Henrik Nielsen

Henrik Nielsen

Professor MSO


  1. 2024
  2. Udgivet

    GPATCH4 regulates rRNA and snRNA 2′-O-methylation in both DHX15-dependent and DHX15-independent manners

    Kanwal, N., Krogh, Nicolai, Memet, I., Lemus-Diaz, N., Thomé, C. C., Welp, L. M., Mizi, A., Hackert, P., Papantonis, A., Urlaub, H., Nielsen, Henrik, Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2024, I: Nucleic Acids Research. 52, 4, s. 1953-1974 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    Making ends meet: a universal driver of large ribosomal subunit biogenesis

    Bohnsack, K. E., Henras, A. K., Nielsen, Henrik & Bohnsack, M. T., 2023, I: Trends in Biochemical Sciences. 48, 3, s. 213-215

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet
  6. 2022
  7. Udgivet

    Fractional 2'-O-methylation in the ribosomal RNA of Dictyostelium discoideum supports ribosome heterogeneity in Amoebozoa

    Diesend, J., Birkedal, U., Kjellin, J., Zhang, J., Jablonski, K. P., Söderbom, F., Nielsen, Henrik & Hammann, C., 2022, I: Scientific Reports. 12, 1952.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Stool Microbiota Diversity Analysis of Blastocystis-Positive and Blastocystis-Negative Individuals

    Stensvold, C. R., Sorland, B. A., Berg, R. P. K. D., Andersen, L. O., van der Giezen, M., Bowtell, J. L., El-Badry, A. A., Belkessa, S., Kurt, O. & Nielsen, Henrik, 2022, I: Microorganisms. 10, 2, 6 s., 326.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. 2021
  10. Udgivet

    RNA helicase-mediated regulation of snoRNP dynamics on pre-ribosomes and rRNA 2'-O-methylation

    Aquino, G. R. R., Krogh, Nicolai, Hackert, P., Martin, R., Gallesio, J. D., van Nues, R. W., Schneider, C., Watkins, N. J., Nielsen, Henrik, Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 7, s. 4066-4084 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Regulation of translation by site-specific ribosomal RNA methylation

    Jansson, Martin David, Häfner, Sophia Julia, Altinel, Kübra, Tehler, D. E., Krogh, Nicolai, Jakobsen, Emil, Andersen, Jens Velde, Andersen, Kasper Langebjerg, Schoof, E., Ménard, Patrice, Nielsen, Henrik & Lund, Anders H., 2021, I: Nature Structural and Molecular Biology. 28, 11, s. 889-899

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    The Lariat Capping Ribozyme

    Nielsen, Henrik, Krogh, Nicolai, Masquida, B. & Johansen, S. D., 2021, Ribozymes: Principles, Methods, Applications. Müller, S., Masquida, B. & Winkler, W. (red.). Wiley, Bind 2. s. 117-142

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    The RNA helicase Dbp7 promotes domain V/VI compaction and stabilization of inter-domain interactions during early 60S assembly

    Aquino, G. R. R., Hackert, P., Krogh, Nicolai, Pan, K. T., Jaafar, M., Henras, A. K., Nielsen, Henrik, Urlaub, H., Bohnsack, K. E. & Bohnsack, M. T., 2021, I: Nature Communications. 12, 6152.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    The small Cajal body-specific RNA 15 (SCARNA15) directs p53 and redox homeostasis via selective splicing in cancer cells

    Beneventi, G., Munita, R., Cao Thi Ngoc, P., Madej, M., Cieśla, M., Muthukumar, S., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Swaminathan, V. & Bellodi, C., 2021, I: NAR Cancer. 3, 3, zcab026.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Use of a Lariat Capping Ribozyme to Study Cap Function In Vivo

    Pietschmann, M., Tempel, G., Halladjian, Maral, Krogh, Nicolai & Nielsen, Henrik, 2021, Ribozymes: Methods and Protocols. Humana Press, Bind 2167. s. 271-285 15 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2167).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  16. 2020
  17. Udgivet

    Profiling of ribose methylations in ribosomal RNA from diffuse large B-cell lymphoma patients for evaluation of ribosomes as drug targets

    Krogh, Nicolai, Asmar, F., Côme, Christophe Roger Michel, Fibiger Munch-Petersen, H., Grønbæk, Kirsten & Nielsen, Henrik, 4 dec. 2020, I: NAR Cancer. 2, 4, 11 s., zcaa035.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    The shift from early to late types of ribosomes in zebrafish development involves changes at a subset of rRNA 2'-O-Me sites

    Ramachandran, S., Krogh, Nicolai, Jørgensen, T. E., Johansen, S. D., Nielsen, Henrik & Babiak, I., dec. 2020, I: R N A. 26, 12, s. 1919-1934 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Developmental changes of rRNA ribose methylations in the mouse

    Hebras, J., Krogh, Nicolai, Marty, V., Nielsen, Henrik & Cavaillé, J., 2020, I: RNA Biology. 17, 1, s. 150-164 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    RRP7A links primary microcephaly to dysfunction of ribosome biogenesis, resorption of primary cilia, and neurogenesis

    Farooq, M., Lindbæk, L., Krogh, N., Doganli, C., Keller, C., Mönnich, M., Gonçalves, A. B., Sakthivel, S., Mang, Y., Fatima, A., Andersen, V. S., Hussain, M. S., Eiberg, H., Hansen, L., Kjaer, K. W., Gopalakrishnan, J., Pedersen, L. B., Møllgård, K., Nielsen, H., Baig, S. M. & 3 flere, Tommerup, Niels, Christensen, Søren Tvorup & Larsen, Lars Allan, 2020, I: Nature Communications. 11, 16 s., 5816.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Re-assessment of the involvement of snord115 in the serotonin 2c receptor pathway in a genetically relevant mouse model

    Hebras, J., Marty, V., Personnaz, J., Mercier, P., Krogh, Nicolai, Nielsen, Henrik, Aguirrebengoa, M., Seitz, H., Pradère, J., Guiard , B. P. & Cavaillé, J., 2020, I: eLife. 9, s. 1-34 34 s., e60862.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The 23S Ribosomal RNA From Pyrococcus furiosus Is Circularly Permuted

    Birkedal, U., Beckert, B., Wilson, D. N. & Nielsen, Henrik, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 582022.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    ZAKα Recognizes Stalled Ribosomes through Partially Redundant Sensor Domains

    Vind, Anna Constance, Snieckute, Goda, Blasius, Melanie, Tiedje, C., Krogh, Nicolai, Bekker-Jensen, D. B., Andersen, Kasper Langebjerg, Nordgaard, C., Tollenaere, M. A. X., Lund, Anders H., Olsen, Jesper Velgaard, Nielsen, Henrik & Bekker-Jensen, Simon Holst, 2020, I: Molecular Cell. 78, 4, s. 700-713.E7

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2019
  25. Udgivet

    Sequencing-based methods for detection and quantitation of ribose methylations in RNA

    Krogh, Nicolai & Nielsen, Henrik, 2019, I: Methods. 156, s. 5-15

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2018
  27. Udgivet

    Knock-Down of a Novel snoRNA in Tetrahymena Reveals a Dual Role in 5.8S rRNA Processing and Generation of a 26S rRNA Fragment

    Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 2018, I: Biomolecules. 8, 4, 19 s., 128.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge

    Jantsch, M. F., Quattrone, A., O'Connell, M., Helm, M., Frye, M., Macias-Gonzales, M., Ohman, M., Ameres, S., Willems, L., Fuks, F., Oulas, A., Vanacova, S., Nielsen, H., Bousquet-Antonelli, C., Motorin, Y., Roignant, J-Y., Balatsos, N., Dinnyes, A., Baranov, P., Kelly, V. & 40 flere, Lamm, A., Rechavi, G., Pelizzola, M., Liepins, J., Holodnuka Kholodnyuk, I., Zammit, V., Ayers, D., Drablos, F., Dahl, J. A., Bujnicki, J., Jeronimo, C., Almeida, R., Neagu, M., Costache, M., Bankovic, J., Banovic, B., Kyselovic, J., Valor, L. M., Selbert, S., Pir, P., Demircan, T., Cowling, V., Schäfer, M., Rossmanith, W., Lafontaine, D., David, A., Carre, C., Lyko, F., Schaffrath, R., Schwartz, S., Verdel, A., Klungland, A., Purta, E., Timotijevic, G., Cardona, F., Davalos, A., Ballana, E., O Carroll, D., Ule, J. & Fray, R., 2018, I: RNA Biology. 15, 6, s. 829-831 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    SIRT7-Dependent Deacetylation of Fibrillarin Controls Histone H2A Methylation and rRNA Synthesis during the Cell Cycle

    Iyer-Bierhoff, A., Krogh, Nicolai, Tessarz, P., Ruppert, T., Nielsen, Henrik & Grummt, I., 2018, I: Cell Reports. 25, 11, s. 2946-2954

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. 2017
  31. Udgivet

    Bypassing rRNA methylation by RsmA/Dim1during ribosome maturation in the hyperthermophilic archaeon Nanoarchaeum equitans

    Seistrup, K. H., Rose, S., Birkedal, U., Nielsen, Henrik, Huber, H. & Douthwaite, S., 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 4, s. 2007-2015 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Lariat capping as a tool to manipulate the 5' end of individual yeast mRNA species in vivo

    Krogh, Nicolai, Pietschmann, M., Schmid, M., Jensen, T. H. & Nielsen, Henrik, 2017, I: R N A. 23, 5, s. 683-695 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    RiboMeth-seq: Profiling of 2'-O-Me in RNA

    Krogh, Nicolai, Birkedal, U. & Nielsen, Henrik, 2017, RNA Methylation. Springer, Bind 1562. s. 189-209 21 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1562).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Substoichiometric ribose methylations in spliceosomal snRNAs

    Krogh, Nicolai, Kongsbak-Wismann, Martin, Geisler, Carsten & Nielsen, Henrik, 2017, I: Organic and Biomolecular Chemistry. 15, 42, s. 8872-8876 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    The identification and functional annotation of RNA structures conserved in vertebrates

    Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Hansen, C., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Torarinsson, E., Yao, Z., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Nielsen, Henrik, Tommerup, Niels, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Genome Research. 27, s. 1371-1383 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. 2016
  37. Udgivet

    Accumulation of Stable Full-Length Circular Group I Intron RNAs during Heat-Shock

    Andersen, Kasper Langebjerg, Beckert, B., Masquida, B., Johansen, S. D. & Nielsen, Henrik, nov. 2016, I: Molecules. 21, 11, 18 s., 1451.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Profiling of 2'-O-Me in human rRNA reveals a subset of fractionally modified positions and provides evidence for ribosome heterogeneity

    Krogh, Nicolai, Jansson, Martin David, Häfner, Sophia Julia, Tehler, D., Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Lund, Anders H. & Nielsen, Henrik, 19 sep. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 16, s. 7884-7895

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Methods for Determination of 2′-O-Me in RNA

    Birkedal, U., Krogh, Nicolai, Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 30 jul. 2016, Modified Nucleic Acids in Biology and Medicine. Jurga, S., Erdmann, V. A. & Barciszewski, J. (red.). switzerland: Springer Science+Business Media, s. 187-205 (RNA Technologies).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  40. 2015
  41. Udgivet

    Profiling of Ribose Methylations in RNA by High-Throughput Sequencing

    Birkedal, U., Christensen-Dalsgaard, M., Krogh, Nicolai, Radhakrishnan, S., Gorodkin, Jan & Nielsen, Henrik, 7 jan. 2015, I: Angewandte Chemie (International ed. in English). 54, 2, s. 451-455 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Optimizing RNA structures by sequence extensions using RNAcop

    Hecker, N., Christensen-Dalsgaard, M., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Stadler, P. F., Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 17, s. 8135-8145 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    RNA 3D modules in genome-wide predictions of RNA 2D structure

    Theis, C., Zirbel, C. L., Zu Siederdissen, C. H., Anthon, Christian, Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: PLOS ONE. 10, 10, 13 s., e0139900.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. 2014
  45. Udgivet

    Molecular characterization of a new member of the lariat capping twin-ribozyme introns

    Tang, Y., Nielsen, Henrik, Masquida, B., Gardner, P. P. & Johansen, S. D., 15 sep. 2014, I: Mobile D N A. 5, s. 1-13 13 s., 25.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Risk stratification in emergency patients by copeptin

    Iversen, K., Gøtze, J. P., Dalsgaard, M., Nielsen, Henrik, Boesgaard, S., Bay, M., Kirk, V., Nielsen, O. W. & Køber, Lars Valeur, 2014, I: BMC Medicine. 12, s. 1-10 10 s., 80.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Speciation of a group I intron into a lariat capping ribozyme

    Meyer, M., Nielsen, Henrik, Oliéric, V., Roblin, P., Johansen, S. D., Westhof, E. & Masquida, B., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 21, s. 7659-64 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. 2013
  49. Udgivet

    Active ulcerative colitis associated with low prevalence of Blastocystis and Dientamoeba fragilis infection

    Petersen, Andreas Munk, Stensvold, C. R., Mirsepasi, H., Engberg, J., Friis-Moller, A., Porsbo, L. J., Hammerum, A. M., Nordgaard-Lassen, I., Nielsen, Henrik & Krogfelt, K. A., 1 maj 2013, I: Scandinavian Journal of Gastroenterology. 48, 5, s. 638-639 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Hver syvende akutte medicinske indlæggelse kan forebygges

    Hendriksen, C., Nielsen, Henrik, Jensen, B. N., Perrild, Hans & Jepsen, H. K., 2013, I: Ugeskrift for Læger. 175, 22, s. 1551 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  51. Udgivet

    Use of non-invasive ventilation is increasing in patients admitted with a chronic obstructive pulmonary disease exacerbation

    Tøttenborg, Sandra Søgaard, Johnsen, S. P., Thomsen, R. W., Nielsen, Henrik, Hansen, E. F. & Lange, Peter, 2013, I: Danish Medical Journal. 60, 8, s. A4686

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. 2012
  53. Udgivet

    Sequence and expression analysis of gaps in human chromosome 20

    Minocherhomji, S., Seemann, Ernst Stefan, Mang, Y., Elschich, Z., Bak, M., Hansen, C., Papadopoulos, N., Josefsen, K., Nielsen, Henrik, Gorodkin, Jan, Tommerup, Niels & Silahtaroglu, Asli, aug. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6660-6672 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    Experimental identification and analysis of macronuclear non-coding RNAs from the ciliate Tetrahymena thermophila

    Andersen, Kasper Langebjerg & Nielsen, Henrik, 1 feb. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 3, s. 1267-81

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  55. Udgivet

    Group I intron ribozymes

    Nielsen, Henrik, 2012, I: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 848, s. 73-89 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. 2011
  57. Udgivet

    A natural fast-cleaving branching ribozyme from the amoeboflagellate Naegleria pringsheimi

    Tang, Y., Nielsen, Henrik, Birgisdottir, A. B. & Johansen, S., nov. 2011, I: R N A Biology. 8, 6, s. 997-1004 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  58. Udgivet

    Intermolecular interaction between a branching ribozyme and associated homing endonuclease mRNA

    Birgisdottir, A. B., Nielsen, Henrik, Beckert, B., Masquida, B. & Johansen, S. D., 1 apr. 2011, I: Journal of Biological Chemistry. 392, 6, s. 491-9 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  59. Udgivet

    Northern blotting analysis

    Josefsen, K. & Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology : RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 87-105 19 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  60. Udgivet

    Outsourcing of experimental work

    Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology: RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 319-25 7 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  61. Udgivet

    The transcriptional landscape

    Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology : RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 3-14 12 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  62. Udgivet

    Working with RNA

    Nielsen, Henrik, 1 jan. 2011, Methods in Molecular Biology : RNA: Methods and Protocols. Springer Science+Business Media, Bind 703. s. 15-28 14 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  63. Udgivet
  64. Udgivet

    RNA: Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology

    Nielsen, Henrik (red.), 2011, Humana Press, New York: Springer Science+Business Media. 329 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 703).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 3560