Matthias Mann
Professor, forskningschef, Professor
- Udgivet
A new parallel high-pressure packing system enables rapid multiplexed production of capillary columns
Müller-Reif, J. B., Hansen, F. M., Schweizer, L., Treit, P. V., Geyer, P. E. & Mann, Matthias, 2021, I: Molecular and Cellular Proteomics. 20, 10 s., 100082.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A proteomic atlas of the neointima identifies novel druggable targets for preventive therapy
Wierer, M., Werner, J., Wobst, J., Kastrati, A., Cepele, G., Aherrahrou, R., Sager, H. B., Erdmann, J., Dichgans, M., Flockerzi, V., Civelek, M., Dietrich, A., Mann, Matthias, Schunkert, H. & Kessler, T., 8 apr. 2021, (E-pub ahead of print) I: European Heart Journal.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
AlphaTims: Indexing Trapped Ion Mobility Spectrometry-TOF Data for Fast and Easy Accession and Visualization
Willems, S., Voytik, E., Skowronek, P., Strauss, Maximilian & Mann, Matthias, 2021, I: Molecular and Cellular Proteomics. 20, s. 100149Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Artificial intelligence for proteomics and biomarker discovery
Mann, Matthias, Kumar, C., Zeng, W. & Strauss, M. T., 18 aug. 2021, I: Cell Systems. 12, 8, s. 759-770 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cohort profile: the MUNICH Preterm and Term Clinical study (MUNICH-PreTCl), a neonatal birth cohort with focus on prenatal and postnatal determinants of infant and childhood morbidity
Pangratz-Fuehrer, S., Genzel-Boroviczény, O., Bodensohn, W. E., Eisenburger, R., Scharpenack, J., Geyer, P. E., Müller-Reif, J. B., van Hagen, N., Müller, A. M., Jensen, Majken Karoline, Klein, C., Mann, Matthias & Nussbaum, C., 2021, I: BMJ Open. 11, 6, 13 s., e050652.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Data-independent acquisition method for ubiquitinome analysis reveals regulation of circadian biology
Hansen, F. M., Tanzer, M. C., Brüning, F., Bludau, I., Stafford, C., Schulman, B. A., Robles, M. S., Karayel, O. & Mann, Matthias, 11 jan. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, s. 254Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from a million experimental values
Meier, F., Köhler, N. D., Brunner, A. D., Wanka, J. M. H., Voytik, E., Strauss, M. T., Theis, F. J. & Mann, Matthias, 2021, I: Nature Communications. 12, 12 s., 1185.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deep muscle-proteomic analysis of freeze-dried human muscle biopsies reveals fiber type-specific adaptations to exercise training
Deshmukh, Atul Shahaji, Steenberg, D. E., Hostrup, Morten, Birk, Jesper Bratz, Larsen, Jeppe Kjærgaard, Santos, A., Kjøbsted, Rasmus, Hingst, J. R., Schéele, Camilla Charlotte Nielsen, Murgia, M., Kiens, Bente, Richter, Erik A., Mann, Matthias & Wojtaszewski, Jørgen F P, 2021, I: Nature Communications. 12, 15 s., 304.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Defining NASH from a multi-omics systems biology perspective
Niu, Lili, Sulek, K., Vasilopoulou, C. G., Santos, A., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Rasmussen, Simon, Meier, F. & Mann, Matthias, 2021, I: Journal of Clinical Medicine. 10, 20, 22 s., 4673.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Defining the RBPome of primary T helper cells to elucidate higher-order Roquin-mediated mRNA regulation
Hoefig, K. P., Reim, A., Gallus, C., Wong, E. H., Behrens, G., Conrad, C., Xu, M., Kifinger, L., Ito-Kureha, T., Defourny, K. A. Y., Geerlof, A., Mautner, J., Hauck, S. M., Baumjohann, D., Feederle, R., Mann, Matthias, Wierer, M., Glasmacher, E. & Heissmeyer, V., 1 sep. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, s. 5208Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Distinct signaling by insulin and IGF-1 receptors and their extra- and intracellular domains
Nagao, H., Cai, W., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Steger, M., Batista, T. M., Pan, H., Dreyfuss, J. M., Mann, Matthias & Kahn, C. R., 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 17, e2019474118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ethical Principles, Constraints and Opportunities in Clinical Proteomics
Porsdam Mann, Sebastian, Treit, P. V., Geyer, P. E., Omenn, G. S. & Mann, Matthias, 2021, I: Molecular and Cellular Proteomics. 20, 14 s., 100046.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
GID E3 ligase supramolecular chelate assembly configures multipronged ubiquitin targeting of an oligomeric metabolic enzyme
Sherpa, D., Chrustowicz, J., Qiao, S., Langlois, C. R., Hehl, L. A., Gottemukkala, K. V., Hansen, F. M., Karayel, O., von Gronau, S., Prabu, J. R., Mann, Matthias, Alpi, A. F. & Schulman, B. A., 22 apr. 2021, (E-pub ahead of print) I: Molecular Cell.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hepatocyte-specific perturbation of NAD+ biosynthetic pathways in mice induces reversible nonalcoholic steatohepatitis-like phenotypes
Dall, M., Hassing, Anna Skab, Niu, Lili, Nielsen, Thomas Svava, Ingerslev, L. R., Sulek, K., Trammell, Sam, Gillum, M. P., Barrès, Romain, Larsen, Steen, Poulsen, Steen Seier, Mann, Matthias, Ørskov, Cathrine & Treebak, Jonas Thue, 2021, I: Journal of Biological Chemistry. 297, 6, 26 s., 101388.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High-resolution serum proteome trajectories in COVID-19 reveal patient-specific seroconversion
Geyer, P. E., Arend, F. M., Doll, S., Louiset, M., Virreira Winter, S., Müller-Reif, J. B., Torun, F. M., Weigand, M., Eichhorn, P., Bruegel, M., Strauss, M. T., Holdt, L. M., Mann, Matthias & Teupser, D., 2021, I: EMBO Molecular Medicine. 13, 8, 16 s., e14167.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hippocampal disruptions of synaptic and astrocyte metabolism are primary events of early amyloid pathology in the 5xFAD mouse model of Alzheimer's disease
Andersen, Jens Velde, Skotte, Niels Henning, Christensen, S. K., Polli, F. S., Shabani, M., Markussen, K. H., Haukedal, H., Westi, Emil Winther, Diaz-delCastillo, M., Sun, R. C., Kohlmeier, Kristi Anne, Schousboe, Arne, Gentry, M. S., Tanila, H., Freude, Kristine, Aldana, Blanca, Mann, Matthias & Waagepetersen, Helle S., 2021, I: Cell Death & Disease. 12, 11, 13 s., 954 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Homology-directed repair protects the replicating genome from metabolic assaults
Somyajit, K., Spies, J., Coscia, F., Kirik, U., Rask, M., Lee, J., Neelsen, K. J., Mund, Andreas, Jensen, Lars Juhl, Paull, T. T., Mann, Matthias & Lukas, Jiri, 2021, I: Developmental Cell. 56, 4, s. 461-477.e7Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Identification of covalent modifications regulating immune signaling complex composition and phenotype
Frauenstein, A., Ebner, S., Hansen, F. M., Sinha, A., Phulphagar, K., Swatek, K., Hornburg, D., Mann, Matthias & Meissner, F., jul. 2021, I: Molecular Systems Biology. 17, 7, s. e10125Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Identification of the transcription factor MAZ as a regulator of erythropoiesis
Deen, D., Butter, F., Daniels, D. E., Ferrer-Vicens, I., Ferguson, D. C. J., Holland, M. L., Samara, V., Sloane-Stanley, J. A., Ayyub, H., Mann, Matthias, Frayne, J., Garrick, D. & Vernimmen, D., 10 aug. 2021, I: Blood advances. 5, 15, s. 3002-3015 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Integrative analysis of cell state changes in lung fibrosis with peripheral protein biomarkers
Mayr, C. H., Simon, L. M., Leuschner, G., Ansari, M., Schniering, J., Geyer, P. E., Angelidis, I., Strunz, M., Singh, P., Kneidinger, N., Reichenberger, F., Silbernagel, E., Böhm, S., Adler, H., Lindner, M., Maurer, B., Hilgendorff, A., Prasse, A., Behr, J., Mann, M. & 3 flere, , 2021, I: EMBO Molecular Medicine. e12871.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interaction of 7SK with the Smn complex modulates snRNP production
Ji, C., Bader, J., Ramanathan, P., Hennlein, L., Meissner, F., Jablonka, S., Mann, Matthias, Fischer, U., Sendtner, M. & Briese, M., 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 15 s., 1278.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
JAZF1, A Novel p400/TIP60/NuA4 Complex Member, Regulates H2A.Z Acetylation at Regulatory Regions
Procida, T., Friedrich, T., Jack, A. P. M., Peritore, M., Bönisch, C., Eberl, H. C., Daus, N., Kletenkov, K., Nist, A., Stiewe, T., Borggrefe, T., Mann, Matthias, Bartkuhn, M. & Hake, S. B., 12 jan. 2021, I: International Journal of Molecular Sciences. 22, 2Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Large scale discovery of coronavirus-host factor protein interaction motifs reveals SARS-CoV-2 specific mechanisms and vulnerabilities
Kruse, T., Benz, C., Garvanska, D. H., Lindqvist, R., Mihalic, F., Coscia, F., Inturi, R., Sayadi, A., Simonetti, L., Nilsson, E., Ali, M., Kliche, J., Moliner Morro, A., Mund, A., Andersson, E., McInerney, G., Mann, M., Jemth, P., Davey, N. E., Överby, A. K. & 2 flere, , 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 13 s., 6761.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Linkage-specific ubiquitin chain formation depends on a lysine hydrocarbon ruler
Liwocha, J., Krist, D. T., van der Heden van Noort, G. J., Hansen, F. M., Truong, V. H., Karayel, O., Purser, N., Houston, D., Burton, N., Bostock, M. J., Sattler, M., Mann, Matthias, Harrison, J. S., Kleiger, G., Ovaa, H. & Schulman, B. A., mar. 2021, I: Nature Chemical Biology. 17, 3, s. 272-279 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Loss of full-length hnRNP R isoform impairs DNA damage response in motoneurons by inhibiting Yb1 recruitment to chromatin
Ghanawi, H., Hennlein, L., Zare, A., Bader, J., Salehi, S., Hornburg, D., Ji, C., Sivadasan, R., Drepper, C., Meissner, F., Mann, Matthias, Jablonka, S., Briese, M. & Sendtner, M., 2021, I: Nucleic Acids Symposium Series. 49, 21, s. 12284-12305 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular Origin of Blood-based Infrared Spectroscopic Fingerprints
Voronina, L., Leonardo, C., Mueller-Reif, J. B., Geyer, P. E., Huber, M., Trubetskov, M., Kepesidis, K. V., Behr, J., Mann, Matthias, Krausz, F. & Žigman, M., 2021, I: Angewandte Chemie International Edition. 60, 31, s. 17060-17069Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular response to PARP1 inhibition in ovarian cancer cells as determined by mass spectrometry based proteomics
Franz, A., Coscia, F., Shen, C., Charaoui, L., Mann, Matthias & Sander, C., 2021, I: Journal of Ovarian Research. 14, 14 s., 140.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Multi-omics profiling of living human pancreatic islet donors reveals heterogeneous beta cell trajectories towards type 2 diabetes
Wigger, L., Barovic, M., Brunner, A-D., Marzetta, F., Schöniger, E., Mehl, F., Kipke, N., Friedland, D., Burdet, F., Kessler, C., Lesche, M., Thorens, B., Bonifacio, E., Legido-Quigley, C., Barbier Saint Hilaire, P., Delerive, P., Dahl, A., Klose, C., Gerl, M. J., Simons, K. & 7 flere, , 28 jun. 2021, (E-pub ahead of print) I: Nature Metabolism.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Multilevel proteomics reveals host perturbations by SARS-CoV-2 and SARS-CoV
Stukalov, A., Girault, V., Grass, V., Karayel, O., Bergant, V., Urban, C., Haas, D. A., Huang, Y., Oubraham, L., Wang, A., Hamad, M. S., Piras, A., Hansen, F. M., Tanzer, M. C., Paron, I., Zinzula, L., Engleitner, T., Reinecke, M., Lavacca, T. M., Ehmann, R. & 10 flere, , 12 apr. 2021, (E-pub ahead of print) I: Nature.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Phosphoproteome profiling uncovers a key role for CDKs in TNF signaling
Tanzer, M. C., Bludau, I., Stafford, C. A., Hornung, V. & Mann, Matthias, 18 okt. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, s. 6053Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasma proteomic data can contain personally identifiable, sensitive information and incidental findings
Geyer, P. E., Porsdam Mann, Sebastian, Treit, P. V. & Mann, Matthias, 2021, I: Molecular and Cellular Proteomics. 20, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein profile of fiber types in human skeletal muscle: a single-fiber proteomics study
Murgia, M., Nogara, L., Baraldo, M., Reggiani, C., Mann, Matthias & Schiaffino, S., 2021, I: Skeletal Muscle. 11, 1, 19 s., 24.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Proteomic Analysis Identifies NDUFS1 and ATP5O as Novel Markers for Survival Outcome in Prostate Cancer
Wiebringhaus, R., Pecoraro, M., Neubauer, H. A., Trachtová, K., Trimmel, B., Wieselberg, M., Pencik, J., Egger, G., Krall, C., Moriggl, R., Mann, Matthias, Hantusch, B. & Kenner, L., 30 nov. 2021, I: Cancers. 13, 23Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reply to "Quality control requirements for the correct annotation of lipidomics data"
Vasilopoulou, C. G., Sulek, K., Brunner, A., Meitei, N. S., Schweiger-Hufnagel, U., Meyer, S. W., Barsch, A., Mann, Matthias & Meier, F., 2021, I: Nature Communications. 12, 4 s., 4772.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
Signaling defects associated with insulin resistance in nondiabetic and diabetic individuals and modification by sex
Haider, N., Lebastchi, J., Jayavelu, A. K., Batista, T. M., Pan, H., Dreyfuss, J. M., Carcamo-Orive, I., Knowles, J. W., Mann, Matthias & Kahn, C. R., 1 nov. 2021, I: The Journal of Clinical Investigation. 131, 21Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The Hippo pathway controls myofibril assembly and muscle fiber growth by regulating sarcomeric gene expression
Kaya-Çopur, A., Marchiano, F., Hein, M. Y., Alpern, D., Russeil, J., Luis, N. M., Mann, Matthias, Deplancke, B., Habermann, B. H. & Schnorrer, F., 6 jan. 2021, I: eLife. 10Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The tumor suppressor kinase DAPK3 drives tumor-intrinsic immunity through the STING-IFN-β pathway
Takahashi, M., Lio, C. J., Campeau, A., Steger, M., Ay, F., Mann, Matthias, Gonzalez, D. J., Jain, M. & Sharma, S., apr. 2021, I: Nature Immunology. 22, 4, s. 485-496 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Tissue-specific modulation of gene expression in response to lowered insulin signalling in Drosophila
Tain, L. S., Sehlke, R., Meilenbrock, R. L., Leech, T., Paulitz, J., Chokkalingam, M., Nagaraj, N., Grönke, S., Fröhlich, J., Atanassov, I., Mann, Matthias, Beyer, A. & Partridge, L., 21 apr. 2021, I: eLife. 10Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Transcription Factor MAFF (MAF Basic Leucine Zipper Transcription Factor F) Regulates an Atherosclerosis Relevant Network Connecting Inflammation and Cholesterol Metabolism
von Scheidt, M., Zhao, Y., de Aguiar Vallim, T. Q., Che, N., Wierer, M., Seldin, M. M., Franzén, O., Kurt, Z., Pang, S., Bongiovanni, D., Yamamoto, M., Edwards, P. A., Ruusalepp, A., Kovacic, J. C., Mann, Matthias, Björkegren, J. L. M., Lusis, A. J., Yang, X. & Schunkert, H., 2021, I: Circulation. 143, 18, s. 1809-1823Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Trapped Ion Mobility Spectrometry (TIMS) and Parallel Accumulation - Serial Fragmentation (PASEF) in Proteomics
Meier, F., Park, M. A. & Mann, Matthias, 17 aug. 2021, (E-pub ahead of print) I: Molecular and Cellular Proteomics. s. 100138Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Urinary proteome profiling for stratifying patients with familial Parkinson’s disease
Virreira Winter, S., Karayel, O., Strauss, M. T., Padmanabhan, S., Surface, M., Merchant, K., Alcalay, R. N. & Mann, Matthias, 2021, I: EMBO Molecular Medicine. 13, 3, 19 s., e13257.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 5650809
Flest downloads
-
2009
downloads
Activation of the ATR kinase by the RPA-binding protein ETAA1
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
515
downloads
Region and cell-type resolved quantitative proteomic map of the human heart
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
498
downloads
Revisiting biomarker discovery by plasma proteomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet