Rute Andreia Rodrigues da Fonseca
Lektor
Section for Biodiversity
Universitetsparken 15, København Ø
Section for Biodiversity
Universitetsparken 15, 2100 København Ø
- Udgivet
Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds
Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Using UCEs to track the influence of sea‐level change on leafy seadragon populations
Stiller, Josefin, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Alfaro, M. E., Faircloth, B. C., Wilson, N. G. & Rouse, G. W., 2021, I: Molecular Ecology. s. 1364-1380Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The origin and evolution of maize in the Southwestern United States: [+ erratum]
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smith, B. D., Wales, N., Cappellini, Enrico, Skoglund, P., Fumagalli, M., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Hufnagel, D. E., Korneliussen, Thorfinn Sand, Vieira, Filipe Garrett, Jakobsson, M., Arriaza, B., Willerslev, Eske, Nielsen, Rasmus, Hufford, M. B., Albrechtsen, Anders, Ross-Ibarra, J. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature Plants. 1, 5 s., 14003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The elusive nature of adaptive mitochondrial DNA evolution of an Arctic lineage prone to frequent introgression
Melo-Ferreira, J., Vilela, J., Fonseca, M. M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Boursot, P. & Alves, P. C., 2014, I: Genome Biology and Evolution. 6, 4, s. 886-896 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Crown Pearl: a draft genome assembly of the European freshwater pearl mussel Margaritifera margaritifera (Linnaeus, 1758)
Gomes-dos-Santos, A., Lopes-Lima, M., Machado, A. M., Ramos, A. M., Usié, A., Bolotov, I. N., Vikhrev, I. V., Breton, S., Castro, L. F. C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Geist, J., Österling, M. E., Prié, V., Teixeira, A., Gan, H. M., Simakov, O. & Froufe, E., 2021, I: DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes. 28, 2, 10 s., dsab002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- E-pub ahead of print
Site-directed genotype screening for elimination of antinutritional saponins in quinoa seeds identifies TSARL1 as a master controller of saponin biosynthesis selectively in seeds
Trinh, Mai Duy Luu, Visintainer, Davide, Günther, Jan, Østerberg, J. T., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Fondevilla, S., Moog, Max William, Luo, Guangbin, Nørrevang, Anton Frisgaard, Crocoll, C., Nielsen, P. V., Jacobsen, S., Wendt, T., Bak, Søren, Lopez Marques, Rosa Laura & Palmgren, Michael, 2024, (E-pub ahead of print) I: Plant Biotechnology Journal. 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shotgun analysis of the marine mussel Mytilus edulis hemolymph proteome and mapping the innate immunity elements
Campos, A., Apraiz, I., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Cristobal, S., 2015, I: Proteomics. 15, 23-24, s. 4021-4029 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Response of an Afro-Palearctic bird migrant to glaciation cycles
Thorup, Kasper, Pedersen, L., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Naimi, B., Nogues, David Bravo, Krapp, M., Manica, A., Willemoes, M., Sjöberg, Sissel, Feng, S., Chen, G., Rey de la Iglesia, Alba, Campos, P. F., Beyer, R., Araújo, M. B., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Tøttrup, Anders P. & Rahbek, Carsten, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 52, 8 s., e2023836118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomic profiling of gill GSTs in Mytilus galloprovincialis from the North of Portugal and Galicia evidences variations at protein isoform level with a possible relation with water quality
Azevedo, C. C., Guzman-Guillen, R., Martins, J. C., Osório, H., Vasconcelos, V., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Campos, A., 2015, I: Marine Environmental Research. 110, s. 152-161 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomic analysis of a pleistocene mammoth femur reveals more than one hundred ancient bone proteins
Cappellini, Enrico, Jensen, Lars Juhl, Szklarczyk, D. M., Ginolhac, A., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Stafford jr., T., Holen, S. R., Collins, M. J., Orlando, L. A. A., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P & Olsen, Jesper Velgaard, 2012, I: Journal of Proteome Research. 11, 2, s. 917-926 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomic Profiling of Cytosolic Glutathione Transferases from Three Bivalve Species: Corbicula fluminea, Mytilus galloprovincialis and Anodonta cygnea
Martins, J. C., Campos, A., Osorio, H., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Vasconcelos, V., 2014, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 15, 2, s. 1887-1900 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Positive selection on the killer whale mitogenome
Foote, A. D., Morin, P. A., Durban, J. W., Pitman, R. L., Wade, P., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2011, I: Biology Letters. 7, 1, s. 116-118 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Positive selection on apoptosis related genes
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Kosiol, C., Vinař, T., Siepel, A. & Nielsen, Rasmus, 2010, I: FEBS Letters. 584, 3, s. 469-476 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomic footprints of environmental pollution pressure in natural populations of the Mediterranean mussel
Ribeiro, Â. M., Canchaya, C. A., Penaloza, F., Galindo, J. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, jun. 2019, I: Marine Genomics. 45, s. 11-15Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population Genomics Reveals the Underlying Structure of the Small Pelagic European Sardine and Suggests Low Connectivity within Macaronesia
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Campos, P. F., Rey de la Iglesia, Alba, Barroso, G. V., Bergeron, Lucie Adrienne, Nande, M., Tuya, F., Abidli, S., Pérez, M., Riveiro, I., Carrera, P., Jurado-Ruzafa, A., Santamaría, M. T. G., Faria, R., Machado, A. M., Fonseca, M. M., Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2024, I: Genes. 15, 2, 15 s., 170.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomic analyses data of the avian phylogenomics project
Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Alfaro Nuñez, L. A., Narula, N., Liu, L., Burt, D., Ellegren, H., Edwards, S. V., Stamatakis, A. & 7 flere, , 2015, I: GigaScience. 4, 9 s., 4.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Next-generation biology: sequencing and data analysis approaches for non-model organisms
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Albrechtsen, Anders, Themudo, G. E. C., Ramos Madrigal, Jazmin, Sibbesen, Jonas Andreas, Sørensen, L. M., Zepeda Mendoza, M. L., Campos, P., Heller, Rasmus & Pereira, R., 2016, I: Marine Genomics. 30, s. 3-13Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Natural selection shaped the rise and fall of passenger pigeon genomic diversity
Murray, G. G. R., Soares, A. E. R., Novak, B. J., Schaefer, N. K., Cahill, J. A., Baker, A. J., Demboski, J. R., Doll, A., Rodrigues da Fonseca, R. A., Fulton, T. L., Gilbert, T., Heintzman, P. D., Letts, B., McIntosh, G., O'Connell, B. L., Peck, M., Pipes, M-L., Rice, E. S., Santos, K. M., Sohrweide, A. G. & 4 flere, , 17 nov. 2017, I: Science. 358, 6365, s. 951-954 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular clocks indicate turnover and diversification of modern coleoid cephalopods during the Mesozoic Marine Revolution
Tanner, A. R., Fuchs, D., Winkelmann, I. E. H., Gilbert, M Thomas P, Pankey, M. S., Oliveira Ribeiro, Â. M., Kocot, K. M., Halanych, K. M., Oakley, T. H., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Pisani, D. & Vinther, J., 15 mar. 2017, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 284, 1850, 7 s., 20162818.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Marine genomics: news and views
Oliveira Ribeiro, Â. M., Foote, A. D., Kupczok, A., Frazão, B., Limborg, Morten Tønsberg, Piñeiro, R., Abalde, S., Rocha, S. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, feb. 2017, I: Marine Genomics. 31, s. 1-8 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Losing Genes: The Evolutionary Remodeling of Cetacea Skin
Espregueira Themudo, G., Alves, L. Q., Machado, A. M., Lopes-Marques, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Fonseca, M., Ruivo, R. & Castro, L. F. C., 2020, I: Frontiers in Marine Science. 7, 592375.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Liver transcriptome resources of four commercially exploited teleost species
Machado, A. M., Muñoz-Merida, A., Fonseca, E., Veríssimo, A., Pinto, R., Felício, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2020, I: Scientific Data. 7, 9 s., 214.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Link Your Sites (LYS) Scripts: Automated Search of Protein Structures and Mapping of Sites Under Positive Selection Detected by PAML
Sanz Moreta, Lys & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2020, I: Evolutionary Biology. 47, 3, s. 240-245 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits
Chen, L., Qin, Q., Jiang, Y., Wang, K., Lin, Z., Li, Z., Bibi, F., Yang, Y., Wang, J., Nie, W., Su, W., Liu, G., Li, Q., Fu, W., Pan, X., Liu, C., Yang, J., Zhang, C., Yin, Y., Wang, Y. & 32 flere, , 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1152-Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Iron age genomic data from Althiburos – Tunisia renew the debate on the origins of African taurine cattle
Ginja, C., Guimarães, S., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Rasteiro, R., Rodríguez-Varela, R., Simões, L. G., Sarmento, C., Belarte, M. C., Kallala, N., Torres, J. R., Sanmartí, J., Arruda, A. M., Detry, C., Davis, S., Matos, J., Götherström, A., Pires, A. E. & Valenzuela-Lamas, S., 2023, I: iScience. 26, 7, 17 s., 107196.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 33270633
Flest downloads
-
3000
downloads
DivA: detection of non-homologous and very divergent regions in protein sequence alignments
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1039
downloads
The elusive nature of adaptive mitochondrial DNA evolution of an Arctic lineage prone to frequent introgression
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1001
downloads
Ancient genomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet