Tom Gilbert
Professor
- 2021
- Udgivet
Historical population declines prompted significant genomic erosion in the northern and southern white rhinoceros (Ceratotherium simum)
Sánchez-Barreiro, F., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Westbury, Michael Vincent, de Manuel, M., Margaryan, Ashot, Ciucani, M. M., Vieira, Filipe Garrett, Patramanis, Ioannis, Kalthoff, D. C., Timmons, Z., Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Ryder, O. A., KU, thw266, Marques-Bonet, T., Moodley, Y. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6355-6369 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of African swine fever virus transcription within peripheral blood mononuclear cells of acutely infected pigs
Olesen, A. S., Kodama, M., Lohse, L., Accensi, F., Rasmussen, T. B., Lazov, Christina Marie, Limborg, Morten Tønsberg, Gilbert, M Thomas P, Bøtner, A. & Belsham, Graham John, 2021, I: Viruses. 13, 11, 2333.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Kouprey (Bos sauveli) genomes unveil polytomic origin of wild Asian Bos
Sinding, M. S., Ciucani, M. M., Ramos Madrigal, Jazmin, Carmagnini, A., Rasmussen, Jacob Agerbo, Feng, S., Chen, G., Vieira, Filipe Garrett, Mattiangeli, V., Ganjoo, R. K., Larson, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Frantz, L., Gilbert, M Thomas P & Bradley, D. G., 2021, I: iScience. 24, 11, 18 s., 103226.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Leech blood-meal invertebrate-derived DNA reveals differences in Bornean mammal diversity across habitats
Drinkwater, R., Jucker, T., Potter, J. H. T., Swinfield, T., Coomes, D. A., Slade, E. M., Gilbert, M Thomas P, Lewis, O. T., Bernard, H., Struebig, M. J., Clare, E. L. & Rossiter, S. J., 2021, I: Molecular Ecology. 30, 13, s. 3299-3312 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mitochondrial genomes of Danish vertebrate species generated for the national DNA reference database, DNAmark
Margaryan, Ashot, Noer, Christina, Richter, S. R., Restrup, M. E., Bülow‐hansen, J. L., Leerhøi, Frederik, Arfaoui, Emilia Marie Rolander, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Gilbert, M Thomas P & Bohmann, Kristine, 2021, I: Environmental DNA. 3, 2, s. 472-480Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modern Siberian dog ancestry was shaped by several thousand years of Eurasian-wide trade and human dispersal
Feuerborn, T. R., Carmagnini, A., Losey, R. J., Nomokonova, T., Askeyev, A., Askeyev, I., Askeyev, O., Antipina, E. E., Appelt, M., Bachura, O. P., Beglane, F., Bradley, D. G., Daly, K. G., Gopalakrishnan, S., Gregersen, K. M., Guo, C., Gusev, A. V., Jones, C., Kosintsev, P. A., Kuzmin, Y. V. & 17 flere, , 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 39, e2100338118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular parallelisms between pigmentation in the avian iris and the integument of ectothermic vertebrates
Andrade, P., Gazda, M. A., Araújo, P. M., Afonso, S., Rasmussen, Jacob Agerbo, Marques, C. I., Lopes, R. J., Gilbert, M Thomas P & Carneiro, M., 2021, I: PLOS Genetics. 17, 2, 16 s., 1009404.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Non-invasive surveys of mammalian viruses using environmental DNA
Alfano, N., Dayaram, A., Axtner, J., Tsangaras, K., Kampmann, Marie-Louise, Mohamed, A., Wong, S. T., Gilbert, M Thomas P, Wilting, A. & Greenwood, A. D., 2021, I: Methods in Ecology and Evolution. 12, 10, s. 1941-1952Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning
Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reconsidering domestication from a process archaeology perspective
Bogaard, A., Allaby, R., Arbuckle, B. S., Bendrey, R., Crowley, S., Cucchi, T., Denham, T., Frantz, L., Fuller, D., Gilbert, M Thomas P, Karlsson, E., Manin, A., Marshall, F., Mueller, N., Peters, J., Stépanoff, C., Weide, A. & Larson, G., 2021, I: World Archaeology. 53, 1, s. 56-77 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Runs of homozygosity in killer whale genomes provide a global record of demographic histories
Foote, A. D., Hooper, R., Alexander, A., Baird, R. W., Baker, C. S., Ballance, L., Barlow, J., Brownlow, A., Collins, T., Constantine, R., Dalla Rosa, L., Davison, N. J., Durban, J. W., Esteban, R., Excoffier, L., Martin, S. L. F., Forney, K. A., Gerrodette, T., Gilbert, M. T. P., Guinet, C. & 14 flere, , 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6162-6177 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Salmon gut microbiota correlates with disease infection status: potential for monitoring health in farmed animals
Bozzi, D., Rasmussen, Jacob Agerbo, Carøe, C., Sveier, H., Nordøy, K., Gilbert, M Thomas P & Limborg, Morten Tønsberg, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 1, 17 s., 30.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genetic impact of an Ebola outbreak on a wild gorilla population
Fontsere, C., Frandsen, P., Hernandez-Rodriguez, J., Niemann, Jonas, Scharff-Olsen, Camilla Hjorth, Vallet, D., Le Gouar, P., Ménard, N., Navarro, A., Siegismund, Hans Redlef, Hvilsom, C., Gilbert, M Thomas P, Kuhlwilm, M., Hughes, D. & Marques-Bonet, T., 2021, I: BMC Genomics. 22, 12 s., 735.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genome sequence of the grey wolf, Canis lupus Linnaeus 1758
Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishnan, Shyam, Raundrup, K., Dalén, L., Threlfall, J., Gilbert, M Thomas P, Darwin Tree of Life Barcoding collective, D. T. O. L. B. C., Wellcome Sanger Institute Tree of Life programme, W. S. I. T. O. L. P., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: DNA Pipelines collective, W. S. I. S. O. D. P. C. & Tree of Life Core Informatics collective, Darwin Tree of Life Consortium, T. O. L. C. I. C. D. T. O. L. C., 2021, I: Wellcome Open Research. 6, 12 s., 310.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The germline mutational process in rhesus macaque and its implications for phylogenetic dating
Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Bakker, J., Zheng, J., Li, P., Antunes Pacheco, George, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kamilari, M., Gilbert, M Thomas P, Schierup, M. H. & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 5, 14 s., giab029.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The role of the gut microbiota in the dietary niche expansion of fishing bats
Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Jessen, Lasse Nyholm, Morris, E., Chaverri, G., Montalvo, L. G. H., Flores-Martinez, J. J., Lin, A., Razgour, O., Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 14 s., 76.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species
Rhie, A., McCarthy, S. A., Fedrigo, O., Damas, J., Formenti, G., Koren, S., Uliano-Silva, M., Chow, W., Fungtammasan, A., Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Chaisson, M., Gedman, G. L., Cantin, L. J., Thibaud-Nissen, F., Haggerty, L., Bista, I., Smith, M., Haase, B. & 107 flere, , 2021, I: Nature. 592, 7856, s. 737-746 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
eDNA‐based biomonitoring at an experimental German vineyard to characterize how management regimes shape ecosystem diversity
Rasmussen, Jacob Agerbo, Nielsen, M., Mak, Sarah Siu Tze, Döring, J., Klincke, F., Gopalakrishnan, Shyam, Dunn, Rob, Kauer, R. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Environmental DNA. 3, 1, s. 70-82 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Using paleo-archives to safeguard biodiversity under climate change
Fordham, D. A., Jackson, S. T., Brown, S. C., Huntley, B., Dahl-Jensen, Dorthe, Gilbert, M Thomas P, Otto-Bliesner, B., Svensson, Anders, Theodoridis, S., Wilmshurst, J. M., Buettel, J. C., Canteri, Elisabetta, McDowell, M., Orlando, L. A. A., Pilowsky, Julia Aaron, Rahbek, Carsten & Nogues, David Bravo, 28 aug. 2020, I: Science. 369, 6507, s. 1072-1083 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux
da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, , 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss
Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient DNA suggests modern wolves trace their origin to a Late Pleistocene expansion from Beringia
Loog, L., Thalmann, O., Sinding, M. H. S., Schuenemann, V. J., Perri, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Witt, K. E., Samaniego Castruita, J. A., Velasco, M. S., Lundstrøm, I. K. C., Wales, N., Sonet, G., Frantz, L., Schroeder, H., Budd, J., Jimenez, E. L., Fedorov, S., Gasparyan, B., Kandel, A. W. & 16 flere, , 2020, I: Molecular Ecology. 29, 9, s. 1596-1610 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition
Sinding, M. H. S., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, F. G., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Andersen-Ranberg, E. U., Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, E., Skoglund, P. & 15 flere, , 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification
Bohmann, Kristine, Mirarab, S., Bafna, V. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Molecular Ecology. 29, 14, s. 2521-2534Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bone biodeterioration - The effect of marine and terrestrial depositional environments on early diagenesis and bone bacterial community
Eriksen, A. M. H., Nielsen, Tue Kjærgaard, Matthiesen, H., Carøe, C., Hansen, Lars Hestbjerg, Gregory, D. J., Turner-Walker, G., Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: PLoS ONE. 15, 10 October, 24 s., e0240512.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 12980
Flest downloads
-
6185
downloads
Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5637
downloads
Deep sequencing of RNA from ancient maize kernels
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
5248
downloads
True single-molecule DNA sequencing of a pleistocene horse bone
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet