Rute Andreia Rodrigues da Fonseca
Lektor
Section for Biodiversity
Universitetsparken 15, København Ø
Section for Biodiversity
Universitetsparken 15, 2100 København Ø
- 2010
- Udgivet
Positive selection on apoptosis related genes
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Kosiol, C., Vinař, T., Siepel, A. & Nielsen, Rasmus, 2010, I: FEBS Letters. 584, 3, s. 469-476 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
Positive selection on the killer whale mitogenome
Foote, A. D., Morin, P. A., Durban, J. W., Pitman, R. L., Wade, P., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2011, I: Biology Letters. 7, 1, s. 116-118 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Cephalopod genomics: a plan of strategies and organization
Albertin, C. B., Bonnaud, L., Brown, C. T., Crookes-Goodson, W. J., Rodrigues da Fonseca, R. A., Di Cristo, C., Dilkes, B. P., Edsinger-Gonzales, E., Freeman, Jr., R. M., Hanlon, R. T., Koenig, K. M., Lindgren, A. R., Martindale, M. Q., Minx, P., Moroz, L. L., Nödl, M-T., Nyholm, S. V., Ogura, A., Pungor, J. R., Rosenthal, J. J. C. & 6 flere, , 2012, I: Standards in Genomic Sciences. 7, s. 175-188 14 s., 1.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomic analysis of a pleistocene mammoth femur reveals more than one hundred ancient bone proteins
Cappellini, Enrico, Jensen, Lars Juhl, Szklarczyk, D. M., Ginolhac, A., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Stafford jr., T., Holen, S. R., Collins, M. J., Orlando, L. A. A., Willerslev, Eske, Gilbert, M Thomas P & Olsen, Jesper Velgaard, 2012, I: Journal of Proteome Research. 11, 2, s. 917-926 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
Cephalopods in neuroscience: regulations, research and the 3Rs
Fiorito, G., Affuso, A., Anderson, D. B., Basil, J., Bonnaud, L., Botta, G., Cole, A., D'Angelo, L., De Girolamo, P., Dennison, N., Dickel, L., Di Cosmo, A., Di Cristo, C., Gestal, C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Grasso, F., Kristiansen, T., Kuba, M., Maffucci, F., Manciocco, A. & 15 flere, , 2014, I: Invertebrate Neuroscience. 14, 1, s. 13-36 24 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation
Zhang, G., Li, C., Li, Q., Li, B., Larkin, D. M., Lee, C., Storz, J. F., Antunes, A., Greenwold, M. J., Meredith, R. W., Ödeen, A., Cui, J., Zhou, Q., Xu, L., Pan, H., Wang, Z., Jin, L., Zhang, P., Hu, H., Yang, W. & 85 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1311-1320 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DivA: detection of non-homologous and very divergent regions in protein sequence alignments
Zepeda Mendoza, M. L., Nygaard, S. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2014, I: BMC Research Notes. 7, 806, 6 s., 806.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomic Profiling of Cytosolic Glutathione Transferases from Three Bivalve Species: Corbicula fluminea, Mytilus galloprovincialis and Anodonta cygnea
Martins, J. C., Campos, A., Osorio, H., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Vasconcelos, V., 2014, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 15, 2, s. 1887-1900 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The elusive nature of adaptive mitochondrial DNA evolution of an Arctic lineage prone to frequent introgression
Melo-Ferreira, J., Vilela, J., Fonseca, M. M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Boursot, P. & Alves, P. C., 2014, I: Genome Biology and Evolution. 6, 4, s. 886-896 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds
Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Li, J., Zhang, F., Li, H., Zhou, L., Narula, N., Liu, L., Ganapathy, G. & 85 flere, , 2014, I: Science. 346, 6215, s. 1320-1331 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
- Udgivet
A refined model of the genomic basis for phenotypic variation in vertebrate hemostasis
Ribeiro, Â. M., Zepeda Mendoza, M. L., Bertelsen, Mads Frost, Kristensen, Annemarie T., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, 2015, I: B M C Evolutionary Biology. 15, 8 s., 124.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ancient genomics
Der Sarkissian, C., Allentoft, M. E., Avila Arcos, M. D. C., Barnett, R., Campos, P. F., Cappellini, E., Ermini, L., Fernandez Garcia, R., Rodrigues da Fonseca, R. A., Ginolhac, A., Hansen, A. J., Jónsson, H., Korneliussen, T. S., Margaryan, A., Martin, M. D., Moreno Mayar, J. V., Raghavan, M., Rasmussen, M., Sandoval Velasco, M., Schroeder, H. & 6 flere, , 2015, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370, 1660, 12 s., 20130387.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomic analyses data of the avian phylogenomics project
Jarvis, E. D., Mirarab, S., Aberer, A. J., Li, B., Houde, P., Li, C., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Nabholz, B., Howard, J. T., Suh, A., Weber, C. C., Rodrigues da Fonseca, R. A., Alfaro Nuñez, L. A., Narula, N., Liu, L., Burt, D., Ellegren, H., Edwards, S. V., Stamatakis, A. & 7 flere, , 2015, I: GigaScience. 4, 9 s., 4.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomic profiling of gill GSTs in Mytilus galloprovincialis from the North of Portugal and Galicia evidences variations at protein isoform level with a possible relation with water quality
Azevedo, C. C., Guzman-Guillen, R., Martins, J. C., Osório, H., Vasconcelos, V., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Campos, A., 2015, I: Marine Environmental Research. 110, s. 152-161 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shotgun analysis of the marine mussel Mytilus edulis hemolymph proteome and mapping the innate immunity elements
Campos, A., Apraiz, I., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Cristobal, S., 2015, I: Proteomics. 15, 23-24, s. 4021-4029 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The origin and evolution of maize in the Southwestern United States: [+ erratum]
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Smith, B. D., Wales, N., Cappellini, Enrico, Skoglund, P., Fumagalli, M., Samaniego Castruita, J. A., Carøe, C., Avila Arcos, M. D. C., Hufnagel, D. E., Korneliussen, Thorfinn Sand, Vieira, Filipe Garrett, Jakobsson, M., Arriaza, B., Willerslev, Eske, Nielsen, Rasmus, Hufford, M. B., Albrechtsen, Anders, Ross-Ibarra, J. & Gilbert, M Thomas P, 2015, I: Nature Plants. 1, 5 s., 14003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
Combined transcriptomic and proteomic analysis of the posterior salivary gland from the southern blue-ringed octopus and the southern sand octopus
Whitelaw, B. L., Strugnell, J. M., Faou, P., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Hall, N. E., Norman, M., Finn, J. & Cooke, I. R., 2016, I: Journal of Proteome Research. 15, 9, s. 3284-3297 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative analysis of complete mitochondrial genomes suggests that relaxed purifying selection is driving high nonsynonymous evolutionary rate of the NADH2 gene in whitefish (Coregonus ssp.)
Jacobsen, M. W., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Bernatchez, L. & Hansen, M. M., 2016, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 95, s. 161-170 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Next-generation biology: sequencing and data analysis approaches for non-model organisms
Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Albrechtsen, Anders, Themudo, G. E. C., Ramos Madrigal, Jazmin, Sibbesen, Jonas Andreas, Sørensen, L. M., Zepeda Mendoza, M. L., Campos, P., Heller, Rasmus & Pereira, R., 2016, I: Marine Genomics. 30, s. 3-13Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
Marine genomics: news and views
Oliveira Ribeiro, Â. M., Foote, A. D., Kupczok, A., Frazão, B., Limborg, Morten Tønsberg, Piñeiro, R., Abalde, S., Rocha, S. & Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, feb. 2017, I: Marine Genomics. 31, s. 1-8 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular clocks indicate turnover and diversification of modern coleoid cephalopods during the Mesozoic Marine Revolution
Tanner, A. R., Fuchs, D., Winkelmann, I. E. H., Gilbert, M Thomas P, Pankey, M. S., Oliveira Ribeiro, Â. M., Kocot, K. M., Halanych, K. M., Oakley, T. H., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Pisani, D. & Vinther, J., 15 mar. 2017, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 284, 1850, 7 s., 20162818.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Natural selection shaped the rise and fall of passenger pigeon genomic diversity
Murray, G. G. R., Soares, A. E. R., Novak, B. J., Schaefer, N. K., Cahill, J. A., Baker, A. J., Demboski, J. R., Doll, A., Rodrigues da Fonseca, R. A., Fulton, T. L., Gilbert, T., Heintzman, P. D., Letts, B., McIntosh, G., O'Connell, B. L., Peck, M., Pipes, M-L., Rice, E. S., Santos, K. M., Sohrweide, A. G. & 4 flere, , 17 nov. 2017, I: Science. 358, 6365, s. 951-954 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
"Out of the Can": A Draft Genome Assembly, Liver Transcriptome, and Nutrigenomics of the European Sardine, Sardina pilchardus
Machado, A. M., Tørresen, O. K., Kabeya, N., Couto, A., Petersen, Bent, Felicio, M., Campos, P. F., Fonseca, E., Bandarra, N., Lopes-Marques, M., Ferraz, R., Ruivo, R., Fonseca, M. M., Jentoft, S., Monroig, Ó., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Castro, L. F. C., 2018, I: Genes. 9, 10, s. 1-13 485.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A resource for sustainable management: De novo assembly and annotation of the liver transcriptome of the Atlantic chub mackerel, Scomber colias
Machado, A. M., Felício, M., Fonseca, E., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia & Castro, L. F. C., 2018, I: Data in Brief. 18, s. 276-284 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequence and effectorome of Moniliophthora perniciosa and Moniliophthora roreri subpopulations
Barbosa, C. S., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Batista, T. M., Barreto, M. A., Argolo, C. S., de Carvalho, M. R., Jordao do Amaral, D. O., de Andrade Silva, E. M., Arevalo-Gardini, E., Hidalgo, K. S., Franco, G. R., Pirovani, C. P., Micheli, F. & Gramacho, K. P., 3 jul. 2018, I: BMC Genomics. 19, 12 s., 509.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 33270633
Flest downloads
-
2994
downloads
DivA: detection of non-homologous and very divergent regions in protein sequence alignments
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1038
downloads
The elusive nature of adaptive mitochondrial DNA evolution of an Arctic lineage prone to frequent introgression
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1001
downloads
Ancient genomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet