Henrik Nielsen
Professor MSO
- 2024
- Udgivet
GPATCH4 regulates rRNA and snRNA 2′-O-methylation in both DHX15-dependent and DHX15-independent manners
Kanwal, N., Krogh, Nicolai, Memet, I., Lemus-Diaz, N., Thomé, C. C., Welp, L. M., Mizi, A., Hackert, P., Papantonis, A., Urlaub, H., Nielsen, Henrik, Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2024, I: Nucleic Acids Research. 52, 4, s. 1953-1974 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Making ends meet: a universal driver of large ribosomal subunit biogenesis
Bohnsack, K. E., Henras, A. K., Nielsen, Henrik & Bohnsack, M. T., 2023, I: Trends in Biochemical Sciences. 48, 3, s. 213-215Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ribosomal RNA 2′-O-methylation dynamics impact cell fate decisions
Häfner, Sophia Julia, Jansson, Martin David, Altinel, Kübra, Andersen, Kasper Langebjerg, Abay-Nørgaard, Zehra Caldwell, Ménard, Patrice, Fontenas, M., Sørensen, Daniel Madriz, Gay, David Michael, Arendrup, Frederic Schrøder, Tehler, D., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Kraushar, M. L., Kirkeby, Agnete & Lund, Anders H., 2023, I: Developmental Cell. 58, 17, s. 1593-1609.e9Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Fractional 2'-O-methylation in the ribosomal RNA of Dictyostelium discoideum supports ribosome heterogeneity in Amoebozoa
Diesend, J., Birkedal, U., Kjellin, J., Zhang, J., Jablonski, K. P., Söderbom, F., Nielsen, Henrik & Hammann, C., 2022, I: Scientific Reports. 12, 1952.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Stool Microbiota Diversity Analysis of Blastocystis-Positive and Blastocystis-Negative Individuals
Stensvold, C. R., Sorland, B. A., Berg, R. P. K. D., Andersen, L. O., van der Giezen, M., Bowtell, J. L., El-Badry, A. A., Belkessa, S., Kurt, O. & Nielsen, Henrik, 2022, I: Microorganisms. 10, 2, 6 s., 326.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
RNA helicase-mediated regulation of snoRNP dynamics on pre-ribosomes and rRNA 2'-O-methylation
Aquino, G. R. R., Krogh, Nicolai, Hackert, P., Martin, R., Gallesio, J. D., van Nues, R. W., Schneider, C., Watkins, N. J., Nielsen, Henrik, Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 7, s. 4066-4084 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Regulation of translation by site-specific ribosomal RNA methylation
Jansson, Martin David, Häfner, Sophia Julia, Altinel, Kübra, Tehler, D. E., Krogh, Nicolai, Jakobsen, Emil, Andersen, Jens Velde, Andersen, Kasper Langebjerg, Schoof, E., Ménard, Patrice, Nielsen, Henrik & Lund, Anders H., 2021, I: Nature Structural and Molecular Biology. 28, 11, s. 889-899Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Lariat Capping Ribozyme
Nielsen, Henrik, Krogh, Nicolai, Masquida, B. & Johansen, S. D., 2021, Ribozymes: Principles, Methods, Applications. Müller, S., Masquida, B. & Winkler, W. (red.). Wiley, Bind 2. s. 117-142Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The RNA helicase Dbp7 promotes domain V/VI compaction and stabilization of inter-domain interactions during early 60S assembly
Aquino, G. R. R., Hackert, P., Krogh, Nicolai, Pan, K. T., Jaafar, M., Henras, A. K., Nielsen, Henrik, Urlaub, H., Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2021, I: Nature Communications. 12, 6152.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The small Cajal body-specific RNA 15 (SCARNA15) directs p53 and redox homeostasis via selective splicing in cancer cells
Beneventi, G., Munita, R., Cao Thi Ngoc, P., Madej, M., Cieśla, M., Muthukumar, S., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Swaminathan, V. & Bellodi, C., 2021, I: NAR Cancer. 3, 3, zcab026.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Use of a Lariat Capping Ribozyme to Study Cap Function In Vivo
Pietschmann, M., Tempel, G., Halladjian, Maral, Krogh, Nicolai & Nielsen, Henrik, 2021, Ribozymes: Methods and Protocols. Humana Press, Bind 2167. s. 271-285 15 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2167).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Profiling of ribose methylations in ribosomal RNA from diffuse large B-cell lymphoma patients for evaluation of ribosomes as drug targets
Krogh, Nicolai, Asmar, F., Côme, Christophe Roger Michel, Fibiger Munch-Petersen, H., Grønbæk, Kirsten & Nielsen, Henrik, 4 dec. 2020, I: NAR Cancer. 2, 4, 11 s., zcaa035.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The shift from early to late types of ribosomes in zebrafish development involves changes at a subset of rRNA 2'-O-Me sites
Ramachandran, S., Krogh, Nicolai, Jørgensen, T. E., Johansen, S. D., Nielsen, Henrik & Babiak, I., dec. 2020, I: R N A. 26, 12, s. 1919-1934 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Developmental changes of rRNA ribose methylations in the mouse
Hebras, J., Krogh, Nicolai, Marty, V., Nielsen, Henrik & Cavaillé, J., 2020, I: RNA Biology. 17, 1, s. 150-164 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RRP7A links primary microcephaly to dysfunction of ribosome biogenesis, resorption of primary cilia, and neurogenesis
Farooq, M., Lindbæk, L., Krogh, N., Doganli, C., Keller, C., Mönnich, M., Gonçalves, A. B., Sakthivel, S., Mang, Y., Fatima, A., Andersen, V. S., Hussain, M. S., Eiberg, H., Hansen, L., Kjaer, K. W., Gopalakrishnan, J., Pedersen, L. B., Møllgård, K., Nielsen, H., Baig, S. M. & 3 flere, , 2020, I: Nature Communications. 11, 16 s., 5816.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Re-assessment of the involvement of snord115 in the serotonin 2c receptor pathway in a genetically relevant mouse model
Hebras, J., Marty, V., Personnaz, J., Mercier, P., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Aguirrebengoa, M., Seitz, H., Pradère, J., Guiard , B. P. & Cavaillé, J., 2020, I: eLife. 9, s. 1-34 34 s., e60862.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The 23S Ribosomal RNA From Pyrococcus furiosus Is Circularly Permuted
Birkedal, U., Beckert, B., Wilson, D. N. & Nielsen, Henrik, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 582022.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
ZAKα Recognizes Stalled Ribosomes through Partially Redundant Sensor Domains
Vind, Anna Constance, Snieckute, Goda, Blasius, Melanie, Tiedje, C., Krogh, Nicolai, Bekker-Jensen, D. B., Andersen, Kasper Langebjerg, Nordgaard, C., Tollenaere, M. A. X., Lund, Anders H., Olsen, Jesper Velgaard, Nielsen, Henrik & Bekker-Jensen, Simon Holst, 2020, I: Molecular Cell. 78, 4, s. 700-713.E7Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
Sequencing-based methods for detection and quantitation of ribose methylations in RNA
Krogh, Nicolai & Nielsen, Henrik, 2019, I: Methods. 156, s. 5-15Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Knock-Down of a Novel snoRNA in Tetrahymena Reveals a Dual Role in 5.8S rRNA Processing and Generation of a 26S rRNA Fragment
Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 2018, I: Biomolecules. 8, 4, 19 s., 128.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge
Jantsch, M. F., Quattrone, A., O'Connell, M., Helm, M., Frye, M., Macias-Gonzales, M., Ohman, M., Ameres, S., Willems, L., Fuks, F., Oulas, A., Vanacova, S., Nielsen, H., Bousquet-Antonelli, C., Motorin, Y., Roignant, J-Y., Balatsos, N., Dinnyes, A., Baranov, P., Kelly, V. & 40 flere, , 2018, I: RNA Biology. 15, 6, s. 829-831 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SIRT7-Dependent Deacetylation of Fibrillarin Controls Histone H2A Methylation and rRNA Synthesis during the Cell Cycle
Iyer-Bierhoff, A., Krogh, Nicolai, Tessarz, P., Ruppert, T., Nielsen, Henrik & Grummt, I., 2018, I: Cell Reports. 25, 11, s. 2946-2954Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
Bypassing rRNA methylation by RsmA/Dim1during ribosome maturation in the hyperthermophilic archaeon Nanoarchaeum equitans
Seistrup, K. H., Rose, S., Birkedal, U., Nielsen, Henrik, Huber, H. & Douthwaite, S., 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 4, s. 2007-2015 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lariat capping as a tool to manipulate the 5' end of individual yeast mRNA species in vivo
Krogh, Nicolai, Pietschmann, M., Schmid, M., Jensen, T. H. & Nielsen, Henrik, 2017, I: R N A. 23, 5, s. 683-695 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RiboMeth-seq: Profiling of 2'-O-Me in RNA
Krogh, Nicolai, Birkedal, U. & Nielsen, Henrik, 2017, RNA Methylation. Springer, Bind 1562. s. 189-209 21 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1562).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Substoichiometric ribose methylations in spliceosomal snRNAs
Krogh, Nicolai, Kongsbak-Wismann, Martin, Geisler, Carsten & Nielsen, Henrik, 2017, I: Organic and Biomolecular Chemistry. 15, 42, s. 8872-8876 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The identification and functional annotation of RNA structures conserved in vertebrates
Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Hansen, C., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Torarinsson, E., Yao, Z., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Nielsen, Henrik, Tommerup, Niels, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Genome Research. 27, s. 1371-1383 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
Accumulation of Stable Full-Length Circular Group I Intron RNAs during Heat-Shock
Andersen, Kasper Langebjerg, Beckert, B., Masquida, B., Johansen, S. D. & Nielsen, Henrik, nov. 2016, I: Molecules. 21, 11, 18 s., 1451.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Profiling of 2'-O-Me in human rRNA reveals a subset of fractionally modified positions and provides evidence for ribosome heterogeneity
Krogh, Nicolai, Jansson, Martin David, Häfner, Sophia Julia, Tehler, D., Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Lund, Anders H. & Nielsen, Henrik, 19 sep. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 16, s. 7884-7895Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Methods for Determination of 2′-O-Me in RNA
Birkedal, U., Krogh, Nicolai, Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 30 jul. 2016, Modified Nucleic Acids in Biology and Medicine. Jurga, S., Erdmann, V. A. & Barciszewski, J. (red.). switzerland: Springer Science+Business Media, s. 187-205 (RNA Technologies).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
- Udgivet
Profiling of Ribose Methylations in RNA by High-Throughput Sequencing
Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Krogh, Nicolai, Radhakrishnan, S., Gorodkin, Jan & Nielsen, Henrik, 7 jan. 2015, I: Angewandte Chemie (International ed. in English). 54, 2, s. 451-455 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimizing RNA structures by sequence extensions using RNAcop
Hecker, N., Christensen-Dalsgaard, M., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Stadler, P. F., Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 17, s. 8135-8145 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RNA 3D modules in genome-wide predictions of RNA 2D structure
Theis, C., Zirbel, C. L., Zu Siederdissen, C. H., Anthon, Christian, Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: PLOS ONE. 10, 10, 13 s., e0139900.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
Molecular characterization of a new member of the lariat capping twin-ribozyme introns
Tang, Y., Nielsen, Henrik, Masquida, B., Gardner, P. P. & Johansen, S. D., 15 sep. 2014, I: Mobile D N A. 5, s. 1-13 13 s., 25.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Risk stratification in emergency patients by copeptin
Iversen, K., Gøtze, J. P., Dalsgaard, M., Nielsen, Henrik, Boesgaard, S., Bay, M., Kirk, V., Nielsen, O. W. & Køber, Lars Valeur, 2014, I: BMC Medicine. 12, s. 1-10 10 s., 80.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Speciation of a group I intron into a lariat capping ribozyme
Meyer, M., Nielsen, Henrik, Oliéric, V., Roblin, P., Johansen, S. D., Westhof, E. & Masquida, B., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 21, s. 7659-64 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
Active ulcerative colitis associated with low prevalence of Blastocystis and Dientamoeba fragilis infection
Petersen, Andreas Munk, Stensvold, C. R., Mirsepasi, H., Engberg, J., Friis-Moller, A., Porsbo, L. J., Hammerum, A. M., Nordgaard-Lassen, I., Nielsen, Henrik & Krogfelt, K. A., 1 maj 2013, I: Scandinavian Journal of Gastroenterology. 48, 5, s. 638-639 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hver syvende akutte medicinske indlæggelse kan forebygges
Hendriksen, C., Nielsen, Henrik, Jensen, B. N., Perrild, Hans & Jepsen, H. K., 2013, I: Ugeskrift for Læger. 175, 22, s. 1551 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling
- Udgivet
Use of non-invasive ventilation is increasing in patients admitted with a chronic obstructive pulmonary disease exacerbation
Tøttenborg, Sandra Søgaard, Johnsen, S. P., Thomsen, R. W., Nielsen, Henrik, Hansen, E. F. & Lange, Peter, 2013, I: Danish Medical Journal. 60, 8, s. A4686Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Sequence and expression analysis of gaps in human chromosome 20
Minocherhomji, S., Seemann, Ernst Stefan, Mang, Y., Elschich, Z., Bak, M., Hansen, C., Papadopoulos, N., Josefsen, K., Nielsen, Henrik, Gorodkin, Jan, Tommerup, Niels & Silahtaroglu, Asli, aug. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6660-6672 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Experimental identification and analysis of macronuclear non-coding RNAs from the ciliate Tetrahymena thermophila
Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 1 feb. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 3, s. 1267-81Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Group I intron ribozymes
Nielsen, Henrik, 2012, I: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 848, s. 73-89 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
A natural fast-cleaving branching ribozyme from the amoeboflagellate Naegleria pringsheimi
Tang, Y., Nielsen, Henrik, Birgisdottir, A. B. & Johansen, S., nov. 2011, I: R N A Biology. 8, 6, s. 997-1004 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Intermolecular interaction between a branching ribozyme and associated homing endonuclease mRNA
Birgisdottir, A. B., Nielsen, Henrik, Beckert, B., Masquida, B. & Johansen, S. D., 1 apr. 2011, I: Journal of Biological Chemistry. 392, 6, s. 491-9 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Northern blotting analysis
Josefsen, K. & Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology : RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 87-105 19 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Outsourcing of experimental work
Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology: RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 319-25 7 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The transcriptional landscape
Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology : RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 3-14 12 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Working with RNA
Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology : RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 15-28 14 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
RNA: Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology
Nielsen, Henrik (red.), 2011, Humana Press, New York: Springer Science+Business Media. 329 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 703).Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
ID: 3560
Flest downloads
-
205
downloads
RNA 3D modules in genome-wide predictions of RNA 2D structure
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
200
downloads
Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
156
downloads
SIRT7-Dependent Deacetylation of Fibrillarin Controls Histone H2A Methylation and rRNA Synthesis during the Cell Cycle
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet