Mani Arumugam

Mani Arumugam

ORCID: 0000-0002-0886-9101

Udgivelsesår:
Alle
1 - 50 ud af 76Pr. side: 50
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2023
  2. Udgivet

    Clostridium scindens secretome suppresses virulence gene expression of Clostridioides difficile in a bile acid-independent manner

    Saenz, C., Fang, Q., Gnanasekaran, Thiyagarajan, Trammell, Sam, Buijink, Jesse A., Pisano, P., Wierer, M., Moens, F., Lengger, B., Brejnrod, A. & Arumugam, Mani, 2023, I: Microbiology Spectrum. 11, 5, s. 1-18 e0393322.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Genetic analysis of blood molecular phenotypes reveals common properties in the regulatory networks affecting complex traits

    Brown, A. A., Fernandez-Tajes, J. J., Hong, M. G., Brorsson, C. A., Koivula, R. W., Davtian, D., Dupuis, T., Sartori, A., Michalettou, T. D., Forgie, I. M., Adam, J., Allin, K. H., Caiazzo, R., Cederberg, H., De Masi, F., Elders, P. J. M., Giordano, G. N., Haid, M., Hansen, T., Hansen, T. H. & 134 flere, Hattersley, A. T., Heggie, A. J., Howald, C., Jones, A. G., Kokkola, T., Laakso, M., Mahajan, A., Mari, A., McDonald, T. J., McEvoy, D., Mourby, M., Musholt, P. B., Nilsson, B., Pattou, F., Penet, D., Raverdy, V., Ridderstråle, M., Romano, L., Rutters, F., Sharma, S., Teare, H., ‘t Hart, L., Tsirigos, Konstantinos, Vangipurapu, J., drb459, drb459, Brunak, Søren, Franks, P. W., Frost, G., Grallert, H., Jablonka, B., McCarthy, M. I., Pavo, I., Pedersen, Oluf Borbye, Ruetten, H., Walker, M., Adragni, K., Allesøe, R. L. L., Artati, A. A., Arumugam, Mani, Atabaki-Pasdar, N., Baltauss, T., Banasik, Karina, Barnett, A. L., Baum, P., Bell, J. D., Beulens, J. W., Bianzano, S. B., Bizzotto, R., Bonnefond, A., Cabrelli, L., Dale, M., Dawed, A. Y., de Preville, N., Dekkers, K. F., Deshmukh, H. A., Dings, C., Donnelly, L., Dutta, A., Ehrhardt, B., pjx571, pjx571, Eriksen, R., Fan, Yong, Ferrer, J., Fitipaldi, H., Forman, A., Fritsche, A., Froguel, P., Gassenhuber, J., Gough, S., Graefe-Mody, U., Grempler, R., Groeneveld, L., Groop, L., Gudmundsdóttir, V., Gupta, R., Hennige, A. M. H., Hill, A. V., Holl, R. W., Hudson, M., Jacobsen, Ulrik Plesner, Jennison, C., Johansen, Joachim, Jonsson, Anna Elisabet, Karaderi, Tugce, Kaye, J., Kennedy, G., Klintenberg, M., Kuulasmaa, T., Lehr, T., Loftus, H., Lundgaard, Agnete Troen, Mazzoni, G., McRobert, N., McVittie, I., Nice, R., Nicolay, C., Nijpels, G., Palmer, C. N., Pedersen, H. K., Perry, M. H., Pomares-Millan, H., Prehn, C. P., Ramisch, A., Rasmussen, Simon, Robertson, N., Rodriquez, M., Sackett, P., Scherer, N., Shah, N., Sihinevich, I., Slieker, R. C., Sondertoft, N. B., Steckel-Hamann, B., Thomas, M. K., Thomas, Cecilia Engel, Thomas, E. L. L., Thorand, B., Thorne, C. E., Tillner, J., Tura, A., Uhlen, M., van Leeuwen, N., van Oort, S., Verkindt, H., Vogt, J., Wad Sackett, P. W., Wesolowska-Andersen, A., Whitcher, B., White, M. W., Adamski, J., Schwenk, J. M., Pearson, E. R., Dermitzakis, E. T. & Viñuela, A., 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 5062.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. E-pub ahead of print

    Impact of acute alcohol consumption on circulating microbiome in asymptomatic alcohol-related liver disease

    Israelsen, M., Alvarez Silva, Maria Camila, Madsen, B. S., Hansen, C. D., Torp, N. C., Johansen, S., Hansen, J. K., Prier Lindvig, K., Insonere, J., Riviere, V., Juel, H. B., Brejnrod, A., Jensen, Lars Juhl, Thiele, M., Lelouvier, B., Hansen, Torben, Arumugam, Mani & Krag, A., 2023, (E-pub ahead of print) I: Gut. gutjnl-2023-330360.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Oral supplementation of nicotinamide riboside alters intestinal microbial composition in rats and mice, but not humans

    Peluso, A. A., Lundgaard, A. T., Babaei, P., Mousovich-Neto, F., Rocha, A. L., Damgaard, M. V., Bak, E. G., Gnanasekaran, T., Dollerup, O. L., Trammell, S. A. J., Nielsen, T. S., Kern, T., Abild, C. B., Sulek, K., Ma, T., Gerhart-Hines, Z., Gillum, M. P., Arumugam, M., Ørskov, C., McCloskey, D. & 4 flere, Jessen, N., Herrgård, M. J., Mori, M. A. S. & Treebak, Jonas Thue, 2023, I: npj Aging. 9, 21 s., 7.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Quantitative differences in synthetic gut microbial inoculums do not affect the final stabilized in vitro community compositions

    Gnanasekaran, Thiyagarajan, Sarathi, Arjun, Fang, Q., Azarm, A., Geraldo, Juliana Assis, Nigro, E. & Arumugam, Mani, 2023, I: mSystems. 8, 4, 16 s., e0124922.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Rifaximin-α for liver fibrosis in patients with alcohol-related liver disease (GALA-RIF): a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 2 trial

    Israelsen, M., Madsen, B. S., Torp, N., Johansen, S., Hansen, C. D., Detlefsen, S., Andersen, P., Hansen, J. K., Lindvig, K. P., Rasmussen, D. N., Thorhauge, K. H., Kjærgaard, M., Karsdal, M., Hansen, Torben, Arumugam, Mani, Trebicka, J., Thiele, M., Krag, A. & GALAXY, G., 2023, I: The Lancet Gastroenterology and Hepatology. 8, 6, s. 523-532 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Sphingolipids Are Depleted in Alcohol-Related Liver Fibrosis

    Thiele, M., Suvitaival, T., Trošt, K., Kim, M., de Zawadzki, A., Kjaergaard, M., Rasmussen, D. N., Lindvig, K. P., Israelsen, M., Detlefsen, S., Andersen, P., Juel, H. B., Nielsen, T., Georgiou, S., Filippa, V., Kuhn, M., Nishijima, S., Moitinho-Silva, L., Rossing, P., Trebicka, J. & 14 flere, Anastasiadou, E., Bork, P., Hansen, T., Legido-Quigley, C., Krag, A., Mann, M., Matthijnssens, J., Arumugam, Mani, Henrar, R., Israelsen, H., Karsdal, M., Melberg, H. O., MicrobLiver Consortium, M. C. & GALAXY Consortium, G. C., 2023, I: Gastroenterology. 164, 7, s. 1248-1260

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. 2022
  10. Udgivet

    MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration

    Saenz, C., Nigro, E., Gunalan, V. & Arumugam, Mani, 2022, I: Frontiers in Bioinformatics. 2, 15 s., 846922.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs

    Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    The effect of gluten in adolescents and young adults with gastrointestinal symptoms: A blinded randomised cross-over trial

    Crawley, C., Savino, N., Halby, C., Sander, S. D., Nybo Andersen, Anne-Marie, Arumugam, Mani, Murray, J., Christensen, R. & Husby, S., 2022, I: Alimentary Pharmacology and Therapeutics, Supplement. 55, 9, s. 1116-1127 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. 2021
  14. Udgivet

    A Previously Undescribed Highly Prevalent Phage Identified in a Danish Enteric Virome Catalog

    Van Espen, L., Bak, E. G., Beller, L., Close, L., Deboutte, W., Juel, H. B., Nielsen, T., Sinar, D., De Coninck, L., Frithioff-Bøjsøe, C., Fonvig, C. E., Jacobsen, S., Kjærgaard, M., Thiele, M., Fullam, A., Kuhn, M., Holm, J. C., Bork, P., Krag, A., Hansen, T. & 2 flere, Arumugam, Mani & Matthijnssens, J., 2021, I: mSystems. 6, 5, 20 s., e00382-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Ecological adaptation and succession of human fecal microbial communities in an automated in vitro fermentation system

    Gnanasekaran, Thiyagarajan, Geraldo, Juliana Assis, Ahrenkiel, D. W., Alvarez Silva, Maria Camila, Saenz, C., Khan, Adnan, Hanteer, O., Gunalan, V., Trost, K., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2021, I: mSystems. 6, 4, 18 s., e00232-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Genomic diversity and ecology of human-associated Akkermansia species in the gut microbiome revealed by extensive metagenomic assembly

    Karcher, N., Nigro, E., Puncochar, M., Blanco-Miguez, A., Ciciani, M., Manghi, P., Zolfo, M., Cumbo, F., Manara, S., Golzato, D., Cereseto, A., Arumugam, Mani, Bui, T. P. N., Tytgat, H. L. P., Valles-Colomer, M., de Vos, W. M. & Segata, N., 2021, I: Genome Biology. 22, 24 s., 209.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Prognostic performance of 7 biomarkers compared to liver biopsy in early alcohol-related liver disease

    Rasmussen, D. N., Thiele, M., Johansen, S., Kjærgaard, M., Lindvig, K. P., Israelsen, M., Antonsen, S., Detlefsen, S., Krag, A., Anastasiadou, E., Arumugam, M., Bork, P., Hansen, T., Hartoft, C., Israelsen, H., Karsdal, M., Legido-Quigley, C., Melberg, H. O., Trebicka, J., Mann, M. & 2 flere, Matthijnssens, J. & MicrobLiver consortia, M. C., 2021, I: Journal of Hepatology. 75, 5, s. 1017-1025 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Reporting guidelines for human microbiome research: the STORMS checklist

    Mirzayi, C., Renson, A., Furlanello, C., Sansone, S. A., Zohra, F., Elsafoury, S., Geistlinger, L., Kasselman, L. J., Eckenrode, K., van de Wijgert, J., Loughman, A., Marques, F. Z., MacIntyre, D. A., Arumugam, M., Azhar, R., Beghini, F., Bergstrom, K., Bhatt, A., Bisanz, J. E., Braun, J. & 32 flere, Bravo, H. C., Buck, G. A., Bushman, F., Casero, D., Clarke, G., Collado, M. C., Cotter, P. D., Cryan, J. F., Demmer, R. T., Devkota, S., Elinav, E., Escobar, J. S., Fettweis, J., Finn, R. D., Fodor, A. A., Forslund, S., Franke, A., Furlanello, C., Gilbert, J., Grice, E., Haibe-Kains, B., Handley, S., Herd, P., Holmes, S., Jacobs, J. P., Karstens, L., Knight, R., Knights, D., Koren, O., Kwon, D. S., Genomic Standards Consortium, G. S. C. & Massive Analysis and Quality Control Society, M. A. A. Q. C. S., 2021, I: Nature Medicine. 27, 11, s. 1885-1892 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Trans-ethnic gut microbial signatures of prediabetic subjects from India and Denmark

    Pinna, N. K., Anjana, R. M., Saxena, S., Dutta, A., Gnanaprakash, V., Rameshkumar, G., Aswath, S., Raghavan, S., Rani, C. S. S., Radha, V., Balasubramanyam, M., Pant, A., Nielsen, T., Jørgensen, T., Færch, K., Kashani, A., Silva, M. C. A., Vestergaard, H., Hansen, T. H., Hansen, T. & 6 flere, Arumugam, Mani, Nair, G. B., Das, B., Pedersen, Oluf Borbye, Mohan, V. & Mande, S. S., 2021, I: Genome Medicine. 13, 20 s., 36.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Trans-ethnic gut microbiota signatures of type 2 diabetes in Denmark and India

    Alvarez-Silva, C., Kashani, A., Hansen, T. H., Pinna, N. K., Anjana, R. M., Dutta, A., Saxena, S., Støy, J., Kampmann, U., Nielsen, T., Jørgensen, T., Gnanaprakash, V., Gnanavadivel, R., Sukumaran, A., Rani, C. S. S., Færch, K., Radha, V., Balasubramanyam, M., Nair, G. B., Das, B. & 6 flere, drb459, drb459, Hansen, Torben, Mande, S. S., Mohan, V., Arumugam, Mani & Pedersen, Oluf Borbye, 2021, I: Genome Medicine. 13, 37.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Utilizing the gut microbiome in decompensated cirrhosis and acute-on-chronic liver failure

    Trebicka, J., Bork, P., Krag, A. & Arumugam, Mani, 2021, I: Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology. 18, s. 167-180 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  22. 2020
  23. Udgivet

    Butyrate producing colonic Clostridiales metabolise human milk oligosaccharides and cross feed on mucin via conserved pathways

    Pichler, M. J., Yamada, C., Shuoker, B., Alvarez Silva, Maria Camila, Gotoh, A., Leth, M. L., Schoof, E., Katoh, T., Sakanaka, M., Katayama, T., Jin, C., Karlsson, N. G., Arumugam, Mani, Fushinobu, S. & Abou Hachem, M., 2020, I: Nature Communications. 11, 15 s., 3285.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Identification of Novel Bioactive Metabolites Produced During the Cocultivation of Probiotic Strains and Clostridium Difficile in In Vitro Setup

    Gnanasekaran, Thiyagarajan, Saenz, C., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2020, I: Journal of Clinical Gastroenterology. 54, Suppl. 1, s. S12 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

  25. Udgivet

    Perturbation of gut microbiota decreases susceptibility but does not modulate ongoing autoimmune neurological disease

    Gödel, C., Kunkel, B., Kashani, A., Lassmann, H., Arumugam, Mani & Krishnamoorthy, G., 2020, I: Journal of Neuroinflammation. 17, 1, s. 79

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    The intestinal microbiome is a co-determinant of the postprandial plasma glucose response

    Søndertoft, N. B., Vogt, J. K., Arumugam, Mani, Kristensen, M., Gøbel, R. J., Fan, Yong, Lyu, Liwei, Bahl, M. I., Eriksen, C., Ängquist, Lars, Frøkiær, Hanne, Hansen, T. H., Brix, Susanne, Nielsen, H. B., Hansen, Torben, Vestergaard, H., Gupta, R., Licht, T. R., Lauritzen, Lotte & Pedersen, Oluf Borbye, 2020, I: P L o S One. 15, 9, 23 s., e0238648.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Trust is good, control is better: technical considerations in blood microbiome analysis

    Schierwagen, R., Alvarez Silva, Maria Camila, Servant, F., Trebicka, J., Lelouvier, B. & Arumugam, Mani, 2020, I: Gut. 69, 7, s. 1362-1363

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Variation in Bile Microbiome by the Etiology of Cholestatic Liver Disease

    Tyc, O., Jansen, C., Schierwagen, R., Uschner, F. E., Israelsen, M., Klein, S., Ortiz, C., Strassburg, C. P., Zeuzem, S., Gu, W., Torres, S., Praktiknjo, M., Kersting, S., Langheinrich, M., Nattermann, J., Servant, F., Arumugam, M., Krag, A., Lelouvier, B., Weismueller, T. J. & 1 flere, Trebicka, J., 2020, I: Liver Transplantation. 26, 12, s. 1652-1657 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning

  29. 2019
  30. Udgivet

    Author Correction: Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation (Nature Medicine, (2019), 25, 4, (667-678), 10.1038/s41591-019-0405-7)

    Thomas, A. M., Manghi, P., Asnicar, F., Pasolli, E., Armanini, F., Zolfo, M., Beghini, F., Manara, S., Karcher, N., Pozzi, C., Gandini, S., Serrano, D., Tarallo, S., Francavilla, A., Gallo, G., Trompetto, M., Ferrero, G., Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S. & 19 flere, Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Wirbel, J., Schrotz-King, P., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P., Zeller, G., Cordero, F., Dias-Neto, E., Setubal, J. C., Tett, A., Pardini, B., Rescigno, M., Waldron, L., Naccarati, A. & Segata, N., 1 dec. 2019, I: Nature Medicine. 25, 12, s. 1948 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Author Correction: Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 (Nature Biotechnology, (2019), 37, 8, (852-857), 10.1038/s41587-019-0209-9)

    Bolyen, E., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N. A., Abnet, C. C., Al-Ghalith, G. A., Alexander, H., Alm, E. J., Arumugam, M., Asnicar, F., Bai, Y., Bisanz, J. E., Bittinger, K., Brejnrod, A., Brislawn, C. J., Brown, C. T., Callahan, B. J., Caraballo-Rodríguez, A. M., Chase, J., Cope, E. K. & 92 flere, Da Silva, R., Diener, C., Dorrestein, P. C., Douglas, G. M., Durall, D. M., Duvallet, C., Edwardson, C. F., Ernst, M., Estaki, M., Fouquier, J., Gauglitz, J. M., Gibbons, S. M., Gibson, D. L., Gonzalez, A., Gorlick, K., Guo, J., Hillmann, B., Holmes, S., Holste, H., Huttenhower, C., Huttley, G. A., Janssen, S., Jarmusch, A. K., Jiang, L., Kaehler, B. D., Kang, K. B., Keefe, C. R., Keim, P., Kelley, S. T., Knights, D., Koester, I., Kosciolek, T., Kreps, J., Langille, M. G. I., Lee, J., Ley, R., Liu, Y. X., Loftfield, E., Lozupone, C., Maher, M., Marotz, C., Martin, B. D., McDonald, D., McIver, L. J., Melnik, A. V., Metcalf, J. L., Morgan, S. C., Morton, J. T., Naimey, A. T., Navas-Molina, J. A., Nothias, L. F., Orchanian, S. B., Pearson, T., Peoples, S. L., Petras, D., Preuss, M. L., Pruesse, E., Rasmussen, L. B., Rivers, A., Robeson, M. S., Rosenthal, P., Segata, N., Shaffer, M., Shiffer, A., Sinha, R., Song, S. J., Spear, J. R., Swafford, A. D., Thompson, L. R., Torres, P. J., Trinh, P., Tripathi, A., Turnbaugh, P. J., Ul-Hasan, S., van der Hooft, J. J. J., Vargas, F., Vázquez-Baeza, Y., Vogtmann, E., von Hippel, M., Walters, W., Wan, Y., Wang, M., Warren, J., Weber, K. C., Williamson, C. H. D., Willis, A. D., Xu, Z. Z., Zaneveld, J. R., Zhang, Y., Zhu, Q., Knight, R. & Caporaso, J. G., 1 sep. 2019, I: Nature Biotechnology. 37, 9, s. 1091 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    Circulating microbiome in blood of different circulatory compartments

    Schierwagen, R., Alvarez Silva, Maria Camila, Madsen, M. S. A., Kolbe, C. C., Meyer, C., Thomas, D., Uschner, F. E., Magdaleno, F., Jansen, C., Pohlmann, A., Praktiknjo, M., Hischebeth, G. T., Molitor, E., Latz, E., Lelouvier, B., Trebicka, J. & Arumugam, Mani, 2019, I: Gut. 68, 3, s. 578-580

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  33. Udgivet

    Compartmentalization of Immune Response and Microbial Translocation in Decompensated Cirrhosis

    Alvarez Silva, Maria Camila, Schierwagen, R., Pohlmann, A., Magdaleno, F., Uschner, F. E., Ryan, P., Vehreschild, M. J. G. T., Claria, J., Latz, E., Lelouvier, B., Arumugam, Mani & Trebicka, J., 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 11 s., 69.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Genes controlling the activation of natural killer lymphocytes are epigenetically remodeled in intestinal cells from germ-free mice

    Poupeau, A., Garde, C., Sulek, K., Citirikkaya, K., Treebak, Jonas Thue, Arumugam, Mani, Simar, D., Olofsson, L. E., Bäckhed, F. & Barrès, Romain, 2019, I: F A S E B Journal. 33, 2, s. 2719-2731 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    Genetic studies of abdominal MRI data identify genes regulating hepcidin as major determinants of liver iron concentration

    Wilman, H. R., Parisinos, C. A., Atabaki-Pasdar, N., Kelly, M., Thomas, E. L., Neubauer, S., Jennison, C., Ehrhardt, B., Baum, P., Schoelsch, C., Freijer, J., Grempler, R., Graefe-Mody, U., Hennige, A., Dings, C., Lehr, T., Scherer, N., Sihinecich, I., Pattou, F., Raverdi, V. & 31 flere, Caiazzo, R., Torres, F., Verkindt, H., Mari, A., Tura, A., Giorgino, T., Bizzotto, Froguel, P., Brorsson, C., Brunak, Søren, De Masi, F., Pedersen, H., Banasik, Karina, Thomas, Cecilia Engel, Lundgaard, Agnete Troen, Nielsen, A., Mazzoni, G., Karaderi, Tugce, Rasmussen, Simon, Johansen, Joachim, Allesøe, R., Arumugam, Mani, Allin, K., Hansen, Torben, Hansen, T., Jonsson, Anna Elisabet, Pedersen, Oluf Borbye, Dutta, A., Vogt, J., drb459, drb459 & IMI-DIRECT consortium, I. C., 2019, I: Journal of Hepatology. 71, 3, s. 594-602 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    Impaired glucose metabolism and altered gut microbiome despite calorie restriction of ob/ob mice

    Kashani, A., Brejnrod, A. D., Jin, C., Kern, T., Madsen, A. N., Holm, L. A., Gerber, G. K., Holm, Jens-Christian, Hansen, Torben, Holst, Birgitte & Arumugam, Mani, 2019, I: Animal Microbiome. 1, 1, 16 s., 11.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer

    Wirbel, J., Pyl, P. T., Kartal, E., Zych, K., Kashani, A., Milanese, A., Fleck, J. S., Voigt, A. Y., Palleja, A., Ponnudurai, R., Sunagawa, S., Coelho, L. P., Schrotz-King, P., Vogtmann, E., Habermann, N., Niméus, E., Thomas, A. M., Manghi, P., Gandini, S., Serrano, D. & 15 flere, Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S., Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Waldron, L., Naccarati, A., Segata, N., Sinha, R., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P. & Zeller, G., 2019, I: Nature Medicine. 25, 4, s. 679-689 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation

    Thomas, A. M., Manghi, P., Asnicar, F., Pasolli, E., Armanini, F., Zolfo, M., Beghini, F., Manara, S., Karcher, N., Pozzi, C., Gandini, S., Serrano, D., Tarallo, S., Francavilla, A., Gallo, G., Trompetto, M., Ferrero, G., Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S. & 19 flere, Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Wirbel, J., Schrotz-King, P., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P., Zeller, G., Cordero, F., Dias-Neto, E., Setubal, J. C., Tett, A., Pardini, B., Rescigno, M., Waldron, L., Naccarati, A. & Segata, N., 2019, I: Nature Medicine. 25, 4, s. 667-678 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2

    Bolyen, E., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N., Abnet, C. C., Al-Ghalith, G. A., Alexander, H., Alm, E. J., Arumugam, M., Asnicar, F., Bai, Y., Bisanz, J. E., Bittinger, K., Brejnrod, A., Brislawn, C. J., Brown, C. T., Callahan, B. J., Caraballo-Rodriguez, A. M., Chase, J., Cope, E. K. & 92 flere, Da Silva, R., Diener, C., Dorrestein, P. C., Douglas, G. M., Durall, D. M., Duvallet, C., Edwardson, C. F., Ernst, M., Estaki, M., Fouquier, J., Gauglitz, J. M., Gibbons, S. M., Gibson, D. L., Gonzalez, A., Gorlick, K., Guo, J., Hillmann, B., Holmes, S., Holste, H., Huttenhower, C., Huttley, G. A., Janssen, S., Jarmusch, A. K., Jiang, L., Kaehler, B. D., Bin Kang, K., Keefe, C. R., Keim, P., Kelley, S. T., Knights, D., Koester, I., Kosciolek, T., Kreps, J., Langille, M. G. I., Lee, J., Ley, R., Liu, Y., Loftfield, E., Lozupone, C., Maher, M., Marotz, C., Martin, B. D., McDonald, D., McIver, L. J., Melnik, A. V., Metcalf, J. L., Morgan, S. C., Morton, J. T., Naimey, A. T., Navas-Molina, J. A., Nothias, L. F., Orchanian, S. B., Pearson, T., Peoples, S. L., Petras, D., Preuss, M. L., Pruesse, E., Rasmussen, L. B., Rivers, A., Robeson, M. S. ,. I., Rosenthal, P., Segata, N., Shaffer, M., Shiffer, A., Sinha, R., Song, S. J., Spear, J. R., Swafford, A. D., Thompson, L. R., Torres, P. J., Trinh, P., Tripathi, A., Turnbaugh, P. J., Ul-Hasan, S., vander Hooft, J. J. J., Vargas, F., Vazquez-Baeza, Y., Vogtmann, E., von Hippel, M., Walters, W., Wan, Y., Wang, M., Warren, J., Weber, K. C., Williamson, C. H. D., Willis, A. D., Xu, Z. Z., Zaneveld, J. R., Zhang, Y., Zhu, Q., Knight, R. & Caporaso, J. G., 2019, I: Nature Biotechnology. 37, 8, s. 852-857

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  40. 2018
  41. Udgivet

    The role of the bacterial microbiota in alcoholic and non-alcoholic fatty liver disease

    Madsen, Anne Lundager, Brach, Thorsten, Kern, T., Bak, Emilie Glad, Nielsen, T. & Arumugam, Mani, 9 nov. 2018, The Human Gut-Liver-Axis in Health and Disease. Springer, s. 89-104 16 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Undervisning

  42. Udgivet

    The role of the mycobiota in the gut-liver axis

    Alvarez Silva, Maria Camila, Brach, Thorsten, Brejnrod, A. D. & Arumugam, Mani, 9 nov. 2018, The Human Gut-Liver-Axis in Health and Disease. Springer, s. 133-145 13 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Undervisning

  43. Udgivet

    Recovery of gut microbiota of healthy adults following antibiotic exposure

    Palleja, A., Mikkelsen, K. H., Forslund, S. K., Kashani, A., Allin, K. H., Nielsen, T., Hansen, T. H., Liang, S., Feng, Q., Zhang, C., Pyl, P. T., Coelho, L. P., Yang, H., Wang, J., Typas, A., Nielsen, M. F., Nielsen, H. B., Bork, P., Wang, J., Vilsbøll, T. & 4 flere, Hansen, Torben, Knop, Filip Krag, Arumugam, Mani & Pedersen, Oluf Borbye, nov. 2018, I: Nature Microbiology. 3, 11, s. 1255-1265 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Antifibrotic and molecular aspects of rifaximin in alcoholic liver disease: study protocol for a randomized controlled trial

    Madsen, B. S., Trebicka, J., Thiele, M., Israelsen, M., Arumugam, Mani, Havelund, T. & Krag, A., 2018, I: Trials. 19, s. 1-5 5 s., 143.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition

    Costea, P. I., Hildebrand, F., Manimozhiyan, A., Bäckhed, F., Blaser, M. J., Bushman, F. D., De Vos, W. M., Ehrlich, S. D., Fraser, C. M., Hattori, M., Huttenhower, C., Jeffery, I. B., Knights, D., Lewis, J. D., Ley, R. E., Ochman, H., O'Toole, P. W., Quince, C., Relman, D. A., Shanahan, F. & 9 flere, Sunagawa, S., Wang, J., Weinstock, G. M., Wu, G. D., Zeller, G., Zhao, L., Raes, J., Knight, R. & Bork, P., 2018, I: Nature Microbiology. 3, 1, s. 8-16 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. 2017
  47. Udgivet

    Complete Genome Sequences of emm111 Type Streptococcus pyogenes Strain GUR, with Antitumor Activity, and Its Derivative Strain GURSA1 with an Inactivated emm Gene

    Suvorova, M. A., Tsapieva, A. N., Bak, Emilie Glad, Chereshnev, V. A., Kiseleva, E. P., Suvorov, A. N. & Arumugam, Mani, 21 sep. 2017, I: Genome Announcements. 5, 38, 2 s., e00939-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  48. Udgivet

    Corrigendum: Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

    Forslund, K., Hildebrand, F., Nielsen, T., Falony, G., Le Chatelier, E., Sunagawa, S., Prifti, E., Vieira-Silva, S., Gudmundsdottir, V., Pedersen, H. K., Arumugam, M., Kristiansen, K., Voigt, A. Y., Vestergaard, H., Hercog, R., Costea, P. I., Kultima, J. R., Li, J., Jørgensen, T., Levenez, F. & 10 flere, Doré, J., Nielsen, H. B., Brunak, Søren, Raes, J., Hansen, Torben, Wang, J., Ehrlich, S. D., Bork, P., Pedersen, Oluf Borbye & MetaHIT consortium, M. C., 3 maj 2017, I: Nature. 545, 116, 1 s., 22318.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning

  49. Udgivet

    High-fat feeding rather than obesity drives taxonomical and functional changes in the gut microbiota in mice

    Xiao, L., Sonne, S. B., Feng, Q., Chen, N., Xia, Z., Li, X., Fang, Z., Zhang, D., Fjære, E., Midtbø, L. K., Derrien, M., Hugenholtz, F., Tang, L., Li, J., Zhang, J., Liu, C., Hao, Q., Vogel, U. B., Mortensen, A., Kleerebezem, M. & 8 flere, Licht, T. R., Yang, H., Wang, J., Li, Y., Arumugam, Mani, Wang, J., Madsen, L. & Kristiansen, Karsten, 8 apr. 2017, I: Microbiome. 5, 12 s., 43.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Metagenomic analysis of faecal microbiome as a tool towards targeted non-invasive biomarkers for colorectal cancer

    Yu, J., Feng, Q., Wong, S. H., Zhang, D., Liang, Q. Y., Qin, Y., Tang, L., Zhao, H., Stenvang, J., Li, Y., Wang, X., Xu, X., Chen, N., Wu, W. K. K., Al-Aama, J., Nielsen, H. J., Kiilerich, P., Jensen, B. A. H., Yau, T. O., Lan, Z. & 19 flere, Jia, H., Li, J., Xiao, L., Lam, T. Y. T., Ng, S. C., Cheng, A. S., Wong, V. W., Chan, F. K. L., Xu, X., Yang, H., Madsen, L., Datz, C., Tilg, H., Wang, J., Brünner, N., Kristiansen, Karsten, Arumugam, Mani, Sung, J. J. & Wang, J., 2017, I: Gut. 66, s. 70-78 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  51. 2016
  52. Udgivet

    An Improved Method for High Quality Metagenomics DNA Extraction from Human and Environmental Samples

    Bag, S., Saha, B., Mehta, O., Anbumani, D., Kumar, N., Dayal, M., Pant, A., Kumar, P., Saxena, S., Allin, K. H., Hansen, T., Arumugam, M., Vestergaard, H., Pedersen, O., Pereira, V., Abraham, P., Tripathi, R., Wadhwa, N., Bhatnagar, S., Prakash, V. G. & 7 flere, Radha, V., Anjana, R. M., Mohan, V., Takeda, K., Kurakawa, T., Nair, G. B. & Das, B., 2016, I: Scientific Reports. 6, 9 s., 26775.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  53. Udgivet

    Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

    Pedersen, H. K., Gudmundsdottir, V., Nielsen, H. B., Hyotylainen, T., Nielsen, T., Jensen, B. A. H., Forslund, K., Hildebrand, F., Prifti, E., Falony, G., Le Chatelier, E., Levenez, F., Doré, J., Mattila, I., Plichta, D. R., Pöhö, P., Hellgren, L. I., Arumugam, M., Sunagawa, S., Vieira-Silva, S. & 14 flere, Jørgensen, T., Holm, J. B., Trošt, K., Kristiansen, Karsten, Brix, Susanne, Raes, J., Wang, J., Hansen, Torben, Bork, P., Brunak, Søren, Oresic, M., Ehrlich, S. D., Pedersen, Oluf Borbye & MetaHIT Consortium, M. C., 2016, I: Nature. 535, 7612, s. 376-381 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  54. Udgivet

    Roux-en-Y gastric bypass surgery of morbidly obese patients induces swift and persistent changes of the individual gut microbiota

    Palleja, A., Kashani, A., Allin, K. H., Nielsen, T., Zhang, C., Li, Y., Brach, Thorsten, Liang, S., Feng, Q., Jørgensen, N. B., Bojsen-Møller, K. N., Dirksen, C., Burgdorf, Kristoffer Sølvsten, Holst, Jens Juul, Madsbad, Sten, Wang, J., Pedersen, Oluf Borbye, Hansen, Torben & Arumugam, Mani, 2016, I: Genome Medicine. 8, 13 s., 67.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. 2015
  56. Udgivet

    Interplay between FGF21 and insulin action in the liver regulates metabolism

    Emanuelli, Brice, Vienberg, S. G., Smyth, G., Cheng, C., Stanford, K. I., Arumugam, Mani, Michael, M. D., Adams, A. C., Kharitonenkov, A. & Kahn, C. R., jan. 2015, I: The Journal of Clinical Investigation. 125, 1, s. 458

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

  57. Udgivet

    A catalog of the mouse gut metagenome: [incl. Author Correction]

    Xiao, L., Feng, Q., Liang, S., Sonne, S. B., Xia, Z., Qiu, X., Li, X., Long, H., Zhang, J., Zhang, D., Liu, C., Fang, Z., Chou, J., Glanville, J., Hao, Q., Kotowska, D. E., Colding, C. S., Licht, T. R., Wu, D., Yu, J. & 17 flere, Sung, J. J. Y., Liang, Q., Li, J., Jia, H., Lan, Z., Tremaroli, V., Dworzynski, P., Nielsen, H. B., Bäckhed, G. F., Dore, J., Le Chatelier, E., Ehrlich, S. D., Lin, J. C., Arumugam, Mani, Wang, J., Madsen, L. & Kristiansen, Karsten, 2015, I: Nature Biotechnology. 33, 10, s. 1103-1108 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  58. Udgivet

    Disentangling type 2 diabetes and metformin treatment signatures in the human gut microbiota

    Forslund, K., Hildebrand, F., Nielsen, T., Falony, G., Le Chatelier, E., Sunagawa, S., Prifti, E., Vieira-Silva, S., Gudmundsdottir, V., Pedersen, H. K., Arumugam, M., Kristiansen, K., Yvonne Voigt, A., Vestergaard, H., Hercog, R., Igor Costea, P., Roat Kultima, J., Li, J., Jørgensen, T., Levenez, F. & 9 flere, Dore, J., Nielsen, H. B., Brunak, Søren, Raes, J., Hansen, Torben, Wang, J., Dusko Ehrlich, S., Bork, P. & Pedersen, Oluf Borbye, 2015, I: Nature. 528, 7581, s. 262-266 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  59. Udgivet

    Gut microbiome development along the colorectal adenoma-carcinoma sequence

    Feng, Q., Liang, S., Jia, H., Stadlmayr, A., Tang, L., Lan, Z., Zhang, D., Xia, H., Xu, X., Jie, Z., Su, L., Li, X., Li, X., Li, J., Xiao, L., Huber-Schönauer, U., Niederseer, D., Xu, X., Al-Aama, J. Y., Yang, H. & 6 flere, Wang, J., Kristiansen, Karsten, Arumugam, Mani, Tilg, H., Datz, C. & Wang, J., 2015, I: Nature Communications. 6, 13 s., 6528.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 41056735