Thomas Wim Hamelryck
Lektor, Gæsteforsker
Bioinformatik og RNA Biologi
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
Programming Languages and Theory of Computing
Universitetsparken 5, 2100 København Ø
- 2022
- Udgivet
Mixture Models for Spherical Data with Applications to Protein Bioinformatics
Mardia, K. V., Barber, S., Burdett, P. M., Kent, J. T. & Hamelryck, Thomas Wim, 2022, Directional Statistics for Innovative Applications: A Bicentennial Tribute to Florence Nightingale. Springer, s. 15-32 (Forum for Interdisciplinary Mathematics).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Persistent Topology of Protein Space
Hamilton, W., Borgert, J. E., Hamelryck, Thomas Wim & Marron, J. S., 2022, Research in Computational Topology 2. Springer, s. 223-244 (Association for Women in Mathematics Series, Bind 30).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Efficient Generative Modelling of Protein Structure Fragments using a Deep Markov Model
Thygesen, Christian Bahne, Al-Sibahi, A. S., Steenmanns, C. S., Sanz Moreta, Lys, Sørensen, A. B. & Hamelryck, Thomas Wim, 2021, International Conference on Machine Learning, 18-24 July 2021, Virtual. PMLR, s. 10258-10267 (Proceedings of Machine Learning Research, Bind 139).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Time-efficient Bayesian Inference for a (Skewed) von Mises Distribution on the Torus in a Deep Probabilistic Programming Language
Rønning, Ola, Ley, C., Mardia, K. V. & Hamelryck, Thomas Wim, 2021, 2021 IEEE International Conference on Multisensor Fusion and Integration for Intelligent Systems (MFI). IEEE, s. 1-8Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Bayesian protein superposition using Hamiltonian Monte Carlo
Sanz Moreta, Lys, Al-Sibahi, A. S. & Hamelryck, Thomas Wim, okt. 2020, Proceedings - IEEE 20th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering, BIBE 2020. IEEE, s. 1-11 9288019Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A community proposal to integrate structural bioinformatics activities in ELIXIR (3D-Bioinfo Community) [version 1; peer review: 1 approved, 3 approved with reservations]
Orengo, C., Velankar, S., Wodak, S., Zoete, V., Bonvin, A. M. J. J., Elofsson, A., Feenstra, K. A., Gerloff, D. L., Hamelryck, Thomas Wim, Hancock, J. M., Helmer-Citterich, M., Hospital, A., Orozco, M., Perrakis, A., Rarey, M., Soares, C., Sussman, J. L., Thornton, J. M., Tuffery, P., Tusnady, G., Wierenga, R., Salminen, T. & Schneider, B., 2020, I: F1000Research. 9, 27 s., 278.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GISA: using Gauss Integrals to identify rare conformations in protein structures
Grønbæk, Christian, Hamelryck, Thomas Wim & Røgen, P., 2020, I: PeerJ. 8, 16 s., e9159.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
A Probabilistic Programming Approach to Protein Structure Superposition
Sanz Moreta, Lys, Al-Sibahi, A. S., Theobald, D., Bullock, W., Rommes, B. N., Manoukian, Andreas & Hamelryck, Thomas Wim, 2019, 2019 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology, CIBCB 2019. Baruzzo, G., Daberdaku, S., Di Camillo, B., Furini, S., Giordano, E. D. & Nicosia, G. (red.). IEEE, 5 s. 8791469Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Langevin diffusions on the torus: estimation and applications
García-Portugués, E., Sørensen, Michael, Mardia, K. V. & Hamelryck, Thomas Wim, 2019, I: Statistics and Computing. 29, 1, s. 1-22 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
MyPMFs: a simple tool for creating statistical potentials to assess protein structural models
Postic, G., Hamelryck, Thomas Wim, Chomilier, J. & Stratmann, D., 2018, I: Biochimie. 151, s. 37-41 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 5765
Flest downloads
-
2244
downloads
Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1759
downloads
Parallel GPGPU Evaluation of Small Angle X-ray Scattering Profiles in a Markov Chain Monte Carlo Framework
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1432
downloads
A probabilistic model of RNA conformational space
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet