Matthias Mann

Matthias Mann

Professor, forskningschef, Professor


  1. Udgivet

    Deep proteomics of mouse skeletal muscle enables quantitation of protein isoforms, metabolic pathways and transcription factors

    Deshmukh, Atul Shahaji, Murgia, M., Nagaraja, N., Treebak, Jonas Thue, Cox, J. & Mann, Matthias, apr. 2015, I: Molecular and Cellular Proteomics. 14, 4, s. 841-853

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet
  3. CRL2(Lrr1) promotes unloading of the vertebrate replisome from chromatin during replication termination

    Dewar, J. M., Low, E., Mann, Matthias, Räschle, M. & Walter, J. C., 1 feb. 2017, I: Genes & Development. 31, 3, s. 275-290 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    C/EBPα creates elite cells for iPSC reprogramming by upregulating Klf4 and increasing the levels of Lsd1 and Brd4

    Di Stefano, B., Collombet, S., Jakobsen, J. S., Wierer, M., Sardina, J. L., Lackner, A., Stadhouders, R., Segura-Morales, C., Francesconi, M., Limone, F., Mann, Matthias, Porse, Bo Torben, Thieffry, D. & Graf, T., apr. 2016, I: Nature Cell Biology. 18, 4, s. 371-81 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Organ-specific metabolic pathways distinguish prediabetes, type 2 diabetes, and normal tissues

    Diamanti, K., Cavalli, M., Pereira, M. J., Pan, G., Castillejo-López, C., Kumar, C., Mundt Madsen, Filip Oskar, Komorowski, J., Deshmukh, Atul Shahaji, Mann, Matthias, Korsgren, O., Eriksson, J. W. & Wadelius, C., 2022, I: Cell Reports Medicine. 3, 10, 21 s., 100763.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Gene-selective transcription promotes the inhibition of tissue reparative macrophages by TNF

    Dichtl, S., Sanin, D. E., Koss, C. K., Willenborg, S., Petzold, A., Tanzer, M. C., Dahl, A., Kabat, A. M., Lindenthal, L., Zeitler, L., Satzinger, S., Strasser, A., Mann, Matthias, Roers, A., Eming, S. A., El Kasmi, K. C., Pearce, E. J. & Murray, P. J., apr. 2022, I: Life Science Alliance. 5, 4

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Systems Analyses Reveal Shared and Diverse Attributes of Oct4 Regulation in Pluripotent Cells

    Ding, L., Paszkowski-Rogacz, M., Winzi, M., Chakraborty, D., Theis, M., Singh, S., Ciotta, G., Poser, I., Roguev, A., Chu, W. K., Choudhary, Chunaram, Mann, Matthias, Stewart, A. F., Krogan, N. & Buchholz, F., 26 aug. 2015, I: Cell Systems. 1, 2, s. 141-151 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    The Case for Proteomics and Phospho-Proteomics in Personalized Cancer Medicine

    Doll, S., Gnad, F. & Mann, Matthias, 2019, I: Proteomics - Clinical Applications. 13, 2, 10 s., e1800113.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Region and cell-type resolved quantitative proteomic map of the human heart

    Doll, S., Dreßen, M., Geyer, P. E., Itzhak, D. N., Braun, C., Doppler, S. A., Meier, F., Deutsch, M., Lahm, H., Lange, R., Krane, M. & Mann, Matthias, 13 nov. 2017, I: Nature Communications. 8, 1, 13 s., 1469.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Rapid proteomic analysis for solid tumors reveals LSD1 as a drug target in an end-stage cancer patient

    Doll, S., Kriegmair, M. C., Santos, A., Wierer, M., Coscia, F., Neil, H. M., Porubsky, S., Geyer, P. E., Mund, Andreas, Nuhn, P. & Mann, Matthias, 2018, I: Molecular Oncology. 12, 8, s. 1296-1307 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    A spatially resolved proteomic atlas of human skin and its associated immune system

    Dyring-Andersen, Beatrice, Coscia, F., Santos, A., Løvendorf, M. B., Sørensen, L. B. P., Niu, Lili, Andersen, J. L., Clark, R., Skov, L., Teunissen, M. B. & Mann, Matthias, 2019, I: Journal of Investigative Dermatology. 139, 9, suppl., s. S259 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  12. Udgivet

    A spatially resolved proteomic atlas of psoriatic skin

    Dyring-Andersen, Beatrice, Lovendorf, M. B., Santos, A., Coscia, F., Sørensen, L. B. P., Niu, Lili, Andersen, J. L., Teunissen, M. B., Skov, L. & Mann, Matthias, 2019, I: Journal of Investigative Dermatology. 139, 9, suppl., s. S260 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  13. Udgivet

    Spatially and cell-type resolved quantitative proteomic atlas of healthy human skin

    Dyring-Andersen, Beatrice, Løvendorf, M. B., Coscia, F., Santos, A., Møller, L. B. P., Colaço, A. R., Niu, Lili, Bzorek, M., Doll, S., Andersen, J. L., Clark, R. A., Skov, Lone, Teunissen, M. B. M. & Mann, Matthias, 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 5587.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Proteomics reveals NNMT as a master metabolic regulator of cancer-associated fibroblasts

    Eckert, M. A., Coscia, F., Chryplewicz, A., Chang, J. W., Hernandez, K. M., Pan, S., Tienda, S. M., Nahotko, D. A., Li, G., Blaženović, I., Lastra, R. R., Curtis, M., Yamada, S. D., Perets, R., McGregor, S. M., Andrade, J., Fiehn, O., Moellering, R. E., Mann, Matthias & Lengyel, E., 2019, I: Nature. 569, 7758, s. 723-728

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Cell-Type- and Brain-Region-Resolved Mouse Brain Lipidome

    Fitzner, D., Bader, J. M., Penkert, H., Bergner, C. G., Su, M., Weil, M., Surma, M. A., Mann, Matthias, Klose, C. & Simons, M., 2020, I: Cell Reports. 32, 21 s., 108132.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Molecular response to PARP1 inhibition in ovarian cancer cells as determined by mass spectrometry based proteomics

    Franz, A., Coscia, F., Shen, C., Charaoui, L., Mann, Matthias & Sander, C., 2021, I: Journal of Ovarian Research. 14, 14 s., 140.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Identification of covalent modifications regulating immune signaling complex composition and phenotype

    Frauenstein, A., Ebner, S., Hansen, F. M., Sinha, A., Phulphagar, K., Swatek, K., Hornburg, D., Mann, Matthias & Meissner, F., jul. 2021, I: Molecular Systems Biology. 17, 7, s. e10125

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Towards Precision Dermatology: Emerging Role of Proteomic Analysis of the Skin

    Fredman, G., Skov, Lone, Mann, Matthias & Dyring-Andersen, Beatrice, 2022, I: Dermatology. 238, s. 185–194

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  19. Molecular basis of PRC1 targeting to Polycomb response elements by PhoRC

    Frey, F., Sheahan, T., Finkl, K., Stoehr, G., Mann, Matthias, Benda, C. & Müller, J., 1 maj 2016, I: Genes & Development. 30, 9, s. 1116-27 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Mechanism of replication-coupled DNA-protein crosslink proteolysis by SPRTN and the proteasome

    Gao, A., Larsen, N., Sparks, J., Gallina, I., Mann, Matthias, Räschle, M., Walter, J. & Duxin, Julien, 2018, bioRxiv, 54 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  21. Udgivet

    The NSP3 protein of SARS-CoV-2 binds fragile X mental retardation proteins to disrupt UBAP2L interactions

    Garvanska, D. H., Alvarado, R. E., Mundt, F. O., Lindqvist, R., Duel, J. K., Coscia, F., Nilsson, E., Lokugamage, K., Johnson, B. A., Plante, J. A., Morris, D. R., Vu, M. N., Estes, L. K., McLeland, A. M., Walker, J., Crocquet-Valdes, P. A., Mendez, B. L., Plante, K. S., Walker, D. H., Weisser, M. B. & 4 flere, Överby, A. K., Mann, Matthias, Menachery, V. D. & Nilsson, Jakob, 2024, I: EMBO Reports.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. L-Arginine Modulates T Cell Metabolism and Enhances Survival and Anti-tumor Activity

    Geiger, R., Rieckmann, J. C., Wolf, T., Basso, C., Feng, Y., Fuhrer, T., Kogadeeva, M., Picotti, P., Meissner, F., Mann, Matthias, Zamboni, N., Sallusto, F. & Lanzavecchia, A., 20 okt. 2016, I: Cell. 167, 3, s. 829-842.e13

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Initial quantitative proteomic map of 28 mouse tissues using the SILAC mouse

    Geiger, T., Velic, A., Macek, B., Lundberg, E., Kampf, C., Nagaraj, N., Uhlen, M., Cox, J. & Mann, Matthias, jun. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 6, s. 1709-22 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Plasma Proteome Profiling to Assess Human Health and Disease

    Geyer, P. E., Kulak, N. A., Pichler, G., Holdt, L. M., Teupser, D. & Mann, Matthias, 23 mar. 2016, I: Cell Systems. 2, 3, s. 185-95 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Revisiting biomarker discovery by plasma proteomics

    Geyer, P. E., Holdt, L. M., Teupser, D. & Mann, Matthias, 26 sep. 2017, I: Molecular Systems Biology. 13, 9, 16 s., 942.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Proteomics reveals the effects of sustained weight loss on the human plasma proteome

    Geyer, P. E., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Tyanova, S., Grassl, N., Iepsen, E. P. W., Lundgren, J., Madsbad, Sten, Holst, Jens Juul, Torekov, Signe Sørensen & Mann, Matthias, 22 dec. 2016, I: Molecular Systems Biology. 12, 16 s., 901.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    High-resolution serum proteome trajectories in COVID-19 reveal patient-specific seroconversion

    Geyer, P. E., Arend, F. M., Doll, S., Louiset, M., Virreira Winter, S., Müller-Reif, J. B., Torun, F. M., Weigand, M., Eichhorn, P., Bruegel, M., Strauss, M. T., Holdt, L. M., Mann, Matthias & Teupser, D., 2021, I: EMBO Molecular Medicine. 13, 8, 16 s., e14167.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Plasma Proteome Profiling to detect and avoid sample-related biases in biomarker studies

    Geyer, P. E., Voytik, E., Treit, P. V., Doll, S., Kleinhempel, A., Niu, Lili, Müller, J. B., Buchholtz, M., Bader, J. M., Teupser, D., Holdt, L. M. & Mann, Matthias, 2019, I: EMBO Molecular Medicine. 11, 11, e10427.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Plasma proteomic data can contain personally identifiable, sensitive information and incidental findings

    Geyer, P. E., Porsdam Mann, Sebastian, Treit, P. V. & Mann, Matthias, 2021, I: Molecular and Cellular Proteomics. 20, 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Loss of full-length hnRNP R isoform impairs DNA damage response in motoneurons by inhibiting Yb1 recruitment to chromatin

    Ghanawi, H., Hennlein, L., Zare, A., Bader, J., Salehi, S., Hornburg, D., Ji, C., Sivadasan, R., Drepper, C., Meissner, F., Mann, Matthias, Jablonka, S., Briese, M. & Sendtner, M., 2021, I: Nucleic Acids Symposium Series. 49, 21, s. 12284-12305 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    High-accuracy identification and bioinformatic analysis of in vivo protein phosphorylation sites in yeast

    Gnad, F., de Godoy, L. M. F., Cox, J., Neuhauser, N., Ren, S., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Proteomics. 9, 20, s. 4642-4652 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. PHOSIDA (phosphorylation site database): management, structural and evolutionary investigation, and prediction of phosphosites

    Gnad, F., Ren, S., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Oroshi, M. & Mann, Matthias, 2007, I: Genome Biology. 8, 11, s. R250

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. MicroRNAs of the miR-290-295 Family Maintain Bivalency in Mouse Embryonic Stem Cells

    Graham, B., Marcais, A., Dharmalingam, G., Carroll, T., Kanellopoulou, C., Graumann, J., Nesterova, T. B., Bermange, A., Brazauskas, P., Xella, B., Kriaucionis, S., Higgs, D. R., Brockdorff, N., Mann, Matthias, Fisher, A. G. & Merkenschlager, M., 10 maj 2016, I: Stem Cell Reports. 6, 5, s. 635-642 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Antisense-mediated exon skipping: a therapeutic strategy for titin-based dilated cardiomyopathy

    Gramlich, M., Pane, L. S., Zhou, Q., Chen, Z., Murgia, M., Schötterl, S., Goedel, A., Metzger, K., Brade, T., Parrotta, E., Schaller, M., Gerull, B., Thierfelder, L., Aartsma-Rus, A., Labeit, S., Atherton, J. J., McGaughran, J., Harvey, R. P., Sinnecker, D., Mann, M. & 3 flere, Laugwitz, K., Gawaz, M. P. & Moretti, A., 9 mar. 2015, I: EMBO Molecular Medicine. 7, 5, s. 562-576 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Ultra-deep and quantitative saliva proteome reveals dynamics of the oral microbiome

    Grassl, N., Kulak, N. A., Pichler, G., Geyer, P. E., Jung, J., Schubert, S., Sinitcyn, P., Cox, J. & Mann, Matthias, 21 apr. 2016, I: Genome Medicine. 8, 13 s., 44.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Molecular and structural architecture of polyQ aggregates in yeast

    Gruber, A., Hornburg, D., Antonin, M., Krahmer, N., Collado, J., Schaffer, M., Zubaite, G., Lüchtenborg, C., Sachsenheimer, T., Brügger, B., Mann, Matthias, Baumeister, W., Hartl, F. U., Hipp, M. S. & Fernández-Busnadiego, R., 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Quantitative phosphoproteomics applied to the yeast pheromone signaling pathway

    Gruhler, A., Olsen, Jesper Velgaard, Mohammed, S., Mortensen, P., Faergeman, N. J., Mann, Matthias & Jensen, O. N., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 3, s. 310-27 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. PLEKHA7 Recruits PDZD11 to Adherens Junctions to Stabilize Nectins

    Guerrera, D., Shah, J., Vasileva, E., Sluysmans, S., Méan, I., Jond, L., Poser, I., Mann, Matthias, Hyman, A. A. & Citi, S., 20 maj 2016, I: The Journal of Biological Chemistry. 291, 21, s. 11016-29 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Mobi-DIK (Ion Mobility DIA Analysis Kit): Targeted analysis software for diaPASEF data improves proteome coverage

    Ha, A., Frank, M., Meier, F., Brunner, A., Kaspar-Schoenefeld, S., Koch, S., Lubeck, M., Raether, O., Collins, B. C., Aebersold, R., Mann, Matthias & Rost, H., 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S17 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  40. Udgivet

    Activation of the ATR kinase by the RPA-binding protein ETAA1

    Haahr, Peter Thorlund, Hoffmann, Saskia, Tollenaere, M. A. X., Ho, T., Toledo Lazaro, L. I., Mann, Matthias, Bekker-Jensen, Simon Holst, Räschle, M. & Mailand, Niels, nov. 2016, I: Nature Cell Biology. 18, 11, s. 1196–1207

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Signaling defects associated with insulin resistance in nondiabetic and diabetic individuals and modification by sex

    Haider, N., Lebastchi, J., Jayavelu, A. K., Batista, T. M., Pan, H., Dreyfuss, J. M., Carcamo-Orive, I., Knowles, J. W., Mann, Matthias & Kahn, C. R., 1 nov. 2021, I: The Journal of Clinical Investigation. 131, 21

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Data-independent acquisition method for ubiquitinome analysis reveals regulation of circadian biology

    Hansen, F. M., Tanzer, M. C., Brüning, F., Bludau, I., Stafford, C., Schulman, B. A., Robles, M. S., Karayel, O. & Mann, Matthias, 11 jan. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, s. 254

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    SCAI promotes DNA double-strand break repair in distinct chromosomal contexts

    Hansen, R. K., Mund, A., Poulsen, S. L., Sandoval, M., Klement, K., Tsouroula, K., Tollenaere, M. A. X., Räschle, M., Soria, R., Offermanns, S., Worzfeld, T., Grosse, R., Brandt, D. T., Rozell, B., Mann, M., Cole, F., Soutoglou, E., Goodarzi, A. A., Daniel, J. A., Mailand, N. & 1 flere, Bekker-Jensen, Simon Holst, 7 nov. 2016, I: Nature Cell Biology. 18, 12, s. 1357–1366

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Mesothelial Cell HIF1α Expression Is Metabolically Downregulated by Metformin to Prevent Oncogenic Tumor-Stromal Crosstalk

    Hart, P. C., Kenny, H. A., Grassl, N., Watters, K. M., Litchfield, L. M., Coscia, F., Blaženović, I., Ploetzky, L., Fiehn, O., Mann, Matthias, Lengyel, E. & Romero, I. L., 2019, I: Cell Reports. 29, 12, s. 4086-4098.e6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Lysine acetylome profiling uncovers novel histone deacetylase substrate proteins in Arabidopsis

    Hartl, M., Füßl, M., Boersema, P. J., Jost, J., Kramer, K., Bakirbas, A., Sindlinger, J., Plöchinger, M., Leister, D., Uhrig, G., Moorhead, G. B., Cox, J., Salvucci, M. E., Schwarzer, D., Mann, Matthias & Finkemeier, I., 2017, I: Molecular Systems Biology. 13, 10, 16 s., 949.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Fam20C regulates protein secretion by Cab45 phosphorylation

    Hecht, T. K., Blank, B., Steger, M., Lopez, V., Beck, G., Ramazanov, B., Mann, Matthias, Tagliabracci, V. & von Blume, J., 1 jun. 2020, I: The Journal of Cell Biology. 219, 6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Activity-based profiling of cullin–RING E3 networks by conformation-specific probes

    Henneberg, L. T., Singh, J., Duda, D. M., Baek, K., Yanishevski, D., Murray, P. J., Mann, Matthias, Sidhu, S. S. & Schulman, B. A., 2023, I: Nature Chemical Biology. 19, s. 1513-1523

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Signaling initiated by overexpression of the fibroblast growth factor receptor-1 investigated by mass spectrometry

    Hinsby, A. M., Olsen, Jesper Velgaard, Bennett, K. L. & Mann, Matthias, 2003, I: Molecular and Cellular Proteomics. 2, 1, s. 29-36 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Tyrosine phosphoproteomics of fibroblast growth factor signaling: a role for insulin receptor substrate-4

    Hinsby, A. M., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2004, I: Journal of Biological Chemistry. 279, 45, s. 46438-47 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Interaction between AP-5 and the hereditary spastic paraplegia proteins SPG11 and SPG15

    Hirst, J., Borner, G. H. H., Edgar, J., Hein, M. Y., Mann, Matthias, Buchholz, F., Antrobus, R. & Robinson, M. S., aug. 2013, I: Molecular Biology of the Cell. 24, 16, s. 2558-69 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 5650809