Matthias Mann
Professor, forskningschef, Professor
Linkage-specific ubiquitin chain formation depends on a lysine hydrocarbon ruler
Liwocha, J., Krist, D. T., van der Heden van Noort, G. J., Hansen, F. M., Truong, V. H., Karayel, O., Purser, N., Houston, D., Burton, N., Bostock, M. J., Sattler, M., Mann, Matthias, Harrison, J. S., Kleiger, G., Ovaa, H. & Schulman, B. A., mar. 2021, I: Nature Chemical Biology. 17, 3, s. 272-279 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Democratizing knowledge representation with BioCypher
Lobentanzer, S., Aloy, P., Baumbach, J., Bohar, B., Carey, V. J., Charoentong, P., Danhauser, K., Doğan, T., Dreo, J., Dunham, I., Farr, E., Fernandez-Torras, A., Gyori, B. M., Hartung, M., Hoyt, C. T., Klein, C., Korcsmaros, T., Maier, A., Mann, M., Ochoa, D. & 12 flere, , 2023, I: Nature Biotechnology. 41, s. 1056-1059Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Nanoelectrospray peptide mapping revisited: Composite survey spectra allow high dynamic range protein characterization without LCMS on an orbitrap mass spectrometer
Lu, A., Waanders, L. F., Almeida, R., Li, G., Allen, M., Cox, J., Olsen, Jesper Velgaard, Bonaldi, T. & Mann, Matthias, 1 dec. 2007, I: International Journal of Mass Spectrometry. 268, 2-3, s. 158-167 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Erratum: Evidence of extrapancreatic glucagon secretion in man. Diabetes 2016;65:585-597
Lund, Asger Bach, Bagger, J. I., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Christensen, M., Grøndahl, M., Hartmann, Bolette, Mathiesen, Elisabeth, Hansen, C. P., Storkholm, J. H., van Hall, Gerrit, Rehfeld, Jens Frederik, Hornburg, D., Meissner, F., Mann, Matthias, Larsen, S., Holst, Jens Juul, Vilsbøll, Tina & Knop, Filip Krag, 1 jun. 2016, I: Diabetes. 65, 6, s. 1752 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evidence of Extrapancreatic Glucagon Secretion in Man
Lund, Asger Bach, Bagger, J. I., Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Christensen, M., Grøndahl, M., Hartmann, Bolette, Mathiesen, Elisabeth, Hansen, C. P., Storkholm, J. H., van Hall, Gerrit, Rehfeld, Jens Frederik, Hornburg, D., Meissner, F., Mann, Matthias, Larsen, S., Holst, Jens Juul, Vilsbøll, Tina & Knop, Filip Krag, mar. 2016, I: Diabetes. 65, 3, s. 585-597 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
p53 down-regulates SARS coronavirus replication and is targeted by the SARS-unique domain and PLpro via E3 ubiquitin ligase RCHY1
Ma-Lauer, Y., Carbajo-Lozoya, J., Hein, M. Y., Müller, M. A., Deng, W., Lei, J., Meyer, B., Kusov, Y., von Brunn, B., Bairad, D. R., Hünten, S., Drosten, C., Hermeking, H., Leonhardt, H., Mann, Matthias, Hilgenfeld, R. & von Brunn, A., 30 aug. 2016, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113, 35, s. E5192-201Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Top-down protein sequencing and MS3 on a hybrid linear quadrupole ion trap-orbitrap mass spectrometer
Macek, B., Waanders, L. F., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2006, I: Molecular and Cellular Proteomics. 5, 5, s. 949-58 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Global and site-specific quantitative phosphoproteomics: principles and applications
Macek, B., Mann, Matthias & Olsen, J. V., 2009, I: Annual Review of Pharmacology and Toxicology. 49, s. 199-221 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The serine/threonine/tyrosine phosphoproteome of the model bacterium Bacillus subtilis
Macek, B., Mijakovic, I., Olsen, Jesper Velgaard, Gnad, F., Kumar, C., Jensen, P. R. & Mann, Matthias, feb. 2008, I: Molecular and Cellular Proteomics. 6, 4, s. 697-707 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Phosphoproteome analysis of E. coli reveals evolutionary conservation of bacterial Ser/Thr/Tyr phosphorylation
Macek, B., Gnad, F., Soufi, B., Kumar, C., Olsen, Jesper Velgaard, Mijakovic, I. & Mann, Matthias, 2007, I: Molecular and Cellular Proteomics. 7, 2, s. 299-307 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Identification of new chicken egg proteins by mass spectrometry-based proteomic analysis
Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, MaĉEk, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, jun. 2008, I: World's Poultry Science Journal. 64, 2, s. 209-218 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Phosphoproteins of the chicken eggshell calcified layer
Mann, K., Olsen, Jesper Velgaard, Macek, B., Gnad, F. & Mann, Matthias, 2007, I: Proteomics. 7, 1, s. 106-15 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The proteome of the calcified layer organic matrix of turkey (Meleagris gallopavo) eggshell
Mann, K. & Mann, Matthias, 2013, I: Proteome Science. 11, 1, s. 40Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
In-depth proteomic analyses of (greenlip abalone) nacre and prismatic organic shell matrix
Mann, K., Cerveau, N., Gummich, M., Fritz, M., Mann, Matthias & Jackson, D. J., 2018, I: Proteome Science. 16, s. 11Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Error-tolerant identification of peptides in sequence databases by peptide sequence tags
Mann, Matthias & Wilm, M., 15 dec. 1994, I: Analytical Chemistry. 66, 24, s. 4390-9 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomics for biomedicine: A half-completed journey
Mann, Matthias, 1 feb. 2012, I: EMBO Molecular Medicine. 4, 2, s. 75-77 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Coming Age of Complete, Accurate, and Ubiquitous Proteomes
Mann, Matthias, Kulak, N. A., Nagaraj, N. & Cox, J., 21 feb. 2013, I: Molecular Cell. 49, 4, s. 583-590 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The ever expanding scope of electrospray mass spectrometry-a 30 year journey
Mann, Matthias, 2019, I: Nature Communications. 10, 3744.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning
Artificial intelligence for proteomics and biomarker discovery
Mann, Matthias, Kumar, C., Zeng, W. & Strauss, M. T., 18 aug. 2021, I: Cell Systems. 12, 8, s. 759-770 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Origins of Organellar Mapping by Protein Correlation Profiling
Mann, Matthias, 2020, I: Proteomics. 20, 23, 4 s., e1900330.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plenary Lecture Proteomics technologies for signaling, clinical applications
Mann, Matthias, 2017, s. S62. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
Development, use, application of novel TIMS-Tof system
Mann, Matthias, 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S20 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning
Origins of mass spectrometry-based proteomics
Mann, Matthias, nov. 2016, I: Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 17, 11, s. 678Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ethical Principles, Constraints and Opportunities in Clinical Proteomics
Porsdam Mann, Sebastian, Treit, P. V., Geyer, P. E., Omenn, G. S. & Mann, Matthias, 2021, I: Molecular and Cellular Proteomics. 20, 14 s., 100046.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Inflammatory signaling in human tuberculosis granulomas is spatially organized
Marakalala, M. J., Raju, R. M., Sharma, K., Zhang, Y. J., Eugenin, E. A., Prideaux, B., Daudelin, I. B., Chen, P., Booty, M. G., Kim, J. H., Eum, S. Y., Via, L. E., Behar, S. M., Barry, C. E., Mann, Matthias, Dartois, V. & Rubin, E. J., maj 2016, I: Nature Medicine. 22, 5, s. 531-8 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Fibro-adipogenic progenitors of dystrophic mice are insensitive to NOTCH regulation of adipogenesis
Marinkovic, M., Fuoco, C., Sacco, F., Cerquone Perpetuini, A., Giuliani, G., Micarelli, E., Pavlidou, T., Petrilli, L. L., Reggio, A., Riccio, F., Spada, F., Vumbaca, S., Zuccotti, A., Castagnoli, L., Mann, Matthias, Gargioli, C. & Cesareni, G., jun. 2019, I: Life Science Alliance. 2, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A large synthetic peptide and phosphopeptide reference library for mass spectrometry-based proteomics
Marx, H., Lemeer, S., Schliep, J. E., Matheron, L., Mohammed, S., Cox, J., Mann, Matthias, Heck, A. J. R. & Kuster, B., jun. 2013, I: Nature Biotechnology. 31, 6, s. 557-64 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Integrative analysis of cell state changes in lung fibrosis with peripheral protein biomarkers
Mayr, C. H., Simon, L. M., Leuschner, G., Ansari, M., Schniering, J., Geyer, P. E., Angelidis, I., Strunz, M., Singh, P., Kneidinger, N., Reichenberger, F., Silbernagel, E., Böhm, S., Adler, H., Lindner, M., Maurer, B., Hilgendorff, A., Prasse, A., Behr, J., Mann, M. & 3 flere, , 2021, I: EMBO Molecular Medicine. e12871.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Temporal resolution of gene derepression and proteome changes upon PROTAC-mediated degradation of BCL11A protein in erythroid cells
Mehta, S., Buyanbat, A., Kai, Y., Karayel, O., Goldman, S. R., Seruggia, D., Zhang, K., Fujiwara, Y., Donovan, K. A., Zhu, Q., Yang, H., Nabet, B., Gray, N. S., Mann, Matthias, Fischer, E. S., Adelman, K. & Orkin, S. H., 18 aug. 2022, I: Cell Chemical Biology. 29, 8, s. 1273-1287.e8Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
BoxCar acquisition method enables single-shot proteomics at a depth of 10,000 proteins in 100 minutes
Meier, F., Geyer, P. E., Virreira Winter, S., Cox, J. & Mann, Matthias, 2018, I: Nature Methods. 15, 6, s. 440-448 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
diaPASEF: parallel accumulation-serial fragmentation combined with data-independent acquisition
Meier, F., Brunner, A., Frank, M., Ha, A., Bludau, I., Voytik, E., Kaspar-Schoenefeld, S., Lubeck, M., Raether, O., Bache, N., Aebersold, R., Collins, B. C., Roest, H. L. & Mann, Matthias, 2020, I: Nature Methods. 17, 12, s. 1229-1236Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from a million experimental values
Meier, F., Köhler, N. D., Brunner, A. D., Wanka, J. M. H., Voytik, E., Strauss, M. T., Theis, F. J. & Mann, Matthias, 2021, I: Nature Communications. 12, 12 s., 1185.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Trapped Ion Mobility Spectrometry (TIMS) and Parallel Accumulation - Serial Fragmentation (PASEF) in Proteomics
Meier, F., Park, M. A. & Mann, Matthias, 17 aug. 2021, (E-pub ahead of print) I: Molecular and Cellular Proteomics. s. 100138Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Online parallel accumulation - serial fragmentation (PASEF) with a novel trapped ion mobility mass spectrometer
Meier, F., Brunner, A., Koch, S., Koch, H., Lubeck, M., Krause, M., Goedecke, N., Decker, J., Kosinski, T., Park, M. A., Bache, N., Hoerning, O., Cox, J., Räther, O. & Mann, Matthias, 2018, I: Molecular and Cellular Proteomics. 17, 12, s. 2534-2545Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Parallel accumulation - serial fragmentation combined with data-independent acquisition (diaPASEF)
Meier, F., Brunner, A., Frank, M., Ha, A., Voytik, E., Kaspar-Schoenefeld, S., Lubeck, M., Raether, O., Aebersold, R., Collins, B. C., Roest, H. L. & Mann, Matthias, 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S17 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning
- Udgivet
The emerging role of mass spectrometry-based proteomics in drug discovery
Meissner, F., Geddes-McAlister, J., Mann, Matthias & Bantscheff, M., 2022, I: Nature Reviews Drug Discovery. 21, s. 637-654 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Direct proteomic quantification of the secretome of activated immune cells
Meissner, F., Scheltema, R. A., Mollenkopf, H. & Mann, Matthias, 26 apr. 2013, I: Science (New York, N.Y.). 340, 6131, s. 475-8 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The social and structural architecture of the yeast protein interactome
Michaelis, A. C., Brunner, A., Zwiebel, M., Meier, F., Strauss, Maximilian, Bludau, I. & Mann, Matthias, 2023, I: Nature. 624, 7990, s. 192-200 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
HYPK promotes the activity of the Nα-acetyltransferase A complex to determine proteostasis of nonAc-X2/N-degron-containing proteins
Miklánková, P., Linster, E., Boyer, J., Weidenhausen, J., Mueller, J., Armbruster, L., Lapouge, K., De La Torre, C., Bienvenut, W., Sticht, C., Mann, Matthias, Meinnel, T., Sinning, I., Giglione, C., Hell, R. & Wirtz, M., 2022, I: Science Advances. 8, 24, 14 s., eabn6153.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
IKAP: A heuristic framework for inference of kinase activities from Phosphoproteomics data
Mischnik, M., Sacco, F., Cox, J., Schneider, H., Schäfer, M., Hendlich, M., Crowther, D., Mann, Matthias & Klabunde, T., 1 feb. 2016, I: Bioinformatics (Online). 32, 3, s. 424-31 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Integrated analysis of protein composition, tissue diversity, and gene regulation in mouse mitochondria
Mootha, V. K., Bunkenborg, J., Olsen, Jesper Velgaard, Hjerrild, M., Wisniewski, J. R., Stahl, E., Bolouri, M. S., Ray, H. N., Sihag, S., Kamal, M., Patterson, N., Lander, E. S. & Mann, Matthias, 2003, I: Cell. 115, 5, s. 629-40 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
MSQuant, an Open Source Platform for Mass Spectrometry-Based Quantitative Proteomics
Mortensen, P., Gouw, J. W., Olsen, Jesper Velgaard, Ong, S., Rigbolt, K. T. G., Bunkenborg, J., Cox, J., Foster, L. J., Heck, A. J. R., Blagoev, B., Andersen, J. S. & Mann, Matthias, jan. 2010, I: Journal of Proteome Research.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatial characterization of single tumor cells by proteomics
Mund, Andreas & Mann, Matthias, 2022, I: Nature Biotechnology. 40, 8, s. 1186-1187 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning
- Udgivet
Unbiased spatial proteomics with single-cell resolution in tissues
Mund, Andreas, Brunner, A. & Mann, Matthias, 2022, I: Molecular Cell. 82, 12, s. 2335-2349 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity
Mund, A., Coscia, F., Kriston, A., Hollandi, R., Kovács, F., Brunner, A-D., Migh, E., Schweizer, L., Santos, A., Bzorek, M., Naimy, S., Rahbek-Gjerdrum, L. M., Dyring-Andersen, B., Bulkescher, J., Lukas, C., Eckert, M. A., Lengyel, E., Gnann, C., Lundberg, E., Horvath, P. & 1 flere, , 2022, I: Nature Biotechnology. 40, s. 1231-1240Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Foresight in clinical proteomics: current status, ethical considerations, and future perspectives
Mundt Madsen, Filip Oskar, Albrechtsen, Nicolai Jacob Wewer, Porsdam Mann, Sebastian, Treit, P., Ghodgaonkar-Steger, M., O’Flaherty, M., Raijmakers, R., Vizcaíno, J. A., Heck, A. J. R. & Mann, Matthias, 2023, I: Open Research Europe. 3, 19 s., 59.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Single Muscle Fiber Proteomics Reveals Fiber-Type-Specific Features of Human Muscle Aging
Murgia, M., Toniolo, L., Nagaraj, N., Ciciliot, S., Vindigni, V., Schiaffino, S., Reggiani, C. & Mann, Matthias, 13 jun. 2017, I: Cell Reports. 19, 11, s. 2396-2409 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein profile of fiber types in human skeletal muscle: a single-fiber proteomics study
Murgia, M., Nogara, L., Baraldo, M., Reggiani, C., Mann, Matthias & Schiaffino, S., 2021, I: Skeletal Muscle. 11, 1, 19 s., 24.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasma proteome profiling of healthy subjects undergoing bed rest reveals unloading-dependent changes linked to muscle atrophy
Murgia, M., Brocca, L., Monti, E., Franchi, M. V., Zwiebel, M., Steigerwald, S., Giacomello, E., Sartori, R., Zampieri, S., Capovilla, G., Gasparini, M., Biolo, G., Sandri, M., Mann, Matthias & Narici, M. V., 2023, I: Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle. 14, s. 439-451Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Single muscle fiber proteomics reveals unexpected mitochondrial specialization
Murgia, M., Nagaraj, N., Deshmukh, Atul Shahaji, Zeiler, M., Cancellara, P., Moretti, I., Reggiani, C., Schiaffino, S. & Mann, Matthias, 1 mar. 2015, I: E M B O Reports. 16, 3, s. 387-95 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 5650809
Flest downloads
-
2009
downloads
Activation of the ATR kinase by the RPA-binding protein ETAA1
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
515
downloads
Region and cell-type resolved quantitative proteomic map of the human heart
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
498
downloads
Revisiting biomarker discovery by plasma proteomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet