Matthias Mann

Matthias Mann

Professor, forskningschef, Professor


  1. 2022
  2. Analysis of RANK-c interaction partners identifies TRAF3 as a critical regulator of breast cancer aggressiveness

    Sirinian, C., Papanastasiou, A. D., Karayel, O., Degn, S. E., Peroukidis, S., Chaniotis, D., Nonni, A., Repanti, M., Kriegsmann, M., Makatsoris, T., Koutras, A., Mann, Matthias & Kalofonos, H. P., nov. 2022, I: Neoplasia (New York, N.Y.). 33, s. 100836

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Temporal resolution of gene derepression and proteome changes upon PROTAC-mediated degradation of BCL11A protein in erythroid cells

    Mehta, S., Buyanbat, A., Kai, Y., Karayel, O., Goldman, S. R., Seruggia, D., Zhang, K., Fujiwara, Y., Donovan, K. A., Zhu, Q., Yang, H., Nabet, B., Gray, N. S., Mann, Matthias, Fischer, E. S., Adelman, K. & Orkin, S. H., 18 aug. 2022, I: Cell Chemical Biology. 29, 8, s. 1273-1287.e8

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Gene-selective transcription promotes the inhibition of tissue reparative macrophages by TNF

    Dichtl, S., Sanin, D. E., Koss, C. K., Willenborg, S., Petzold, A., Tanzer, M. C., Dahl, A., Kabat, A. M., Lindenthal, L., Zeitler, L., Satzinger, S., Strasser, A., Mann, Matthias, Roers, A., Eming, S. A., El Kasmi, K. C., Pearce, E. J. & Murray, P. J., apr. 2022, I: Life Science Alliance. 5, 4

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Adverse stem cell clones within a single patient's tumor predict clinical outcome in AML patients

    Zeller, C., Richter, D., Jurinovic, V., Valtierra-Gutiérrez, I. A., Jayavelu, A. K., Mann, Matthias, Bagnoli, J. W., Hellmann, I., Herold, T., Enard, W., Vick, B. & Jeremias, I., 12 mar. 2022, I: Journal of Hematology & Oncology. 15, 1, s. 25

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Amyloid-like aggregating proteins cause lysosomal defects in neurons via gain-of-function toxicity

    Riera-Tur, I., Schäfer, T., Hornburg, D., Mishra, A., da Silva Padilha, M., Fernández-Mosquera, L., Feigenbutz, D., Auer, P., Mann, Matthias, Baumeister, W., Klein, R., Meissner, F., Raimundo, N., Fernández-Busnadiego, R. & Dudanova, I., mar. 2022, I: Life Science Alliance. 5, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Phosphorylation of serine-893 in CARD11 suppresses the formation and activity of the CARD11-BCL10-MALT1 complex in T and B cells

    Kutzner, K., Woods, S., Karayel, O., Gehring, T., Yin, H., Flatley, A., Graß, C., Wimberger, N., Tofaute, M. J., Seeholzer, T., Feederle, R., Mann, Matthias & Krappmann, D., mar. 2022, I: Science Signaling. 15, 723, s. eabk3083

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. YBX1 mediates translation of oncogenic transcripts to control cell competition in AML

    Perner, F., Schnoeder, T. M., Xiong, Y., Jayavelu, A. K., Mashamba, N., Santamaria, N. T., Huber, N., Todorova, K., Hatton, C., Perner, B., Eifert, T., Murphy, C., Hartmann, M., Hoell, J. I., Schröder, N., Brandt, S., Hochhaus, A., Mertens, P. R., Mann, M., Armstrong, S. A. & 2 flere, Mandinova, A. & Heidel, F. H., feb. 2022, I: Leukemia. 36, 2, s. 426-437 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. A20 and ABIN-1 cooperate in balancing CBM complex-triggered NF-κB signaling in activated T cells

    Yin, H., Karayel, O., Chao, Y., Seeholzer, T., Hamp, I., Plettenburg, O., Gehring, T., Zielinski, C., Mann, Matthias & Krappmann, D., 31 jan. 2022, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 79, 2, s. 112

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    A knowledge graph to interpret clinical proteomics data

    Santos, A., Colaço, A. R., Nielsen, A. B., Niu, Lili, Strauss, Maximilian, Geyer, P. E., Coscia, F., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Mundt, F., Jensen, Lars Juhl & Mann, Matthias, 2022, I: Nature Biotechnology. 40, s. 692–702

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    AlphaMap: an open-source Python package for the visual annotation of proteomics data with sequence-specific knowledge

    Voytik, E., Bludau, I., Willems, S., Hansen, F. M., Brunner, A., Strauss, Maximilian & Mann, Matthias, 2022, I: Bioinformatics. 38, 3, s. 849-852

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    AlphaPeptDeep: a modular deep learning framework to predict peptide properties for proteomics

    Zeng, W. F., Zhou, X. X., Willems, S., Ammar, C., Wahle, M., Bludau, I., Voytik, E., Strauss, Maximilian & Mann, Matthias, 2022, I: Nature Communications. 13, 14 s., 7238.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Association of Complement and MAPK Activation With SARS-CoV-2-Associated Myocardial Inflammation

    Weckbach, L. T., Schweizer, L., Kraechan, A., Bieber, S., Ishikawa-Ankerhold, H., Hausleiter, J., Massberg, S., Straub, T., Klingel, K., Grabmaier, U., Zwiebel, M., Mann, Matthias & Schulz, C., 2022, I: JAMA Cardiology. 7, 3, s. 286-297 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Cotranslational N-degron masking by acetylation promotes proteome stability in plants

    Linster, E., Forero Ruiz, F. L., Miklankova, P., Ruppert, T., Mueller, J., Armbruster, L., Gong, X., Serino, G., Mann, Matthias, Hell, R. & Wirtz, M., 2022, I: Nature Communications. 13, 1, s. 810

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Cryo-EM structures of Gid12-bound GID E3 reveal steric blockade as a mechanism inhibiting substrate ubiquitylation

    Qiao, S., Lee, C., Sherpa, D., Chrustowicz, J., Cheng, J., Duennebacke, M., Steigenberger, B., Karayel, O., Vu, D. T., von Gronau, S., Mann, Matthias, Wilfling, F. & Schulman, B. A., 2022, I: Nature Communications. 13, 3041.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    D13 Saliva biomarker discovery in Huntington’s disease

    Qvist, Filippa Liliendahl, Hellem, M. N., Nielsen, Jørgen Erik, Mann, Matthias & Skotte, Niels Henning, 2022, I: Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry. 93, Suppl. 1, s. A24-A25

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity

    Mund, A., Coscia, F., Kriston, A., Hollandi, R., Kovács, F., Brunner, A-D., Migh, E., Schweizer, L., Santos, A., Bzorek, M., Naimy, S., Rahbek-Gjerdrum, L. M., Dyring-Andersen, B., Bulkescher, J., Lukas, C., Eckert, M. A., Lengyel, E., Gnann, C., Lundberg, E., Horvath, P. & 1 flere, Mann, Matthias, 2022, I: Nature Biotechnology. 40, s. 1231-1240

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Dynamic human liver proteome atlas reveals functional insights into disease pathways

    Niu, Lili, Geyer, P. E., Gupta, R., Santos, A., Meier, F., Doll, S., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Klein, S., Ortiz, C., Uschner, F. E., Schierwagen, R., Trebicka, J. & Mann, Matthias, 2022, I: Molecular Systems Biology. 18, 5, 24 s., e10947.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Gel-like inclusions of C-terminal fragments of TDP-43 sequester stalled proteasomes in neurons

    Riemenschneider, H., Guo, Q., Bader, J., Frottin, F., Farny, D., Kleinberger, G., Haass, C., Mann, Matthias, Hartl, F. U., Baumeister, W., Hipp, M. S., Meissner, F., Fernández-Busnadiego, R. & Edbauer, D., 2022, I: EMBO Reports. 23, 6, e53890.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    HYPK promotes the activity of the Nα-acetyltransferase A complex to determine proteostasis of nonAc-X2/N-degron-containing proteins

    Miklánková, P., Linster, E., Boyer, J., Weidenhausen, J., Mueller, J., Armbruster, L., Lapouge, K., De La Torre, C., Bienvenut, W., Sticht, C., Mann, Matthias, Meinnel, T., Sinning, I., Giglione, C., Hell, R. & Wirtz, M., 2022, I: Science Advances. 8, 24, 14 s., eabn6153.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. IKKβ primes inflammasome formation by recruiting NLRP3 to the trans-Golgi network

    Schmacke, N. A., O'Duill, F., Gaidt, M. M., Szymanska, I., Kamper, J. M., Schmid-Burgk, J. L., Mädler, S. C., Mackens-Kiani, T., Kozaki, T., Chauhan, D., Nagl, D., Stafford, C. A., Harz, H., Fröhlich, A. L., Pinci, F., Ginhoux, F., Beckmann, R., Mann, Matthias, Leonhardt, H. & Hornung, V., 2022, I: Immunity. 55, 12, s. 2271-2284.e7

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Identification of early neurodegenerative pathways in progressive multiple sclerosis

    Kaufmann, M., Schaupp, A. L., Sun, R., Coscia, F., Dendrou, C. A., Cortes, A., Kaur, G., Evans, H. G., Mollbrink, A., Navarro, J. F., Sonner, J. K., Mayer, C., DeLuca, G. C., Lundeberg, J., Matthews, P. M., Attfield, K. E., Friese, M. A., Mann, Matthias & Fugger, Lars, 2022, I: Nature Neuroscience. 25, s. 944-955

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. In vivo PDX CRISPR/Cas9 screens reveal mutual therapeutic targets to overcome heterogeneous acquired chemo-resistance

    Wirth, A-K., Wange, L., Vosberg, S., Henrich, K-O., Rausch, C., Özdemir, E., Zeller, C. M., Richter, D., Feuchtinger, T., Kaller, M., Hermeking, H., Greif, P. A., Senft, D., Jurinovic, V., Bahrami, E., Jayavelu, A. K., Westermann, F., Mann, M., Enard, W., Herold, T. & 1 flere, Jeremias, I., 2022, I: Leukemia. 36, s. 2863-2874 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Mast cells in lung damage of COVID-19 autopsies: A descriptive study

    Schaller, T., Märkl, B., Claus, R., Sholl, L., Hornick, J. L., Giannetti, M. P., Schweizer, L., Mann, Matthias & Castells, M., 2022, I: Allergy. 77, 7, s. 2237-2239 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  25. Udgivet

    Noninvasive proteomic biomarkers for alcohol-related liver disease

    Niu, Lili, Thiele, M., Geyer, P. E., Rasmussen, D. N., Webel, Henry, Santos, A., Gupta, R., Meier, F., Strauss, Maximilian, Kjaergaard, M., Lindvig, K., Jacobsen, S., Rasmussen, Simon, Hansen, Torben, Krag, A. & Mann, Matthias, 2022, I: Nature Medicine. 28, 6, s. 1277-1287 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    OpenCell: Endogenous tagging for the cartography of human cellular organization

    Cho, N. H., Cheveralls, K. C., Brunner, A. D., Kim, K., Michaelis, A. C., Raghavan, P., Kobayashi, H., Savy, L., Li, J. Y., Canaj, H., Kim, J. Y. S., Stewart, E. M., Gnann, C., McCarthy, F., Cabrera, J. P., Brunetti, R. M., Chhun, B. B., Dingle, G., Hein, M. Y., Huang, B. & 7 flere, Mehta, S. B., Weissman, J. S., Gómez-Sjöberg, R., Itzhak, D. N., Royer, L. A., Mann, Matthias & Leonetti, M. D., 2022, I: Science. 375, 6585, eabi6983.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Organ-specific metabolic pathways distinguish prediabetes, type 2 diabetes, and normal tissues

    Diamanti, K., Cavalli, M., Pereira, M. J., Pan, G., Castillejo-López, C., Kumar, C., Mundt Madsen, Filip Oskar, Komorowski, J., Deshmukh, Atul Shahaji, Mann, Matthias, Korsgren, O., Eriksson, J. W. & Wadelius, C., 2022, I: Cell Reports Medicine. 3, 10, 21 s., 100763.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. PLCG1 is required for AML1-ETO leukemia stem cell self-renewal

    Schnoeder, T. M., Schwarzer, A., Jayavelu, A. K., Hsu, C-J., Kirkpatrick, J., Döhner, K., Perner, F., Eifert, T., Huber, N., Arreba-Tutusaus, P., Dolnik, A., Assi, S. A., Nafria, M., Jiang, L., Dai, Y-T., Chen, Z., Chen, S-J., Kellaway, S. G., Ptasinska, A., Ng, E. S. & 17 flere, Stanley, E. G., Elefanty, A. G., Buschbeck, M., Bierhoff, H., Brodt, S., Matziolis, G., Fischer, K., Hochhaus, A., Chen, C., Heidenreich, O., Mann, Matthias, Lane, S. W., Bullinger, L., Ori, A., von Eyss, B., Bonifer, C. & Heidel, F. H., 2022, I: Blood. 139, 7, s. 1080-1097 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Phosphorylation of muramyl peptides by NAGK is required for NOD2 activation

    Stafford, C. A., Gassauer, A. M., de Oliveira Mann, C. C., Tanzer, M. C., Fessler, E., Wefers, B., Nagl, D., Kuut, G., Sulek, K., Vasilopoulou, C., Schwojer, S. J., Wiest, A., Pfautsch, M. K., Wurst, W., Yabal, M., Fröhlich, T., Mann, Matthias, Gisch, N., Jae, L. T. & Hornung, V., 2022, I: Nature. 609, s. 590-596 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Proteome profiling of cerebrospinal fluid reveals biomarker candidates for Parkinson's disease

    Karayel, O., Virreira Winter, S., Padmanabhan, S., Kuras, Y. I., Vu, D. T., Tuncali, I., Merchant, K., Wills, A. M., Scherzer, C. R. & Mann, Matthias, 2022, I: Cell Reports Medicine. 3, 6, 20 s., 100661.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Rapid and In-Depth Coverage of the (Phospho-)Proteome With Deep Libraries and Optimal Window Design for dia-PASEF

    Skowronek, P., Thielert, Marvin Christoffer, Voytik, E., Tanzer, M. C., Hansen, F. M., Willems, S., Karayel, O., Brunner, A., Meier, F. & Mann, Matthias, 2022, I: Molecular and Cellular Proteomics. 21, 9, 15 s., 100279.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Spatial characterization of single tumor cells by proteomics

    Mund, Andreas & Mann, Matthias, 2022, I: Nature Biotechnology. 40, 8, s. 1186-1187 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  33. Udgivet

    Spatial proteomics in three-dimensional intact specimens

    Bhatia, H. S., Brunner, A-D., Öztürk, F., Kapoor, S., Rong, Z., Mai, H., Thielert, M., Ali, M., Al-Maskari, R., Paetzold, J. C., Kofler, F., Todorov, M. I., Molbay, M., Kolabas, Z. I., Negwer, M., Hoeher, L., Steinke, H., Dima, A., Gupta, B., Kaltenecker, D. & 11 flere, Caliskan, Ö. S., Brandt, D., Krahmer, N., Müller, S., Lichtenthaler, S. F., Hellal, F., Bechmann, I., Menze, B., Theis, F., Mann, Matthias & Ertürk, A., 2022, I: Cell. 185, 26, s. 5040-5058.e19

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    The emerging role of mass spectrometry-based proteomics in drug discovery

    Meissner, F., Geddes-McAlister, J., Mann, Matthias & Bantscheff, M., 2022, I: Nature Reviews Drug Discovery. 21, s. 637-654 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    The structural context of posttranslational modifications at a proteome-wide scale

    Bludau, I., Willems, S., Zeng, W. F., Strauss, Maximilian, Hansen, F. M., Tanzer, M. C., Karayel, O., Schulman, B. A. & Mann, Matthias, 2022, I: PLOS Biology. 20, 5, 23 s., e3001636.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Towards Precision Dermatology: Emerging Role of Proteomic Analysis of the Skin

    Fredman, G., Skov, Lone, Mann, Matthias & Dyring-Andersen, Beatrice, 2022, I: Dermatology. 238, s. 185–194

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation

    Brunner, A., Thielert, Marvin Christoffer, Vasilopoulou, C., Ammar, C., Coscia, F., Mund, Andreas, Hoerning, O. B., Bache, N., Apalategui, A., Lubeck, M., Richter, S., Fischer, D. S., Raether, O., Park, M. A., Meier, F., Theis, F. J. & Mann, Matthias, 2022, I: Molecular Systems Biology. 18, 3, 15 s., e10798.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Unbiased spatial proteomics with single-cell resolution in tissues

    Mund, Andreas, Brunner, A. & Mann, Matthias, 2022, I: Molecular Cell. 82, 12, s. 2335-2349 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

ID: 5650809