Peter E. Nielsen
Professor
Transcription, RNA, and Gene Medicine Program
Blegdamsvej 3, 2200 København N., 18 Bygning 18, Bygning: 18-2-16
Medlem af:
- 2024
- Udgivet
Polymyxins with Potent Antibacterial Activity against Colistin-Resistant Pathogens: Fine-Tuning Hydrophobicity with Unnatural Amino Acids
Jørgensen, Johan Storm, Harifi Mood, Elnaz, Knap, A. S. H., Nielsen, S. E., Nielsen, Peter E., Żabicka, D., Matias, C., Domraceva, I., Björkling, Fredrik & Franzyk, Henrik, 2024, I: Journal of Medicinal Chemistry. 67, 2, s. 1370–1383Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Targeting synthesis of the Chromosome Replication Initiator Protein DnaA by antisense PNA-peptide conjugates in Escherichia coli
Campion, C., Charbon, Godefroid, Nielsen, Peter E. & Løbner-Olesen, Anders, 2024, I: Frontiers in Antibiotics. 3, 10 s., 1384390.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Peptide nucleic acid-zirconium coordination nanoparticles
Öztürk, Ö., Lessl, A., Höhn, M., Wuttke, S., Nielsen, Peter E., Wagner, E. & Lächelt, U., 2023, I: Scientific Reports. 13, 16 s., 14222.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Antisense Peptide Nucleic Acid-Diaminobutanoic Acid Dendron Conjugates with SbmA-Independent Antimicrobial Activity against Gram-Negative Bacteria
Iubatti, M., Gabas, I. M., Cavaco, L. M., Harifi Mood, Elnaz, Lim, Ernest Wee Kiat, Bonanno, F., Yavari, Niloofar, Brolin, C. & Nielsen, Peter E., 2022, I: ACS Infectious Diseases. 8, 5, s. 1098–1106Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effects of LPS Composition in Escherichia coli on Antibacterial Activity and Bacterial Uptake of Antisense Peptide-PNA Conjugates
Goltermann, Lise, Zhang, Meiqin, Ebbensgaard, Anna Elisabeth, Fiodorovaite, M., Yavari, Niloofar, Løbner-Olesen, Anders & Nielsen, Peter E., 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 877377.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Translocation of non-lytic antimicrobial peptides and bacteria penetrating peptides across the inner membrane of the bacterial envelope
Frimodt-Møller, Jakob, Campion, C., Nielsen, Peter E. & Løbner-Olesen, Anders, 2022, I: Current Genetics. 68, 1, s. 83-90Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Activating the Cpx response induces tolerance to antisense PNA delivered by an arginine-rich peptide in Escherichia coli
Frimodt-Møller, Jakob, Koulouktsis, A., Charbon, Godefroid, Otterlei, M., Nielsen, Peter E. & Løbner-Olesen, Anders, 2021, I: Molecular Therapy - Nucleic Acids. 25, s. 444-454 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Antibiotic Potentiation in Multidrug-Resistant Gram-Negative Pathogenic Bacteria by a Synthetic Peptidomimetic
Harifi Mood, Elnaz, Goltermann, Lise, Brolin, C., Cavaco, L. M., Japoni Nejad, Alireza, Yavari, Niloofar, Frederiksen, N., Franzyk, Henrik & Nielsen, Peter E., 2021, I: ACS Infectious Diseases. 7, 8, s. 2152–2163Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Antisense inhibition of the Escherichia coli NrdAB aerobic ribonucleotide reductase is bactericidal due to induction of DNA strand breaks
Campion, C., Charbon, Godefroid, Thomsen, T. T., Nielsen, Peter E. & Løbner-Olesen, Anders, 2021, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 76, 11, s. 2802–2814 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Approaches for Systemic Delivery of Dystrophin Antisense Peptide Nucleic Acid in the mdx Mouse Model
Brolin, C., Lim, Ernest Wee Kiat, Grizot, S., Olsen, C. H., Yavari, Niloofar, Krag, T. O. & Nielsen, Peter E., 2021, I: Nucleic Acid Therapeutics. 31, 3, s. 208-219 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimized Synthesis of Fmoc/Boc-Protected PNA Monomers and their Assembly into PNA Oligomers.
Shaikh, Ashif Yasin, Björkling, Fredrik, Nielsen, Peter E. & Franzyk, Henrik, 2021, I: European Journal of Organic Chemistry. 2021, 19, s. 2792-2801 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Targeting of the essential acpp, ftsz, and rne genes in carbapenem-resistant acinetobacter baumannii by antisense pna precision antibacterials
Japoni Nejad, Alireza, Shahrokhi, N. & Nielsen, Peter E., 2021, I: Biomedicines. 9, 4, 429.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Uptake, Stability, and Activity of Antisense Anti-acpP PNA-Peptide Conjugates in Escherichia coli and the Role of SbmA
Yavari, Niloofar, Goltermann, Lise & Nielsen, Peter E., 2021, I: ACS chemical biology. 16, 3, s. 471-479 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Effective Cellular Delivery of Antisense Peptide Nucleic Acid by Conjugation to Guanidinylated Diaminobutanoic Acid-Based Peptide Dendrons
Gabas, I. M. & Nielsen, Peter E., 2020, I: Biomacromolecules. 21, 2, s. 472-483 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enzyme-Triggered Release of the Antisense Octaarginine-PNA Conjugate from Phospholipase A2 Sensitive Liposomes
Ghavami, M., Shiraishi, T. & Nielsen, Peter E., 2020, I: ACS Applied Bio Materials. 3, 2, s. 1018-1025 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
In Vitro Cellular Delivery of Peptide Nucleic Acid (PNA)
Shiraishi, T., Ghavami, M. & Nielsen, Peter E., 2020, Peptide Nucleic Acids: Methods and Protocols. Humana Press, s. 173-185 13 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2105).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
In Vivo Administration of Splice Switching PNAs Using the mdx Mouse as a Model System
Brolin, C., Lim, Ernest Wee Kiat & Nielsen, Peter E., 2020, Peptide Nucleic Acids. Humana Press, s. 241-250 10 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2105).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Near-Infrared In Vivo Whole-Body Fluorescence Imaging of PNA
Lim, Ernest Wee Kiat, Brolin, C. & Nielsen, Peter E., 2020, Peptide Nucleic Acids: Methods and Protocols. Humana Press, s. 251-260 10 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2105).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PNA Antisense Targeting in Bacteria: Determination of Antibacterial Activity (MIC) of PNA-Peptide Conjugates
Goltermann, Lise & Nielsen, Peter E., 2020, Peptide Nucleic Acids. Humana Press, s. 231-239 9 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2105).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Preface
Nielsen, Peter E., 2020, Peptide Nucleic Acids: Methods and Protocols. Springer, s. v (Methods in Molecular Biology; Nr. 2105).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Forord/efterskrift › Forskning
- Udgivet
Targeting TdT gene expression in Molt-4 cells by PNA-octaarginine conjugates
Montazersaheb, S., Avci, Ç. B., Bagca, B. G., Ay, N. P. O., Tarhriz, V., Nielsen, Peter E., Charoudeh, H. N. & Hejazi, M. S., 2020, I: International Journal of Biological Macromolecules. 164, s. 4583-4590 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
Optimization of lung infection model with carbapenemase producing Klebsiella pneumoniae ST258 (KPC-2) for intranasal treatment in neutropenic NMRI mice
Goncalves Cavaco, L. M., Hjortkjær, C. B., Rasmussen, C., Nielsen, Peter E. & Lundberg, C. V., 17 apr. 2019.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cooperative Cellular Uptake and Activity of Octaarginine Antisense Peptide Nucleic acid (PNA) Conjugates
Ghavami, M., Shiraishi, T. & Nielsen, Peter E., 2019, I: Biomolecules. 9, 10, 554.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Downregulation of TdT Expression through Splicing Modulation by Antisense Peptide Nucleic Acid (PNA)
Montazersaheb, S., Kazemi, M., Nabat, E., Nielsen, Peter E. & Hejazi, M. S., 2019, I: Current Pharmaceutical Biotechnology. 20, 2, s. 168-178 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microwave-assisted solid-phase synthesis of antisense acpP peptide nucleic acid-peptide conjugates active against colistin- and tigecycline-resistant E. coli and K. pneumoniae
Hansen, A. M., Bonke, G., Hogendorf, W. F. J., Björkling, Fredrik, Nielsen, J., Kongstad, Kenneth Thermann, Zabicka, D., Tomczak, M., Urbas, M., Nielsen, Peter E. & Franzyk, Henrik, 2019, I: European Journal of Medicinal Chemistry. 168, s. 134-145 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PNA length restriction of antibacterial activity of peptide-PNA conjugates in Escherichia coli through effects of the inner membrane
Goltermann, Lise, Yavari, Niloofar, Zhang, Meiqin, Ghosal, A. & Nielsen, Peter E., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, MAY, 8 s., 1032.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Effective photo-enhancement of cellular activity of fluorophore-octaarginine antisense PNA conjugates correlates with singlet oxygen formation, endosomal escape and chromophore lipophilicity
Yarani, R., Shiraishi, T. & Nielsen, Peter E., 1 dec. 2018, I: Scientific Reports. 8, 11 s., 638.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
Role of Cell-Penetrating Peptides in Intracellular Delivery of Peptide Nucleic Acids Targeting Hepadnaviral Replication
Ndeboko, B., Ramamurthy, N., Lemamy, G. J., Jamard, C., Nielsen, Peter E. & Cova, L., dec. 2017, I: Molecular Therapy - Nucleic Acids. 9, s. 162-169 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An antisense peptide nucleic acid against Pseudomonas aeruginosa inhibiting bacterial-induced inflammatory responses in the cystic fibrosis IB3-1 cellular model system
Montagner, G., Bezzerri, V., Cabrini, G., Fabbri, E., Borgatti, M., Lampronti, I., Finotti, A., Nielsen, Peter E. & Gambari, R., 2017, I: International Journal of Biological Macromolecules. 99, s. 492-498 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Antisense PNA antibiotics against multiresistant Gram-negative bacteria
Nielsen, Peter E., Björkling, Fredrik & Franzyk, Henrik, 2017, I: International Journal of Molecular Medicine. 40, Suppl. 1, s. S22 1 s., Abstract 169.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning
- 2016
- Udgivet
Disruption of Higher Order DNA Structures in Friedreich's Ataxia (GAA)(n) Repeats by PNA or LNA Targeting
Bergquist, H., Rocha, C. S. J., Alvarez-Asencio, R., Chi-Hung Nguyen, Rutland, M. W., Smith, C. I. E., Good, L., Nielsen, Peter E. & Zain, R., 15 nov. 2016, I: P L o S One. 11, 11, 24 s., e0165788.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Noter til BIOPHARMACEUTICALS: BIOORGANISK KEMI
Franzyk, Henrik & Nielsen, Peter E., 15 aug. 2016, Dept. Drug Design and Pharmacology. 159 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Kompendium/lecture notes › Undervisning
- Udgivet
Antibacterial Peptide Nucleic Acid-Antimicrobial Peptide (PNA-AMP) Conjugates: Antisense Targeting of Fatty Acid Biosynthesis
Hansen, A. M., Bonke, G., Larsen, C. J., Yavari, Niloofar, Nielsen, Peter E. & Franzyk, Henrik, 2016, I: Bioconjugate Chemistry. 27, 4, s. 863-867 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
- Udgivet
Cellular Antisense Activity of PNA-Oligo(bicycloguanidinium) Conjugates forming Self-Assembled Nano-aggregates
Valero, J., Shiraishi, T., de Mendoza, J. & Nielsen, Peter E., 27 jul. 2015, I: ChemBioChem. 16, 11, s. 1593-1600 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Correction to Role of SbmA in the Uptake of Peptide Nucleic Acid (PNA)-Peptide Conjugates in E. coli
Ghosal, A., Vitali, A., Stach, J. E. M. & Nielsen, Peter E., 20 feb. 2015, I: ACS chemical biology. 10, 2, s. 631Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Electroporation Enhanced Effect of Dystrophin Splice Switching PNA Oligomers in Normal and Dystrophic Muscle
Hjortkjær, C. B., Shiraishi, T., Hojman, P., Krag, T. O., Nielsen, Peter E. & Gehl, J., 2015, I: Molecular Therapy - Nucleic Acids. 4, e267.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Jagten på kongens efterfølger
Franzyk, Henrik, Björkling, Fredrik, Nielsen, J. & Nielsen, Peter E., 2015, I: Lægemiddelforskning. 2015, s. 24-27 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling
- Udgivet
Therapeutic Potential of Cell Penetrating Peptides (CPPs) and Cationic Polymers for Chronic Hepatitis B
Ndeboko, B., Lemamy, G. J., Nielsen, Peter E. & Cova, L., 2015, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 16, 12, s. 28230-41 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
Toward Peptide Nucleic Acid (PNA) Directed Peptide Translation Using Ester Based Aminoacyl Transfer
Singhal, A., Bagnacani, V., Corradini, R. & Nielsen, Peter E., nov. 2014, I: ACS chemical biology. 9, 11, s. 2612-2620 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cross-catalytic peptide nucleic acid (PNA) replication based on templated ligation
Singhal, A. & Nielsen, Peter E., 21 sep. 2014, I: Organic & Biomolecular Chemistry. 12, 35, s. 6901-6907 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tethered particle analysis of supercoiled circular DNA using peptide nucleic acid handles
Norregaard, K., Andersson, M., Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., sep. 2014, I: Nature Protocols (Print). 9, 9, s. 2206-23 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Novel Indirect Sequence Readout Component in the E. coli Cyclic AMP Receptor Protein Operator
Lindemose, Søren, Nielsen, Peter E., Valentin-Hansen, P. & Møllegaard, Niels Erik, 21 mar. 2014, I: ACS chemical biology. 9, 3, s. 752-60 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detection and interpretation of 8-oxodG and 8-oxoGua in urine, plasma and cerebrospinal fluid
Poulsen, Henrik Enghusen, Nadal, L. L., Broedbaek, K., Nielsen, Peter E. & Weimann, A., feb. 2014, I: BBA General Subjects. 1840, 2, s. 801-808 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of supercoiling on the λ switch
Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, Kim, Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 1 jan. 2014, I: Bacteriophage. 4, 2, s. 1-5 5 s., e27517.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Phosphorylation Tag for Uranyl Mediated Protein Purification and Photo Assisted Tag Removal
Zhang, Q., Jørgensen, T. J. D., Nielsen, Peter E. & Møllegaard, Niels Erik, 2014, I: PloS one. 9, 3, s. 1-6 6 s., e91138.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cellular Delivery of Peptide Nucleic Acids (PNAs)
Shiraishi, T. & Nielsen, Peter E., 2014, Peptide Nucleic Acids: Methods and Protocols. Nielsen, P. E. & Appella, D. H. (red.). heidelberg: Humana Press, Bind 1050. s. 193-205 16 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1050).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
DNA supercoiling enhances cooperativity and efficiency of an epigenetic switch
Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, Kim, Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 22 okt. 2013, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 110, 43, s. 17386-91 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Organic synthesis by in vitro evolution
Nielsen, Peter E., 9 jul. 2013, I: Nature Biotechnology. 31, 7, s. 613-4 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Role of SbmA in the Uptake of Peptide Nucleic Acid (PNA)-Peptide Conjugates in E. coli
Ghosal, A., Vitali, A., Stach, J. E. M. & Nielsen, Peter E., 15 feb. 2013, I: A C S Chemical Biology. 8, 2, s. 360-367 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Potent Antibacterial Antisense Peptide-Peptide Nucleic Acid Conjugates Against Pseudomonas aeruginosa
Ghosal, A. & Nielsen, Peter E., okt. 2012, I: Nucleic Acid Therapeutics. 22, 5, s. 323-34 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10736
Flest downloads
-
235
downloads
Disruption of Higher Order DNA Structures in Friedreich's Ataxia (GAA)(n) Repeats by PNA or LNA Targeting
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
226
downloads
Effective photo-enhancement of cellular activity of fluorophore-octaarginine antisense PNA conjugates correlates with singlet oxygen formation, endosomal escape and chromophore lipophilicity
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
223
downloads
Role of Cell-Penetrating Peptides in Intracellular Delivery of Peptide Nucleic Acids Targeting Hepadnaviral Replication
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet