Sune Darkner
Lektor
Image Analysis, Computational Modelling and Geometry
Universitetsparken 1
2100 København Ø
- Udgivet
Collision-constrained deformable image registration framework for discontinuity management
Alscher, Thomas Michael, Erleben, Kenny & Darkner, Sune, 2023, I: PLoS ONE. 18, 8, 15 s., e0290243.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Jet-based local image descriptors
Boesen Lindbo Larsen, A., Darkner, Sune, Dahl, A. L. & Steenstrup Pedersen, Kim, 2012, Computer Vision – ECCV 2012: 12th European Conference on Computer Vision, Florence, Italy, October 7-13, 2012, Proceedings, Part III. Fitzgibbon, A., Lazebnik, S., Perona, P., Sato, Y. & Schmid, C. (red.). Springer, s. 638-650 13 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7574).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Contact modeling from images using cut finite element solvers
Claus, S., Kerfriden, P., nsv780, nsv780, Darkner, Sune, Erleben, Kenny & Wong, Christian, 2021, I: Advanced Modeling and Simulation in Engineering Sciences. 8, 1, s. 1-23 13.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Revisiting Transformer-based Models for Long Document Classification
Dai, X., Chalkidis, Ilias, Darkner, Sune & Elliott, Desmond, 2022, Findings of the Association for Computational Linguistics: EMNLP 2022. Association for Computational Linguistics, s. 7212–7230Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Generalized Partial Volume: an inferior density estimator to Parzen Windows for normalized mutual information
Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2011, Information Processing in Medical Imaging: 22nd International Conference, IPMI 2011, Kloster Irsee, Germany, July 3-8, 2011. Proceedings. Székely, G. & Hahn, H. K. (red.). Springer, s. 436-447 12 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6801).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A hyper elasticity method for interactive virtual design of hearing aids: a parallel method for general non-linear hyper elasticity modeling
Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2011, I: Visual Computer. 27, 6, s. 645-653 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Locally orderless registration
Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2013, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 35, 6, s. 1437-1450 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Data driven constraints for the SVM
Darkner, Sune & Clemmensen, L. H., 2012, Machine Learning in Medical Imaging: Third International Workshop, MLMI 2012, Held in Conjunction with MICCAI 2012, Nice, France, October 1, 2012, Revised Selected Papers. Wang, F., Shen, D., Yan, P. & Suzuki, K. (red.). Springer, s. 70-77 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 7588).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
First Order Locally Orderless Registration
Darkner, Sune, Vidarte, J. D. T. & Lauze, Francois Bernard, 2021, Scale Space and Variational Methods in Computer Vision - 8th International Conference, SSVM 2021, Proceedings. Elmoataz, A., Fadili, J., Quéau, Y., Rabin, J. & Simon, L. (red.). Springer, s. 177-188 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 12679 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Collocation for diffeomorphic deformations in medical image registration
Darkner, Sune, Pai, A. S. U., Liptrot, M. G. & Sporring, Jon, 2018, I: I E E E Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 40, 7, s. 1570-1583Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient hyperelastic regularization for registration
Darkner, Sune, Hansen, M. S., Larsen, R. & Hansen, M. F., 2011, Image Analysis: 17th Scandinavian Conference, SCIA 2011, Ystad, Sweden, May 2011. Proceedings. Heyden, A. & Kahl, F. (red.). Springer, s. 295-305 11 s. (Lecture notes in computer science, Bind 6688).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Locally Orderless Registration
Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2012, arxiv.org, 14 s.Publikation: Working paper › Preprint
- Udgivet
Locally orderless registration code: fast normalized mutual information and P-Norm for MATLAB
Darkner, Sune & Sporring, Jon, 2012Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Softwareprogram › Forskning
- Udgivet
FDG-PET template MNI152 1mm
Darkner, Sune, 2013Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Datasæt › Forskning
- Udgivet
OpenJaw Dataset
Gholamalizadeh, T., Darkner, Sune, Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 2021Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Datasæt › Forskning
- Udgivet
A multi-patient analysis of the center of rotation trajectories using finite element models of the human mandible
Gholamalizadeh, T., Darkner, Sune, Søndergaard, P. L. & Erleben, Kenny, 2021, I: PLoS ONE. 16, 11 November, 16 s., e0259794.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mandibular Teeth Movement Variations in Tipping Scenario: A Finite Element Study on Several Patients
Gholamalizadeh, T., Darkner, Sune, Cattaneo, P. M., Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 2020. 10 s.Publikation: Konferencebidrag › Paper › Forskning
- Udgivet
Open-Full-Jaw: An open-access dataset and pipeline for finite element models of human jaw
Gholamalizadeh, T., nsv780, nsv780, Ferguson, Z., Schneider, T., Panozzo, D., Darkner, Sune, Makaremi, M., Chan, F., Lempel Søndergaard, P. & Erleben, Kenny, 1 sep. 2022, I: Computer Methods and Programs in Biomedicine. 224, 17 s., 107009.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
First-in-man mesenchymal stem cells for radiation-induced xerostomia (MESRIX): study protocol for a randomized controlled trial.
Grønhøj, C., Jensen, D. H., Glovinski, P. V., mpw981, M., Jensen, A. B., Oliveri, R. S., Specht, Lena, Thomsen, C., Darkner, Sune, Kiss, K., Fischer-Nielsen, A. & von Buchwald, Christian, 2017, I: Trials. 18, 1, 10 s., 108.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Safety and Efficacy of Mesenchymal Stem Cells for Radiation-Induced Xerostomia: A Randomized, Placebo-Controlled Phase 1/2 Trial (MESRIX)
Grønhøj, C., Jensen, D. H., Vester-Glowinski, Peter Viktor, Jensen, S. B., Bardow, A., Oliveri, R. S., Fog, L. M., Specht, Lena, Thomsen, C., Darkner, Sune, Jensen, M., Müller, V., Kiss, K., Agander, T., Andersen, E., Fischer-Nielsen, A. & von Buchwald, Christian, 1 jul. 2018, I: International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics. 101, 3, s. 581-592 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deterministic Group Tractography with Local Uncertainty Quantification
Holm, Andreas Nugaard, Feragen, A., Dela Haije, T. & Darkner, Sune, 2019, Computational Diffusion: International MICCAI Workshop, Granada,. Bonet-Carne, E., Grussu, F., Ning, L., Sepehrband, F. & Tax, C. M. W. (red.). 226249 udg. Springer, s. 377-386 (Mathematics and Visualization).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Data Driven Inverse Kinematics of Soft Robots using Local Models
Holsten, F., Engell-norregard, M. P., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2019, 2019 International Conference on Robotics and Automation (ICRA). IEEE, s. 6251-6257Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Information-Theoretic Registration with Explicit Reorientation of Diffusion-Weighted Images
Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard & Darkner, Sune, 2022, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 64, s. 1-16Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Density-based non-rigid registration of diffusion-weighted images
Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard, Nielsen, Mads & Darkner, Sune, apr. 2017.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Locally orderless registration for diffusion weighted images
Jensen, H. G., Lauze, Francois Bernard, Nielsen, Mads & Darkner, Sune, 2015, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2015: 18th international conference, Munich, Germany, October 5-9, 2015, Proceedings, Part II. Navab, N., Hornegger, J., Wells, W. M. & Frangi, A. F. (red.). Springer, s. 305-312 8 s. (Lecture notes in computer science, Bind 9350).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An Automatic DWI/FLAIR Mismatch Assessment of Stroke Patients
Johansen, Jacob, Offersen, C. M., Carlsen, Jonathan Frederik, Ingala, S., Hansen, Adam Espe, Nielsen, Michael Bachmann, Darkner, Sune & Pai, A., 2024, I: Diagnostics. 14, 1, 12 s., 69.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Finding significantly connected voxels based on histograms of connection strengths
Kasenburg, N., Pedersen, M. V. & Darkner, Sune, 2016, Medical Imaging 2016: Image Processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 7 s. 978431. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 39, Bind 17).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural parcellation of the thalamus using shortest-path tractography
Kasenburg, N., Darkner, Sune, Hahn, U., Liptrot, M. G. & Feragen, A., 2016, 2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). IEEE, s. 559-563 5 s. 7493330Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
3D analysis of synaptic vesicle density and distribution after acute foot-shock stress by using serial section transmission electron microscopy
Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R., Wegener, G., Popoli, M. & Sporring, Jon, 2017, I: Journal of Microscopy. 265, 1, s. 101–110 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
3D estimation of synaptic vesicle distributions in serial section transmission electron microscopy
Khanmohammadi, M., Darkner, Sune, Nava, N., Nyengaard, J. R., Wegener, G., Popoli, M. & Sporring, Jon, 2017, I: Journal of Microscopy. 265, 1, s. 101–110 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Automatic correction of dental artifacts in PET/MRI
Ladefoged, C. N., Andersen, F. L., Keller, S., Beyer, T., Law, I., Højgaard, Liselotte, Darkner, Sune & Lauze, Francois Bernard, 2015, I: SPIE Journal of Medical Imaging. 2, 2, 13 s., 024009.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The added effect of artificial intelligence on physicians’ performance in detecting thoracic pathologies on CT and chest X-ray: A systematic review
Li, D., Pehrson, Lea Marie, Lauridsen, C. A., Tøttrup, L., Fraccaro, M., Elliott, Desmond, Zajac, Hubert Dariusz, Darkner, Sune, Carlsen, Jonathan Frederik & Nielsen, Michael Bachmann, 2021, I: Diagnostics. 11, 12, 17 s., 2206.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Performance and Agreement When Annotating Chest X-ray Text Reports - A Preliminary Step in the Development of a Deep Learning-Based Prioritization and Detection System
Li, D., Pehrson, Lea Marie, Bonnevie, R., Fraccaro, M., Thrane, J., Tøttrup, L., Lauridsen, C. A., Balaganeshan, Sedrah Butt, Jankovic, J., Andersen, T. T., Mayar, A., Hansen, Kristoffer Lindskov, Carlsen, Jonathan Frederik, Darkner, Sune & Nielsen, Michael Bachmann, 2023, I: Diagnostics. 13, 6, 24 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Inter- and Intra-Observer Agreement When Using a Diagnostic Labeling Scheme for Annotating Findings on Chest X-rays—An Early Step in the Development of a Deep Learning-Based Decision Support System
Li, D., Pehrson, Lea Marie, Tøttrup, L., Fraccaro, M., Bonnevie, R., Thrane, J., Sørensen, P. J., Rykkje, A., Andersen, T. T., Steglich-Arnholm, H., Stærk, D. M. R., Borgwardt, L., Hansen, Kristoffer Lindskov, Darkner, Sune, Carlsen, Jonathan Frederik & Nielsen, Michael Bachmann, 2022, I: Diagnostics. 12, 12, 3112.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evaluation of WBAA with registration-based cube propagation for brain atrophy quantification
Lillholm, Martin, Pai, A. S. U., Sørensen, L., Nielsen, Mads, Sporring, Jon, Darkner, Sune & Dam, E., 2013. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Streamlet Tractography
Liptrot, M. G., Darkner, Sune, Feragen, A. & Lauze, Francois Bernard, apr. 2017.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Bundle Geodesic Convolutional Neural Network for DWI Segmentation from Single Scan Learning
Liu, Renfei, Lauze, Francois Bernard, Erleben, Kenny & Darkner, Sune, 2021, Computational Diffusion MRI - 12th International Workshop, CDMRI 2021, Held in Conjunction with MICCAI 2021, Proceedings. Cetin-Karayumak, S., Christiaens, D., Figini, M., Guevara, P., Gyori, N., Nath, V. & Pieciak, T. (red.). Springer, s. 121-132 (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 13006 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bundle geodesic convolutional neural network for diffusion-weighted imaging segmentation
Liu, Renfei, Lauze, Francois Bernard, Erleben, Kenny, Berg, Rune W. & Darkner, Sune, 2022, I: Journal of Medical Imaging. 9, 6, 14 s., 064002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
cRedAnno+: Annotation Exploitation In Self-Explanatory Lung Nodule Diagnosis
Lu, J., Yin, C., Erleben, Kenny, Nielsen, Michael Bachmann & Darkner, Sune, 2023, 2023 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2023. IEEE Computer Society Press, (Proceedings - International Symposium on Biomedical Imaging, Bind 2023-April).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reducing Annotation Need in Self-explanatory Models for Lung Nodule Diagnosis
Lu, J., Yin, C., Krause, Oswin, Erleben, Kenny, Nielsen, Michael Bachmann & Darkner, Sune, 2022, Interpretability of Machine Intelligence in Medical Image Computing. Reyes, M., Abreu, PH. & Cardoso, J. (red.). Springer, s. 33-43 (Lecture Notes in Computer Science, Bind 13611).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pseudo-Label Guided Image Synthesis for Semi-Supervised COVID-19 Pneumonia Infection Segmentation
Lyu, F., Ye, M., Carlsen, J. F., Erleben, Kenny, Darkner, Sune & Yuen, P. C., 2023, I: IEEE Transactions on Medical Imaging. 42, 3, s. 797-809Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Vortex Particle Method for Fluid-Character Interaction
Meldgaard, A., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, Proceedings of Graphics Interface 2022: Montréal, Quebec, 16 - 19 May 2022. ACM Press, s. 84-91Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Vortex Particle Method for Fluid-Character Interaction
Meldgaard, A., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, I: OpenReview.net. 2022, 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning
- Udgivet
Combining the boundary shift integral and tensor-based morphometry for brain atrophy estimation
Michalkiewicz, M. D., Pai, A. S. U., Leung, K. K., Sommer, Stefan Horst, Darkner, Sune, Sørensen, L., Sporring, Jon & Nielsen, Mads, 2016, Medical imaging 2016: Image processing. Styner, M. A. & Angelini, E. D. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 978406. (Progress in Biomedical Optics and Imaging).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Direct Geometry Processing Cartilage Generation Method Using Segmented Bone Models from Datasets with Poor Cartilage Visibility
nsv780, nsv780, Nielsen, M. K., Tascon Vidarte, J. D., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, Computational Biomechanics for Medicine: Towards Translation and Better Patient Outcomes. Springer, s. 155.169Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
LibHip: An open-access hip joint model repository suitable for finite element method simulation
nsv780, nsv780, Gholamalizadeh, T., Ferguson, Z., Schneider, T., Nielsen, Michael Bachmann, Panozzo, D., Darkner, Sune & Erleben, Kenny, 2022, I: Computer Methods and Programs in Biomedicine. 226, 14 s., 107140.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Automatic measurement of wrist synovitis from contrast-enhanced MRI: a registration-centered approach
Mysling, P., Darkner, Sune, Sporring, Jon, Dam, E. & Lillholm, Martin, 2013, Medical Imaging 2013: Image Processing. Ourselin, S. & Haynor, D. R. (red.). SPIE - International Society for Optical Engineering, 6 s. 86692U. (Progress in Biomedical Optics and Imaging; Nr. 36, Bind 14).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
ID: 18038443
Flest downloads
-
5782
downloads
Locally orderless registration
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
4118
downloads
Jet-based local image descriptors
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3019
downloads
FDG-PET template MNI152 1mm
Publikation: Bidrag der ikke har en tekstform › Datasæt › Forskning
Udgivet