Joachim Lütken Weischenfeldt

Joachim Lütken Weischenfeldt

Gruppeleder, Klinisk professor

Medlem af:

    ORCID: 0000-0002-3917-5524

    Udgivelsesår:
    Alle
    1 - 68 ud af 68Pr. side: 100
    Sortering: Udgivelsesdato
    1. 2024
    2. Accepteret/In press

      CEA (CEACAM5) expression is common in muscle-invasive urothelial carcinoma of the bladder but unrelated to the disease course

      Plage, H., Furlano, K., Neymeyer, J., Weinberger, S., Gerdes, B., Hubatsch, M., Ralla, B., Franz, A., Fendler, A., de Martino, M., Roßner, F., Schallenberg, S., Elezkurtaj, S., Kluth, M., Lennartz, M., Blessin, N. C., Marx, A. H., Samtleben, H., Fisch, M., Rink, M. & 14 flere, Kaczmarek, K., Ecke, T., Hallmann, S., Koch, S., Adamini, N., Minner, S., Simon, R., Sauter, G., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Klatte, T., Schlomm, T., Horst, D., Zecha, H. & Slojewski, M., 2024, (Accepteret/In press) I: BJUI Compass.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    3. Udgivet

      Loss of Upk1a and Upk1b expression is linked to stage progression in urothelial carcinoma of the bladder

      Kaczmarek, K., Plage, H., Furlano, K., Hofbauer, S., Weinberger, S., Ralla, B., Franz, A., Fendler, A., de Martino, M., Roßner, F., Schallenberg, S., Elezkurtaj, S., Kluth, M., Lennartz, M., Blessin, N. C., Marx, A. H., Samtleben, H., Fisch, M., Rink, M., Slojewski, M. & 12 flere, Ecke, T., Hallmann, S., Koch, S., Adamini, N., Minner, S., Simon, R., Sauter, G., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Klatte, T., Schlomm, T., Horst, D. & Zecha, H., 2024, I: International Urology and Nephrology. 56, s. 499-508 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    4. 2023
    5. Udgivet

      A polygenic two-hit hypothesis for prostate cancer

      Houlahan, K. E., Livingstone, J., Fox, N. S., Kurganovs, N., Zhu, H., Sietsma Penington, J., Jung, C-H., Yamaguchi, T. N., Heisler, L. E., Jovelin, R., Costello, A. J., Pope, B. J., Kishan, A. U., Corcoran, N. M., Bristow, R. G., Waszak, S. M., Weischenfeldt, J., He, H. H., Hung, R. J., Hovens, C. M. & 1 flere, Boutros, P. C., 2023, I: Journal of the National Cancer Institute. 115, 4, s. 468-472 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      Epithelial specific splicing regulator proteins as emerging oncogenes in aggressive prostate cancer

      Advani, R., Luzzi, S., Scott, E., Dalgliesh, C., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Munkley, J. & Elliott, D. J., 2023, I: Oncogene. 42, s. 3161-3168 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    7. Udgivet

      Frequency and Functional Characterization of RUNX1 Germline Variants in Myeloid Neoplasms

      Nitschke, N. J., Almosailleakh, M., Niu, Yiyuan, Hansen, Jakob Werner, Raaschou-Jensen, K., Jespersen, Jakob Schmidt, Severinsen, M. T., Roug, A. S., Frödin, Morten, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Andersen, M. K. & Grønbæk, Kirsten, 2023, I: Human Mutation. 2023, 11 s., 4738660.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    8. Udgivet

      Hunting for the elusive target antigen in gestational alloimmune liver disease (GALD)

      Rieneck, K., Rasmussen, K. K., Schoof, E. M., Clausen, F. B., Holze, H., Bergholt, Thomas, Jørgensen, M. H., Christensen, Vibeke Brix, Almaas, R., Jordal, P. L., Locard-Paulet, Marie, Runager, K., Nielsen, L. K., Schlotmann, Balthasar Clemens, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Jensen, Lars Juhl & Dziegiel, Morten Hanefeld, 2023, I: PLoS ONE. 18, 10, 25 s., e0286432.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. Udgivet

      The Neurogenome study: Comprehensive molecular profiling to optimize treatment for Danish glioblastoma patients

      Nørøxe, D. S., Maarup, S., Fougner, Vincent Nicolay, Muhic, A., Møller, Søren, Urup, T., Lü, Maya Jeje Schuang, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Hansen, Adam Espe, Skovgaard Poulsen, H., Lassen, Ulrik Niels & Hasselbalch, B., 2023, I: Neuro-Oncology Advances. 5, 1, 8 s., vdad137.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    10. Udgivet

      When 3D genome changes cause disease: the impact of structural variations in congenital disease and cancer

      Weischenfeldt, Joachim Lütken & Ibrahim, D. M., 2023, I: Current Opinion in Genetics and Development. 80, 102048.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    11. 2022
    12. Udgivet

      Clonal Hematopoiesis and Epigenetic Age Acceleration in Elderly Danish Twins

      Sørensen, M., Tulstrup, Morten Rytter, Hansen, Jakob Werner, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Grønbæk, Kirsten & Christensen, K., 2022, I: HemaSphere. 6, 9, 6 s., 768.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    13. Udgivet

      Clonal hematopoiesis is associated with hematological toxicity during lenalidomide-based therapy for MCL

      Husby, Simon, Bæch-Laursen, C., Eskelund, C. W., Favero, Francesco, Jespersen, Jakob Schmidt, Hutchings, M., Pedersen, L. B., Niemann, Carsten, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Räty, R., Larsen, T. S., Kolstad, A., Jerkeman, M. & Grønbæk, Kirsten, 2022, I: Leukemia. 36, s. 2912-2916

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Udgivet

      Implementing targeted therapies in the treatment of glioblastoma: Previous shortcomings, future promises, and a multimodal strategy recommendation

      Fougner, V., Hasselbalch, B., Lassen, Ulrik Niels, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Poulsen, H. S. & Urup, T., 2022, I: Neuro-Oncology Advances. 4, 1, vdac157.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    15. Udgivet

      Level of unique T cell clonotypes is associated with clonal hematopoiesis and survival in patients with lymphoma undergoing ASCT

      Husby, Simon, Jørgensen, G. Ø., Favero, Francesco, Jespersen, Jakob Schmidt, Rodriguez Gonzalez, Francisco G, Nielsen, C., Sorensen, B., Ebbesen, L. H., Bæch, J., Haastrup, E. K., Josefsson, P., Thorsgaard, M., Brown, Peter de Nully, El-Galaly, T. C., Larsen, T. S., Weischenfeldt, Joachim Lütken & Grønbæk, Kirsten, 2022, I: Bone Marrow Transplantation. 57, s. 674-677

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

    16. Udgivet

      Rare Germline Variants Are Associated with Rapid Biochemical Recurrence After Radical Prostate Cancer Treatment: A Pan Prostate Cancer Group Study

      Burns, D., Anokian, E., Saunders, E. J., Bristow, R. G., Fraser, M., Reimand, J., Schlomm, T., Sauter, G., Brors, B., Korbel, J., Weischenfeldt, J., Waszak, S. M., Corcoran, N. M., Jung, C. H., Pope, B. J., Hovens, C. M., Cancel-Tassin, G., Cussenot, O., Loda, M., Sander, C. & 16 flere, Hayes, V. M., Dalsgaard Sorensen, K., Lu, Y. J., Hamdy, F. C., Foster, C. S., Gnanapragasam, V., Butler, A., Lynch, A. G., Massie, C. E., Woodcock, D. J., Cooper, C. S., Wedge, D. C., Brewer, D. S., Kote-Jarai, Z., Eeles, R. A. & CR-UK/Prostate Cancer UK, ICGC, The PPCG, C. C. U. I. T. P., 2022, I: European Urology. 82, 2, s. 201-211 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    17. Udgivet

      Somatic structural variant formation is guided by and influences genome architecture

      Sidiropoulos, N., Mardin, B. R., Rodriguez Gonzalez, Francisco G, Bochkov, I. D., Garg, S., Stuetz, A. M., Korbel, J. O., Aiden, E. L. & Weischenfeldt, Joachim Lütken, 2022, I: Genome Research. 32, 4, s. 643-655

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    18. Udgivet

      Structural variations in cancer and the 3D genome

      Dubois, F., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken & Beroukhim, R., 2022, I: Nature Reviews Cancer. 22, s. 533-546

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    19. Udgivet

      Tumor mutational burden and purity adjustment before and after treatment with temozolomide in 27 paired samples of glioblastoma: a prospective study

      Nørøxe, D. S., Flynn, A., Yde, C. W., Østrup, O., Nielsen, Finn Cilius, Skjøth, Jane, Brennum, J., Hamerlik, P., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Skovgaard Poulsen, H. & Lassen, Ulrik Niels, 2022, I: Molecular Oncology. 16, 1, s. 206-218

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    20. 2021
    21. Udgivet

      Mutations known from B-cell lymphoid malignancies are not found in CD34+ stem cells from patients with lymphoma

      Husby, Simon, Favero, Francesco, Rodriguez Gonzalez, Francisco G, Sutton, L. A., Haastrup, E. K., mxz703, mxz703, Hansen, Jakob Werner, Arboe, B., Aslan, D., Clasen-Linde, E., Gjerdrum, Lise Mette Rahbek, Gørlev, J. S., Brown, Peter de Nully, Fischer-Nielsen, A., Rosenquist, R., Weischenfeldt, Joachim Lütken & Grønbæk, Kirsten, 2021, I: Leukemia and Lymphoma. 62, 11, s. 2808-2811

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    22. Udgivet

      Systematic dissection of transcriptional regulatory networks by genome-scale and single-cell CRISPR screens

      Lopes, R., Sprouffske, K., Sheng, C., Uijttewaal, E. C. H., Wesdorp, A. E., Dahinden, J., Wengert, S., Diaz-Miyar, J., Yildiz, U., Bleu, M., Apfel, V., Mermet-Meillon, F., Krese, R., Eder, M., Olsen, A. V., Hoppe, P., Knehr, J., Carbone, W., Cuttat, R., Waldt, A. & 8 flere, Altorfer, M., Naumann, U., Weischenfeldt, Joachim Lütken, deWeck, A., Kauffmann, A., Roma, G., Schübeler, D. & Galli, G. G., 2021, I: Science Advances. 7, 27, eabf5733.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    23. Udgivet

      TET2 mutations are associated with hypermethylation at key regulatory enhancers in normal and malignant hematopoiesis

      Tulstrup, Morten Rytter, Soerensen, M., Hansen, Jakob Werner, Gillberg, Linn, Needhamsen, M., Kaastrup, K., Helin, K., Christensen, K., Weischenfeldt, Joachim Lütken & Grønbæk, Kirsten, 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 10 s., 6061.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    24. 2020
    25. Udgivet

      Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing

      Cortés-Ciriano, I., Lee, J. J. K., Xi, R., Jain, D., Jung, Y. L., Yang, L., Gordenin, D., Klimczak, L. J., Zhang, C. Z., Pellman, D. S., Akdemir, K. C., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Beroukhim, R., Boutros, P. C., Bowtell, D. D. L., Brors, B., Burns, K. H., Campbell, P. J., Chan, K. & 32 flere, Chen, K., Cortés-Ciriano, I., Dueso-Barroso, A., Dunford, A. J., Edwards, P. A., Estivill, X., Etemadmoghadam, D., Feuerbach, L., Fink, J. L., Frenkel-Morgenstern, M., Garsed, D. W., Gerstein, M., Gordenin, D. A., Haan, D., Haber, J. E., Hess, J. M., Hutter, B., Imielinski, M., Jones, D. T. W., Ju, Y. S., Kazanov, M. D., Klimczak, L. J., Koh, Y., Korbel, J. O., Kumar, K., Lee, E. A., Lee, J. J. K., Li, Y., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Structural Variation Working Group, P. S. V. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 6 feb. 2020, I: Nature Genetics.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    26. Udgivet

      Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data

      Paczkowska, M., Barenboim, J., Sintupisut, N., Fox, N. S., Zhu, H., Abd-Rabbo, D., Mee, M. W., Boutros, P. C., Abascal, F., Amin, S. B., Bader, G. D., Beroukhim, R., Bertl, J., Boroevich, K. A., Brunak, S., Campbell, P. J., Carlevaro-Fita, J., Chakravarty, D., Chan, C. W. Y., Chen, K. & 30 flere, Choi, J. K., Deu-Pons, J., Dhingra, P., Diamanti, K., Feuerbach, L., Fink, J. L., Fonseca, N. A., Frigola, J., Gambacorti-Passerini, C., Garsed, D. W., Gerstein, M., Getz, G., Gonzalez-Perez, A., Guo, Q., Gut, I. G., Haan, D., Hamilton, M. P., Haradhvala, N. J., Harmanci, A. O., Helmy, M., Herrmann, C., Hess, J. M., Hobolth, A., Hodzic, E., Hong, C., Hornshøj, H., Nielsen, M. M., Pedersen, J. S., Sidiropoulos, N. & Weischenfeldt, Joachim Lütken, 5 feb. 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 735.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    27. Udgivet

      Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes

      Rheinbay, E., Nielsen, M. M., Abascal, F., Wala, J. A., Shapira, O., Tiao, G., Hornshøj, H., Hess, J. M., Juul, R. I., Lin, Z., Feuerbach, L., Sabarinathan, R., Madsen, T., Kim, J., Mularoni, L., Shuai, S., Lanzós, A., Herrmann, C., Maruvka, Y. E., Shen, C. & 31 flere, Amin, S. B., Bandopadhayay, P., Bertl, J., Boroevich, K. A., Busanovich, J., Carlevaro-Fita, J., Chakravarty, D., Chan, C. W. Y., Craft, D., Dhingra, P., Diamanti, K., Fonseca, N. A., Gonzalez-Perez, A., Guo, Q., Hamilton, M. P., Haradhvala, N. J., Hong, C., Isaev, K., Johnson, T. A., Juul, M., Kahles, A., Kahraman, A., Kim, Y., Komorowski, J., Kumar, K., Kumar, S., Lee, D., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Pedersen, J. S. & PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group, P. D. A. F. I. W. G., feb. 2020, I: Nature. 578, 7793, s. 102-111 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    28. Udgivet

      A Novel Gene Signature-Based Model Predicts Biochemical Recurrence-Free Survival in Prostate Cancer Patients after Radical Prostatectomy

      Shi, R., Bao, X., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Schaefer, C., Rogowski, P., Schmidt-Hegemann, N., Unger, K., Lauber, K., Wang, X., Buchner, A., Stief, C., Schlomm, T., Belka, C. & Li, M., 2020, I: Cancers. 12, 1, s. 1-12 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    29. Udgivet

      Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomes

      Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Technical Working Group, P. T. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Biotechnology. 38, 3, s. 288-292 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    30. Udgivet

      Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis

      Carlevaro-Fita, J., Lanzós, A., Feuerbach, L., Hong, C., Mas-Ponte, D., Pedersen, J. S., Johnson, R., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken & Brunak, Søren, 2020, I: Communications Biology. 3, 1, s. 1-16 56.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    31. Udgivet

      Clinical impact of clonal hematopoiesis in patients with lymphoma undergoing ASCT: a national population-based cohort study

      Husby, S., Favero, F., Nielsen, C., Sørensen, B. S., Bæch, J., Grell, K., Hansen, J. W., Rodriguez-Gonzalez, F. G., Haastrup, E. K., Fischer-Nielsen, A., Andersen, P., Arboe, B., Sækmose, S. G., Hansen, P. B., Christiansen, I., Clasen-Linde, E., Meldgaard, L., Ebbesen, L. H., Segel, E. K., Josefsson, P. & 6 flere, Thorsgaard, M., El-Galaly, T. C., Brown, Peter de Nully, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Larsen, T. S. & Grønbæk, Kirsten, 2020, I: Leukemia. 34, s. 3256-3268 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    32. Udgivet

      Clonal hematopoiesis evolves from pretreatment clones and stabilizes after end of chemotherapy in patients with MCL

      Eskelund, C. W., Husby, Simon, Favero, Francesco, Klausen, T. W., Rodriguez Gonzalez, Francisco G, Kolstad, A., Pedersen, L. B., Räty, R. K., Geisler, C. H., Jerkeman, M., Weischenfeldt, Joachim Lütken & Grønbæk, Kirsten, 2020, I: Blood. 135, 22, s. 2000-2004

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

    33. Udgivet

      Clonal hematopoiesis in elderly twins: concordance, discordance, and mortality

      Hansen, Jakob Werner, Pedersen, D. A., Larsen, L. A., Husby, Simon, Clemmensen, S. B., Hjelmborg, J., Favero, Francesco, Weischenfeldt, Joachim Lütken, Christensen, K. & Grønbæk, Kirsten, 2020, I: Blood. 135, 4, s. 261-268

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    34. Udgivet

      Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower

      Shuai, S., Abascal, F., Amin, S. B., Bader, G. D., Bandopadhayay, P., Barenboim, J., Beroukhim, R., Bertl, J., Boroevich, K. A., Brunak, S., Campbell, P. J., Carlevaro-Fita, J., Chakravarty, D., Chan, C. W. Y., Chen, K., Choi, J. K., Deu-Pons, J., Dhingra, P., Diamanti, K., Feuerbach, L. & 32 flere, Fink, J. L., Fonseca, N. A., Frigola, J., Gambacorti-Passerini, C., Garsed, D. W., Gerstein, M., Getz, G., Guo, Q., Gut, I. G., Haan, D., Hamilton, M. P., Haradhvala, N. J., Harmanci, A. O., Helmy, M., Herrmann, C., Hess, J. M., Hobolth, A., Hodzic, E., Hong, C., Hornshøj, H., Isaev, K., Izarzugaza, J. M. G., Johnson, R., Johnson, T. A., Juul, M., Juul, R. I., Kahles, A., Pedersen, J. S., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group, P. D. A. F. I. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 12 s., 734.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    35. Udgivet

      Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancer

      Akdemir, K. C., Le, V. T., Chandran, S., Li, Y., Verhaak, R. G., Beroukhim, R., Campbell, P. J., Chin, L., Dixon, J. R., Futreal, P. A., Akdemir, K. C., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Beroukhim, R., Boutros, P. C., Bowtell, D. D. L., Brors, B., Burns, K. H., Campbell, P. J., Chan, K. & 32 flere, Chen, K., Cortés-Ciriano, I., Dueso-Barroso, A., Dunford, A. J., Edwards, P. A., Estivill, X., Etemadmoghadam, D., Feuerbach, L., Fink, J. L., Frenkel-Morgenstern, M., Garsed, D. W., Gerstein, M., Gordenin, D. A., Haan, D., Haber, J. E., Hess, J. M., Hutter, B., Imielinski, M., Jones, D. T. W., Ju, Y. S., Kazanov, M. D., Klimczak, L. J., Koh, Y., Korbel, J. O., Kumar, K., Lee, E. A., Lee, J. J. K., Li, Y., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Structural Variation Working Group, P. S. V. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Genetics. s. 294-305

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    36. Udgivet

      Genomic footprints of activated telomere maintenance mechanisms in cancer

      Sieverling, L., Hong, C., Koser, S. D., Ginsbach, P., Kleinheinz, K., Hutter, B., Braun, D. M., Cortés-Ciriano, I., Xi, R., Kabbe, R., Park, P. J., Eils, R., Schlesner, M., Akdemir, K. C., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Beroukhim, R., Boutros, P. C., Bowtell, D. D. L., Brors, B. & 32 flere, Burns, K. H., Campbell, P. J., Chan, K., Chen, K., Cortés-Ciriano, I., Dueso-Barroso, A., Dunford, A. J., Edwards, P. A., Estivill, X., Etemadmoghadam, D., Feuerbach, L., Fink, J. L., Frenkel-Morgenstern, M., Garsed, D. W., Gerstein, M., Gordenin, D. A., Haan, D., Haber, J. E., Hess, J. M., Hutter, B., Imielinski, M., Jones, D. T. W., Ju, Y. S., Kazanov, M. D., Klimczak, L. J., Koh, Y., Korbel, J. O., Kumar, K., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Structural Variation Working Group, P. S. V. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 733.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    37. Udgivet

      High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterations

      Zhang, Y., Chen, F., Fonseca, N. A., He, Y., Fujita, M., Nakagawa, H., Zhang, Z., Brazma, A., Amin, S. B., Awadalla, P., Bailey, P. J., Brazma, A., Brooks, A. N., Calabrese, C., Chateigner, A., Cortés-Ciriano, I., Craft, B., Craft, D., Creighton, C. J., Davidson, N. R. & 33 flere, Demircioğlu, D., Erkek, S., Fonseca, N. A., Frenkel-Morgenstern, M., Goldman, M. J., Greger, L., Göke, J., He, Y., Hoadley, K. A., Hou, Y., Huska, M. R., Kahles, A., Khurana, E., Kilpinen, H., Korbel, J. O., Lamaze, F. C., Lehmann, K. V., Li, C., Li, S., Li, X., Li, X., Liu, D., Liu, F., Liu, X., Nielsen, M. M., Pedersen, J. S., Wu, K., Zhu, S., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Transcriptome Working Group, P. T. W. G., PCAWG Structural Variation Working Group, P. S. V. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Communications. 11, 1, s. 1-14 736.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    38. Udgivet

      Identification of unique and shared mitochondrial DNA mutations in neurodegeneration and cancer by single-cell mitochondrial DNA structural variation sequencing (MitoSV-seq)

      Jaberi, E., Tresse-Gommeaux, Emilie, Grønbæk, Kirsten, Weischenfeldt, Joachim Lütken & Issazadeh-Navikas, Shohreh, 2020, I: EBioMedicine. 57, s. 1-17 102868.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    39. Udgivet

      Pan-cancer analysis of whole genomes

      ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium, I. P. A. O. W. G. C., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Sidiropoulos, N., Brunak, Søren & Rodriguez Gonzalez, Francisco G, 2020, I: Nature. 578, 7793, s. 82-93 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    40. Udgivet

      Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition

      Rodriguez-Martin, B., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Zamora, J., Supek, F., Demeulemeester, J., Santamarina, M., Ju, Y. S., Temes, J., Garcia-Souto, D., Detering, H., Li, Y., Rodriguez-Castro, J., Dueso-Barroso, A., Bruzos, A. L., Dentro, S. C., Blanco, M. G., Contino, G., Ardeljan, D., Tojo, M. & 32 flere, Roberts, N. D., Zumalave, S., Edwards, P. A. W., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Puiggròs, M., Chong, Z., Chen, K., Lee, E. A., Wala, J. A., Raine, K., Butler, A., Waszak, S. M., Navarro, F. C. P., Schumacher, S. E., Monlong, J., Maura, F., Bolli, N., Bourque, G., Gerstein, M., Park, P. J., Wedge, D. C., Beroukhim, R., Torrents, D., Korbel, J. O., Martincorena, I., Fitzgerald, R. C., Van Loo, P., Kazazian, H. H., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Structural Variation Working Group, P. S. V. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Genetics. 52, 3, s. 306-319 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    41. Udgivet

      Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes

      Reyna, M. A., Haan, D., Paczkowska, M., Verbeke, L. P. C., Vazquez, M., Kahraman, A., Pulido-Tamayo, S., Barenboim, J., Wadi, L., Dhingra, P., Shrestha, R., Getz, G., Lawrence, M. S., Pedersen, J. S., Rubin, M. A., Wheeler, D. A., Brunak, S., Izarzugaza, J. M. G., Khurana, E., Marchal, K. & 32 flere, von Mering, C., Sahinalp, S. C., Valencia, A., Abascal, F., Amin, S. B., Bader, G. D., Bandopadhayay, P., Beroukhim, R., Bertl, J., Boroevich, K. A., Busanovich, J., Campbell, P. J., Carlevaro-Fita, J., Chakravarty, D., Chan, C. W. Y., Chen, K., Choi, J. K., Deu-Pons, J., Diamanti, K., Feuerbach, L., Fink, J. L., Fonseca, N. A., Frigola, J., Gambacorti-Passerini, C., Garsed, D. W., Gerstein, M., Larsson, E., Nielsen, M. M., Sidiropoulos, N., Weischenfeldt, Joachim Lütken, PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group, P. D. A. F. I. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Communications. 11, 1, s. 1-17 729.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    42. Udgivet

      Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes

      Li, Y., Roberts, N. D., Wala, J. A., Shapira, O., Schumacher, S. E., Kumar, K., Khurana, E., Waszak, S., Korbel, J. O., Haber, J. E., Imielinski, M., Akdemir, K. C., Alvarez, E. G., Baez-Ortega, A., Beroukhim, R., Boutros, P. C., Bowtell, D. D. L., Brors, B., Burns, K. H., Campbell, P. J. & 29 flere, Chan, K., Chen, K., Cortés-Ciriano, I., Dueso-Barroso, A., Dunford, A. J., Edwards, P. A., Estivill, X., Etemadmoghadam, D., Feuerbach, L., Fink, J. L., Frenkel-Morgenstern, M., Garsed, D. W., Gerstein, M., Gordenin, D. A., Haan, D., Haber, J. E., Hess, J. M., Hutter, B., Imielinski, M., Jones, D. T. W., Ju, Y. S., Kazanov, M. D., Klimczak, L. J., Koh, Y., Korbel, J. O., Kumar, K., Lee, E. A., Sidiropoulos, N. & Weischenfeldt, Joachim Lütken, 2020, I: Nature. 578, 7793, s. 112-121 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    43. Udgivet

      Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples

      Bailey, M. H., Meyerson, W. U., Dursi, L. J., Wang, L. B., Dong, G., Liang, W. W., Weerasinghe, A., Li, S., Kelso, S., Akbani, R., Anur, P., Bailey, M. H., Buchanan, A., Chiotti, K., Covington, K., Creason, A., Ding, L., Weischenfeldt, J., Brunak, S., Ding, L. & 4 flere, Favero, Francesco, MC3 Working Group, M. W. G., PCAWG novel somatic mutation calling methods working group, P. N. S. M. C. M. W. G. & PCAWG Consortium, P. C., 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 4748.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    44. 2019
    45. Udgivet

      Regulation of ETAA1-mediated ATR activation couples DNA replication fidelity and genome stability

      Achuthankutty, D., Thakur, R. S., Haahr, Peter Thorlund, Hoffmann, Saskia, Drainas, A. P., Bizard, A. H., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Hickson, Ian David & Mailand, Niels, 2019, I: The Journal of Cell Biology. 218, 12, 11 s., 3943.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    46. Udgivet

      Response to olaparib in a PALB2 germline mutated prostate cancer and genetic events associated with resistance

      Horak, P., Weischenfeldt, J., von Amsberg, G., Beyer, B., Schütte, A., Uhrig, S., Gieldon, L., Klink, B., Feuerbach, L., Hübschmann, D., Kreutzfeldt, S., Heining, C., Maier, S., Hutter, B., Penzel, R., Schlesner, M., Eils, R., Sauter, G., Stenzinger, A., Brors, B. & 4 flere, Schröck, E., Glimm, H., Fröhling, S. & Schlomm, T., 2019, I: Cold Spring Harbor molecular case studies. 5, 2, s. 1-9 a003657.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    47. 2018
    48. Udgivet

      Molecular Evolution of Early-Onset Prostate Cancer Identifies Molecular Risk Markers and Clinical Trajectories

      Gerhauser, C., Favero, F., Risch, T., Simon, R., Feuerbach, L., Assenov, Y., Heckmann, D., Sidiropoulos, N., Waszak, S. M., Hübschmann, D., Urbanucci, A., Girma, E. G., Kuryshev, V., Klimczak, L. J., Saini, N., Stütz, A. M., Weichenhan, D., Böttcher, L. M., Toth, R., Hendriksen, J. D. & 35 flere, Koop, C., Lutsik, P., Matzk, S., Warnatz, H. J., Amstislavskiy, V., Feuerstein, C., Raeder, B., Bogatyrova, O., Schmitz, E. M., Hube-Magg, C., Kluth, M., Huland, H., Graefen, M., Lawerenz, C., Henry, G. H., Yamaguchi, T. N., Malewska, A., Meiners, J., Schilling, D., Reisinger, E., Eils, R., Schlesner, M., Strand, D. W., Bristow, R. G., Boutros, P. C., von Kalle, C., Gordenin, D., Sültmann, H., Brors, B., Sauter, G., Plass, C., Yaspo, M. L., Korbel, J. O., Schlomm, T. & Weischenfeldt, Joachim Lütken, 2018, I: Cancer Cell. 34, 6, s. 996-1011.e8 24 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    49. Udgivet

      Spectrum and prevalence of genetic predisposition in medulloblastoma: a retrospective genetic study and prospective validation in a clinical trial cohort

      Waszak, S. M., Northcott, P. A., Buchhalter, I., Robinson, G. W., Sutter, C., Groebner, S., Grund, K. B., Brugières, L., Jones, D. T. W., Pajtler, K. W., Morrissy, A. S., Kool, M., Sturm, D., Chavez, L., Ernst, A., Brabetz, S., Hain, M., Zichner, T., Segura-Wang, M., Weischenfeldt, J. & 67 flere, Rausch, T., Mardin, B. R., Zhou, X., Baciu, C., Lawerenz, C., Chan, J. A., Varlet, P., Guerrini-Rousseau, L., Fults, D. W., Grajkowska, W., Hauser, P., Jabado, N., Ra, Y. S., Zitterbart, K., Shringarpure, S. S., De La Vega, F. M., Bustamante, C. D., Ng, H. K., Perry, A., MacDonald, T. J., Hernáiz Driever, P., Bendel, A. E., Bowers, D. C., McCowage, G., Chintagumpala, M. M., Cohn, R., Hassall, T., Fleischhack, G., Eggen, T., Wesenberg, F., Feychting, M., Lannering, B., Schüz, J., Johansen, Christoffer, Andersen, T. V., Röösli, M., Kuehni, C. E., Grotzer, M., Kjaerheim, K., Monoranu, C. M., Archer, T. C., Duke, E., Pomeroy, S. L., Shelagh, R., Frank, S., Sumerauer, D., Scheurlen, W., Ryzhova, M. V., Milde, T., Kratz, C. P., Samuel, D., Zhang, J., Solomon, D. A., Marra, M., Eils, R., Bartram, C. R., von Hoff, K., Rutkowski, S., Ramaswamy, V., Gilbertson, R. J., Korshunov, A., Taylor, M. D., Lichter, P., Malkin, D., Gajjar, A., Korbel, J. O. & Pfister, S. M., 2018, I: The Lancet Oncology. 19, 6, s. 785-798 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    50. Udgivet

      SvABA: genome-wide detection of structural variants and indels by local assembly

      Wala, J. A., Bandopadhayay, P., Greenwald, N. F., O'Rourke, R., Sharpe, T., Stewart, C., Schumacher, S., Li, Y., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Yao, X., Nusbaum, C., Campbell, P., Getz, G., Meyerson, M., Zhang, C., Imielinski, M. & Beroukhim, R., 2018, I: Genome Research. 28, 4, s. 581-591 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    51. Udgivet

      The landscape of genomic alterations across childhood cancers

      ICGC PedBrain-Seq Project, I. P. P., 2018, I: Nature. 555, 7696, s. 321-327 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    52. 2017

    53. Deletion lengthening at chromosomes 6q and 16q targets multiple tumor suppressor genes and is associated with an increasingly poor prognosis in prostate cancer

      Kluth, M., Jung, S., Habib, O., Eshagzaiy, M., Heinl, A., Amschler, N., Masser, S., Mader, M., Runte, F., Barow, P., Frogh, S., Omari, J., Möller-Koop, C., Hube-Magg, C., Weischenfeldt, J., Korbel, J., Steurer, S., Krech, T., Huland, H., Graefen, M. & 4 flere, Minner, S., Sauter, G., Schlomm, T. & Simon, R., 12 dec. 2017, I: OncoTarget. 8, 65, s. 108923-108935 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    54. Udgivet

      Mitochondrial mutations drive prostate cancer aggression

      Hopkins, J. F., Sabelnykova, V. Y., Weischenfeldt, J., Simon, R., Aguiar, J. A., Alkallas, R., Heisler, L. E., Zhang, J., Watson, J. D., Chua, M. L. K., Fraser, M., Favero, F., Lawerenz, C., Plass, C., Sauter, G., McPherson, J. D., Van Der Kwast, T., Korbel, J., Schlomm, T., Bristow, R. G. & 1 flere, Boutros, P. C., 1 dec. 2017, I: Nature Communications. 8, 1, 8 s., 656.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    55. Udgivet

      Genomes of early onset prostate cancer

      Weischenfeldt, Joachim Lütken & Korbel, J. O., 1 sep. 2017, I: Current Opinion in Urology. 27, 5, s. 481-487 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    56. Udgivet

      The whole-genome landscape of medulloblastoma subtypes

      Northcott, P. A., Buchhalter, I., Morrissy, A. S., Hovestadt, V., Weischenfeldt, J., Ehrenberger, T., Gröbner, S., Segura-Wang, M., Zichner, T., Rudneva, V. A., Warnatz, H. J., Sidiropoulos, N., Phillips, A. H., Schumacher, S., Kleinheinz, K., Waszak, S. M., Erkek, S., Jones, D. T. W., Worst, B. C., Kool, M. & 67 flere, Zapatka, M., Jäger, N., Chavez, L., Hutter, B., Bieg, M., Paramasivam, N., Heinold, M., Gu, Z., Ishaque, N., Jäger-Schmidt, C., Imbusch, C. D., Jugold, A., Hübschmann, D., Risch, T., Amstislavskiy, V., Gonzalez, F. G. R., Weber, U. D., Wolf, S., Robinson, G. W., Zhou, X., Wu, G., Finkelstein, D., Liu, Y., Cavalli, F. M. G., Luu, B., Ramaswamy, V., Wu, X., Koster, J., Ryzhova, M., Cho, Y. J., Pomeroy, S. L., Herold-Mende, C., Schuhmann, M., Ebinger, M., Liau, L. M., Mora, J., McLendon, R. E., Jabado, N., Kumabe, T., Chuah, E., Ma, Y., Moore, R. A., Mungall, A. J., Mungall, K. L., Thiessen, N., Tse, K., Wong, T., Jones, S. J. M., Witt, O., Milde, T., Von Deimling, A., Capper, D., Korshunov, A., Yaspo, M. L., Kriwacki, R., Gajjar, A., Zhang, J., Beroukhim, R., Fraenkel, E., Korbel, J. O., Brors, B., Schlesner, M., Eils, R., Marra, M. A., Pfister, S. M., Taylor, M. D. & Lichter, P., 19 jul. 2017, I: Nature. 547, 7663, s. 311-317 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    57. Udgivet

      Pan-cancer analysis of somatic copy-number alterations implicates IRS4 and IGF2 in enhancer hijacking

      Weischenfeldt, J. L., Dubash, T., Drainas, A. P., Mardin, B. R., Chen, Y., Stütz, A. M., Waszak, S. M., Bosco, G., Halvorsen, A. R., Raeder, B., Efthymiopoulos, T., Erkek, S., Siegl, C., Brenner, H., Brustugun, O. T., Dieter, S. M., Northcott, P. A., Petersen, I., Pfister, S. M., Schneider, M. & 12 flere, Solberg, S. K., Thunissen, E., Weichert, W., Zichner, T., Thomas, R., Peifer, M., Helland, A., Ball, C. R., Jechlinger, M., Sotillo, R., Glimm, H. & Korbel, J. O., 2017, I: Nature Genetics. 49, 1, s. 65-74 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    58. 2016

    59. Heterogeneity of ERG expression in prostate cancer: a large section mapping study of entire prostatectomy specimens from 125 patients

      Tsourlakis, M., Stender, A., Quaas, A., Kluth, M., Wittmer, C., Haese, A., Graefen, M., Steurer, S., Simon, R., Korbel, J., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Huland, H., Sauter, G., Schlomm, T. & Minner, S., 17 aug. 2016, I: B M C Cancer. 16, s. 641

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    60. Immortalization capacity of HPV types is inversely related to chromosomal instability

      Schütze, D. M., Krijgsman, O., Snijders, P. J. F., Ylstra, B., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Mardin, B. R., Stütz, A. M., Korbel, J. O., de Winter, J. P., Meijer, C. J. L. M., Quint, W. G. V., Bosch, L., Wilting, S. M. & Steenbergen, R. D. M., 14 mar. 2016, I: OncoTarget. 7, 25, s. 37608-37621 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    61. 2015

    62. The Aging Prostate Is Never "Normal": Implications from the Genomic Characterization of Multifocal Prostate Cancers

      Schlomm, T., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Korbel, J. & Sauter, G., sep. 2015, I: European Urology (Italian Edition). 68, 3, s. 348-50 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    63. Pediatric T-lymphoblastic leukemia evolves into relapse by clonal selection, acquisition of mutations and promoter hypomethylation

      Kunz, J. B., Rausch, T., Bandapalli, O. R., Eilers, J., Pechanska, P., Schuessele, S., Assenov, Y., Stütz, A. M., Kirschner-Schwabe, R., Hof, J., Eckert, C., von Stackelberg, A., Schrappe, M., Stanulla, M., Koehler, R., Avigad, S., Elitzur, S., Handgretinger, R., Benes, V., Weischenfeldt, J. & 3 flere, Korbel, J. O., Muckenthaler, M. U. & Kulozik, A. E., 20 aug. 2015, I: Haematologica. s. 1442-1450 8 s., 100.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    64. Prevalence of chromosomal rearrangements involving non-ETS genes in prostate cancer

      Kluth, M., Galal, R., Krohn, A., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Tsourlakis, C., Paustian, L., Ahrary, R., Ahmed, M., Scherzai, S., Meyer, A., Sirma, H., Korbel, J., Sauter, G., Schlomm, T., Simon, R. & Minner, S., apr. 2015, I: International Journal of Oncology. 46, 4, s. 1637-42 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    65. A cell-based model system links chromothripsis with hyperploidy

      Mardin, B. R., Drainas, A. P., Waszak, S. M., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Isokane, M., Stütz, A. M., Raeder, B., Efthymiopoulos, T., Buccitelli, C., Segura-Wang, M., Northcott, P., Pfister, S. M., Lichter, P., Ellenberg, J. & Korbel, J. O., 2015, I: Molecular Systems Biology. 11, 9, s. 828

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    66. 2014

    67. TMPRSS2-ERG fusions are strongly linked to young patient age in low-grade prostate cancer

      Steurer, S., Mayer, P. S., Adam, M., Krohn, A., Koop, C., Ospina-Klinck, D., Tehrani, A. A., Simon, R., Tennstedt, P., Graefen, M., Wittmer, C., Brors, B., Plass, C., Korbel, J., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Sauter, G., Huland, H., Tsourlakis, M. C., Minner, S. & Schlomm, T., dec. 2014, I: European Urology (Italian Edition). 66, 6, s. 978-81 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    68. Intratumor DNA methylation heterogeneity reflects clonal evolution in aggressive prostate cancer

      Brocks, D., Assenov, Y., Minner, S., Bogatyrova, O., Simon, R., Koop, C., Oakes, C., Zucknick, M., Lipka, D. B., Weischenfeldt, J., Feuerbach, L., Cowper-Sal Lari, R., Lupien, M., Brors, B., Korbel, J., Schlomm, T., Tanay, A., Sauter, G., Gerhäuser, C., Plass, C. & 1 flere, ICGC Early Onset Prostate Cancer Project, I. E. O. P. C. P., 7 aug. 2014, I: Cell Reports. 8, 3, s. 798-806 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    69. 2013

    70. Integrative genomic analyses reveal an androgen-driven somatic alteration landscape in early-onset prostate cancer

      Weischenfeldt, J., Simon, R., Feuerbach, L., Schlangen, K., Weichenhan, D., Minner, S., Wuttig, D., Warnatz, H-J., Stehr, H., Rausch, T., Jäger, N., Gu, L., Bogatyrova, O., Stütz, A. M., Claus, R., Eils, J., Eils, R., Gerhäuser, C., Huang, P-H., Hutter, B. & 40 flere, Kabbe, R., Lawerenz, C., Radomski, S., Bartholomae, C. C., Fälth, M., Gade, S., Schmidt, M., Amschler, N., Haß, T., Galal, R., Gjoni, J., Kuner, R., Baer, C., Masser, S., von Kalle, C., Zichner, T., Benes, V., Raeder, B., Mader, M., Amstislavskiy, V., Avci, M., Lehrach, H., Parkhomchuk, D., Sultan, M., Burkhardt, L., Graefen, M., Huland, H., Kluth, M., Krohn, A., Sirma, H., Stumm, L., Steurer, S., Grupp, K., Sültmann, H., Sauter, G., Plass, C., Brors, B., Yaspo, M., Korbel, J. O. & Schlomm, T., 11 feb. 2013, I: Cancer Cell. 23, 2, s. 159-70 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    71. Phenotypic impact of genomic structural variation: insights from and for human disease

      Weischenfeldt, Joachim Lütken, Symmons, O., Spitz, F. & Korbel, J. O., feb. 2013, I: Nature Reviews. Genetics. 14, 2, s. 125-38 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    72. 2012

    73. Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma

      Jones, D. T. W., Jäger, N., Kool, M., Zichner, T., Hutter, B., Sultan, M., Cho, Y-J., Pugh, T. J., Hovestadt, V., Stütz, A. M., Rausch, T., Warnatz, H-J., Ryzhova, M., Bender, S., Sturm, D., Pleier, S., Cin, H., Pfaff, E., Sieber, L., Wittmann, A. & 70 flere, Remke, M., Witt, H., Hutter, S., Tzaridis, T., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Raeder, B., Avci, M., Amstislavskiy, V., Zapatka, M., Weber, U. D., Wang, Q., Lasitschka, B., Bartholomae, C. C., Schmidt, M., von Kalle, C., Ast, V., Lawerenz, C., Eils, J., Kabbe, R., Benes, V., van Sluis, P., Koster, J., Volckmann, R., Shih, D., Betts, M. J., Russell, R. B., Coco, S., Tonini, G. P., Schüller, U., Hans, V., Graf, N., Kim, Y., Monoranu, C., Roggendorf, W., Unterberg, A., Herold-Mende, C., Milde, T., Kulozik, A. E., von Deimling, A., Witt, O., Maass, E., Rössler, J., Ebinger, M., Schuhmann, M. U., Frühwald, M. C., Hasselblatt, M., Jabado, N., Rutkowski, S., von Bueren, A. O., Williamson, D., Clifford, S. C., McCabe, M. G., Collins, V. P., Wolf, S., Wiemann, S., Lehrach, H., Brors, B., Scheurlen, W., Felsberg, J., Reifenberger, G., Northcott, P. A., Taylor, M. D., Meyerson, M., Pomeroy, S. L., Yaspo, M., Korbel, J. O., Korshunov, A., Eils, R., Pfister, S. M. & Lichter, P., 2 aug. 2012, I: Nature. 488, 7409, s. 100-5 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    74. Genome sequencing of pediatric medulloblastoma links catastrophic DNA rearrangements with TP53 mutations

      Rausch, T., Jones, D. T. W., Zapatka, M., Stütz, A. M., Zichner, T., Weischenfeldt, J., Jäger, N., Remke, M., Shih, D., Northcott, P. A., Pfaff, E., Tica, J., Wang, Q., Massimi, L., Witt, H., Bender, S., Pleier, S., Cin, H., Hawkins, C., Beck, C. & 31 flere, von Deimling, A., Hans, V., Brors, B., Eils, R., Scheurlen, W., Blake, J., Benes, V., Kulozik, A. E., Witt, O., Martin, D., Zhang, C., Porat, R., Merino, D. M., Wasserman, J., Jabado, N., Fontebasso, A., Bullinger, L., Rücker, F. G., Döhner, K., Döhner, H., Koster, J., Molenaar, J. J., Versteeg, R., Kool, M., Tabori, U., Malkin, D., Korshunov, A., Taylor, M. D., Lichter, P., Pfister, S. M. & Korbel, J. O., 20 jan. 2012, I: Cell. 148, 1-2, s. 59-71 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    75. Udgivet

      Mammalian tissues defective in nonsense-mediated mRNA decay display highly aberrant splicing patterns

      Weischenfeldt, Joachim Lütken, Waage, J. E., Tian, G., Zhao, J., Damgaard, I., Jakobsen, J. S., Kristiansen, Karsten, Krogh, Anders, Wang, J. & Porse, Bo Torben, 2012, I: Genome Biology (Online Edition). 13, 5, 19 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    76. 2010
    77. Udgivet

      UPF2 is a critical regulator of liver development, function and regeneration

      Thoren, L. A., Nørgaard, G. A., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Waage, J., Jakobsen, J. S., Damgaard, I., Bergström, F. C., Blom, A. M., Borup, R., Bisgaard, Hanne Cathrine & Porse, Bo Torben, 2010, I: PLoS ONE. 5, 7, s. e11650

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    78. 2008
    79. Udgivet

      Bone Marrow-derived Macrophages (BMMs): Isolation and applications.

      Weischenfeldt, Joachim Lütken & Porse, Bo Torben, 2008, I: Cold Spring Harbor Protocols.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    80. Udgivet

      NMD is essential for hematopoietic stem and progenitor cells and for eliminating by-products of programmed DNA rearrangements.

      Weischenfeldt, Joachim Lütken, Damgaard, I., Bryder, D., Theilgaard-Mønch, Kim, Thoren, L. A., Nielsen, F. C., Jacobsen, S. E. W., Nerlov, C. & Porse, Bo Torben, 2008, I: Genes & Development. 22, 10, s. 1381-96 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    81. 2006

    82. Probing the role of Nonsense-mediated mRNA decay in the mammalian organism and cell.

      Weischenfeldt, Joachim Lütken, 2006

      Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

    83. 2005
    84. Udgivet

      Messenger RNA surveillance: neutralizing natural nonsense.

      Weischenfeldt, Joachim Lütken, Lykke-Andersen, J. & Porse, Bo Torben, 2005, I: Current Biology. 15, 14, s. R559-62

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    85. 2004

    86. Comparative analysis of different vaccine constructs expressing defined antigens from Mycobacterium tuberculosis.

      Doherty, T. M., Olsen, A. W., Weischenfeldt, Joachim Lütken, Huygen, K., D'Souza, S., Kondratieva, T. K., Yeremeev, V. V., Apt, A. S., Raupach, B., Grode, L., Kaufmann, S. & Andersen, P., 2004, I: Journal of Infectious Diseases. 190, 12, s. 2146-53 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    ID: 3997200