thw266 KU

thw266 KU

Professor, Adjungeret professor

Medlem af:


    1. 2022
    2. Udgivet

      A complete, telomere-to-telomere human genome sequence presents new opportunities for evolutionary genomics

      Mao, Y. & KU, thw266, 2022, I: Nature Methods. 19, 6, s. 635-638 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      A haplotype-resolved genome assembly of the Nile rat facilitates exploration of the genetic basis of diabetes

      Toh, H., Yang, C., Formenti, G., Raja, K., Yan, L., Tracey, A., Chow, W., Howe, K., Bergeron, L. A., Zhang, G., Haase, B., Mountcastle, J., Fedrigo, O., Fogg, J., Kirilenko, B., Munegowda, C., Hiller, M., Jain, A., Kihara, D., Rhie, A. & 9 flere, Phillippy, A. M., Swanson, S. A., Jiang, P., Clegg, D. O., Jarvis, E. D., Thomson, J. A., Stewart, R., Chaisson, M. J. P. & Bukhman, Y. V., 2022, I: BMC Biology. 20, 21 s., 245.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      A single-cell transcriptomic atlas tracking the neural basis of division of labour in an ant superorganism

      Li, Q., Wang, M., Zhang, P., Liu, Y., Guo, Q., Zhu, Y., Wen, T., Dai, X., Zhang, X., Nagel, M., Dethlefsen, B. H., Xie, N., Zhao, J., Jiang, W., Han, L., Wu, L., Zhong, W., Wang, Z., Wei, X., Dai, W. & 9 flere, Liu, L., Xu, X., Lu, H., Yang, H., Wang, J., Boomsma, Jacobus J., Liu, C., KU, thw266 & Liu, W., 2022, I: Nature Ecology & Evolution. 6, 8, s. 1191-1204

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Adaptation and Cryptic Pseudogenization in Penguin Toll-Like Receptors

      Fiddaman, S. R., Vinkler, M., Spiro, S. G., Levy, H., Emerling, C. A., Boyd, A. C., Dimopoulos, E. A., Vianna, J. A., Cole, T. L., Pan, H., Fang, M., KU, thw266, Hart, T., Frantz, L. A. F. & Smith, A. L., 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 1, 17 s., msab354.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      Ancient proteins resolve controversy over the identity of Genyornis eggshell

      Demarchi, B., Stiller, Josefin, Grealy, A., Mackie, Meaghan, Deng, Y., Gilbert, M Thomas P, Clarke, J., Legendre, L. J., Boano, R., Sicheritz-Pontén, Thomas, Magee, J., KU, thw266, Bunce, M., Collins, Matthew James & Miller, G., 2022, I: PNAS. 119, 43, 9 s., e2109326119.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Canalized gene expression during development mediates caste differentiation in ants

      Qiu, Bitao, Dai, X., Li, P., Larsen, Rasmus Stenbak, Li, Ruyan, Price, A. L., Ding, G., Texada, Michael James, Zhang, X., Zuo, D., Gao, Q., Jiang, W., Wen, T., Pontieri, L., Guo, C., Rewitz, Kim, Li, Q., Liu, W., Boomsma, Jacobus J. & KU, thw266, 2022, I: Nature Ecology and Evolution. 6, 11, s. 1753-1765

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      Comparative phylogeography study reveals introgression and incomplete lineage sorting during rapid diversification of Rhodiola

      You, J., Lougheed, S. C., Zhao, Y., KU, thw266, Liu, W., Lu, F., Wang, Y., Zhang, W., Yang, J., Qiong, L. & Song, Z., 2022, I: Annals of Botany. 129, 2, s. 185-200 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Conservation genomics of the endangered Seychelles Magpie-Robin (Copsychus sechellarum): a unique insight into the history of a precious endemic bird

      Cavill, Emily Louisa, Gopalakrishnan, Shyam, Puetz, Lara Christine, Ribeiro, Â. M., Mak, Sarah Siu Tze, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Antunes Pacheco, George, Dunlop, B., Accouche, W., Shah, N., Zora, A., Calabrese, L., Genner, M., Jones, G., Guo, C., KU, thw266 & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Ibis. 164, 2, s. 396-410 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Draft genome assemblies of four manakins

      Li, X., Gao, R., Chen, G., Price, A. L., Øksnebjerg, Daniel Bilyeli, Hosner, Peter Andrew, Zhou, Y., KU, thw266 & Feng, S., 2022, I: Scientific Data. 9, 11 s., 564.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      False gene and chromosome losses in genome assemblies caused by GC content variation and repeats

      Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Yoo, D. A., Won, S., Phillippy, A. M., Fedrigo, O., KU, thw266, Howe, K., Wood, J., Durbin, R., Formenti, G., Brown, S., Cantin, L., Mello, C. V., Cho, S., Rhie, A., Kim, H. & Jarvis, E. D., 2022, I: Genome Biology. 23, 29 s., 204.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Functional Diversity and Evolution of Bitter Taste Receptors in Egg-Laying Mammals

      Itoigawa, A., Hayakawa, T., Zhou, Y., Manning, A. D., KU, thw266, Grutzner, F. & Imai, H., 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 6, 9 s., msac107.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      Functional genomics analysis reveals the evolutionary adaptation and demographic history of pygmy lorises

      Li, M. L., Wang, S., Xu, P., Tian, H. Y., Bai, M., Zhang, Y. P., Shao, Y., Xiong, Z. J., Qi, X. G., Cooper, D. N., KU, thw266, Zhu, H. H. & Wu, D. D., 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 40, 10 s., e2123030119.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      Genetic load and adaptive potential of a recovered avian species that narrowly avoided extinction

      Femerling Romero, Maria Georgette, Oosterhout, C. V., Feng, S., Bristol, R. M., KU, thw266, Groombridge, J., Gilbert, M Thomas P & Morales Villegas, Hernan Eduardo, 2022, bioRxiv, 23 s.

      Publikation: Working paperPreprintForskning

    15. Udgivet

      Genomic insights into the secondary aquatic transition of penguins

      Cole, T. L., Zhou, C., Fang, M., Pan, H., Ksepka, D. T., Fiddaman, S. R., Emerling, C. A., Thomas, D. B., Bi, X., Fang, Q., Ellegaard, M. R., Feng, S., Smith, A. L., Heath, T. A., Tennyson, A. J. D., Borboroglu, P. G., Wood, J. R., Hadden, P. W., Grosser, S., Bost, C. A. & 20 flere, Cherel, Y., Mattern, T., Hart, T., Sinding, Mikkel Holger Strander, Shepherd, L. D., Phillips, R. A., Quillfeldt, P., Masello, J. F., Bouzat, J. L., Ryan, P. G., Thompson, D. R., Ellenberg, U., Dann, P., Miller, G., Dee Boersma, P., Zhao, R., Gilbert, M Thomas P, Yang, H., Zhang, D. & KU, thw266, 2022, I: Nature Communications. 13, 13 s., 3912.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      Incomplete lineage sorting and phenotypic evolution in marsupials

      Feng, S., Bai, M., Rivas-González, I., Li, C., Liu, S., Tong, Y., Yang, H., Chen, G., Xie, D., Sears, K. E., Franco, L. M., Gaitan-Espitia, J. D., Nespolo, R. F., Johnson, W. E., Yang, H., Brandies, P. A., Hogg, C. J., Belov, K., Renfree, M. B., Helgen, K. M. & 3 flere, Boomsma, Jacobus J., Schierup, M. H. & KU, thw266, 2022, I: Cell. 185, 10, s. 1646-1660.e18

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      Initiation of the Primate Genome Project

      Wu, D., Qi, X., Yu, L., Li, M., Liu, Z., Yoder, A. D., Roos, C., Hayakawa, T., Rogers, J., Marques-Bonet, T., Su, B., Yao, Y., Zhang, Y. & KU, thw266, 2022, I: Zoological research. 43, 2, s. 147-149 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      Origin and Deep Evolution of Human Endogenous Retroviruses in Pan-Primates

      Li, Y., KU, thw266 & Cui, J., 2022, I: Viruses. 14, 7, 14 s., 1370.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      Orthologous microsatellites, transposable elements, and DNA deletions correlate with generation time and body mass in neoavian birds

      Ji, Y., Feng, S., Wu, L., Fang, Q., Brüniche-Olsen, Anna, DeWoody, J. A., Cheng, Y., Zhang, D., Hao, Y., Song, G., Qu, Y., Suh, A., KU, thw266, Hackett, S. J. & Lei, F., 2022, I: Science Advances. 8, 35, 11 s., eabo0099.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      Phylogenomic analyses of the genus Drosophila reveals genomic signals of climate adaptation

      Li, F., Rane, R. V., Luria, V., Xiong, Z., Chen, J., Li, Z., Catullo, R. A., Griffin, P. C., Schiffer, M., Pearce, S., Lee, S. F., McElroy, K., Stocker, A., Shirriffs, J., Cockerell, F., Coppin, C., Sgrò, C. M., Karger, A., Cain, J. W., Weber, J. A. & 5 flere, Santpere, G., Kirschner, M. W., Hoffmann, A. A., Oakeshott, J. G. & KU, thw266, 2022, I: Molecular Ecology Resources. 22, 4, s. 1559-1581 23 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    21. Udgivet

      Phylogeny and sex chromosome evolution of palaeognathae

      Wang, Z., Zhang, J., Xu, X., Witt, C., Deng, Y., Chen, G., Meng, G., Feng, S., Xu, L., Szekely, T., KU, thw266 & Zhou, Q., 2022, I: Journal of Genetics and Genomics. 49, 2, s. 109-119 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    22. Udgivet

      Probing the genomic limits of de-extinction in the Christmas Island rat

      Lin, J., Duchene, David, Carøe, C., Smith, O., Ciucani, M. M., Niemann, Jonas, Richmond, D., Greenwood, A. D., MacPhee, R., KU, thw266, Gopalakrishnan, Shyam & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 7, s. 1650-1656.e3

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Udgivet

      Species-specific traits mediate avian demographic responses under past climate change

      Germain, Ryan Ross, Feng, S., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Nogues, David Bravo, 2022, bioRxiv, 24 s.

      Publikation: Working paperPreprintForskning

    24. Udgivet

      Standards recommendations for the Earth BioGenome Project

      Lawniczak, M. K. N., Durbin, R., Flicek, P., Lindblad-Toh, K., Wei, X., Archibald, J. M., Baker, W. J., Belov, K., Blaxter, M. L., Bonet, T. M., Childers, A. K., Coddington, J. A., Crandall, K. A., Crawford, A. J., Davey, R. P., Palma, F. D., Fang, Q., Haerty, W., Hall, N., Hoff, K. J. & 25 flere, Howe, K., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Johnson, R. N., Kersey, P. J., Liu, X., Lopez, J. V., Myers, E. W., Pettersson, O. V., Phillippy, A. M., Poelchau, M. F., Pruitt, K. D., Rhie, A., Castilla-Rubio, J. C., Sahu, S. K., Salmon, N. A., Soltis, P. S., Swarbreck, D., Thibaud-Nissen, F., Wang, S., Wegrzyn, J. L., KU, thw266, Zhang, H., Lewin, H. A. & Richards, S., 2022, I: PNAS. 119, 4, 8 s., e2115639118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      The Earth BioGenome Project 2020: Starting the clock

      Lewin, H. A., Richards, S., Aiden, E. L., Allende, M. L., Archibald, J. M., Bálint, M., Barker, K. B., Baumgartner, B., Belov, K., Bertorelle, G., Blaxter, M. L., Cai, J., Caperello, N. D., Carlson, K., Castilla-Rubio, J. C., Chaw, S. M., Chen, L., Childers, A. K., Coddington, J. A., Conde, D. A. & 65 flere, Corominas, M., Crandall, K. A., Crawford, A. J., DiPalma, F., Durbin, R., Ebenezer, T. E., Edwards, S. V., Fedrigo, O., Flicek, P., Formenti, G., Gibbs, R. A., Gilbert, M Thomas P, Goldstein, M. M., Graves, J. M., Greely, H. T., Grigoriev, I. V., Hackett, K. J., Hall, N., Haussler, D., Helgen, K. M., Hogg, C. J., Isobe, S., Jakobsen, K. S., Janke, A., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Jones, S. J. M., Karlsson, E. K., Kersey, P. J., Kim, J. H., Kress, W. J., Kuraku, S., Lawniczak, M. K. N., Leebens-Mack, J. H., Li, X., Lindblad-Toh, K., Liu, X., Lopez, J. V., Marques-Bonet, T., Mazard, S., Mazet, J. A. K., Mazzoni, C. J., Myers, E. W., O’Neill, R. J., Paez, S., Park, H., Robinson, G. E., Roquet, C., Ryder, O. A., Sabir, J. S. M., Shaffer, H. B., Shank, T. M., Sherkow, J. S., Soltis, P. S., Tang, B., Tedersoo, L., Uliano-Silva, M., Wang, K., Wei, X., Wetzer, R., Wilson, J. L., Xu, X., Yang, H., Yoder, A. D. & KU, thw266, 2022, I: PNAS. 119, 4, 7 s., e2115635118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      The Mutationathon highlights the importance of reaching standardization in estimates of pedigree-based germline mutation rates

      Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Turner, T. N., Versoza, C. J., Wang, R. J., Price, A. L., Armstrong, E., Riera, M., Carlson, J., Chen, Hwei-Yen, Hahn, M. W., Harris, K., Kleppe, A. S., López-Nandam, E. H., Moorjani, P., Pfeifer, S. P., Tiley, G. P., Yoder, A. D., KU, thw266 & Schierup, M. H., 2022, I: eLife. 11, 28 s., e73577.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    27. Udgivet

      The era of reference genomes in conservation genomics

      Formenti, G., Theissinger, K., Fernandes, C., Bista, I., Bombarely, A., Bleidorn, C., Ciofi, C., Crottini, A., Godoy, J. A., Höglund, J., Malukiewicz, J., Mouton, A., Oomen, R. A., Paez, S., Palsbøll, P. J., Pampoulie, C., Ruiz-López, M. J., Svardal, H., Theofanopoulou, C., de Vries, J. & 8 flere, Waldvogel, A. M., KU, thw266, Mazzoni, C. J., Jarvis, E., Bálint, M., Gilbert, M Thomas P, tsr259, tsr259 & European Reference Genome Atlas (ERGA) Consortium, E. R. G. A. (. C., 2022, I: Trends in Ecology and Evolution. 37, 3, s. 197-202 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    28. Udgivet

      Transcriptome innovations in primates revealed by single-molecule long-read sequencing

      Ferrández-Peral, L., Zhan, X., Alvarez-Estape, M., Chiva, C., Esteller-Cucala, P., García-Pérez, R., Julià, E., Lizano, E., Fornas, Ò., Sabidó, E., Li, Q., Marquès-Bonet, T., Juan, D. & KU, thw266, 2022, I: Genome Research. 32, 8, s. 1448-1462 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    29. Udgivet

      Unparalleled details of soft tissues in a Cretaceous ant

      Zhuang, Y., Xu, W., KU, thw266, Mai, H., Li, X., He, H., Ran, H. & Liu, Y., 2022, I: BMC Ecology and Evolution. 22, 1, 10 s., 146.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    30. Udgivet

      Validation of Potential Reference Genes for Real-Time qPCR Analysis in Pharaoh Ant, Monomorium pharaonis (Hymenoptera: Formicidae)

      Ding, G., Gao, Q., Chen, J., Zhao, J., KU, thw266 & Liu, W., 2022, I: Frontiers in Physiology. 13, 9 s., 852357.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    31. Udgivet

      Why sequence all eukaryotes?

      Blaxter, M., Archibald, J. M., Childers, A. K., Coddington, J. A., Crandall, K. A., Di Palma, F., Durbin, R., Edwards, S. V., Graves, J. A. M., Hackett, K. J., Hall, N., Jarvis, E. D., Johnson, R. N., Karlsson, E. K., Kress, W. J., Kuraku, S., Lawniczak, M. K. N., Lindblad-Toh, K., Lopez, J. V., Moran, N. A. & 7 flere, Robinson, G. E., Ryder, O. A., Shapiro, B., Soltis, P. S., Warnow, T., KU, thw266 & Lewin, H. A., 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 4, 9 s., e2115636118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    ID: 40294134