Kresten Lindorff-Larsen
Professor
Biomolecular Sciences
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- 2019
- Udgivet
Allosteric modulation of the sarcoplasmic reticulum Ca2+ ATPase by thapsigargin via decoupling of functional motions
Saleh, N., Wang, Y., Nissen, P. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 21, 39, s. 21991-21995Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Barnaba: software for analysis of nucleic acid structures and trajectories
Bottaro, S., Bussi, G., Pinamonti, G., Reisser, S., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: RNA. 25, 2, s. 219-231Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bayesian-Maximum-Entropy Reweighting of IDP Ensembles Based on NMR Chemical Shifts
Crehuet, R., Buigues, P. J., Salvatella, X. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Entropy. 21, 9, 17 s., 898.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biophysical and Mechanistic Models for Disease-Causing Protein Variants
Stein, Amelie, Fowler, D. M., Hartmann-Petersen, Rasmus & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Trends in Biochemical Sciences. 44, 7, s. 575-588Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational and cellular studies reveal structural destabilization and degradation of MLH1 variants in Lynch syndrome
Abildgaard, A. B., Stein, Amelie, Nielsen, S. V., Schultz-Knudsen, Katrine, Papaleo, E., Shrikhande, A., Hoffmann, Eva, Bernstein, I., Gerdes, Anne-Marie Axø, Takahashi, M., Ishioka, C., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, I: eLife. 8, 28 s., e49138 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dissecting the statistical properties of the linear extrapolation method of determining protein stability
Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Protein engineering, design & selection : PEDS. 32, 10, s. 471-479 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fitting Corrections to an RNA Force Field Using Experimental Data
Cesari, A., Bottaro, S., Lindorff-Larsen, Kresten, Banás, P., Sponer, J. & Bussi, G., 2019, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 15, 6, s. 3425-3431Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Promoting transparency and reproducibility in enhanced molecular simulations
Bonomi, M., Bussi, G., Camilloni, C., Tribello, G. A., Banas, P., Barducci, A., Bernetti, M., Bolhuis, P. G., Bottaro, S., Branduardi, D., Capelli, R., Carloni, P., Ceriotti, M., Cesari, A., Chen, H., Chen, W., Colizzi, F., De, S., De La Pierre, M., Donadio, D. & 54 flere, , 2019, I: Nature Methods. 16, 8, s. 670-673Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein stability and degradation in health and disease
Bjørnkjær, Lene, Abildgaard, A. B., Gersing, S. K., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, Molecular Chaperones in Human Disorders. Donev, R. (red.). Academic Press, s. 61-83 (Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, Bind 114).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Side chain to main chain hydrogen bonds stabilize a polyglutamine helix in a transcription factor
Escobedo, A., Topal, B., Kunze, M. B. A., Aranda, J., Chiesa, G., Mungianu, D., Bernardo-Seisdedos, G., Eftekharzadeh, B., Gairí, M., Pierattelli, R., Felli, I. C., Diercks, T., Millet, O., García, J., Orozco, M., Crehuet, R., Lindorff-Larsen, Kresten & Salvatella, X., 2019, I: Nature Communications. 10, 11 s., 2034.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural Basis for Properdin Oligomerization and Convertase Stimulation in the Human Complement System
Pedersen, D. V., Gadeberg, T. A. F., Thomas, C., Wang, Y., Joram, N., Jensen, R. K., Mazarakis, S. M. M., Revel, M., El Sissy, C., Petersen, S. V., Lindorff-Larsen, Kresten, Thiel, S., Laursen, N. S., Fremeaux-Bacchi, V. & Andersen, G. R., 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 19 s., 2007.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Substrate-induced conformational dynamics of the dopamine transporter
Nielsen, A. K., Möller, I. R., Wang, Y., Rasmussen, Søren Gøgsig Faarup, Lindorff-Larsen, Kresten, Rand, Kasper Dyrberg & Loland, Claus Juul, 2019, I: Nature Communications. 10, 14 s., 2714.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toward mechanistic models for genotype-phenotype correlations in phenylketonuria using protein stability calculations
Scheller, R., Stein, Amelie, Nielsen, S. V., Marin, F. I., Gerdes, Anne-Marie Axø, Di Marco, M., Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, I: Human Mutation. 40, 4, s. 444-457Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular dynamics-guided discovery of an ago-allosteric modulator for GPR40/FFAR1
Lückmann, Michael, Trauelsen, Mette, Bentsen, M. A., Nissen, T. A. D., Martins, J., Fallah, Z., Nygaard, M. M., Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten, Schwartz, Thue W. & Frimurer, Thomas Michael, 2 apr. 2019, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116, 14, s. 7123-7128Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Classifying disease-associated variants using measures of protein activity and stability
Jepsen, M. M., Fowler, D. M., Hartmann-Petersen, Rasmus, Stein, Amelie & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, Protein Homeostasis Diseases: Mechanisms and Novel Therapies. Pey, A. L. (red.). Elsevier, s. 91-107Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Co-Chaperones in Targeting and Delivery of Misfolded Proteins to the 26S Proteasome
Abildgaard, A. B., Gersing, S. K., Larsen-Ledet, Sven, Nielsen, S. V., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2020, I: Biomolecules. 10, 8, 24 s., 1141.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Combining molecular dynamics simulations with small-angle X-ray and neutron scattering data to study multi-domain proteins in solution
Nørgrd Larsen, Andreas, Wang, Y., Bottaro, S., Grudinin, S., Arleth, Lise & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, I: P L o S Computational Biology. 16, 4, 29 s., e1007870.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computing, Analyzing, and Comparing the Radius of Gyration and Hydrodynamic Radius in Conformational Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins
Ahmed, M. C., Crehuet, R. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, Intrinsically Disordered Proteins: Methods and Protocols. Kragelund, B. B. & Skriver, K. (red.). Humana Press, s. 429-445 17 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2141).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Folliculin variants linked to Birt-Hogg-Dubé syndrome are targeted for proteasomal degradation
Bjørnkjær, Lene, Stein, Amelie, Grønbæk-Thygesen, Martin, Nygaard, L., Søltoft, C. L., Nielsen, S. V., Lisby, Michael, Ravid, T., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2020, I: PLOS Genetics. 16, 11, 28 s., e1009187.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Global analysis of protein stability by temperature and chemical denaturation
Hamborg, L., Horsted, E. W., Johansson, Kristoffer Enøe, Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten & Teilum, Kaare, 2020, I: Analytical Biochemistry. 605, 7 s., 113863.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
How to learn from inconsistencies: Integrating molecular simulations with experimental data
Orioli, S., Nørgrd Larsen, Andreas, Bottaro, S. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, Computational Approaches for Understanding Dynamical Systems: Protein Folding and Assembly. Strodel, B. & Barz, B. (red.). Academic Press, s. 123-176 54 s. (Progress in Molecular Biology and Translational Science, Bind 170).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Integrating Molecular Simulation and Experimental Data: A Bayesian/Maximum Entropy Reweighting Approach
Bottaro, S., Bengtsen, T. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, Structural Bioinformatics: Methods and Protocols. Gáspári, Z. (red.). Humana Press, s. 219-240 22 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2112).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Integrating NMR and simulations reveals motions in the UUCG tetraloop
Bottaro, S., Nichols, P. J., Vögeli, B., Parrinello, M. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 11, s. 5839-5848 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel HARS2 missense variants identified in individuals with sensorineural hearing impairment and Perrault syndrome
Karstensen, H. G., Rendtorff, N. D., Hindbæk, L. S., Colombo, R., Stein, Amelie, Birkebæk, N. H., Hartmann-Petersen, Rasmus, Lindorff-Larsen, Kresten, Højland, A. T., Petersen, M. B. & Tranebjærg, Lisbeth, 2020, I: European Journal of Medical Genetics. 63, 3, 6 s., 103733.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein Dynamics Enables Phosphorylation of Buried Residues in Cdk2/Cyclin-A-Bound p27
Henriques, J. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, I: Biophysical Journal. 119, 10, s. 2010-2018 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 35228567
Flest downloads
-
2312
downloads
Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
914
downloads
Similarity measures for protein ensembles
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
849
downloads
Evaluating the effects of cutoffs and treatment of long-range electrostatics in protein folding simulations
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt