Ole Winther
Professor MSO, Gæsteprofessor
- 2006
- Udgivet
Growth-rate regulated genes have profound impact on interpretation of transcriptome profiling in Saccharomyces cerevisiae
Regenberg, Birgitte, Grotkjaer, T., Winther, Ole, Fausbøll, A., Akesson, M., Bro, C., Hansen, L. K., Brunak, Søren & Nielsen, Jens Bo, 2006, I: Genome Biology (Online Edition). 7, 11, s. R107Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Robust multi-scale clustering of large DNA microarray datasets with the consensus algorithm
Grotkjær, T., Winther, Ole, Regenberg, Birgitte, Nielsen, J. & Hansen, L. K., 2006, I: Bioinformatics. 22, 1, s. 58-67 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
- Udgivet
BayesMD: Flexible Biological Modeling for Motif Discovery
Tang, M. E., Krogh, Anders & Winther, Ole, 2008, I: Journal of Computational Biology. 15, 10, s. 1347-63 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR, the open access database of transcription factor-binding profiles: new content and tools in the 2008 update.
Bryne, J. C., Valen, E., Tang, M. E., Marstrand, T., Winther, Ole, da Piedade, I., Krogh, Anders, Lenhard, B. & Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, Database issue, s. D102-6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
- Udgivet
Discovery of regulatory elements is improved by a discriminatory approach
Valen, E., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Krogh, Anders, 2009, I: PLoS Computational Biology. 5, 11, s. e1000562Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome-wide detection and analysis of hippocampus core promoters using DeepCAGE
Valen, E., Pascarella, G., Chalk, A., Maeda, N., Kojima, M., Kawazu, C., Murata, M., Nishiyori, H., Lazarevic, D., Motti, D., Marstrand, T. T., Tang, M-H. E., Zhao, X., Krogh, A., Winther, O., Arakawa, T., Kawai, J., Wells, C., Daub, C., Harbers, M. & 4 flere, , 2009, I: Genome Research. 19, 2, s. 255-65 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RSK is a principal effector of the RAS-ERK pathway for eliciting a coordinate promotile/invasive gene program and phenotype in epithelial cells
Doehn, U., Hauge, C., Frank, S. R., Jensen, C. A. J., Duda, K., Nielsen, J. V., Cohen, M. S., Johansen, Jens Vilstrup, Winther, B. R., Lund, L. R., Winther, Ole, Taunton, J., Hansen, S. H. & Frödin, Morten, 2009, I: Molecular Cell. 35, 4, s. 511-22 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line
Suzuki, H., Forrest, A. R. R., van Nimwegen, E., Daub, C. O., Balwierz, P. J., Irvine, K. M., Lassmann, T., Ravasi, T., Hasegawa, Y., de Hoon, M. J. L., Katayama, S., Schroder, K., Carninci, P., Tomaru, Y., Kanamori-Katayama, M., Kubosaki, A., Akalin, A., Ando, Y., Arner, E., Asada, M. & 31 flere, , 2009, I: Nature Genetics. 41, 5, s. 553-62 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
- Udgivet
Molecular signatures of thyroid follicular neoplasia
Helweg-Larsen, R. B., Rossing, M., Henao Giraldo, R., Yamamoto, Y., Krogdahl, A., Godballe, C., Winther, Ole, Kiss, K., Christensen, L. H., Høgdall, Estrid Vilma Solyom, Bennedbæk, F. N. & Nielsen, Finn Cilius, 2010, I: Endocrine - Related Cancer. 17, 3, s. 691-708 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements
Carstensen, L., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Hansen, Niels Richard, 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, s. 456Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional regulation of gene expression clusters in motor neurons following spinal cord injury
Ryge, J., Winther, Ole, Wienecke, Jacob, Sandelin, Albin Gustav, Westerdahl, A., Hultborn, Hans & Kiehn, O., 2010, I: BMC Genomics. 11, 1, s. 365 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
Gene expression of the endolymphatic sac
Friis, M., Martin-Bertelsen, T., Friis-Hansen, Lennart Jan, Winther, Ole, Henao Giraldo, R., Sørensen, Mads Sølvsten & Qvortrup, Klaus, 2011, I: Acta Oto-Laryngologica. 131, 12, s. 1257-63 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Down-regulation of microRNAs controlling tumourigenic factors in follicular thyroid carcinoma
Rossing, M., Helweg-Larsen, R. B., Henao Giraldo, R., Winther, Ole, Vikeså, J., Niazi, O., Godballe, C., Krogdahl, A., Glud, M., Sørensen, C. H., Kiss, K., Bennedbæk, F. N. & Nielsen, Finn Cilius, 2012, I: Journal of Molecular Endocrinology. 48, 1, s. 11-23 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Integrative analyses reveal novel strategies in HPV11,-16 and -45 early infection
Kaczkowski, B., Rossing, M., Andersen, D. K., Dreher, A., Morevati, M., Visser, M. A., Winther, Ole, Nielsen, Finn Cilius & Norrild, B., 2012, I: Scientific Reports. 2, s. 515Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Predictive active set selection methods for Gaussian processes
Henao, R. & Winther, Ole, 2012, I: Neurocomputing. 80, s. 10-18 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
Enterococcus faecalis infection causes inflammation, intracellular oxphos-independent ROS production, and DNA damage in human gastric cancer cells
Strickertsson, J. A. B., Desler, Claus, Martin-Bertelsen, T., Machado, A. M. D., Wadstrøm, T., Winther, Ole, Rasmussen, Lene Juel & Friis-Hansen, Lennart Jan, 2013, I: PLOS ONE. 8, 4, s. 1-13 13 s., e63147.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
HemaExplorer: a database of mRNA expression profiles in normal and malignant haematopoiesis
Bagger, F. O., Rapin, N. P. J., Theilgaard-Mønch, Kim, Kaczkowski, B., Thorén, L. A. M., Jendholm, L. J., Winther, Ole & Porse, Bo Torben, 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, Database issue, s. D1034-D1039 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Improving The Analysis Of Gene Expression Profiles By Comparing AML Blasts With Their Nearest Normal Counterparts
Rapin, N., Bagger, F. O., Jendholm, J., Mora-Jensen, H. I., Krogh, Anders, Kohlmann, A., Thiede, C., Borregaard, N., Bullinger, L., Winther, Ole, Theilgaard-Mønch, Kim & Porse, Bo Torben, 2013, I: Blood. 122, 21Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Literature classification for semi-automated updating of biological knowledgebases
Olsen, L. R., Kudahl, U. J., Winther, Ole & Brusic, V., 2013, I: B M C Genomics. 14(Suppl 5), 10 s., S14.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
Bioinformatics for cancer immunotherapy target discovery
Olsen, L. R., Campos, B., Stein Barnkob, M., Winther, Ole, Brusic, V. & Andersen, M. H., 2014, I: Cancer Immunology, Immunotherapy. 63, 12, s. 1235-1249 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bone signaling in middle ear development: a genome-wide differential expression analysis
Nielsen, M. C., Martin-Bertelsen, T., Friis, M., Winther, Ole, Friis-Hansen, Lennart Jan, Cayé-Thomasen, Per & Sørensen, Mads Sølvsten, 2014, I: Anatomical Record. 297, 12, s. 2349-2355 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
MicroRNA expression analysis and Multiplex ligation-dependent probe amplification in metastatic and non-metastatic uveal melanoma
Larsen, A., Holst, L. M., Kaczkowski, B., Andersen, M. T., Manfé, V., Siersma, Volkert Dirk, Kolko, Miriam, Kiilgaard, Jens Folke, Winther, Ole, Prause, J. U., Gniadecki, R. & Heegaard, Steffen, 2014, I: Acta Ophthalmologica. 92, 6, s. 541-549Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tumor antigens as proteogenomic biomarkers in invasive ductal carcinomas
Olsen, L. R., Campos, B., Winther, Ole, Sgroi, D. C., Karger, B. L. & Brusic, V., 2014, I: B M C Medical Genomics. 7, 3, s. 1-13 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparing cancer vs normal gene expression profiles identifies new disease entities and common transcriptional programs in AML patients
Rapin, N. P. J., Bagger, F. O., Jendholm, L. J., Mora-Jensen, H., Krogh, Anders, Kohlmann, A., Thiede, C., Borregaard, N., Bullinger, L., Winther, Ole, Theilgaard-Mønch, Kim & Porse, Bo Torben, 6 feb. 2014, I: Blood (online). 123, 6, s. 894-904 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
- Udgivet
A computational method for identification of vaccine targets from protein regions of conserved human leukocyte antigen binding
Olsen, L. R., Simon, C., Kudahl, U. J., Bagger, F. O., Winther, Ole, Reinherz, E. L., Zhang, G. L. & Brusic, V., 2015, I: B M C Medical Genomics. 8, Suppl 4, 6 s., 5.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 171145930
Flest downloads
-
2986
downloads
Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2481
downloads
HemaExplorer: a database of mRNA expression profiles in normal and malignant haematopoiesis
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
984
downloads
Enterococcus faecalis infection causes inflammation, intracellular oxphos-independent ROS production, and DNA damage in human gastric cancer cells
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet