Matthias Mann
Professor, forskningschef, Professor
- 1994
- Udgivet
Error-tolerant identification of peptides in sequence databases by peptide sequence tags
Mann, Matthias & Wilm, M., 15 dec. 1994, I: Analytical Chemistry. 66, 24, s. 4390-9 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 1996
- Udgivet
Femtomole sequencing of proteins from polyacrylamide gels by nano-electrospray mass spectrometry
Wilm, M., Shevchenko, A., Houthaeve, T., Breit, S., Schweigerer, L., Fotsis, T. & Mann, Matthias, 1 feb. 1996, I: Nature. 379, 6564, s. 466-9 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 1997
Identification of a novel membrane protein that interacts specifically with the upar-prourokinase complex
Behrendt, Niels, Engelholm, Lars Henning, Jensen, O. N., Mörtz, E., Ranne, E., Mann, Matthias & Dan, K., 1997, I: Fibrinolysis and Proteolysis. 11, Supl. 3, s. 10 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning
- 2000
A urokinase receptor-associated protein with specific collagen binding properties
Behrendt, Niels, Jensen, O. N., Engelholm, Lars Henning, Mørtz, E., Mann, Matthias & Danø, K., 2000, I: The Journal of Biological Chemistry. 275, 3, s. 1993-2002 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2003
Integrated analysis of protein composition, tissue diversity, and gene regulation in mouse mitochondria
Mootha, V. K., Bunkenborg, J., Olsen, Jesper Velgaard, Hjerrild, M., Wisniewski, J. R., Stahl, E., Bolouri, M. S., Ray, H. N., Sihag, S., Kamal, M., Patterson, N., Lander, E. S. & Mann, Matthias, 2003, I: Cell. 115, 5, s. 629-40 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Signaling initiated by overexpression of the fibroblast growth factor receptor-1 investigated by mass spectrometry
Hinsby, A. M., Olsen, Jesper Velgaard, Bennett, K. L. & Mann, Matthias, 2003, I: Molecular and Cellular Proteomics. 2, 1, s. 29-36 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2004
Improved peptide identification in proteomics by two consecutive stages of mass spectrometric fragmentation
Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2004, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 101, 37, s. 13417-22 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Trypsin cleaves exclusively C-terminal to arginine and lysine residues
Olsen, Jesper Velgaard, Ong, S. & Mann, Matthias, 2004, I: Molecular and Cellular Proteomics. 3, 6, s. 608-14 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Tyrosine phosphoproteomics of fibroblast growth factor signaling: a role for insulin receptor substrate-4
Hinsby, A. M., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2004, I: Journal of Biological Chemistry. 279, 45, s. 46438-47 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
HysTag--a novel proteomic quantification tool applied to differential display analysis of membrane proteins from distinct areas of mouse brain
Olsen, Jesper Velgaard, Andersen, J. R., Nielsen, P. A., Nielsen, Michael Lund, Figeys, D., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., jan. 2004, I: Molecular and Cellular Proteomics. 3, 1, s. 82-92 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2005
Parts per million mass accuracy on an Orbitrap mass spectrometer via lock mass injection into a C-trap
Olsen, Jesper Velgaard, de Godoy, L. M. F., Li, G., Macek, B., Mortensen, P., Pesch, R., Makarov, A., Lange, O., Horning, S. & Mann, Matthias, 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 12, s. 2010-21 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Proteomic mapping of brain plasma membrane proteins
Nielsen, P. A., Olsen, Jesper Velgaard, Podtelejnikov, A. V., Andersen, J. R., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 4, s. 402-8 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Quantitative phosphoproteomics applied to the yeast pheromone signaling pathway
Gruhler, A., Olsen, Jesper Velgaard, Mohammed, S., Mortensen, P., Faergeman, N. J., Mann, Matthias & Jensen, O. N., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 3, s. 310-27 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2006
Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks
Olsen, Jesper Velgaard, Blagoev, B., Gnad, F., Macek, B., Kumar, C., Mortensen, P. & Mann, Matthias, 2006, I: Cell. 127, 3, s. 635-48 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
In-gel digestion for mass spectrometric characterization of proteins and proteomes
Shevchenko, A., Tomas, H., Havlis, J., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Nature Protocols (Print Edition). 1, 6, s. 2856-60 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Status of complete proteome analysis by mass spectrometry: SILAC labeled yeast as a model system
de Godoy, L. M. F., Olsen, Jesper Velgaard, de Souza, G. A., Li, G., Mortensen, P. & Mann, Matthias, 2006, I: Genome Biology. 7, 6, s. R50Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The human urinary proteome contains more than 1500 proteins, including a large proportion of membrane proteins
Adachi, J., Kumar, C., Zhang, Y., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Genome Biology. 7, 9, s. R80Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Top-down protein sequencing and MS3 on a hybrid linear quadrupole ion trap-orbitrap mass spectrometer
Macek, B., Waanders, L. F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Molecular and Cellular Proteomics. 5, 5, s. 949-58 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Actin homolog MreB and RNA polymerase interact and are both required for chromosome segregation in Escherichia coli
Kruse, Thomas, Blagoev, B., Løbner-Olesen, Anders, Wachi, M., Sasaki, K., Iwai, N., Mann, Matthias & Gerdes, K., 1 jan. 2006, I: Genes & Development. 20, 1, s. 113-124 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2007
A mass spectrometry-friendly database for cSNP identification
Schandorff, S., Olsen, Jesper Velgaard, Bunkenborg, J., Blagoev, B., Zhang, Y., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, 2007, I: Nature Methods. 4, 6, s. 465-6 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Functional characterization of Rad18 domains for Rad6, ubiquitin, DNA binding and PCNA modification
Notenboom, V., Hibbert, R. G., van Rossum-Fikkert, S. E., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, Matthias & Sixma, T. K., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, 17, s. 5819-30 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Higher-energy C-trap dissociation for peptide modification analysis
Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Lange, O., Makarov, A., Horning, S. & Mann, Matthias, 2007, I: Nature Methods. 4, 9, s. 709-12 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Noncovalent interaction between Ubc9 and SUMO promotes SUMO chain formation
Knipscheer, P., van Dijk, W. J., Olsen, Jesper Velgaard, Mann, Matthias & Sixma, T. K., 2007, I: EMBO Journal. 26, 11, s. 2797-807 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
PHOSIDA (phosphorylation site database): management, structural and evolutionary investigation, and prediction of phosphosites
Gnad, F., Ren, S., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Oroshi, M. & Mann, Matthias, 2007, I: Genome Biology. 8, 11, s. R250Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Phosphoproteins of the chicken eggshell calcified layer
Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, 2007, I: Proteomics. 7, 1, s. 106-15 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Phosphoproteome analysis of E. coli reveals evolutionary conservation of bacterial Ser/Thr/Tyr phosphorylation
Macek, B., Gnad, F., Soufi, B., Kumar, C., Olsen, Jesper Velgaard, Mijakovic, I. & Mann, Matthias, 2007, I: Molecular and Cellular Proteomics. 7, 2, s. 299-307 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Quantitative proteomic assessment of very early cellular signaling events
Dengjel, J., Akimov, V., Olsen, Jesper Velgaard, Bunkenborg, J., Mann, Matthias, Blagoev, B. & Andersen, J. S., 2007, I: Nature Biotechnology. 25, 5, s. 566-8 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Quantitative proteomic profiling of membrane proteins from the mouse brain cortex, hippocampus, and cerebellum using the HysTag reagent: mapping of neurotransmitter receptors and ion channels
Olsen, Jesper Velgaard, Nielsen, P. A., Andersen, J. R., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., 2007, I: Brain Research. 1134, 1, s. 95-106 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The low molecular weight proteome of Halobacterium salinarum
Klein, C., Aivaliotis, M., Olsen, Jesper Velgaard, Falb, M., Besir, H., Scheffer, B., Bisle, B., Tebbe, A., Konstantinidis, K., Siedler, F., Pfeiffer, F., Mann, Matthias & Oesterhelt, D., 2007, I: Journal of Proteome Research. 6, 4, s. 1510-8 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
MAPU: Max-Planck Unified database of organellar, cellular, tissue and body fluid proteomes
Zhang, Y., Zhang, Y., Adachi, J., Olsen, Jesper Velgaard, Shi, R., de Souza, G., Pasini, E., Foster, L. J., Macek, B., Zougman, A., Kumar, C., Wisniewski, J. R., Jun, W. & Mann, Matthias, jan. 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, Database issue, s. D771-9Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Nanoelectrospray peptide mapping revisited: Composite survey spectra allow high dynamic range protein characterization without LCMS on an orbitrap mass spectrometer
Lu, A., Waanders, L. F., Almeida, R., Li, G., Allen, M., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Bonaldi, T. & Mann, Matthias, 1 dec. 2007, I: International Journal of Mass Spectrometry. 268, 2-3, s. 158-167 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
Quantitative phosphoproteome analysis of a mouse liver cell line reveals specificity of phosphatase inhibitors
Pan, C., Gnad, F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2008, I: Proteomics. 8, 21, s. 4534-46 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The serine/threonine/tyrosine phosphoproteome of the model bacterium Bacillus subtilis
Macek, B., Mijakovic, I., Olsen, Jesper Velgaard, Gnad, F., Kumar, C., Jensen, P. R. & Mann, Matthias, feb. 2008, I: Molecular and Cellular Proteomics. 6, 4, s. 697-707 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Identification of new chicken egg proteins by mass spectrometry-based proteomic analysis
Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, MaĉEk, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, jun. 2008, I: World's Poultry Science Journal. 64, 2, s. 209-218 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
A dual pressure linear ion trap orbitrap instrument with very high sequencing speed
Olsen, Jesper Velgaard, Schwartz, J. C., Griep-Raming, J., Nielsen, Michael Lund, Damoc, E., Denisov, E., Lange, O., Remes, P., Taylor, D., Splendore, M., Wouters, E. R., Senko, M., Makarov, A., Mann, Matthias & Horning, S., 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2759-69 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Global and site-specific quantitative phosphoproteomics: principles and applications
Macek, B., Mann, Matthias & Olsen, J. V., 2009, I: Annual Review of Pharmacology and Toxicology. 49, s. 199-221 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Global effects of kinase inhibitors on signaling networks revealed by quantitative phosphoproteomics
Pan, C., Olsen, Jesper Velgaard, Daub, H. & Mann, Matthias, 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2796-808 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High-accuracy identification and bioinformatic analysis of in vivo protein phosphorylation sites in yeast
Gnad, F., de Godoy, L. M. F., Cox, J., Neuhauser, N., Ren, S., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Proteomics. 9, 20, s. 4642-4652 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions
Choudhary, Chunaram, Kumar, C., Gnad, F., Nielsen, Michael Lund, Rehman, M., Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Science. 325, 5942, s. 834-40 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mislocalized activation of oncogenic RTKs switches downstream signaling outcomes
Choudhary, Chunaram, Olsen, Jesper Velgaard, Brandts, C., Cox, J., Reddy, P. N. G., Böhmer, F. D., Gerke, V., Schmidt-Arras, D., Berdel, W. E., Müller-Tidow, C., Mann, Matthias & Serve, H., 2009, I: Molecular Cell. 36, 2, s. 326-39 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
- Udgivet
Quantitative phosphoproteomics reveals widespread full phosphorylation site occupancy during mitosis
Olsen, Jesper Velgaard, Vermeulen, M., Santamaria, A., Kumar, C., Miller, M. L., Jensen, Lars Juhl, Gnad, F., Cox, J., Jensen, T. S., Nigg, E. A., Brunak, Søren & Mann, Matthias, 2010, I: Science Signaling. 3, 104, s. ra3 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
MSQuant, an Open Source Platform for Mass Spectrometry-Based Quantitative Proteomics
Mortensen, P., Gouw, J. W., Olsen, Jesper Velgaard, Ong, S., Rigbolt, K. T. G., Bunkenborg, J., Cox, J., Foster, L. J., Heck, A. J. R., Blagoev, B., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, jan. 2010, I: Journal of Proteome Research.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Yeast expression proteomics by high-resolution mass spectrometry
Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 jan. 2010, I: Methods in Enzymology. 470, s. 259-80 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Decoding signalling networks by mass spectrometry-based proteomics
Choudhary, Chunaram & Mann, Matthias, 1 jun. 2010, I: Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 11, 6, s. 427-39 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
System-wide temporal characterization of the proteome and phosphoproteome of human embryonic stem cell differentiation
Rigbolt, K. T. G., Prokhorova, T., Akimov, V., Løkkegaard, Jeanette, Johansen, P. T., Kratchmarova, I., Kassem, M. S. E., Mann, Matthias, Olsen, Jesper Velgaard & Blagoev, B., 2011, I: Science Signaling. 4, 164, s. rs3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effective representation and storage of mass spectrometry-based proteomic data sets for the scientific community
Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 jan. 2011, I: Science Signaling. 4, 160, s. pe7Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Andromeda - a peptide search engine integrated into the MaxQuant environment
Cox, J., Neuhauser, N., Michalski, A., Scheltema, R. A., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 1 apr. 2011, I: Journal of Proteome Research. 10, 4, s. 1794-805 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantitative, high-resolution proteomics for data-driven systems biology
Cox, J. & Mann, Matthias, 7 jul. 2011, I: Annual Review of Biochemistry. 80, s. 273-299 27 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Proteome-wide, Quantitative Survey of In Vivo Ubiquitylation Sites Reveals Widespread Regulatory Roles
Wagner, S. A., Beli, P., Weinert, B. T., Nielsen, Michael Lund, Cox, J., Mann, Matthias & Choudhary, Chunaram, 1 okt. 2011, I: Molecular and Cellular Proteomics. 10, 10, s. M111.013284Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
1D and 2D annotation enrichment: a statistical method integrating quantitative proteomics with complementary high-throughput data
Cox, J. & Mann, Matthias, 2012, I: B M C Bioinformatics. 13 Suppl 16, s. S12Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 5650809
Flest downloads
-
2000
downloads
Activation of the ATR kinase by the RPA-binding protein ETAA1
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
515
downloads
Region and cell-type resolved quantitative proteomic map of the human heart
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
498
downloads
Revisiting biomarker discovery by plasma proteomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet