Tom Gilbert

Tom Gilbert

Professor

Medlem af:


    1. 2021
    2. Udgivet

      Historical population declines prompted significant genomic erosion in the northern and southern white rhinoceros (Ceratotherium simum)

      Sánchez-Barreiro, F., Gopalakrishnan, Shyam, Ramos Madrigal, Jazmin, Westbury, Michael Vincent, de Manuel, M., Margaryan, Ashot, Ciucani, M. M., Vieira, Filipe Garrett, Patramanis, Ioannis, Kalthoff, D. C., Timmons, Z., Sicheritz-Pontén, Thomas, Dalén, L., Ryder, O. A., KU, thw266, Marques-Bonet, T., Moodley, Y. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6355-6369 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      Identification of African swine fever virus transcription within peripheral blood mononuclear cells of acutely infected pigs

      Olesen, A. S., Kodama, M., Lohse, L., Accensi, F., Rasmussen, T. B., Lazov, Christina Marie, Limborg, Morten Tønsberg, Gilbert, M Thomas P, Bøtner, A. & Belsham, Graham John, 2021, I: Viruses. 13, 11, 2333.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Kouprey (Bos sauveli) genomes unveil polytomic origin of wild Asian Bos

      Sinding, M. S., Ciucani, M. M., Ramos Madrigal, Jazmin, Carmagnini, A., Rasmussen, Jacob Agerbo, Feng, S., Chen, G., Vieira, Filipe Garrett, Mattiangeli, V., Ganjoo, R. K., Larson, G., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Frantz, L., Gilbert, M Thomas P & Bradley, D. G., 2021, I: iScience. 24, 11, 18 s., 103226.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Leech blood-meal invertebrate-derived DNA reveals differences in Bornean mammal diversity across habitats

      Drinkwater, R., Jucker, T., Potter, J. H. T., Swinfield, T., Coomes, D. A., Slade, E. M., Gilbert, M Thomas P, Lewis, O. T., Bernard, H., Struebig, M. J., Clare, E. L. & Rossiter, S. J., 2021, I: Molecular Ecology. 30, 13, s. 3299-3312 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      Mitochondrial genomes of Danish vertebrate species generated for the national DNA reference database, DNAmark

      Margaryan, Ashot, Noer, Christina, Richter, S. R., Restrup, M. E., Bülow‐hansen, J. L., Leerhøi, Frederik, Arfaoui, Emilia Marie Rolander, Gopalakrishnan, Shyam, Carøe, C., Gilbert, M Thomas P & Bohmann, Kristine, 2021, I: Environmental DNA. 3, 2, s. 472-480

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Modern Siberian dog ancestry was shaped by several thousand years of Eurasian-wide trade and human dispersal

      Feuerborn, T. R., Carmagnini, A., Losey, R. J., Nomokonova, T., Askeyev, A., Askeyev, I., Askeyev, O., Antipina, E. E., Appelt, M., Bachura, O. P., Beglane, F., Bradley, D. G., Daly, K. G., Gopalakrishnan, S., Gregersen, K. M., Guo, C., Gusev, A. V., Jones, C., Kosintsev, P. A., Kuzmin, Y. V. & 17 flere, Mattiangeli, V., Perri, A. R., Plekhanov, A. V., Ramos Madrigal, Jazmin, Schmidt, A. L., Shaymuratova, D., Smith, O., Yavorskaya, L. V., KU, thw266, Willerslev, Eske, Meldgaard, Morten, Gilbert, M Thomas P, Larson, G., Dalén, L., Hansen, Anders Johannes, Sinding, Mikkel Holger Strander & Frantz, L., 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 39, e2100338118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      Molecular parallelisms between pigmentation in the avian iris and the integument of ectothermic vertebrates

      Andrade, P., Gazda, M. A., Araújo, P. M., Afonso, S., Rasmussen, Jacob Agerbo, Marques, C. I., Lopes, R. J., Gilbert, M Thomas P & Carneiro, M., 2021, I: PLOS Genetics. 17, 2, 16 s., 1009404.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Non-invasive surveys of mammalian viruses using environmental DNA

      Alfano, N., Dayaram, A., Axtner, J., Tsangaras, K., Kampmann, Marie-Louise, Mohamed, A., Wong, S. T., Gilbert, M Thomas P, Wilting, A. & Greenwood, A. D., 2021, I: Methods in Ecology and Evolution. 12, 10, s. 1941-1952

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Rapid discovery of novel prophages using biological feature engineering and machine learning

      Sirén, K., Millard, A., Petersen, Bent, Gilbert, M Thomas P, Clokie, M. R. J. & Sicheritz-Pontén, Thomas, 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 1, 10 s., lqaa109.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      Reconsidering domestication from a process archaeology perspective

      Bogaard, A., Allaby, R., Arbuckle, B. S., Bendrey, R., Crowley, S., Cucchi, T., Denham, T., Frantz, L., Fuller, D., Gilbert, M Thomas P, Karlsson, E., Manin, A., Marshall, F., Mueller, N., Peters, J., Stépanoff, C., Weide, A. & Larson, G., 2021, I: World Archaeology. 53, 1, s. 56-77 22 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Runs of homozygosity in killer whale genomes provide a global record of demographic histories

      Foote, A. D., Hooper, R., Alexander, A., Baird, R. W., Baker, C. S., Ballance, L., Barlow, J., Brownlow, A., Collins, T., Constantine, R., Dalla Rosa, L., Davison, N. J., Durban, J. W., Esteban, R., Excoffier, L., Martin, S. L. F., Forney, K. A., Gerrodette, T., Gilbert, M. T. P., Guinet, C. & 14 flere, Hanson, M. B., Li, S., Martin, M. D., Robertson, K. M., Samarra, F. I. P., de Stephanis, R., Tavares, S. B., Tixier, P., Totterdell, J. A., Wade, P., Wolf, J. B. W., Fan, G., Zhang, Y. & Morin, P. A., 2021, I: Molecular Ecology. 30, 23, s. 6162-6177 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      Salmon gut microbiota correlates with disease infection status: potential for monitoring health in farmed animals

      Bozzi, D., Rasmussen, Jacob Agerbo, Carøe, C., Sveier, H., Nordøy, K., Gilbert, M Thomas P & Limborg, Morten Tønsberg, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 1, 17 s., 30.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      The genetic impact of an Ebola outbreak on a wild gorilla population

      Fontsere, C., Frandsen, P., Hernandez-Rodriguez, J., Niemann, Jonas, Scharff-Olsen, Camilla Hjorth, Vallet, D., Le Gouar, P., Ménard, N., Navarro, A., Siegismund, Hans Redlef, Hvilsom, C., Gilbert, M Thomas P, Kuhlwilm, M., Hughes, D. & Marques-Bonet, T., 2021, I: BMC Genomics. 22, 12 s., 735.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      The genome sequence of the grey wolf, Canis lupus Linnaeus 1758

      Sinding, Mikkel Holger Strander, Gopalakrishnan, Shyam, Raundrup, K., Dalén, L., Threlfall, J., Gilbert, M Thomas P, Darwin Tree of Life Barcoding collective, D. T. O. L. B. C., Wellcome Sanger Institute Tree of Life programme, W. S. I. T. O. L. P., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: DNA Pipelines collective, W. S. I. S. O. D. P. C. & Tree of Life Core Informatics collective, Darwin Tree of Life Consortium, T. O. L. C. I. C. D. T. O. L. C., 2021, I: Wellcome Open Research. 6, 12 s., 310.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      The germline mutational process in rhesus macaque and its implications for phylogenetic dating

      Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Bakker, J., Zheng, J., Li, P., Antunes Pacheco, George, Sinding, Mikkel Holger Strander, Kamilari, M., Gilbert, M Thomas P, Schierup, M. H. & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 5, 14 s., giab029.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      The role of the gut microbiota in the dietary niche expansion of fishing bats

      Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Jessen, Lasse Nyholm, Morris, E., Chaverri, G., Montalvo, L. G. H., Flores-Martinez, J. J., Lin, A., Razgour, O., Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2021, I: BMC Animal Microbiome. 3, 14 s., 76.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species

      Rhie, A., McCarthy, S. A., Fedrigo, O., Damas, J., Formenti, G., Koren, S., Uliano-Silva, M., Chow, W., Fungtammasan, A., Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Chaisson, M., Gedman, G. L., Cantin, L. J., Thibaud-Nissen, F., Haggerty, L., Bista, I., Smith, M., Haase, B. & 107 flere, Mountcastle, J., Winkler, S., Paez, S., Howard, J., Vernes, S. C., Lama, T. M., Grutzner, F., Warren, W. C., Balakrishnan, C. N., Burt, D., George, J. M., Biegler, M. T., Iorns, D., Digby, A., Eason, D., Robertson, B., Edwards, T., Wilkinson, M., Turner, G., Meyer, A., Kautt, A. F., Franchini, P., Detrich, H. W., Svardal, H., Wagner, M., Naylor, G. J. P., Pippel, M., Malinsky, M., Mooney, M., Simbirsky, M., Hannigan, B. T., Pesout, T., Houck, M., Misuraca, A., Kingan, S. B., Hall, R., Kronenberg, Z., Sović, I., Dunn, C., Ning, Z., Hastie, A., Lee, J., Selvaraj, S., Green, R. E., Putnam, N. H., Gut, I., Ghurye, J., Garrison, E., Sims, Y., Collins, J., Pelan, S., Torrance, J., Tracey, A., Wood, J., Dagnew, R. E., Guan, D., London, S. E., Clayton, D. F., Mello, C. V., Friedrich, S. R., Lovell, P. V., Osipova, E., Al-Ajli, F. O., Secomandi, S., Kim, H., Theofanopoulou, C., Hiller, M., Zhou, Y., Harris, R. S., Makova, K. D., Medvedev, P., Hoffman, J., Masterson, P., Clark, K., Martin, F., Howe, K., Flicek, P., Walenz, B. P., Kwak, W., Clawson, H., Diekhans, M., Nassar, L., Paten, B., Kraus, R. H. S., Crawford, A. J., Gilbert, M Thomas P, KU, thw266, Venkatesh, B., Murphy, R. W., Koepfli, K., Shapiro, B., Johnson, W. E., Di Palma, F., Marques-Bonet, T., Teeling, E. C., Warnow, T., Graves, J. M., Ryder, O. A., Haussler, D., O’Brien, S. J., Korlach, J., Lewin, H. A., Howe, K., Myers, E. W., Durbin, R., Phillippy, A. M. & Jarvis, E. D., 2021, I: Nature. 592, 7856, s. 737-746 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      eDNA‐based biomonitoring at an experimental German vineyard to characterize how management regimes shape ecosystem diversity

      Rasmussen, Jacob Agerbo, Nielsen, M., Mak, Sarah Siu Tze, Döring, J., Klincke, F., Gopalakrishnan, Shyam, Dunn, Rob, Kauer, R. & Gilbert, M Thomas P, 2021, I: Environmental DNA. 3, 1, s. 70-82 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. 2020
    21. Udgivet

      Using paleo-archives to safeguard biodiversity under climate change

      Fordham, D. A., Jackson, S. T., Brown, S. C., Huntley, B., Dahl-Jensen, Dorthe, Gilbert, M Thomas P, Otto-Bliesner, B., Svensson, Anders, Theodoridis, S., Wilmshurst, J. M., Buettel, J. C., Canteri, Elisabetta, McDowell, M., Orlando, L. A. A., Pilowsky, Julia Aaron, Rahbek, Carsten & Nogues, David Bravo, 28 aug. 2020, I: Science. 369, 6507, s. 1072-1083 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    22. Udgivet

      A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux

      da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, Osório, H., Winkelmann, I., Simakov, O., Rasmussen, Simon, Rahman, M. Z., Pisani, D., Vinther, J., Jarvis, E., KU, thw266, Strugnell, J. M., Castro, L. F. C., Fedrigo, O., Patricio, M., Li, Q., Rocha, S., Antunes, A., Wu, Y., Ma, B., Sanges, R., Vinar, T., Blagoev, B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Nielsen, Rasmus & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Udgivet

      Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss

      Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. Udgivet

      Ancient DNA suggests modern wolves trace their origin to a Late Pleistocene expansion from Beringia

      Loog, L., Thalmann, O., Sinding, M. H. S., Schuenemann, V. J., Perri, A., Germonpré, M., Bocherens, H., Witt, K. E., Samaniego Castruita, J. A., Velasco, M. S., Lundstrøm, I. K. C., Wales, N., Sonet, G., Frantz, L., Schroeder, H., Budd, J., Jimenez, E. L., Fedorov, S., Gasparyan, B., Kandel, A. W. & 16 flere, Lázničková-Galetová, M., Napierala, H., Uerpmann, H. P., Nikolskiy, P. A., Pavlova, E. Y., Pitulko, V. V., Herzig, K., Malhi, R. S., Willerslev, Eske, Hansen, Anders Johannes, Dobney, K., Gilbert, M Thomas P, Krause, J., Larson, G., Eriksson, A. & Manica, A., 2020, I: Molecular Ecology. 29, 9, s. 1596-1610 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      Arctic-adapted dogs emerged at the Pleistocene-Holocene transition

      Sinding, M. H. S., Gopalakrishnan, S., Ramos-Madrigal, J., de Manuel, M., Pitulko, V. V., Kuderna, L., Feuerborn, T. R., Frantz, L. A. F., Vieira, F. G., Niemann, J., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Andersen-Ranberg, E. U., Jordan, P. D., Pavlova, E. Y., Nikolskiy, P. A., Kasparov, A. K., Ivanova, V. V., Willerslev, E., Skoglund, P. & 15 flere, Fredholm, Merete, Wennerberg, S. E., Heide-Jørgensen, M. P., Dietz, R., Sonne, C., Meldgaard, Morten, Dalén, L., Larson, G., Petersen, Bent, Sicheritz-Pontén, Thomas, Bachmann, L., Wiig, Ø., Marques-Bonet, T., Hansen, Anders Johannes & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Science (New York, N.Y.). 368, 6498, s. 1495-1499 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification

      Bohmann, Kristine, Mirarab, S., Bafna, V. & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: Molecular Ecology. 29, 14, s. 2521-2534

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    27. Udgivet

      Bone biodeterioration - The effect of marine and terrestrial depositional environments on early diagenesis and bone bacterial community

      Eriksen, A. M. H., Nielsen, Tue Kjærgaard, Matthiesen, H., Carøe, C., Hansen, Lars Hestbjerg, Gregory, D. J., Turner-Walker, G., Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: PLoS ONE. 15, 10 October, 24 s., e0240512.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    Forrige 1 2 3 4 5 6 7 8 ...18 Næste

    ID: 12980