thw266 KU

thw266 KU

Professor, Adjungeret professor

Medlem af:


    1. Udgivet

      Progressive Cactus is a multiple-genome aligner for the thousand-genome era

      Armstrong, J., Hickey, G., Diekhans, M., Fiddes, I. T., Novak, A. M., Deran, A., Fang, Q., Xie, D., Feng, S., Stiller, J., Genereux, D., Johnson, J., Marinescu, V. D., Alföldi, J., Harris, R. S., Lindblad-Toh, K., Haussler, D., Karlsson, E., Jarvis, E. D., Zhang, G. & 1 flere, Paten, B., 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 246-251

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    2. Udgivet

      RES-Scanner: a software package for genome-wide identification of RNA-editing sites

      Wang, Z., Lian, J., Li, Q., Zhang, P., Zhou, Y., Zhan, X. & KU, thw266, 2016, I: GigaScience. 5, 9 s., 37.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      Rapid loss of endogenous DNA in pig bone buried in five different environments

      Eriksen, A. M. H., Matthiesen, H., Kontopoulos, I., Gregory, D., Snoeck, C., KU, thw266, Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Archaeometry. 62, 4, s. 827-846 20 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Reciprocal genomic evolution in the ant-fungus agricultural symbiosis

      Nygaard, S., Hu, H., Li, C., Schiøtt, M., Chen, Z., Yang, Z., Xie, Q., Ma, C., Deng, Y., Dikow, R. B., Rabeling, C., Nash, David Richard, Wcislo, W. T., Brady, S. G., Schultz, T. R., KU, thw266 & Boomsma, Jacobus J., 2016, I: Nature Communications. 7, 9 s., 12233.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviours

      Kukekova, A. V., Johnson, J. L., Xiang, X., Feng, S., Liu, S., Rando, H. M., Kharlamova, A. V., Herbeck, Y., Serdyukova, N. A., Xiong, Z., Beklemischeva, V., Koepfli, K-P., Gulevich, R. G., Vladimirova, A. V., Hekman, J. P., Perelman, P. L., Graphodatsky, A. S., O'Brien, S. J., Wang, X., Clark, A. G. & 3 flere, Acland, G. M., Trut, L. N. & KU, thw266, 2018, I: Nature Ecology & Evolution. 2, 9, s. 1479-1491

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      Reference genome of wild goat (capra aegagrus) and sequencing of goat breeds provide insight into genic basis of goat domestication

      Dong, Y., Zhang, X., Xie, M., Arefnezhad, B., Wang, Z., Wang, W., Feng, S., Huang, G., Guan, R., Shen, W., Bunch, R., McCulloch, R., Li, Q., Li, B., KU, thw266, Xu, X., Kijas, J. W., Salekdeh, G. H., Wang, W. & Jiang, Y., 2015, I: B M C Genomics. 16, 11 s., 431.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Reference-assisted chromosome assembly

      Kim, J., Larkin, D. M., Cai, Q., Asan, Zhang, Y., Ge, R., Auvil, L., Capitanu, B., KU, thw266, Lewin, H. A. & Ma, J., 2013, I: PNAS. 110, 5, s. 1785-1790 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      Relaxed selection underlies genome erosion in socially parasitic ant species

      Schrader, Lukas, Pan, H., Bollazzi, M., Schiøtt, M., Larabee, F. J., Bi, X., Deng, Y., KU, thw266, Boomsma, Jacobus J. & Rabeling, C., 2021, I: Nature Communications. 12, 13 s., 2918.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Response of an Afro-Palearctic bird migrant to glaciation cycles

      Thorup, Kasper, Pedersen, L., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Naimi, B., Nogues, David Bravo, Krapp, M., Manica, A., Willemoes, M., Sjöberg, Sissel, Feng, S., Chen, G., Rey de la Iglesia, Alba, Campos, P. F., Beyer, R., Araújo, M. B., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Tøttrup, Anders P. & Rahbek, Carsten, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 52, 8 s., e2023836118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Response to Comment on “Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds”

      Cracraft, J., Houde, P., Ho, S. Y. W., Mindell, D. P., Fjeldså, Jon, Lindow, Bent Erik Kramer, Edwards, S. V., Rahbek, Carsten, Mirarab, S., Warnow, T., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Braun, E. L. & Jarvis, E. D., 2015, I: Science. 349, 6255, s. 1460b 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Sensory Rewiring in an Echolocator: Genome-Wide Modification of Retinogenic and Auditory Genes in the Bat Myotis davidii

      Hudson, N. J., Baker, M. L., Hart, N. S., Wynne, J. W., Gu, Q., Huang, Z., KU, thw266, Ingham, A. B., Wang, L. & Reverter, A., 2014, I: G3: Genes, Genomes, Genetics. 4, 10, s. 1825-1835 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Sequencing, de novo assembling, and annotating the genome of the endangered Chinese crocodile lizard Shinisaurus crocodilurus

      Gao, J., Li, Q., Wang, Z., Zhou, Y., Martelli, P., Li, F., Xiong, Z., Wang, J., Yang, H. & KU, thw266, jul. 2017, I: GigaScience. 6, 7, s. 1-6 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      Species-specific traits mediate avian demographic responses under past climate change

      Germain, Ryan Ross, Feng, S., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Nogues, David Bravo, 2022, bioRxiv, 24 s.

      Publikation: Working paperPreprintForskning

    14. Udgivet

      Species-specific traits mediate avian demographic responses under past climate change

      Germain, Ryan Ross, Feng, S., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, KU, thw266 & Nogues, David Bravo, 2023, I: Nature Ecology and Evolution. 7, 6, s. 862-872 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Standards recommendations for the Earth BioGenome Project

      Lawniczak, M. K. N., Durbin, R., Flicek, P., Lindblad-Toh, K., Wei, X., Archibald, J. M., Baker, W. J., Belov, K., Blaxter, M. L., Bonet, T. M., Childers, A. K., Coddington, J. A., Crandall, K. A., Crawford, A. J., Davey, R. P., Palma, F. D., Fang, Q., Haerty, W., Hall, N., Hoff, K. J. & 25 flere, Howe, K., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Johnson, R. N., Kersey, P. J., Liu, X., Lopez, J. V., Myers, E. W., Pettersson, O. V., Phillippy, A. M., Poelchau, M. F., Pruitt, K. D., Rhie, A., Castilla-Rubio, J. C., Sahu, S. K., Salmon, N. A., Soltis, P. S., Swarbreck, D., Thibaud-Nissen, F., Wang, S., Wegrzyn, J. L., KU, thw266, Zhang, H., Lewin, H. A. & Richards, S., 2022, I: PNAS. 119, 4, 8 s., e2115639118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      Studying mutation rate evolution in primates - a need for systematic comparison of computational pipelines

      Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Schierup, M. H. & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 10, 4 s., giab072.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      Temporal dynamics of avian populations during pleistocene revealed by whole-genome sequences

      Nadachowska-Brzyska, K., Li, C., Smeds, L., KU, thw266 & Ellegren, H., 2015, I: Current Biology. 25, 10, s. 1375-1380 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      Temporal genomic evolution of bird sex chromosomes

      Wang, Z., Zhang, J., Yang, W., An, N., Zhang, P., KU, thw266 & Zhou, Q., 2014, I: B M C Evolutionary Biology. 14, 12 s., 250.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      Testing cophylogeny between coral reef invertebrates and their bacterial and archaeal symbionts

      O'Brien, P. A., Andreakis, N., Tan, S., Miller, D. J., Webster, N. S., KU, thw266 & Bourne, D. G., 2021, I: Molecular Ecology. 30, 15, s. 3768-3782 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      The Earth BioGenome Project 2020: Starting the clock

      Lewin, H. A., Richards, S., Aiden, E. L., Allende, M. L., Archibald, J. M., Bálint, M., Barker, K. B., Baumgartner, B., Belov, K., Bertorelle, G., Blaxter, M. L., Cai, J., Caperello, N. D., Carlson, K., Castilla-Rubio, J. C., Chaw, S. M., Chen, L., Childers, A. K., Coddington, J. A., Conde, D. A. & 65 flere, Corominas, M., Crandall, K. A., Crawford, A. J., DiPalma, F., Durbin, R., Ebenezer, T. E., Edwards, S. V., Fedrigo, O., Flicek, P., Formenti, G., Gibbs, R. A., Gilbert, M Thomas P, Goldstein, M. M., Graves, J. M., Greely, H. T., Grigoriev, I. V., Hackett, K. J., Hall, N., Haussler, D., Helgen, K. M., Hogg, C. J., Isobe, S., Jakobsen, K. S., Janke, A., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Jones, S. J. M., Karlsson, E. K., Kersey, P. J., Kim, J. H., Kress, W. J., Kuraku, S., Lawniczak, M. K. N., Leebens-Mack, J. H., Li, X., Lindblad-Toh, K., Liu, X., Lopez, J. V., Marques-Bonet, T., Mazard, S., Mazet, J. A. K., Mazzoni, C. J., Myers, E. W., O’Neill, R. J., Paez, S., Park, H., Robinson, G. E., Roquet, C., Ryder, O. A., Sabir, J. S. M., Shaffer, H. B., Shank, T. M., Sherkow, J. S., Soltis, P. S., Tang, B., Tedersoo, L., Uliano-Silva, M., Wang, K., Wei, X., Wetzer, R., Wilson, J. L., Xu, X., Yang, H., Yoder, A. D. & KU, thw266, 2022, I: PNAS. 119, 4, 7 s., e2115635118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    21. Udgivet

      The Genome 10K Project: a way forward

      Koepfli, K-P., Paten, B., O'Brien, S. J., Antunes, A., Belov, K., Bustamante, C., Castoe, T. A., Clawson, H., Crawford, A. J., Diekhans, M., Distel, D., Durbin, R., Earl, D., Fujita, M. K., Gamble, T., Georges, A., Gemmell, N., Gilbert, M. T. P., Graves, J. M., Green, R. E. & 25 flere, Hickey, G., Jarvis, E. D., Johnson, W., Komissarov, A., Korf, I., Kuhn, R., Larkin, D. M., Lewin, H., Lopez, J. V., Ma, J., Marques-Bonet, T., Miller, W., Murphy, R., Pevzner, P., Shapiro, B., Steiner, C., Tamazian, G., Venkatesh, B., Wang, J., Wayne, R., Wiley, E., Yang, H., KU, thw266, Haussler, D. & Ryder, O., 2015, I: Annual Review of Animal Biosciences. 3, s. 57-111 55 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    22. The Genome of Dendrobium officinale Illuminates the Biology of the Important Traditional Chinese Orchid Herb

      Yan, L., Wang, X., Liu, H., Tian, Y., Lian, J., Yang, R., Hao, S., Wang, X., Yang, S., Li, Q., Qi, S., Kui, L., Okpekum, M., Ma, X., Zhang, J., Ding, Z., KU, thw266, Wang, W., Dong, Y. & Sheng, J., 2015, I: Molecular Plant. 8, 6, s. 922-934 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Udgivet

      The Genomic Footprints of the Fall and Recovery of the Crested Ibis

      Feng, S., Fang, Q., Barnett, R., Li, C., Han, S., Kuhlwilm, M., Zhou, L., Pan, H., Deng, Y., Chen, G., Gamauf, A., Woog, F., Prys-Jones, R., Marques-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & KU, thw266, 2019, I: Current Biology. 29, 2, s. 340-349, e1-e7

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. Udgivet

      The Global Ant Genomics Alliance (GAGA)

      Boomsma, Jacobus J., Brady, S. G., Dunn, Rob, Gadau, J., Heinze, J., Keller, L., Moreau, C. S., Sanders, N., Schrader, Lukas, Schultz, T. R., Sundström, L., Ward, P. S., Wcislo, W. T. & KU, thw266, okt. 2017, I: Myrmecological News. 25, s. 61-66 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      The Mutationathon highlights the importance of reaching standardization in estimates of pedigree-based germline mutation rates

      Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Turner, T. N., Versoza, C. J., Wang, R. J., Price, A. L., Armstrong, E., Riera, M., Carlson, J., Chen, Hwei-Yen, Hahn, M. W., Harris, K., Kleppe, A. S., López-Nandam, E. H., Moorjani, P., Pfeifer, S. P., Tiley, G. P., Yoder, A. D., KU, thw266 & Schierup, M. H., 2022, I: eLife. 11, 28 s., e73577.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    ID: 40294134