Jan Gorodkin

Jan Gorodkin

Professor

Medlem af:


    1. Udgivet

      CRISPR-Cas9 off-targeting assessment with nucleic acid duplex energy parameters

      Alkan, F., Wenzel, Anne, Anthon, Christian, Havgaard, Jakob Hull & Gorodkin, Jan, 2018, I: Genome Biology. 19, 13 s., 177.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    2. Udgivet

      RIsearch2: suffix array-based large-scale prediction of RNA-RNA interactions and siRNA off-targets

      Alkan, F., Wenzel, Anne, Palasca, Oana, Kerpedjiev, P., Rudebeck, A. F., Stadler, P. F., Hofacker, I. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 8, 13 s., e60.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      Discovery of a divergent HPIV4 from respiratory secretions using second and third generation metagenomic sequencing

      Alquezar Planas, D. E., Mourier, T., Bruhn, C. A. W., Hansen, Anders Johannes, Vitcetz, S. N., Mørk, S., Gorodkin, Jan, Nielsen, H. A., Guo, Y., Sethuraman, A., Paxinos, E. E., Shan, T., Delwart, E. L. & Nielsen, L. P., 3 sep. 2013, I: Scientific Reports. 3, 10 s., 2468.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      The tmRDB and SRPDB resources

      Andersen, E. S., Rosenblad, M. A., Larsen, N., Westergaard, Jesper Cairo, Burks, J., Wower, I. K., Wower, J., Gorodkin, Jan, Samuelsson, T. & Zwieb, C., 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, s. D163-D168 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Semiautomated improvement of RNA alignments

      Andersen, E. S., Lind-Thomsen, A., Knudsen, B., Kristensen, S. E., Havgaard, Jakob Hull, Torarinsson, E., Larsen, N., Zwieb, C., Sestoft, P., Kjems, J. & Gorodkin, Jan, 2007, I: RNA: A publication of the RNA Society. 13, 11, s. 1850-1859 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      Structured RNAs and synteny regions in the pig genome

      Anthon, Christian, Tafer, H., Havgaard, Jakob Hull, Thomsen, B., Hedegaard, J., Seemann, Ernst Stefan, Pundhir, Sachin, Kehr, S., Bartschat, S., Nielsen, M., Nielsen, R. O., Fredholm, Merete, Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2014, I: BMC Genomics. 15, 27 s., 459.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      CRISPRon/off: CRISPR/Cas9 on- and off-target gRNA design

      Anthon, Christian, Corsi, G. I. & Gorodkin, Jan, 2022, I: Bioinformatics. 38, 24, s. 5437-5439 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      Comparative RNA genomics

      Backofen, R., Gorodkin, Jan, Hofacker, I. L. & Stadler, P. F., 2018, Comparative Genomics: Methods and Protocols. Humana Press, Bind 1704. s. 363-400 38 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1704).

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Production of human entorhinal stellate cell-like cells by forward programming shows an important role of Foxp1 in reprogramming

      Bergmann, T., Liu, Y., Skov, J., Mogus, L., Lee, J., Pfisterer, U., Handfield, L. F., Asenjo-Martinez, A., Lisa-Vargas, I., Seemann, S. E., Lee, J. T. H., Patikas, N., Kornum, B. R., Denham, M., Hyttel, P., Witter, M. P., Gorodkin, J., Pers, T. H., Hemberg, M., Khodosevich, K. & 1 flere, Hall, Vanessa Jane, 2022, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 976549.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      The developing Entorhinal Cortex – a cellular map

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    11. Udgivet

      Uncovering the anatomical and molecular landscape of the starting point of Alzheimer’s disease in the brain

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    12. Udgivet

      The developing Entorhinal cortex - a cellular map

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Handfield, L., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Hemberg, M., Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 25 nov. 2019. 1 s.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceFormidling

    13. Udgivet

      The developmental neurogenic niche of the Entorhinal cortex revealed by single-cell transcriptomics.

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Peralvo Vidal, Juan Miguel, Mori, Yuki, Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Gorodkin, Jan, Hall, Vanessa Jane & Pers, Tune H, 2018.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    14. Udgivet

      Profiling of Ribose Methylations in RNA by High-Throughput Sequencing

      Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Krogh, Nicolai, Radhakrishnan, S., Gorodkin, Jan & Nielsen, Henrik, 7 jan. 2015, I: Angewandte Chemie (International ed. in English). 54, 2, s. 451-455 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      IFN-λ and microRNAs are important modulators of the pulmonary innate immune response against influenza A (H1N2) infection in pigs

      Brogaard, L., Larsen, Lars, Heegaard, P. M. H., Anthon, Christian, Gorodkin, Jan, Dürrwald, R. & Skovgaard, K., 2018, I: PLOS ONE. 13, 4, 23 s., e0194765.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      Utilizing directed evolution to interrogate and optimize CRISPR/Cas guide RNA scaffolds

      Bush, K., Corsi, G. I., Yan, A. C., Haynes, K., Layzer, J. M., Zhou, J. H., Llanga, T., Gorodkin, Jan & Sullenger, B. A., 2023, I: Cell Chemical Biology. 30, 8, s. 879-892.e5

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      Progress and harmonization of gene editing to treat human diseases: Proceeding of COST Action CA21113 GenE-HumDi

      Cavazza, A., Hendel, A., Bak, R. O., Rio, P., Güell, M., Lainšček, D., Arechavala-Gomeza, V., Peng, L., Hapil, F. Z., Harvey, J., Ortega, F. G., Gonzalez-Martinez, C., Lederer, C. W., Mikkelsen, K., Gasiunas, G., Kalter, N., Gonçalves, M. A. F. V., Petersen, J., Garanto, A., Montoliu, L. & 20 flere, Maresca, M., Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan, Mazini, L., Sanchez, R., Rodriguez-Madoz, J. R., Maldonado-Pérez, N., Laura, T., Schmueck-Henneresse, M., Maccalli, C., Grünewald, J., Carmona, G., Kachamakova-Trojanowska, N., Miccio, A., Martin, F., Turchiano, G., Cathomen, T., Luo, Y., Tsai, S. Q. & Benabdellah, K., 2023, I: Molecular Therapy Nucleic Acids. 34, 14 s., 102066.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      Mutation in FTD3 CHMP2B causes impaired autography and distorted energy metabolism cumulating in reactive astrocyte phenotypes

      Chandrasekaran, A., Dittlau, K. S., Corsi, G., Haukedal, H., Doncheva, N. T., Ramakrishna, S., Ambardar, S., Salcedo, C., Schmidt, S. I., Cirera, S., Pihl, M., Schmid, B., Nielsen, T. T., Nielsen, J., Kolko, M., Kobolak, J., Dinnyes, A., Hyttel, P., Palakodeti, D., Gorodkin, J. & 4 flere, Muddashetty, R., Meyer, M., Aldana, Blanca & Freude, Kristine, 2020.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    19. Udgivet

      Astrocytic reactivity triggered by defective autophagy and metabolic failure causes neurotoxicity in frontotemporal dementia type 3

      Chandrasekaran, A., Dittlau, K. S., Corsi, G. I., Haukedal, H., Doncheva, N. T., Ramakrishna, S., Ambardar, S., Salcedo, C., Schmidt, S. I., Zhang, Y., Cirera, S., Pihl, M., Schmid, B., Nielsen, T. T., Nielsen, J. E., Kolko, M., Kobolák, J., Dinnyés, A., Hyttel, P., Palakodeti, D. & 5 flere, Gorodkin, Jan, Muddashetty, R. S., Meyer, M., Aldana, Blanca & Freude, Kristine, 2021, I: Stem Cell Reports. 16, 11, s. 2736-2751

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      Mutations in FTD3 CHMP2B causes impaired autophagy and distorted energy metabolism cumulating in reactive astrocyte phenotypes

      Chandrasekaran, A., Dittlau, K. S., Corsi, G., Doncheva, N. T., Haukedal, H., Ramakrishna, S., Ambardar, S., Salcedo, C., Schmidt, S. I., Cirera, S., Pihl, M., Schmid, B., Nielsen, T. T., Nielsen, J., Kolko, M., Kobolak, J., Dinnyes, A., Hyttel, P., Palakodeti, D., Gorodkin, J. & 4 flere, Muddashetty, R., Meyer, M., Aldana, Blanca & Freude, Kristine, 2020.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    21. Udgivet

      CRISPR/Cas9 gRNA activity depends on free energy changes and on the target PAM context

      Corsi, G. I., Qu, Kunli, Alkan, F., Pan, Xiaoguang, Luo, Y. & Gorodkin, Jan, 2022, I: Nature Communications. 13, 14 s., 3006.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    22. Udgivet

      CRISPRroots: On-and off-target assessment of RNA-seq data in CRISPR-Cas9 edited cells

      Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 4, 12 s., E20.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Udgivet

      The transcriptomic landscape of neurons carrying PSEN1 mutations reveals changes in extracellular matrix components and non-coding gene expression

      Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Haukedal, H., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Ambardar, S., Palakodeti, D., Hyttel, P., Freude, Kristine, Seemann, Ernst Stefan & Gorodkin, Jan, 2023, I: Neurobiology of Disease. 178, 17 s., 105980.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. Udgivet

      Letter to the editor: Testing on external independent datasets is necessary to corroborate machine learning model improvement

      Corsi, G. I., Anthon, Christian & Gorodkin, Jan, 2023, I: Bioinformatics. 39, 6, btad327.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      Good guide, bad guide: spacer sequence-dependent cleavage efficiency of Cas12a

      Creutzburg, S. C. A., Wu, W. Y., Mohanraju, P., Swartjes, T., Alkan, F., Gorodkin, Jan, Staals, R. H. J. & van der Oost, J., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 6, s. 3228-3243 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      Multiple independent analyses reveal only transcription factors as an enriched functional class associated with microRNAs

      Croft, L. J., Szklarczyk, D., Jensen, Lars Juhl & Gorodkin, Jan, 2012, I: B M C Systems Biology. 6, 1, s. 90

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    27. Udgivet

      RNA interactions in the 5' region of the HIV-1 genome

      Damgaard, C. K., Andersen, E. S., Knudsen, B., Gorodkin, Jan & Kjems, J., 2004, I: Journal of Molecular Biology. 336, 2, s. 369-379 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    28. Udgivet

      Cytoscape stringApp: Network analysis and visualization of proteomics data

      Doncheva, Nadezhda Tsankova, Morris, J., Gorodkin, Jan & Jensen, Lars Juhl, 2019, I: Journal of Proteome Research. 18, 2, s. 623-632

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    29. Udgivet

      Human pathways in animal models: possibilities and limitations

      Doncheva, Nadezhda Tsankova, Palasca, Oana, Yarani, R., Litman, Thomas, Anthon, Christian, Groenen, M. A. M., Stadler, P. F., Pociot, Flemming, Jensen, Lars Juhl & Gorodkin, Jan, 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 4, s. 1859-1871 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    30. Udgivet

      A splice-site variant in the lncRNA gene RP1-140A9.1 cosegregates in the large Volkmann cataract family

      Eiberg, Hans Rudolf Lytchoff, Mikkelsen, Annemette Friis, Bak, M., Tommerup, Niels, Lund, A. M., Wenzel, Anne, Sabarinathan, R., Gorodkin, Jan, Bang-Berthelsen, C. H. & Hansen, Lars, 2019, I: Molecular Vision. 25, s. 1-11 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    31. Udgivet

      Warburg Effect Metabolism Drives Neoplasia in a Drosophila Genetic Model of Epithelial Cancer

      Eichenlaub, T., Villadsen, René, Freitas, F. C. P., Andrejeva, Diana, Aldana, Blanca, Nguyen, H. T., Petersen, Ole William, Gorodkin, Jan, Herranz, Hector & Cohen, S. M., 2018, I: Current Biology. 28, 20, s. 3220-3228.e6

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    32. Udgivet

      Flagella disruption in Bacillus subtilis increases amylase production yield

      Fehler, A. O., Kallehauge, T. B., Geissler, Adrian Sven, González-Tortuero, E., Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan & Vinther, Jeppe, 2022, I: Microbial Cell Factories. 21, 11 s., 131.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    33. Udgivet

      The impact of PrsA over-expression on the Bacillus subtilis transcriptome during fed-batch fermentation of alpha-amylase production

      Geissler, Adrian Sven, Poulsen, L. D., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, González-Tortuero, E., Breüner, A., Jensen, Lars Juhl, Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 17 s., 909493.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    34. Udgivet

      CRISPRi screen for enhancing heterologous alpha-amylase yield in Bacillus subtilis

      Geissler, Adrian Sven, Fehler, A. O., Poulsen, L. D., Gonzalez-Tortuero, E., Kallehauge, T. B., Alkan, F., Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, Rasmussen, M. D., Breuener, A., Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2023, I: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 50, 1, 16 s., kuac028.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    35. Udgivet

      Bsgatlas: A unified bacillus subtilis genome and transcriptome annotation atlas with enhanced information access

      Geissler, Adrian Sven, Anthon, Christian, Alkan, F., González-Tortuero, E., Poulsen, L. D., Kallehauge, T. B., Breüner, A., Seemann, Ernst Stefan, Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2021, I: Microbial Genomics. 7, 2, 17 s., 000524.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    36. Udgivet

      The Bacillaceae-1 RNA motif comprises two distinct classes

      González-Tortuero, E., Anthon, Christian, Havgaard, Jakob Hull, Geissler, Adrian Sven, Breüner, A., Hjort, C., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2022, I: Gene. 841, 146756.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    37. Udgivet

      Porcine transcriptome analysis based on 97 non-normalized cDNA libraries and assembly of 1,021,891 expressed sequence tags

      Gorodkin, J., Cirera, S., Hedegaard, J., Gilchrist, M. J., Panitz, F., Jørgensen, C., Scheibye-Knudsen, K., Arvin, T., Lumholdt, S., Sawera, M., Green, T., Nielsen, B., Havgaard, J. H., Rosenkilde, C., Wang, J., Li, H., Li, R., Liu, B., Hu, S., Dong, W. & 16 flere, Li, W., Yu, J., Wang, J., Staefeldt, H., Wernersson, R., Madsen, L. B., Thomsen, B. S., Hornshøj, H., Bujie, Z., Wang, X., Wang, X., Bolund, L., Brunak, Søren, Yang, H., Bendixen, C. & Fredholm, Merete, 2007, I: Genome Biology. 8, R45, s. R45 16 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    38. Udgivet

      Concepts and introduction to RNA bioinformatics

      Gorodkin, Jan, Hofacker, I. L. & Ruzzo, W. L., 2014, I: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1097, s. 1-31 31 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    39. Udgivet

      From structure prediction to genomic screens for novel non-coding RNAs

      Gorodkin, Jan & Hofacker, I. L., 2011, I: PLoS Computational Biology. 7, 8, 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    40. Udgivet

      Special issue: Computational analysis of RNA structure and function

      Gorodkin, Jan, 2019, I: Genes. 10, 1, 3 s., 55.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskning

    41. Udgivet

      Comparing two K-category assignments by a K-category correlation coefficient

      Gorodkin, Jan, 2004, I: Computational Biology and Chemistry. 28, 5-6, s. 367-374 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    42. Udgivet

      De novo prediction of structured RNAs from genomic sequences

      Gorodkin, Jan, Hofacker, I. L., Þórarinsson, E., Yao, Z., Havgaard, Jakob Hull & Ruzzo, W. L., 2010, I: Trends in Biotechnology. 28, 1, s. 9-19 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    43. Udgivet

      MicroRNA sequence motifs reveal asymmetry between the stem arms

      Gorodkin, Jan, Havgaard, Jakob Hull, Ensterö, M., Sawera, M., Jensen, P., Öhman, M. & Fredholm, Merete, 2006, I: Computational Biology and Chemistry. 30, 4, s. 249-254 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    44. Udgivet

      Analyses of pig genomes provide insight into porcine demography and evolution

      Groenen, M. A., Archibald, A. L., Uenishi, H., Tuggle, C. K., Takeuchi, Y., Rothschild, M. F., Rogel-Gaillard, C., Park, C., Milan, D., Megens, H-J., Li, S., Larkin, D. M., Kim, H., Frantz, L. A. F., Caccamo, M., Ahn, H., Aken, B. L., Anselmo, A., Anthon, C., Auvil, L. & 116 flere, Badaoui, B., Beattie, C. W., Bendixen, C., Berman, D., Blecha, F., Blomberg, J., Bolund, L., Bosse, M., Botti, S., Zhan, B., Bystrom, M., Capitanu, B., Carvalho-Silva, D., Chardon, P., Chen, C., Cheng, R., Choi, S., Chow, W., Clark, R. C., Clee, C., Crooijmans, R. P. M. A., Dawson, H. D., Dehais, P., Sapio, F. D., Dibbits, B., Drou, N., Du, Z., Eversole, K., Fadista, J., Fairley, S., Faraut, T., Faulkner, G. J., Fowler, K. E., Fredholm, Merete, Fritz, E., Gilbert, J. G. R., Giuffra, E., Gorodkin, Jan, Griffin, D. K., Harrow, J. L., Hayward, A., Howe, K., Hu, Z., Humphray, S. J., Hunt, T., Jensen, H. H., Jeon, J., Jern, P., Jones, M., Jurka, J., Kanamori, H., Kapetanovic, R., Kim, J., Kim, J., Kim, K., Kim, T., Larson, G., Lee, K., Lee, K., Leggett, R., Lewin, H. A., Li, Y., Liu, W., Loveland, J. E., Lu, Y., Lunney, J. K., Ma, J., Madsen, O., Mann, K., Matthews, L., McLaren, S., Morozumi, T., Murtaugh, M. P., Narayan, J., Nguyen, D. T., Ni, P., Oh, S., Onteru, S., Panitz, F., Park, E., Park, H., Pascal, G., Paudel, Y., Perez-Enciso, M., Ramirez-Gonzalez, R., Reecy, J. M., Rodriguez-Zas, S., Rohrer, G. A., Rund, L., Sang, Y., Schachtschneider, K., Schraiber, J. G., Schwartz, J., Scobie, L., Scott, C., Searle, S., Servin, B., Southey, B. R., Sperber, G., Stadler, P., Sweedler, J. V., Tafer, H., Thomsen, B., Wali, R., Wang, J., Wang, J., White, S., Xu, X., Yerke, M., Zhang, G., Zhang, J., Zhang, J., Zhao, S., Rogers, J., Churcher, C. & Schook, L. B., 2012, I: Nature. 491, 7424, s. 393-398 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    45. Udgivet

      iPSC-derived Microglia for Disease Modeling of Frontotemporal Dementia 3

      Haukedal, H., Freude, Kristine, Garcia, B. A., Corsi, G., Gadekar, V. & Gorodkin, Jan, 2021, I: Glia. 69, S1, s. E480-E481 T14-066D.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

    46. Udgivet

      Alteration of microglial metabolism and inflammatory profile contributes to neurotoxicity in a hiPSC-derived microglia model of frontotemporal dementia 3

      Haukedal, H., Syshøj Lorenzen, S., Westi, Emil Winther, Corsi, G., Gadekar, V. P., McQuade, A., Davtyan, H., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Schmid, B., Chandrasekaran, Abinaya, Seemann, Ernst Stefan, Cirera, Susanna, Blurton-Jones, M., Meyer, M., Gorodkin, Jan, Aldana, Blanca & Freude, Kristine, 2023, I: Brain, Behavior, and Immunity. 113, s. 353-373

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    47. Udgivet

      Golgi fragmentation: One of the earliest organelle phenotypes in Alzheimer's disease neurons

      Haukedal, H., Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Doncheva, N. T., Kedia, S., de Haan, N., Chandrasekaran, A., Jensen, P., Schiønning, P., Vallin, S., Marlet, F. R., Poon, A., Pires, C., Agha, F. K., Wandall, H. H., Cirera, S., Simonsen, A. H., Nielsen, T. T., Nielsen, J. E., Hyttel, P. & 7 flere, Muddashetty, R., Aldana, Blanca, Gorodkin, Jan, Nair, D., Meyer, M., Larsen, M. R. & Freude, Kristine, 2023, I: Frontiers in Neuroscience. 17, 17 s., 1120086.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    48. Udgivet

      Patient iPSC-Derived Neorons for Disease Modeling of Familiar Alzheimer's Disease with Mutations in Presenilin 1

      Haukedal, H., Poon, A. F., Jensen, P., Aldana, Blanca, Pires, C., Chandrasekaran, Abinaya, Christensen, S. K., Schiønning, P., Vallin, S., Simonsen, A. H., Nielsen, J., Dinnyes, A., Gorodkin, Jan, Ramakrishna, S., Muddashetty, R., Palakodeti, D., Hyttel, P., Waagepetersen, Helle S., Larsen, M. R. & Freude, Kristine, okt. 2020.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    49. Udgivet

      Patient iPSC-Derived Neurons for Disease Modeling of Familiar Alzheier's Disease with Mutations in Presenilin 1

      Haukedal, H., Poon, A. F., Jensen, P., Aldana, Blanca, Pires, C., Chandrasekaran, Abinaya, Christensen, S. K., Schiønning, P., Vallin, S., Simonsen, A. H., Nielsen, J., Dinnyes, A., Gorodkin, Jan, Ramakrishna, S., Muddashetty, R., Palakodeti, D., Hyttel, P., Waagepetersen, Helle S., Larsen, M. R. & Freude, Kristine, 26 mar. 2019.

      Publikation: KonferencebidragPosterFormidling

    50. Udgivet

      Fast pairwise structural RNA alignments by pruning of the dynamical programming matrix

      Havgaard, Jakob Hull, Torarinsson, E. & Gorodkin, Jan, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 10, s. 1896-1908 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    Forrige 1 2 3 4 Næste

    ID: 4356276