Tom Gilbert
Professor
- Udgivet
Evaluating the Y chromosomal timescale in human demographic and lineage dating
Wang, C., Gilbert, M Thomas P, Jin, L. & Li, H., 2014, I: Investigative Genetics. 5, 7 s., 12.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Direct evidence of milk consumption from ancient human dental calculus
Warinner, C., Hendy, J., Speller, C., Cappellini, E., Fischer, R., Trachsel, C., Arneborg, J., Lynnerup, N., Craig, O. E., Swallow, D. M., Fotakis, A. K., Jersie-Christensen, R. R., Olsen, J. V., Liebert, A., Montalva, N., Fiddyment, S., Charlton, S., Mackie, M. E., Canci, A., Bouwman, A. & 3 flere, , 2014, I: Scientific Reports. 4, 6 s., 7104.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pathogens and host immunity in the ancient human oral cavity
Warinner, C., Rodrigues, J. F. M., Vyas, R., Trachsel, C., Shved, N., Grossmann, J., Radini, A., Hancock, Y., Tito, R. Y., Fiddyment, S., Speller, C., Hendy, J., Charlton, S., Luder, H. U., Salazar-García, D. C., Eppler, E., Seiler, R., Hansen, L. H., Samaniego Castruita, J. A., Barkow-Oesterreicher, S. & 12 flere, , 2014, I: Nature Genetics. 46, s. 336-344 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Direct evidence of milk consumption from ancient human dental calculus
Warinner, C., Hendy, J., Speller, C., Cappellini, E., Fischer, R., Trachsel, C., Arneborg, J., Lynnerup, N., Craig, O., Swallow, D. M., Fotakis, A. K., Christensen, R. J., Olsen, J. V., Liebert, A., Montalva, N., Fiddyment, S., Mackie, M., Canci, A., Bouwman, A., Ruhli, F. & 2 flere, , 2015, I: American Journal of Physical Anthropology. 156, Suppl. 60, s. 319 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pre-Clovis mastodon hunting 13,800 years ago at the Manis site, Washington
Waters, M. R., Stafford jr., T., McDonald, H. G., Gustafson, C., Rasmussen, M., Cappellini, Enrico, Olsen, Jesper Velgaard, Szklarczyk, D. M., Jensen, Lars Juhl, Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2011, I: Science. 334, 6054, s. 351-353 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The late Pleistocene distribution of vicunas (Vicugna vicugna) and the "extinction" of the gracile Llama ("Lama gracilis"): New molecular data
Weinstock, J., Gilbert, M Thomas P & Willerslev, Eske, 2009, I: Quaternary Science Reviews. 28, s. 1369-1373Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives: [version 1; peer review: 2 approved]
Westbury, Michael Vincent, Barnett, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Gower, Graham, Vieira, Filipe Garrett, de Manuel, M., Hansen, Anders Johannes, Yamaguchi, N., Werdelin, L., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lorenzen, Eline, 2021, I: Open Research Europe. 1, 15 s., 25.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A genomic exploration of the early evolution of extant cats and their sabre-toothed relatives: [version 2; peer review: 2 approved]
Westbury, Michael Vincent, Barnett, R., Sandoval-Velasco, Marcela, Gower, Graham, Vieira, Filipe Garrett, de Manuel, M., Hansen, Anders Johannes, Yamaguchi, N., Werdelin, L., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Lorenzen, Eline, 2021, I: Open Research Europe. 1, 16 s., 25.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The evolutionary history of cockatoos (Aves: Psittaciformes: Cacatuidae)
White, N. E., Phillips, M. J., Gilbert, M Thomas P, Alfaro Nuñez, L. A., Willerslev, Eske, Mawson, P. R., Spencer, P. B. S. & Bunce, M., jun. 2011, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 59, 3, s. 615-622 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss
Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diverse plant and animal genetic records from Holocene and Pleistocene sediments
Willerslev, Eske, Hansen, Anders Johannes, Binladen, J., Brand, T. B., Gilbert, M Thomas P, Shapiro, B., Bunce, M., Wiuf, C., Gilichinsky, D. A. & Cooper, A., 2003, I: Science. 300, 5620, s. 791-5Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient biomolecules from deep ice cores reveal a forested southern Greenland.
Willerslev, E., Cappellini, E., Boomsma, W. K., Nielsen, R., Hebsgaard, M. B., Brand, T. B., Hofreiter, M., Bunce, M., Poinar, H. N., Dahl-Jensen, D., Johnsen, S. J., Steffensen, J. P., Bennike, O., Schwenninger, J-L., Nathan, R., Armitage, S., de Hoog, C-J., Alfimov, V., Christl, M., Beer, J. & 10 flere, , 2007, I: Science. 317, 5834, s. 111-114 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Analysis of complete mitochondrial genomes from extinct and extant rhinoceroses reveals lack of phylogenetic resolution
Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P, Binladen, J., Ho, S. Y. W., Campos, P. F., Ratan, A., Tomsho, L. P., da Fonseca, R. R., Sher, A., Kuznetsova, T. V., Nowak-Kemp, M., Roth, T. L., Miller, W. & Schuster, S. C., 2009, I: BMC Evolutionary Biology. 9, s. 95Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fifty thousand years of Arctic vegetation and megafaunal diet
Willerslev, E., Davison, J., Moora, M., Zobel, M., Coissac, E., Edwards, M. E., Lorenzen, E., Vestergård, M., Gussarova, G., Haile, J. S., Craine, J., Gielly, L., Boessenkool, S., Epp, L. S., Pearman, P. B., Cheddadi, R., Murray, D., Bråthen, K. A., Yoccoz, N., Binney, H. & 30 flere, , 2014, I: Nature. 506, 7486, s. 47-51 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stable isotope and DNA evidence for ritual sequences in Inca child sacrifice.
Wilson, A. S., Taylor, T., Ceruti, M. C., Chavez, J. A., Reinhard, J., Grimes, V., Meier-Augenstein, W., Cartmell, L., Stern, B., Richards, M. P., Worobey, M., Barnes, I. & Gilbert, M Thomas P, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 42, s. 16456-61 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mitochondrial genome diversity and population structure of the giant squid Architeuthis: genetics sheds new light on one of the most enigmatic marine species
Winkelmann, I. E. H., Campos, P., Strugnell, J., Cherel, Y., Smith, P. J., Kubodera, T., Allcock, L., Kampmann, Marie-Louise, Schroeder, Hannes, Guerra, A., Norman, M., Finn, J., Ingrao, D., Clarke, M. & Gilbert, M Thomas P, 22 maj 2013, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 280, 1759, 9 s., 20130273.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Direct evidence of extensive diversity of HIV-1 in Kinshasa by 1960
Worobey, M., Gemmel, M., Teuwen, D. E., Haselkorn, T., Kunstman, K., Bunce, M., Muyembe, J., Kabongo, J. M., Kalengayi, R. M., Van Marck, E., Gilbert, M Thomas P & Wolinsky, S. M., 2008, I: Nature. 455, 7213, s. 661-4 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reply to Pape et al.: the phylogeography of HIV-1 group M subtype B.
Worobey, M., Pitchenik, A. E., Gilbert, M Thomas P, Wlasiuk, G. & Rambaut, A., 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 105, 12, s. E16Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Historical mammal extinction on Christmas Island (Indian Ocean) correlates with introduced infectious disease
Wyatt, K. B., Campos, P. F., Gilbert, M Thomas P, Kolokotronis, S., Hynes, W. H., DeSalle, R., Daszak, P., MacPhee, R. D. E. & Greenwood, A. D., 2008, I: PLoS ONE. 3, 11, s. e3602Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA from soil mirrors plant taxonomic and growth form diversity
Yoccoz, N. G., Bråthen, K. A., Gielly, L., Haile, J. S., Edwards, M. E., Goslar, T., von Stedingk, H., Brysting, A. K., Coissac, E., Pompanon, F., Sønstebo, J. H., Miquel, C., Valentini, A., de Bello, F., Chave, J., Thuiller, W., Wincker, P., Cruaud, C., Gavory, F., Rasmussen, M. & 5 flere, , 1 aug. 2012, I: Molecular Ecology. 21, 15, s. 3647-3655 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Environmental genes and genomes: understanding the differences and challenges in the approaches and software for their analyses
Zepeda Mendoza, M. L., Sicheritz-Pontén, T. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Briefings in Bioinformatics. 16, 5, s. 745-758 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DAMe: a toolkit for the initial processing of datasets with PCR replicates of double-tagged amplicons for DNA metabarcoding analyses
Zepeda Mendoza, M. L., Bohmann, Kristine, Baez, A. C. & Gilbert, M Thomas P, 2016, I: BMC Research Notes. 9, 13 s., 255.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hologenomic adaptations underlying the evolution of sanguivory in the common vampire bat
Zepeda Mendoza, M. L., Xiong, Z., Escalera-Zamudio, M., Runge, A. K. W., Thézé, J., Streicker, D., Frank, H. K., Loza-Rubio, E., Liu, S., Ryder, O. A., Castruita, J. A. S., Katzourakis, A., Pacheco, G. A., Taboada, B., Löber, U., Pybus, O. G., Li, Y., Rojas-Anaya, E., Bohmann, K., Carmona Baez, A. & 9 flere, , 2018, I: Nature Ecology & Evolution. 2, 4, s. 659-668 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protective role of the vulture facial skin and gut microbiomes aid adaptation to scavenging
Zepeda Mendoza, M. L., Roggenbuck, M., Manzano Vargas, K., Hansen, L. H., Brunak, Søren, Gilbert, M Thomas P & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2018, I: Acta Veterinaria Scandinavica. 60, 1, s. 1-19 19 s., 61.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bird sequencing project takes off
KU, thw266, Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature. 522, 7554, s. 34 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A flock of Genomes
KU, thw266, Jarvis, E. D. & Gilbert, M Thomas P, 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1308-1309 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation
Zhang, G., Li, C., Li, Q., Li, B., Larkin, D. M., Lee, C., Storz, J. F., Antunes, A., Greenwold, M. J., Meredith, R. W., Ödeen, A., Cui, J., Zhou, Q., Xu, L., Pan, H., Wang, Z., Jin, L., Zhang, P., Hu, H., Yang, W. & 85 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1311-1320 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genomic data of the Avian Phylogenomics Project
KU, thw266, Li, B., Li, C., Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., Wang, J. & Avian Genome Consortium, A. G. C., 2014, I: GigaScience. 3, 8 s., 26.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On the origin and evolution of RNA editing in metazoans
Zhang, P., Zhu, Y., Guo, Q., Li, J., Zhan, X., Yu, H., Xie, N., Tan, H., Lundholm, Nina, Garcia-Cuetos, L., Martin, M. D., Subirats, M. A., Su, Y., Ruiz-Trillo, I., Martindale, M. Q., Yu, J., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Li, Q., 2023, I: Cell Reports. 42, 2, 22 s., 112112.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complex evolutionary trajectories of sex chromosomes across bird taxa
Zhou, Q., Zhang, J., Bachtrog, D., An, N., Huang, Q., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2014, I: Science. 346, 6215, 8 s., 1246338.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pan-genome Analysis of Ancient and Modern Salmonella enterica Demonstrates Genomic Stability of the Invasive Para C Lineage for Millennia
Zhou, Z., Lundstrøm, I. K. C., Tran-Dien, A., Duchêne, S., Alikhan, N., Sergeant, M. J., Langridge, G., Fotaki, Anna Katerina, Nair, S., Stenøien, H. K., Hamre, S. S., Casjens, S., Christophersen, A., Quince, C., Thomson, N. R., Weill, F., Ho, S. Y. W., Gilbert, M Thomas P & Achtman, M., 6 aug. 2018, I: Current Biology. 28, 15, s. 2420-2429 20 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA metabarcoding - need for robust experimental designs to draw sound ecological conclusions
Zinger, L., Bonin, A., Alsos, I. G., Bálint, M., Bik, H., Boyer, F., Chariton, A. A., Creer, S., Coissac, E., Deagle, B. E., De Barba, M., Dickie, I. A., Dumbrell, A. J., Ficetola, G. F., Fierer, N., Fumagalli, L., Gilbert, M. T. P., Jarman, S., Jumpponen, A., Kauserud, H. & 7 flere, , 2019, I: Molecular Ecology. 28, 8, s. 1857-1862 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux
da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, , 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomics of the world's otters
de Ferran, V., Figueiró, H. V., Trindade, F. D. J., Smith, O., Sinding, Mikkel Holger Strander, Trinca, C. S., Lazzari, G. Z., Veron, G., Vianna, J. A., Barbanera, F., Kliver, S., Serdyukova, N., Bulyonkova, T., Ryder, O. A., Gilbert, M Thomas P, Koepfli, K. & Eizirik, E., 2022, I: Current Biology. 32, 16, s. 3650-3658.e4 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The evolutionary history of extinct and living lions
de Manuel, M., Barnett, R., Sandoval-Velasco, M., Yamaguchi, N., Vieira, F. G., Mendoza, M. L. Z., Liu, S., Martin, M. D., Sinding, M-H. S., Mak, S. S. T., Caroe, C., Liu, S., Guo, C., Zheng, J., Zazula, G., Baryshnikov, G., Eizirik, E., Koepfli, K-P., Johnson, W. E., Antunes, A. & 9 flere, , 2020, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 20, s. 10927-10934 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic affinities of an eradicated European Plasmodium falciparum strain
de-Dios, T., van Dorp, L., Gelabert, P., Carøe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Fregel, R., Escosa, R., Aranda, C., Huijben, S., Balloux, F., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2019, I: Microbial Genomics. 5, 9, 7 s., 289.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bone marrow and bone as a source for postmortem RNA
van Doorn, N. L., Wilson, A. S., Willerslev, Eske & Gilbert, M Thomas P, 2011, I: Journal of Forensic Sciences. 56, 3, s. 720-725 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmodium vivax Malaria Viewed through the Lens of an Eradicated European Strain
van Dorp, L., Gelabert, P., Rieux, A., de Manuel, M., de-Dios, T., Gopalakrishnan, Shyam, Caroe, C., Sandoval-Velasco, Marcela, Fregel, R., Olalde, I., Escosa, R., Aranda, C., Huijben, S., Mueller, I., Marques-Bonet, T., Balloux, F., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 37, 3, s. 773-785 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Founding Feathers: The true ancestry of the domestic Barbary Dove
van Grouw, H., Hernández-Alonso, G., Cavill, Emily Louisa & Gilbert, M Thomas P, 2023, I: Bulletin of the British Ornithologists' Club. 143, 2, s. 153-171 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic insights into the conservation status of the world's last remaining Sumatran rhinoceros populations
von Seth, J., Dussex, N., Diez-del-Molino, D., van der Valk, T., Kutschera, V. E., Kierczak, M., Steiner, C. C., Liu, S., Gilbert, M. T. P., Sinding, M-H. S., Prost, S., Guschanski, K., Nathan, S. K. S. S., Brace, S., Chan, Y. L., Wheat, C. W., Skoglund, P., Ryder, O. A., Goossens, B., Gotherstrom, A. & 1 flere, , 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 11 s., 2393.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Performance of Two Whole Genome Capture Methodologies on Ancient DNA Illumina Libraries
Ávila-Arcos, M. C., Sandoval-Velasco, Marcela, Schroeder, Hannes, Carpenter, M. L., Malaspinas, A., Wales, N., Peñaloza, F., Bustamante, C. D. & Gilbert, M Thomas P, 2014, 6 udg., bioRxiv, 37 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
ID: 12980
Flest downloads
-
6191
downloads
Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5645
downloads
Deep sequencing of RNA from ancient maize kernels
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5252
downloads
True single-molecule DNA sequencing of a pleistocene horse bone
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet