Rute Andreia Rodrigues da Fonseca
Lektor
Section for Biodiversity
Universitetsparken 15, København Ø
Section for Biodiversity
Universitetsparken 15, 2100 København Ø
- 2019
- Udgivet
31º South: The physiology of adaptation to arid conditions in a passerine bird
Ribeiro, Â. M., Puetz, Lara Christine, Pattinson, N. B., Dalén, L., Deng, Y., KU, thw266, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smit, B. & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Molecular Ecology. 28, 16, s. 3709-3721 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete Inactivation of Sebum-Producing Genes Parallels the Loss of Sebaceous Glands in Cetacea
Lopes-Marques, M., Machado, A. M., Alves, L. Q., Fonseca, M. M., Barbosa, S., Sinding, M. S., Rasmussen, M. H., Iversen, M. R., Bertelsen, Mads Frost, Campos, P. F., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ruivo, R. & Castro, L. F. C., 2019, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 36, 6, s. 1270-1280Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Consequences of breed formation on patterns of genomic diversity and differentiation: the case of highly diverse peripheral Iberian cattle
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Urena, I., Afonso, S., Pires, A. E., Jørsboe, E., Chikhi, L. & Ginja, C., 2019, I: BMC Genomics. 20, s. 1-13 334.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identifying loci under positive selection in complex population histories
Refoyo Martínez, Alba, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Halldórsdóttir, K., Árnason, E., Mailund, T. & Racimo, Fernando, 2019, I: Genome Research. 29, 9, s. 1506-1520Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits
Chen, L., Qin, Q., Jiang, Y., Wang, K., Lin, Z., Li, Z., Bibi, F., Yang, Y., Wang, J., Nie, W., Su, W., Liu, G., Li, Q., Fu, W., Pan, X., Liu, C., Yang, J., Zhang, C., Yin, Y., Wang, Y. & 32 flere, , 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1152-Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population genomic footprints of environmental pollution pressure in natural populations of the Mediterranean mussel
Ribeiro, Â. M., Canchaya, C. A., Penaloza, F., Galindo, J. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, jun. 2019, I: Marine Genomics. 45, s. 11-15Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux
da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, , 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adaptive venom evolution and toxicity in octopods is driven by extensive novel gene formation, expansion, and loss
Whitelaw, B. L., Cooke, I. R., Finn, J., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ritschard, E. A., Gilbert, M Thomas P, Simakov, O. & Strugnell, J. M., 2020, I: GigaScience. 9, 11, 15 s., giaa120.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cartilaginous fishes offer unique insights into the evolution of the nuclear receptor gene repertoire in gnathostomes
Fonseca, E., Machado, A. M., Vilas-Arrondo, N., Gomes-dos-Santos, A., Verissimo, A., Esteves, P., Almeida, T., Themudo, G., Ruivo, R., Perez, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Santos, M. M., Froufe, E., Roman-Marcote, E., Venkatesh, B. & Castro, L. F. C., 2020, I: General and Comparative Endocrinology. 295, 10 s., 113527.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics
Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, , 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evolution of the extracytoplasmic function σ factor protein family
Pinto, D. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2020, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 2, 1, 13 s., lqz026.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Link Your Sites (LYS) Scripts: Automated Search of Protein Structures and Mapping of Sites Under Positive Selection Detected by PAML
Sanz Moreta, Lys & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2020, I: Evolutionary Biology. 47, 3, s. 240-245 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Liver transcriptome resources of four commercially exploited teleost species
Machado, A. M., Muñoz-Merida, A., Fonseca, E., Veríssimo, A., Pinto, R., Felício, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2020, I: Scientific Data. 7, 9 s., 214.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Losing Genes: The Evolutionary Remodeling of Cetacea Skin
Espregueira Themudo, G., Alves, L. Q., Machado, A. M., Lopes-Marques, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Fonseca, M., Ruivo, R. & Castro, L. F. C., 2020, I: Frontiers in Marine Science. 7, 592375.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Declining genetic diversity of European honeybees along the twentieth century
Themudo, G. E., Rey de la Iglesia, Alba, Tascón, L. R., Jensen, Annette Bruun, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Campos, P. F., 29 jun. 2020, I: Scientific Reports. 10, 12 s., 10520.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Comparative genomics provides insights into the aquatic adaptations of mammals
Yuan, Y., Zhang, Y., Zhang, P., Liu, C., Wang, J., Gao, H., Rus Hoelzel, A., Seim, I., Lv, M., Lin, M., Dong, L., Gao, H., Yang, Z., Caruso, F., Lin, W., Da Fonseca, R. R., Wang, D., Wang, X., Rasmussen, M. H., Liu, M. & 21 flere, , 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 37, 9 s., e2106080118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High genetic diversity and low differentiation reflect the ecological versatility of the African leopard
Chrzanová Pecnerová, Patrícia, Garcia Erill, Genís, Liu, Xiaodong, Nursyifa, Casia, Waples, R. K., Santander, Cindy, Quinn, Liam James Elgaard, Frandsen, P., Meisner, Jonas, Stæger, Frederik Filip Vinggaard, Rasmussen, Malthe Sebro, Brüniche-Olsen, Anna, Jørgensen, C. H. F., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Siegismund, Hans Redlef, Albrechtsen, Anders, Heller, Rasmus, Moltke, Ida & Hanghøj, Kristian Ebbesen, 2021, I: Current Biology. 31, 9, s. 1862-1871, e1-e5Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Response of an Afro-Palearctic bird migrant to glaciation cycles
Thorup, Kasper, Pedersen, L., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Naimi, B., Nogues, David Bravo, Krapp, M., Manica, A., Willemoes, M., Sjöberg, Sissel, Feng, S., Chen, G., Rey de la Iglesia, Alba, Campos, P. F., Beyer, R., Araújo, M. B., Hansen, Anders Johannes, KU, thw266, Tøttrup, Anders P. & Rahbek, Carsten, 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 52, 8 s., e2023836118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Crown Pearl: a draft genome assembly of the European freshwater pearl mussel Margaritifera margaritifera (Linnaeus, 1758)
Gomes-dos-Santos, A., Lopes-Lima, M., Machado, A. M., Ramos, A. M., Usié, A., Bolotov, I. N., Vikhrev, I. V., Breton, S., Castro, L. F. C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Geist, J., Österling, M. E., Prié, V., Teixeira, A., Gan, H. M., Simakov, O. & Froufe, E., 2021, I: DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes. 28, 2, 10 s., dsab002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Using UCEs to track the influence of sea‐level change on leafy seadragon populations
Stiller, Josefin, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Alfaro, M. E., Faircloth, B. C., Wilson, N. G. & Rouse, G. W., 2021, I: Molecular Ecology. s. 1364-1380Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Conservation genomics of the endangered Seychelles Magpie-Robin (Copsychus sechellarum): a unique insight into the history of a precious endemic bird
Cavill, Emily Louisa, Gopalakrishnan, Shyam, Puetz, Lara Christine, Ribeiro, Â. M., Mak, Sarah Siu Tze, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Antunes Pacheco, George, Dunlop, B., Accouche, W., Shah, N., Zora, A., Calabrese, L., Genner, M., Jones, G., Guo, C., KU, thw266 & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Ibis. 164, 2, s. 396-410 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Iron age genomic data from Althiburos – Tunisia renew the debate on the origins of African taurine cattle
Ginja, C., Guimarães, S., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Rasteiro, R., Rodríguez-Varela, R., Simões, L. G., Sarmento, C., Belarte, M. C., Kallala, N., Torres, J. R., Sanmartí, J., Arruda, A. M., Detry, C., Davis, S., Matos, J., Götherström, A., Pires, A. E. & Valenzuela-Lamas, S., 2023, I: iScience. 26, 7, 17 s., 107196.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2024
- Udgivet
Fertilizer regime and cultivar affect barley growth and rhizobiome composition
Kindtler, Nikolaj Lunding, Sheikh, Sanea, Richardy, J., Krogh, E., Maccario, Lorrie, Vestergård, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ekelund, Flemming & Laursen, Kristian Holst, 2024, I: Applied Soil Ecology. 198, 13 s., 105384.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Introgression and disruption of migration routes have shaped the genetic integrity of wildebeest populations
Liu, X., Lin, L., Sinding, M. H. S., Bertola, L. D., Hanghøj, K., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Rasmussen, M. S., Schubert, M., Pečnerová, P., Balboa, R. F., Li, Z., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Pinto, R. R., Wang, X., Kuja, J., Brüniche-Olsen, A., Meisner, J., Santander, C. G. & 8 flere, , 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 2921.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population Genomics Reveals the Underlying Structure of the Small Pelagic European Sardine and Suggests Low Connectivity within Macaronesia
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Campos, P. F., Rey de la Iglesia, Alba, Barroso, G. V., Bergeron, Lucie Adrienne, Nande, M., Tuya, F., Abidli, S., Pérez, M., Riveiro, I., Carrera, P., Jurado-Ruzafa, A., Santamaría, M. T. G., Faria, R., Machado, A. M., Fonseca, M. M., Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2024, I: Genes. 15, 2, 15 s., 170.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 33270633
Flest downloads
-
3000
downloads
DivA: detection of non-homologous and very divergent regions in protein sequence alignments
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1039
downloads
The elusive nature of adaptive mitochondrial DNA evolution of an Arctic lineage prone to frequent introgression
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1001
downloads
Ancient genomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet