Mani Arumugam

Mani Arumugam


  1. 2023
  2. Udgivet

    Clostridium scindens secretome suppresses virulence gene expression of Clostridioides difficile in a bile acid-independent manner

    Saenz, C., Fang, Q., Gnanasekaran, Thiyagarajan, Trammell, Sam, Buijink, Jesse A., Pisano, P., Wierer, M., Moens, F., Lengger, B., Brejnrod, A. & Arumugam, Mani, 2023, I: Microbiology Spectrum. 11, 5, s. 1-18 e0393322.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Genetic analysis of blood molecular phenotypes reveals common properties in the regulatory networks affecting complex traits

    Brown, A. A., Fernandez-Tajes, J. J., Hong, M. G., Brorsson, C. A., Koivula, R. W., Davtian, D., Dupuis, T., Sartori, A., Michalettou, T. D., Forgie, I. M., Adam, J., Allin, K. H., Caiazzo, R., Cederberg, H., De Masi, F., Elders, P. J. M., Giordano, G. N., Haid, M., Hansen, T., Hansen, T. H. & 134 flere, Hattersley, A. T., Heggie, A. J., Howald, C., Jones, A. G., Kokkola, T., Laakso, M., Mahajan, A., Mari, A., McDonald, T. J., McEvoy, D., Mourby, M., Musholt, P. B., Nilsson, B., Pattou, F., Penet, D., Raverdy, V., Ridderstråle, M., Romano, L., Rutters, F., Sharma, S., Teare, H., ‘t Hart, L., Tsirigos, Konstantinos, Vangipurapu, J., drb459, drb459, Brunak, Søren, Franks, P. W., Frost, G., Grallert, H., Jablonka, B., McCarthy, M. I., Pavo, I., Pedersen, Oluf Borbye, Ruetten, H., Walker, M., Adragni, K., Allesøe, R. L. L., Artati, A. A., Arumugam, Mani, Atabaki-Pasdar, N., Baltauss, T., Banasik, Karina, Barnett, A. L., Baum, P., Bell, J. D., Beulens, J. W., Bianzano, S. B., Bizzotto, R., Bonnefond, A., Cabrelli, L., Dale, M., Dawed, A. Y., de Preville, N., Dekkers, K. F., Deshmukh, H. A., Dings, C., Donnelly, L., Dutta, A., Ehrhardt, B., pjx571, pjx571, Eriksen, R., Fan, Yong, Ferrer, J., Fitipaldi, H., Forman, A., Fritsche, A., Froguel, P., Gassenhuber, J., Gough, S., Graefe-Mody, U., Grempler, R., Groeneveld, L., Groop, L., Gudmundsdóttir, V., Gupta, R., Hennige, A. M. H., Hill, A. V., Holl, R. W., Hudson, M., Jacobsen, Ulrik Plesner, Jennison, C., Johansen, Joachim, Jonsson, Anna Elisabet, Karaderi, Tugce, Kaye, J., Kennedy, G., Klintenberg, M., Kuulasmaa, T., Lehr, T., Loftus, H., Lundgaard, Agnete Troen, Mazzoni, G., McRobert, N., McVittie, I., Nice, R., Nicolay, C., Nijpels, G., Palmer, C. N., Pedersen, H. K., Perry, M. H., Pomares-Millan, H., Prehn, C. P., Ramisch, A., Rasmussen, Simon, Robertson, N., Rodriquez, M., Sackett, P., Scherer, N., Shah, N., Sihinevich, I., Slieker, R. C., Sondertoft, N. B., Steckel-Hamann, B., Thomas, M. K., Thomas, Cecilia Engel, Thomas, E. L. L., Thorand, B., Thorne, C. E., Tillner, J., Tura, A., Uhlen, M., van Leeuwen, N., van Oort, S., Verkindt, H., Vogt, J., Wad Sackett, P. W., Wesolowska-Andersen, A., Whitcher, B., White, M. W., Adamski, J., Schwenk, J. M., Pearson, E. R., Dermitzakis, E. T. & Viñuela, A., 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 5062.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. E-pub ahead of print

    Impact of acute alcohol consumption on circulating microbiome in asymptomatic alcohol-related liver disease

    Israelsen, M., Alvarez Silva, Maria Camila, Madsen, B. S., Hansen, C. D., Torp, N. C., Johansen, S., Hansen, J. K., Prier Lindvig, K., Insonere, J., Riviere, V., Juel, H. B., Brejnrod, A., Jensen, Lars Juhl, Thiele, M., Lelouvier, B., Hansen, Torben, Arumugam, Mani & Krag, A., 2023, (E-pub ahead of print) I: Gut. gutjnl-2023-330360.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Oral supplementation of nicotinamide riboside alters intestinal microbial composition in rats and mice, but not humans

    Peluso, A. A., Lundgaard, A. T., Babaei, P., Mousovich-Neto, F., Rocha, A. L., Damgaard, M. V., Bak, E. G., Gnanasekaran, T., Dollerup, O. L., Trammell, S. A. J., Nielsen, T. S., Kern, T., Abild, C. B., Sulek, K., Ma, T., Gerhart-Hines, Z., Gillum, M. P., Arumugam, M., Ørskov, C., McCloskey, D. & 4 flere, Jessen, N., Herrgård, M. J., Mori, M. A. S. & Treebak, Jonas Thue, 2023, I: npj Aging. 9, 21 s., 7.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Quantitative differences in synthetic gut microbial inoculums do not affect the final stabilized in vitro community compositions

    Gnanasekaran, Thiyagarajan, Sarathi, Arjun, Fang, Q., Azarm, A., Geraldo, Juliana Assis, Nigro, E. & Arumugam, Mani, 2023, I: mSystems. 8, 4, 16 s., e0124922.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Rifaximin-α for liver fibrosis in patients with alcohol-related liver disease (GALA-RIF): a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 2 trial

    Israelsen, M., Madsen, B. S., Torp, N., Johansen, S., Hansen, C. D., Detlefsen, S., Andersen, P., Hansen, J. K., Lindvig, K. P., Rasmussen, D. N., Thorhauge, K. H., Kjærgaard, M., Karsdal, M., Hansen, Torben, Arumugam, Mani, Trebicka, J., Thiele, M., Krag, A. & GALAXY, G., 2023, I: The Lancet Gastroenterology and Hepatology. 8, 6, s. 523-532 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Sphingolipids Are Depleted in Alcohol-Related Liver Fibrosis

    Thiele, M., Suvitaival, T., Trošt, K., Kim, M., de Zawadzki, A., Kjaergaard, M., Rasmussen, D. N., Lindvig, K. P., Israelsen, M., Detlefsen, S., Andersen, P., Juel, H. B., Nielsen, T., Georgiou, S., Filippa, V., Kuhn, M., Nishijima, S., Moitinho-Silva, L., Rossing, P., Trebicka, J. & 14 flere, Anastasiadou, E., Bork, P., Hansen, T., Legido-Quigley, C., Krag, A., Mann, M., Matthijnssens, J., Arumugam, Mani, Henrar, R., Israelsen, H., Karsdal, M., Melberg, H. O., MicrobLiver Consortium, M. C. & GALAXY Consortium, G. C., 2023, I: Gastroenterology. 164, 7, s. 1248-1260

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. 2022
  10. Udgivet

    MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration

    Saenz, C., Nigro, E., Gunalan, V. & Arumugam, Mani, 2022, I: Frontiers in Bioinformatics. 2, 15 s., 846922.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs

    Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    The effect of gluten in adolescents and young adults with gastrointestinal symptoms: A blinded randomised cross-over trial

    Crawley, C., Savino, N., Halby, C., Sander, S. D., Nybo Andersen, Anne-Marie, Arumugam, Mani, Murray, J., Christensen, R. & Husby, S., 2022, I: Alimentary Pharmacology and Therapeutics, Supplement. 55, 9, s. 1116-1127 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. 2021
  14. Udgivet

    A Previously Undescribed Highly Prevalent Phage Identified in a Danish Enteric Virome Catalog

    Van Espen, L., Bak, E. G., Beller, L., Close, L., Deboutte, W., Juel, H. B., Nielsen, T., Sinar, D., De Coninck, L., Frithioff-Bøjsøe, C., Fonvig, C. E., Jacobsen, S., Kjærgaard, M., Thiele, M., Fullam, A., Kuhn, M., Holm, J. C., Bork, P., Krag, A., Hansen, T. & 2 flere, Arumugam, Mani & Matthijnssens, J., 2021, I: mSystems. 6, 5, 20 s., e00382-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Ecological adaptation and succession of human fecal microbial communities in an automated in vitro fermentation system

    Gnanasekaran, Thiyagarajan, Geraldo, Juliana Assis, Ahrenkiel, D. W., Alvarez Silva, Maria Camila, Saenz, C., Khan, Adnan, Hanteer, O., Gunalan, V., Trost, K., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2021, I: mSystems. 6, 4, 18 s., e00232-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Genomic diversity and ecology of human-associated Akkermansia species in the gut microbiome revealed by extensive metagenomic assembly

    Karcher, N., Nigro, E., Puncochar, M., Blanco-Miguez, A., Ciciani, M., Manghi, P., Zolfo, M., Cumbo, F., Manara, S., Golzato, D., Cereseto, A., Arumugam, Mani, Bui, T. P. N., Tytgat, H. L. P., Valles-Colomer, M., de Vos, W. M. & Segata, N., 2021, I: Genome Biology. 22, 24 s., 209.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Prognostic performance of 7 biomarkers compared to liver biopsy in early alcohol-related liver disease

    Rasmussen, D. N., Thiele, M., Johansen, S., Kjærgaard, M., Lindvig, K. P., Israelsen, M., Antonsen, S., Detlefsen, S., Krag, A., Anastasiadou, E., Arumugam, M., Bork, P., Hansen, T., Hartoft, C., Israelsen, H., Karsdal, M., Legido-Quigley, C., Melberg, H. O., Trebicka, J., Mann, M. & 2 flere, Matthijnssens, J. & MicrobLiver consortia, M. C., 2021, I: Journal of Hepatology. 75, 5, s. 1017-1025 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Reporting guidelines for human microbiome research: the STORMS checklist

    Mirzayi, C., Renson, A., Furlanello, C., Sansone, S. A., Zohra, F., Elsafoury, S., Geistlinger, L., Kasselman, L. J., Eckenrode, K., van de Wijgert, J., Loughman, A., Marques, F. Z., MacIntyre, D. A., Arumugam, M., Azhar, R., Beghini, F., Bergstrom, K., Bhatt, A., Bisanz, J. E., Braun, J. & 32 flere, Bravo, H. C., Buck, G. A., Bushman, F., Casero, D., Clarke, G., Collado, M. C., Cotter, P. D., Cryan, J. F., Demmer, R. T., Devkota, S., Elinav, E., Escobar, J. S., Fettweis, J., Finn, R. D., Fodor, A. A., Forslund, S., Franke, A., Furlanello, C., Gilbert, J., Grice, E., Haibe-Kains, B., Handley, S., Herd, P., Holmes, S., Jacobs, J. P., Karstens, L., Knight, R., Knights, D., Koren, O., Kwon, D. S., Genomic Standards Consortium, G. S. C. & Massive Analysis and Quality Control Society, M. A. A. Q. C. S., 2021, I: Nature Medicine. 27, 11, s. 1885-1892 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Trans-ethnic gut microbial signatures of prediabetic subjects from India and Denmark

    Pinna, N. K., Anjana, R. M., Saxena, S., Dutta, A., Gnanaprakash, V., Rameshkumar, G., Aswath, S., Raghavan, S., Rani, C. S. S., Radha, V., Balasubramanyam, M., Pant, A., Nielsen, T., Jørgensen, T., Færch, K., Kashani, A., Silva, M. C. A., Vestergaard, H., Hansen, T. H., Hansen, T. & 6 flere, Arumugam, Mani, Nair, G. B., Das, B., Pedersen, Oluf Borbye, Mohan, V. & Mande, S. S., 2021, I: Genome Medicine. 13, 20 s., 36.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Trans-ethnic gut microbiota signatures of type 2 diabetes in Denmark and India

    Alvarez-Silva, C., Kashani, A., Hansen, T. H., Pinna, N. K., Anjana, R. M., Dutta, A., Saxena, S., Støy, J., Kampmann, U., Nielsen, T., Jørgensen, T., Gnanaprakash, V., Gnanavadivel, R., Sukumaran, A., Rani, C. S. S., Færch, K., Radha, V., Balasubramanyam, M., Nair, G. B., Das, B. & 6 flere, drb459, drb459, Hansen, Torben, Mande, S. S., Mohan, V., Arumugam, Mani & Pedersen, Oluf Borbye, 2021, I: Genome Medicine. 13, 37.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Utilizing the gut microbiome in decompensated cirrhosis and acute-on-chronic liver failure

    Trebicka, J., Bork, P., Krag, A. & Arumugam, Mani, 2021, I: Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology. 18, s. 167-180 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  22. 2020
  23. Udgivet

    Butyrate producing colonic Clostridiales metabolise human milk oligosaccharides and cross feed on mucin via conserved pathways

    Pichler, M. J., Yamada, C., Shuoker, B., Alvarez Silva, Maria Camila, Gotoh, A., Leth, M. L., Schoof, E., Katoh, T., Sakanaka, M., Katayama, T., Jin, C., Karlsson, N. G., Arumugam, Mani, Fushinobu, S. & Abou Hachem, M., 2020, I: Nature Communications. 11, 15 s., 3285.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Identification of Novel Bioactive Metabolites Produced During the Cocultivation of Probiotic Strains and Clostridium Difficile in In Vitro Setup

    Gnanasekaran, Thiyagarajan, Saenz, C., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2020, I: Journal of Clinical Gastroenterology. 54, Suppl. 1, s. S12 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  25. Udgivet

    Perturbation of gut microbiota decreases susceptibility but does not modulate ongoing autoimmune neurological disease

    Gödel, C., Kunkel, B., Kashani, A., Lassmann, H., Arumugam, Mani & Krishnamoorthy, G., 2020, I: Journal of Neuroinflammation. 17, 1, s. 79

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    The intestinal microbiome is a co-determinant of the postprandial plasma glucose response

    Søndertoft, N. B., Vogt, J. K., Arumugam, Mani, Kristensen, M., Gøbel, R. J., Fan, Yong, Lyu, Liwei, Bahl, M. I., Eriksen, C., Ängquist, Lars, Frøkiær, Hanne, Hansen, T. H., Brix, Susanne, Nielsen, H. B., Hansen, Torben, Vestergaard, H., Gupta, R., Licht, T. R., Lauritzen, Lotte & Pedersen, Oluf Borbye, 2020, I: P L o S One. 15, 9, 23 s., e0238648.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Trust is good, control is better: technical considerations in blood microbiome analysis

    Schierwagen, R., Alvarez Silva, Maria Camila, Servant, F., Trebicka, J., Lelouvier, B. & Arumugam, Mani, 2020, I: Gut. 69, 7, s. 1362-1363

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Variation in Bile Microbiome by the Etiology of Cholestatic Liver Disease

    Tyc, O., Jansen, C., Schierwagen, R., Uschner, F. E., Israelsen, M., Klein, S., Ortiz, C., Strassburg, C. P., Zeuzem, S., Gu, W., Torres, S., Praktiknjo, M., Kersting, S., Langheinrich, M., Nattermann, J., Servant, F., Arumugam, M., Krag, A., Lelouvier, B., Weismueller, T. J. & 1 flere, Trebicka, J., 2020, I: Liver Transplantation. 26, 12, s. 1652-1657 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskning

  29. 2019
  30. Udgivet

    Author Correction: Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation (Nature Medicine, (2019), 25, 4, (667-678), 10.1038/s41591-019-0405-7)

    Thomas, A. M., Manghi, P., Asnicar, F., Pasolli, E., Armanini, F., Zolfo, M., Beghini, F., Manara, S., Karcher, N., Pozzi, C., Gandini, S., Serrano, D., Tarallo, S., Francavilla, A., Gallo, G., Trompetto, M., Ferrero, G., Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S. & 19 flere, Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Wirbel, J., Schrotz-King, P., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P., Zeller, G., Cordero, F., Dias-Neto, E., Setubal, J. C., Tett, A., Pardini, B., Rescigno, M., Waldron, L., Naccarati, A. & Segata, N., 1 dec. 2019, I: Nature Medicine. 25, 12, s. 1948 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 Næste

ID: 41056735