Simon Rasmussen
Professor
Rasmussen Group
- Udgivet
Similar genomic patterns of clinical infective endocarditis and oral isolates of Streptococcus sanguinis and Streptococcus gordonii
Iversen, K. H., Rasmussen, L. H., Al-Nakeeb, K., Armenteros, J. J. A., Jensen, C. S., Dargis, R., Lukjancenko, O., Justesen, U. S., Moser, C., Rosenvinge, F. S., Nielsen, X. C., Christensen, J. J. & Rasmussen, Simon, 17 feb. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 11 s., 2728.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Streptococcus pseudopneumoniae: Use of whole-genome sequences to validate species identification methods
Jensen, C. S., Iversen, K. H., Dargis, R., Shewmaker, P., Rasmussen, Simon, Christensen, J. J. & Nielsen, X. C., 2021, I: Journal of Clinical Microbiology. 59, 2, 11 s., e02503-20.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Assembly and analysis of 100 full MHC haplotypes from the Danish population
Jensen, J. M., Villesen, P., Friborg, R. M., Mailund, T., Besenbacher, S., Sørensen, L. M., Petersen, B., Sibbesen, J. A., Liu, S., Skov, L., Belling, K. G., Have, C. T., Izarzugaza, J. M. G., Grosjean, M., Bork-Jensen, J., Grove, J., Als, T. D., Huang, S., Chang, Y., Xu, R. & 39 flere, , sep. 2017, I: Genome Research. 27, 9, s. 1597-1607 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stone Age “chewing gum” yields 5,700 yearold human genome and oral microbiome
Jensen, Theis Zetner Trolle, Niemann, Jonas, Iversen, K. H., Fotaki, Anna Katerina, Gopalakrishan, S., Sinding, Mikkel Holger Strander, Ellegaard, M. R., Allentoft, Morten Erik, Lanigan, Liam Thomas, Taurozzi, Alberto John, Nielsen, Sofie Holtsmark, Dee, M. W., Mortensen, M. N., Christensen, M. C., Sørensen, S. A., Collins, Matthew James, Gilbert, M Thomas P, Sikora, Martin, Rasmussen, Simon & Schroeder, Hannes, 2018, bioRxiv, 32 s.Publikation: Working paper › Preprint
- Udgivet
A 5700 year-old human genome and oral microbiome from chewed birch pitch
Jensen, T. Z. T., Niemann, J., Iversen, K. H., Fotakis, A. K., Gopalakrishnan, S., Vågene, Å. J., Pedersen, M. W., Sinding, M-H. S., Ellegaard, M. R., Allentoft, M. E., Lanigan, L. T., Taurozzi, A. J., Nielsen, S. H., Dee, M. W., Mortensen, M. N., Christensen, M. C., Sørensen, S. A., Collins, M. J., Gilbert, M. T. P., Sikora, M. & 2 flere, , 2019, I: Nature Communications. 10, 10 s., 5520.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Global within-species phylogenetics of sewage microbes suggest that local adaptation shapes geographical bacterial clustering
Jespersen, Marie Louise, Munk, P., Johansen, Joachim, Kaas, R. S., Webel, Henry, Vigre, H., Nielsen, H. B., Rasmussen, Simon & Aarestrup, F. M., 2023, I: Communications Biology . 6, 9 s., 700.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan
Johansen, Joachim, Atarashi, K., Arai, Y., Hirose, N., Sørensen, Søren Johannes, Vatanen, T., Knip, M., Honda, K., Xavier, R. J., Rasmussen, Simon & Plichta, D. R., 2023, I: Nature Microbiology. 8, s. 1064-1078 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome binning of viral entities from bulk metagenomics data
Johansen, Joachim, Plichta, D. R., Nissen, J. N., Jespersen, Marie Louise, Shah, S. A., Deng, Ling, Stokholm, Jakob, Bisgaard, H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes & Rasmussen, Simon, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 965.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
FAVA: High-quality functional association networks inferred from scRNA-seq and proteomics data
Koutrouli, Mikaela, Nastou, Katerina, Piera Líndez, Pau, Bouwmeester, R., Rasmussen, Simon, Martens, L. & Jensen, Lars Juhl, 2024, I: Bioinformatics. 40, 2, 11 s., btae010.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Re-theorising mobility and the formation of culture and language among the Corded Ware Culture in Europe: [incl. Corrigendum]
Kristiansen, K., Allentoft, Morten Erik, Frei, K. M., Iversen, Rune, Johannsen, N. N., Kroonen, Guus, Pospieszny, L., Price, T. D., Rasmussen, Simon, Sjögren, K., Sikora, Martin & Willerslev, Eske, apr. 2017, I: Antiquity. 91, 356, s. 334-347Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 204201681
Flest downloads
-
1365
downloads
Genome-scale cold stress response regulatory networks in ten Arabidopsis thaliana ecotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
608
downloads
Bifidobacterium bifidum actively changes the gene expression profile induced by Lactobacillus acidophilus in murine dendritic cells
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
433
downloads
Discovery, genotyping and characterization of structural variation and novel sequence at single nucleotide resolution from de novo genome assemblies on a population scale
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet