Matthias Mann

Matthias Mann

Professor, forskningschef, Professor


  1. 2019
  2. A mass spectrometry guided approach for the identification of novel vaccine candidates in gram-negative pathogens

    Hornburg, D., Kruse, T., Anderl, F., Daschkin, C., Semper, R. P., Klar, K., Guenther, A., Mejías-Luque, R., Schneiderhan-Marra, N., Mann, Matthias, Meissner, F. & Gerhard, M., 22 nov. 2019, I: Scientific Reports. 9, 1, s. 17401

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Defective glycosylation and multisystem abnormalities characterize the primary immunodeficiency XMEN disease

    Ravell, J. C., Matsuda-Lennikov, M., Chauvin, S. D., Zou, J., Biancalana, M., Deeb, S. J., Price, S., Su, H. C., Notarangelo, G., Jiang, P., Morawski, A., Kanellopoulou, C., Binder, K. W., Mukherjee, R., Anibal, J. T., Sellers, B., Zheng, L., He, T., George, A. B., Pittaluga, S. & 34 flere, Powers, A., Kleiner, D. E., Kapuria, D., Ghany, M., Hunsberger, S., Cohen, J. I., Uzel, G., Bergerson, J., Wolfe, L., Toro, C., Gahl, W., Folio, L. R., Matthews, H., Angelus, P., Chinn, I. K., Orange, J. S., Trujillo-Vargas, C. M., Franco, J. L., Orrego-Arango, J., Gutiérrez-Hincapié, S., Patel, N. C., Raymond, K., Patiroglu, T., Unal, E., Karakukcu, M., Day, A. G., Mehta, P., Masutani, E., De Ravin, S. S., Malech, H. L., Altan-Bonnet, G., Rao, V. K., Mann, Matthias & Lenardo, M. J., 5 nov. 2019, (E-pub ahead of print) I: The Journal of Clinical Investigation.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Interconversion between Anticipatory and Active GID E3 Ubiquitin Ligase Conformations via Metabolically Driven Substrate Receptor Assembly

    Qiao, S., Langlois, C. R., Chrustowicz, J., Sherpa, D., Karayel, O., Hansen, F. M., Beier, V., von Gronau, S., Bollschweiler, D., Schäfer, T., Alpi, A. F., Mann, Matthias, Prabu, J. R. & Schulman, B. A., 1 nov. 2019, (E-pub ahead of print) I: Molecular Cell.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. The Atherosclerosis Risk Variant rs2107595 Mediates Allele-Specific Transcriptional Regulation of HDAC9 via E2F3 and Rb1

    Prestel, M., Prell-Schicker, C., Webb, T., Malik, R., Lindner, B., Ziesch, N., Rex-Haffner, M., Röh, S., Viturawong, T., Lehm, M., Mokry, M., den Ruijter, H., Haitjema, S., Asare, Y., Söllner, F., Najafabadi, M. G., Aherrahrou, R., Civelek, M., Samani, N. J., Mann, M. & 2 flere, Haffner, C. & Dichgans, M., okt. 2019, I: Stroke. 50, 10, s. 2651-2660 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Plasma proteome profiling discovers potential biomarkers of non-alcoholic fatty liver disease

    Niu, Lili, Gupta, R., Geyer, P. E., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Gluud, Lise Lotte, Santos, A., Doll, S., Holst, Jens Juul, Knop, Filip Krag, Vilsbøll, Tina, Junker, A., Sachs, S., Stemmer, K., Mueller, T. D., Tschoep, M. H., Hofmann, S. M. & Mann, Matthias, aug. 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S71 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  7. Key Features Relevant to Select Antigens and TCR From the MHC-Mismatched Repertoire to Treat Cancer

    Audehm, S., Glaser, M., Pecoraro, M., Bräunlein, E., Mall, S., Klar, R., Effenberger, M., Albers, J., Bianchi, H. D. O., Peper, J., Yusufi, N., Busch, D. H., Stevanović, S., Mann, Matthias, Antes, I. & Krackhardt, A. M., 28 jun. 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 1485.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Fibro-adipogenic progenitors of dystrophic mice are insensitive to NOTCH regulation of adipogenesis

    Marinkovic, M., Fuoco, C., Sacco, F., Cerquone Perpetuini, A., Giuliani, G., Micarelli, E., Pavlidou, T., Petrilli, L. L., Reggio, A., Riccio, F., Spada, F., Vumbaca, S., Zuccotti, A., Castagnoli, L., Mann, Matthias, Gargioli, C. & Cesareni, G., jun. 2019, I: Life Science Alliance. 2, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Multi-omic Profiling Reveals Dynamics of the Phased Progression of Pluripotency

    Yang, P., Humphrey, S. J., Cinghu, S., Pathania, R., Oldfield, A. J., Kumar, D., Perera, D., Yang, J. Y. H., James, D. E., Mann, Matthias & Jothi, R., 22 maj 2019, I: Cell Systems. 8, 5, s. 427-445.e10

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Cortical circuit alterations precede motor impairments in Huntington's disease mice

    Burgold, J., Schulz-Trieglaff, E. K., Voelkl, K., Gutiérrez-Ángel, S., Bader, J. M., Hosp, F., Mann, Matthias, Arzberger, T., Klein, R., Liebscher, S. & Dudanova, I., 29 apr. 2019, I: Scientific Reports. 9, 1, s. 6634

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Phosphoproteomics Reveals the GSK3-PDX1 Axis as a Key Pathogenic Signaling Node in Diabetic Islets

    Sacco, F., Seelig, A., Humphrey, S. J., Krahmer, N., Volta, F., Reggio, A., Marchetti, P., Gerdes, J. & Mann, Matthias, 7 mar. 2019, (E-pub ahead of print) I: Cell Metabolism.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. A protein-interaction network of interferon-stimulated genes extends the innate immune system landscape

    Hubel, P., Urban, C., Bergant, V., Schneider, W. M., Knauer, B., Stukalov, A., Scaturro, P., Mann, A., Brunotte, L., Hoffmann, H. H., Schoggins, J. W., Schwemmle, M., Mann, Matthias, Rice, C. M. & Pichlmair, A., 4 mar. 2019, (E-pub ahead of print) I: Nature Immunology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics

    Angelidis, I., Simon, L. M., Fernandez, I. E., Strunz, M., Mayr, C. H., Greiffo, F. R., Tsitsiridis, G., Ansari, M., Graf, E., Strom, T., Nagendran, M., Desai, T., Eickelberg, O., Mann, Matthias, Theis, F. J. & Schiller, H. B., 27 feb. 2019, I: Nature Communications. 10, 1, s. 963

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    A spatially resolved proteomic atlas of human skin and its associated immune system

    Dyring-Andersen, Beatrice, Coscia, F., Santos, A., Løvendorf, M. B., Sørensen, L. B. P., Niu, Lili, Andersen, J. L., Clark, R., Skov, L., Teunissen, M. B. & Mann, Matthias, 2019, I: Journal of Investigative Dermatology. 139, 9, suppl., s. S259 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  15. Udgivet

    A spatially resolved proteomic atlas of psoriatic skin

    Dyring-Andersen, Beatrice, Lovendorf, M. B., Santos, A., Coscia, F., Sørensen, L. B. P., Niu, Lili, Andersen, J. L., Teunissen, M. B., Skov, L. & Mann, Matthias, 2019, I: Journal of Investigative Dermatology. 139, 9, suppl., s. S260 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  16. Udgivet

    Catching Lipid Droplet Contacts by Proteomics

    Krahmer, N. & Mann, Matthias, 2019, I: Contact. 2, s. 1-8 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Development, use, application of novel TIMS-Tof system

    Mann, Matthias, 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S20 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  18. Udgivet

    Efficient mitotic checkpoint signaling depends on integrated activities of Bub1 and the RZZ complex

    Zhang, G., Kruse, Thomas, Guasch Boldú, C., Garvanska, Dimitriya Hristoforova, Coscia, F., Mann, Matthias, Barisic, Marin & Nilsson, Jakob, 2019, I: E M B O Journal. 38, 7, e100977.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Hepatic Rab24 controls blood glucose homeostasis via improving mitochondrial plasticity

    Seitz, S., Kwon, Y., Hartleben, G., Juelg, J., Sekar, R., Krahmer, N., Najafi, B., Loft, A., Gancheva, S., Stemmer, K., Feuchtinger, A., de Angelis, M. H., Mueller, T. D., Mann, M., Blueher, M., Roden, M., Diaz, M. B., Behrends, C., Gilleron, J., Herzig, S. & 1 flere, Zeigerer, A., 2019, I: Nature Metabolism. 1, s. 1009-1026

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    MaxQuant.Live enables global targeting of more than 25,000 peptides

    Wichmann, C., Meier, F., Virreira Winter, S., Brunner, A., Cox, J. & Mann, Matthias, 2019, I: Molecular and Cellular Proteomics. 18, 5, s. 982-994 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Mesothelial Cell HIF1α Expression Is Metabolically Downregulated by Metformin to Prevent Oncogenic Tumor-Stromal Crosstalk

    Hart, P. C., Kenny, H. A., Grassl, N., Watters, K. M., Litchfield, L. M., Coscia, F., Blaženović, I., Ploetzky, L., Fiehn, O., Mann, Matthias, Lengyel, E. & Romero, I. L., 2019, I: Cell Reports. 29, 12, s. 4086-4098.e6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Metallopeptidase Inhibitor 1 (TIMP-1) promotes receptor tyrosine kinase c-Kit signaling in colorectal cancer

    Nordgaard, C., Doll, S., Matos, A. L. D. S. A., Høeberg, M., Kazi, J. U., Friis, S., Stenvang, Jan, Rönnstrand, L., Mann, Matthias & Moreira, José, 2019, I: Molecular Oncology. 13, 12, s. 2646-2662

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Mobi-DIK (Ion Mobility DIA Analysis Kit): Targeted analysis software for diaPASEF data improves proteome coverage

    Ha, A., Frank, M., Meier, F., Brunner, A., Kaspar-Schoenefeld, S., Koch, S., Lubeck, M., Raether, O., Collins, B. C., Aebersold, R., Mann, Matthias & Rost, H., 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S17 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  24. Udgivet

    Myosin binding protein H-like (MYBPHL): a promising biomarker to predict atrial damage

    Lahm, H., Dressen, M., Beck, N., Doppler, S., Deutsch, M., Matsushima, S., Neb, I., Koenig, K. C., Sideris, K., Voss, S., Eschenbach, L., Puluca, N., Deisenhofer, I., Doll, S., Holdenrieder, S., Mann, Matthias, Lange, R. & Krane, M., 2019, I: Scientific Reports. 9, 8 s., 9986.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Neurodevelopmental deficits in human isogenic fragile x syndrome neurons

    Utami, K., Skotte, N. H., Colaco, A. R. -., Yusof, N. A. B. M., Sim, B., Yeo, X. Y., Bae, H., Garcia-Miralles, M., Radulescu, C., Jung, S., Mann, Matthias & Pouladi, M., 2019, I: Journal of Neurochemistry. 150, s. 103 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  26. Udgivet

    Parallel accumulation - serial fragmentation combined with data-independent acquisition (diaPASEF)

    Meier, F., Brunner, A., Frank, M., Ha, A., Voytik, E., Kaspar-Schoenefeld, S., Lubeck, M., Raether, O., Aebersold, R., Collins, B. C., Roest, H. L. & Mann, Matthias, 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S17 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  27. Udgivet

    Plasma Proteome Profiling to detect and avoid sample-related biases in biomarker studies

    Geyer, P. E., Voytik, E., Treit, P. V., Doll, S., Kleinhempel, A., Niu, Lili, Müller, J. B., Buchholtz, M., Bader, J. M., Teupser, D., Holdt, L. M. & Mann, Matthias, 2019, I: EMBO Molecular Medicine. 11, 11, e10427.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Plasma proteome profiling discovers novel proteins associated with non-alcoholic fatty liver disease

    Niu, Lili, Geyer, P. E., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Gluud, Lise Lotte, Santos, A., Doll, S., Treit, P. V., Holst, Jens Juul, Knop, Filip Krag, Vilsbøll, Tina, Junker, A., Sachs, S., Stemmer, K., Müller, T. D., Tschöp, M. H., Hofmann, S. M. & Mann, Matthias, 2019, I: Molecular Systems Biology. 15, 16 s., e8793.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Proteomics of Cytochrome c Oxidase-Negative versus -Positive Muscle Fiber Sections in Mitochondrial Myopathy

    Murgia, M., Tan, J., Geyer, P. E., Doll, S., Mann, Matthias & Klopstock, T., 2019, I: Cell Reports. 29, 12, s. 3825-3834 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Proteomics reveals NNMT as a master metabolic regulator of cancer-associated fibroblasts

    Eckert, M. A., Coscia, F., Chryplewicz, A., Chang, J. W., Hernandez, K. M., Pan, S., Tienda, S. M., Nahotko, D. A., Li, G., Blaženović, I., Lastra, R. R., Curtis, M., Yamada, S. D., Perets, R., McGregor, S. M., Andrade, J., Fiehn, O., Moellering, R. E., Mann, Matthias & Lengyel, E., 2019, I: Nature. 569, 7758, s. 723-728

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Proteomics-Based Comparative Mapping of the Secretomes of Human Brown and White Adipocytes Reveals EPDR1 as a Novel Batokine

    Deshmukh, A. S., Peijs, L., Beaudry, J. L., Jespersen, N. Z., Nielsen, C. H., Ma, T., Brunner, A. D., Larsen, T. J., Bayarri-Olmos, R., Prabhakar, B. S., Helgstrand, C., Severinsen, M. C. K., Holst, B., Kjaer, A., Tang-Christensen, M., Sanfridson, A., Garred, P., Privé, G. G., Pedersen, B. K., Gerhart-Hines, Z. & 4 flere, Nielsen, S., Drucker, D. J., Mann, Matthias & Schéele, Camilla Charlotte Nielsen, 2019, I: Cell Metabolism. 30, 5, s. 963-975.e7 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Quick and clean: Cracking sentences encoded in E. coli by LC-MS/MS, de novo sequencing, and dictionary search

    Niu, Lili & Mann, Matthias, 2019, I: EuPA Open Proteomics. 22-23, s. 30-35 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Replication-Coupled DNA-Protein Crosslink Repair by SPRTN and the Proteasome in Xenopus Egg Extracts

    Larsen, N. B., Gao, A. O., Sparks, J. L., Gallina, I., Wu, R. A., Mann, Matthias, Räschle, M., Walter, J. C. & Duxin, Julien, 2019, I: Molecular Cell. 73, 3, s. 574-588.e7 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Response to Raaijmakers & Medema

    Zhang, G., Kruse, Thomas, Boldú, C. G., Garvanska, Dimitriya Hristoforova, Coscia, F., Mann, Matthias, Barisic, Marin & Nilsson, Jakob, 2019, I: The EMBO Journal. 38, 22, 5 s., e103547.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  35. Udgivet

    SILAC-based quantitative mass spectrometry-based proteomics quantifies endoplasmic reticulum stress in whole HeLa cells

    Itzhak, D. N., Sacco, F., Nagaraj, N., Tyanova, S., Mann, Matthias & Murgia, M., 2019, I: Disease Models & Mechanisms. 12, 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Sleep-wake cycles drive daily dynamics of synaptic phosphorylation

    Brüning, F., Noya, S. B., Bange, T., Koutsouli, S., Rudolph, J. D., Tyagarajan, S. K., Cox, J., Mann, Matthias, Brown, S. A. & Robles, M. S., 2019, I: Science (New York, N.Y.). 366, 6462, eaav3617 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    The CMG Helicase Bypasses DNA-Protein Cross-Links to Facilitate Their Repair

    Sparks, J. L., Chistol, G., Gao, A. O., Räschle, M., Larsen, N. B., Mann, Matthias, Duxin, Julien & Walter, J. C., 2019, I: Cell. 176, 1-2, s. 167-181.e21

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    The Case for Proteomics and Phospho-Proteomics in Personalized Cancer Medicine

    Doll, S., Gnad, F. & Mann, Matthias, 2019, I: Proteomics - Clinical Applications. 13, 2, 10 s., e1800113.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    The ever expanding scope of electrospray mass spectrometry-a 30 year journey

    Mann, Matthias, 2019, I: Nature Communications. 10, 3744.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  40. Udgivet

    The forebrain synaptic transcriptome is organized by clocks but its proteome is driven by sleep

    Noya, S. B., Colameo, D., Brüning, F., Spinnler, A., Mircsof, D., Opitz, L., Mann, Matthias, Tyagarajan, S. K., Robles, M. S. & Brown, S. A., 2019, I: Science. 366, 6462, eaav2642 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 5650809