Kresten Lindorff-Larsen

Kresten Lindorff-Larsen

Professor

ORCID: 0000-0002-4750-6039

Udgivelsesår:
Alle
1 - 100 ud af 208Pr. side: 100
Sortering: Titel
  1. Udgivet

    What does evolution tell us about the structure of a functional amyloid protein?

    Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D. E., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Biophysical Journal. 108, 2, Supplement 1, s. 227a 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    What Will Computational Modeling Approaches Have to Say in the Era of Atomistic Cryo-EM Data?

    Fraser, J. S., Lindorff-Larsen, Kresten & Bonomi, M., 2020, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 60, 5, s. 2410-2412 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    WASCO: A Wasserstein-based Statistical Tool to Compare Conformational Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins

    González-Delgado, J., Sagar, A., Zanon, C., Lindorff-Larsen, Kresten, Bernadó, P., Neuvial, P. & Cortés, J., 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 14, 11 s., 168053.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    Variational optimization of an all-atom implicit solvent force field to match explicit solvent simulation data

    Bottaro, S., Lindorff-Larsen, Kresten & Best, R. B., 2013, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 9, 12, s. 5641-5652 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    VM i molekylære puslespil

    Abildgaard, A. B., Winther, Jakob R., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 16 apr. 2021, I: Weekendavisen: Ideer. 15, s. 11

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Kronik › Formidling

  6. Udgivet

    Understanding the Origins of Loss of Protein Function by Analyzing the Effects of Thousands of Variants on Activity and Abundance

    Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Valanciute, A., Nielsen, S. V., Hartmann-Petersen, Rasmus, Yang, J. J., Fowler, D. M., Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2021, I: Molecular Biology and Evolution. 38, 8, s. 3235-3246

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Understanding single-pass transmembrane receptor signaling from a structural viewpoint—what are we missing?

    Bugge, K. Ø., Lindorff-Larsen, Kresten & Kragelund, Birthe Brandt, dec. 2016, I: The FEBS Journal. 283, 24, s. 4424-4451 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Ubiquitin Interacting Motifs: Duality Between Structured and Disordered Motifs

    Lambrughi, M., Maiani, E., Fas, B. A., Shaw, G. S., Kragelund, Birthe Brandt, Lindorff-Larsen, Kresten, Teilum, Kaare, Invernizzi, G. & Papaleo, E., 2021, I: Frontiers in Molecular Biosciences. 8, 14 s., 676235.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Tyrosine kinases compete for growth hormone receptor binding and regulate receptor mobility and degradation

    Chhabra, Y., Seiffert, P., Gormal, R. S., Vullings, M., Lee, C. M. M., Wallis, T. P., Dehkhoda, F., Indrakumar, S., Jacobsen, Nina Louise, Lindorff-Larsen, Kresten, Durisic, N., Waters, M. J., Meunier, F. A., Kragelund, Birthe Brandt & Brooks, A. J., 2023, I: Cell Reports. 42, 5, 26 s., 112490.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Transition states for protein folding have native topologies despite high structural variability

    Lindorff-Larsen, Kresten, Vendruscolo, M., Paci, E. & Dobson, C. M., 2004, I: Nature Structural and Molecular Biology. 11, 5, s. 443-9 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Transition State Contact Orders Correlate with Protein Folding Rates

    Paci, E., Lindorff-Larsen, Kresten, Dobson, C. M., Karplus, M. & Vendruscolo, M., 2005, I: Journal of Molecular Biology. 352, 3, s. 495-500

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Transient exposure of a buried phosphorylation site in an autoinhibited protein

    Orioli, S., Henning Hansen, C. G. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2022, I: Biophysical Journal. 121, 1, s. 91-101 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Toward mechanistic models for genotype-phenotype correlations in phenylketonuria using protein stability calculations

    Scheller, R., Stein, Amelie, Nielsen, S. V., Marin, F. I., Gerdes, Anne-Marie Axø, Di Marco, M., Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, I: Human Mutation. 40, 4, s. 444-457

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Topological constraints and modular structure in the folding and functional motions of GlpG, an intramembrane protease

    Schafer, N. P., Truong, H. H., Otzen, D. E., Lindorff-Larsen, Kresten & Wolynes, P. G., 2016, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113, 8, s. 2098-2103 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Thiol alkylation below neutral pH

    Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, J. R., 2000, I: Analytical Biochemistry. 286, 2, s. 308-10 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    The role of water coordination in the pH-dependent gating of hAQP10

    Truelsen, S. F., Missel, Julie Winkel, Gotfryd, K., Pedersen, Per Amstrup, Gourdon, Pontus Emanuel, Lindorff-Larsen, Kresten & Hélix-Nielsen, C., 2022, I: B B A - Biomembranes. 1864, 1, 13 s., 183809.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    The role of protein loops and linkers in conformational dynamics and allostery

    Papaleo, E., Saladino, G., Lambrughi, M., Lindorff-Larsen, Kresten, Gervasio, F. L. & Nussinov, R., 2016, I: Chemical Reviews. 116, 11, s. 6391-6423 33 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    The prolactin receptor scaffolds Janus kinase 2 via co-structure formation with phosphoinositide-4,5-bisphosphate

    Araya-Secchi, R., Bugge, K., Seiffert, P., Petry, A., Haxholm, G. W., Lindorff-Larsen, Kresten, Pedersen, Stine Helene Falsig, Arleth, Lise & Kragelund, Birthe Brandt, 2023, I: eLife. 12, 27 s., e84645.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    The effect of linker conformation on performance and stability of a two-domain lytic polysaccharide monooxygenase

    Forsberg, Z., Stepnov, A. A., Tesei, Giulio, Wang, Y., Buchinger, E., Kristiansen, S. K., Aachmann, F. L., Arleth, Lise, Eijsink, V. G. H., Lindorff-Larsen, Kresten & Courtade, G., 2023, I: Journal of Biological Chemistry. 299, 11, 17 s., 105262.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    The covalent reactivity of functionalized 5-hydroxy-butyrolactams is the basis for targeting of fatty acid binding protein 5 (FABP5) by the neurotrophic agent MT-21

    Svenningsen, E. B., Ottosen, R. N., Jørgensen, K. H., Nisavic, M., Larsen, C. K., Hansen, B. K., Wang, Y., Lindorff-Larsen, Kresten, Tørring, T., Hacker, S. M., Palmfeldt, J. & Poulsen, T. B., 2022, I: RSC Chemical Biology. 3, 10, s. 1216-1229 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    The Structure of the Central Side Chain is Crucial for Anoplin Hemolytic Activity

    Munk, J., Thøgersen, L., Uggerhøj, L. E., Wimmer, R., Frimodt-Møller, N., Lindorff-Larsen, Kresten & Hansen, Paul Robert, 2013, Proceedings of the 23rd American Peptide Symposium. Lebl, M. (red.). American Peptide Society

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  22. Systematic validation of protein force fields against experimental data

    Lindorff-Larsen, Kresten, Maragakis, P., Piana, S., Eastwood, M. P., Dror, R. O. & Shaw, D. E., 2012, I: P L o S One. 7, 2, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Synergistic stabilization of a double mutant in chymotrypsin inhibitor 2 from a library screen in E. coli

    Hamborg, L., Granata, D., Olsen, Johan Gotthardt, Roche, J. V., Pedersen, L. E., Nielsen, A. T., Lindorff-Larsen, Kresten & Teilum, Kaare, 2021, I: Communications Biology . 4, 9 s., 980.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Surprisingly high stability of barley lipid transfer protein, LTP1, towards denaturant, heat and proteases

    Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2001, I: FEBS Letters. 488, 3, s. 145-148 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Substrate-induced conformational dynamics of the dopamine transporter

    Nielsen, A. K., Möller, I. R., Wang, Y., Rasmussen, Søren Gøgsig Faarup, Lindorff-Larsen, Kresten, Rand, Kasper Dyrberg & Loland, Claus Juul, 2019, I: Nature Communications. 10, 14 s., 2714.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Structure of the regulatory apparatus of a calcium-dependent protein kinase (CDPK): a novel mode of calmodulin-target recognition

    Chandran, V., Stollar, E. J., Lindorff-Larsen, Kresten, Harper, J. F., Chazin, W. J., Dobson, C. M., Luisi, B. F. & Christodoulou, J., 2006, I: Journal of Molecular Biology. 357, 2, s. 400-10 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Structure of the bacterial cytoskeleton protein bactofilin by NMR chemical shifts and sequence variation

    Kassem, M. M., Wang, Y., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2016, I: Biophysical Journal. 110, 11, s. 2342-2348 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Structure of a functional amyloid protein subunit computed using sequence variation

    Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 22–25 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Structure and dynamics of an unfolded protein examined by molecular dynamics simulation

    Lindorff-Larsen, Kresten, Trbovic, N., Maragakis, P., Piana, S. & Shaw, D. E., 2012, I: Journal of the American Chemical Society. 134, 8, s. 3787-3791 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Structure and dynamics of a nanodisc by integrating NMR, SAXS and SANS experiments with molecular dynamics simulations.

    Bengtsen, T., Midtgaard, S. R., Holm-Janas, Viktor, Kjølbye, L. R., Johansen, Nicolai Tidemand, Tesei, Giulio, Bottaro, S., Schiøtt, B., Arleth, Lise & Lindorff-Larsen, Kresten, 30 jul. 2020, I: eLife. 9, 24 s., e56518.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Structural heterogeneity and dynamics in protein evolution and design

    Johansson, Kristoffer Enøe & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. 157-163 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    Structural basis of client specificity in mitochondrial membrane-protein chaperones

    Sučec, I., Wang, Y., Dakhlaoui, O., Weinhäupl, K., Jores, T., Costa, D., Hessel, A., Brennich, M., Rapaport, D., Lindorff-Larsen, Kresten, Bersch, B. & Schanda, P., 2020, I: Science Advances. 6, 51, 15 s., eabd0263.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Udgivet

    Structural and functional variation of chitin-binding domains of a lytic polysaccharide monooxygenase from Cellvibrio japonicus

    Madland, E., Forsberg, Z., Wang, Y., Lindorff-Larsen, Kresten, Niebisch, A., Modregger, J., Eijsink, V. G. H., Aachmann, F. L. & Courtade, G., 2021, I: Journal of Biological Chemistry. 297, 4, 17 s., 101084.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Structural Basis of Membrane Protein Chaperoning through the Mitochondrial Intermembrane Space

    Weinhaupl, K., Lindau, C., Hessel, A., Wang, Y., Schültze, C., Jores, T., Melchionda, L., Schönfisch, B., Kalbacher, H., Bersch, B., Rapaport, D., Brennich, M., Lindorff-Larsen, Kresten, Wiedemann, N. & Schanda, P., 2018, I: Cell. 175, 5, s. 1365-1379, e25

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    Structural Basis for Properdin Oligomerization and Convertase Stimulation in the Human Complement System

    Pedersen, D. V., Gadeberg, T. A. F., Thomas, C., Wang, Y., Joram, N., Jensen, R. K., Mazarakis, S. M. M., Revel, M., El Sissy, C., Petersen, S. V., Lindorff-Larsen, Kresten, Thiel, S., Laursen, N. S., Fremeaux-Bacchi, V. & Andersen, G. R., 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 19 s., 2007.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    Small-angle Neutron Scattering Shows that the Solution Structures of the Bacterial Mg2+-Channel CorA are Overall Similar with and without Mg2+ Bound

    Arleth, Lise, Johansen, Nicolai Tidemand, Bengtsen, T., Larsen, A. H., Tidemand, Frederik Grønbæk, Pomorski, Thomas Guenther & Lindorff-Larsen, Kresten, 7 feb. 2020, I: Biophysical Journal. 118, 3, Suppl. 1, s. 12A 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

  37. Udgivet

    Slow conformational changes in the rigid and highly stable chymotrypsin inhibitor 2

    Gavrilov, Y., Prestel, Andreas, Lindorff-Larsen, Kresten & Teilum, Kaare, 2023, I: Protein Science. 32, 4, 9 s., 4604.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Simultaneous determination of protein structure and dynamics

    Lindorff-Larsen, Kresten, Best, R. B., DePristo, M. A., Dobson, C. M. & Vendruscolo, M., 2005, I: Nature. 433, 7022, s. 128-132

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Similarity measures for protein ensembles

    Lindorff-Larsen, Kresten & Ferkinghoff-Borg, J., 2009, I: PLoS ONE. 4, 1, 13 s., e4203.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    Side chain to main chain hydrogen bonds stabilize a polyglutamine helix in a transcription factor

    Escobedo, A., Topal, B., Kunze, M. B. A., Aranda, J., Chiesa, G., Mungianu, D., Bernardo-Seisdedos, G., Eftekharzadeh, B., Gairí, M., Pierattelli, R., Felli, I. C., Diercks, T., Millet, O., García, J., Orozco, M., Crehuet, R., Lindorff-Larsen, Kresten & Salvatella, X., 2019, I: Nature Communications. 10, 11 s., 2034.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Role of protein dynamics in transmembrane receptor signalling

    Wang, Y., Bugge, K. Ø., Kragelund, Birthe Brandt & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. 74-82 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Robust estimation of diffusion-optimized ensembles for enhanced sampling

    Tian, P., Jónsson, S. Æ., Ferkinghoff-Borg, J., Krivov, S. V. .., Lindorff-Larsen, Kresten, Irbäck, A. & Boomsma, Wouter, 2014, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 10, 2, s. 543–553 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Udgivet

    Relation between native ensembles and experimental structures of proteins.

    Best, R. B., Lindorff-Larsen, Kresten, DePristo, M. A. & VEndruscolo, M., 2006, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, 29, s. 10901-6

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Refining conformational ensembles of flexible proteins against small-angle x-ray scattering data

    Pesce, Francesco & Lindorff-Larsen, Kresten, 2021, I: Biophysical Journal. 120, 22, s. 5124-5135 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Refinement of α-Synuclein Ensembles Against SAXS Data: Comparison of Force Fields and Methods

    Ahmed, M. C., Skaanning, L. K., Jussupow, A., Newcombe, Estella Anne, Kragelund, Birthe Brandt, Camilloni, C., Langkilde, Annette Eva & Lindorff-Larsen, Kresten, 2021, I: Frontiers in Molecular Biosciences. 8, 13 s., 654333.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Rare Catechol-O-methyltransferase Missense Variants Are Structurally Unstable Proteasome Targets

    Larsen, Fia Brunsgaard Valsted, Cagiada, Matteo, Dideriksen, J., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2023, I: Biochemistry. 62, 8, 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. Udgivet

    Rapid protein stability prediction using deep learning representations

    Blaabjerg, Lasse Møller, Kassem, M. M., Good, L. L., Jonsson, Nicolas, Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Boomsma, Wouter, Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: eLife. 12, 19 s., e82593.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Random mutagenesis analysis of the Influenza A M2 proton channel reveals novel resistance mutants

    Santner, P., Martins, J. M. D. S., Kampmeyer, Caroline, Hartmann-Petersen, Rasmus, Laursen, J. S., Stein, Amelie, Olsen, Christian Adam, Arkin, I. T., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5957-5968

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics

    Christensen, A. S., Linnet, T. E., Borg, M., Boomsma, Wouter, Lindorff-Larsen, Kresten, Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLoS ONE. 8, 12, 10 s., e84123.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Protein stability and degradation in health and disease

    Bjørnkjær, Lene, Abildgaard, A. B., Gersing, S. K., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, Molecular Chaperones in Human Disorders. Donev, R. (red.). Academic Press, s. 61-83 (Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, Bind 114).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  51. Protein folding kinetics and thermodynamics from atomistic simulation

    Piana, S., Lindorff-Larsen, Kresten & Shaw, D. E., 2012, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 44, s. 17845-17850 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  52. Protein folding and the organization of the protein topology universe

    Lindorff-Larsen, Kresten, Røgen, P., Paci, E., Vendruscolo, M. & Dobson, C. M., 2005, I: TIBS -Trends in Biochemical Sciences. Regular ed.. 30, 1, s. 13-19

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  53. Udgivet

    Protein destabilization and degradation as a mechanism for hereditary disease

    Nielsen, S. V., Schenstrøm, S. M., Christensen, Caspar Elo, Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2020, Protein Homeostasis Diseases: Mechanisms and Novel Therapies. Pey, A. L. (red.). Elsevier, s. 111-125

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  54. Udgivet

    Protein Dynamics Enables Phosphorylation of Buried Residues in Cdk2/Cyclin-A-Bound p27

    Henriques, J. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, I: Biophysical Journal. 119, 10, s. 2010-2018 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. Udgivet

    Properdin oligomers adopt rigid extended conformations supporting function

    Pedersen, D. V., Pedersen, M. N., Mazarakis, S. M. M., Wang, Y., Lindorff-Larsen, Kresten, Arleth, Lise & Andersen, G. R., 2021, I: eLife. 10, 22 s., e63356.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  56. Udgivet

    Promoting transparency and reproducibility in enhanced molecular simulations

    Bonomi, M., Bussi, G., Camilloni, C., Tribello, G. A., Banas, P., Barducci, A., Bernetti, M., Bolhuis, P. G., Bottaro, S., Branduardi, D., Capelli, R., Carloni, P., Ceriotti, M., Cesari, A., Chen, H., Chen, W., Colizzi, F., De, S., De La Pierre, M., Donadio, D. & 54 flere, Drobot, V., Ensing, B., Ferguson, A. L., Filizola, M., Fraser, J. S., Fu, H., Gasparotto, P., Gervasio, F. L., Giberti, F., Gil-Ley, A., Giorgino, T., Heller, G. T., Hocky, G. M., Iannuzzi, M., Invernizzi, M., Jelfs, K. E., Jussupow, A., Kirilin, E., Laio, A., Limongelli, V., Lindorff-Larsen, Kresten, Lohr, T., Marinelli, F., Martin-Samos, L., Masetti, M., Meyer, R., Michaelides, A., Molteni, C., Morishita, T., Nava, M., Paissoni, C., Papaleo, E., Parrinello, M., Pfaendtner, J., Piaggi, P., Piccini, G., Pietropaolo, A., Pietrucci, F., Pipolo, S., Provasi, D., Quigley, D., Raiteri, P., Raniolo, S., Rydzewski, J., Salvalaglio, M., Sosso, G. C., Spiwok, V., Sponer, J., Swenson, D. W. H., Tiwary, P., Valsson, O., Vendruscolo, M., Voth, G. A. & White, A., 2019, I: Nature Methods. 16, 8, s. 670-673

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt

  57. Udgivet

    Probabilistic determination of native state ensembles of proteins

    Olsson, S., Vögeli, B. R., Cavalli, A., Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J., Lindorff-Larsen, Kresten & Hamelryck, Thomas Wim, 2014, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 10, 8, s. 3484-3491 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  58. Principles of conduction and hydrophobic gating in K+ channels

    Jensen, M. Ø., Borhani, D. W., Lindorff-Larsen, Kresten, Maragakis, P., Jogini, V., Eastwood, M. P., Dror, R. O. & Shaw, D. E., 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 13, s. 5833-8 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  59. Udgivet

    Prediction of Quality-control Degradation Signals in Yeast Proteins

    Johansson, Kristoffer Enøe, Mashahreh, B., Hartmann-Petersen, Rasmus, Ravid, T. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 2, 9 s., 167915.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  60. Udgivet

    Predicting the impact of Lynch syndrome-causing missense mutations from structural calculations

    Nielsen, S. V., Stein, Amelie, Dinitzen, A. B., Papaleo, E., Tatham, M. H., Poulsen, E. G., Kassem, M. M., Rasmussen, Lene Juel, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 19 apr. 2017, I: PLoS Genetics. 13, 4, 26 s., e1006739.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  61. Udgivet

    Predicting and interpreting large-scale mutagenesis data using analyses of protein stability and conservation

    Høie, M. H., Cagiada, Matteo, Frederiksen, A. H. B., Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2022, I: Cell Reports. 38, 2, 15 s., 110207.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  62. Udgivet

    Plant YTHDF proteins are direct effectors of antiviral immunity against an N6-methyladenosine-containing RNA virus

    Martínez-Pérez, M., Aparicio, F., Arribas Hernandez, Laura, Tankmar, Mathias Due, Rennie, Sarah, von Bülow, Sören, Lindorff-Larsen, Kresten, Brodersen, Peter & Pallas, V., 2023, I: EMBO Journal. 42, 18, 17 s., e113378.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  63. Picosecond to Millisecond Structural Dynamics in Human Ubiquitin

    Lindorff-Larsen, Kresten, Maragakis, P., Piana, S. & Shaw, D. E., 2016, I: Journal of Physical Chemistry B. 120, 33, s. 8313-8320 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  64. Udgivet

    Paths of long-range communication in the E2 enzymes of family 3: a molecular dynamics investigation

    Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten & Gioia, L. D., 2012, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 14, s. 12515-12525 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  65. Parallel protein-unfolding pathways revealed and mapped

    Wright, C. F., Lindorff-Larsen, Kresten, Randles, L. G. & Clarke, J., 2003, I: Nature Structural and Molecular Biology. 10, 8, s. 658-62 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  66. Udgivet

    PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

    Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, Jan Halborg, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  67. Udgivet

    Order and disorder - An integrative structure of the full-length human growth hormone receptor

    Kassem, N., Araya-Secchi, R., Bugge, K., Barclay, A., Steinocher, H., Khondker, A., Wang, Y., Lenard, A. J., Bürck, J., Sahin, Cagla, Ulrich, A. S., Landreh, M., Pedersen, Martin Cramer, Rheinstädter, M. C., Pedersen, Per Amstrup, Lindorff-Larsen, Kresten, Arleth, Lise & Kragelund, Birthe Brandt, 2021, I: Science Advances. 7, 27, 20 s., eabh3805.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  68. Udgivet

    On the Potential of Machine Learning to Examine the Relationship Between Sequence, Structure, Dynamics and Function of Intrinsically Disordered Proteins

    Lindorff-Larsen, Kresten & Kragelund, Birthe Brandt, 2021, I: Journal of Molecular Biology. 433, 20, 22 s., 167196.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  69. Udgivet

    On the Calculation of SAXS Profiles of Folded and Intrinsically Disordered Proteins from Computer Simulations

    Henriques, J., Arleth, Lise, Lindorff-Larsen, Kresten & Skepo, M., 3 aug. 2018, I: Journal of Molecular Biology. 430, 16, SI, s. 2521-2539

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  70. Udgivet

    Novel HARS2 missense variants identified in individuals with sensorineural hearing impairment and Perrault syndrome

    Karstensen, H. G., Rendtorff, N. D., Hindbæk, L. S., Colombo, R., Stein, Amelie, Birkebæk, N. H., Hartmann-Petersen, Rasmus, Lindorff-Larsen, Kresten, Højland, A. T., Petersen, M. B. & Tranebjærg, Lisbeth, 2020, I: European Journal of Medical Genetics. 63, 3, 6 s., 103733.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  71. Udgivet

    Multiplexed assays reveal effects of missense variants in MSH2 and cancer predisposition

    Nielsen, S. V., Hartmann-Petersen, Rasmus, Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2021, I: PLOS Genetics. 17, 4, 6 s., e1009496.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  72. Udgivet

    Monte Carlo Sampling of Protein Folding by Combining an All-Atom Physics-Based Model with a Native State Bias

    Wang, Y., Tian, P., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Journal of Physical Chemistry B. 122, 49, s. 11174-11185

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  73. Udgivet

    Molekylære stavefejl

    Abildgaard, A. B., Winther, Jakob R., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 28 jan. 2021, I: Weekendavisen, Ideer.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Kronik › Formidling

  74. Udgivet

    Molecular dynamics-guided discovery of an ago-allosteric modulator for GPR40/FFAR1

    Lückmann, Michael, Trauelsen, Mette, Bentsen, M. A., Nissen, T. A. D., Martins, J., Fallah, Z., Nygaard, M. M., Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten, Schwartz, Thue W. & Frimurer, Thomas Michael, 2 apr. 2019, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116, 14, s. 7123-7128

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  75. Udgivet

    Molecular dynamics ensemble refinement of the heterogeneous native state of NCBD using chemical shifts and NOEs

    Papaleo, E., Camilloni, C., Teilum, Kaare, Vendruscolo, M. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: PeerJ. 6, s. 1-24 e5125.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  76. Millisecond-scale molecular dynamics simulations on Anton

    Shaw, D. E., Dror, R. O., Salmon, J. K., Grossman, J. P., Mackenzie, K. M., Bank, J. A., Young, C., Deneroff, M. M., Batson, B., Bowers, K. J., Chow, E., Eastwood, M. P., Ierardi, D., Klepeis, J. L., Kuskin, J., Larson, R. H., Lindorff-Larsen, K., Maragakis, P., Moraes, M. A., Piana, S. & 2 flere, Shan, Y. & Towles, B., 2009, Proceedings of the Conference on High Performance Computing Networking, Storage and Analysis. Association for Computing Machinery, 11 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  77. Udgivet

    Microsecond molecular dynamics simulation shows effect of slow loop dynamics on backbone amide order parameters of proteins

    Maragakis, P., Lindorff-Larsen, Kresten, Eastwood, M. P., Dror, R. O., Klepeis, J. L., Arkin, I. T., Jensen, M. Ø., Xu, H., Trbovic, N., Friesner, R. A., Iii, A. G. P. & Shaw, D. E., 2008, I: Journal of Physical Chemistry Part B: Condensed Matter, Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical. 112, 19, s. 6155-6158 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  78. Udgivet

    Mg2+-dependent conformational equilibria in CorA and an integrated view on transport regulation

    Johansen, Nicolai Tidemand, Bonaccorsi, M., Bengtsen, T., Nørgrd Larsen, Andreas, Tidemand, Frederik Grønbæk, Pedersen, Martin Cramer, Huda, P., Berndtsson, J., Darwish, T., Yepuri, N. R., Martel, A., Pomorski, Thomas Guenther, Bertarello, A., Sansom, M., Rapp, M., Crehuet, R., Schubeis, T., Lindorff-Larsen, Kresten, Pintacuda, G. & Arleth, Lise, 2022, I: eLife. 11, 35 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  79. Udgivet

    Mapping transiently formed and sparsely populated conformations on a complex energy landscape

    Wang, Y., Papaleo, E. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2016, I: eLife. 5, 35 s., e17505.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  80. Udgivet

    Mapping the universe of RNA tetraloop folds

    Bottaro, S. & Lindorff-Larsen, Kresten, 25 jul. 2017, I: Biophysical Journal. 113, 2, s. 257-267 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  81. Udgivet

    Mapping the degradation pathway of a disease-linked aspartoacylase variant

    Gersing, S. K., Wang, Y., Grønbæk-Thygesen, Martin, Kampmeyer, Caroline, Bjørnkjær, Lene, Willemoës, Martin, Andréasson, C., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2021, I: PLOS Genetics. 17, 4, 28 s., e1009539.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  82. Mapping Long-Range Interactions in a-Synuclein using Spin-Label NMR and Ensemble Molecular Dynamics Simulations

    Dedmon, M. M., Lindorff-Larsen, Kresten, Christodoulou, J., Vendruscolo, M. & Dobson, C. M., 2005, I: Journal of the American Chemical Society. 127, 2, s. 476-477

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  83. Udgivet

    Lynch syndrome, molecular mechanisms and variant classification

    Abildgaard, A. B., Nielsen, S., Bernstein, I., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2023, I: British Journal of Cancer. 128, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  84. Long-timescale molecular dynamics simulations of protein structure and function

    Klepeis, J. L., Lindorff-Larsen, Kresten, Dror, R. O. & Shaw, D. E., 2009, I: Current Opinion in Structural Biology. 19, 2, s. 120-7 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  85. Udgivet

    Linking thermodynamics and measurements of protein stability

    Lindorff-Larsen, Kresten & Teilum, Kaare, 2021, I: Protein engineering, design & selection : PEDS. 34, 13 s., gzab002.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  86. Udgivet

    Interpreting the molecular mechanisms of disease variants in human transmembrane proteins

    Tiemann, Johanna Katarina Sofie, Zschach, Henrike, Lindorff-Larsen, Kresten & Stein, Amelie, 2023, I: Biophysical Journal. 122, 11, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  87. Udgivet

    Interpreting Dynamically-Averaged Scalar Couplings in Proteins

    Lindorff-Larsen, Kresten, Best, R. B. & Vendruscolo, M., 2005, I: Journal of Biomolecular NMR. 32, 4, s. 273-280

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  88. Udgivet

    Interplay of folded domains and the disordered low-complexity domain in mediating hnRNPA1 phase separation

    Martin, E. W., Thomasen, Emil, Milkovic, N. M., Cuneo, M. J., Grace, C. R., Nourse, A., Lindorff-Larsen, Kresten & Mittag, T., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 5, s. 2931-2945 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  89. Interaction networks in protein folding via atomic-resolution experiments and long-time-scale molecular dynamics simulations

    Sborgi, L., Verma, A., Piana, S., Lindorff-Larsen, Kresten, Cerminara, M., Santiveri, C. M., Shaw, D. E., De Alba, E. & Muñoz, V., 2015, I: Journal of the American Chemical Society. 137, 20, s. 6506-6516 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  90. Udgivet

    Integrating NMR and simulations reveals motions in the UUCG tetraloop

    Bottaro, S., Nichols, P. J., Vögeli, B., Parrinello, M. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 11, s. 5839-5848 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  91. Udgivet

    Integrating Molecular Simulation and Experimental Data: A Bayesian/Maximum Entropy Reweighting Approach

    Bottaro, S., Bengtsen, T. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, Structural Bioinformatics: Methods and Protocols. Gáspári, Z. (red.). Humana Press, s. 219-240 22 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2112).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  92. Udgivet

    Integrated NMR/Molecular Dynamics Determination of the Ensemble Conformation of a Thermodynamically Stable CUUG RNA Tetraloop

    Oxenfarth, A., Kümmerer, Felix, Bottaro, S., Schnieders, R., Pinter, G., Jonker, H. R. A., Fürtig, B., Richter, C., Blackledge, M., Lindorff-Larsen, Kresten & Schwalbe, H., 2023, I: Journal of the American Chemical Society. 145, 30, s. 16557-16572 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  93. Udgivet

    Insights into the conservation and diversification of the molecular functions of YTHDF proteins

    Flores-Téllez, D., Tankmar, Mathias Due, von Bülow, Sören, Chen, Junyu, Lindorff-Larsen, Kresten, Brodersen, Peter & Arribas Hernandez, Laura, 2023, I: PLOS Genetics. 19, 10, 37 s., e1010980.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  94. Udgivet

    Insight into Calcium-Binding Motifs of Intrinsically Disordered Proteins

    Newcombe, Estella Anne, Fernandes, Catarina, Lundsgaard, J. E., Brakti, Inna, Lindorff-Larsen, Kresten, Langkilde, Annette Eva, Skriver, Karen & Kragelund, Birthe Brandt, 2021, I: Biomolecules. 11, 8, 17 s., 1173.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  95. Udgivet

    Increasing protein stability by inferring substitution effects from high-throughput experiments

    Norrild, R. K., Johansson, Kristoffer Enøe, O'Shea, Charlotte, Morth, J. P., Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2022, I: Cell Reports Methods. 2, 11, 11 s., 100333.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  96. Udgivet

    Improving Martini 3 for Disordered and Multidomain Proteins

    Thomasen, Emil, Pesce, Francesco, Roesgaard, M. A., Tesei, Giulio & Lindorff-Larsen, Kresten, 2022, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 18, 4, s. 2033-2041 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  97. Improved side-chain torsion potentials for the Amber ff99SB protein force field

    Lindorff-Larsen, Kresten, Piana, S., Palmo, K., Maragakis, P., Klepeis, J. L., Dror, R. O. & Shaw, D. E., jun. 2010, I: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 78, 8, s. 1950-8 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  98. Udgivet

    Improved predictions of phase behaviour of intrinsically disordered proteins by tuning the interaction range

    Tesei, Giulio & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: Open Research Europe. 2, 94, 24 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  99. Udgivet

    IL-2 is inactivated by the acidic pH environment of tumors enabling engineering of a pH-selective mutein

    Gaggero, S., Martinez-Fabregas, J., Cozzani, A., Fyfe, P. K., Leprohon, M., Yang, J., Thomasen, F. E., Winkelmann, H., Magnez, R., Conti, A. G., Wilmes, S., Pohler, E., van Gijsel Bonnello, M., Thuru, X., Quesnel, B., Soncin, F., Piehler, J., Lindorff-Larsen, K., Roychoudhuri, R., Moraga, I. & 1 flere, Mitra, S., 2022, I: Science immunology. 7, 78, 15 s., eade5686.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  100. Udgivet

    How well do force fields capture the strength of salt bridges in proteins?

    Ahmed, M. C. H., Papaleo, E. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: PeerJ. 6, 17 s., 4967.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 35228567