Rute Andreia Rodrigues da Fonseca

Rute Andreia Rodrigues da Fonseca

Lektor


  1. Udgivet

    Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds

    Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, Boussau, B., Bayzid, M. S., Zavidovych, V., Subramanian, S., Gabaldón, T., Capella-Gutiérrez, S., Huerta-Cepas, J., Rekepalli, B., Terkelsen, K. M., Schierup, M. H., Lindow, Bent Erik Kramer, Warren, W. C., Ray, D., Green, R. E., Bruford, M. W., Zhan, X., Dixon, A., Li, S., Li, N., Huang, Y., Derryberry, E. P., Bertelsen, Mads Frost, Sheldon, F. H., Brumfield, R. T., Mello, C. V., Lovell, P. V., Wirthlin, M., Schneider, M. P. C., Prosdocimi, F., Samaniego Castruita, J. A., Velazquez, A. M. V., Alfaro Nuñez, L. A., Campos, P., Petersen, Bent, Sicheritz-Ponten, T., Pas, A., Bailey, T., Scofield, P., Bunce, M., Lambert, D. M., Zhou, Q., Perelman, P., Driskell, A. C., Shapiro, B., Xiong, Z., Zeng, Y., Liu, S., Li, Z., Liu, B., Wu, K., Xiao, J., Yinqi, X., Zheng, Q., Zhang, Y., Yang, H., Wang, J., Smeds, L., Rheindt, F. E., Braun, M., Fjeldså, Jon, Orlando, L. A. A., Barker, F. K., Jønsson, Knud Andreas, Johnson, W., Koepfli, K. P., O'Brien, S., Haussler, D., Ryder, O. A., Rahbek, Carsten, Willerslev, Eske, Graves, G. R., Glenn, T. C., McCormack, J., Burt, D., Ellegren, H., Alström, P., Edwards, S. V., Stamatakis, A., Mindell, D. P., Cracraft, J., Braun, E. L., Warnow, T., Wang, J., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Using UCEs to track the influence of sea‐level change on leafy seadragon populations

    Stiller, Josefin, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Alfaro, M. E., Faircloth, B. C., Wilson, N. G. & Rouse, G. W., 2021, I: Molecular Ecology. s. 1364-1380

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    The origin and evolution of maize in the Southwestern United States: [+ erratum]

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smith, B. D., Wales, N., Cappellini, Enrico, Skoglund, P., Fumagalli, M., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Hufnagel, D. E., Korneliussen, Thorfinn Sand, Vieira, Filipe Garrett, Jakobsson, M., Arriaza, B., Willerslev, Eske, Nielsen, Rasmus, Hufford, M. B., Albrechtsen, Anders, Ross-Ibarra, J. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature Plants. 1, 5 s., 14003.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    The elusive nature of adaptive mitochondrial DNA evolution of an Arctic lineage prone to frequent introgression

    Melo-Ferreira, J., Vilela, J., Fonseca, M. M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Boursot, P. & Alves, P. C., 2014, I: Genome Biology and Evolution. 6, 4, s. 886-896 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    The Crown Pearl: a draft genome assembly of the European freshwater pearl mussel Margaritifera margaritifera (Linnaeus, 1758)

    Gomes-dos-Santos, A., Lopes-Lima, M., Machado, A. M., Ramos, A. M., Usié, A., Bolotov, I. N., Vikhrev, I. V., Breton, S., Castro, L. F. C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Geist, J., Österling, M. E., Prié, V., Teixeira, A., Gan, H. M., Simakov, O. & Froufe, E., 2021, I: DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes. 28, 2, 10 s., dsab002.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. E-pub ahead of print

    Site-directed genotype screening for elimination of antinutritional saponins in quinoa seeds identifies TSARL1 as a master controller of saponin biosynthesis selectively in seeds

    Trinh, Mai Duy Luu, Visintainer, Davide, Günther, Jan, Østerberg, J. T., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Fondevilla, S., Moog, Max William, Luo, Guangbin, Nørrevang, Anton Frisgaard, Crocoll, C., Nielsen, P. V., Jacobsen, S., Wendt, T., Bak, Søren, Lopez Marques, Rosa Laura & Palmgren, Michael, 2024, (E-pub ahead of print) I: Plant Biotechnology Journal. 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Shotgun analysis of the marine mussel Mytilus edulis hemolymph proteome and mapping the innate immunity elements

    Campos, A., Apraiz, I., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Cristobal, S., 2015, I: Proteomics. 15, 23-24, s. 4021-4029 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Response of an Afro-Palearctic bird migrant to glaciation cycles

    Thorup, Kasper, Pedersen, L., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Naimi, B., Nogues, David Bravo, Krapp, M., Manica, A., Willemoes, M., Sjöberg, Sissel, Feng, S., Chen, G., Rey de la Iglesia, Alba, Campos, P. F., Beyer, R., Araújo, M. B., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Tøttrup, Anders P. & Rahbek, Carsten, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 52, 8 s., e2023836118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Proteomic profiling of gill GSTs in Mytilus galloprovincialis from the North of Portugal and Galicia evidences variations at protein isoform level with a possible relation with water quality

    Azevedo, C. C., Guzman-Guillen, R., Martins, J. C., Osório, H., Vasconcelos, V., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Campos, A., 2015, I: Marine Environmental Research. 110, s. 152-161 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Proteomic analysis of a pleistocene mammoth femur reveals more than one hundred ancient bone proteins

    Cappellini, Enrico, Jensen, Lars Juhl, Szklarczyk, D. M., Ginolhac, A., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Stafford jr., T., Holen, S. R., Collins, M. J., Orlando, L. A. A., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P & Olsen, Jesper Velgaard, 2012, I: Journal of Proteome Research. 11, 2, s. 917-926 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Proteomic Profiling of Cytosolic Glutathione Transferases from Three Bivalve Species: Corbicula fluminea, Mytilus galloprovincialis and Anodonta cygnea

    Martins, J. C., Campos, A., Osorio, H., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Vasconcelos, V., 2014, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 15, 2, s. 1887-1900 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Positive selection on the killer whale mitogenome

    Foote, A. D., Morin, P. A., Durban, J. W., Pitman, R. L., Wade, P., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2011, I: Biology Letters. 7, 1, s. 116-118 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Positive selection on apoptosis related genes

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Kosiol, C., Vinař, T., Siepel, A. & Nielsen, Rasmus, 2010, I: FEBS Letters. 584, 3, s. 469-476 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Population genomic footprints of environmental pollution pressure in natural populations of the Mediterranean mussel

    Ribeiro, Â. M., Canchaya, C. A., Penaloza, F., Galindo, J. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, jun. 2019, I: Marine Genomics. 45, s. 11-15

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Population Genomics Reveals the Underlying Structure of the Small Pelagic European Sardine and Suggests Low Connectivity within Macaronesia

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Campos, P. F., Rey de la Iglesia, Alba, Barroso, G. V., Bergeron, Lucie Adrienne, Nande, M., Tuya, F., Abidli, S., Pérez, M., Riveiro, I., Carrera, P., Jurado-Ruzafa, A., Santamaría, M. T. G., Faria, R., Machado, A. M., Fonseca, M. M., Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2024, I: Genes. 15, 2, 15 s., 170.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Phylogenomic analyses data of the avian phylogenomics project

    Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Alfaro Nuñez, L. A., Narula, N., Liu, L., Burt, D., Ellegren, H., Edwards, S. V., Stamatakis, A. & 7 flere, Mindell, D. P., Cracraft, J., Braun, E. L., Warnow, T., Wang, J., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2015, I: GigaScience. 4, 9 s., 4.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Next-generation biology: sequencing and data analysis approaches for non-model organisms

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Albrechtsen, Anders, Themudo, G. E. C., Ramos Madrigal, Jazmin, Sibbesen, Jonas Andreas, Sørensen, L. M., Zepeda Mendoza, M. L., Campos, P., Heller, Rasmus & Pereira, R., 2016, I: Marine Genomics. 30, s. 3-13

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Natural selection shaped the rise and fall of passenger pigeon genomic diversity

    Murray, G. G. R., Soares, A. E. R., Novak, B. J., Schaefer, N. K., Cahill, J. A., Baker, A. J., Demboski, J. R., Doll, A., Rodrigues da Fonseca, R. A., Fulton, T. L., Gilbert, T., Heintzman, P. D., Letts, B., McIntosh, G., O'Connell, B. L., Peck, M., Pipes, M-L., Rice, E. S., Santos, K. M., Sohrweide, A. G. & 4 flere, Vohr, S. H., Corbett-Detig, R. B., Green, R. E. & Shapiro, B., 17 nov. 2017, I: Science. 358, 6365, s. 951-954 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Molecular clocks indicate turnover and diversification of modern coleoid cephalopods during the Mesozoic Marine Revolution

    Tanner, A. R., Fuchs, D., Winkelmann, I. E. H., Gilbert, M Thomas P, Pankey, M. S., Oliveira Ribeiro, Â. M., Kocot, K. M., Halanych, K. M., Oakley, T. H., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Pisani, D. & Vinther, J., 15 mar. 2017, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 284, 1850, 7 s., 20162818.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Marine genomics: news and views

    Oliveira Ribeiro, Â. M., Foote, A. D., Kupczok, A., Frazão, B., Limborg, Morten Tønsberg, Piñeiro, R., Abalde, S., Rocha, S. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, feb. 2017, I: Marine Genomics. 31, s. 1-8 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Losing Genes: The Evolutionary Remodeling of Cetacea Skin

    Espregueira Themudo, G., Alves, L. Q., Machado, A. M., Lopes-Marques, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Fonseca, M., Ruivo, R. & Castro, L. F. C., 2020, I: Frontiers in Marine Science. 7, 592375.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Liver transcriptome resources of four commercially exploited teleost species

    Machado, A. M., Muñoz-Merida, A., Fonseca, E., Veríssimo, A., Pinto, R., Felício, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2020, I: Scientific Data. 7, 9 s., 214.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Link Your Sites (LYS) Scripts: Automated Search of Protein Structures and Mapping of Sites Under Positive Selection Detected by PAML

    Sanz Moreta, Lys & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2020, I: Evolutionary Biology. 47, 3, s. 240-245 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits

    Chen, L., Qin, Q., Jiang, Y., Wang, K., Lin, Z., Li, Z., Bibi, F., Yang, Y., Wang, J., Nie, W., Su, W., Liu, G., Li, Q., Fu, W., Pan, X., Liu, C., Yang, J., Zhang, C., Yin, Y., Wang, Y. & 32 flere, Zhao, Y., Zhang, C., Wang, Z., Qin, Y., Liu, W., Wang, B., Ren, Y., Zhang, R., Zeng, Y., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Wei, B., Li, R., Wan, W., Zhao, R., Zhu, W., Wang, Y., Duan, S., Gao, Y., Zhang, Y. E., Chen, C., Hvilsom, C., Epps, C. W., Chemnick, L. G., Doug, Y., Mirarab, S., Siegismund, Hans Redlef, Ryder, O. A., Gilbert, M Thomas P, Lewin, H. A., KU, thw266, Heller, Rasmus & Wang, W., 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1152-

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Iron age genomic data from Althiburos – Tunisia renew the debate on the origins of African taurine cattle

    Ginja, C., Guimarães, S., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Rasteiro, R., Rodríguez-Varela, R., Simões, L. G., Sarmento, C., Belarte, M. C., Kallala, N., Torres, J. R., Sanmartí, J., Arruda, A. M., Detry, C., Davis, S., Matos, J., Götherström, A., Pires, A. E. & Valenzuela-Lamas, S., 2023, I: iScience. 26, 7, 17 s., 107196.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 33270633