Rute Andreia Rodrigues da Fonseca

Rute Andreia Rodrigues da Fonseca

Lektor


  1. 2019
  2. Udgivet

    31º South: The physiology of adaptation to arid conditions in a passerine bird

    Ribeiro, Â. M., Puetz, Lara Christine, Pattinson, N. B., Dalén, L., Deng, Y., KU, thw266, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smit, B. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Molecular Ecology. 28, 16, s. 3709-3721 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Complete Inactivation of Sebum-Producing Genes Parallels the Loss of Sebaceous Glands in Cetacea

    Lopes-Marques, M., Machado, A. M., Alves, L. Q., Fonseca, M. M., Barbosa, S., Sinding, M. S., Rasmussen, M. H., Iversen, M. R., Bertelsen, Mads Frost, Campos, P. F., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ruivo, R. & Castro, L. F. C., 2019, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 36, 6, s. 1270-1280

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Consequences of breed formation on patterns of genomic diversity and differentiation: the case of highly diverse peripheral Iberian cattle

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Urena, I., Afonso, S., Pires, A. E., Jørsboe, E., Chikhi, L. & Ginja, C., 2019, I: BMC Genomics. 20, s. 1-13 334.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Identifying loci under positive selection in complex population histories

    Refoyo Martínez, Alba, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Halldórsdóttir, K., Árnason, E., Mailund, T. & Racimo, Fernando, 2019, I: Genome Research. 29, 9, s. 1506-1520

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits

    Chen, L., Qin, Q., Jiang, Y., Wang, K., Lin, Z., Li, Z., Bibi, F., Yang, Y., Wang, J., Nie, W., Su, W., Liu, G., Li, Q., Fu, W., Pan, X., Liu, C., Yang, J., Zhang, C., Yin, Y., Wang, Y. & 32 flere, Zhao, Y., Zhang, C., Wang, Z., Qin, Y., Liu, W., Wang, B., Ren, Y., Zhang, R., Zeng, Y., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Wei, B., Li, R., Wan, W., Zhao, R., Zhu, W., Wang, Y., Duan, S., Gao, Y., Zhang, Y. E., Chen, C., Hvilsom, C., Epps, C. W., Chemnick, L. G., Doug, Y., Mirarab, S., Siegismund, Hans Redlef, Ryder, O. A., Gilbert, M Thomas P, Lewin, H. A., KU, thw266, Heller, Rasmus & Wang, W., 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1152-

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Population genomic footprints of environmental pollution pressure in natural populations of the Mediterranean mussel

    Ribeiro, Â. M., Canchaya, C. A., Penaloza, F., Galindo, J. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, jun. 2019, I: Marine Genomics. 45, s. 11-15

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. 2020
  9. Udgivet

    A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux

    da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, Osório, H., Winkelmann, I., Simakov, O., Rasmussen, Simon, Rahman, M. Z., Pisani, D., Vinther, J., Jarvis, E., KU, thw266, Strugnell, J. M., Castro, L. F. C., Fedrigo, O., Patricio, M., Li, Q., Rocha, S., Antunes, A., Wu, Y., Ma, B., Sanges, R., Vinar, T., Blagoev, B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Nielsen, Rasmus & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss

    Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Cartilaginous fishes offer unique insights into the evolution of the nuclear receptor gene repertoire in gnathostomes

    Fonseca, E., Machado, A. M., Vilas-Arrondo, N., Gomes-dos-Santos, A., Verissimo, A., Esteves, P., Almeida, T., Themudo, G., Ruivo, R., Perez, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Santos, M. M., Froufe, E., Roman-Marcote, E., Venkatesh, B. & Castro, L. F. C., 2020, I: General and Comparative Endocrinology. 295, 10 s., 113527.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics

    Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, Sinding, Mikkel Holger Strander, Puetz, Lara Christine, Cavill, Emily Louisa, Ribeiro, Â. M., Eckhart, L., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Brumfield, R. T., Christidis, L., Bertelsen, Mads Frost, Sicheritz-Pontén, Thomas, Tietze, D. T., Robertson, B. C., Song, G., Borgia, G., Claramunt, S., Lovette, I. J., Cowen, S. J., Njoroge, P., Dumbacher, J. P., Ryder, O. A., Fuchs, J., Bunce, M., Burt, D. W., Cracraft, J., Meng, G., Hackett, S. J., Ryan, P. G., Jønsson, Knud Andreas, Jamieson, I. G., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Braun, E. L., Houde, P., Mirarab, S., Suh, A., Hansson, B., Ponnikas, S., Sigeman, H., Stervander, M., Frandsen, P. B., van der Zwan, H., van der Sluis, R., Visser, C., Balakrishnan, C. N., Clark, A. G., Fitzpatrick, J. W., Bowman, R., Chen, N., Cloutier, A., Sackton, T. B., Edwards, S. V., Foote, D. J., Shakya, S. B., Sheldon, F. H., Vignal, A., Soares, A. E. R., Shapiro, B., González-Solís, J., Ferrer-Obiol, J., Rozas, J., Riutort, M., Tigano, A., Friesen, V., Dalén, L., Urrutia, A. O., Székely, T., Liu, Y., Campana, M. G., Corvelo, A., Fleischer, R. C., Rutherford, K. M., Gemmell, N. J., Dussex, N., Mouritsen, H., Thiele, N., Delmore, K., Liedvogel, M., Franke, A., Hoeppner, M. P., Krone, O., Fudickar, A. M., Milá, B., Ketterson, E. D., Fidler, A. E., Friis, G., Parody-Merino, Á. M., Battley, P. F., Cox, M. P., Lima, N. C. B., Prosdocimi, F., Parchman, T. L., Schlinger, B. A., Loiselle, B. A., Blake, J. G., Lim, H. C., Day, L. B., Fuxjager, M. J., Baldwin, M. W., Braun, M. J., Wirthlin, M., Dikow, R. B., Ryder, T. B., Camenisch, G., Keller, L. F., Dacosta, J. M., Hauber, M. E., Louder, M. I. M., Witt, C. C., McGuire, J. A., Mudge, J., Megna, L. C., Carling, M. D., Wang, B., Taylor, S. A., Del-Rio, G., Aleixo, A., Vasconcelos, A. T. R., Mello, C. V., Weir, J. T., Haussler, D., Li, Q., Yang, H., Wang, J., Lei, F., Rahbek, Carsten, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R., Jarvis, E. D., Paten, B. & KU, thw266, 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Evolution of the extracytoplasmic function σ factor protein family

    Pinto, D. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2020, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 2, 1, 13 s., lqz026.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Link Your Sites (LYS) Scripts: Automated Search of Protein Structures and Mapping of Sites Under Positive Selection Detected by PAML

    Sanz Moreta, Lys & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2020, I: Evolutionary Biology. 47, 3, s. 240-245 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Liver transcriptome resources of four commercially exploited teleost species

    Machado, A. M., Muñoz-Merida, A., Fonseca, E., Veríssimo, A., Pinto, R., Felício, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2020, I: Scientific Data. 7, 9 s., 214.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Losing Genes: The Evolutionary Remodeling of Cetacea Skin

    Espregueira Themudo, G., Alves, L. Q., Machado, A. M., Lopes-Marques, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Fonseca, M., Ruivo, R. & Castro, L. F. C., 2020, I: Frontiers in Marine Science. 7, 592375.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Declining genetic diversity of European honeybees along the twentieth century

    Themudo, G. E., Rey de la Iglesia, Alba, Tascón, L. R., Jensen, Annette Bruun, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Campos, P. F., 29 jun. 2020, I: Scientific Reports. 10, 12 s., 10520.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. 2021
  19. Udgivet

    Comparative genomics provides insights into the aquatic adaptations of mammals

    Yuan, Y., Zhang, Y., Zhang, P., Liu, C., Wang, J., Gao, H., Rus Hoelzel, A., Seim, I., Lv, M., Lin, M., Dong, L., Gao, H., Yang, Z., Caruso, F., Lin, W., Da Fonseca, R. R., Wang, D., Wang, X., Rasmussen, M. H., Liu, M. & 21 flere, Zheng, J., Zhao, L., Campos, P. F., Kang, H., Iversen, M., Song, Y., Guo, X., Guo, J., Qin, Y., Pan, S., Xu, Q., Meng, L., A, Y., Liu, S., Ming-Yuen Lee, S., Liu, X., Xu, X., Yang, H., Fan, G., Wang, K. & Li, S., 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 37, 9 s., e2106080118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet
  21. Udgivet

    Response of an Afro-Palearctic bird migrant to glaciation cycles

    Thorup, Kasper, Pedersen, L., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Naimi, B., Nogues, David Bravo, Krapp, M., Manica, A., Willemoes, M., Sjöberg, Sissel, Feng, S., Chen, G., Rey de la Iglesia, Alba, Campos, P. F., Beyer, R., Araújo, M. B., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Tøttrup, Anders P. & Rahbek, Carsten, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 52, 8 s., e2023836118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The Crown Pearl: a draft genome assembly of the European freshwater pearl mussel Margaritifera margaritifera (Linnaeus, 1758)

    Gomes-dos-Santos, A., Lopes-Lima, M., Machado, A. M., Ramos, A. M., Usié, A., Bolotov, I. N., Vikhrev, I. V., Breton, S., Castro, L. F. C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Geist, J., Österling, M. E., Prié, V., Teixeira, A., Gan, H. M., Simakov, O. & Froufe, E., 2021, I: DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes. 28, 2, 10 s., dsab002.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Using UCEs to track the influence of sea‐level change on leafy seadragon populations

    Stiller, Josefin, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Alfaro, M. E., Faircloth, B. C., Wilson, N. G. & Rouse, G. W., 2021, I: Molecular Ecology. s. 1364-1380

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2022
  25. Udgivet

    Conservation genomics of the endangered Seychelles Magpie-Robin (Copsychus sechellarum): a unique insight into the history of a precious endemic bird

    Cavill, Emily Louisa, Gopalakrishnan, Shyam, Puetz, Lara Christine, Ribeiro, Â. M., Mak, Sarah Siu Tze, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Antunes Pacheco, George, Dunlop, B., Accouche, W., Shah, N., Zora, A., Calabrese, L., Genner, M., Jones, G., Guo, C., KU, thw266 & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Ibis. 164, 2, s. 396-410 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2023
  27. Udgivet

    Iron age genomic data from Althiburos – Tunisia renew the debate on the origins of African taurine cattle

    Ginja, C., Guimarães, S., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Rasteiro, R., Rodríguez-Varela, R., Simões, L. G., Sarmento, C., Belarte, M. C., Kallala, N., Torres, J. R., Sanmartí, J., Arruda, A. M., Detry, C., Davis, S., Matos, J., Götherström, A., Pires, A. E. & Valenzuela-Lamas, S., 2023, I: iScience. 26, 7, 17 s., 107196.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. 2024
  29. Udgivet

    Fertilizer regime and cultivar affect barley growth and rhizobiome composition

    Kindtler, Nikolaj Lunding, Sheikh, Sanea, Richardy, J., Krogh, E., Maccario, Lorrie, Vestergård, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ekelund, Flemming & Laursen, Kristian Holst, 2024, I: Applied Soil Ecology. 198, 13 s., 105384.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Introgression and disruption of migration routes have shaped the genetic integrity of wildebeest populations

    Liu, X., Lin, L., Sinding, M. H. S., Bertola, L. D., Hanghøj, K., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Rasmussen, M. S., Schubert, M., Pečnerová, P., Balboa, R. F., Li, Z., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Pinto, R. R., Wang, X., Kuja, J., Brüniche-Olsen, A., Meisner, J., Santander, C. G. & 8 flere, Ogutu, J. O., Masembe, C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Muwanika, V., Siegismund, Hans Redlef, Albrechtsen, Anders, Moltke, Ida & Heller, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 2921.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Population Genomics Reveals the Underlying Structure of the Small Pelagic European Sardine and Suggests Low Connectivity within Macaronesia

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Campos, P. F., Rey de la Iglesia, Alba, Barroso, G. V., Bergeron, Lucie Adrienne, Nande, M., Tuya, F., Abidli, S., Pérez, M., Riveiro, I., Carrera, P., Jurado-Ruzafa, A., Santamaría, M. T. G., Faria, R., Machado, A. M., Fonseca, M. M., Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2024, I: Genes. 15, 2, 15 s., 170.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 33270633