Simon Rasmussen

Simon Rasmussen

Professor


  1. Identification of acquired antimicrobial resistance genes

    Zankari, E., Hasman, H., Cosentino, S., Vestergaard, M., Rasmussen, Simon, Lund, O., Aarestrup, F. M. & Larsen, M. V., 2012, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 67, 11, s. 2640-4 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Immunity and mental illness: findings from a Danish population-based immunogenetic study of seven psychiatric and neurodevelopmental disorders

    Nudel, R., Benros, Michael Eriksen, Krebs, M. D., Allesøe, R. L., Lemvigh, C. K., Bybjerg-Grauholm, J., Børglum, A. D., Daly, M. J., Nordentoft, Merete, Mors, O., Hougaard, D. M., Mortensen, P. B., Buil, A., Werge, Thomas, Rasmussen, Simon & Thompson, W. K., 2019, I: European Journal of Human Genetics. 27, s. 1445-1455

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Impaired uptake and/or utilization of leucine by Saccharomyces cerevisiae is suppressed by the SPT15-300 allele of the TATA-binding protein gene

    Baerends, R. J. S., Qiu, J., Rasmussen, Simon, Nielsen, H. B. & Brandt, A., 2009, I: Applied and Environmental Microbiology. 75, 19, s. 6055-6061 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Improved metagenome binning and assembly using deep variational autoencoders

    Nissen, J. N., Johansen, Joachim, Allesoe, R. L., Sonderby, C. K., Armenteros, J. J. A., Grønbech, Christopher Heje, Jensen, Lars Juhl, Nielsen, H. B., Petersen, T. N., Winther, Ole & Rasmussen, Simon, 2021, I: Nature Biotechnology. 39, s. 555-560

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    In silico assessment of virulence factors in strains of streptococcus oralis and Streptococcus mitis isolated from patients with infective endocarditis

    Rasmussen, L. H., Højholt, K., Dargis, R., Christensen, J. J., Skovgaard, O., Justesen, U. S., Rosenvinge, F. S., Moser, Claus Ernst, Lukjancenko, O., Rasmussen, Simon & Nielsen, X. C., 1 sep. 2017, I: Journal of Medical Microbiology. 66, s. 1316-1323 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Machine learning and deep learning applications in microbiome research

    Hernandez Medina, Ricardo, Kutuzova, Svetlana, Nielsen, Knud Nor, Johansen, Joachim, Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Mads & Rasmussen, Simon, 2022, I: ISME Communications. 2, 7 s., 98.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Mapache: a flexible pipeline to map ancient DNA

    Neuenschwander, S., Cruz Dávalos, D. I., Anchieri, L., Sousa da Mota, B., Bozzi, D., Rubinacci, S., Delaneau, O., Rasmussen, Simon & Malaspinas, A., 2023, I: Bioinformatics (Online). 39, 2, 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Markers of inflammation predict survival in newly diagnosed cirrhosis: a prospective registry study

    Mynster Kronborg, T., Webel, Henry, O’Connell, M. B., Danielsen, K. V., Hobolth, L., Møller, Søren, Jensen, Rasmus Tanderup, Bendtsen, Flemming, Hansen, Torben, Rasmussen, Simon, Juel, H. B. & Kimer, N., 2023, I: Scientific Reports. 13, 11 s., 20039.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Mass spectrometry-based proteomics data from thousands of HeLa control samples

    Webel, Henry, Perez-Riverol, Y., Nielsen, A. B. & Rasmussen, Simon, 2024, I: Scientific Data. 11, 7 s., 112.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Meta-genomic analysis of toilet waste from long distance flights; a step towards global surveillance of infectious diseases and antimicrobial resistance

    Nordahl Petersen, T., Rasmussen, Simon, Hasman, H., Carøe, C., Bælum, J., Schultz, A. C., Bergmark, L., Svendsen, C. A., Lund, O., Sicheritz-Pontén, T. & Aarestrup, F. M., 10 jul. 2015, I: Scientific Reports. 5, s. 11444

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 204201681