., Høiby, Niels, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, dec. 2015, I: MicrobiologyOpen. 4, 6, s. 917-930 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Precision-engineering the Pseudomonas aeruginosa genome with two-step allelic exchange

Hmelo, L. R., Borlee, B. R., Almblad, H., Love, M. E., Randall, T. E., Tseng, B. S., Lin, C., Irie, Y., Storek, K. M., Yang, J. J., Siehnel, R. J., Howell, P. L., Singh, P. K., Tolker-Nielsen, Tim, Parsek, M. R., Schweizer, H. P. & Harrison, J. J., nov. 2015, I: Nature Protocols (Print). 10, 11, s. 1820-41 22 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The bactericidal activity of β-lactam antibiotics is increased by metabolizable sugar species

Thorsing, M., Bentin, Thomas, Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim & Goltermann, Lise, okt. 2015, I: Microbiology. 161, 10, s. 1999-2007 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

In vitro and in vivo generation and characterization of Pseudomonas aeruginosa biofilm-dispersed cells via c-di-GMP manipulation

Chua, S. L., Hultqvist, Louise Dahl, Yuan, M., Rybtke, Morten Levin, Nielsen, Thomas Eiland, Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim & Yang, L., aug. 2015, I: Nature Protocols (Print). 10, 8, s. 1165-80 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Cranberry (Vaccinium macrocarpon) oligosaccharides decrease biofilm formation by uropathogenic Escherichia coli

Sun, J., Marais, J. P. J., Khoo, C., LaPlante, K., Vejborg, R. M., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Seeram, N. P. & Rowley, D. C., aug. 2015, I: Journal of Functional Foods. 17, s. 235-242 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

Erratum for Almblad et al., The Cyclic AMP-Vfr Signaling Pathway in Pseudomonas aeruginosa Is Inhibited by Cyclic Di-GMP

Almblad, H., Harrison, J. J., Rybtke, Morten Levin, Groizeleau, J., Givskov, Michael, Parsek, M. R. & Tolker-Nielsen, Tim, aug. 2015, I: Journal of Bacteriology. 197, 16, s. 2731 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning

The Cyclic AMP-Vfr Signaling Pathway in Pseudomonas aeruginosa Is Inhibited by Cyclic Di-GMP

Almblad, H., Harrison, J. J., Rybtke, Morten Levin, Groizeleau, J., Givskov, Michael, Parsek, M. R. & Tolker-Nielsen, Tim, jul. 2015, I: Journal of Bacteriology. 197, 13, s. 2190-200 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Viable Bacteria Associated with Red Blood Cells and Plasma in Freshly Drawn Blood Donations

Damgaard, Christian, Magnussen, K., Enevold, Christian, Nilsson, Carl Martin Peter, Tolker-Nielsen, Tim, Holmstrup, Palle & Nielsen, Claus Henrik, 9 mar. 2015, I: P L o S One. 10, 3, s. 1-9 9 s., e0120826.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pseudomonas aeruginosa LysR PA4203 regulator NmoR acts as a repressor of the PA4202 nmoA gene, encoding a nitronate monooxygenase

Vercammen, K., Wei, Q., Charlier, D., Dötsch, A., Haüssler, S., Schulz, S., Salvi, F., Gadda, G., Spain, J., Rybtke, Morten Levin, Tolker-Nielsen, Tim, Dingemans, J., Ye, L. & Cornelis, P., mar. 2015, I: Journal of Bacteriology. 197, 6, s. 1026-39 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Biofilm Development

Tolker-Nielsen, Tim, mar. 2015, I: Microbiology Spectrum. 3, 2, 12 s., MB-0001-2014.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pseudomonas aeruginosa Biofilm Infections: Community Structure, Antimicrobial Tolerance and Immune Response

Rybtke, Morten Levin, Hultqvist, Louise Dahl, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2015, I: Journal of Molecular Biology. 427, 23, s. 3628-3645

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Absence of Bacteria on Coronary Angioplasty Balloons from Unselected Patients: Results with Use of a High Sensitivity Polymerase Chain Reaction Assay

Hansen, G. M., Nilsson, M., Nielsen, Claus Henrik, Holmstrup, Palle, Helqvist, S., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Hansen, Peter Riis, 2015, I: PloS one. 10, 12, s. 1-11 11 s., e0145657.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Antimicrobial resistance, respiratory tract infections and role of biofilms in lung infections in cystic fibrosis patients

Ciofu, Oana, Tolker-Nielsen, Tim, Jensen, Peter Østrup, Wang, H. & Høiby, Niels, 2015, I: Advanced Drug Delivery Reviews. 85, s. 7-23 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

C-di-GMP regulates Pseudomonas aeruginosa stress response to tellurite during both planktonic and biofilm modes of growth

Chua, S. L., Sivakumar, K., Rybtke, Morten Levin, Yuan, M., Andersen, Jens Bo, Nielsen, T. E., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Cao, B., Kjelleberg, S. & Yang, L., 2015, I: Scientific Reports. 5, 13 s., 10052.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Functional bacterial amyloid increases Pseudomonas biofilm hydrophobicity and stiffness

Zeng, G., Vad, B. S., Dueholm, M. S., Christiansen, G., Nilsson, Carl Martin Peter, Tolker-Nielsen, Tim, Nielsen, P. H., Meyer, R. L. & Otzen, D. E., 2015, I: Frontiers in Microbiology. 6, 14 s., 1099.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

In silico analyses of metagenomes from human atherosclerotic plaque samples

Mitra, S., Drautz-Moses, D. I., Alhede, M., Maw, M. T., Liu, Y., Purbojati, R. W., Yap, Z. H., Kushwaha, K. K., Gheorghe, Alexandra Gabriella, Bjarnsholt, Thomas, Hansen, G. M., Sillesen, Henrik, Hougen, H. P., Hansen, Peter Riis, Yang, L., Tolker-Nielsen, Tim, Schuster, S. C. & Givskov, Michael, 2015, I: Microbiome. 3, s. 1-14 38.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

In-frame and unmarked gene deletions in Burkholderia cenocepacia via an allelic exchange system compatible with gateway technology

Fazli, M., Harrison, J. J., Gambino, M., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 11, s. 3623-3630 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Lipopeptide biosurfactant viscosin enhances dispersal of Pseudomonas fluorescens SBW25 biofilms

Bonnichsen, L., Svenningsen, N. B., Rybtke, Morten Levin, de Bruijn, I., Raaijmakers, J. M., Tolker-Nielsen, Tim & Nybroe, O., 2015, I: Microbiology. 161, 12, s. 2289-2297 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Multiple diguanylate cyclase-coordinated regulation of pyoverdine synthesis in Pseudomonas aeruginosa

Chen, Y., Yuan, M., Mohanty, A., Yam, J. K. H., Liu, Y., Chua, S. L., Nielsen, T. E., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Cao, B. & Yang, L., 2015, I: Environmental Microbiology Reports. 7, 3, s. 498-507 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Triazole-containing N-acyl homoserine lactones targeting the quorum sensing system in Pseudomonas aeruginosa

Hansen, M. R., Jakobsen, Tim Holm, Bang, C. G., Cohrt, A. E., Hansen, C. L., Clausen, J. R. W., Le Quement, S. T., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Nielsen, T., 2015, I: Bioorganic & Medicinal Chemistry. 23, 7, s. 1638-1650 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Comparative systems biology analysis to study the mode of action of the isothiocyanate compound Iberin on Pseudomonas aeruginosa

Tan, S. Y., Liu, Y., Chua, S. L., Vejborg, R. M., Jakobsen, Tim Holm, Chew, S. C., Li, Y., Nielsen, T. E., Tolker-Nielsen, Tim, Yang, L. & Givskov, Michael, nov. 2014, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 58, 11, s. 6648-59 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Pseudomonas aeruginosa Type III Translocon Is Required for Biofilm Formation at the Epithelial Barrier

Tran, C. S., Rangel, S. M., Almblad, H., Kierbel, A., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Hauser, A. R. & Engel, J. N., nov. 2014, I: P L o S Pathogens. 10, 11, s. 1-11 12 s., e1004479.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Antimicrobial and anti-biofilm effect of a novel BODIPY photosensitizer against Pseudomonas aeruginosa PAO1

Orlandi, V. T., Rybtke, Morten Levin, Caruso, E., Banfi, S., Tolker-Nielsen, Tim & Barbieri, P., sep. 2014, I: Biofouling. 30, 8, s. 883-91 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A mariner transposon vector adapted for mutagenesis in oral streptococci

Nilsson, M., Christiansen, N., Høiby, Niels, Twetman, Svante, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, jun. 2014, I: MicrobiologyOpen. 3, 3, s. 333-40 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mulig sammenhæng mellem marginal parodontitis og iskæmisk hjertesygdom

Hansen, G. M., Holmstrup, Palle, Tolker-Nielsen, Tim, Køllgaard, T., Nielsen, Claus Henrik, Givskov, Michael & Hansen, Peter Riis, 28 apr. 2014, I: Ugeskrift for Laeger. 176, 18, s. 1752-1754 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Solid-phase synthesis and biological evaluation of N-dipeptido L-homoserine lactones as quorum sensing activators

Hansen, M. R., Le Quement, S. T., Jakobsen, Tim Holm, Skovstrup, S., Taboureau, O., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Nielsen, T. E., 10 feb. 2014, I: ChemBioChem. 15, 3, s. 460-5 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Bacteria-triggered release of antimicrobial agents

Komnatnyy, V. V., Chiang, W., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Nielsen, T. E., 7 jan. 2014, I: Angewandte Chemie (International ed. in English). 53, 2, s. 439-41 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A possible correlation between periodontitis and ischaemic heart disease

Hansen, G. M., Holmstrup, Palle, Tolker-Nielsen, Tim, Køllgaard, T., Nielsen, C. H., Givskov, Michael & Hansen, Peter Riis, 2014, I: Ugeskrift for Laeger.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Colony morphology and transcriptome profiling of Pseudomonas putida KT2440 and its mutants deficient in alginate or all EPS synthesis under controlled matric potentials

Gulez, G., Altintas, A., Fazli, M., Dechesne, A., Workman, C., Tolker-Nielsen, Tim & Smets, B. F., 2014, I: MicrobiologyOpen. 3, 4, s. 457-469

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dispersed cells represent a distinct stage in the transition from bacterial biofilm to planktonic lifestyles

Chua, S. L., Liu, Y., Yam, J. K. H., Chen, Y., Vejborg, R. M., Tan, B. G. C., Kjelleberg, S., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Yang, L., 2014, I: Nature Communications. 5, s. 1-12 13 s., 4462.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Draft Genome Sequence of the Model Naphthalene-Utilizing Organism Pseudomonas putida OUS82

Tay, M., Roizman, D., Cohen, Y., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Yang, L., 2014, I: Genome Announcements. 2, 1, s. 1 1 s., e01161-13.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Methods for studying biofilm formation: flow cells and confocal laser scanning microscopy

Tolker-Nielsen, Tim & Sternberg, C., 2014, I: Methods in Molecular Biology. 1149, s. 615-29 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

PNA-based fluorescence in situ hybridization for identification of bacteria in clinical samples

Fazli, M., Bjarnsholt, Thomas, Høiby, Niels, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2014, I: Methods in Molecular Biology. 1211, s. 261-71 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Regulation of biofilm formation in Pseudomonas and Burkholderia species

Fazli, M., Almblad, H., Rybtke, Morten Levin, Givskov, Michael, Eberl, L. & Tolker-Nielsen, Tim, 2014, I: Environmental Microbiology. 16, 7, s. 1961-1981 21 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Clearance of Pseudomonas aeruginosa Foreign-Body Biofilm Infections through Reduction of the Cyclic Di-GMP Level in the Bacteria

Hultqvist, Louise Dahl, van Gennip, M., Rybtke, Morten Levin, Wu, H., Chiang, W., Alhede, M., Høiby, Niels, Nielsen, T., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, aug. 2013, I: Infection and Immunity. 81, 8, s. 2705-13 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Extracellular DNA shields against aminoglycosides in Pseudomonas aeruginosa biofilms

Chiang, W., Nilsson, M., Jensen, Peter Østrup, Høiby, Niels, Nielsen, T., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, maj 2013, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 57, 5, s. 2352-61 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Biofilm formation by Staphylococcus epidermidis on peritoneal dialysis catheters and the effects of extracellular products from Pseudomonas aeruginosa

Pihl, M., Arvidsson, A., Skepö, M., Nilsson, M., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Svensäter, G. & Davies, J. R., apr. 2013, I: Pathogens and Disease. 67, 3, s. 192-198 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Expression of Fap amyloids in Pseudomonas aeruginosa, P. fluorescens, and P. putida results in aggregation and increased biofilm formation

Dueholm, M. S., Søndergaard, M., Nilsson, M., Christiansen, G., Stensballe, A., Overgaard, M. T., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Otzen, D. & Nielsen, P. H., 18 mar. 2013, I: MicrobiologyOpen. 2, s. 365-382 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The exopolysaccharide gene cluster Bcam1330-Bcam1341 is involved in Burkholderia cenocepacia biofilm formation, and its expression is regulated by c-di-GMP and Bcam1349

Fazli, M., McCarthy, Y., Givskov, Michael, Ryan, R. P. & Tolker-Nielsen, Tim, feb. 2013, I: MicrobiologyOpen. 2, 1, s. 105-122 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

C-di-GMP regulates antimicrobial peptide resistance in Pseudomonas aeruginosa

Chua, S. L., Tan, S. Y., Rybtke, Morten Levin, Chen, Y., Rice, S. A., Kjelleberg, S., Tolker-Nielsen, Tim, Yang, L. & Givskov, Michael, 2013, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 57, 5, s. 2066-2075 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Engineering PQS biosynthesis pathway for enhancement of bioelectricity production in Pseudomonas aeruginosa microbial fuel cells

Wang, V. B., Chua, S., Cao, B., Seviour, T., Nesatyy, V. J., Marsili, E., Kjelleberg, S., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Song, H., Loo, J. S. C. & Yang, L., 2013, I: PLOS ONE. 8, 5, s. e63129 7 s., e63129.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of LasR ligands through a virtual screening approach

Skovstrup, S., Le Quement, S. T., Hansen, T., Jakobsen, Tim Holm, Harmsen, M., Tolker-Nielsen, Tim, Nielsen, T. E., Givskov, Michael & Taboureau, O., 2013, I: ChemMedChem. 8, 1, s. 157-63 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Synthesis and biological evaluation of triazole-containing N-acyl homoserine lactones as quorum sensing modulators

Stacy, D. M., Le Quement, S. T., Hansen, C., Clausen, J. W., Tolker-Nielsen, Tim, Brummond, J. W., Givskov, Michael, Nielsen, T. E. & Blackwell, H. E., 2013, I: Organic & Biomolecular Chemistry. 11, 6, s. 938-54 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The catabolite repression control protein Crc plays a role in the development of antimicrobial-tolerant subpopulations in Pseudomonas aeruginosa biofilms

Zhang, L., Chiang, W., Gao, Q., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Yang, L. & Zhang, G., dec. 2012, I: Microbiology. 158, 12, s. 3014-3019 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The metabolically active subpopulation in Pseudomonas aeruginosa biofilms survives exposure to membrane-targeting antimicrobials via distinct molecular mechanisms

Chiang, W., Pamp, S. J., Nilsson, Carl Martin Peter, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, jul. 2012, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 65, 2, s. 245-256 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

When the PilZ don't work: effectors for cyclic di-GMP action in bacteria

Ryan, R. P., Tolker-Nielsen, Tim & Dow, J. M., maj 2012, I: Current Trends in Microbiology. 20, 5, s. 235-242 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Bursting the bubble on bacterial biofilms: a flow cell methodology

Crusz, S. A., Popat, R., Rybtke, Morten Levin, Cámara, M., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim, Diggle, S. P. & Williams, P., 2012, I: Biofouling. 28, 8, s. 835-842 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Fluorescence-based reporter for gauging cyclic di-GMP Levels in Pseudomonas aeruginosa.

Rybtke, Morten Levin, Borlee, B. R., Murakami, K., Irie, Y., Hentzer, M., Nielsen, T. E., Givskov, Michael, Parsek, M. R. & Tolker-Nielsen, Tim, 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 15, s. 5060-5069 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pattern differentiation in co-culture biofilms formed by Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa

Yang, L., Liu, Y., Markussen, T., Høiby, Niels, Tolker-Nielsen, Tim & Molin, S., 1 aug. 2011, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 62, 3, s. 339-47 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The contribution of cell-cell signaling and motility to bacterial biofilm formation

Shrout, J. D., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Parsek, M. R., maj 2011, I: M R S Bulletin. 36, 5, s. 367-373 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Growing and analyzing biofilms in flow chambers

Tolker-Nielsen, Tim & Sternberg, C., 2011, I: Current Protocols in Microbiology. 21, s. 1B.2.1-1B.2.17

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Influence of putative exopolysaccharide genes on Pseudomonas putida KT2440 biofilm stability

Nilsson, M., Chiang, W., Fazli, M., Gjermansen, M., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2011, I: Environmental Microbiology. 13, 5, s. 1357-69

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Phenotypes of Non-Attached Pseudomonas aeruginosa Aggregates Resemble Surface Attached Biofilm

Alhede, M., Kragh, K. N., Qvortrup, Klaus, Allesen-Holm, M., van Gennip, M., Hultqvist, Louise Dahl, Jensen, Peter Østrup, Nielsen, A. K., Parsek, M., Wozniak, D., Molin, S., Tolker-Nielsen, Tim, Høiby, Niels, Givskov, Michael & Bjarnsholt, Thomas, 2011, I: P L o S One. 6, 11, s. e27943

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Quantitative analysis of the cellular inflammatory response against biofilm bacteria in chronic wounds

Fazli, M., Bjarnsholt, Thomas, Kirketerp-Møller, K., Jørgensen, A., Andersen, C. B., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2011, I: Wound Repair and Regeneration. 19, 3, s. 387-91 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Report from Eurobiofilms 2011

Jensen, Peter Østrup & Tolker-Nielsen, Tim, 2011, I: Future Microbiology. 6, 11, s. 1237-45

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The CRP/FNR family protein Bcam1349 is a c-di-GMP effector that regulates biofilm formation in the respiratory pathogen Burkholderia cenocepacia

Fazli, M., O'Connell, A., Nilsson, M., Niehaus, K., Dow, J. M., Givskov, Michael, Ryan, R. P. & Tolker-Nielsen, Tim, 2011, I: Molecular Microbiology. 82, 2, s. 327-41

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The clinical impact of bacterial biofilms

Høiby, Niels, Ciofu, Oana, Johansen, Helle Krogh, Song, Z., Moser, Claus Ernst, Jensen, Peter Østrup, Molin, S., Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim & Bjarnsholt, Thomas, 2011, I: International Journal of Oral Science. 3, 2, s. 55-65

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The implication of Pseudomonas aeruginosa biofilms in infections

Rybtke, Morten Levin, Jensen, Peter Østrup, Høiby, Niels, Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim & Bjarnsholt, Thomas, 2011, I: Inflammation & Allergy - Drug Targets. 10, 2, s. 141-57 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Quorum sensing and virulence of Pseudomonas aeruginosa during lung infection of cystic fibrosis patients

Bjarnsholt, Thomas, Jensen, Peter Østrup, Jakobsen, Tim Holm, Phipps, R., Nielsen, A. K., Rybtke, Morten Levin, Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Høiby, Niels, Ciofu, Oana & Scandinavian Cystic Fibrosis Study Consortium, S. C. F. S. C., 1 jan. 2010, I: PLoS ONE. 5, 4, s. e10115

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A sensor kinase recognizing the cell-cell signal BDSF (cis-2-dodecenoic acid) regulates virulence in Burkholderia cenocepacia

McCarthy, Y., Yang, L., Twomey, K. B., Sass, A., Tolker-Nielsen, Tim, Mahenthiralingam, E., Dow, J. M. & Ryan, R. P., 2010, I: Molecular Microbiology. 77, 5, s. 1220-1236 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

An update on Pseudomonas aeruginosa biofilm formation, tolerance, and dispersal

Harmsen, M., Yang, L., Pamp, S. J. & Tolker-Nielsen, Tim, 2010, I: FEMS Immunology and Medical Microbiology. 59, 3, s. 253-68 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Bacteria can form interconnected microcolonies when a self-excreted product reduces their surface motility: evidence from individual-based model simulations

Mabrouk, N., Deffuant, G., Tolker-Nielsen, Tim & Lobry, C., 2010, I: Theory in Biosciences. 129, 1, s. 1-13 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Biofilms in chronic infections - a matter of opportunity - monospecies biofilms in multispecies infections

Burmølle, Mette, Thomsen, T. R., Fazli, M., Dige, I., Christensen, L., Homøe, Preben, Tvede, M., Nyvad, B., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Moser, Claus Ernst, Kirketerp-Møller, K., Johansen, Helle Krogh, Høiby, Niels, Jensen, Peter Østrup, Sørensen, Søren Johannes & Bjarnsholt, Thomas, 2010, I: FEMS Immunology and Medical Microbiology. 59, 3, s. 324-336 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Burkholderia type VI secretion systems have distinct roles in eukaryotic and bacterial cell interactions

Schwarz, S., West, T. E., Boyer, F., Chiang, W., Carl, M. A., Hood, R. D., Rohmer, L., Tolker-Nielsen, Tim, Skerrett, S. J. & Mougous, J. D., 2010, I: PLoS Pathogens. 6, 8

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Characterization and transfer studies of macrolide resistance genes in Streptococcus pneumoniae from Denmark

Nielsen, K. L., Hammerum, A. M., Lambertsen, L. M., Lester, C. H., Arpi, M., Knudsen, J. D., Stegger, M., Tolker-Nielsen, Tim & Frimodt-Møller, N., 2010, I: Scandinavian Journal of Infectious Diseases. 42, 8, s. 586-93 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Characterization of starvation-induced dispersion in Pseudomonas putida biofilms: genetic elements and molecular mechanisms

Gjermansen, M., Nilsson, Carl Martin Peter, Yang, L. & Tolker-Nielsen, Tim, 2010, I: Molecular Microbiology. 75, 4, s. 815-26 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Influence of silver additions to type 316 stainless steels on bacterial inhibition, mechanical properties, and corrosion resistance.

Chiang, W., Tseng, I., Møller, P., Rischel Hilbert, L., Tolker-Nielsen, Tim & Wu, J., 2010, I: Materials Chemistry and Physics. 119, s. 123–130 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Interference of Pseudomonas aeruginosa signalling and biofilm formation for infection control

Bjarnsholt, Thomas, Tolker-Nielsen, Tim, Høiby, Niels & Givskov, Michael, 2010, I: Expert Reviews in Molecular Medicine. 12, s. e11 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Inactivation of the rhlA gene in Pseudomonas aeruginosa prevents rhamnolipid production, disabling the protection against polymorphonuclear leukocytes

Van Gennip, M., Hultqvist, Louise Dahl, Alhede, M., Phipps, R., Jensen, Peter Østrup, Christophersen, L., Pamp, S. J., Moser, C., Mikkelsen, P. J., Koh, A. Y., Tolker-Nielsen, Tim, Pier, G. B., Høiby, Niels, Givskov, Michael & Bjarnsholt, Thomas, 1 jul. 2009, I: Acta Pathologica Microbiologica et Immunologica Scandinavica. 117, 7, s. 537-46 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Computer-aided identification of recognized drugs as Pseudomonas aeruginosa quorum-sensing inhibitors

Yang, L., Rybtke, Morten Levin, Jakobsen, Tim Holm, Hentzer, M., Bjarnsholt, Thomas, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2009, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 53, 6, s. 2432-43 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Detection of Bacteria by Fluorescence in Situ Hybridization in Culture-Negative Soft Tissue Filler Lesions

Bjarnsholt, Thomas, Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Janssen, M. & Christensen, L. H., 2009, I: Dermatologic Surgery. 35 Suppl 2, s. 1620-1624 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Extracellular DNA and F-actin as targets in antibiofilm cystic fibrosis therapy

Tolker-Nielsen, Tim & Høiby, Niels, 2009, I: Future Microbiology. 4, s. 645-7 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

HD-GYP domain proteins regulate biofilm formation and virulence in Pseudomonas aeruginosa

Ryan, R. P., Lucey, J., O'Donovan, K., McCarthy, Y., Yang, L., Tolker-Nielsen, Tim & Dow, J. M., 2009, I: Environmental Microbiology. 11, 5, s. 1126-36 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Insight into the microbial multicellular lifestyle via flow-cell technology and confocal microscopy

Pamp, S. J., Sternberg, C. & Tolker-Nielsen, Tim, 2009, I: Cytometry. Part A. 75, 2, s. 90-103 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Nonrandom distribution of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus in chronic wounds

Fazli, M., Bjarnsholt, Thomas, Kirketerp-Møller, K., Jørgensen, B., Andersen, A. S., Krogfelt, K. A., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2009, I: Journal of Clinical Microbiology. 47, 12, s. 4084-9 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pseudomonas aeruginosa extracellular products inhibit staphylococcal growth, and disrupt established biofilms produced by Staphylococcus epidermidis

Qin, Z., Yang, L., Qu, D., Molin, S. & Tolker-Nielsen, Tim, 2009, I: Microbiology. 155, Pt 7, s. 2148-56 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Pyoverdine and PQS mediated subpopulation interactions involved in Pseudomonas aeruginosa biofilm formation

Yang, L., Nilsson, Carl Martin Peter, Gjermansen, M., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2009, I: Molecular Microbiology. 74, 6, s. 1380-92 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Silver-palladium surfaces inhibit biofilm formation

Chiang, W., Schroll, C., Hilbert, L. R. & Tolker-Nielsen, Tim, 2009, I: Applied and Environmental Microbiology. 75, 6, s. 1674-8 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Effects of antibiotics on quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa

Skindersoe, M. E., Alhede, M., Phipps, R., Yang, L., Jensen, P. O., Rasmussen, T. B., Bjarnsholt, Thomas, Tolker-Nielsen, Tim, Høiby, Niels & Givskov, Michael, 1 okt. 2008, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 52, 10, s. 3648-63 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Distribution, organization, and ecology of bacteria in chronic wounds

Kirketerp-Møller, K., Jensen, Peter Østrup, Fazli, M., Madsen, K. G., Pedersen, J., Moser, C., Tolker-Nielsen, Tim, Høiby, Niels, Givskov, Michael & Bjarnsholt, Thomas, 1 aug. 2008, I: Journal of Clinical Microbiology. 46, 8, s. 2717-22 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Architecture and spatial organization in a triple-species bacterial biofilm synergistically degrading the phenylurea herbicide linuron

Breugelmans, P., Barken, K. B., Tolker-Nielsen, Tim, Hofkens, J., Dejonghe, W. & Springael, D., maj 2008, I: F E M S Microbiology Ecology. 64, 2, s. 271-82 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tolerance to the antimicrobial peptide colistin in Pseudomonas aeruginosa biofilms is linked to metabolically active cells, and depends on the pmr and mexAB-oprM genes

Pamp, S. J., Gjermansen, M., Johansen, Helle Krogh & Tolker-Nielsen, Tim, 2008, I: Molecular Microbiology. 68, 1, s. 223-40 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt