Kristoffer Enøe Johansson

Kristoffer Enøe Johansson

Akademisk medarbejder FU


  1. 2010
  2. Udgivet

    Beyond rotamers: a generative, probabilistic model of side chains in proteins

    Harder, T., Boomsma, Wouter, Paluszewski, M., Frellsen, J., Johansson, Kristoffer Enøe & Hamelryck, Thomas Wim, 1 jan. 2010, I: B M C Bioinformatics. 11, s. 306

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. 2011
  4. Udgivet

    Efficient, non-disruptive local moves for Monte Carlo sampling of proteins

    Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Johansson, Kristoffer Enøe, Andreetta, C., Hamelryck, Thomas Wim & Ferkinghoff-Borg, J., 2011, Next Generation Statistics in Biosciences: Proceedings of the 30th Leeds Annual Statistical Research (LASR) Workshop. Mardia, K. V., Gusnanto, A., Riley, A. D. & Voss, J. (red.). University of Leeds, s. 127 1 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferenceabstrakt i proceedingsForskning

  5. 2012
  6. Udgivet

    Computational Protein Design

    Johansson, Kristoffer Enøe, 2012, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 151 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  7. Udgivet

    Subtle Monte Carlo updates in dense molecular systems

    Bottaro, S., Boomsma, Wouter, Johansson, Kristoffer Enøe, Andreetta, C., Hamelryck, Thomas Wim & Ferkinghoff-Borg, J., 2012, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 8, 2, s. 695-702 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. 2013
  9. Udgivet

    A simple probabilistic model of multibody interactions in proteins

    Johansson, Kristoffer Enøe & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 81, 8, s. 1340-1350 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

    Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, Jan Halborg, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Phaistos user manual

    Boomsma, Wouter, Bottaro, S., Hamelryck, Thomas Wim, Frellsen, J., Andreetta, C., Borg, M., Harder, T., Johansson, Kristoffer Enøe, Stovgaard, K. & Tian, P., 2013, 90 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogUndervisning

  12. 2014
  13. Udgivet

    Distinguishing tautomerism in the crystal structure of (Z)-N-(5-ethyl-2,3-dihydro-1,3,4-thiadiazol-2-ylidene)-4-methylbenzenesulfonamide using DFT-D calculations and (13)C solid-state NMR

    Li, X., Bond, A. D., Johansson, Kristoffer Enøe & Van de Streek, J., 15 aug. 2014, I: Acta Crystallographica. Section C: Crystal Structure Communications. C70, Pt 8, s. 784-9 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. 2016
  15. Udgivet

    A soluble, folded protein without charged amino acid residues

    Højgaard, C., Kofoed, Christian, Espersen, R., Johansson, Kristoffer Enøe, Villa, M., Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten, Teilum, Kaare & Winther, Jakob R., 2016, I: Biochemistry. 55, 28, s. 3949–3956 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Computational redesign of thioredoxin is hypersensitive towards minor conformational changes in the backbone template

    Johansson, Kristoffer Enøe, Johansen, Nicolai Tidemand, Christensen, S., Horowitz, S., Bardwell, J. C. A., Olsen, Johan Gotthardt, Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J., Hamelryck, Thomas Wim & Winther, Jakob R., 2016, I: Journal of Molecular Biology. 428, 21, s. 4361-4377 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Revision of the Crystal Structure of the First Molecular Polymorph in History

    Johansson, Kristoffer Enøe & Van De Streek, J., 2 mar. 2016, I: Crystal Growth & Design. 16, 3, s. 1366-1370 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Local structure in the disordered solid solution of cis- and trans-perinones

    Teteruk, J. L., Glinnemann, J., Heyse, W., Johansson, Kristoffer Enøe, van de Streek, J. & Schmidt, M. U., jun. 2016, I: Acta Crystallographica. Section B: Structural Science. B72, s. 416-433 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. 2017
  20. Udgivet

    Computational Dehydration of Crystalline Hydrates Using Molecular Dynamics Simulations

    Larsen, A. S., Rantanen, Jukka & Johansson, Kristoffer Enøe, 2017, I: Journal of Pharmaceutical Sciences. 106, 1, s. 348-355 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Tracking dehydration mechanisms in crystalline hydrates with molecular dynamics simulations

    Larsen, A. S., Ruggiero, M. T., Johansson, Kristoffer Enøe, Zeitler, J. A. & Rantanen, Jukka, okt. 2017, I: Crystal Growth & Design. 17, 10, s. 5017-5022 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  22. 2018
  23. Udgivet

    Characterization of the hydrodynamics in a miniaturized dissolution apparatus

    Johansson, Kristoffer Enøe, Plum, J., Mosleh, M., Madsen, C. M., Rades, Thomas & Mullertz, Anette , 2018, I: Journal of Pharmaceutical Sciences. 107, 4, s. 1095-1103 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Protein evolution: Hacking an enzyme

    Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 2018, I: Nature Chemical Biology. 14, 3, s. 202-204 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Structural heterogeneity and dynamics in protein evolution and design

    Johansson, Kristoffer Enøe & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. 157-163 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Comprehensive mapping of GFP structure-function relationship using high-density peptide arrays

    Antonescu, O., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 10 jul. 2018.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskningfagfællebedømt

  27. 2019
  28. Udgivet

    Shining light on split fluorescent protein fitness landscapes using peptide array-based deep substitutional scanning

    ANTONESCU, O., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 30 jun. 2019.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Improving folding properties of computationally designed proteins

    Bjerre, B., Nissen, J., Madsen, M., Kamarauskaite, J., Norrild, R. K., Holm, Peter Christoffer, Nordentoft, M. K., O'Shea, Charlotte, Willemoës, Martin, Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 13 dec. 2019, I: Protein Engineering Design and Selection (Print). 32, 3, s. 145-151 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. 2020
  31. Udgivet

    Global analysis of protein stability by temperature and chemical denaturation

    Hamborg, L., Horsted, E. W., Johansson, Kristoffer Enøe, Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten & Teilum, Kaare, 2020, I: Analytical Biochemistry. 605, 7 s., 113863.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. 2021
  33. Udgivet

    Charge Interactions in a Highly Charge-Depleted Protein

    Hervø-Hansen, S., Højgaard, C., Johansson, Kristoffer Enøe, Wang, Y., Wahni, K., Young, D., Messens, J., Teilum, Kaare, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2021, I: Journal of the American Chemical Society. 143, 6, s. 2500-2508 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Computational and Experimental Assessment of Backbone Templates for Computational Redesign of the Thioredoxin Fold

    Marin, Frederikke Isa, Johansson, Kristoffer Enøe, O'Shea, Charlotte, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2021, I: The Journal of Physical Chemistry B. 125, 40, s. 11141-11149

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Substitutional landscape of a split fluorescent protein fragment using high-density peptide microarrays

    Antonescu, O. N., Rasmussen, A., Damm, N. A. M., Heidemann, Ditte Fogh, Popov, R., Nesterov-Mueller, A., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 2021, I: PLoS ONE. 16, 2, 17 s., e0241461.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Understanding the Origins of Loss of Protein Function by Analyzing the Effects of Thousands of Variants on Activity and Abundance

    Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Valanciute, A., Nielsen, S. V., Hartmann-Petersen, Rasmus, Yang, J. J., Fowler, D. M., Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2021, I: Molecular Biology and Evolution. 38, 8, s. 3235-3246

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. 2022
  38. Udgivet

    14-fold increased prevalence of rare glucokinase gene variant carriers in unselected Danish patients with newly diagnosed type 2 diabetes

    Gjesing, A. P., Engelbrechtsen, L., Cathrine B. Thuesen, A., Have, C. T., Hollensted, M., Grarup, N., Linneberg, A., Steen Nielsen, J., Christensen, L. B., Thomsen, R. W., Johansson, K. E., Cagiada, M., Gersing, S., Hartmann-Petersen, R., Lindorff-Larsen, K., Vaag, A., Sørensen, H. T., Brandslund, I., Beck-Nielsen, H., Pedersen, O. & 2 flere, Rungby, Jørgen & Hansen, Torben, 2022, I: Diabetes Research and Clinical Practice. 194, 9 s., 110159.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Conserved degronome features governing quality control associated proteolysis

    Mashahreh, B., Armony, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Chappleboim, A., Friedman, N., Gardner, R. G., Hartmann-Petersen, Rasmus, Lindorff-Larsen, Kresten & Ravid, T., 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 13 s., 7588.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Increasing protein stability by inferring substitution effects from high-throughput experiments

    Norrild, R. K., Johansson, Kristoffer Enøe, O'Shea, Charlotte, Morth, J. P., Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2022, I: Cell Reports Methods. 2, 11, 11 s., 100333.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. 2023
  42. Udgivet

    Global analysis of multi-mutants to improve protein function

    Johansson, Kristoffer Enøe, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 8, 15 s., 168034.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    HSP70-binding motifs function as protein quality control degrons

    Abildgaard, A. B., Voutsinos, Vasileios, Petersen, S. D., Larsen, Fia Brunsgaard Valsted, Kampmeyer, Caroline, Johansson, Kristoffer Enøe, Stein, Amelie, Ravid, T., Andréasson, C., Jensen, M. K., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2023, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 80, 1, 17 s., 32.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Prediction of Quality-control Degradation Signals in Yeast Proteins

    Johansson, Kristoffer Enøe, Mashahreh, B., Hartmann-Petersen, Rasmus, Ravid, T. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 2, 9 s., 167915.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Rapid protein stability prediction using deep learning representations

    Blaabjerg, Lasse Møller, Kassem, M. M., Good, L. L., Jonsson, Nicolas, Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Boomsma, Wouter, Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: eLife. 12, 19 s., e82593.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. 2024
  47. Udgivet

    A mutational atlas for Parkin proteostasis

    Clausen, L., Voutsinos, Vasileios, Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Grønbæk-Thygesen, Martin, Nariya, S., Powell, R. L., Have, M. K. N., Østergaard, Vibe Hallundbæk, Stein, Amelie, Fowler, D. M., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 17 s., 1541.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Conformational ensembles of the human intrinsically disordered proteome

    Tesei, Giulio, Trolle, A. I., Jonsson, Nicolas, Betz, J., Knudsen, F. E., Pesce, Francesco, Johansson, Kristoffer Enøe & Lindorff-Larsen, Kresten, 2024, I: Nature. 626, s. 897-904 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 11048943