Matthias Mann

Matthias Mann

Professor, forskningschef, Professor


  1. 2016
  2. Glucose-regulated and drug-perturbed phosphoproteome reveals molecular mechanisms controlling insulin secretion

    Sacco, F., Humphrey, S. J., Cox, J., Mischnik, M., Schulte, A., Klabunde, T., Schäfer, M. & Mann, Matthias, 14 nov. 2016, I: Nature Communications. 7, s. 13250

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. A genome-wide resource for the analysis of protein localisation in Drosophila

    Sarov, M., Barz, C., Jambor, H., Hein, M. Y., Schmied, C., Suchold, D., Stender, B., Janosch, S., K J, V. V., Krishnan, R. T., Krishnamoorthy, A., Ferreira, I. R. S., Ejsmont, R. K., Finkl, K., Hasse, S., Kämpfer, P., Plewka, N., Vinis, E., Schloissnig, S., Knust, E. & 6 flere, Hartenstein, V., Mann, Matthias, Ramaswami, M., VijayRaghavan, K., Tomancak, P. & Schnorrer, F., 20 feb. 2016, I: eLife. 5, s. e12068

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Glutathione peroxidase 3 localizes to the epithelial lining fluid and the extracellular matrix in interstitial lung disease

    Schamberger, A. C., Schiller, H. B., Fernandez, I. E., Sterclova, M., Heinzelmann, K., Hennen, E., Hatz, R., Behr, J., Vašáková, M., Mann, Matthias, Eickelberg, O. & Staab-Weijnitz, C. A., 20 jul. 2016, I: Scientific Reports. 6, s. 29952

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. C9ORF72 interaction with cofilin modulates actin dynamics in motor neurons

    Sivadasan, R., Hornburg, D., Drepper, C., Frank, N., Jablonka, S., Hansel, A., Lojewski, X., Sterneckert, J., Hermann, A., Shaw, P. J., Ince, P. G., Mann, Matthias, Meissner, F. & Sendtner, M., dec. 2016, I: Nature Neuroscience. 19, 12, s. 1610-1618 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Phosphoproteomics reveals that Parkinson's disease kinase LRRK2 regulates a subset of Rab GTPases

    Steger, M., Tonelli, F., Ito, G., Davies, P., Trost, M., Vetter, M., Wachter, S., Lorentzen, E., Duddy, G., Wilson, S., Baptista, M. A., Fiske, B. K., Fell, M. J., Morrow, J. A., Reith, A. D., Alessi, D. R. & Mann, Matthias, 29 jan. 2016, I: eLife. 5

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Homology-driven assembly of NOn-redundant protEin sequence sets (NOmESS) for mass spectrometry

    Temu, T., Mann, Matthias, Räschle, M. & Cox, J., 1 maj 2016, I: Bioinformatics (Online). 32, 9, s. 1417-9 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Proteomic maps of breast cancer subtypes

    Tyanova, S., Albrechtsen, Reidar, Kronqvist, P., Cox, J., Mann, Matthias & Geiger, T., 4 jan. 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 10259.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. The Perseus computational platform for comprehensive analysis of (prote)omics data

    Tyanova, S., Temu, T., Sinitcyn, P., Carlson, A., Hein, M. Y., Geiger, T., Mann, Matthias & Cox, J., sep. 2016, I: Nature Methods. 13, 9, s. 731-40 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Oxyntomodulin Identified as a Marker of Type 2 Diabetes and Gastric Bypass Surgery by Mass-spectrometry Based Profiling of Human Plasma

    Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Hornburg, D., Albrechtsen, Reidar, Svendsen, B., Toräng, S., Jepsen, Sara Lind, Kuhre, Rune Ehrenreich, Hansen, M., Janus, C., Floyd, A., Lund, Asger Bach, Vilsbøll, Tina, Knop, Filip Krag, drb459, drb459, Deacon, Carolyn F., Meissner, F., Mann, Matthias, Holst, Jens Juul & Hartmann, Bolette, maj 2016, I: EBioMedicine. 7, s. 112-120 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Proteomics to study DNA-bound and chromatin-associated gene regulatory complexes

    Wierer, M. & Mann, Matthias, 1 okt. 2016, I: Human Molecular Genetics. 25, R2, s. R106-R114

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. A Proteomics Approach to the Protein Normalization Problem: Selection of Unvarying Proteins for MS-Based Proteomics and Western Blotting

    Wiśniewski, J. R. & Mann, Matthias, 1 jul. 2016, I: Journal of Proteome Research. 15, 7, s. 2321-6 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Cytoplasmic protein aggregates interfere with nucleocytoplasmic transport of protein and RNA

    Woerner, A. C., Frottin, F., Hornburg, D., Feng, L. R., Meissner, F., Patra, M., Tatzelt, J., Mann, Matthias, Winklhofer, K. F., Hartl, F. U. & Hipp, M. S., 8 jan. 2016, I: Science (New York, N.Y.). 351, 6269, s. 173-6 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. 2015
  15. Udgivet

    Mass Spectrometry of Human Leukocyte Antigen Class I Peptidomes Reveals Strong Effects of Protein Abundance and Turnover on Antigen Presentation

    Bassani-Sternberg, M., Pletscher-Frankild, S., Jensen, Lars Juhl & Mann, Matthias, mar. 2015, I: Molecular and Cellular Proteomics. 14, 3, s. 658-73 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Deep proteomics of mouse skeletal muscle enables quantitation of protein isoforms, metabolic pathways and transcription factors

    Deshmukh, Atul Shahaji, Murgia, M., Nagaraja, N., Treebak, Jonas Thue, Cox, J. & Mann, Matthias, apr. 2015, I: Molecular and Cellular Proteomics. 14, 4, s. 841-853

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Secretome Analysis of Lipid-Induced Insulin Resistance in Skeletal Muscle Cells by a Combined Experimental and Bioinformatics Workflow

    Deshmukh, Atul Shahaji, Cox, J., Jensen, Lars Juhl, Meissner, F. & Mann, Matthias, 6 nov. 2015, I: Journal of Proteome Research. 14, 11, s. 4885-95 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Systems Analyses Reveal Shared and Diverse Attributes of Oct4 Regulation in Pluripotent Cells

    Ding, L., Paszkowski-Rogacz, M., Winzi, M., Chakraborty, D., Theis, M., Singh, S., Ciotta, G., Poser, I., Roguev, A., Chu, W. K., Choudhary, Chunaram, Mann, Matthias, Stewart, A. F., Krogan, N. & Buchholz, F., 26 aug. 2015, I: Cell Systems. 1, 2, s. 141-151 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Antisense-mediated exon skipping: a therapeutic strategy for titin-based dilated cardiomyopathy

    Gramlich, M., Pane, L. S., Zhou, Q., Chen, Z., Murgia, M., Schötterl, S., Goedel, A., Metzger, K., Brade, T., Parrotta, E., Schaller, M., Gerull, B., Thierfelder, L., Aartsma-Rus, A., Labeit, S., Atherton, J. J., McGaughran, J., Harvey, R. P., Sinnecker, D., Mann, M. & 3 flere, Laugwitz, K., Gawaz, M. P. & Moretti, A., 9 mar. 2015, I: EMBO Molecular Medicine. 7, 5, s. 562-576 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. A double-barrel LC-MS/MS system to quantify 96 interactomes per day

    Hosp, F., Scheltema, R. A., Eberl, C., Kulak, N. A., Keilhauer, E. C., Mayr, K. & Mann, Matthias, 17 apr. 2015, I: Molecular and Cellular Proteomics. 14, 7, s. 2030-41 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Single muscle fiber proteomics reveals unexpected mitochondrial specialization

    Murgia, M., Nagaraj, N., Deshmukh, Atul Shahaji, Zeiler, M., Cancellara, P., Moretti, I., Reggiani, C., Schiaffino, S. & Mann, Matthias, 1 mar. 2015, I: E M B O Reports. 16, 3, s. 387-95 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Proteomics reveals dynamic assembly of repair complexes during bypass of DNA cross-links

    Räschle, M., Smeenk, G., Hansen, R. K., Temu, T., Oka, Y., Hein, M. Y., Nagaraj, N., Long, D. T., Walter, J. C., Hofmann, K., Storchova, Z., Cox, J., Bekker-Jensen, Simon Holst, Mailand, Niels & Mann, Matthias, 2015, I: Science. 348, 6234, s. 539- 10 s., 1253671.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Mitochondrial specialization revealed by single muscle fiber proteomics: focus on the Krebs cycle

    Schiaffino, S., Reggiani, C., Kostrominova, T. Y., Mann, Matthias & Murgia, M., dec. 2015, I: Scandinavian Journal of Medicine & Science in Sports. 25, Suppl 4, s. 41-8 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  24. 2014
  25. Udgivet

    The growing landscape of lysine acetylation links metabolism and cell signalling

    Choudhary, Chunaram, Weinert, B. T., Nishida, Y., Verdin, E. & Mann, Matthias, 23 jul. 2014, I: Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 15, 8, s. 536-50 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Time-resolved dissection of early phosphoproteome and ensuing proteome changes in response to TGF-β

    J D'Souza, R. C., Knittle, A. M., Nagaraj, N., van Dinther, M., Choudhary, Chunaram, Ten Dijke, P., Mann, Matthias & Sharma, K., jul. 2014, I: Science Signaling. 7, 335, s. rs5 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Specificity and commonality of the phosphoinositide-binding proteome analyzed by quantitative mass spectrometry

    Jungmichel, S., Sylvestersen, K. B., Choudhary, Chunaram, Nguyen, S., Mann, Matthias & Nielsen, Michael Lund, 13 feb. 2014, I: Cell Reports. 6, 3, s. 578-91 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Overexpression of Q-rich prion-like proteins suppresses polyQ cytotoxicity and alters the polyQ interactome

    Ripaud, L., Chumakova, V., Antonin, M., Hastie, A. R., Pinkert, S., Körner, R., Ruff, K. M., Pappu, R. V., Hornburg, D., Mann, Matthias, Hartl, F. U. & Hipp, M. S., 23 dec. 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 51, s. 18219-24 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. 2013
  30. A systematic mammalian genetic interaction map reveals pathways underlying ricin susceptibility

    Bassik, M. C., Kampmann, M., Lebbink, R. J., Wang, S., Hein, M. Y., Poser, I., Weibezahn, J., Horlbeck, M. A., Chen, S., Mann, Matthias, Hyman, A. A., Leproust, E. M., McManus, M. T. & Weissman, J. S., 14 feb. 2013, I: Cell. 152, 4, s. 909-22 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Quantification of the N-glycosylated secretome by super-SILAC during breast cancer progression and in human blood Samples

    Boersema, P. J., Geiger, T., Wiśniewski, J. R. & Mann, Matthias, 1 jan. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 1, s. 158-171 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. DEAD box protein DDX1 regulates cytoplasmic localization of KSRP

    Chou, C., Lin, W., Lin, C., Luber, C. A., Godbout, R., Mann, Matthias & Chen, C., 4 sep. 2013, I: P L o S One. 8, 9, e73752.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  33. N-linked glycosylation enrichment for in-depth cell surface proteomics of diffuse large B-cell lymphoma subtypes

    Deeb, S. J., Cox, J., Schmidt-Supprian, M. & Mann, Matthias, 4 nov. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Initial quantitative proteomic map of 28 mouse tissues using the SILAC mouse

    Geiger, T., Velic, A., Macek, B., Lundberg, E., Kampf, C., Nagaraj, N., Uhlen, M., Cox, J. & Mann, Matthias, jun. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 6, s. 1709-22 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Interaction between AP-5 and the hereditary spastic paraplegia proteins SPG11 and SPG15

    Hirst, J., Borner, G. H. H., Edgar, J., Hein, M. Y., Mann, Matthias, Buchholz, F., Antrobus, R. & Robinson, M. S., aug. 2013, I: Molecular Biology of the Cell. 24, 16, s. 2558-69 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. HOT1 is a mammalian direct telomere repeat-binding protein contributing to telomerase recruitment

    Kappei, D., Butter, F., Benda, C., Scheibe, M., Draškovič, I., Stevense, M., Novo, C. L., Basquin, C., Araki, M., Araki, K., Krastev, D. B., Kittler, R., Jessberger, R., Londoño-Vallejo, J. A., Mann, Matthias & Buchholz, F., 12 jun. 2013, I: E M B O Journal. 32, 12, s. 1681-701 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Quantitative proteomic analysis reveals concurrent RNA-protein interactions and identifies new RNA-binding proteins in Saccharomyces cerevisiae

    Klass, D. M., Scheibe, M., Butter, F., Hogan, G. J., Mann, Matthias & Brown, P. O., jun. 2013, I: Genome Research. 23, 6, s. 1028-38 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Protein correlation profiles identify lipid droplet proteins with high confidence

    Krahmer, N., Hilger, M., Kory, N., Wilfling, F., Stoehr, G., Mann, Matthias, Farese, R. V. & Walther, T. C., maj 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 5, s. 1115-26 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. The proteome of the calcified layer organic matrix of turkey (Meleagris gallopavo) eggshell

    Mann, K. & Mann, Matthias, 2013, I: Proteome Science. 11, 1, s. 40

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    The Coming Age of Complete, Accurate, and Ubiquitous Proteomes

    Mann, Matthias, Kulak, N. A., Nagaraj, N. & Cox, J., 21 feb. 2013, I: Molecular Cell. 49, 4, s. 583-590 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. A large synthetic peptide and phosphopeptide reference library for mass spectrometry-based proteomics

    Marx, H., Lemeer, S., Schliep, J. E., Matheron, L., Mohammed, S., Cox, J., Mann, Matthias, Heck, A. J. R. & Kuster, B., jun. 2013, I: Nature Biotechnology. 31, 6, s. 557-64 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Direct proteomic quantification of the secretome of activated immune cells

    Meissner, F., Scheltema, R. A., Mollenkopf, H. & Mann, Matthias, 26 apr. 2013, I: Science (New York, N.Y.). 340, 6131, s. 475-8 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. High performance computational analysis of large-scale proteome data sets to assess incremental contribution to coverage of the human genome

    Neuhauser, N., Nagaraj, N., McHardy, P., Zanivan, S., Scheltema, R., Cox, J. & Mann, Matthias, 7 jun. 2013, I: Journal of Proteome Research. 12, 6, s. 2858-68 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Status of large-scale analysis of post-translational modifications by mass spectrometry

    Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 nov. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, s. 3444-52

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Proteomic and genetic analyses demonstrate that Plasmodium berghei blood stages export a large and diverse repertoire of proteins

    Pasini, E. M., Braks, J. A., Fonager, J., Klop, O., Aime, E., Spaccapelo, R., Otto, T. D., Berriman, M., Hiss, J. A., Thomas, A. W., Mann, Matthias, Janse, C. J., Kocken, C. H. M. & Franke-Fayard, B., feb. 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 2, s. 426-48 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Alleles of a polymorphic ETV6 binding site in DCDC2 confer risk of reading and language impairment

    Powers, N. R., Eicher, J. D., Butter, F., Kong, Y., Miller, L. L., Ring, S. M., Mann, Matthias & Gruen, J. R., 11 jul. 2013, I: American Journal of Human Genetics. 93, 1, s. 19-28 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Stabilization of integrin-linked kinase by the Hsp90-CHIP axis impacts cellular force generation, migration and the fibrotic response

    Radovanac, K., Morgner, J., Schulz, J., Blumbach, K., Patterson, C., Geiger, T., Mann, Matthias, Krieg, T., Eckes, B., Fässler, R. & Wickström, S. A., 15 maj 2013, I: E M B O Journal. 32, 10, s. 1409-24 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Proteomic approaches in circadian biology

    Robles, M. S. & Mann, Matthias, 2013, Handbook of experimental pharmacology: Circadian Clocks. s. 389-407 19 s. (Handbook of Experimental Pharmacology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiFormidling

  49. Quantitative interaction screen of telomeric repeat-containing RNA reveals novel TERRA regulators

    Scheibe, M., Arnoult, N., Kappei, D., Buchholz, F., Decottignies, A., Butter, F. & Mann, Matthias, 22 okt. 2013, I: Genome Research.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Quantitative interaction screen of telomeric repeat-containing RNA reveals novel TERRA regulators

    Scheibe, M., Arnoult, N., Kappei, D., Buchholz, F., Decottignies, A., Butter, F. & Mann, Matthias, 22 okt. 2013, I: Genome Research.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. β1- and αv-class integrins cooperate to regulate myosin II during rigidity sensing of fibronectin-based microenvironments

    Schiller, H. B., Hermann, M., Polleux, J., Vignaud, T., Zanivan, S., Friedel, C. C., Sun, Z., Raducanu, A., Gottschalk, K., Théry, M., Mann, Matthias & Fässler, R., jun. 2013, I: Nature Cell Biology. 15, 6, s. 625-36 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  52. The chromodomain helicase Chd4 is required for Polycomb-mediated inhibition of astroglial differentiation

    Sparmann, A., Xie, Y., Verhoeven, E., Vermeulen, M., Lancini, C., Gargiulo, G., Hulsman, D., Mann, Matthias, Knoblich, J. A. & van Lohuizen, M., 29 maj 2013, I: E M B O Journal. 32, 11, s. 1598-612 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. A SILAC-based approach identifies substrates of caspase-dependent cleavage upon TRAIL-induced apoptosis

    Stoehr, G., Schaab, C., Graumann, J. & Mann, Matthias, maj 2013, I: Molecular & Cellular Proteomics. 12, 5, s. 1436-50 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    The SH2 domain interaction landscape

    Tinti, M., Kiemer, L., Costa, S., Miller, M. L., Sacco, F., Olsen, Jesper Velgaard, Carducci, M., Paoluzi, S., Langone, F., Workman, C., Blom, N., Machida, K., Thompson, C. M., Schutkowski, M., Brunak, Søren, Mann, Matthias, Mayer, B. J., Castagnoli, L. & Cesareni, G., 2013, I: Cell Reports. 3, 4, s. 1293-1305 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 5650809