Sachin Pundhir
Seniorforsker
Porse Group
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- Udgivet
Structured RNAs and synteny regions in the pig genome
Anthon, Christian, Tafer, H., Havgaard, Jakob Hull, Thomsen, B., Hedegaard, J., Seemann, Ernst Stefan, Pundhir, Sachin, Kehr, S., Bartschat, S., Nielsen, M., Nielsen, R. O., Fredholm, Merete, Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2014, I: BMC Genomics. 15, 27 s., 459.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
BloodSpot: a database of gene expression profiles and transcriptional programs for healthy and malignant haematopoiesis
Bagger, F. O., Sasivarevic, D., Hadi Sohi, S., Laursen, L. G., Pundhir, Sachin, Sønderby, C. K., Winther, Ole, Rapin, N. & Porse, Bo Torben, 4 jan. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, D1, s. D917-24 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The ASXL1-G643W variant accelerates the development of CEBPA mutant acute myeloid leukemia
D'Altri, T., Wilhelmson, Anna, Schuster, Mikkel Bruhn, Wenzel, Anne, Kalvisa, A., Pundhir, Sachin, Hansen, A. M. & Porse, Bo Torben, 2021, I: Haematologica. 106, 4, s. 1000-1007 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The splicing factor RBM25 controls MYC activity in acute myeloid leukemia
Ge, Y., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Rapin, N., Bagger, F. O., Sidiropoulos, N., Hashem, N. & Porse, Bo Torben, 2019, I: Nature Communications. 10, 1, s. 1-14 14 s., 172.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
H3K9 dimethylation safeguards cancer cells against activation of the interferon pathway
Hansen, A. M., Ge, Y., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Jakobsen, J. S., Kalvisa, A., Tapia, Marta Cecylia, Gordon, Sandra, Ambri, F., Bagger, F. O., Pandey, D., Helin, K. & Porse, Bo Torben, 2022, I: Science Advances. 8, 11, eabf8627.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
TET2 lesions enhance the aggressiveness of CEBPA-mutant acute myeloid leukemia by rebalancing GATA2 expression
Heyes, E., Wilhelmson, Anna, Wenzel, Anne, Manhart, G., Eder, T., Schuster, Mikkel Bruhn, Rzepa, E., Pundhir, Sachin, D’Altri, T., Frank, Anne-Katrine, Gentil, C., Woessmann, J., Schoof, E. M., Meggendorfer, M., Schwaller, J., Haferlach, T., Grebien, F. & Porse, Bo Torben, 2023, I: Nature Communications. 14, 18 s., 6185.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Adipocyte gene expression and DNA methylation patterns differ significantly between lean and obese pigs
Jacobsen, M. J., Havgaard, Jakob Hull, Mentzel, Caroline M. Junker, Sørensen, P. M., Pundhir, Sachin, Anthon, Christian, Karlskov-Mortensen, Peter, Bruun, Camilla Vibeke Sichlau, Cirera, Susanna, Gorodkin, Jan, Jørgensen, Claus Bøttcher, Barrès, Romain & Fredholm, Merete, 9 nov. 2016, I: Journal of Animal Science. 94, Supplement 4, s. 46-47 2 s., P2019.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Epigenetic and Transcriptomic Characterization of Pure Adipocyte Fractions From Obese Pigs Identifies Candidate Pathways Controlling Metabolism
Jacobsen, M. J., Havgaard, Jakob Hull, Anthon, Christian, Mentzel, Caroline M. Junker, Cirera, Susanna, Krogh, P. M., Pundhir, Sachin, Karlskov-Mortensen, Peter, Bruun, C. S., Lesnik, P., Guerin, M., Gorodkin, Jan, Jørgensen, Claus Bøttcher, Fredholm, Merete & Barrès, Romain, 2019, I: Frontiers in Genetics. 10, 13 s., 1268.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mutant CEBPA directly drives the expression of the targetable tumor-promoting factor CD73 in AML
Jakobsen, J. S., Laursen, L. G., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Schoof, E., Ge, Y., d'Altri, T., Vitting-Seerup, K., Rapin, N., Gentil, C., Jendholm, J., Theilgaard-Mønch, Kim, Reckzeh, K., Bullinger, L., Döhner, K., Hokland, P., Fitzgibbon, J. & Porse, Bo Torben, 2019, I: Science Advances. 5, 7, s. 1-16 16 s., eaaw4304.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DeepBlockAlign: a tool for aligning RNA-seq profiles of read block patterns
Langenberger, D., Pundhir, Sachin, Ekstrøm, Claus Thorn, Stadler, P. F., Hoffmann, S. & Gorodkin, Jan, 2012, I: Bioinformatics. 28, 1, s. 17-24 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Differences in Cell Cycle Status Underlie Transcriptional Heterogeneity in the HSC Compartment
Lauridsen, F. K., Jensen, T. L., Rapin, N., Aslan, D., Wilhelmson, Anna, Pundhir, Sachin, Rehn, M., Paul, F., Giladi, A., Hasemann, M. S., Serup, Palle, Amit, I. & Porse, Bo Torben, 2018, I: Cell Reports. 24, 3, s. 766-780 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
HOTAIR ancient sequence suggests regulatory roles both in cis and trans
Nepal, C., Hadzheiv, Y., Pundhir, Sachin, Mydel, P., Lenhard, B., Mueller, F. & Andersen, J., 2018Publikation: Andet › Andet bidrag › Forskning
- Udgivet
Ancestrally Duplicated Conserved Noncoding Element Suggests Dual Regulatory Roles of HOTAIR in cis and trans
Nepal, C., Taranta, A., Hadzhiev, Y., Pundhir, Sachin, Mydel, P., Lenhard, B., Müller, F. & Andersen, Jesper Bøje, 2020, I: iScience. 23, 4, s. 1-27 UNSP 101008.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
PredictBias: a server for the identification of genomic and pathogenicity islands in prokaryotes
Pundhir, Sachin & Kumar, A., 2008, I: In Silico Biology. 8, 3-4, s. 223-234 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enhancer and Transcription Factor Dynamics during Myeloid Differentiation Reveal an Early Differentiation Block in Cebpa null Progenitors
Pundhir, Sachin, Bratt Lauridsen, F. K., Schuster, Mikkel Bruhn, Jakobsen, J. S., Ge, Y., Schoof, E. M., Rapin, N. P. J., Waage, J., Hasemann, M. S. & Porse, Bo Torben, 2018, I: Cell Reports. 23, 9, s. 2744-2757 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emerging applications of read profiles towards the functional annotation of the genome
Pundhir, Sachin, Poirazi, P. & Gorodkin, Jan, 19 maj 2015, I: Frontiers in Genetics. 6, 11 s., 188.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
SSPred: a prediction server based on SVM for the identification and classification of protein involved in bacterial secretion systems.
Pundhir, Sachin & Kumar, A., 2011, I: Bioinformation. 6, 10, s. 380-382 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The impact of SWI/SNF and NuRD inactivation on gene expression is tightly coupled with levels of RNA polymerase II occupancy at promoters
Pundhir, Sachin, Su, Jinyu, Tapia, Marta Cecylia, Hansen, A. M., Haile, James Seymour, Hansen, K. & Porse, Bo Torben, 2023, I: Genome Research. 33, 3, s. 332-345 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Differential and coherent processing patterns from small RNAs
Pundhir, Sachin & Gorodkin, Jan, 13 jul. 2015, I: Scientific Reports. 5, 16 s., 12062.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatially conserved regulatory elements identified within human and mouse Cd247 gene using high-throughput sequencing data from the ENCODE project.
Pundhir, Sachin, Hannibal, T. D., Bang-Berthelsen, C. H., Wegener, A. K., Pociot, Flemming, Holmberg, D. I. & Gorodkin, Jan, 2 maj 2014, I: Gene. 545, 1, s. 80-87 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Peak-valley-peak pattern of histone modifications delineates active regulatory elements and their directionality
Pundhir, Sachin, Bagger, F. O., Lauridsen, F. K. B., Rapin, N. P. J. & Porse, Bo Torben, 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 9, s. 4037-4051 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PTBP1 promotes hematopoietic stem cell maintenance and red blood cell development by ensuring sufficient availability of ribosomal constituents
Rehn, M., Wenzel, Anne, Frank, Anne-Katrine, Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Jørgensen, N., Vitting-Seerup, K., Ge, Y., Jendholm, J., Michaut, Magali, Schoof, E. M., Jensen, T. L., Rapin, N., Sapio, R. T., Andersen, Kasper Langebjerg, Lund, Anders H., Solimena, M., Holzenberger, M., Pestov, D. G. & Porse, Bo Torben, 2022, I: Cell Reports. 39, 6, 28 s., 110793.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcription factor-driven coordination of cell cycle exit and lineage-specification in vivo during granulocytic differentiation: In memoriam Professor Niels Borregaard
Theilgaard-Mønch, Kim, Pundhir, Sachin, Reckzeh, K., Su, Jinyu, Tapia, Marta Cecylia, Furtwängler, Benjamin, Jendholm, J., Jakobsen, J. S., Hasemann, M. S., Knudsen, K. J., Cowland, J. B., Fossum, A., Schoof, E., Schuster, Mikkel Bruhn & Porse, Bo Torben, 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 17 s., 3595.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The histone demethylase KDM5C functions as a tumor suppressor in AML by repression of bivalently marked immature genes
Trempenau, M. L., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Araújo Pereira, Mafalda, Kalvisa, A., Tapia, Marta Cecylia, Su, Jinyu, Ge, Y., de Boer, Bauke, Balhuizen, Alexander, Bagger, F. O., Shliaha, P., Sroczynska, P., Walfridsson, J., Grønbæk, Kirsten, Theilgaard-Mønch, Kim, Jensen, O. N., Helin, K. & Porse, Bo Torben, 2023, I: Leukemia. 37, 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 21221836
Flest downloads
-
880
downloads
Structured RNAs and synteny regions in the pig genome
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
245
downloads
Peak-valley-peak pattern of histone modifications delineates active regulatory elements and their directionality
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
184
downloads
BloodSpot: a database of gene expression profiles and transcriptional programs for healthy and malignant haematopoiesis
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet