Mani Arumugam
- 2023
- Udgivet
Clostridium scindens secretome suppresses virulence gene expression of Clostridioides difficile in a bile acid-independent manner
Saenz, C., Fang, Q., Gnanasekaran, Thiyagarajan, Trammell, Sam, Buijink, Jesse A., Pisano, P., Wierer, M., Moens, F., Lengger, B., Brejnrod, A. & Arumugam, Mani, 2023, I: Microbiology Spectrum. 11, 5, s. 1-18 e0393322.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic analysis of blood molecular phenotypes reveals common properties in the regulatory networks affecting complex traits
Brown, A. A., Fernandez-Tajes, J. J., Hong, M. G., Brorsson, C. A., Koivula, R. W., Davtian, D., Dupuis, T., Sartori, A., Michalettou, T. D., Forgie, I. M., Adam, J., Allin, K. H., Caiazzo, R., Cederberg, H., De Masi, F., Elders, P. J. M., Giordano, G. N., Haid, M., Hansen, T., Hansen, T. H. & 134 flere, , 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 5062.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- E-pub ahead of print
Impact of acute alcohol consumption on circulating microbiome in asymptomatic alcohol-related liver disease
Israelsen, M., Alvarez Silva, Maria Camila, Madsen, B. S., Hansen, C. D., Torp, N. C., Johansen, S., Hansen, J. K., Prier Lindvig, K., Insonere, J., Riviere, V., Juel, H. B., Brejnrod, A., Jensen, Lars Juhl, Thiele, M., Lelouvier, B., Hansen, Torben, Arumugam, Mani & Krag, A., 2023, (E-pub ahead of print) I: Gut. gutjnl-2023-330360.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oral supplementation of nicotinamide riboside alters intestinal microbial composition in rats and mice, but not humans
Peluso, A. A., Lundgaard, A. T., Babaei, P., Mousovich-Neto, F., Rocha, A. L., Damgaard, M. V., Bak, E. G., Gnanasekaran, T., Dollerup, O. L., Trammell, S. A. J., Nielsen, T. S., Kern, T., Abild, C. B., Sulek, K., Ma, T., Gerhart-Hines, Z., Gillum, M. P., Arumugam, M., Ørskov, C., McCloskey, D. & 4 flere, , 2023, I: npj Aging. 9, 21 s., 7.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantitative differences in synthetic gut microbial inoculums do not affect the final stabilized in vitro community compositions
Gnanasekaran, Thiyagarajan, Sarathi, Arjun, Fang, Q., Azarm, A., Geraldo, Juliana Assis, Nigro, E. & Arumugam, Mani, 2023, I: mSystems. 8, 4, 16 s., e0124922.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rifaximin-α for liver fibrosis in patients with alcohol-related liver disease (GALA-RIF): a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 2 trial
Israelsen, M., Madsen, B. S., Torp, N., Johansen, S., Hansen, C. D., Detlefsen, S., Andersen, P., Hansen, J. K., Lindvig, K. P., Rasmussen, D. N., Thorhauge, K. H., Kjærgaard, M., Karsdal, M., Hansen, Torben, Arumugam, Mani, Trebicka, J., Thiele, M., Krag, A. & GALAXY, G., 2023, I: The Lancet Gastroenterology and Hepatology. 8, 6, s. 523-532 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sphingolipids Are Depleted in Alcohol-Related Liver Fibrosis
Thiele, M., Suvitaival, T., Trošt, K., Kim, M., de Zawadzki, A., Kjaergaard, M., Rasmussen, D. N., Lindvig, K. P., Israelsen, M., Detlefsen, S., Andersen, P., Juel, H. B., Nielsen, T., Georgiou, S., Filippa, V., Kuhn, M., Nishijima, S., Moitinho-Silva, L., Rossing, P., Trebicka, J. & 14 flere, , 2023, I: Gastroenterology. 164, 7, s. 1248-1260Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
MIntO: A Modular and Scalable Pipeline For Microbiome Metagenomic and Metatranscriptomic Data Integration
Saenz, C., Nigro, E., Gunalan, V. & Arumugam, Mani, 2022, I: Frontiers in Bioinformatics. 2, 15 s., 846922.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs
Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The effect of gluten in adolescents and young adults with gastrointestinal symptoms: A blinded randomised cross-over trial
Crawley, C., Savino, N., Halby, C., Sander, S. D., Nybo Andersen, Anne-Marie, Arumugam, Mani, Murray, J., Christensen, R. & Husby, S., 2022, I: Alimentary Pharmacology and Therapeutics, Supplement. 55, 9, s. 1116-1127 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
A Previously Undescribed Highly Prevalent Phage Identified in a Danish Enteric Virome Catalog
Van Espen, L., Bak, E. G., Beller, L., Close, L., Deboutte, W., Juel, H. B., Nielsen, T., Sinar, D., De Coninck, L., Frithioff-Bøjsøe, C., Fonvig, C. E., Jacobsen, S., Kjærgaard, M., Thiele, M., Fullam, A., Kuhn, M., Holm, J. C., Bork, P., Krag, A., Hansen, T. & 2 flere, , 2021, I: mSystems. 6, 5, 20 s., e00382-21.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecological adaptation and succession of human fecal microbial communities in an automated in vitro fermentation system
Gnanasekaran, Thiyagarajan, Geraldo, Juliana Assis, Ahrenkiel, D. W., Alvarez Silva, Maria Camila, Saenz, C., Khan, Adnan, Hanteer, O., Gunalan, V., Trost, K., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2021, I: mSystems. 6, 4, 18 s., e00232-21.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic diversity and ecology of human-associated Akkermansia species in the gut microbiome revealed by extensive metagenomic assembly
Karcher, N., Nigro, E., Puncochar, M., Blanco-Miguez, A., Ciciani, M., Manghi, P., Zolfo, M., Cumbo, F., Manara, S., Golzato, D., Cereseto, A., Arumugam, Mani, Bui, T. P. N., Tytgat, H. L. P., Valles-Colomer, M., de Vos, W. M. & Segata, N., 2021, I: Genome Biology. 22, 24 s., 209.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prognostic performance of 7 biomarkers compared to liver biopsy in early alcohol-related liver disease
Rasmussen, D. N., Thiele, M., Johansen, S., Kjærgaard, M., Lindvig, K. P., Israelsen, M., Antonsen, S., Detlefsen, S., Krag, A., Anastasiadou, E., Arumugam, M., Bork, P., Hansen, T., Hartoft, C., Israelsen, H., Karsdal, M., Legido-Quigley, C., Melberg, H. O., Trebicka, J., Mann, M. & 2 flere, , 2021, I: Journal of Hepatology. 75, 5, s. 1017-1025 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reporting guidelines for human microbiome research: the STORMS checklist
Mirzayi, C., Renson, A., Furlanello, C., Sansone, S. A., Zohra, F., Elsafoury, S., Geistlinger, L., Kasselman, L. J., Eckenrode, K., van de Wijgert, J., Loughman, A., Marques, F. Z., MacIntyre, D. A., Arumugam, M., Azhar, R., Beghini, F., Bergstrom, K., Bhatt, A., Bisanz, J. E., Braun, J. & 32 flere, , 2021, I: Nature Medicine. 27, 11, s. 1885-1892 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Trans-ethnic gut microbial signatures of prediabetic subjects from India and Denmark
Pinna, N. K., Anjana, R. M., Saxena, S., Dutta, A., Gnanaprakash, V., Rameshkumar, G., Aswath, S., Raghavan, S., Rani, C. S. S., Radha, V., Balasubramanyam, M., Pant, A., Nielsen, T., Jørgensen, T., Færch, K., Kashani, A., Silva, M. C. A., Vestergaard, H., Hansen, T. H., Hansen, T. & 6 flere, , 2021, I: Genome Medicine. 13, 20 s., 36.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Trans-ethnic gut microbiota signatures of type 2 diabetes in Denmark and India
Alvarez-Silva, C., Kashani, A., Hansen, T. H., Pinna, N. K., Anjana, R. M., Dutta, A., Saxena, S., Støy, J., Kampmann, U., Nielsen, T., Jørgensen, T., Gnanaprakash, V., Gnanavadivel, R., Sukumaran, A., Rani, C. S. S., Færch, K., Radha, V., Balasubramanyam, M., Nair, G. B., Das, B. & 6 flere, , 2021, I: Genome Medicine. 13, 37.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Utilizing the gut microbiome in decompensated cirrhosis and acute-on-chronic liver failure
Trebicka, J., Bork, P., Krag, A. & Arumugam, Mani, 2021, I: Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology. 18, s. 167-180 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Butyrate producing colonic Clostridiales metabolise human milk oligosaccharides and cross feed on mucin via conserved pathways
Pichler, M. J., Yamada, C., Shuoker, B., Alvarez Silva, Maria Camila, Gotoh, A., Leth, M. L., Schoof, E., Katoh, T., Sakanaka, M., Katayama, T., Jin, C., Karlsson, N. G., Arumugam, Mani, Fushinobu, S. & Abou Hachem, M., 2020, I: Nature Communications. 11, 15 s., 3285.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of Novel Bioactive Metabolites Produced During the Cocultivation of Probiotic Strains and Clostridium Difficile in In Vitro Setup
Gnanasekaran, Thiyagarajan, Saenz, C., Moritz, Thomas & Arumugam, Mani, 2020, I: Journal of Clinical Gastroenterology. 54, Suppl. 1, s. S12 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning
- Udgivet
Perturbation of gut microbiota decreases susceptibility but does not modulate ongoing autoimmune neurological disease
Gödel, C., Kunkel, B., Kashani, A., Lassmann, H., Arumugam, Mani & Krishnamoorthy, G., 2020, I: Journal of Neuroinflammation. 17, 1, s. 79Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The intestinal microbiome is a co-determinant of the postprandial plasma glucose response
Søndertoft, N. B., Vogt, J. K., Arumugam, Mani, Kristensen, M., Gøbel, R. J., Fan, Yong, Lyu, Liwei, Bahl, M. I., Eriksen, C., Ängquist, Lars, Frøkiær, Hanne, Hansen, T. H., Brix, Susanne, Nielsen, H. B., Hansen, Torben, Vestergaard, H., Gupta, R., Licht, T. R., Lauritzen, Lotte & Pedersen, Oluf Borbye, 2020, I: P L o S One. 15, 9, 23 s., e0238648.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Trust is good, control is better: technical considerations in blood microbiome analysis
Schierwagen, R., Alvarez Silva, Maria Camila, Servant, F., Trebicka, J., Lelouvier, B. & Arumugam, Mani, 2020, I: Gut. 69, 7, s. 1362-1363Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variation in Bile Microbiome by the Etiology of Cholestatic Liver Disease
Tyc, O., Jansen, C., Schierwagen, R., Uschner, F. E., Israelsen, M., Klein, S., Ortiz, C., Strassburg, C. P., Zeuzem, S., Gu, W., Torres, S., Praktiknjo, M., Kersting, S., Langheinrich, M., Nattermann, J., Servant, F., Arumugam, M., Krag, A., Lelouvier, B., Weismueller, T. J. & 1 flere, , 2020, I: Liver Transplantation. 26, 12, s. 1652-1657 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning
- 2019
- Udgivet
Author Correction: Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation (Nature Medicine, (2019), 25, 4, (667-678), 10.1038/s41591-019-0405-7)
Thomas, A. M., Manghi, P., Asnicar, F., Pasolli, E., Armanini, F., Zolfo, M., Beghini, F., Manara, S., Karcher, N., Pozzi, C., Gandini, S., Serrano, D., Tarallo, S., Francavilla, A., Gallo, G., Trompetto, M., Ferrero, G., Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S. & 19 flere, , 1 dec. 2019, I: Nature Medicine. 25, 12, s. 1948 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
ID: 41056735
Flest downloads
-
1244
downloads
A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
633
downloads
Circulating microbiome in blood of different circulatory compartments
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
445
downloads
An Improved Method for High Quality Metagenomics DNA Extraction from Human and Environmental Samples
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet