Sachin Pundhir

Sachin Pundhir

Seniorforsker

ORCID: 0000-0001-9047-7280

Udgivelsesår:
Alle
1 - 24 ud af 24Pr. side: 25
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2023
  2. Udgivet

    TET2 lesions enhance the aggressiveness of CEBPA-mutant acute myeloid leukemia by rebalancing GATA2 expression

    Heyes, E., Wilhelmson, Anna, Wenzel, Anne, Manhart, G., Eder, T., Schuster, Mikkel Bruhn, Rzepa, E., Pundhir, Sachin, D’Altri, T., Frank, Anne-Katrine, Gentil, C., Woessmann, J., Schoof, E. M., Meggendorfer, M., Schwaller, J., Haferlach, T., Grebien, F. & Porse, Bo Torben, 2023, I: Nature Communications. 14, 18 s., 6185.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    The histone demethylase KDM5C functions as a tumor suppressor in AML by repression of bivalently marked immature genes

    Trempenau, M. L., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Araújo Pereira, Mafalda, Kalvisa, A., Tapia, Marta Cecylia, Su, Jinyu, Ge, Y., de Boer, Bauke, Balhuizen, Alexander, Bagger, F. O., Shliaha, P., Sroczynska, P., Walfridsson, J., Grønbæk, Kirsten, Theilgaard-Mønch, Kim, Jensen, O. N., Helin, K. & Porse, Bo Torben, 2023, I: Leukemia. 37, 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    The impact of SWI/SNF and NuRD inactivation on gene expression is tightly coupled with levels of RNA polymerase II occupancy at promoters

    Pundhir, Sachin, Su, Jinyu, Tapia, Marta Cecylia, Hansen, A. M., Haile, James Seymour, Hansen, K. & Porse, Bo Torben, 2023, I: Genome Research. 33, 3, s. 332-345 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. 2022
  6. Udgivet

    H3K9 dimethylation safeguards cancer cells against activation of the interferon pathway

    Hansen, A. M., Ge, Y., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Jakobsen, J. S., Kalvisa, A., Tapia, Marta Cecylia, Gordon, Sandra, Ambri, F., Bagger, F. O., Pandey, D., Helin, K. & Porse, Bo Torben, 2022, I: Science Advances. 8, 11, eabf8627.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    PTBP1 promotes hematopoietic stem cell maintenance and red blood cell development by ensuring sufficient availability of ribosomal constituents

    Rehn, M., Wenzel, Anne, Frank, Anne-Katrine, Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Jørgensen, N., Vitting-Seerup, K., Ge, Y., Jendholm, J., Michaut, Magali, Schoof, E. M., Jensen, T. L., Rapin, N., Sapio, R. T., Andersen, Kasper Langebjerg, Lund, Anders H., Solimena, M., Holzenberger, M., Pestov, D. G. & Porse, Bo Torben, 2022, I: Cell Reports. 39, 6, 28 s., 110793.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Transcription factor-driven coordination of cell cycle exit and lineage-specification in vivo during granulocytic differentiation: In memoriam Professor Niels Borregaard

    Theilgaard-Mønch, Kim, Pundhir, Sachin, Reckzeh, K., Su, Jinyu, Tapia, Marta Cecylia, Furtwängler, Benjamin, Jendholm, J., Jakobsen, J. S., Hasemann, M. S., Knudsen, K. J., Cowland, J. B., Fossum, A., Schoof, E., Schuster, Mikkel Bruhn & Porse, Bo Torben, 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 17 s., 3595.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. 2021
  10. Udgivet

    The ASXL1-G643W variant accelerates the development of CEBPA mutant acute myeloid leukemia

    D'Altri, T., Wilhelmson, Anna, Schuster, Mikkel Bruhn, Wenzel, Anne, Kalvisa, A., Pundhir, Sachin, Hansen, A. M. & Porse, Bo Torben, 2021, I: Haematologica. 106, 4, s. 1000-1007 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. 2020
  12. Udgivet

    Ancestrally Duplicated Conserved Noncoding Element Suggests Dual Regulatory Roles of HOTAIR in cis and trans

    Nepal, C., Taranta, A., Hadzhiev, Y., Pundhir, Sachin, Mydel, P., Lenhard, B., Müller, F. & Andersen, Jesper Bøje, 2020, I: iScience. 23, 4, s. 1-27 UNSP 101008.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. 2019
  14. Udgivet

    Epigenetic and Transcriptomic Characterization of Pure Adipocyte Fractions From Obese Pigs Identifies Candidate Pathways Controlling Metabolism

    Jacobsen, M. J., Havgaard, Jakob Hull, Anthon, Christian, Mentzel, Caroline M. Junker, Cirera, Susanna, Krogh, P. M., Pundhir, Sachin, Karlskov-Mortensen, Peter, Bruun, C. S., Lesnik, P., Guerin, M., Gorodkin, Jan, Jørgensen, Claus Bøttcher, Fredholm, Merete & Barrès, Romain, 2019, I: Frontiers in Genetics. 10, 13 s., 1268.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Mutant CEBPA directly drives the expression of the targetable tumor-promoting factor CD73 in AML

    Jakobsen, J. S., Laursen, L. G., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Schoof, E., Ge, Y., d'Altri, T., Vitting-Seerup, K., Rapin, N., Gentil, C., Jendholm, J., Theilgaard-Mønch, Kim, Reckzeh, K., Bullinger, L., Döhner, K., Hokland, P., Fitzgibbon, J. & Porse, Bo Torben, 2019, I: Science Advances. 5, 7, s. 1-16 16 s., eaaw4304.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    The splicing factor RBM25 controls MYC activity in acute myeloid leukemia

    Ge, Y., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Rapin, N., Bagger, F. O., Sidiropoulos, N., Hashem, N. & Porse, Bo Torben, 2019, I: Nature Communications. 10, 1, s. 1-14 14 s., 172.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. 2018
  18. Udgivet

    Differences in Cell Cycle Status Underlie Transcriptional Heterogeneity in the HSC Compartment

    Lauridsen, F. K., Jensen, T. L., Rapin, N., Aslan, D., Wilhelmson, Anna, Pundhir, Sachin, Rehn, M., Paul, F., Giladi, A., Hasemann, M. S., Serup, Palle, Amit, I. & Porse, Bo Torben, 2018, I: Cell Reports. 24, 3, s. 766-780 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Enhancer and Transcription Factor Dynamics during Myeloid Differentiation Reveal an Early Differentiation Block in Cebpa null Progenitors

    Pundhir, Sachin, Bratt Lauridsen, F. K., Schuster, Mikkel Bruhn, Jakobsen, J. S., Ge, Y., Schoof, E. M., Rapin, N. P. J., Waage, J., Hasemann, M. S. & Porse, Bo Torben, 2018, I: Cell Reports. 23, 9, s. 2744-2757 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    HOTAIR ancient sequence suggests regulatory roles both in cis and trans

    Nepal, C., Hadzheiv, Y., Pundhir, Sachin, Mydel, P., Lenhard, B., Mueller, F. & Andersen, J., 2018

    Publikation: Andet › Andet bidrag › Forskning

  21. 2016
  22. Udgivet

    Adipocyte gene expression and DNA methylation patterns differ significantly between lean and obese pigs

    Jacobsen, M. J., Havgaard, Jakob Hull, Mentzel, Caroline M. Junker, Sørensen, P. M., Pundhir, Sachin, Anthon, Christian, Karlskov-Mortensen, Peter, Bruun, Camilla Vibeke Sichlau, Cirera, Susanna, Gorodkin, Jan, Jørgensen, Claus Bøttcher, Barrès, Romain & Fredholm, Merete, 9 nov. 2016, I: Journal of Animal Science. 94, Supplement 4, s. 46-47 2 s., P2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    BloodSpot: a database of gene expression profiles and transcriptional programs for healthy and malignant haematopoiesis

    Bagger, F. O., Sasivarevic, D., Hadi Sohi, S., Laursen, L. G., Pundhir, Sachin, Sønderby, C. K., Winther, Ole, Rapin, N. & Porse, Bo Torben, 4 jan. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, D1, s. D917-24 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Peak-valley-peak pattern of histone modifications delineates active regulatory elements and their directionality

    Pundhir, Sachin, Bagger, F. O., Lauridsen, F. K. B., Rapin, N. P. J. & Porse, Bo Torben, 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 9, s. 4037-4051 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. 2015
  26. Udgivet

    Differential and coherent processing patterns from small RNAs

    Pundhir, Sachin & Gorodkin, Jan, 13 jul. 2015, I: Scientific Reports. 5, 16 s., 12062.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Emerging applications of read profiles towards the functional annotation of the genome

    Pundhir, Sachin, Poirazi, P. & Gorodkin, Jan, 19 maj 2015, I: Frontiers in Genetics. 6, 11 s., 188.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. 2014
  29. Udgivet

    Spatially conserved regulatory elements identified within human and mouse Cd247 gene using high-throughput sequencing data from the ENCODE project.

    Pundhir, Sachin, Hannibal, T. D., Bang-Berthelsen, C. H., Wegener, A. K., Pociot, Flemming, Holmberg, D. I. & Gorodkin, Jan, 2 maj 2014, I: Gene. 545, 1, s. 80-87 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Structured RNAs and synteny regions in the pig genome

    Anthon, Christian, Tafer, H., Havgaard, Jakob Hull, Thomsen, B., Hedegaard, J., Seemann, Ernst Stefan, Pundhir, Sachin, Kehr, S., Bartschat, S., Nielsen, M., Nielsen, R. O., Fredholm, Merete, Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2014, I: BMC Genomics. 15, 27 s., 459.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. 2012
  32. Udgivet

    DeepBlockAlign: a tool for aligning RNA-seq profiles of read block patterns

    Langenberger, D., Pundhir, Sachin, Ekstrøm, Claus Thorn, Stadler, P. F., Hoffmann, S. & Gorodkin, Jan, 2012, I: Bioinformatics. 28, 1, s. 17-24 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. 2011

  34. SSPred: a prediction server based on SVM for the identification and classification of protein involved in bacterial secretion systems.

    Pundhir, Sachin & Kumar, A., 2011, I: Bioinformation. 6, 10, s. 380-382 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. 2008

  36. PredictBias: a server for the identification of genomic and pathogenicity islands in prokaryotes

    Pundhir, Sachin & Kumar, A., 2008, I: In Silico Biology. 8, 3-4, s. 223-234 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

ID: 21221836