Antonio Fernandez Guerra
Tenure Track Adjunkt
Section for Geogenetics
Øster Voldgade 5-7
1350 København K
- 2023
- Udgivet
Mirusviruses link herpesviruses to giant viruses
Gaïa, M., Meng, L., Pelletier, E., Forterre, P., Vanni, C., Fernandez Guerra, Antonio, Jaillon, O., Wincker, P., Ogata, H., Krupovic, M. & Delmont, T. O., 2023, I: Nature. 616, 7958, s. 783-789 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic adaptation of giant viruses in polar oceans
Meng, L., Delmont, T. O., Gaïa, M., Pelletier, E., Fernandez Guerra, Antonio, Chaffron, S., Neches, R. Y., Wu, J., Kaneko, H., Endo, H. & Ogata, H., 2023, I: Nature Communications. 14, 12 s., 6233.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Inter-comparison of marine microbiome sampling protocols
Pascoal, F., Tomasino, M. P., Piredda, R., Quero, G. M., Torgo, L., Poulain, J., Galand, P. E., Fuhrman, J. A., Mitchell, A., Tinta, T., Turk Dermastia, T., Fernandez-Guerra, A., Vezzi, A., Logares, R., Malfatti, F., Endo, H., Dąbrowska, A. M., De Pascale, F., Sánchez, P., Henry, N. & 9 flere, , 2023, I: ISME communications. 3, 16 s., 84.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Functional repertoire convergence of distantly related eukaryotic plankton lineages abundant in the sunlit ocean
Delmont, T. O., Gaia, M., Hinsinger, D. D., Frémont, P., Vanni, C., Fernandez-Guerra, A., Eren, A. M., Kourlaiev, A., d'Agata, L., Clayssen, Q., Villar, E., Labadie, K., Cruaud, C., Poulain, J., Da Silva, C., Wessner, M., Noel, B., Aury, J-M., Sunagawa, S., Acinas, S. G. & 30 flere, , 2022, I: Cell Genomics. 2, 5, 17 s., 100123.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A 2-million-year-old ecosystem in Greenland uncovered by environmental DNA
Kjær, K. H., Pedersen, M. W., De Sanctis, B., De Cahsan, B., Korneliussen, T. S., Michelsen, C. S., Sand, K. K., Jelavić, S., Ruter, A. H., Schmidt, A. M. A., Kjeldsen, K. K., Tesakov, A. S., Snowball, I., Gosse, J. C., Alsos, I. G., Wang, Y., Dockter, C., Rasmussen, M., Jørgensen, M. E., Skadhauge, B. & 19 flere, , 2022, I: Nature. 612, 7939, s. 283-291 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Renewal of planktonic foraminifera diversity after the Cretaceous Paleogene mass extinction by benthic colonizers
Morard, R., Hassenrück, C., Greco, M., Fernandez Guerra, Antonio, Rigaud, S., Douady, C. J. & Kucera, M., 2022, I: Nature Communications. 13, 9 s., 7135.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic evidence for global ocean plankton biogeography shaped by large-scale current systems
Richter, D. J., Watteaux, R., Vannier, T., Leconte, J., Frémont, P., Reygondeau, G., Maillet, N., Henry, N., Benoit, G., Da Silva, O., Delmont, T. O., Fernàndez-Guerra, A., Suweis, S., Narci, R., Berney, C., Eveillard, D., Gavory, F., Guidi, L., Labadie, K., Mahieu, E. & 27 flere, , 2022, I: eLife. 11, 30 s., e78129.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Unifying the known and unknown microbial coding sequence space
Vanni, C., Schechter, M. S., Acinas, S. G., Barberán, A., Buttigieg, P. L., Casamayor, E. O., Delmont, T. O., Duarte, C. M., Eren, A. M., Finn, R. D., Kottmann, R., Mitchell, A., Sánchez, P., Siren, K., Steinegger, M., Glöckner, F. O. & Fernandez Guerra, Antonio, 2022, I: eLife. 11, 60 s., e67667.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reply to: When did mammoths go extinct?
Wang, Y., Prohaska, A., Dong, H., Alberti, A., Alsos, I. G., Beilman, D. W., Bjørk, A. A., Cao, J., Cherezova, A. A., Coissac, E., De Sanctis, B., Denoeud, F., Dockter, C., Durbin, R., Edwards, M. E., Edwards, N. R., Esdale, J., Fedorov, G. B., Fernandez-Guerra, A., Froese, D. G. & 32 flere, , 2022, I: Nature. 612, 7938, s. E4-E6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Functional repertoire convergence of distantly related eukaryotic plankton lineages revealed by genome-resolved metagenomics
Delmont, T. O., Gaia, M., Hinsinger, D. D., Fremont, P., Vanni, C., Fernandez Guerra, A., Eren, A. M., Kourlaiev, A., d'Agata, L., Clayssen, Q., Villar, E., Labadie, K., Cruaud, C., Poulain, J., Da Silva, C., Wessner, M., Noel, B., Aury, J-M., de Vargas, C., Bowler, C. & 4 flere, , 23 jan. 2021, 30 s. (bioRxiv).Publikation: Working paper › Preprint
- Udgivet
Community-led, integrated, reproducible multi-omics with anvi'o
Eren, A. M., Kiefl, E., Shaiber, A., Veseli, I., Miller, S. E., Schechter, M. S., Fink, I., Pan, J. N., Yousef, M., Fogarty, E. C., Trigodet, F., Watson, A. R., Esen, O. C., Moore, R. M., Clayssen, Q., Lee, M. D., Kivenson, V., Graham, E. D., Merrill, B. D., Karkman, A. & 14 flere, , 2021, I: Nature Microbiology. 6, 1, s. 3-6 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mining metagenomes for natural product biosynthetic gene clusters: unlocking new potential with ultrafast techniques
Pereira-Flores, E., Medema, M., Buttigieg, P. L., Meinicke, P., Glöckner, F. O. & Fernandez Guerra, Antonio, 2021, 29 s. (bioRxiv).Publikation: Working paper › Preprint
- Udgivet
Secondary metabolite biosynthetic diversity in Arctic Ocean metagenomes
Rego, A., Fernandez Guerra, Antonio, Duarte, P., Assmy, P., Leão, P. N. & Magalhães, C., 2021, I: Microbial genomics. 7, 12, 14 s., 000731.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Late Quaternary dynamics of Arctic biota from ancient environmental genomics: [+ Correction]
Wang, Y., Pedersen, M. W., Alsos, I. G., De Sanctis, B., Racimo, F., Prohaska, A., Coissac, E., Owens, H. L., Merkel, M. K. F., Fernandez-Guerra, A., Rouillard, A., Lammers, Y., Alberti, A., Denoeud, F., Money, D., Ruter, A. H., McColl, H., Larsen, N. K., Cherezova, A. A., Edwards, M. E. & 30 flere, , 2021, I: Nature. 600, 7887, s. 86–92 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Community-curated and standardised metadata of published ancient metagenomic samples with AncientMetagenomeDir
Yates, J. A. F., Andrades Valtuena, A., Vågene, Åshild Joanne, Cribdon, B., Velsko, I. M., Borry, M., Bravo-Lopez, M. J., Fernandez Guerra, Antonio, Green, E. J., Ramachandran, S. L., Heintzman, P. D., Spyrou, M. A., Huebner, A., Gancz, A. S., Hider, J., Allshouse, A. F., Zaro, V. & Warinner, C., 2021, I: Scientific Data. 8, 8 s., 31.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
Future Science Brief - Big Data in Marine Science
Guidi, L., Fernandez Guerra, Antonio, Canchaya, C., Curry, E., Foglini, F., Irisson, J., Malde, K., Marshall, T. C., Obst, M., Ribeiro, R. P., Tjiputra, J. & Bakker, D. C. E., 2020, 52 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Linking Spatial and Temporal Dynamic of Bacterioplankton Communities With Ecological Strategies Across a Coastal Frontal Area
Lemonnier, C., Perennou, M., Eveillard, D., Fernandez Guerra, Antonio, Leynaert, A., Marie, L., Morrison, H. G., Memery, L., Paillard, C. & Maignien, L., 2020, I: Frontiers in Marine Science. 7, 13 s., 376.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Meta-SourceTracker: application of Bayesian source tracking to shotgun metagenomics
McGhee, J. J., Rawson, N., Bailey, B. A., Fernandez Guerra, Antonio, Sisk-Hackworth, L. & Kelley, S. T., 2020, I: PeerJ. 8, 18 s., 8783.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A computational framework to explore large-scale biosynthetic diversity
Navarro-Muñoz, J. C., Selem-Mojica, N., Mullowney, M. W., Kautsar, S. A., Tryon, J. H., Parkinson, E. I., De Los Santos, E. L. C., Yeong, M., Cruz-Morales, P., Abubucker, S., Roeters, A., Lokhorst, W., Fernandez Guerra, Antonio, Cappelini, L. T. D., Goering, A. W., Thomson, R. J., Metcalf, W. W., Kelleher, N. L., Barona-Gomez, F. & Medema, M. H., jan. 2020, I: Nature Chemical Biology. 16, 1, s. 60-68 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Verrucomicrobia use hundreds of enzymes to digest the algal polysaccharide fucoidan
Sichert, A., Corzett, C. H., Schechter, M. S., Unfried, F., Markert, S., Becher, D., Fernandez Guerra, Antonio, Liebeke, M., Schweder, T., Polz, M. F. & Hehemann, J. H., 2020, I: Nature Microbiology. 5, s. 1026-1039Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
Decoding the ocean's microbiological secrets for marine enzyme biodiscovery
Ferrer, M., Mendez-Garcia, C., Bargiela, R., Chow, J., Alonso, S., Garcia-Moyano, A., Bjerga, G. E. K., Steen, I. H., Schwabe, T., Blom, C., Vester, J., Weckbecker, A., Shahgaldian, P., de Carvalho, C. C. C. R., Meskys, R., Zanaroli, G., Gloeckner, F. O., Fernandez-Guerra, A., Thambisetty, S., de la Calle, F. & 9 flere, , 2019, I: FEMS Microbiology Letters. 366, 1Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
Organic matter processing by microbial communities throughout the Atlantic water column as revealed by metaproteomics
Bergauer, K., Fernandez Guerra, Antonio, Garcia, J. A. L., Sprenger, R. R., Stepanauskas, R., Pachiadaki, M. G., Jensen, O. N. & Herndl, G. J., 16 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 3, s. E400-E408 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Recurrent patterns of microdiversity in a temperate coastal marine environment
Chafee, M., Fernandez Guerra, Antonio, Buttigieg, P. L., Gerdts, G., Eren, A. M., Teeling, H. & Amann, R. I., jan. 2018, I: ISME Journal. 12, 1, s. 237-252 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Determinants and Prediction of Esterase Substrate Promiscuity Patterns
Martinez-Martinez, M., Coscolin, C., Santiago, G., Chow, J., Stogios, P. J., Bargiela, R., Gertler, C., Navarro-Fernandez, J., Bollinger, A., Thies, S., Mendez-Garcia, C., Popovic, A., Brown, G., Chernikova, T. N., Garcia-Moyano, A., Bjerga, G. E. K., Perez-Garcia, P., Hai, T., Del Pozo, M. V., Stokke, R. & 22 flere, , jan. 2018, I: ACS chemical biology. 13, 1, s. 225-234 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Molecular recognition of the beta-glucans laminarin and pustulan by a SusD-like glycan-binding protein of a marine Bacteroidetes
Mystkowska, A. A., Robb, C., Vidal-Melgosa, S., Vanni, C., Fernandez Guerra, Antonio, Hoehne, M. & Hehemann, J., 2018, I: FEBS Journal. 285, 23, s. 4465-4481Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
Analysis of phytoplankton assemblage structure in the Mediterranean Sea based on high-throughput sequencing of partial 18S rRNA sequences
Penna, A., Casabianca, S., Fernandez Guerra, Antonio, Vernesi, C. & Scardi, M., dec. 2017, I: Marine Genomics. 36, s. 49-55 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Geographic distribution at subspecies resolution level: closely related Rhodopirellula species in European coastal sediments
Zure, Marina, Fernandez Guerra, Antonio, Munn, C. B. & Harder, J., feb. 2017, I: ISME Journal. 11, 2, s. 478-489 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
BioVeL: a virtual laboratory for data analysis and modelling in biodiversity science and ecology
Hardisty, A. R., Bacall, F., Beard, N., Balcazar-Vargas, M-P., Balech, B., Barcza, Z., Bourlat, S. J., De Giovanni, R., de Jong, Y., De Leo, F., Dobor, L., Donvito, G., Fellows, D., Fernandez Guerra, A., Ferreira, N., Fetyukova, Y., Fosso, B., Giddy, J., Goble, C., Guentsch, A. & 31 flere, , 2016, I: BMC Ecology. 16, 16 s., 49.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Comparative Genomic Analysis Reveals a Diverse Repertoire of Genes Involved in Prokaryote-Eukaryote Interactions within the Pseudovibrio Genus
Romano, S., Fernandez Guerra, Antonio, Reen, F. J., Gloeckner, F. O., Crowley, S. P., O'Sullivan, O., Cotter, P. D., Adams, C., Dobson, A. D. W. & O'Gara, F., 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 20 s., 387.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
MyOSD 2014: Evaluating Oceanographic Measurements Contributed by Citizen Scientists in Support of Ocean Sampling Day
Schnetzer, J., Kopf, A., Bietz, M. J., Buttigieg, P. L., Fernandez Guerra, Antonio, Ristov, A. P., Gloeckner, F. O. & Kottmann, R., 2016, I: Journal of Microbiology and Biology Education. 17, 1, s. 163-171Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Optimized R functions for analysis of ecological community data using the R virtual laboratory (RvLab)
Varsos, C., Patkos, T., Oulas, A., Pavloudi, C., Gougousis, A., Ijaz, U. Z., Filiopoulou, I., Pattakos, N., Berghe, E. V., Fernandez Guerra, Antonio, Faulwetter, S., Chatzinikolaou, E., Pafilis, E., Bekiari, C., Doerr, M. & Arvanitidis, C., 2016, I: Biodiversity Data Journal. 4, 28 s., e8357.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
The ocean sampling day consortium
Kopf, A., Bicak, M., Kottmann, R., Schnetzer, J., Kostadinov, I., Lehmann, K., Fernandez-Guerra, A., Jeanthon, C., Rahav, E., Ullrich, M., Wichels, A., Gerdts, G., Polymenakou, P., Kotoulas, G., Siam, R., Abdallah, R. Z., Sonnenschein, E. C., Cariou, T., O'Gara, F., Jackson, S. & 31 flere, , 2015, I: GigaScience. 4, 5 s., 27.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
Pheromone Evolution, Reproductive Genes, and Comparative Transcriptomics in Mediterranean Earthworms (Annelida, Oligochaeta, Hormogastridae)
Novo, M., Riesgo, A., Fernandez Guerra, Antonio & Giribet, G., 2013, I: Molecular Biology and Evolution. 30, 7, s. 1614-1629Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
Exploration of community traits as ecological markers in microbial metagenomes
Barberán, A., Fernandez Guerra, Antonio, Bohannan, B. J. M. & Casamayor, E. O., 2012, I: Molecular Ecology. 21, 8, s. 1909-1917Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Habitat-Associated Phylogenetic Community Patterns of Microbial Ammonia Oxidizers
Fernandez Guerra, Antonio & Casamayor, E. O., 2012, I: PLoS ONE. 7, 10, 9 s., e47330.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Patterns and architecture of genomic islands in marine bacteria
Fernandez-Gomez, B., Fernandez Guerra, Antonio, Casamayor, E. O., Gonzalez, J. M., Pedros-Alio, C. & Acinas, S. G., 2012, I: BMC Genomics. 13, 19 s., 347.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
Phylogenetic ecology of widespread uncultured clades of the Kingdom Euryarchaeota
Barberán, A., Fernandez Guerra, Antonio, Auguet, J., Galand, P. E. & Casamayor, E. O., 2011, I: Molecular Ecology. 20, 9, s. 1988-1996Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A close relationship between primary nucleotides sequence structure and the composition of functional genes in the genome of prokaryotes
Garcia, J. A. L., Fernandez Guerra, Antonio & Casamayor, E. O., 2011, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 61, 3, s. 650-658Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genomics of the Proteorhodopsin-Containing Marine Flavobacterium Dokdonia sp. Strain MED134
Gonzalez, J. M., Pinhassi, J., Fernandez-Gomez, B., Coll-Llado, M., Gonzalez-Velazquez, M., Puigbo, P., Jaenicke, S., Gomez-Consarnau, L., Fernandez Guerra, Antonio, Goesmann, A. & Pedros-Alio, C., 2011, I: Applied and Environmental Microbiology. 77, 24, s. 8676-8686Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
T-RFPred: a nucleotide sequence size prediction tool for microbial community description based on terminal-restriction fragment length polymorphism chromatograms
Fernandez Guerra, Antonio, Buchan, A., Mou, X., Casamayor, E. O. & Gonzalez, J. M., 2010, I: BMC Microbiology. 10, 7 s., 262.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
Genome analysis of the proteorhodopsin-containing marine bacterium Polaribacter sp. MED152 (Flavobacteria)
Gonzalez, J. M., Fernandez-Gomez, B., Fernandez Guerra, Antonio, Gomez-Consarnau, L., Sanchez, O., Coll-Llado, M., del Campo, J., Escudero, L., Rodriguez-Martinez, R., Alonso-Sáez, L., Latasa, M., Paulsen, I., Nedashkovskaya, O., Lekunberri, I., Pinhassi, J. & Pedros-Alio, C., 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 25, s. 8724-8729Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2006
The genomic repertoire for cell cycle control and DNA metabolism in S. purpuratus
Fernandez Guerra, Antonio, Aze, A., Morales, J., Mulner-Lorillon, O., Cosson, B., Cormier, P., Bradham, C., Adams, N., Robertson, A. J., Marzluff, W. F., Coffman, J. A. & Geneviere, A., 2006, I: Developmental Biology. 300, 1, s. 238-251Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
The Genome of the Sea Urchin Strongylocentrotus purpuratus
Sodergren, E., Weinstock, G. M., Davidson, E. H., Cameron, R. A., Gibbs, R. A., Angerer, R. C., Angerer, L. M., Arnone, M. I., Burgess, D. R., Burke, R. D., Cameron, R. A., Coffman, J. A., Davidson, E. H., Dean, M., Elphick, M. R., Ettensohn, C. A., Foltz, K. R., Hamdoun, A., Hynes, R. O., Klein, W. H. & 28 flere, , 2006, I: Science. 314, 5801, s. 941-952Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 235125386
Flest downloads
-
99
downloads
Meta-SourceTracker: application of Bayesian source tracking to shotgun metagenomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
65
downloads
A 2-million-year-old ecosystem in Greenland uncovered by environmental DNA
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
52
downloads
Linking Spatial and Temporal Dynamic of Bacterioplankton Communities With Ecological Strategies Across a Coastal Frontal Area
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet