Sune Darkner

Sune Darkner

Lektor

ORCID: 0000-0001-6114-7100

Udgivelsesår:
Alle
1 - 87 ud af 87Pr. side: 500
Sortering: Udgivelsesår
  1. 2023
  2. Udgivet

    Collision-constrained deformable image registration framework for discontinuity management

    Alscher, Thomas Michael, Erleben, Kenny & Darkner, Sune, 2023, I: PLoS ONE. 18, 8, 15 s., e0290243.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Performance and Agreement When Annotating Chest X-ray Text Reports - A Preliminary Step in the Development of a Deep Learning-Based Prioritization and Detection System

    Li, D., Pehrson, Lea Marie, Bonnevie, R., Fraccaro, M., Thrane, J., Tøttrup, L., Lauridsen, C. A., Balaganeshan, Sedrah Butt, Jankovic, J., Andersen, T. T., Mayar, A., Hansen, Kristoffer Lindskov, Carlsen, Jonathan Frederik, Darkner, Sune & Nielsen, Michael Bachmann, 2023, I: Diagnostics. 13, 6, 24 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  4. Accepteret/In press

    Pseudo-Label Guided Image Synthesis for Semi-Supervised COVID-19 Pneumonia Infection Segmentation

    Lyu, F., Ye, M., Carlsen, J. F., Erleben, Kenny, Darkner, Sune & Yuen, P. C., 2023, (Accepteret/In press) I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    A hybrid approach to full-scale reconstruction of renal arterial network

    Xu, Peidi, von Holstein-Rathlou, Niels-Henrik, Søgaard, S. B., Gundlach, C., Sørensen, Charlotte Mehlin, Erleben, Kenny, Sosnovtseva, Olga & Darkner, Sune, 9 maj 2023, I: Scientific Reports. 13, 1, 15 s., 7569.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  6. 2022
  7. Udgivet

    Revisiting Transformer-based Models for Long Document Classification

    Dai, X., Chalkidis, Ilias, Darkner, Sune & Elliott, Desmond, 2022, Findings of the Association for Computational Linguistics: EMNLP 2022. Association for Computational Linguistics, s. 7212–7230

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Open-Full-Jaw: An open-access dataset and pipeline for finite element models of human jaw

    Gholamalizadeh, T., Moshfeghifar, Faezeh, Ferguson, Z., Schneider, T., Panozzo, D., Darkner, Sune, Makaremi, M., Chan, F., Lempel Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 1 sep. 2022, I: Computer Methods and Programs in Biomedicine. 224, 17 s., 107009.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Information-Theoretic Registration with Explicit Reorientation of Diffusion-Weighted Images

    Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard & Darkner, Sune, 2022, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 64, s. 1-16

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Inter- and Intra-Observer Agreement When Using a Diagnostic Labeling Scheme for Annotating Findings on Chest X-rays—An Early Step in the Development of a Deep Learning-Based Decision Support System

    Li, D., Pehrson, Lea Marie, Tøttrup, L., Fraccaro, M., Bonnevie, R., Thrane, J., Sørensen, P. J., Rykkje, A., Andersen, T. T., Steglich-Arnholm, H., Stærk, D. M. R., Borgwardt, L., Hansen, Kristoffer Lindskov, Darkner, Sune, Carlsen, Jonathan Frederik & Nielsen, Michael Bachmann, 2022, I: Diagnostics. 12, 12, 3112.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Bundle geodesic convolutional neural network for diffusion-weighted imaging segmentation

    Liu, Renfei, Lauze, Francois Bernard, Erleben, Kenny, Berg, Rune W. & Darkner, Sune, 2022, I: Journal of Medical Imaging. 9, 6, 14 s., 064002.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Reducing Annotation Need in Self-explanatory Models for Lung Nodule Diagnosis

    Lu, J., Yin, C., Krause, Oswin, Erleben, Kenny, Nielsen, Michael Bachmann & Darkner, Sune, 2022, Interpretability of Machine Intelligence in Medical Image Computing. Reyes, M., Abreu, PH. & Cardoso, J. (red.). Springer, s. 33-43 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 13611).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Fast Vortex Particle Method for Fluid-Character Interaction

    Meldgaard, A., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, I: OpenReview.net. 2022, 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel

  14. Udgivet

    A Direct Geometry Processing Cartilage Generation Method Using Segmented Bone Models from Datasets with Poor Cartilage Visibility

    Moshfeghifar, Faezeh, Nielsen, M. K., Tascon Vidarte, J. D., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, Computational Biomechanics for Medicine: Towards Translation and Better Patient Outcomes. Springer, s. 155.169

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    LibHip: An open-access hip joint model repository suitable for finite element method simulation

    Moshfeghifar, Faezeh, Gholamalizadeh, T., Ferguson, Z., Schneider, T., Nielsen, Michael Bachmann, Panozzo, D., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, I: Computer Methods and Programs in Biomedicine. 226, 14 s., 107140.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    RootPainter3D: Interactive-machine-learning enables rapid and accurate contouring for radiotherapy

    Smith, Abraham George, Petersen, Jens, Terrones-Campos, C., Berthelsen, A. K., Forbes, N. J., Darkner, Sune, Specht, Lena & Vogelius, I. R., 2022, I: Medical Physics. 49, 1, s. 461-473

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    An algebra for local histograms

    Sporring, Jon & Darkner, Sune, 2022, I: Frontiers in Computer Science. 4, s. 1-9 939563.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Reconstructing Binary Signals from Local Histograms

    Sporring, Jon & Darkner, Sune, 21 mar. 2022, I: Entropy. 24, 3, s. 1-11 433.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Accuracy and consistency of intensity-based deformable image registration in 4DCT for tumor motion estimation in liver radiotherapy planning

    Tascon-Vidarte, J. D., Stick, L. B., Josipovic, Mirjana, Risum, S., Jomier, J., Erleben, Kenny, Vogelius, Ivan R. & Darkner, Sune, jul. 2022, I: PLoS ONE. 17, 7 July, s. 1-15 e0271064.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Auto-segmentation of Hip Joints Using MultiPlanar UNet with Transfer Learning

    Xu, Peidi, Moshfeghifar, Faezeh, Gholamalizadeh, T., Nielsen, Michael Bachmann, Erleben, Kenny & Darkner, Sune, 2022, Medical Image Learning with Limited and Noisy Data: First International Workshop, MILLanD 2022 Held in Conjunction with MICCAI 2022 Singapore, September 22, 2022 Proceedings. Zamzmi, G., Antani, S., Rajaraman, S., Xue, Z., Bagci, U. & Linguraru, M. G. (red.). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, s. 153-162 10 s. (Medical Image Learning with Limited and Noisy Data, Bind 13559).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  21. 2021
  22. Udgivet

    Contact modeling from images using cut finite element solvers

    Claus, S., Kerfriden, P., Moshfeghifar, Faezeh, Darkner, Sune, Erleben, Kenny & Wong, Christian, 2021, I: Advanced Modeling and Simulation in Engineering Sciences. 8, 1, s. 1-23 13.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    First Order Locally Orderless Registration

    Darkner, Sune, Vidarte, J. D. T. & Lauze, Francois Bernard, 2021, Scale Space and Variational Methods in Computer Vision - 8th International Conference, SSVM 2021, Proceedings. Elmoataz, A., Fadili, J., Quéau, Y., Rabin, J. & Simon, L. (red.). Springer, s. 177-188 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 12679 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    A multi-patient analysis of the center of rotation trajectories using finite element models of the human mandible

    Gholamalizadeh, T., Darkner, Sune, Søndergaard, P. L. & Erleben, Kenny, 2021, I: PLoS ONE. 16, 11 November, 16 s., e0259794.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    OpenJaw Dataset

    Gholamalizadeh, T., Darkner, Sune, Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 2021

    Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Datasæt › Forskning

  26. Udgivet

    The added effect of artificial intelligence on physicians’ performance in detecting thoracic pathologies on CT and chest X-ray: A systematic review

    Li, D., Pehrson, Lea Marie, Lauridsen, C. A., Tøttrup, L., Fraccaro, M., Elliott, Desmond, Zajac, Hubert Dariusz, Darkner, Sune, Carlsen, Jonathan Frederik & Nielsen, Michael Bachmann, 2021, I: Diagnostics. 11, 12, 17 s., 2206.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Bundle Geodesic Convolutional Neural Network for DWI Segmentation from Single Scan Learning

    Liu, Renfei, Lauze, Francois Bernard, Erleben, Kenny & Darkner, Sune, 2021, Computational Diffusion MRI - 12th International Workshop, CDMRI 2021, Held in Conjunction with MICCAI 2021, Proceedings. Cetin-Karayumak, S., Christiaens, D., Figini, M., Guevara, P., Gyori, N., Nath, V. & Pieciak, T. (red.). Springer, s. 121-132 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 13006 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    U-Sleep: resilient high-frequency sleep staging

    Perslev, M., Darkner, Sune, Kempfner, L., Nikolic, M., Jennum, Poul & Igel, Christian, 15 apr. 2021, I: npj Digital Medicine. 4, 1, 12 s., 72.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Global Position Prediction for Interactive Motion Capture

    Schreiner, Paul, Perepichka, M., Lewis, H., Darkner, Sune, Kry, P. G., Erleben, Kenny & Zordan, V. B., 2021, I: Proceedings of the ACM on Computer Graphics and Interactive Techniques. 4, 3, s. 1-16 3479985.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    A framework for voxel-based assessment of biological effect after proton radiotherapy in pediatric brain cancer patients using multi-modal imaging

    Skaarup, M., Lundemann, M. J., Darkner, Sune, Jorgensen, M., Marner, Lisbeth, Mirkovic, D., Grosshans, D., Peeler, C., Mohan, R., Vogelius, Ivan R. & Appelt, A., 10 jun. 2021, I: Medical Physics. 48, 7, 12 s., 4110-4121.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Cine-MRI Simulation to Evaluate Tumor Tracking

    Tascón-Vidarte, J. D., Wahlstedt, I., Jomier, J., Erleben, Kenny, Vogelius, Ivan R. & Darkner, Sune, 2021, Simulation and Synthesis in Medical Imaging - 6th International Workshop, SASHIMI 2021, Held in Conjunction with MICCAI 2021, Proceedings. Svoboda, D., Burgos, N., Wolterink, J. M. & Zhao, C. (red.). Springer, s. 131-141 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 12965 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  32. 2020
  33. Udgivet

    Mandibular Teeth Movement Variations in Tipping Scenario: A Finite Element Study on Several Patients

    Gholamalizadeh, T., Darkner, Sune, Cattaneo, P. M., Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 2020. 10 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning

  34. Udgivet

    A Highly Accurate Model Based Registration Method for FIB-SEM Images of Neurons

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2020, 8 s. (arXiv.org).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning

  35. Udgivet

    Restoring drifted electron microscope volumes using synaptic vesicles at sub-pixel accuracy

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2020, I: Communications Biology. 3, 1, 7 s., ´81.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  36. 2019
  37. Udgivet

    Deterministic Group Tractography with Local Uncertainty Quantification

    Holm, Andreas Nugaard, Feragen, A., Dela Haije, T. & Darkner, Sune, 2019, Computational Diffusion: International MICCAI Workshop, Granada,. Bonet-Carne, E., Grussu, F., Ning, L., Sepehrband, F. & Tax, C. M. W. (red.). 226249 udg. Springer, s. 377-386 (Mathematics and Visualization).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Data Driven Inverse Kinematics of Soft Robots using Local Models

    Holsten, F., Engell-norregard, M. P., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2019, 2019 International Conference on Robotics and Automation (ICRA). IEEE, s. 6251-6257

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    TopAwaRe: Topology-Aware Registration

    Nielsen, R. K., Darkner, Sune & Feragen, A., 2019, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2019 - 22nd International Conference, Proceedings. Shen, D., Yap, P-T., Liu, T., Peters, T. M., Khan, A., Staib, L. H., Essert, C. & Zhou, S. (red.). Springer VS, s. 364-372 9 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11765 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    U-Time: A Fully Convolutional Network for Time Series Segmentation Applied to Sleep Staging

    Perslev, M., Hejselbak Jensen, M., Darkner, Sune, Jørgen Jennum, P. & Igel, Christian, 1 okt. 2019, Advances in Neural Information Processing Systems 32 (NIPS 2019). NIPS Proceedings, Bind 32. s. 4415-4426

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Drift Corrector Software

    Stephensen, Hans Jacob Teglbjærg, Darkner, Sune & Sporring, Jon, 20 aug. 2019

    Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning

  42. 2018
  43. Udgivet

    Collocation for diffeomorphic deformations in medical image registration

    Darkner, Sune, Pai, A. S. U., Liptrot, M. G. & Sporring, Jon, 2018, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 40, 7, s. 1570-1583

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Safety and Efficacy of Mesenchymal Stem Cells for Radiation-Induced Xerostomia: A Randomized, Placebo-Controlled Phase 1/2 Trial (MESRIX)

    Grønhøj, C., Jensen, D. H., Vester-Glowinski, Peter Viktor, Jensen, S. B., Bardow, A., Oliveri, R. S., Fog, L. M., Specht, Lena, Thomsen, C., Darkner, Sune, Jensen, M., Müller, V., Kiss, K., Agander, T., Andersen, E., Fischer-Nielsen, A. & von Buchwald, Christian, 1 jul. 2018, I: International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics. 101, 3, s. 581-592 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Brain Segmentation in Rodent MR-Images Using Convolutional Neural Networks

    Sigurdsson, B., Darkner, Sune, Sommer, Stefan Horst, Mortensen, K. N., Sanggaard, S., Kostrikov, S. & Nedergaard, Maiken, 2018.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt

  46. 2017
  47. Udgivet

    First-in-man mesenchymal stem cells for radiation-induced xerostomia (MESRIX): study protocol for a randomized controlled trial.

    Grønhøj, C., Jensen, D. H., Glovinski, P. V., mpw981, M., Jensen, A. B., Oliveri, R. S., Specht, Lena, Thomsen, C., Darkner, Sune, Kiss, K., Fischer-Nielsen, A. & von Buchwald, Christian, 2017, I: Trials. 18, 1, 10 s., 108.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Density-based non-rigid registration of diffusion-weighted images

    Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard, Nielsen, Mads & Darkner, Sune, apr. 2017.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    3D analysis of synaptic vesicle density and distribution after acute foot-shock stress by using serial section transmission electron microscopy

    Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R., Wegener, G., Popoli, M. & Sporring, Jon, 2017, I: Journal of Microscopy. 265, 1, s. 101–110 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Streamlet Tractography

    Liptrot, M. G., Darkner, Sune, Feragen, A. & Lauze, Francois Bernard, apr. 2017.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt

  51. Udgivet

    A statistical model for simultaneous template estimation, bias correction, and registration of 3D brain images

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Raket, L. L., Kühnel, L., Darkner, Sune, Sørensen, L. & Nielsen, Mads, 2017, Medical Computer Vision and Bayesian and Graphical Models for Biomedical Imaging: MICCAI 2016 International Workshops, MCV and BAMBI, Athens, Greece, October 21, 2016, Revised Selected Papers. Müller, H., Kelm, B. M., Arbel, T., Cai, W., Cardoso, M. J., Langs, G., Menze, B., Metaxas, D., Montillo, A., Wells, W. M., Zhang, S., Chung, A. C. S., Jenkinson, M. & Ribbens, A. (red.). Springer, s. 151-159 9 s. (Lecture notes in computer science, Bind 10081).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  52. Udgivet

    Hippocampal texture predicts rate of cognitive decline in mild cognitive impairment

    Pai, A. S. U., Pillai, J. A., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sommer, Stefan Horst & Nielsen, Mads, jul. 2017, I: Alzheimer's & Dementia. 13, 7, supplement, s. P1356 1 s., P4-225.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift

  53. 2016
  54. Udgivet

    Finding significantly connected voxels based on histograms of connection strengths

    Kasenburg, N., Pedersen, M. V. & Darkner, Sune, 2016, Medical Imaging 2016: Image Processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. 978431. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 39, Bind 17).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  55. Udgivet

    Structural parcellation of the thalamus using shortest-path tractography

    Kasenburg, N., Darkner, Sune, Hahn, U., Liptrot, M. G. & Feragen, A., 2016, 2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). IEEE, s. 559-563 5 s. 7493330

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  56. Udgivet

    Combining the boundary shift integral and tensor-based morphometry for brain atrophy estimation

    Michalkiewicz, M. D., Pai, A. S. U., Leung, K. K., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, Medical imaging 2016: Image processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 978406. (Progress in Biomedical Optics and Imaging).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  57. Udgivet

    Deformation-based atrophy computation by surface propagation and its application to Alzheimer’s disease

    Pai, A. S. U., Sporring, Jon, Darkner, Sune, Dam, Erik Bjørnager, Lillholm, Martin, Jørgensen, D., Oh, J., Chen, G., Suhy, J., Sørensen, L. & Nielsen, Mads, 2016, I: SPIE Journal of Medical Imaging. 3, 1, 11 s., 014005.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  58. Udgivet

    Kernel bundle diffeomorphic image registration using stationary velocity fields and Wendland basis functions

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 35, 6, s. 1369-1380 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  59. Udgivet

    The minimal energetic requirement of sustained awareness after brain injury

    Stender, J., Mortensen, K. N., Thibaut, A., Darkner, Sune, Laureys, S., Gjedde, Albert & Kupers, Ron, 6 jun. 2016, I: Current Biology. 26, 11, s. 1494-1499 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  60. 2015
  61. Udgivet

    Locally orderless registration for diffusion weighted images

    Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard, Nielsen, Mads & Darkner, Sune, 2015, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2015: 18th international conference, Munich, Germany, October 5-9, 2015, Proceedings, Part II. Navab, N., Hornegger, J., Wells, W. M. & Frangi, A. F. (red.). Springer, s. 305-312 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 9350).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  62. Udgivet

    Multimodal brain extraction from structural MRI using co-registered FDG-PET

    Jensen, H. G., Federspiel, F. V. K., Ptito, Maurice, Nielsen, Mads, Gjedde, Albert, Keller, S. H., Law, Ian, Kupers, Ron & Darkner, Sune, 2015. 12 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning

  63. Udgivet

    Automatic correction of dental artifacts in PET/MRI

    Ladefoged, C. N., Andersen, F. L., Keller, S., Beyer, T., Law, I., Højgaard, Liselotte, Darkner, Sune & Lauze, Francois Bernard, 2015, I: SPIE Journal of Medical Imaging. 2, 2, 13 s., 024009.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  64. Udgivet

    Adaptive time-stepping in dieomorphic image registration with bounded inverse consistency error

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Proceedings of the fifth international workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy (MFCA 2015) . INRIA, s. 35-47

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  65. Udgivet

    Adaptive time-stepping in diffeomorphic image registration with bounded inverse consistency error

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L. E. B. L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, The 18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention: proceedings. Technische Universität München , s. 35-47 13 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  66. Udgivet

    Comparison of several computational pipelines for atrophy computation in longitudinal Alzheimers studies

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L. E. B. L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt

  67. Udgivet

    Diffeomorphic image registration with automatic time-step adjustment

    Pai, A. S. U., Klein, S., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, 2015 IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). IEEE, s. 1085-1088 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  68. Udgivet

    Image registration using stationary velocity fields parameterized by norm-minimizing Wendland kernel

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2015, Medical Imaging 2015: Image Processing. SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. (Proceedings of S P I E - International Society for Optical Engineering, Bind 9413).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  69. 2014
  70. Udgivet

    Stepwise inverse consistent Euler’s scheme for diffeomorphic image registration

    Pai, A. S. U., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2014, Biomedical Image Registration: 6th International Workshop, WBIR 2014, London, UK, July 7-8, 2014. Proceedings. Ourselin, S. & Modat, M. (red.). Springer, s. 223-230 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 8545).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  71. Udgivet

    White matter hypointensity growth rate correlates with rate of brain atrophy

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Rostrup, E. & Nielsen, Mads, 2014, I: Alzheimer's & Dementia. 10, 4, Supplement, s. P75-P76 2 s., IC-P-131.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt

  72. Udgivet

    White matter hypointensity growth rate correlates with rate of brain atrophy

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Rostrup, E. & Nielsen, Mads, 2014, I: Alzheimer's & Dementia. 10, 4, Supplement, s. P414 1 s., P1-285.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt

  73. Udgivet

    Automatic FDG-PET-based tumor and metastatic lymph node segmentation in cervical cancer

    Rodríguez Arbonès, D., Jensen, H. G., Loft, A., af Rosenschöld, P. M., Hansen, A. E., Igel, Christian & Darkner, Sune, 2014, Medical Imaging 2014: Image Processing. Ourselin, S. & Styner, M. A. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 8 s. 903441. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 35, Bind 15).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  74. Udgivet

    Estimating the thickness of ultra thin sections for electron microscopy by image statistics

    Sporring, Jon, Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R. & Jensen, E. B. V., 2014, 2014 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging. IEEE, s. 157-160 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  75. Udgivet

    Conforming contact manifolds for multibody simulations

    Visseq, V., Bonde, U., Erleben, Kenny & Darkner, Sune, 2014. 2 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  76. 2013
  77. Udgivet

    FDG-PET template MNI152 1mm

    Darkner, Sune, 2013

    Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Datasæt › Forskning

  78. Udgivet

    Locally orderless registration

    Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2013, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 35, 6, s. 1437-1450 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  79. Udgivet

    3D estimation of synaptic vesicle distributions in serial section transmission electron microscopy

    Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R. & Sporring, Jon, 8 jun. 2013. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt

  80. Udgivet

    Evaluation of WBAA with registration-based cube propagation for brain atrophy quantification

    Lillholm, Martin, Pai, A. S. U., Sørensen, L., Nielsen, Mads, Sporring, Jon, Darkner, Sune & Dam, E., 2013. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt

  81. Udgivet

    Automatic measurement of wrist synovitis from contrast-enhanced MRI: a registration-centered approach

    Mysling, P., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Dam, E. & Lillholm, Martin, 2013, Medical Imaging 2013: Image Processing. Ourselin, S. & Haynor, D. R. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 86692U. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 36, Bind 14).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  82. Udgivet

    Cube propagation for focal brain atrophy estimation

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Mysling, P., Jørgensen, D. R., Dam, E. B., Lillholm, Martin, Oh, J., Chen, G., Suhy, J., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, 2013 IEEE 10th International Symposium on Biomedical Imaging. IEEE, s. 402-405 4 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  83. Udgivet

    Localized cerebral atrophy acceleration during Alzheimer’s disease

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Lillholm, Martin, Dam, E. B., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, I: Alzheimer's & Dementia. 9, 4, Supplement, s. P36–P37 2 s., IC-P-059.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt

  84. Udgivet

    Localized cerebral atrophy acceleration during Alzheimer’s disease

    Pai, A. S. U., Sørensen, L., Darkner, Sune, Lillholm, Martin, Dam, E. B., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2013, I: Alzheimer's & Dementia. 9, 4, Supplement, s. P151 1 s., O1-10-06.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt

  85. Udgivet

    Higher-order momentum distributions and locally affine LDDMM registration

    Sommer, Stefan Horst, Nielsen, Mads, Darkner, Sune & Pennec, X., 2013, I: S I A M Journal on Imaging Sciences. 6, 1, s. 341-367 27 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  86. Udgivet

    Hippocampal texture predicts one-year hippocampal atrophy in mild cognitively impaired subjects

    Sørensen, L., Pai, A. S. U., Mysling, P., Darkner, Sune, Chen, G., Oh, J., Suhy, J., Igel, Christian & Nielsen, Mads, 2013. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt

  87. 2012
  88. Udgivet

    Jet-based local image descriptors

    Boesen Lindbo Larsen, A., Darkner, Sune, Dahl, A. L. & Steenstrup Pedersen, Kim, 2012, Computer Vision – ECCV 2012: 12th European Conference on Computer Vision, Florence, Italy, October 7-13, 2012, Proceedings, Part III. Fitzgibbon, A., Lazebnik, S., Perona, P., Sato, Y. & Schmid, C. (red.). Springer, s. 638-650 13 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7574).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  89. Udgivet

    Data driven constraints for the SVM

    Darkner, Sune & Clemmensen, L. H., 2012, Machine Learning in Medical Imaging: Third International Workshop, MLMI 2012, Held in Conjunction with MICCAI 2012, Nice, France, October 1, 2012, Revised Selected Papers. Wang, F., Shen, D., Yan, P. & Suzuki, K. (red.). Springer, s. 70-77 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7588).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  90. Udgivet

    Locally Orderless Registration

    Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2012, arxiv.org. 14 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning

  91. Udgivet

    Locally orderless registration code: fast normalized mutual information and P-Norm for MATLAB

    Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2012

    Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning

  92. Udgivet

    Evaluation of bias in brain atrophy estimation

    Pai, A. S. U., Darkner, Sune, Sørensen, L., Erleben, L. L., Mysling, P., Sporring, Jon, Dam, E. & Nielsen, Mads, 2012, NIBAD '12: MICCAI 2012 Workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer’s Disease and Related Disorders. Wang, L., Yushkevich, P. & Ourselin, S. (red.). MICCAI , s. 198-206 9 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  93. Udgivet

    Hippocampal texture provides volume independent information for Alzheimer's diagnosis

    Sørensen, L., Pai, A. S. U., Darkner, Sune, Suhy, J., Oh, J., Chen, G., Igel, Christian & Nielsen, Mads, 2012, I: Alzheimer's & Dementia. 8, 4, Supplement, s. 15 1 s., IC-P-013.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › fagfællebedømt

  94. Udgivet

    Hippocampal texture provides volume-independent information for Alzheimer's disease diagnosis

    Sørensen, L., Pai, A. S. U., Darkner, Sune, Suhy, J., Oh, J., Chen, G., Igel, Christian & Nielsen, M., 2012, I: Alzheimer's & Dementia. 8, 4, Supplement, s. P162–P163 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift

  95. 2011
  96. Udgivet

    A hyper elasticity method for interactive virtual design of hearing aids: a parallel method for general non-linear hyper elasticity modeling

    Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2011, I: Visual Computer. 27, 6, s. 645-653 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  97. Udgivet

    Efficient hyperelastic regularization for registration

    Darkner, Sune, Hansen, M. S., Larsen, R. & Hansen, M. F., 2011, Image Analysis: 17th Scandinavian Conference, SCIA 2011, Ystad, Sweden, May 2011. Proceedings. Heyden, A. & Kahl, F. (red.). Springer, s. 295-305 11 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6688).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  98. Udgivet

    Generalized Partial Volume: an inferior density estimator to Parzen Windows for normalized mutual information

    Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2011, Information Processing in Medical Imaging: 22nd International Conference, IPMI 2011, Kloster Irsee, Germany, July 3-8, 2011. Proceedings. Székely, G. & Hahn, H. K. (red.). Springer, s. 436-447 12 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6801).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  99. Udgivet

    The cartilage bone junction and its implications for deep canal hearing instrument fittings

    Nielsen, C. & Darkner, Sune, 2011, I: Hearing Journal. 64, 3, s. 35-42 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt

  100. Udgivet

    Jacobians for Lebesgue registration for a range of similarity measures

    Sporring, Jon & Darkner, Sune, 2011, Department of Computer Science, University of Copenhagen. 8 s. (Koebenhavns Universitet. Datalogisk Institut. Rapport; Nr. 04/2011).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Forskning

ID: 18038443