Robin Andersson
Lektor
Bioinformatik og RNA Biologi
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- 2014
- Udgivet
Identification of TNF-α-responsive promoters and enhancers in the intestinal epithelial cell model Caco-2
Boyd, M., Coskun, M., Lilje, B., Andersson, Robin, Hoof, I., Lange, Jette Bornholdt, Dahlgaard, K., Olsen, Jørgen, Vitezic, M., Bjerrum, Jakob Tveiten , Seidelin, Jakob Benedict, Nielsen, Ole Haagen, Troelsen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: D N A Research. 21, 6, s. 569-583 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nuclear stability and transcriptional directionality separate functionally distinct RNA species
Andersson, Robin, Refsing Andersen, P., Valen, E., Core, L. J., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: Nature Communications. 5, 10 s., 5336.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Nucleosome regulatory dynamics in response to TGFβ
Enroth, S., Andersson, Robin, Bysani, M., Wallerman, O., Termén, S., Tuch, B. B., de la Vega, F. M., Heldin, C., Moustakas, A., Komorowski, J. & Wadelius, C., 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, 11, s. 6921-6934 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional profiling of the human fibrillin/LTBP gene family, key regulators of mesenchymal cell functions
Davis, M. R., Andersson, Robin, Severin, J., de Hoon, M., Bertin, N., Baillie, J. K., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Forrest, A. R. R. & Summers, K. M., 2014, I: Molecular Genetics and Metabolism. 112, 3, s. 73-83 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
Polyadenylation site-induced decay of upstream transcripts enforces promoter directionality
Ntini, E., Järvelin, A. I., Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Boyd, M., Jørgensen, M., Andersson, Robin, Hoof, I., Schein, A., Andersen, P. R., Andersen, P. K., Preker, P., Valen, E., Zhao, X., Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2013, I: Nature Structural and Molecular Biology. 20, s. 923-928 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
A strand specific high resolution normalization method for chip-sequencing data employing multiple experimental control measurements.
Enroth, S., Andersson, C., Andersson, Robin, Wadelius, C., Gustafsson, M. & Komorowski, J., 2012, I: Algorithms for Molecular Biology. 7, 1, s. 2 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
Cancer associated epigenetic transitions identified by genome-wide histone methylation binding profiles in human colorectal cancer samples and paired normal mucosa
Enroth, S., Rada-Iglesisas, A., Andersson, Robin, Wallerman, O., Wanders, A., Påhlman, L., Komorowski, J. & Wadelius, C., 2011, I: B M C Cancer. 11, 13 s., 450.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
Recurrent genomic alterations in benign and malignant pheochromocytomas and paragangliomas revealed by whole-genome array comparative genomic hybridization analysis
Sandgren, J., Diaz de Ståhl, T., Andersson, Robin, Menzel, U., Piotrowski, A., Nord, H., Bäckdahl, M., Kiss, N. B., Brauckhoff, M., Komorowski, J., Dralle, H., Hessman, O., Larsson, C., Akerström, G., Bruder, C., Dumanski, J. P. & Westin, G., sep. 2010, I: Endocrine - Related Cancer. 17, 3, s. 561-79 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Integrative epigenomic and genomic analysis of malignant pheochromocytoma
Sandgren, J., Andersson, Robin, Rada-Iglesias, A., Enroth, S., Akerstrom, G., Dumanski, J. P., Komorowski, J., Westin, G. & Wadelius, C., 31 jul. 2010, I: Experimental & Molecular Medicine. 42, 7, s. 484-502 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Frequent genetic differences between matched primary and metastatic breast cancer provide an approach to identification of biomarkers for disease progression
Popławski, A. B., Jankowski, M., Erickson, S. W., Díaz de Ståhl, T., Partridge, E. C., Crasto, C., Guo, J., Gibson, J., Menzel, U., Bruder, C. E., Kaczmarczyk, A., Benetkiewicz, M., Andersson, R., Sandgren, J., Zegarska, B., Bała, D., Srutek, E., Allison, D. B., Piotrowski, A., Zegarski, W. & 1 flere, , maj 2010, I: European Journal of Human Genetics. 18, 5, s. 560-8 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
SICTIN: Rapid footprinting of massively parallel sequencing data
Enroth, S., Andersson, Robin, Wadelius, C. & Komorowski, J., 2010, I: BioData Mining. 3, 1, s. 4Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
Characterization of novel and complex genomic aberrations in glioblastoma using a 32K BAC array
Nord, H., Hartmann, C., Andersson, Robin, Menzel, U., Pfeifer, S., Piotrowski, A., Bogdan, A., Kloc, W., Sandgren, J., Olofsson, T., Hesselager, G., Blomquist, E., Komorowski, J., von Deimling, A., Bruder, C. E. G., Dumanski, J. P. & Díaz de Ståhl, T., dec. 2009, I: Neuro-Oncology. 11, 6, s. 803-18 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genome-wide high-resolution analysis of DNA copy number alterations in NF1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors using 32K BAC array
Mantripragada, K. K., Díaz de Ståhl, T., Patridge, C., Menzel, U., Andersson, Robin, Chuzhanova, N., Kluwe, L., Guha, A., Mautner, V., Dumanski, J. P. & Upadhyaya, M., okt. 2009, I: Genes, Chromosomes & Cancer. 48, 10, s. 897-907 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Nucleosomes are well positioned in exons and carry characteristic histone modifications
Andersson, Robin, Enroth, S., Rada-Iglesias, A., Wadelius, C. & Komorowski, J., okt. 2009, I: Genome Research. 19, 10, s. 1732-41 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Using multi-data hidden Markov models trained on local neighborhoods of protein structure to predict residue-residue contacts
Björkholm, P., Daniluk, P., Kryshtafovych, A., Fidelis, K., Andersson, Robin & Hvidsten, T. R., 15 maj 2009, I: Bioinformatics (Online). 25, 10, s. 1264-70 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Histone H3 lysine 27 trimethylation in adult differentiated colon associated to cancer DNA hypermethylation
Rada-Iglesias, A., Enroth, S., Andersson, Robin, Wanders, A., Påhlman, L., Komorowski, J. & Wadelius, C., 16 feb. 2009, I: Epigenetics : official journal of the DNA Methylation Society. 4, 2, s. 107-13 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
Somatic mosaicism for copy number variation in differentiated human tissues
Piotrowski, A., Bruder, C. E. G., Andersson, Robin, Diaz de Ståhl, T., Menzel, U., Sandgren, J., Poplawski, A., von Tell, D., Crasto, C., Bogdan, A., Bartoszewski, R., Bebok, Z., Krzyzanowski, M., Jankowski, Z., Partridge, E. C., Komorowski, J. & Dumanski, J. P., sep. 2008, I: Human Mutation. 29, 9, s. 1118-24 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A segmental maximum a posteriori approach to genome-wide copy number profiling
Andersson, Robin, Bruder, C. E. G., Piotrowski, A., Menzel, U., Nord, H., Sandgren, J., Hvidsten, T. R., Diaz de Ståhl, T., Dumanski, J. P. & Komorowski, J., 15 mar. 2008, I: Bioinformatics (Online). 24, 6, s. 751-8 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Phenotypically concordant and discordant monozygotic twins display different DNA copy-number-variation profiles
Bruder, C. E. G., Piotrowski, A., Gijsbers, A. A. C. J., Andersson, R., Erickson, S., Diaz de Ståhl, T., Menzel, U., Sandgren, J., von Tell, D., Poplawski, A., Crowley, M., Crasto, C., Partridge, E. C., Tiwari, H., Allison, D. B., Komorowski, J., van Ommen, G-J. B., Boomsma, D. I., Pedersen, N. L., den Dunnen, J. T. & 2 flere, , mar. 2008, I: American Journal of Human Genetics. 82, 3, s. 763-71 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Profiling of copy number variations (CNVs) in healthy individuals from three ethnic groups using a human genome 32 K BAC-clone-based array
Díaz de Ståhl, T., Sandgren, J., Piotrowski, A., Nord, H., Andersson, Robin, Menzel, U., Bogdan, A., Thuresson, A., Poplawski, A., von Tell, D., Hansson, C. M., Elshafie, A. I., Elghazali, G., Imreh, S., Nordenskjöld, M., Upadhyaya, M., Komorowski, J., Bruder, C. E. G. & Dumanski, J. P., mar. 2008, I: Human Mutation. 29, 3, s. 398-408 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2007
A previously unrecognized microdeletion syndrome on chromosome 22 band q11.2 encompassing the BCR gene
Mikhail, F. M., Descartes, M., Piotrowski, A., Andersson, Robin, Diaz de Ståhl, T., Komorowski, J., Bruder, C. E. G., Dumanski, J. P. & Carroll, A. J., 15 sep. 2007, I: American Journal of Medical Genetics. Part A. 143A, 18, s. 2178-84 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Overlapping phenotype of Wolf-Hirschhorn and Beckwith-Wiedemann syndromes in a girl with der(4)t(4;11)(pter;pter)
Mikhail, F. M., Sathienkijkanchai, A., Robin, N. H., Prucka, S., Biggerstaff, J. S., Komorowski, J., Andersson, Robin, Bruder, C. E. G., Piotrowski, A., Diaz de Ståhl, T., Dumanski, J. P. & Carroll, A. J., 1 aug. 2007, I: American Journal of Medical Genetics. Part A. 143A, 15, s. 1760-6 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2005
RoSy: A Rough Knowledge Base System
Andersson, Robin, Vitória, A., Małuszyński, J. & Komorowski, J., 2005, Rough Sets, Fuzzy Sets, Data Mining, and Granular Computing. Slezak, D., Yao, J., Peters, J. F., Ziarko, W. & Hu, X. (red.). Springer, s. 48-58 11 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 3642 LNAI).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
ID: 32384007
Flest downloads
-
1910
downloads
Identification of TNF-α-responsive promoters and enhancers in the intestinal epithelial cell model Caco-2
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1381
downloads
Cancer associated epigenetic transitions identified by genome-wide histone methylation binding profiles in human colorectal cancer samples and paired normal mucosa
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1067
downloads
A strand specific high resolution normalization method for chip-sequencing data employing multiple experimental control measurements.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet