thw266 KU

thw266 KU

Professor, Adjungeret professor

Medlem af:


    1. Udgivet

      Genome sequencing reveals insights into physiology and longevity of the naked mole rat

      Kim, E. B., Fang, X., Fushan, A. A., Huang, Z., Lobanov, A. V., Han, L., Marino, S. M., Sun, X., Turanov, A. A., Yang, P., Yim, S. H., Zhao, X., Kasaikina, M. V., Stoletzki, N., Peng, C., Polak, P., Xiong, Z., Kiezun, A., Zhu, Y., Chen, Y. & 16 flere, Kryukov, G. V., Zhang, Q., Peshkin, L., Yang, L., Bronson, R. T., Buffenstein, R., Wang, B., Han, C., Li, Q., Chen, L., Zhao, W., Sunyaev, S. R., Park, T. J., KU, thw266, Wang, J. & Gladyshev, V. N., 2011, I: Nature Photographer. 479, 7372, s. 223-7 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    2. Reference-assisted chromosome assembly

      Kim, J., Larkin, D. M., Cai, Q., Asan, Zhang, Y., Ge, R., Auvil, L., Capitanu, B., KU, thw266, Lewin, H. A. & Ma, J., 2013, I: PNAS. 110, 5, s. 1785-1790 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      False gene and chromosome losses in genome assemblies caused by GC content variation and repeats

      Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Yoo, D. A., Won, S., Phillippy, A. M., Fedrigo, O., KU, thw266, Howe, K., Wood, J., Durbin, R., Formenti, G., Brown, S., Cantin, L., Mello, C. V., Cho, S., Rhie, A., Kim, H. & Jarvis, E. D., 2022, I: Genome Biology. 23, 29 s., 204.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      The draft genome of a socially polymorphic halictid bee, Lasioglossum albipes: [plus] Erratum

      Kocher, S. D., Li, C., Yang, W., Tan, H., Yi, S. V., Yang, X., Hoekstra, H. E., KU, thw266, Pierce, N. E. & Yu, D. W., 2013, I: Genome Biology. 14, 12, 14 s., R142 .

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      The Genome 10K Project: a way forward

      Koepfli, K-P., Paten, B., O'Brien, S. J., Antunes, A., Belov, K., Bustamante, C., Castoe, T. A., Clawson, H., Crawford, A. J., Diekhans, M., Distel, D., Durbin, R., Earl, D., Fujita, M. K., Gamble, T., Georges, A., Gemmell, N., Gilbert, M. T. P., Graves, J. M., Green, R. E. & 25 flere, Hickey, G., Jarvis, E. D., Johnson, W., Komissarov, A., Korf, I., Kuhn, R., Larkin, D. M., Lewin, H., Lopez, J. V., Ma, J., Marques-Bonet, T., Miller, W., Murphy, R., Pevzner, P., Shapiro, B., Steiner, C., Tamazian, G., Venkatesh, B., Wang, J., Wayne, R., Wiley, E., Yang, H., KU, thw266, Haussler, D. & Ryder, O., 2015, I: Annual Review of Animal Biosciences. 3, s. 57-111 55 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      A genomic comparison of two termites with different social complexity

      Korb, J., Poulsen, Michael, Hu, H., Li, C., Boomsma, Jacobus J., KU, thw266 & Liebig, J., 2015, I: Frontiers in Genetics. 6, 12 s., 9.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Identification of constrained sequence elements across 239 primate genomes

      Kuderna, L. F. K., Ulirsch, J. C., Rashid, S., Ameen, M., Sundaram, L., Hickey, G., Cox, A. J., Gao, H., Kumar, A., Aguet, F., Christmas, M. J., Clawson, H., Haeussler, M., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J. & 72 flere, Rouselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S., Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., KU, thw266, Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Karakikes, I., Wang, K. C., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Siepel, A., Kundaje, A., Paten, B., Lindblad-Toh, K., Rogers, J., Marques Bonet, T. & Farh, K. K. H., 2024, I: Nature. 625, s. 735–742 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      A global catalog of whole-genome diversity from 233 primate species

      Kuderna, L. F. K., Gao, H., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., Rousselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S. & 55 flere, Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., KU, thw266, Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Rogers, J., Farh, K. K. H. & Marques Bonet, T., 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, s. 906-913 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviours

      Kukekova, A. V., Johnson, J. L., Xiang, X., Feng, S., Liu, S., Rando, H. M., Kharlamova, A. V., Herbeck, Y., Serdyukova, N. A., Xiong, Z., Beklemischeva, V., Koepfli, K-P., Gulevich, R. G., Vladimirova, A. V., Hekman, J. P., Perelman, P. L., Graphodatsky, A. S., O'Brien, S. J., Wang, X., Clark, A. G. & 3 flere, Acland, G. M., Trut, L. N. & KU, thw266, 2018, I: Nature Ecology & Evolution. 2, 9, s. 1479-1491

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Labour classified by cervical dilatation & fetal membrane rupture demonstrates differential impact on RNA-seq data for human myometrium tissues

      Lai, P. F., Lei, K., Zhan, X., Sooranna, G., Li, J. K. H., Georgiou, E. X., Das, A., Singh, N., Li, Q., Stanfield, Z., KU, thw266, Tribe, R. M., Mesiano, S. & Johnson, M. R., 2021, I: PLoS ONE. 16, 11, 22 s., e0260119.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      Standards recommendations for the Earth BioGenome Project

      Lawniczak, M. K. N., Durbin, R., Flicek, P., Lindblad-Toh, K., Wei, X., Archibald, J. M., Baker, W. J., Belov, K., Blaxter, M. L., Bonet, T. M., Childers, A. K., Coddington, J. A., Crandall, K. A., Crawford, A. J., Davey, R. P., Palma, F. D., Fang, Q., Haerty, W., Hall, N., Hoff, K. J. & 25 flere, Howe, K., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Johnson, R. N., Kersey, P. J., Liu, X., Lopez, J. V., Myers, E. W., Pettersson, O. V., Phillippy, A. M., Poelchau, M. F., Pruitt, K. D., Rhie, A., Castilla-Rubio, J. C., Sahu, S. K., Salmon, N. A., Soltis, P. S., Swarbreck, D., Thibaud-Nissen, F., Wang, S., Wegrzyn, J. L., KU, thw266, Zhang, H., Lewin, H. A. & Richards, S., 2022, I: PNAS. 119, 4, 8 s., e2115639118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      The Earth BioGenome Project 2020: Starting the clock

      Lewin, H. A., Richards, S., Aiden, E. L., Allende, M. L., Archibald, J. M., Bálint, M., Barker, K. B., Baumgartner, B., Belov, K., Bertorelle, G., Blaxter, M. L., Cai, J., Caperello, N. D., Carlson, K., Castilla-Rubio, J. C., Chaw, S. M., Chen, L., Childers, A. K., Coddington, J. A., Conde, D. A. & 65 flere, Corominas, M., Crandall, K. A., Crawford, A. J., DiPalma, F., Durbin, R., Ebenezer, T. E., Edwards, S. V., Fedrigo, O., Flicek, P., Formenti, G., Gibbs, R. A., Gilbert, M Thomas P, Goldstein, M. M., Graves, J. M., Greely, H. T., Grigoriev, I. V., Hackett, K. J., Hall, N., Haussler, D., Helgen, K. M., Hogg, C. J., Isobe, S., Jakobsen, K. S., Janke, A., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Jones, S. J. M., Karlsson, E. K., Kersey, P. J., Kim, J. H., Kress, W. J., Kuraku, S., Lawniczak, M. K. N., Leebens-Mack, J. H., Li, X., Lindblad-Toh, K., Liu, X., Lopez, J. V., Marques-Bonet, T., Mazard, S., Mazet, J. A. K., Mazzoni, C. J., Myers, E. W., O’Neill, R. J., Paez, S., Park, H., Robinson, G. E., Roquet, C., Ryder, O. A., Sabir, J. S. M., Shaffer, H. B., Shank, T. M., Sherkow, J. S., Soltis, P. S., Tang, B., Tedersoo, L., Uliano-Silva, M., Wang, K., Wei, X., Wetzer, R., Wilson, J. L., Xu, X., Yang, H., Yoder, A. D. & KU, thw266, 2022, I: PNAS. 119, 4, 7 s., e2115635118.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      Earth BioGenome Project: sequencing life for the future of life

      Lewin, H. A., Robinson, G. E., Kress, W. J., Baker, W. J., Coddington, J., Crandall, K. A., Durbin, R., Edwards, S. V., Forest, F., Gilbert, M. T. P., Goldstein, M. M., Grigoriev, I. V., Hackett, K. J., Haussler, D., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Patrinos, A., Richards, S., Castilla-Rubio, J. C., van Sluys, M-A. & 4 flere, Soltis, P. S., Xu, X., Yang, H. & KU, thw266, 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 17, s. 4325-4333 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      Two Antarctic penguin genomes reveal insights into their evolutionary history and molecular changes related to the Antarctic environment

      Li, C., Zhang, Y., Li, J., Kong, L., Hu, H., Pan, H., Xu, L., Deng, Y., Li, Q., Jin, L., Yu, H., Chen, Y., Liu, B., Yang, L., Liu, S., Zhang, Y., Lang, Y., Xia, J., He, W., Shi, Q. & 21 flere, Subramanian, S., Millar, C. D., Meader, S., Rands, C. M., Fujita, M. K., Greenwold, M. J., Castoe, T. A., Pollock, D. D., Gu, W., Nam, K., Ellegren, H., Ho, S. Y., Burt, D. W., Ponting, C. P., Jarvis, E. D., Gilbert, M Thomas P, Yang, H., Wang, J., Lambert, D. M., Wang, J. & KU, thw266, 2014, I: GigaScience. 3, 27, 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Phylogenomic analyses of the genus Drosophila reveals genomic signals of climate adaptation

      Li, F., Rane, R. V., Luria, V., Xiong, Z., Chen, J., Li, Z., Catullo, R. A., Griffin, P. C., Schiffer, M., Pearce, S., Lee, S. F., McElroy, K., Stocker, A., Shirriffs, J., Cockerell, F., Coppin, C., Sgrò, C. M., Karger, A., Cain, J. W., Weber, J. A. & 5 flere, Santpere, G., Kirschner, M. W., Hoffmann, A. A., Oakeshott, J. G. & KU, thw266, 2022, I: Molecular Ecology Resources. 22, 4, s. 1559-1581 23 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      A new duck genome reveals conserved and convergently evolved chromosome architectures of birds and mammals

      Li, J., Zhang, J., Liu, J., Zhou, Y., Cai, C., Xu, L., Dai, X., Feng, S., Guo, C., Rao, J., Wei, K., Jarvis, E. D., Jiang, Y., Zhou, Z., KU, thw266 & Zhou, Q., 2021, I: GigaScience. 10, 1, 15 s., giaa142.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      Functional genomics analysis reveals the evolutionary adaptation and demographic history of pygmy lorises

      Li, M. L., Wang, S., Xu, P., Tian, H. Y., Bai, M., Zhang, Y. P., Shao, Y., Xiong, Z. J., Qi, X. G., Cooper, D. N., KU, thw266, Zhu, H. H. & Wu, D. D., 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 40, 10 s., e2123030119.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      A single-cell transcriptomic atlas tracking the neural basis of division of labour in an ant superorganism

      Li, Q., Wang, M., Zhang, P., Liu, Y., Guo, Q., Zhu, Y., Wen, T., Dai, X., Zhang, X., Nagel, M., Dethlefsen, B. H., Xie, N., Zhao, J., Jiang, W., Han, L., Wu, L., Zhong, W., Wang, Z., Wei, X., Dai, W. & 9 flere, Liu, L., Xu, X., Lu, H., Yang, H., Wang, J., Boomsma, Jacobus J., Liu, C., KU, thw266 & Liu, W., 2022, I: Nature Ecology & Evolution. 6, 8, s. 1191-1204

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      Caste-specific RNA editomes in the leaf-cutting ant Acromyrmex echinatior

      Li, Q., Wang, Z., Lian, J., Schiøtt, M., Jin, L., Zhang, P., Zhang, Y., Nygaard, S., Peng, Z., Zhou, Y., Deng, Y., Zhang, W., Boomsma, Jacobus J. & KU, thw266, 2014, I: Nature Communications. 5, 11 s., 4943.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      Genomic signatures of near-extinction and rebirth of the crested ibis and other endangered bird species

      Li, S., Li, B., Cheng, C., Xiong, Z., Liu, Q., Lai, J., Carey, H. V., Zhang, Q., Zheng, H., Wei, S., Zhang, H., Chang, L., Liu, S., Zhang, S., Yu, B., Zeng, X., Hou, Y., Nie, W., Guo, Y., Chen, T. & 13 flere, Han, J., Wang, J., Wang, J., Chen, C., Liu, J., Stambrook, P. J., Xu, M., KU, thw266, Gilbert, M Thomas P, Yang, H., Jarvis, E. D., Yu, J. & Yan, J., 2014, I: Genome Biology (Online Edition). 15, 16 s., 557.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    21. Udgivet

      Draft genome assemblies of four manakins

      Li, X., Gao, R., Chen, G., Price, A. L., Øksnebjerg, Daniel Bilyeli, Hosner, Peter Andrew, Zhou, Y., KU, thw266 & Feng, S., 2022, I: Scientific Data. 9, 11 s., 564.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    22. Udgivet

      Outbred genome sequencing and CRISPR/Cas9 gene editing in butterflies

      Li, X., Fan, D., Zhang, W., Liu, G., Zhang, L., Zhao, L., Fang, X., Chen, L., Dong, Y., Chen, Y., Ding, Y., Zhao, R., Feng, M., Zhu, Y., Feng, Y., Jiang, X., Zhu, D., Xiang, H., Feng, X., Li, S. & 4 flere, Wang, J., KU, thw266, Kronforst, M. R. & Wang, W., 2015, I: Nature Communications. 6, 10 s., 8212.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    23. Adaptive diversity of innate immune receptor family short pentraxins in Murinae

      Li, Y., Robins, J. H., Ye, J., Huang, Z., Wen, Q. & KU, thw266, 2012, I: F E B S Letters. 586, 6, s. 798-803 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. Udgivet

      Origin and Deep Evolution of Human Endogenous Retroviruses in Pan-Primates

      Li, Y., KU, thw266 & Cui, J., 2022, I: Viruses. 14, 7, 14 s., 1370.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      Probing the genomic limits of de-extinction in the Christmas Island rat

      Lin, J., Duchene, David, Carøe, C., Smith, O., Ciucani, M. M., Niemann, Jonas, Richmond, D., Greenwood, A. D., MacPhee, R., KU, thw266, Gopalakrishnan, Shyam & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 7, s. 1650-1656.e3

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    ID: 40294134