Flemming Steen Jørgensen
Professor
Strukturbiologi
Universitetsparken 2
2100 København Ø
- 2024
- Udgivet
Effect of Essential Oil Components on the Activity of Steroidogenic Cytochrome P450
Sharma, K., Lanzilotto, A., Yakubu, J., Therkelsen, S., Vöegel, C. D., Du Toit, T., Jørgensen, Flemming Steen & Pandey, A. V., 2024, I: Biomolecules. 14, 2, 19 s., 203.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Differences between the GluD1 and GluD2 receptors revealed by GluD1 X-ray crystallography, binding studies and molecular dynamics
Masternak, Magdalena, Koch, A., Laulumaa, S., Tapken, D., Hollmann, M., Jørgensen, Flemming Steen & Kastrup, Jette Sandholm Jensen, 2023, I: F E B S Journal. 290, 15, s. 3781-3801Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring the Potential of Sulfur Moieties in Compounds Inhibiting Steroidogenesis
Wróbel, T. M., Sharma, K., Mannella, I., Oliaro-Bosso, S., Nieckarz, P., Du Toit, T., Voegel, C. D., Rojas Velazquez, M. N., Yakubu, J., Matveeva, A., Therkelsen, S., Jørgensen, Flemming Steen, Pandey, A. V., Pippione, A. C., Lolli, M. L., Boschi, D. & Björkling, Fredrik, 2023, I: Biomolecules. 13, 9, 18 s., 1349.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Non-steroidal CYP17A1 Inhibitors: Discovery and Assessment
Wróbel, T. M., Jørgensen, Flemming Steen, Pandey, A. V., Grudzińska, A., Sharma, K., Yakubu, J. & Björkling, Fredrik, 2023, I: Journal of Medicinal Chemistry. 66, 10, s. 6542–6566Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Polypharmacology-labeled molecular networking: An analytical technology workflow for accelerated identification of multiple bioactive constituents in complex extracts
Zhao, Yong, Gericke, Oliver, Li, T., Kjaerulff, Louise, Kongstad, Kenneth Thermann, Heskes, A. M., Møller, Birger Lindberg, Jørgensen, Flemming Steen, Venter, H., Coriani, S., Semple, S. J. & Stærk, Dan, 2023, I: Analytical Chemistry. 95, 9, s. 4381-4389 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Itraconazole Reverts ABCB1-Mediated Docetaxel Resistance in Prostate Cancer
Lima, T. S., De Oliveira Souza, Luciano, Iglesias Gato, Diego, Elversang, J., Jørgensen, Flemming Steen, Kallunki, Tuula Anneli, Røder, Andreas, Brasso, K. & Moreira, José, 2022, I: Frontiers in Pharmacology. 13, 13 s., 869461.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Synthesis and Structure–Activity Relationships of Novel Non-Steroidal CYP17A1 Inhibitors as Potential Prostate Cancer Agents
Wróbel, T. M., Rogova, O., Sharma, K., Velazquez, M. N. R., Pandey, A. V., Jørgensen, Flemming Steen, Arendrup, Frederic Schrøder, Andersen, Kasper Langebjerg & Björkling, Fredrik, 2022, I: Biomolecules. 12, 2, 165.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Biased cytochrome P450-mediated metabolism via small-molecule ligands binding P450 oxidoreductase
Jensen, S. B., Thodberg, S., Parween, S., Moses, M. E., Hansen, Cecilie Ida Cetti, Thomsen, J., Sletfjerding, M. B., Knudsen, C., Del Giudice, R., Lund, P. M., Castaño, P. R., Bustamante, Y. G., Velazquez, M. N. R., Jørgensen, Flemming Steen, Pandey, A. V., Laursen, Tomas, Møller, Birger Lindberg & Hatzakis, Nikos, 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 14 s., 2260.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Is the unique benzodiazepine structure interacting with CYP enzymes to affect steroid synthesis in vitro?
Johannsen, Malene Louise, Munkboel, C. H., Jørgensen, Flemming Steen & Styrishave, Bjarne, 2021, I: Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 205, 10 s., 105765.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PTR2/POT/NPF transporters: what makes them tick?
Prabhala, B. K., Rahman, M., Nour-Eldin, Hussam Hassan, Jørgensen, Flemming Steen & Mirza, Osman Asghar, 2021, I: Advances in Protein Chemistry and Structural Biology. 123, s. 219-240 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Discovery of Novel Non-Steroidal Cytochrome P450 17A1 Inhibitors as Potential Prostate Cancer Agents
Wróbel, T. M., Rogova, O., Andersen, Kasper Langebjerg, Yadav, R., Brixius-Anderko, S., Scott, E. E., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen & Björkling, Fredrik, 2020, I: International Journal of Molecular Sciences . 21, 14, s. 1-11 4868.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
An Optimized Screen Reduces the Number of GA Transporters and Provides Insights Into Nitrate Transporter 1/Peptide Transporter Family Substrate Determinants
Wulff, N., Ernst, H. A., Jørgensen, M. E., Lambertz, S., Maierhofer, T., Belew, Zeinu Mussa, Crocoll, C., Motawie, Mohammed Saddik, Geiger, D., Jørgensen, Flemming Steen, Mirza, Osman Asghar & Nour-Eldin, Hussam Hassan, 3 okt. 2019, I: Frontiers in Plant Science. 10, 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SMARTCyp 3.0: enhanced cytochrome P450 site-of-metabolism prediction server
Olsen, L., Montefiori, M., Tran, K. P. & Jørgensen, Flemming Steen, 1 sep. 2019, I: Bioinformatics (Oxford, England). 35, 17, s. 3174-3175 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Both Reactivity and Accessibility Are Important in Cytochrome P450 Metabolism: A Combined DFT and MD Study of Fenamic Acids in BM3 Mutants
Leth, R., Ercig, B., Olsen, L. & Jørgensen, Flemming Steen, 25 feb. 2019, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 59, 2, s. 743-753 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular Dynamics Simulations Reveal the Proton:Peptide Coupling Mechanism in the Bacterial Proton-Coupled Oligopeptide Transporter YbgH
Aduri, N. G., Montefiori, M., Khalil, R., Gajhede, Michael, Jørgensen, Flemming Steen & Mirza, Osman Asghar, 31 jan. 2019, I: ACS Omega. 4, 1, s. 2040-2046 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Methods for Prediction of Aldehyde Oxidase-Mediated Site-of-Metabolism
Montefiori, M., Lyngholm-Kjærby, C., Long, A., Olsen, L. & Jørgensen, Flemming Steen, 1 jan. 2019, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 17, s. 345-351 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An Optimized Screen Reduces the Number of GA Transporters and provides Insights into NPF Substrate Determinants
Wulff, N., Ernst, H. A., Jørgensen, M. E., Lambertz, S., Maierhofer, T., Belew, Zeinu Mussa, Crocoll, C., Motawia, M. S., Geiger, D., Jørgensen, Flemming Steen, Mirza, Osman Asghar & Nour-Eldin, Hussam Hassan, 2019, bioRxiv.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- Udgivet
Structural analysis of Cytochrome P450 BM3 mutant M11 in complex with dithiothreitol
Frydenvang, Karla Andrea, Verkade-Vreeker, M. C. A., Dohmen, F., Commandeur, J. N. M., Rafiq, M., Mirza, Osman Asghar, Jørgensen, Flemming Steen & Geerke, D. P., 2019, I: PLoS ONE. 14, 5, 15 s., e0217292.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
The anti-epileptic drug lamotrigine inhibits the CYP17A1 lyase reaction in vitro
Munkboel, C. H., Christensen, L. R., Islin, J., Bonomo, S., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen & Styrishave, Bjarne, okt. 2018, I: Biology of Reproduction. 99, 4, s. 888-897Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
Aldehyde Oxidase: Reaction Mechanism and Prediction of Site of Metabolism
Montefiori, M., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., aug. 2017, I: ACS Omega. 2, 8, s. 4237-4244Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mechanism of Cytochrome P450 17A1-Catalyzed Hydroxylase and Lyase Reactions
Bonomo, S., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 22 maj 2017, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 57, 5, s. 1123-1133 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The low binding affinity of D-serine at the ionotropic glutamate receptor GluD2 can be attributed to the hinge region
Tapken, D., Steffensen, T. B., Leth, R., Kristensen, L. B., Gerbola, A., Gajhede, Michael, Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, L. & Kastrup, Jette Sandholm Jensen, 7 apr. 2017, I: Scientific Reports. 7, 12 s., 46145.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure-based optimisation of non-steroidal cytochrome P450 17A1 inhibitors
Larsen, M., Hansen, C. H., Rasmussen, T. B., Styrishave, Bjarne, Olsen, L. & Jørgensen, Flemming Steen, 28 feb. 2017, I: Chemical Communications. 53, 3118, 4 s., 3118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dissecting the Cytochrome P450 1A2- and 3A4-Mediated Metabolism of Aflatoxin B1 in Ligand and Protein Contributions
Bonomo, S., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 24 feb. 2017, I: Chemistry: A European Journal. 23, 12, s. 2884-2893 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
Promising Tools in Prostate Cancer Research: Selective Non-Steroidal Cytochrome P450 17A1 Inhibitors
Bonomo, S., Hansen, C. H., Petrunak, E. M., Scott, E. E., Styrishave, Bjarne, Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 12 jul. 2016, I: Scientific Reports. 6, 11 s., 29468.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enantioselective endocrine disrupting effects of omeprazole studied in the H295R cell assay and by molecular modeling
Sørensen, A. M., Hansen, C. H., Bonomo, S., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen, Weisser, J. J., Kretschmann, A. C. & Styrishave, Bjarne, 19 mar. 2016, I: Toxicology in Vitro. 34, s. 71-80 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Insights into regioselective metabolism of mefenamic acid by cytochrome P450 BM3 mutants through crystallography, docking, molecular dynamics, and free energy calculations
Capoferri, L., Leth, R., Ter Haar, E., Mohanty, A. K., Grootenhuis, P. D. J., Vottero, E., Commandeur, J. M. N., Vermeulen, N. P. E., Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, L. & Geerke, D. P., mar. 2016, I: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 84, 3, s. 383-96 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cytochrome P450 Mediated Drug Metabolism
Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen & Oostenbrink, C., 2016, New Horizons in Predictive Drug Metabolism and Pharmacokinetics. Wilson, A. G. E. (red.). Cambridge: Royal Society of Chemistry, s. 66-78 13 s. (RSC Drug Discovery, Bind 49).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
- Udgivet
Prediction of cytochrome P450 mediated metabolism
Olsen, L., Oostenbrink, C. & Jørgensen, Flemming Steen, 6 maj 2015, I: Advanced Drug Delivery Reviews. 86, s. 61-71 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Density functional theory study on the formation of reactive benzoquinone imines by hydrogen abstraction
Leth, R., Rydberg, P., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 23 mar. 2015, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 55, 3, s. 660-6 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Salt-bridge Swapping in the EXXERFXYY Motif of Proton Coupled Oligopeptide Transporters
Aduri, N. G., Prabhala, B. K., Ernst, H. A., Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, L. & Mirza, Osman Asghar, 2015, I: The Journal of Biological Chemistry. 290, 50, s. 29931-29940 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
Design of prodrugs targeting the intestinal di/tri‐peptide transporter hPEPT1 (SLC15A1
Omkvist, D. H., Nielsen, C. U., Steffansen, B., Larsen, S. B., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen & Larsen, Birger Brodin, 4 apr. 2014. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Use of density functional theory in drug metabolism studies
Rydberg, P., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., feb. 2014, I: Expert Opinion on Drug Metabolism & Toxicology. 10, 2, s. 215-27 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
A robust force field based method for calculating conformational energies of charged drug-like molecules
Pøhlsgaard, J., Harpsøe, Kasper, Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 2012, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 52, 2, s. 409-419Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A steered molecular dynamics study of binding and translocation processes in the GABA transporter
Skovstrup, S., David, L., Taboureau, O. & Jørgensen, Flemming Steen, 2012, I: P L o S One. 7, 6, s. e39360Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prediction of pH-dependent aqueous solubility of druglike molecules
Hansen, N. T., Kouskoumvekaki, I., Jørgensen, Flemming Steen, Brunak, Søren & Jónsdóttir, S. O., 2012, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 46, 6, s. 2601-2609 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Synthesis and antiangiogenic activity of N-alkylated levamisole derivatives
Hansen, A. N., Bendiksen, C. D., Sylvest, L., Friis, T., Stærk, Dan, Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, Christian Adam & Houen, G., 2012, I: P L o S One. 7, 9, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
hERG classification model based on a combination of support vector machine method and GRIND descriptors
Li, Q., Jørgensen, Flemming Steen, Oprea, T., Brunak, Søren & Taboureau, O., 2012, I: Molecular Pharmaceutics. 5, 1, s. 117-127 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
In silico predictions of hERG channel blockers in drug discovery: from ligand-based and target-based approaches to systems chemical biology
Taboureau, O. & Jørgensen, Flemming Steen, jun. 2011, I: Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 14, 5, s. 375-387Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
G protein- and agonist-bound serotonin 5-HT2A receptor model activated by steered molecular dynamics simulations
Ísberg, V., Balle, T., Sander, T., Jørgensen, Flemming Steen & Gloriam, David E., 28 feb. 2011, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 51, 2, s. 315-325Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of CYP1A2 ligands by structure-based and ligand-based virtual screening
Poongavanam, V., Lastdrager, J., Oostenbrink, C., Commandeur, J. N. M., Vermeulen, N. P. E., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 2011, I: MedChemComm. 2, 9, s. 853-859Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
- Udgivet
A diversity optimized combinatorial library for the identification of Fc-fragment binding ligands
Nielsen, A. L., Jørgensen, Flemming Steen, Olsen, L., Christensen, S. F., Benie, A. J., Bjørnholm, T. & St. Hilaire, P. M., 2010, I: Biopolymers. 94, 2, s. 192-205Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A quantitative structure-activity relationship for translocation of tripeptides via the human proton-coupled peptide transporter, hPEPT1 (SLC15A1)
Omkvist, D. H., Larsen, S. B., Nielsen, C. U., Steffansen, B., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen & Larsen, Birger Brodin, 2010, I: The AAPS Journal. 12, 3, s. 385-396Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biostructure-based drug design
Jørgensen, Flemming Steen & Kastrup, Jette Sandholm Jensen, 2010, Textbook of drug design and discovery. Krogsgaard-Larsen, P., Strømgaard, K. & Madsen, U. (red.). 4 udg. Boca Raton: CRC Press, s. 29-42Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Undervisning
- Udgivet
Computational prediction of binding affinity for CYP1A2-ligand complexes using empirical free energy calculations
Poongavanam, V., Olsen, L., Jørgensen, Flemming Steen, Vermeulen, N. P. E. & Oostenbrink, C., 2010, I: Drug Metabolism and Disposition. 38, 8, s. 1347-1354Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Forbedret optagelse af lægemidler i organismen: computeren viser vejen
Larsen, S. B., Jørgensen, Flemming Steen & Olsen, L., 2010, I: Dansk Kemi. 91, 6/7, s. 18-20Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Homology modelling of the GABA transporter and analysis of tiagabine binding
Skovstrup, S., Taboureau, O., Bräuner, Hans & Jørgensen, Flemming Steen, 2010, I: ChemMedChem. 5, 7, s. 986-1000Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mutational mapping and modeling of the binding site for (S)-citalopram in the human serotonin transporter
Andersen, J., Olsen, L., Hansen, K. B., Taboureau, O., Jørgensen, Flemming Steen, Jørgensen, A. M., Bang-Andersen, B., Egebjerg, J., Strømgaard, Kristian & Kristensen, Anders Skov, 2010, I: Journal of Biological Chemistry. 285, 3, s. 2051-2063Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
- Udgivet
Classification of cytochrome P450 1A2 inhibitors and noninhibitors by machine learning techniques
Poongavanam, V., Taboureau, O., Oostenbrink, C., Vermeulen, N. P. E., Olsen, L. & Jørgensen, Flemming Steen, 2009, I: Drug Metabolism and Disposition. 37, 3, s. 658-664Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computeren er medicinalkemikerens arbejdshest
Larsen, S. B., Olsen, L. & Jørgensen, Flemming Steen, 2009, I: Lægemiddelforskning. s. 7-9Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling
ID: 1302104
Flest downloads
-
2011
downloads
Synthesis and antiangiogenic activity of N-alkylated levamisole derivatives
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1967
downloads
Forbedret optagelse af lægemidler i organismen: computeren viser vejen
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
Udgivet -
1528
downloads
Design of prodrugs targeting the intestinal di/tri‐peptide transporter hPEPT1 (SLC15A1
Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet