Tim Holm Jakobsen

Tim Holm Jakobsen

Lektor


  1. Udgivet

    Novel and future treatment strategies

    Alhede, M., Jakobsen, Tim Holm & Givskov, Michael, 1 dec. 2011, Biofilm Infections. Springer, s. 231-249 19 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Identification of small molecules that interfere with c-di-GMP signaling and induce dispersal of Pseudomonas aeruginosa biofilms

    Andersen, Jens Bo, Hultqvist, Louise Dahl, Jansen, C. U., Jakobsen, Tim Holm, Nilsson, Carl Martin Peter, Rybtke, Morten Levin, Uhd, J., Fritz, Blaine Gabriel, Seifert, R., Berthelsen, J., Nielsen, Thomas Eiland, Qvortrup, K., Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2021, I: npj Biofilms and Microbiomes. 7, 13 s., 59.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Induction of native c-di-GMP phosphodiesterases leads to dispersal of Pseudomonas aeruginosa biofilms

    Andersen, Jens Bo, Kragh, K. N., Hultqvist, Louise Dahl, Rybtke, Morten Levin, Nilsson, Carl Martin Peter, Jakobsen, Tim Holm, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2021, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 65, 4, e02431-20.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Metagenomic and metatranscriptomic analysis of saliva reveals disease-associated microbiota in patients with periodontitis and dental caries

    Midjord-Belstrøm, Daniel, Constancias, F., Liu, Y., Yang, L., Drautz-Moses, D. I., Schuster, S. C., Kohli, G. S., Jakobsen, Tim Holm, Holmstrup, Palle & Givskov, Michael, 2017, I: npj Biofilms and Microbiomes. 3, 8 s., 23.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    In vitro screens for quorum sensing inhibitors and in vivo confirmation of their effect

    Bjarnsholt, Thomas, van Gennip, M., Jakobsen, Tim Holm, Hultqvist, Louise Dahl, Jensen, Peter Østrup & Givskov, Michael, 2010, I: Nature Protocols (Print Edition). 5, 2, s. 282-93 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Quorum sensing and virulence of Pseudomonas aeruginosa during lung infection of cystic fibrosis patients

    Bjarnsholt, Thomas, Jensen, Peter Østrup, Jakobsen, Tim Holm, Phipps, R., Nielsen, A. K., Rybtke, Morten Levin, Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Høiby, Niels, Ciofu, Oana & Scandinavian Cystic Fibrosis Study Consortium, S. C. F. S. C., 1 jan. 2010, I: PLoS ONE. 5, 4, s. e10115

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Process for the manufacture of ajoene derivatives

    Bjarnsholt, Thomas, Høiby, Niels, Jensen, Peter Østrup, Phipps, R., Shanmugham, Meenakshi, S., Alhede, M., Hultqvist, Louise Dahl, Jakobsen, Tim Holm, Tanner, D., Larsen, Thomas, O. & Givskov, Michael, 14 jun. 2012, IPC nr. C07C 323/ 65 A I, Patentnr. WO2012076016, Prioritetsdato 8 dec. 2010, Prioritetsnr. EP20100194154

    Publikation: Patent

  8. Udgivet

    Synergistic antibacterial efficacy of early combination treatment with tobramycin and quorum-sensing inhibitors against Pseudomonas aeruginosa in an intraperitoneal foreign-body infection mouse model

    Christensen, L., van Gennip, M., Jakobsen, Tim Holm, Alhede, M., Hougen, H. P., Høiby, Niels, Bjarnsholt, Thomas, Givskov, Michael & Alhede, M., maj 2012, I: The Journal of antimicrobial chemotherapy. 67, 5, s. 1198-206 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Imaging N-acyl homoserine lactone quorum sensing in vivo

    Hultqvist, Louise Dahl, van Gennip, M., Jakobsen, Tim Holm, Givskov, Michael & Bjarnsholt, Thomas, 1 jan. 2011, I: Methods in Molecular Biology. 692, 2, s. 147-157 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Kinetic Model for Signal Binding to the Quorum Sensing Regulator LasR

    Claussen, A., Jakobsen, Tim Holm, Bjarnsholt, Thomas, Givskov, Michael, Welch, M., Ferkinghoff-Borg, J. & Sams, T., 2013, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 14, 7, s. 13360-76 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Solid-phase synthesis and biological evaluation of piperazine-based novel bacterial topoisomerase inhibitors

    Flagstad, T., Pedersen, M. T., Jakobsen, Tim Holm, Felding, J., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Qvortrup, K. & Nielsen, Thomas Eiland, 2022, I: Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. 57, 128499.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Disulfide Bond-Containing Ajoene Analogues As Novel Quorum Sensing Inhibitors of Pseudomonas aeruginosa

    Fong, J., Yuan, M., Jakobsen, Tim Holm, Mortensen, K. T., Delos Santos, M. M. S., Chua, S. L., Yang, L., Tan, C. H., Nielsen, Thomas Eiland & Givskov, Michael, 12 jan. 2017, I: Journal of Medicinal Chemistry. 60, 1, s. 215-227

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Quorum sensing regulation in Aeromonas hydrophila

    Garde, C., Bjarnsholt, Thomas, Givskov, Michael, Jakobsen, Tim Holm, Hentzer, M., Claussen, A., Sneppen, K., Ferkinghoff-Borg, J. & Sams, T., 2010, I: Journal of Molecular Biology. 396, 4, s. 849-57 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Solid-phase synthesis and biological evaluation of N-dipeptido L-homoserine lactones as quorum sensing activators

    Hansen, M. R., Le Quement, S. T., Jakobsen, Tim Holm, Skovstrup, S., Taboureau, O., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Nielsen, T. E., 10 feb. 2014, I: ChemBioChem. 15, 3, s. 460-5 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Triazole-containing N-acyl homoserine lactones targeting the quorum sensing system in Pseudomonas aeruginosa

    Hansen, M. R., Jakobsen, Tim Holm, Bang, C. G., Cohrt, A. E., Hansen, C. L., Clausen, J. R. W., Le Quement, S. T., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Nielsen, T., 2015, I: Bioorganic & Medicinal Chemistry. 23, 7, s. 1638-1650 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Imaging N-acyl homoserine lactone quorum sensing in vivo

    Hultqvist, Louise Dahl, Alhede, M., Jakobsen, Tim Holm, Givskov, Michael & Bjarnsholt, Thomas, 2018, Quorum Sensing: Methods and Protocols. Leoni, L. & Rampion, G. (red.). Humana Press, Bind 1673. s. 203-212 10 s. (Methods in Molecular Biology; Nr. 1673).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Synergistic antibacterial efficacy of early combination treatment with tobramycin and quorom sensing inhibitors against Pseudomonas aeruginosa in an intraperitoneal foreign-body infection mouse model.

    Hultqvist, Louise Dahl, van Gennip, M., Jakobsen, Tim Holm, Alhede, M., Hougen, H. P., Høiby, Niels, Bjarnsholt, Thomas & Givskov, Michael, 2012, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 67, 5, s. 1198-1206 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. E-pub ahead of print

    Novel sampling technique maintaining the two-dimensional organization of microbes during cultivation from chronic wounds: The Imprint method

    Iversen, A. K. S., Fritz, Blaine Gabriel, Hansen, M. J., Kirketerp-Møller, K., Jakobsen, Tim Holm, Bjarnsholt, Thomas & Lichtenberg, Mads, 2024, (E-pub ahead of print) I: APMIS.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Implants induce a new niche for microbiomes

    Jakobsen, Tim Holm, Eickhardt, S. R., Gheorghe, Alexandra Gabriella, Stenqvist, C., Sønderholm, M., Stavnsberg, C., Jensen, Peter Østrup, Odgaard, Anders, Whiteley, M., Moser, Claus Ernst, Hvolris, J., Hougen, H. P. & Bjarnsholt, Thomas, 1 aug. 2018, I: APMIS - Journal of Pathology, Microbiology and Immunology. 126, 8, s. 685-692 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    A broad range quorum sensing inhibitor working through sRNA inhibition

    Jakobsen, Tim Holm, Warming, A. N., Vejborg, R. M., Moscoso, J. A., Stegger, M., Lorenzen, F., Rybtke, Morten Levin, Andersen, Jens Bo, Petersen, R., Andersen, P. S., Nielsen, Thomas Eiland, Tolker-Nielsen, Tim, Filloux, A., Ingmer, Hanne & Givskov, Michael, 2017, I: Scientific Reports. 7, 1, 12 s., 9857.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Sampling challenges in diagnosis of chronic bacterial infections

    Jakobsen, Tim Holm, Xu, Y., Bay, Lene, Schønheyder, H. C., Jakobsen, T., Bjarnsholt, Thomas & Thomsen, T. R., 2021, I: Journal of Medical Microbiology. 70, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Qualitative and Quantitative Determination of Quorum Sensing Inhibition In Vitro

    Jakobsen, Tim Holm, Alhede, M., Hultqvist, Louise Dahl, Bjarnsholt, Thomas & Givskov, Michael, 2018, Quorum Sensing: Methods and Protocols. Springer, Bind 1673. s. 275-285 11 s. (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes

    Jakobsen, T. H., Hansen, M. A., Jensen, P. Ø., Hansen, L., Riber, L., Cockburn, A. P. I., Kolpen, M., Hansen, C. R., Ridderberg, W., Eickhardt-Sørensen, S. R., Hansen, M., Kerpedjiev, P., Alhede, M., Qvortrup, K., Burmølle, M., Moser, C. E., Kühl, M., Ciofu, O., Givskov, M., Sørensen, S. J. & 2 flere, Høiby, Niels & Bjarnsholt, Thomas, 2013, I: P L o S One. 8, 7, 17 s., e68484.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Qualitative and quantitative determination of quorum sensing inhibition in vitro

    Jakobsen, Tim Holm, van Gennip, M., Hultqvist, Louise Dahl, Bjarnsholt, Thomas & Givskov, Michael, 1 jan. 2011, I: Methods in Molecular Biology. 692, 3, s. 253-263 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Bacterial Biofilm Control by Perturbation of Bacterial Signaling Processes

    Jakobsen, Tim Holm, Tolker-Nielsen, Tim & Givskov, Michael, sep. 2017, I: International Journal of Molecular Sciences. 18, 9, 27 s., 1970.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Targeting quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa biofilms: current and emerging inhibitors

    Jakobsen, Tim Holm, Bjarnsholt, Thomas, Jensen, Peter Østrup, Givskov, Michael & Høiby, Niels, jul. 2013, I: Future Microbiology. 8, 7, s. 901-21 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Food as a source for quorum sensing inhibitors: iberin from horseradish revealed as a quorum sensing inhibitor of Pseudomonas aeruginosa

    Jakobsen, Tim Holm, Bragason, S. K., Phipps, R. K., Hultqvist, Louise Dahl, van Gennip, M., Alhede, M., Skindersoe, M., Larsen, T. O., Høiby, Niels, Bjarnsholt, Thomas & Givskov, Michael, 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 7, s. 2410-2421 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Ajoene, a sulfur-rich molecule from garlic, inhibits genes controlled by quorum sensing

    Jakobsen, Tim Holm, van Gennip, M., Phipps, R. K., Shanmugham, M. S., Hultqvist, Louise Dahl, Alhede, M., Skindersoe, M. E., Rasmussen, T. B., Friedrich, K., Uthe, F., Jensen, Peter Østrup, Moser, Claus Ernst, Nielsen, Kristian Fog, Eberl, L., Larsen, T. O., Tanner, D. A., Høiby, Niels, Bjarnsholt, Thomas, Givskov, Michael & Alhede, M., maj 2012, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 56, 5, s. 2314-25 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    SAR study of 4-arylazo-3,5-diamino-1: H -pyrazoles: identification of small molecules that induce dispersal of Pseudomonas aeruginosa biofilms

    Jansen, C. U., Uhd, J., Andersen, Jens Bo, Hultqvist, Louise Dahl, Jakobsen, Tim Holm, Nilsson, Carl Martin Peter, Nielsen, Thomas Eiland, Givskov, Michael, Tolker-Nielsen, Tim & Qvortrup, K. M., 2021, I: RSC Medicinal Chemistry. 12, 11, s. 1868-1878 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Chemical Regulation of Pseudomonas aeruginosa Biofilm Formation as a Potential Treatment for Persistent Infections

    Kristensen, Rasmus, Tolker-Nielsen, Tim & Jakobsen, Tim Holm, 2022, Antibiofilm Strategies: Current and Future Applications to Prevent, Control and Eradicate Biofilms. Springer, s. 159-179 (Springer Series on Biofilms; Nr. 11).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Inhibition of Pseudomonas aeruginosa quorum sensing by chemical induction of the MexEF-oprN efflux pump

    Kristensen, Rasmus, Andersen, Jens Bo, Rybtke, Morten Levin, Jansen, C. U., Fritz, Blaine Gabriel, Kiilerich, R. O., Uhd, J., Bjarnsholt, Thomas, Qvortrup, K., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael & Jakobsen, Tim Holm, 2024, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 68, 2

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. E-pub ahead of print

    Single cells and bacterial biofilm populations in chronic wound infections

    Lichtenberg, Mads, Kirketerp-Møller, K., Kvich, Lasse Andersson, Christensen, Mads Holm, Fritz, Blaine Gabriel, Jakobsen, Tim Holm & Bjarnsholt, Thomas, 2024, (E-pub ahead of print) I: APMIS.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    What's in a name? Characteristics of clinical biofilms

    Lichtenberg, Mads, Coenye, T., Parsek, M. R., Bjarnsholt, Thomas & Jakobsen, Tim Holm, 2023, I: FEMS Microbiology Reviews. 47, 5, s. 1-8 fuad050.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Nitric-oxide-driven oxygen release in anoxic Pseudomonas aeruginosa

    Lichtenberg, Mads, Line, L., Schrameyer, V., Jakobsen, Tim Holm, Rybtke, Morten Levin, Toyofuku, M., Nomura, N., Kolpen, Mette, Tolker-Nielsen, Tim, Kühl, Michael, Bjarnsholt, Thomas & Jensen, Peter Østrup, 2021, I: iScience. 24, 12, 103404.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Inoculum Concentration Influences Pseudomonas aeruginosa Phenotype and Biofilm Architecture

    Lichtenberg, Mads, Kvich, Lasse Andersson, Larsen, S. L. B., Jakobsen, Tim Holm & Bjarnsholt, Thomas, 2022, I: Microbiology Spectrum. 10, 6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    The structure-function relationship of Pseudomonas aeruginosa in infections and its influence on the microenvironment

    Lichtenberg, Mads, Jakobsen, Tim Holm, Kühl, Michael, Kolpen, Mette, Jensen, Peter Østrup & Bjarnsholt, Thomas, 2022, I: FEMS Microbiology Reviews. 46, 5, 13 s., fuac018.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Oxidative stress response plays a role in antibiotic tolerance of Streptococcus mutans biofilms

    Nilsson, Carl Martin Peter, Jakobsen, Tim Holm, Givskov, Michael, Twetman, Svante & Tolker-Nielsen, Tim, 2019, I: Microbiology. 165, 3, s. 334-342

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Small Molecule Anti-biofilm Agents Developed on the Basis of Mechanistic Understanding of Biofilm Formation

    Qvortrup, K., Hultqvist, Louise Dahl, Nilsson, Carl Martin Peter, Jakobsen, Tim Holm, Jansen, C. U., Uhd, J., Andersen, Jens Bo, Nielsen, Thomas Eiland, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2019, I: Frontiers in Chemistry. 7, 27 s., 742.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Identification of LasR ligands through a virtual screening approach

    Skovstrup, S., Le Quement, S. T., Hansen, T., Jakobsen, Tim Holm, Harmsen, M., Tolker-Nielsen, Tim, Nielsen, T. E., Givskov, Michael & Taboureau, O., 2013, I: ChemMedChem. 8, 1, s. 157-63 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Pseudomonas aeruginosa aggregate formation in an alginate bead model system exhibits In Vivo-like characteristics

    Sønderholm, M., Kragh, K. N., Koren, K., Jakobsen, Tim Holm, Darch, S., Alhede, M., Jensen, Peter Østrup, Whiteley, M., Kühl, Michael & Bjarnsholt, Thomas, maj 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 83, 9, 15 s., e00113-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Comparative systems biology analysis to study the mode of action of the isothiocyanate compound Iberin on Pseudomonas aeruginosa

    Tan, S. Y., Liu, Y., Chua, S. L., Vejborg, R. M., Jakobsen, Tim Holm, Chew, S. C., Li, Y., Nielsen, T. E., Tolker-Nielsen, Tim, Yang, L. & Givskov, Michael, nov. 2014, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 58, 11, s. 6648-59 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Biofilm Survival Strategies in Chronic Wounds

    Thaarup, Ida Clement, Iversen, A. K. S., Lichtenberg, Mads, Bjarnsholt, Thomas & Jakobsen, Tim Holm, 2022, I: Microorganisms. 10, 4, 775.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Fusaric acid and analogues as gram-negative bacterial quorum sensing inhibitors

    Thanh Tung, T., Jakobsen, Tim Holm, Dao, T. T., Fuglsang, Anja Thoe, Givskov, Michael, Christensen, Søren Brøgger & Nielsen, J., 2017, I: European Journal of Medicinal Chemistry. 126, s. 1011-1020 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Computer-aided identification of recognized drugs as Pseudomonas aeruginosa quorum-sensing inhibitors

    Yang, L., Rybtke, Morten Levin, Jakobsen, Tim Holm, Hentzer, M., Bjarnsholt, Thomas, Givskov, Michael & Tolker-Nielsen, Tim, 2009, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 53, 6, s. 2432-43 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Synergistic bactericidal effect of nisin and phytic acid against Escherichia coli O157:H7

    Zhao, G., Kempen, Paul Joseph, Zheng, T., Jakobsen, Tim Holm, Zhao, S., Gu, L., Solem, C. & Ruhdal Jensen, P., 2023, I: Food Control. 144, 109324.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 9840851