Mani Arumugam

Mani Arumugam


  1. 2019
  2. Udgivet

    Author Correction: Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation (Nature Medicine, (2019), 25, 4, (667-678), 10.1038/s41591-019-0405-7)

    Thomas, A. M., Manghi, P., Asnicar, F., Pasolli, E., Armanini, F., Zolfo, M., Beghini, F., Manara, S., Karcher, N., Pozzi, C., Gandini, S., Serrano, D., Tarallo, S., Francavilla, A., Gallo, G., Trompetto, M., Ferrero, G., Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S. & 19 flere, Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Wirbel, J., Schrotz-King, P., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P., Zeller, G., Cordero, F., Dias-Neto, E., Setubal, J. C., Tett, A., Pardini, B., Rescigno, M., Waldron, L., Naccarati, A. & Segata, N., 1 dec. 2019, I: Nature Medicine. 25, 12, s. 1948 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Author Correction: Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 (Nature Biotechnology, (2019), 37, 8, (852-857), 10.1038/s41587-019-0209-9)

    Bolyen, E., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N. A., Abnet, C. C., Al-Ghalith, G. A., Alexander, H., Alm, E. J., Arumugam, M., Asnicar, F., Bai, Y., Bisanz, J. E., Bittinger, K., Brejnrod, A., Brislawn, C. J., Brown, C. T., Callahan, B. J., Caraballo-Rodríguez, A. M., Chase, J., Cope, E. K. & 92 flere, Da Silva, R., Diener, C., Dorrestein, P. C., Douglas, G. M., Durall, D. M., Duvallet, C., Edwardson, C. F., Ernst, M., Estaki, M., Fouquier, J., Gauglitz, J. M., Gibbons, S. M., Gibson, D. L., Gonzalez, A., Gorlick, K., Guo, J., Hillmann, B., Holmes, S., Holste, H., Huttenhower, C., Huttley, G. A., Janssen, S., Jarmusch, A. K., Jiang, L., Kaehler, B. D., Kang, K. B., Keefe, C. R., Keim, P., Kelley, S. T., Knights, D., Koester, I., Kosciolek, T., Kreps, J., Langille, M. G. I., Lee, J., Ley, R., Liu, Y. X., Loftfield, E., Lozupone, C., Maher, M., Marotz, C., Martin, B. D., McDonald, D., McIver, L. J., Melnik, A. V., Metcalf, J. L., Morgan, S. C., Morton, J. T., Naimey, A. T., Navas-Molina, J. A., Nothias, L. F., Orchanian, S. B., Pearson, T., Peoples, S. L., Petras, D., Preuss, M. L., Pruesse, E., Rasmussen, L. B., Rivers, A., Robeson, M. S., Rosenthal, P., Segata, N., Shaffer, M., Shiffer, A., Sinha, R., Song, S. J., Spear, J. R., Swafford, A. D., Thompson, L. R., Torres, P. J., Trinh, P., Tripathi, A., Turnbaugh, P. J., Ul-Hasan, S., van der Hooft, J. J. J., Vargas, F., Vázquez-Baeza, Y., Vogtmann, E., von Hippel, M., Walters, W., Wan, Y., Wang, M., Warren, J., Weber, K. C., Williamson, C. H. D., Willis, A. D., Xu, Z. Z., Zaneveld, J. R., Zhang, Y., Zhu, Q., Knight, R. & Caporaso, J. G., 1 sep. 2019, I: Nature Biotechnology. 37, 9, s. 1091 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Circulating microbiome in blood of different circulatory compartments

    Schierwagen, R., Alvarez Silva, Maria Camila, Madsen, M. S. A., Kolbe, C. C., Meyer, C., Thomas, D., Uschner, F. E., Magdaleno, F., Jansen, C., Pohlmann, A., Praktiknjo, M., Hischebeth, G. T., Molitor, E., Latz, E., Lelouvier, B., Trebicka, J. & Arumugam, Mani, 2019, I: Gut. 68, 3, s. 578-580

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Compartmentalization of Immune Response and Microbial Translocation in Decompensated Cirrhosis

    Alvarez Silva, Maria Camila, Schierwagen, R., Pohlmann, A., Magdaleno, F., Uschner, F. E., Ryan, P., Vehreschild, M. J. G. T., Claria, J., Latz, E., Lelouvier, B., Arumugam, Mani & Trebicka, J., 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 11 s., 69.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Genes controlling the activation of natural killer lymphocytes are epigenetically remodeled in intestinal cells from germ-free mice

    Poupeau, A., Garde, C., Sulek, K., Citirikkaya, K., Treebak, Jonas Thue, Arumugam, Mani, Simar, D., Olofsson, L. E., Bäckhed, F. & Barrès, Romain, 2019, I: F A S E B Journal. 33, 2, s. 2719-2731 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Genetic studies of abdominal MRI data identify genes regulating hepcidin as major determinants of liver iron concentration

    Wilman, H. R., Parisinos, C. A., Atabaki-Pasdar, N., Kelly, M., Thomas, E. L., Neubauer, S., Jennison, C., Ehrhardt, B., Baum, P., Schoelsch, C., Freijer, J., Grempler, R., Graefe-Mody, U., Hennige, A., Dings, C., Lehr, T., Scherer, N., Sihinecich, I., Pattou, F., Raverdi, V. & 31 flere, Caiazzo, R., Torres, F., Verkindt, H., Mari, A., Tura, A., Giorgino, T., Bizzotto, Froguel, P., Brorsson, C., Brunak, Søren, De Masi, F., Pedersen, H., Banasik, Karina, Thomas, Cecilia Engel, Lundgaard, Agnete Troen, Nielsen, A., Mazzoni, G., Karaderi, Tugce, Rasmussen, Simon, Johansen, Joachim, Allesøe, R., Arumugam, Mani, Allin, K., Hansen, Torben, Hansen, T., Jonsson, Anna Elisabet, Pedersen, Oluf Borbye, Dutta, A., Vogt, J., drb459, drb459 & IMI-DIRECT consortium, I. C., 2019, I: Journal of Hepatology. 71, 3, s. 594-602 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Impaired glucose metabolism and altered gut microbiome despite calorie restriction of ob/ob mice

    Kashani, A., Brejnrod, A. D., Jin, C., Kern, T., Madsen, A. N., Holm, L. A., Gerber, G. K., Holm, Jens-Christian, Hansen, Torben, Holst, Birgitte & Arumugam, Mani, 2019, I: Animal Microbiome. 1, 1, 16 s., 11.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer

    Wirbel, J., Pyl, P. T., Kartal, E., Zych, K., Kashani, A., Milanese, A., Fleck, J. S., Voigt, A. Y., Palleja, A., Ponnudurai, R., Sunagawa, S., Coelho, L. P., Schrotz-King, P., Vogtmann, E., Habermann, N., Niméus, E., Thomas, A. M., Manghi, P., Gandini, S., Serrano, D. & 15 flere, Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S., Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Waldron, L., Naccarati, A., Segata, N., Sinha, R., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P. & Zeller, G., 2019, I: Nature Medicine. 25, 4, s. 679-689 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation

    Thomas, A. M., Manghi, P., Asnicar, F., Pasolli, E., Armanini, F., Zolfo, M., Beghini, F., Manara, S., Karcher, N., Pozzi, C., Gandini, S., Serrano, D., Tarallo, S., Francavilla, A., Gallo, G., Trompetto, M., Ferrero, G., Mizutani, S., Shiroma, H., Shiba, S. & 19 flere, Shibata, T., Yachida, S., Yamada, T., Wirbel, J., Schrotz-King, P., Ulrich, C. M., Brenner, H., Arumugam, Mani, Bork, P., Zeller, G., Cordero, F., Dias-Neto, E., Setubal, J. C., Tett, A., Pardini, B., Rescigno, M., Waldron, L., Naccarati, A. & Segata, N., 2019, I: Nature Medicine. 25, 4, s. 667-678 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2

    Bolyen, E., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N., Abnet, C. C., Al-Ghalith, G. A., Alexander, H., Alm, E. J., Arumugam, M., Asnicar, F., Bai, Y., Bisanz, J. E., Bittinger, K., Brejnrod, A., Brislawn, C. J., Brown, C. T., Callahan, B. J., Caraballo-Rodriguez, A. M., Chase, J., Cope, E. K. & 92 flere, Da Silva, R., Diener, C., Dorrestein, P. C., Douglas, G. M., Durall, D. M., Duvallet, C., Edwardson, C. F., Ernst, M., Estaki, M., Fouquier, J., Gauglitz, J. M., Gibbons, S. M., Gibson, D. L., Gonzalez, A., Gorlick, K., Guo, J., Hillmann, B., Holmes, S., Holste, H., Huttenhower, C., Huttley, G. A., Janssen, S., Jarmusch, A. K., Jiang, L., Kaehler, B. D., Bin Kang, K., Keefe, C. R., Keim, P., Kelley, S. T., Knights, D., Koester, I., Kosciolek, T., Kreps, J., Langille, M. G. I., Lee, J., Ley, R., Liu, Y., Loftfield, E., Lozupone, C., Maher, M., Marotz, C., Martin, B. D., McDonald, D., McIver, L. J., Melnik, A. V., Metcalf, J. L., Morgan, S. C., Morton, J. T., Naimey, A. T., Navas-Molina, J. A., Nothias, L. F., Orchanian, S. B., Pearson, T., Peoples, S. L., Petras, D., Preuss, M. L., Pruesse, E., Rasmussen, L. B., Rivers, A., Robeson, M. S. ,. I., Rosenthal, P., Segata, N., Shaffer, M., Shiffer, A., Sinha, R., Song, S. J., Spear, J. R., Swafford, A. D., Thompson, L. R., Torres, P. J., Trinh, P., Tripathi, A., Turnbaugh, P. J., Ul-Hasan, S., vander Hooft, J. J. J., Vargas, F., Vazquez-Baeza, Y., Vogtmann, E., von Hippel, M., Walters, W., Wan, Y., Wang, M., Warren, J., Weber, K. C., Williamson, C. H. D., Willis, A. D., Xu, Z. Z., Zaneveld, J. R., Zhang, Y., Zhu, Q., Knight, R. & Caporaso, J. G., 2019, I: Nature Biotechnology. 37, 8, s. 852-857

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

ID: 41056735